بررسی آنالیز فیلوژنی و شناسایی ویروس نیوکاسل به روش مولکولی در طیور استان چهارمحال و بختیاری

به منظور آنالیز فیلوژنی و شناسایی خصوصیات مولکولی ویروس نیوکاسل در طیور استان چهارمحال و بختیاری از گله های مشکوک به بیماری نمونه های بافتی ریه، طحال، نای، مغز و لوزه سکومی اخذ و با روش RT-PCR مورد آزمایش قرار گرفتند. در این روش برای شناسایی عامل بیماری نیوکاسل از قطعه ای بطول bp 356 و جهت تعیین توالی نوکلئوتیدها از قطعه ای بطول bp 1349 از ژن F با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر داده شد. پس از ارزیابی نتایج حاصل از این مطالعه، مشخص گردید که در روش RT-PCR تمام نمونه های بافتی تحت مطالعه از نظر ویروس نیوکاسل مثبت بودند. پس از مقایسه اسیدهای آمینه در منطقه شکاف پروتئین F ویروس های شناسایی شده با سویه های استاندرد حاد و کم حدت ویروس نیوکاسل مشخص گردید که ویروس های موجود در نمونه های تحت مطالعه از سویه های حاد ویروس نیوکاسل می باشند و ترتیب اسیدهای آمینه آنها در منطقه شکاف پروتئین F بصورت (GRRRQRRF) می باشد. آنالیز فیلوژنی سویه های شناسایی شده در استان چهار محال و بختیاری قرابت ژنومی نزدیکی را با سویه های ایتالیایی و روسی نشان می دهد.