اثر محرک رشدی سویه های بومی سیانوباکتری بر جوانه زنی برنج همراه با تحلیل بیوانفورماتیکی ‏خانواده ژنی آمونیوم ترانسپورتر (‏OsAMTs‏)‏

سیانوباکتری ها به دلیل تثبیت بیولوژیکی نیتروژن، محلولسازی فسفات و تولید مواد تقویتکننده رشد نقش مهمی در بهبود حاصلخیزی خاک و افزایش بهره وری محصولات ارگانیک دارند. این تحقیق تاثیر سویه های مختلف سیانوباکتری (هشت سویه) بر رشد سه رقم برنج (فجر، روشن و طارم) در مرحله جوانه زنی، بررسی شد. با توجه به فرم ترجیحی جذب نیتروژن در برنج های غرقاب (آمونیوم)، مطالعه خانواده ژنی انتقال دهنده های آمونیوم (AMT) مدنظر قرار گرفت. در این آزمایش اثر سیانوباکتری بر صفتهای درصد جوانه زنی، سرعت جوانه زنی، طول ریشه چه، نسبت طول ریشه چه به ساقه چه، وزن خشک تک بوته و وزن تر تک بوته مورد مطالعه معنی دار بود. بهبود شاخص های جوانه زنی در همکشتی دو رقم پرمحصول روشن و فجر با هشت سویه سیانوباکتر، نسبت به رقم کیفی طارم هاشمی معنی دار بود. میزان برونریزش ازت در هر هشت سویه متفاوت بوده و بالاترین میزان برونریزش نیترات و آمونیوم در سویه شماره 7 به ترتیب به مقدار 08/0 میکروگرم بر میلیلیتر و 010/0 میکروگرم بر میلی لیتر مشاهده شد. در بررسی بیوانفورماتیکی، 12 مکان ژنی و 15 ایزوفرم OsAMT در ژنوم گیاه برنج شناسایی شد. بررسی اعضای خانواده ژنی OsAMT در پایگاه های اختصاصی دمین نشان داد که همه ژن های مورد بررسی (بجز OsAMT 3.4) دارای دمین پروتئینی انتقال دهنده آمونیوم می باشند. بررسی ساختار ژنی و روابط تکاملی OsAMTها نشان داد، همه OsAMTها در سه گروه طبقه بندی شده که هر گروه از الگوهای موتیف و ساختارهای اگزون/اینترون مشابه برخوردارند. شناسایی ژن های فعال و غیرفعال OsAMT در آنالیز این سیلیکو می تواند در مطالعات بررسی ژنومیکس عملکردی خانواده ژنی انتقال دهنده آمونیوم برنج خصوصا در شرایط همکشتی با سویه های سیانوباکتر راهگشا باشد.