به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
فهرست مطالب نویسنده:

محمد درویش خادم

  • سعید پیرمرادی*، محمد درویش خادم
    مقدمه

    مهار فرایندهای التهابی در بیماریهای مختلف مانند سرطان کاربردهای درمانی موثری میتواند داشته باشند. عملکرد موثر انزیم سیس اکونیتات دکربوکسیلاز  (CAD) محصول ژنIRG1 ، در فرایندهای التهابی سرطانها مختلف جدیدا طی تحقیقاتی بالینی اثبات شده است. در انسان آنزیم  (CAD) کاتالیز سیس آکونیتیک اسید به ایتاکونیک اسید را بر عهده دارد.

    روش کار

    در این کار با کمک ابزارهای بیوانفورماتیکی به شناسایی نقاط داغ عملکردی و بررسی جایگاه ان درساختار ACOD1 پرداخته شد سپس به بررسی اثرات تمام حالات جهش در این نقاط پرداخته و جهش های خطرناکتر انتخاب شدند و پایداری ACOD1 در اثر جهش های بدست امده بررسی شدند و برهمکنشهای انزیم دارای جهشهای انتخاب شده با دیگر پروتیینها ارزیابی و مصورسازی شد.

    یافته ها

     این مقاله یک فرایند فراتحلیلی است که طی انالیز جهشهای مختلف در نقاط داغ عملکردی انزیم ACOD1 مشخص شد که 9 جهش (A247C,A248T,A101C,L156P,A244P,N248C,N248F,E150Y,E150W) در هفت نقطه داغ پیش بینی شده دارای بیشترین اثار مخرب از لحاظ عملکردی و کاهش پایداری و برهمکنشی انزیم ACOD1 با دیگر پروتیینها را داشتند.

    نتیجه گیری

    از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی پیامدهای SNPهای پیش گویی شده نقاط داغ عملکردی ژن ACOD1 انسانی در نهایتااز بین تمام جهشهای مورد مطالعه 9 جهش  بدست امد که اثار مخربتری بر عملکرد انزیم ACOD1داشتند که محققان میتوانند از بررسی نقش و عملکرد اثرگذاری انها در فرایندهای بالینی و نیز به عنوان نشانگرهای تشخیصی در بیماریهای سرطان وابسته به التهاب ویا به عنوان اهداف دارویی احتمالی استفاده کنند. این مطالعه insilico یک مسیر احتمالی برای روشن تر شدن مطالعه مکانیسمهای مولکولی درگیر در فرایندهای التهابی ناشی از جهش ژنIRG1 و محصول پروتیینی آن (ACOD1) را ارایه می دهد.

    کلید واژگان: نقاط داغ, بیوانفورماتیک, جهش, اکونیتات دکربوکسیلاز
    Saeed Pirmoradi*, Mohamad Darvishkhadem
    Introduction

    Inhibition of inflammatory processes in various diseases can have effective therapeutic applications. The effective function of cis-aconitate decarboxylase (CAD) enzyme, a product of IRG1 gene, in the inflammatory processes of various diseases has been recently proven in clinical studies. In humans, the enzyme (CAD) catalyzes cis-aconitic acid to itaconic acid.

    Methods

    In this work, with the help of bioinformatics tools, functional hotspots were identified and their position in ACOD1 structure was investigated. Then, the effects of all mutation modes at these points were investigated and more dangerous mutations were selected. Interactions of selected mutant enzymes with other proteins were evaluated and visualized.

    Results

    During the analysis of different mutations in functional hotspots of ACOD1 enzyme, it was found that 9 mutations (A247C, A248T, A101C, L156P, A244P, N248C, N248F, E150Y, E150W) in the seven predicted hotspots had the most destructive effects in terms of function. And decreased the stability and interaction of ACOD1 enzyme with other proteins.

    Conclusions

    From the bioinformatic analysis of the results of the predicted SNPs of the functional hot spots of the human ACOD1 gene, finally, among all the studied mutations, 9 mutations were obtained that had more destructive effects on the ACOD1 enzyme function. which researchers can use to investigate their role and effectiveness in clinical processes and as diagnostic markers in cancer diseases related to inflammation or as possible drug targets. This insilico study provides a possible path to clarify the study of molecular mechanisms involved in inflammatory processes caused by IRG1 gene mutation and its protein product (ACOD1).

