نگاهی بسیار ساده بر شاخص ‏های ژنتیک تکاملی در ژن‎های CAPN3 و CAPN2 بلدرچین ژاپنی

هدف از پژوهش حاضر بررسی بیوانفورماتیکی ژن های CAPN2 و CAPN3 در جمعیت‏هایی از‏ بلدرچین ژاپنی (N=9)، بررسی میزان تنوع ژنتیکی در این جمعیت‎ها و ترسیم رابطه تبارزایی آن‎ها با برخی گونه های دیگر بود. بدین منظور توالی‎های نوکلئوتیدی ژن های CAPN2 و CAPN3 بلدرچین ژاپنی به همراه توالی‏های نوکلئوتیدی مشابه با توالی این دو ژن از برخی گونه های دیگر (N=62) از بانک جهانی ژن (NCBI) استخراج شدند و از نرم افزارهای DnaSP و MEGA برای تحلیل این توالی ها استفاده شد. نتایج نشان داد که در بلدرچین ژاپنی چند شکلی ژن CAPN2 بیشتر از ژن CAPN3 بوده و در نتیجه مناطق حفاظت‎شده در ژن CAPN3 در مقایسه با ژن CAPN2 بیشتر بود. مقدار عددی نسبت dN/dS برای بلدرچین ژاپنی در ژن CAPN3 (94/0) و در ژن CAPN2 68/0 برآورد شد که به ترتیب نشان دهنده انتخاب خنثی و انتخاب خالص بر روی این دو ژن‎ در طول تکامل می‏باشند. بنابراین، نتایج به دست آمده از این تحقیق می تواند در ردیابی مناطق ژنگانی CAPN2 و CAPN3 مرتبط با صفات فنوتیپی متمایزکننده ی گونه های مورد بررسی کار رود. نتایج آنالیز تبارزایی نشان داد که ژن های مورد بررسی در مسیر تکاملی، بسته به گونه‏ی مورد بررسی، پاسخ های تکاملی متفاوتی را از خود نشان داده‎اند که نشان دهنده پیچیدگی پاسخ این دو ژن به فرایند تکامل است؛ گرچه این دو ژن از نظر هستی‏شناسی ژنی و حاشیه‏نویسی متابولیکی در یک گروه و خانواده قرار می گیرند.