مطالعه گونه های Cylindrocarpon همراه با پوسیدگی ریشه و طوقه ذرت و کلزا در استان خوزستان

به منظور شناسایی و مطالعه گونه های Cylindrocarpon همراه با ریشه و طوقه کلزا و ذرت در استان خوزستان طی سال زراعی 1386- 1385، از مزارع کلزا و ذرت در مناطق ایذه، دزفول، شوشتر، شوش، اندیمشک و ملاثانی نمونه برداری به عمل آمد. در این بررسی پنج گونه از جنس سیلندروکارپن شناسایی شد که به ترتیب فراوانی شامل C. destructans(96 جدایه)، C. didymium (69 جدایه)، hederae C. (25 جدایه)، C. obtusisporum (14 جدایه) و C. macrodidymum (3 جدایه) بودند. جداسازی گونه های مذکور از ذرت و کلزا برای اولین بار در دنیا انجام می شود. در این تحقیق از جفت آغازگرهای ITS4 & ITS5 برای شناسایی گونه های سیلندروکارپن استفاده شد. محصول تکثیر شده از DNA جدایه های سیلندروکارپن با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، قطعه ای به وزن 560-500 جفت باز تکثیر نمود. مقایسه توالی های به دست آمده از گونه های فوق با توالی های موجود در بانک ژن، با استفاده از ابزار جستجوی B LAST(Basic Local Alignment Search Tool)، نشان داد که تمامی توالی های به دست آمده از نمونه های مورد بررسی به گونه های سیلندروکارپن تعلق دارند. گروه بندی گونه های سیلندروکارپن با استفاده از توالی ITS مناطق ریبوزومی مطابق با طبقه بندی بر اساس خصوصیات مرفولوژیکی ارائه شده است. این مطلب نشان می دهد که تعیین توالی ITS مناطق ریبوزومی یک ابزار مفید و کار آمد در ارزیابی رابطه فیلوژنتیکی گونه های جنس سیلندروکارپن است.