پپیشگویی تمایل اتصال تعدادی از مشتقات ایماتینیب به عنوان مهارکننده های تیروزین کیناز بر اساس بهینه سازی مونت کارلو
بیماری لوسمی میلوئید مزمن نوعی از سرطان خون است که به تولید ژن جدیدی به نام BCR-ABL منجر می شود و حاوی دستورالعمل تولید پروتئین تیروزین کیناز توسط سلول های غیرطبیعی خون است. داروی ایماتینیب برای درمان این سرطان استفاده می گردد که با مهار آنزیم تیروزین کیناز BCR-ABL، از تکثیر سلول های سرطانی جلوگیری می کند.
به منظور پیشگویی تمایل اتصال 555 ترکیب از مشتقات ایماتینیب به عنوان مهارکننده ABL-BCR تیروزین کیناز، مدل سازی رابطه کمی ساختار-فعالیت (QSAR) با استفاده از روش مونت کارلو انجام شد. داده ها به صورت تصادفی به چهار سری آموزش، آموزش منفعل، کالیبراسیون و آزمون تقسیم و به صورت تصادفی 3 بار تکرار گردید.
یافته های پژوهش:
نتایج حاصل از سه تقسیم تصادفی، مدل های قابل اعتمادی را برای پیش بینی مجموعه آزمون های خارجی با ضریب همبستگی (R2) و ضریب همبستگی اعتبارسنجی متقاطع (Q2) در محدوده 8775/0-8575/0 و 7793/0-7620/0 نشان داد؛ درنتیجه، مدل های به دست آمده به شناسایی توصیفگرهای هیبریدی برای افزایش و کاهش تمایل اتصال (Ki) به عنوان مهارکننده BCR-ABL تیروزین کیناز کمک می کنند. تفسیر مکانیکی مدل به صورت گزارشی از توصیفگرهای کاهنده و افزاینده pKi و همچنین مثال هایی از این توصیفگرها آمده است.
نتایج نشان می دهد که مدل های طراحی شده می تواند در تخمین اثر بیولوژیکی مشتقات ایماتینیب پیشنهادی توسط محققان و متخصصان شیمی دارویی بسیار موثر باشد؛ بنابراین، با صرف هزینه و زمان کمتر و پیش از انجام آزمایش های برون تن یا درون تن می توان آثار بیولوژیک احتمالی آن را پیش بینی کرد.
-
Novel Mefenamic Acid Analogs Featuring 4-Thiazolidinone Moiety: Design, Synthesis, In Silico Modeling and Biological Evaluation
Arefeh Badrzadeh Shekarab, Niloofar Gharahchoulou, Seyed Sam Banisadr, Maryam Bayanati, Mohammad Mahboubi-Rabbani, Shima H.M.E Ketabforoosh, Homa Azizian, *
Journal of Applied Organometallic Chemistry, 2024 Jun -
پیش بینی سمیت برخی آفت کش ها علیه پنج گونه مختلف پرندگان با استفاده از الگوی ارتباط کمی ساختار- سمیت
، شهرام لطفی*، لیلا شماخی، علی عظیمی
فصلنامه زیست شناسی جانوری تجربی، بهار 1403 -
Unraveling the Ozonolysis Mechanism of Terpinolene: Insights from DFT Studies
Ali Azimi, Marjan Jebeli Javan *, , Morteza Rouhani, Zohreh Mirjafary
International Journal of New Chemistry, Autumn 2024 -
مقایسه اثر مشتق هیدرازون 2- فنیل تیو بنزوییک اسید به عنوان یک ضد التهاب جدید با مفنامیک اسید بر هیستولوژی بافت کبد و آنزیم های کبدی در ماهی گورامی سه خال (Trichogaster trichopterus)
یاسمن خانی، طاهره ناجی*، ، همایون حسین زاده
نشریه بهره برداری و پرورش آبزیان، تابستان 1402