شناسایی و آنالیز ژن های کلیدی و مسیرهای سیگنالدهی دخیل در قطر پشم گوسفند

پشم گوسفند یک ماده خام بسیار مهم برای صنعت نساجی است. از آنجایی که قطر الیاف یکی از مهم ترین ویژگی های اقتصادی پشم گوسفند است، شناسایی ژن های تنظیم کننده این ویژگی فرصتی را برای افزایش بهره وری و بهبود کیفیت و تنوع محصول ارائه می دهد. پژوهش های مختلفی صورت گرفته و ژن های مختلفی در رابطه با الیاف تولیدی شناسایی شده است. هر ژن ممکن است در مسیرهای زیستی مختلفی دخیل باشد که شناسایی این مسیرهای زیستی و ژن ها تشکیل دهنده آن دیدگاه وسیع تر و فهم کامل تری در مورد مکانیسم ژنتیکی پیچیده صفات تولیدی ایجاد می کند که می تواند از طریق شناسایی نشانگرهای زیستی برای صفات تولیدی قدم مفیدی در جهت بهبود اصلاح نژاد باشد. داده های مورد استفاده در این پژوهش از پایگاه داده ای GEO با شماره دسترسی GSE85844 دانلود شدند و به منظور سنجش کیفیت و یک دست بودن مورد بررسی قرار گرفتند. جهت شناسایی ژن ها با بیان متفاوت حد آستانه ای در نظر گرفته شده که شامل P-value و Fold Change می باشد. جهت ترسیم شبکه و آنالیز هستی شناسی از نرم افزارString و آنالیز شبکه از نرم افزار Cytoscape افزونه cytoHubba استفاده شد. در مجموع 702 ژن با بیان متفاوت شناسایی شد که در 37 مسیربیولوژیکی مرتبط با تولید فولیکول های پشم دخیل هستند. نتایج آنالیز شبکه 11 ژن بزرگ اثر را شناسایی کرد که بر رشد و قطر پشم تاثیر دارند. این نتایج منابع ارزشمندی را برای افزایش کیفیت و تولید پشم گوسفند فراهم می کند.