تحلیل اثر جهشهای تک نوکلئوتیدی پیشگویی شده نقاط داغ عملکردی انزیم اکونیتات دکربوکسیلاز درمسیرهای التهابی و متابولیسمی سرطانهای مختلف با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی

مهار فرایندهای التهابی در بیماریهای مختلف مانند سرطان کاربردهای درمانی موثری میتواند داشته باشند. عملکرد موثر انزیم سیس اکونیتات دکربوکسیلاز  (CAD) محصول ژنIRG1 ، در فرایندهای التهابی سرطانها مختلف جدیدا طی تحقیقاتی بالینی اثبات شده است. در انسان آنزیم  (CAD) کاتالیز سیس آکونیتیک اسید به ایتاکونیک اسید را بر عهده دارد.

در این کار با کمک ابزارهای بیوانفورماتیکی به شناسایی نقاط داغ عملکردی و بررسی جایگاه ان درساختار ACOD1 پرداخته شد سپس به بررسی اثرات تمام حالات جهش در این نقاط پرداخته و جهش های خطرناکتر انتخاب شدند و پایداری ACOD1 در اثر جهش های بدست امده بررسی شدند و برهمکنشهای انزیم دارای جهشهای انتخاب شده با دیگر پروتیینها ارزیابی و مصورسازی شد.

 این مقاله یک فرایند فراتحلیلی است که طی انالیز جهشهای مختلف در نقاط داغ عملکردی انزیم ACOD1 مشخص شد که 9 جهش (A247C,A248T,A101C,L156P,A244P,N248C,N248F,E150Y,E150W) در هفت نقطه داغ پیش بینی شده دارای بیشترین اثار مخرب از لحاظ عملکردی و کاهش پایداری و برهمکنشی انزیم ACOD1 با دیگر پروتیینها را داشتند.

از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی پیامدهای SNPهای پیش گویی شده نقاط داغ عملکردی ژن ACOD1 انسانی در نهایتااز بین تمام جهشهای مورد مطالعه 9 جهش  بدست امد که اثار مخربتری بر عملکرد انزیم ACOD1داشتند که محققان میتوانند از بررسی نقش و عملکرد اثرگذاری انها در فرایندهای بالینی و نیز به عنوان نشانگرهای تشخیصی در بیماریهای سرطان وابسته به التهاب ویا به عنوان اهداف دارویی احتمالی استفاده کنند. این مطالعه insilico یک مسیر احتمالی برای روشن تر شدن مطالعه مکانیسمهای مولکولی درگیر در فرایندهای التهابی ناشی از جهش ژنIRG1 و محصول پروتیینی آن (ACOD1) را ارایه می دهد.