بازسازی فیلوژنتیک ژن های بیوسنتزکننده سیانوباکتری های جدا شده از آبشار زیارت استان گلستان

سیانوباکتری ها، پروکاریوت های بی هوازی و فتوسنتز کننده هستند. در گذشته رده بندی سیانوباکتری ها تنها براساس صفات مورفولوژیکی استوار بود. اما امروزه از تکنیک های پیشرفته مانند نشانگرهای مولکولی برای دستیابی به رده بندی دقیق تر و قابل اعتمادتر استفاده می شود. در این تحقیق نمونه برداری از آبشار زیارت استان گلستان انجام شد. پس از کشت و خالص سازی در محیط کشت جامد BG-11، شناسایی مولکولی ژن های بیوسنتزکننده ترکیبات طبیعی (hasN، و geoA) به همراه آنالیزهای واگرایی با تکثیر ژن های rpoC1 انجام گردید. سپس سویه حاوی ژن های فوق با تکثیر ژن های 16S rRNA و ITS شناسایی گردید. درختان فیلوژنتیک با استفاده از روش بیشینه درست نمایی و مدل مناسب به کمک وب سرور IQ-Tree ساخته شد. ساختار ثانویه ITS، در بخش های مختلف هلیکس D1-D1′، D2، D3، tRNAIle، tRNAAla، BOX B، BOX A و V3 به کمک برنامه M-fold رسم شد. نتایج نشان داد که تنها سویه Nodosilinea sp. 1359 دارای ژن های فوق بوده و متعلق به تیره Leptolyngbyaceae و راسته Synechococcales است. علاوه بر آن، نتایج حاصل از محاسبه میزان KA/KS ژن های hasN و geoA و ناسازگاری داده های ژنتیکی 16S rRNA و rpo C1 نشان داد که انتخاب طبیعی با ایجاد جهش های مثبت منجر به ایجاد تنوع در سویه مورد مطالعه شده است. این مطالعه، جزو نخستین تحقیقات انجام شده روی فیلوژنی مولکولی سیانوباکتریوم تولیدکننده ترکیبات طبیعی در آبشار زیارت است.