پیش بینی تاثیر LncRNA ها بر انواع مختلف سرطان ها در شبکه های دوبخشی با استفاده از پیش بینی پیوند

بسیاری از سیستم های پیچیده مانند اینترنت، شبکه جهانی وب، مغز و علل بیماری ها را می توان توسط شبکه هایی با گره هایی که نماینده ها و پیوندهایی نشان دهنده روابط یا تعاملات بین گره ها هستند، توصیف کرد. علیرغم اینکه این سیستم ها در نگاه اول کاملا متفاوت به نظر می رسند، همه آن ها از اجزای متقابل تشکیل شده اند. اشیاء منفرد در این نوع سیستم جدا نیستند بلکه از طریق پیوندها یا روابط به هم متصل می شوند RNA .های طولانی غیر کد کننده (LncRNAs) که یکی از عوامل مرتبط با بسیاری از بیماری ها هستند، ژن های خاصی در ژنوم انسان هستند که در کنترل بسیاری از فرآیندهای بیولوژیکی مختلف شرکت می کنند. نشان داده شده است که LncRNA ها توسعه و بروز سرطان را تنظیم می کنند. ما از ابزارهای بیوانفورماتیک پیش بینی پیوند برای شناسایی LncRNAهای موثر بر انواع سرطان ها استفاده کردیم. برای دستیابی به این هدف، از شبکه های دو بخشی با استفاده از الگوریتم های CN همسایگان مشترک  AA (Adamic/Adar)، PA (پیوست ترجیحی) و JC (ضریب جاکارد) استفاده شد. نتایج نشان داد که تمام LncRNA های به دست آمده با امتیاز بالا در مقالات تحقیقاتی دیگر مورد بررسی قرار گرفته اند که این نشان از درستی الگوریتم های ما بود. 5/4 درصد از نتایج به دست آمده فاقد مطالعات علمی و پژوهشی بودند که همگی امتیاز بالایی برای مطالعات آینده داشتند. علاوه بر این، در یک مورد با امتیاز بالا و جایگاه اول در فایل اکسل که با استفاده از الگوریتم ضریب جاکارد به دست آمد، LncRNA با نماد AC09510.3 با آدنوکارسینوما همراه بود، اما این پیوند احتمالی هنوز در هیچ مقاله ای بررسی نشده است. نتیجه گیری مطالعه حاضر ممکن است LncRNA های جدید دخیل در آدنوکارسینوما، کارسینومای سلول سنگفرشی، کارسینومای سلول بازال، کوریوکارسینومای حاملگی، کارسینومای سلول کلیوی کروموفوب، سرطان مغز، سرطان پانکراس، کارسینومای سلول کبدی، سرطان پروستات، سرطان سلول زایا ، سرطان جنینی و کوریوکارسینوما را شناسایی کند. با این حال، تحقیقات بیشتری برای تعیین عملکردهای بالقوه این LncRNA ها در سرطان های ذکر شده در بالا مورد نیاز است.