    Keywords: Hotspots, Bioinformatics, Mutations, Aconite Decarboxylase
  • سعید پیرمرادی، محمد درویش خادم، حامد اسمعیل لشگریان*
    مقدمه

    همه گیری کووید 19 از زمانی که برای اولین بار در اواخر سال 2019 کشف شد، تاثیر زیادی بر سلامت انسان در سراسر جهان گذاشته است. در حال حاضر روش دارویی و درمانی خاصی برای درمان این بیماری کشف نشده است. از سوی دیگر، التهاب بیش از حد ناشی از ترشح بالای سیتوکین ها در بیماران کووید-19 منجر به عوارض کشنده از جمله نارسایی اندام ها و مرگ می شود. بدین منظور برای درک بهتر پاتوفیزیولوژی این ویروس، دانشمندان سعی دارند از روش های مختلفی مانند بررسی برخی داروهای ضد التهابی دردسترس یا ارزیابی In silico ترکیبات بازدارنده به عنوان مهارکننده های رسپتور اینترلوکین 6 (IL-6R) برای تعدیل بخش هایی از سیستم ایمنی استفاده کنند.

    مواد و روش ها

    در این بررسی پس از طراحی In silico، بین لیگاندهای مهارکننده با IL-6R داکینگ صورت گرفت. پس از آن، لیگاند مناسب برای سمیت و آلرژی و پیش بینی ADME (جذب، توزیع، متابولیسم و دفع) مورد ارزیابی قرار گرفت.

    یافته ها

    نتایج داکینگ مولکولی نشان داد که بین قسمتهای غیر قطبی ترکیب لیگاند مهاری طراحی شده عمدتا با بخشهایی از پروتئین IL-6R مشتمل بر آمینواسیدهای  ,Arg118 Thr120 وser122 برهمکنش هیدروژنی صورت گرفته است. همچنین آمینواسیدهای Ser122, Arg118 Trp115, Glu96,Thr120, Pro121, ,Val93, Pro94,Thr125، برهم کنشهای استری را نشان میدهند.

    بحث و نتیجه گیری

    نتایج داکینگ نشان داد که از بین صد لیگاند مورد بررسی، لیگاند [03] unknown (24) دارای انرژی اتصالی مناسب تری(-114.648) با IL-6R نسبت به بقیه لیگاندها دارد و این سطح انرژی بیانگر برهمکنش مطلوب بین این ترکیب مهاری طراحی شده با IL-6R از طریق آمینو اسیدهایSer122, Arg118 Trp115, Glu96,Thr120, Pro121, ,Val93, Pro94 وThr125 دارد. به منظور اثبات میزان اثر مهاری این لیگاند روی IL-6R مطالعات بالینی نیاز می باشد.

    کلید واژگان: لیگاند مهاری, Insilico, اینترلوکین6, التهاب, داکینگ
    Saeed Pirmoradi, Mohamad Darvishkhadem, Hamed Esmaillashkarian*
    Introduction

    The covid 19 pandemic since it was first discovered in late 2019 has made a great impact on human health worldwide. At present, no specific drug and treatment methods have been discovered to treat this disease. On the other hand, excessive inflammation due to high cytokines secretion in Covid-19 patients results in fatal effects including organ failure and death. Therefore, to define a better understanding of the pathophysiology of this virus, scientists are trying to use a variety of methods such as examining some available anti-inflammatory drugs or evaluating Insilico inhibitory compounds as IL-6 receptor (IL-6R) inhibitors to modulate parts of the immune system.

    Methods

    In this study, after designing Insilico, docking was performed between inhibitory ligands and IL6R. Subsequently, the appropriated ligand was evaluated for toxicity and allergy, and ADME prediction (absorption, distribution, metabolism, and excretion).

    Results

    The results of the molecular docking showed that between the non-polar parts of the designed inhibitory ligand composition, mainly with parts of IL-6R protein containing amino acids of Arg118, Thr120, ser122 hydrogen interaction took place. The amino acids of Arg118, Ser122, Trp115, Thr120, Glu96, , Pro121, Val93, Thr125 and Pro94 also demonstrate ester interactions.
    Discussion and

    conclusion

    Docking results demonstrated that out of 100 studied ligands, [03] unknown (24) has more suitable binding energy (-114.648) with the IL-6R than other ligands and this energy level indicates a favorable interaction between this inhibitory compound and IL-6R through amino acids of Ser122, Arg118, Trp115, Glu96, Thr120, Pro121, Val93, Pro94, and Thr125. Clinical studies are needed to prove the inhibitory effect of this ligand on the IL6R.

