مطالعه فارماکولوژی شبکه ای از مسیرهای سیگنال دهی و ژن های هدف ماده بربرین در درمان سرطان تخمدان با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی

سرطان تخمدان یکی از بیماری های کشنده در زنان می باشد که تشخیص زودهنگام آن مشکل است. بنابراین، نیاز فوری به عوامل شیمیایی وجود دارد که می تواند در کنترل توسعه سرطان تخمدان کمک کند. بربرین، به عنوان یک ماده شیمیایی، دارای خواص آنتی اکسیدانی و دارویی متعددی است و نقش ضد سرطانی این ماده تحت پژوهش قرار دارد. هدف این مطالعه تجزیه و تحلیل ژن های هدف بربرین در سرطان تخمدان و شناخت مسیرهای سیگنال دهی بربرین با استفاده از فارماکولوژی شبکه است. در این مطالعه، مجموعه داده GSE36668 از پایگاه داده GEO گرفته شد. ژن های دارای بیان افتراقی(DEGs)، توسط GEO2R با 05/0 adj Pvalue < و 2≤∣logFC∣ مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. اهداف مرتبط با بربرین از پایگاه های داده SwissTargetPrediction و Pharm Mapper جمع آوری شدند. شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین (PPI) اهداف مشترک بربرین و DEGs، بر اساس داده های موجود در پایگاه داده String و با استفاده از نرم افزار Cytoscape ترسیم شد. ژن های مشترک در بربرین و سرطان تخمدان، در بررسی مسیرهای زیستی (BP) و مولکولی (MF) و سلولی استفاده شدند. 10 ژن هاب انتخابی در این مطالعه شامل ESR1، STAT1، CDK1، RXRA، PIK3CA، PGR، CCNB1، CHEK1، PIK3R1 و PIK3CG بودند. همچنین مشخص شد ژنهای هدف بربرین می توانند در مسیرهای سیگنال دهی سرطان، سرطان زایی شیمیایی، تنش برشی سیال و آترواسکلروز، بلوغ تخمک با واسطه پروژسترون و مسیر سیگنالینگ PPAR، نقش داشته باشند. بر اساس این یافته ها بربرین می تواند بر بیان ژن های موثر در سرطان تخمدان و محصولات پروتئینی آن ها اثر داشته و با اثر بر مسیرهای زیستی دخیل در این بیماری، راهکار مناسبی برای درمان سرطان تخمدان باشد.