نخستین جلسه کابینه دوازدهم عصر 29 مرداد برگزار شد، تنها ساعاتی پس از آن که وزرای پیشنهادی توانستند رای اعتماد نمایندگان مجلس را کسب کنند. در فاصله جلسه رای اعتماد و برگزاری جلسه کابینه، احکام وزرا نیز از سوی رئیس جمهوری صادر شد و ترکیب جدید هیات دولت، با قرائت سوگندنامه از سوی اعضا کار خود را آغاز کرد. این امر نشان دهنده اهتمام روحانی برای تعجیل در آغاز به کار دولت دوم او بود. باوجود تلاشی که از دولت و مجلس برای شکل گیری و آغاز به کار دولت دوازدهم دیده شد، امروز در 30 مهرماه، دو ماه بعد از آغاز به کار دولت، هنوز دو وزارتخانه علوم، تحقیقات و فناوری و نیرو با سرپرست اداره می شوند.