    Keywords: Inhibitory ligand, Insilico, Interleukin 6, Inflammation, Docking
  • Mohammad Darvish Khadem, Aria Rasooli *, Alireza Ghadrdan Mashhadi, Ali Shahriari, Babak Mohammadian, Farid Barati

    Scorpion envenomation is a main general health problem in developing countries, especially in tropical and subtropical regions. Hemiscorpius lepturus as a member of the Hemiscorpiidae family is cause of the most scorpion sting lethality in Iran. In the present study, the oxidative stress and antioxidant defense in serum of envenomated sheep with the venom of Hemiscorpius lepturus were investigated. Nine sheep were randomly divided into three groups (three in each). Groups A, B and C received 0.10, 0.05 and 0.01 mg kg-1 of H. lepturus venom subcutaneously, respectively. Blood sampling were performed 30 min before envenomation (control) and 30 min, 1, 2, 3 and 6 hr after envenomation and serum levels of total antioxidant capacity (TAC), malonedialdehyde (MDA) and protein carbonyl (PCO) were determined. The TAC was significantly increased at the doses of 0.10 mg kg-1 (at 3 hr) and 0.05 mg kg-1 (at 6 hr) compared to pre-injection time. However, no significant differences were observed in serum levels of MDA and PCO in different groups. It can be concluded that the dose of 0.01 mg kg-1 of venom had no effect on stress factors of serum, but according to increased level of TAC at the doses of 0.05 and 0.10 and no significant changes in serum levels of MDA and PCO, the oxidative damage has been prevented by the antioxidant defense system response.

