بررسی ماندگاری در گله های گاو هلشتاین ایران با روش رگرسیون تصادفی
نویسنده(گان):	علی اشرافیان، ناصر امام جمعه گاشان*، مختار علی عباسی، علی اصغر صادقی، محمد رکوعی
چکیده:	ماندگاری گاو شیری عبارت از مدت زمان حضور یک حیوان در گله از تاریخ زایش اول تا تاریخ حذف می باشد. در این تحقیق هدف، برآورد پارامتر های ژنتیکی صفت ماندگاری حیوانات دارای داده کامل با مدل رگرسیون تصادفی (RRM) و بررسی ماندگاری دختران مولد های نر در جمعیت بر اساس انتخاب ژنتیکی گاوهای نر با استفاده از اطلاعات ۲۰ دختر آن ها و توانایی پیش بینی ارزش ارثی (EBV) حیوانات دارای داده غیر کامل با استفاده از RRM می باشد. فایل مورد استفاده برای ارزیابی ژنتیکی حیوانات حاوی داده های مربوط به ۱۸۱۲۰ راس دختر از ۹۰۶ مولد نر بود. این گاوهای نر دارای ۲۰ دختر بودند که از بین دختران آن ها به طور تصادفی انتخاب شده بودند. این گاوهای نر علاوه بر دختران مورد استفاده در ارزیابی ژنتیکی (۱۸۱۲۰ راس) در فایل اصلی ۲۸۵۰۶۴ راس دختر داشتند. مولد های نر بر اساس ارزش ارثی متغیر ماندگاری با توجه به مساحت زیر منحنی نرمال از زیاد به کم در ۵ گروه، گروه بندی شدند. سپس میانگین ماندگاری دختران هر گروه که در ارزیابی از آن ها استفاده نشده بود محاسبه شد. در یک فایل دیگر از بین ۲۰ دختر گاوهای نر که کلیه آن ها دارای داده کامل بودند تعداد حداکثر ۱۰ دختر که حداقل ماندگاری آن ها ۶ ماه بود (تعداد ۷۸۸۲ راس) به طور تصادفی انتخاب و برای غیرکامل فرض کردن اطلاعات آن ها عدد ماندگاری آن ها به طور تصادفی بر ۲ و ۳ تقسیم شد. سپس اطلاعات آن ها به صورت داده غیر کامل به همراه حیوانات دارای داده کامل در فایل داده منظور شد. وراثت پذیری صفت نظیر سایر تحقیقات کم در دامنه ۰/۰۰۳ - ۰/۰۳۲ برآورد شد. تفاوت میانگین ماندگاری دختران کلیه گروه ها با آزمون LSD معنی دار بود (۰/۰۱˂P). با افزایش میانگین EBV گروه پدران، ماندگاری دختران در جمعیت نیز بیش تر می شد. همبستگی رتبه ای EBV حیوانات در حالت داده غیر کامل و کامل برابر ۰/۸۱۵+ برآورد شد. علی رغم کم بودن وراثت پذیری متغیر ماندگاری استفاده از اسپرم گاوهای نر برتر از نظر ارزش ارثی ماندگاری می تواند در بهبود ماندگاری در جمعیت موثر باشد. در ضمن، با استفاده از اطلاعات تعداد محدودی از نتاج از هر گاو نر برای ارزیابی ژنتیکی، می توان میانگین ماندگاری در جمعیت گاوهای شیری هلشتاین را افزایش داد. هم چنین EBV ماندگاری دختران در حال تولید مولدهای نر (داده غیرکامل) را نیز به وسیله RRM پیش بینی کرد.
کلیدواژگان:	ارزش ارثی، داده کامل، داده غیرکامل، ماندگاری، مدل رگرسیون تصادفی، وراثت پذیری، نژاد هلشتاین
نوع مقاله:	مقاله پژوهشی/اصیل
زبان:	فارسی
انتشار در:	فصلنامه محیط زیست جانوری، سال شانزدهم شماره ۱ (بهار ۱۴۰۳)
صفحات:	۲۹ -۳۶
نسخه الکترونیکی:	متن این مقاله در سایت مگیران قابل مطالعه است.

Study of Longevity in Iranian Holstein dairy cows using Random Regression Model
Author(s):	Ali Ashrafian، Nasser Emamjomeh Kashan *، Mokhtar Ali Abbasi، Ali Asghar Sadeghi، Mohammad Rokouei
Abstract:	The longevity in dairy cow is the duration of presence of an animal the herd from the date of first calving to the date culled. In present research, the aim is 1) to estimate the genetic parameters of the longevity trait of uncensored animals using random regression model and 2) to study longevity of daughters of sires in the population using the EBV of bulls based on 20 daughters and 3) to test the random regression model (RRM) for EBV prediction of Animals with censored data. Genetic parameters of longevity and breeding value of bulls were estimated by ECHIDNA software using RRM with restricted maximum likelihood (REML) method. The file used for the genetic evaluation contained data on 18,120 daughters from 906 bulls. A number of 20 daughters that randomly selected from each sire to use for EBV prediction. In addition to the daughters used for genetic evaluation (18,120 cows), there were 285,064 daughters of the bulls in the main file. The bulls were grouped according to the Breeding value from high to low based on the area under the normal curve. Then, the mean of longevity of the daughters in each group who were not used the EBV prediction calculated. In a file 10 daughters were randomly selected of 20 daughters of each bull and their months of longevity divided by 2 and 3. These data were considered as censored in the data file. The permanent environmental effect and the additive genetic effect had the largest and smallest contribution to the total variance, respectively. The heritability of the trait was low (0.003-0.032) which is in agreement with results of other report. The difference of mean longevity between groups (LSD test) was significant (P˂0.01). Also, the increase of the mean of EBV of the groups, the mean of longevity of their daughters in the population increased. The correlation of EBV of animals with censored and uncensored data state were +0.815. In the split the low heritability of the longevity trait, using the sperm of superior bulls in terms of EBV of longevity can improve the longevity in the population. Also, it is possible to evaluate and select the bulls with a low progeny number and increase the mean of longevity in the population of Holstein dairy cows. Moreover, the EBV of longevity for young and producing animals can be predicted by RRM.
Keywords:	Breeding Value، Censored Data، Heritability، Holstein Breeds، Longevity، Random Regression Animal Model، Uncensored Data
Article Type:	Research/Original Article
Language:	Persian
Published:	Journal of Animal Environment, Volume:16 Issue: 1, 2024
Pages:	29 -36
Full text:	PDF is available on the website.