پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گوسفندان پوستی و پشمی ایرانی با استفاده از روش های برآوردگر نااریب FST و hapFLK

بررسی نشانه های انتخاب در کل ژنوم به شناسایی ساز و کارهای انتخاب و تشخیص مناطقی از ژنوم که طی سالیان متمادی به صورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شده اند، کمک می کند. هدف از این پژوهش، شناسایی نقاطی از ژنوم در گوسفندان پوستی و پشمی بود که طی سال های مختلف انتخاب شده اند. بدین منظور، 80 راس گوسفند پوستی (قره گل، سیاه کبود و کبوده شیراز) و پشمی (سنجابی، کرمانی و بلوچی) با استفاده از آرایه های گوسفندیk 600 تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانه های انتخاب از آزمون نااریبFST  (تتا) و آزمون hapFLK استفاده شد .نتایج تتا، 26 منطقه ژنومی روی کروموزوم های 1، 2، 6، 19 و 24، و نتایج hapFLK، هفت منطقه ژنومی روی کروموزوم های 6 و 19 شناسایی کرد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژن های موثر بر صفات رنگدانه و مشخصات پشم (KIT، MITF، IGSF10 و PDGFRA)، عضلات (MICALL2)، اتساع عروق و پاسخ ایمنی (P2RY) و سرطان (MIR339، ELFN1، MAD1L1 و GPR87) هم پوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل بره های متولد شده در ارتباط هستند. همچنین نواحی مورد انتخاب با مسیرهای درگیر در تمایز ملانوسیت و رنگدانه ها، تمایز سلول های بنیادی، فرآیندهای سلولی، توسعه سیستم ایمنی، سیستم خونی، فرآیندهای باروری و سلولی ارتباط داشتند. به هر حال، برای شناسایی نقش دقیق ژن ها و QTLهای شناسایی شده، لازم است مطالعات تکمیلی انجام گیرد.