مطالعه رابطه کمی فعالیت -ساختار و اتصال مولکولی مشتقات اکینوپسین حاوی اسیل هیدرازون بر علیه ویروس موزاییک تنباکو

ویروس موزاییک تنباکو، زیان اقتصادی زیادی به تنباکو، فلفل، خیار و گل های زینتی در سراسر جهان وارد می نماید. در این مطالعه، یک سری از مشتقات جدید اکینوپسین حاوی اسیل هیدرازون با فعالیت انتی ویروسی بر علیه ویروس موزاییک تنباکو (TMV) با استفاده از محاسبات رابطه فعالیت کمیت-ساختار و اتصال مولکولی مورد بررسی قرارگرفت. آنالیز اتصال مولکولی مشتقات اکینوپسین با پروتئین ویروس موزائیک توتون (2OM3)با استفاده از نرم افزار اتوداک انجام شد و توصیف کننده هایی مانند انرژی اتصال، انرژی الکترواستاتیک و انرژی پیوند هیدروژنی محاسبه گردید. مقادیر منفی انرژی اتصال نشان داد که ماهیت اتصال این مشتقات، به عنوان لیگاند با پروتئین 2OM3قوی است. برای مدل QSAR،  ابتدا مجموعه داده به دو گروه آموزش و مجموعه تست تقسیم شد. سپس توصیفگرها با استفاده از مکانیک کوانتومی، اتصال مولکولی و توصیفگرهای مولکولی محاسبه شدند.  سپس مدلسازی به روش رگرسیون خطی چندگانه (MLR) انجام شد. مشخص شد که انرژی کمترین اوربیتال مولکولی اشغال نشده (LUMO) و تغییرات انرژی آزاد گیبس در مدل نقش دارند. همچنین توصیف گرهای داکینگ مولکولی مانند توصیفگرهای انرژی کل برهمکنش های واندروالس، پیوند هیدروژنی و انرژی مجموع واندوالس، هیدروژنی و حل شوندگی  در مدل رگرسیونی تاثیر دارند. این مطالعه می تواند نقش مهمی در طراحی مهارکننده های ضد ویروس TMV داشته باشد.