درباره گرایش های سیاسی آیت الله العظمی سیدمحمد شاهرودی کمتر سخن رفته است. در این باره نظر فرزند ایشان را پرسیدیم و او ضمن طرح خاطره ای به این سوال پاسخ داد. آیت الله شاهرودی تعریف می کند: در نجف در بیت مرحوم جد ما آیت الله العظمی سیدمحمود شاهرودی، مجالس استفتاء تشکیل می شدند. این جلسات از یک ساعت پس از غروب شروع می شدو گاهی تا چهار پنج ساعت ادامه پیدا می کرد. یک بار آخر شب و جلسه تمام شده بود و حضار متفرق شده بودند. مرحوم جد و مرحوم والد ما در بیرونی این روزها می گویند دفتر حضور داشتند که در را می زنند و آیت الله العظمی خویی همراه با آقای سیدمحمد شیرازی وارد می شوند.