    Keywords: antioxidant capacity, Malonedialdehyde, Scorpion, Sheep
  • مریم رهروانی، علیرضا قدردان مشهدی، آریا رسولی، بابک محمدیان، محمد راضی جلالی، محمد درویش خادم
    عقرب گزیدگی، یکی از مشکلات عمده ی بهداشتی در کشورهای گرمسیری و نیمه گرمسیری است. عقرب گادیم (Hemiscorpius lepturus) از خطرناک ترین گونه های عقرب است که در استان خوزستان آندمیک می باشد. هدف از انجام دادن پژوهش حاضر، روشن کردن عوارض احتمالی هیستوپاتولوژی ناشی از تزریق سم این عقرب در گوسفند است. این مطالعه روی 12 راس گوسفند بومی نر با سن حدود شش ماه و با میانگین وزنی 61/1±72/20 کیلوگرم، صورت پذیرفت. گوسفندان به طور تصادفی به چهار گروه (3 گوسفند در هر گروه) تقسیم شدند (یک گروه کنترل و سه گروه آزمایش). ونوم عقرب گادیم با سه دوز مختلف (01/0، 05/0 و 1/0 میلی گرم به ازای هر کیلوگرم وزن بدن)، به روش زیرجلدی به سه گروه آزمایش و نیز 1 میلی لیتر آب مقطر به همان روش به گروه کنترل، تزریق شد. پس از مرگ و یا پس از گذشت 72 ساعت، دام ها مورد کالبدگشایی قرار می گرفتند. در مطالعات هیستوپاتولوژی، بیش ترین محل وجود ضایعه در دام های تحت بررسی، کبد و عضلات محل تزریق و کم ترین محل وجود ضایعه، مغز و مثانه بود. ضایعاتی هم چون پتشی (در کالبدگشایی) و خون ریزی و پرخونی (در هیستوپاتولوژی) در اندام های مختلف (هم چون کبد، کلیه، ریه، روده و قلب) مشاهده شد که این یافته ها احتمالا به واسطه ی آسیب عروقی می باشند. آسیب عروقی هم چنین دلیلی بر ایجاد ادم در بسیاری از اندام ها است. نتایج نشان می دهد که ضایعات پاتولوژیک، حداقل در دو عضو از ارگان های بررسی شده ی گوسفندان دریافت کننده ی سم، وجود داشته است. وجود این ضایعات، دلالت بر آن دارد که سم عقرب همی اسکورپیوس لپتوروس در نوع گوسفند، خطرناک است و عوارض جدی (حتی مرگ) را به همراه خواهد داشت.
    کلید واژگان: هیستوپاتولوژیک, عقرب, همی اسکورپیوس لپتوروس, گوسفند
    Maryam Rahravani
    Scorpionism is a common problem that occurs in tropical and subtropical countries. Hemiscorpius lepturus is one of the most dangerous scorpion species, endemic in Khuzestan. The aim of the current study was to clarify the possible histopathological implications due to injection of H. lepturus scorpion venom in sheep. The study performed on 12 native male sheep in which the age and weight average were about 6 months and 20.72±1.61 Kg respectively. Four groups (3 rams in each group) were chosen randomly (1 group as control and the other 3, as experimental groups). Three doses of H. lepturus venom included: 0.01, 0.05 and 0.1 mg/kg BW were injected subcutaneously into the three experimental groups and just 1 mL of distilled water were injected to control group as the same way. After death or after 72 hours, the animals were subjected to necropsy. In most animals, histopathological evidence of lesions, were confined in the liver and skeletal muscles (injection site), whereas the other injuries such as in brain and urinary bladder lesions were at minimum. Lesions such as petechiae (at necropsy), hemorrhage and congestion (in histopathology), which may due to vascular injuries were seen in various organs (such as liver, kidney, lung, bowel and heart). These findings may be due to vascular injuries. Vascular injuries were also the reason of edema in many organs. The results showed that the pathological lesions were existed at least in two parts of the studied organs in the sheep receiving venom. Existence of the leisons imply that the venom of H. lepturus scorpion is dangerous in sheep and serious complications such as death will take place.
    Keywords: Histopathologic, Scorpion, Hemiscorpius lepturus, Sheep
  • حسین نجف زاده ورزی *، بابک محمدیان، مریم رهبر، نسترن اکبری، محمد درویش خادم، لیلا نیک روان
    سابقه و هدف
    با توجه به احتمال افزایش سمیت کلیوی استرپتومایسین بوسیله چای و قهوه که حاوی متیل گزانتین ها از جمله کافئین هستند، هدف از این مطالعه، بررسی تغییرات هیستوپاتولوژیک بافت کلیه و کبد و برخی فاکتورهای سرمی موش صحرایی در مصرف همزمان استرپتومایسین و کافئین می باشد.
    مواد و روش ها
    این مطالعه تجربی در مدل حیوانی و بر روی 25سر موش صحرایی ماده نژاد ویستار با میانگین وزنی 200 گرم در 5 گروه انجام شد. گروه اول بعنوان گروه شاهد، گروه های دوم تا پنجم به ترتیب استرپتومایسین (mg/kg 25)، کافئین(mg/kg 5)+استرپتومایسین، کافئین و استرپتومایسین+ ویتامین سی (mg/kg 100) را به مدت 21 روز و بصورت داخل صفاقی دریافت کردند. سپس موش ها با اتر بیهوش شدند و از قلب خونگیری شد و در سرم مقادیر کراتینین، ازت اوره، سدیم و پتاسیم اندازه گیری شد. از بافت کلیه و کبد برای بررسی پاتولوژیک به روش معمول نمونه گیری و مقطع تهیه شد و با رنگ آمیزی هماتوکسیلین- ائوزین و بوسیله میکروسکوپ نوری مطالعه شدند.
    یافته ها
    مقدار کراتینین و پتاسیم سرم در بین گروه ها تفاوت نداشت در حالی که مقدار ازت در گروه 5 (mg/dl 15 ±0/7) نسبت به گروه 1 و 4 بطور معنی داری کمتر بود (p<0.05). سدیم در گروه 2 (0/2 ±139/8) و 4 (0/447 ±140) افزایش و در گروه 5 (137/25±0/75 meq/l) کاهش معنی داری داشت(p<0.05). آسیب بافت کبد و کلیه در مصرف همزمان استرپتومایسین و کافئین شدیدتر بود. ویتامین سی این ضایعات را کاهش داد.
    نتیجه گیری
    کافئین آسیب کلیوی ناشی از استرپتومایسین را میتواند تشدید نماید در حالی که ویتامین سی آن را کاهش دهد.
    کلید واژگان: استرپتومایسین, کافئین, کلیه, کبد, موش صحرایی
    Hossien Najafzadeh *, Babak Mohamadian, Maryam Rahbar, Nastaran Akbari, Mohammad Darvish Khadem, Leyla Nikravan
    Background And Objective
    Considering the possibility of increased renal toxicity induced by streptomycin in tea and coffee, which contain methylxanthines such as caffeine, we aimed to investigate the histopathological changes in the kidney and liver of rats. We also evaluated some serum parameters after the concurrent use of streptomycin and caffeine.
    Methods
    This experimental study was performed on 25 female Wistar rats, with the average weight of 200 g; the rats were divided in five groups. Group I was regarded as the control group, group II received streptomycin (25 mg/kg), group III was administered streptomycin+caffeine (5 mg/kg), group IV received caffeine (5 mg/kg) and group V received streptomycin + vitamin C (100 mg/kg) for a period of 21 days. Afterwards, the rats were anesthetized with ether and blood samples were obtained from the heart. Serum creatinine, blood urea nitrogen, sodium and potassium levels were measured in rats. After preparing and sectioning renal and hepatic tissues for pathological examinations, they were stained by hematoxylin and eosin (H&E); the samples were examined, using a light microscope.
    Findings
    Serum creatinine and potassium levels were not significantly different between the groups, while urea nitrogen level in group V (15±07 mg/dL) was significantly lower than the values reproted in groups I and IV (p<0.05). Sodium level increased in group II (139. 8±0.2 mEq/L) and group IV (140±0.447 mEq/L), while a significant reduction was reported in group V (137.25±0.75 mEq/L) (p<0.05). According to the findings, hepatic and renal damages were severe after the concomitant use of streptomycin and caffeine. However, vitamin C reduced the induced damages.
    Conclusion
    As the results indicated, caffeine could aggravate renal injuries, induced by streptomycin, while vitamin C had an alleviating effect.
    Keywords: Streptomycin, Caffeine, Kidney, Liver, Rats
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال