به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
فهرست مطالب نویسنده:

محمدعلی حسین پور فیضی

  • آیسان نعمتی، ناصر پولادی*، محمدعلی حسینپور فیضی، رعنا مددی راد
    سابقه و هدف

    برخی از چندشکلی های تک نوکلئوتیدی ژن HOTAIR در انواع سرطان ها نظیر سرطان پستان، تخمدان، کولورکتال و ریه همراهی دارند. محصول ژن HOTAIR یک RNA غیر کد کننده بلند است که در تنظیم بیان ژن و آپوپتوز دخالت دارد و از این رو یک آنکوژن محسوب می شود. این پژوهش با هدف بررسی چندشکلی G>T  rs1899663در استعداد ابتلا به سرطان پستان در منطقه شمال غرب ایران انجام گرفت.

    مواد و روش ها

    در این مطالعه موردی- شاهدی خون محیطی 164 بیمار مبتلا به سرطان پستان مراجعه کننده به بیمارستان های تبریز و 172 فرد سالم تهیه شد. بعد از استخراج DNA افراد به روش نمک اشباع و پروتئیناز K، چندشکلی تک نوکلئوتیدی rs1899663 G>T  ژن HOTAIR به روش تترا- آرمز مورد بررسی قرار گرفت. ارتباط این چندشکلی با برخی از ویژگی های بالینی و آسیب شناختی سرطان پستان شامل سن بیمار، نوع تومور، درجه تومور، اندازه تومور، درگیری غدد لنفی و سمت درگیر بررسی شد.

    یافته ها

    فراوانی ژنوتیپ های GG، GT، TT در افراد بیمار به ترتیب 33/4%، 55/6% و 11% و در افراد سالم به ترتیب 51/7%، 42/3% و 6% بود. ژنوتیپ های GG (0/001=p) و GT (0/029=p) همراهی معنی داری را با سرطان پستان نشان دادند. این چندشکلی با هیچ کدام از ویژگی های کلینیکوپاتولوژیکی سرطان پستان در این جمعیت همراهی ندارد.

    نتیجه گیری

    داده های ما نشان می دهد که بیماران با ژنوتیپ های GT و GG چندشکلی G>T rs1899663 ژن HOTAIR بیشتر مستعد ابتلا به سرطان پستان هستند در حالی که افراد با ژنوتیپ های TT حساسیت پایین تری به گسترش سرطان پستان دارند. نتایج حاصل از آنالیزهای in silico نیز نشان می دهد این چندشکلی های تک نوکلئوتیدی می توانند ریسک ابتلا به سرطان پستان را افزایش دهند.

    کلید واژگان: سرطان, پستان, چندشکلی تک نوکلئوتیدی, HOTAIR
    A .Nemati, N .Pouladi*, MA. Hoseinpour Feizi, R .Madadi Rad
    Background and Objective

    Some single nucleotide polymorphisms of the HOTAIR gene are associated with various types of cancer, such as breast, ovarian, colorectal, and lung cancer. The HOTAIR gene product is a long non-coding RNA that is involved in the regulation of gene expression and apoptosis, and is therefore considered an oncogene. This study was conducted with the aim of investigating the rs1899663 G>T polymorphism in breast cancer susceptibility in the northwestern region of Iran.

    Methods

    In this case-control study, the peripheral blood of 164 breast cancer patients referred to Tabriz hospitals and 172 healthy individuals was collected. After DNA extraction using saturated salt and proteinase K, single nucleotide polymorphism rs1899663 G>T of HOTAIR gene was investigated using tetra-primer ARMS-PCR. The association between this polymorphism and some clinical and pathological features of breast cancer including age, tumor type, tumor grade, tumor size, lymph node involvement and involved side was investigated.

    Findings

    The frequency of GG, GT, TT genotypes in sick people was 33.4%, 55.6% and 11%, respectively and in healthy people was 51.7%, 42.3% and 6%, respectively. GG (p=0.001) and GT (p=0.029) genotypes showed a significant association with breast cancer. This polymorphism is not associated with any of the clinicopathological features of breast cancer in this population.

    Conclusion

    Our data show that patients with GT and GG genotypes of rs1899663 G>T polymorphism of HOTAIR gene are more susceptible to breast cancer, while people with TT genotypes have a lower susceptibility to breast cancer development. The results of in silico analyses also show that these single nucleotide polymorphisms can increase the risk of breast cancer.

    Keywords: Cancer, Breast, Single Nucleotide Polymorphism, HOTAIR
  • مریم علیزاده، ناصر پولادی*، محمدعلی حسینپور فیضی، رعنا مددی راد، سعیده امامی
    سابقه و هدف

    مطالعات حاکی از آن است که پلی‌مورفیسم تک نوکلیوتیدی rs1467465 ژن ICB-1 در سرطان های سینه و تخمدان همراهی دارد. این مطالعه با هدف بررسی همراهی پلی‌ مورفیسم ژن rs1467465 A>G ICB-1 در استعداد ابتلا به سرطان تیرویید انجام گرفت.

    مواد و روش‌ها

    در این مطالعه موردی- شاهدی خون محیطی 92 بیمار مبتلابه سرطان تیرویید مراجعه‌کننده به بیمارستان های تبریز و 203 فرد سالم تهیه شد. پس از استخراج DNA به روش نمک اشباع، پلی‌مورفیسم تک نوکلیوتیدی rs1467465 ژن ICB-1 به روش TETRA-ARMS-PCR مورد بررسی قرار گرفت. سپس فراوانی آللی و ژنوتیپی گروه بیمار و کنترل ارزیابی و مقایسه گردید.

    یافته‌ها:

     در این مطالعه، فراوانی ژنوتیپی AA، AG و GG در گروه بیمار به ترتیب 4/34%، 68/47% و 27/17% و در گروه کنترل، 4/92%، 55/66% و 39/40% به دست آمد. فراوانی آللی A و G به ترتیب در گروه بیمار، 38/58% و 61/41% و در گروه کنترل، 32/75% و 67/24% محاسبه شد. در این مطالعه، ارتباط این پلی‌مورفیسم با برخی از خصوصیات بالینی و آسیب شناختی سرطان تیرویید شامل جنسیت، سن، نوع، درجه و اندازه تومور، درگیری غدد لنفی و سمت درگیر بررسی شد.

    نتیجه‌گیری: 

    مطالعه نشان داد که ژنوتیپ های AG و GG دارای ارتباط معنی داری با ریسک ابتلا به تومورهای تیروییدی در جمعیت مورد مطالعه هستند و همچنین این پلی‌مورفیسم ممکن است در تعیین خطر نسبی گسترش تومورهای تیروییدی سهیم باشد.

    کلید واژگان: سرطان تیروئید, ژن ICB-1, واکنش زنجیره ای پلیمراز
    M .Alizadeh, N .Pouladi *, MA. Hoseinpour Feizi, R .Madadi Rad, S .Emami
    Background and Objective

    Studies indicate that single nucleotide polymorphism of ICB-1 gene rs1467465 is associated with breast cancer and ovarian cancer. This study was conducted with the aim of investigating the association between ICB-1 gene polymorphism rs1467465 (A>G) and thyroid cancer susceptibility.

    Methods

    In this case-control study, the peripheral blood of 92 thyroid cancer patients referred to Tabriz hospitals and 203 healthy individuals were prepared. After DNA extraction by saturated salt solution, single nucleotide polymorphism rs1467465 of ICB-1 gene was investigated by TETRA-ARMS-PCR method. Then, allelic and genotypic frequencies of patient and control groups were evaluated and compared.

    Findings

    In this study, the genotypic frequency of AA, AG and GG in the patient group was 4.34%, 68.47% and 27.17%, respectively, and in the control group was 4.92%, 55.66% and 39.40% respectively. The frequencies of A and G alleles were calculated as 38.58% and 61.41% in the patient group and 32.75% and 67.24% in the control group, respectively. In this study, the relationship between this polymorphism and some clinical and pathological characteristics of thyroid cancer, including gender, age, type, grade and size of tumor, involvement of lymph nodes and involved side, was investigated.

    Conclusion

    This study showed that AG and GG genotypes have a significant relationship with the risk of developing thyroid tumors in the studied population, and this polymorphism may contribute to determining the relative risk of developing thyroid tumors.

    Keywords: Thyroid Cancer, ICB-1 Gene, Polymerase Chain Reaction
  • بهارک ابراهیمی بهنام، محمد خلج کندری*، محمدعلی حسینپور فیضی
    زمینه و هدف

    سقط مکرر (RSA) شایع ترین عارضه بارداری است که به وقوع دو یا بیش از دو مورد سقط قبل از هفته بیستم بارداری اطلاق می گردد. یکی از عوامل مهم دفع جنین مولکول ایمونوتولرانسHLA-G است که نقش مهمی در حفاظت از جنین در قبال سیستم ایمنی مادر دارد. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط پلی مورفیسم های rs1632943 و rs1736932 ناحیه پروموتر ژن HLA-G با سقط مکرر در زنان شمال غرب ایران است.

    مواد و روش ها

     در این مطالعه مورد- شاهدی، 100 زن با سابقه سقط مکرر به عنوان گروه مورد و 80 زن سالم با یک یا بیشتر از یک کودک به عنوان گروه کنترل انتخاب شدند. DNA ژنومی از نمونه خون محیطی آن ها استخراج و ژنوتیپ های آن ها با استفاده از روش تعیین توالی مشخص شد. بررسی آماری نتایج حاصل، توسط آزمون مربع کای و نرم افزار SPSS ورژن 16 انجام شد.

    یافته ها

    در پلی مورفیسم rs1632943 فراوانی ژنوتیپ های CC، CA و AA در گروه بیمار به ترتیب 8 ٪، 33 ٪و 59 ٪و در گروه شاهد 25/16٪، 75/43٪ و40٪ بود. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که ژنوتیپ AA با سقط مکرر خود به خود همراه است (p=0.005) و در پلی مورفیسم rs1736932 فراوانی ژنو تیپ هایCC، CG و GG به ترتیب 8٪، 32٪و 60٪ در گروه بیمار و 5/17٪، 25/41٪ و 25/41٪ در گروه شاهد بود. تجزیه وتحلیل آماری نشان داد که ژنوتیپ GG با سقط مکرر همراه است (005/0 P=). همچنین بررسی هاپلوتایپی نشان داد که هاپلوتایپ H1 (GA) با بیماری همراهی نشان می دهد.

    نتیجه گیری

    نتایج مطالعه حاضر حاکی از آن است که پلی مورفیسم های rs1632943 و rs1736932 می توانند به عنوان یک عامل خطر برای RSA در زنان شمال غربی ایران در نظر گرفته شود.

    کلید واژگان: آنتی ژنهای HLA-G, سقط مکرر, پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی, مطالعات همراهی ژنتیکی
    Baharak Ebrahimi Behnam, Mohammad Khalaj Kondori*, Mohammad Ali Hoseinpour Feizi
    Background and Aim

    Recurrent spontaneous abortion (RSA) is the most common complication of pregnancy that refers to two or more miscarriages before the 20th week of pregnancy. HLA-G immunoglobulin molecule plays an important role in protecting the fetus against mother's immune system. The aim of this study was to investigate the association between rs1632943 and rs1736932 polymorphisms with recurrent spontaneous abortion in Northwest of Iran.

    Materials and Methods

    This case-control study included 100 women with history of RSA as our case group and 80 healthy women with one or more than one children as the control group. Genomic DNA was purified from their peripheral blood samples and their genotypes were determined by PCR-sequencing method. Using SPSS 16, statistical analysis was performed by chi-square test.

    Results

    In rs1632943 polymorphism the frequency of CC, CA and AA genotypes were 8%, 33% and 59% in the patient group and 16.25%, 43.75% and % 40 in the control group, respectively. Statistical analysis showed that AA genotype was associated with the recurrent spontaneous abortion (P = 0.005). In the rs1736932 polymorphism, the frequency of CC, CG and GG genotypes were 8%, 32% and 60% in the patient group and 17.5%, 41.25% and 41.25% in the control group, respectively. Statistical analysis showed that GG genotype was associated with the recurrent miscarriage (P = 0.005). Also, haplotype analysis showed that H1 haplotype (GA) is associated with the disorder.

    Conclusion

    Results of the study showed that rs1632943 and ra1736932 polymorphisms

    Keywords: HLA-G antigens, recurrent miscarriage, Single nucleotide polymorphism, Genetic association studies
  • زینب شقاقی ترکداری، محمد خلج کندری*، محمدعلی حسین پورفیضی
    هدف

    این مطالعه با هدف ارزیابی سطح بیان TINCR در بافت های توموری و غیرتوموری مجاور 50 زن مبتلا به سرطان داکتال تهاجمی پستان انجام شد. ارتباط بیان TINCR و خصوصیات بالینی بیماران نیز مورد مطالعه قرار گرفته است.

    مواد و روش‏ها

    RNA تام از بافت توموری و غیرتوموری مجاور بیماران مبتلا به سرطان پستان با استفاده از محلول RNX-Plus جدا شد. سپس، از معرف Prime Script TM RT برای تبدیل RNA تام به cDNA استفاده شد. سطح بیان  TINCRتوسط qRT-PCR کمی شده و نتایج با آزمون تی زوجی تجزیه و تحلیل شد. علاوه براین، برای ارزیابی قدرت بیومارکری  TINCRاز تحلیل منحنی ROC  در بافت های توموری سرطان پستان استفاده شد.

    نتایج

    کاهش سطح TINCR در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان در مقایسه با بافت غیرتوموری مجاور به دست آمد (001/0p<). میزان بیان TINCR با اندازه تومور و متاستاز غدد لنفاوی در بافت توموری سرطان پستان ارتباط منفی داشت.

    نتیجه ‏گیری

    کاهش سطح بیان TINCR در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان نشان می دهد که سطح بیان آن می تواند بافت توموری و غیرتوموری مجاور را از یک دیگر متمایز سازد. علاوه براین، TINCR دارای سطح بیان پایین تری در بیماران مبتلا به سرطان پستان با تومورهای بزرگ، متاستاز غدد لنفاوی و زیرگروه لومینال A و B دارد.

    کلید واژگان: سرطان پستان, کاهش بیان, lncRNA, TINCR
    Z Shaghaghi Torkdari, M Khalaj-Kondori *, MA Hosseinpour Feizi
    Aim

    This study aimed to evaluate the expression levels of TINCR in tumor and adjacent non-tumor tissues of 50 women diagnosed with invasive ductal carcinoma. The association of TINCR expression and the clinical characteristics of patients have also been studied.

    Material and Methods

    Total RNA was isolated from tumor and adjacent non- tumor tissues of breast cancer patients using RNX-Plus. Then, PrimeScriptTM RT reagent was used for converting total RNA to cDNA. TINCR lncRNA levels were quantified by qRT-PCR and results was analyzed with paired sample t test. Moreover, for evaluation the TINCR biomarker potential, ROC curve analysis was used in breast cancer tumor tissues.

    Results

    Reduced levels of TINCR were obtained in tumor tissues of breast cancer patients compared with adjacent non-tumor tissues (P<0.0001). TINCR expression had negative association with tumor size and lymph node metastasis in breast cancer tumor tissues.

    Conclusion

    TINCR lncRNA downregulation in tumor tissues of breast cancer patients indicates that its expression level could discriminate the tumor from non-tumor tissues in breast cancer patients. Furthermore, TINCR lncRNA have low levels in breast cancer patients with large tumor size, positive lymph node metastasis and luminal A and B subtypes.

    Keywords: Breast cancer, Downregulation, lncRNA, TINCR
  • فاطمه محمودی، لیلا مهدی زاده فایند، نرگس زینال زاده*، محمدعلی حسین پور فیضی
    مقدمه

    وابستگی به هرویین یک بیماری مزمن و عودکننده مغزی است که توسط ترکیبی از عوامل ژنتیکی، اپی ژنتیکی و محیطی ایجاد می شود و سهم ژنتیک در آسیب پذیری به ایجاد این وابستگی 40-60 درصد است. تغییر در انتقال سروتونین در سیستم عصبی مرکزی در وابستگی به مواد مخدر و الکل دخیل است و بر اساس نتایج مطالعات همراهی، چندشکلی تک نوکلیوتیدی rs6313/T102C ژن HTR2A در وابستگی به مواد نقش مهمی دارد. هدف از این مطالعه مورد_شاهدی، ارزیابی همراهی چندشکلی rs6313 ژن HTR2A و وابستگی به هرویین در نمونه ای از جمعیت شمال غرب ایران است.

    مواد و روش ها

    این مطالعه روی 100 فرد بیمار وابسته به هرویین و 102 فرد کنترل بدون وابستگی به مواد انجام شد. پس از استخراج DNA از خون، ژنوتیپ افراد نسبت به چندشکلی rs6313 ژن HTR2A با استفاده از روش PCR-RFLP تعیین گردید. آنالیز آماری داده ها برای مشخص کردن همراهی با نرم افزار SPSS vol.16 انجام پذیرفت.

    یافته ها

    فراوانی ژنوتیپ های CT,CC و TT چندشکلی rs6313 ژن HTR2A در گروه بیمار به ترتیب 50،23 و 27 درصد و در گروه شاهد به ترتیب 35/32، 12/44 و 53/23 درصد بودند و بر اساس بررسی های آماری، تفاوت معناداری میان گروه های کنترل و بیمار وجود نداشت (P˃0.05).

    بحث و نتیجه گیری

    نتایج پژوهش حاضر نتوانست شواهدی مبنی بر همراهی چندشکلی rs6313 ژن HTR2A با استعداد وابستگی به هرویین در جمعیت آذری شمال غرب ایران ارایه دهد و این مسئله بر لزوم بررسی سایر چندشکلی های ژنتیکی کاندید در جمعیت مطالعه شده دلالت دارد.

    کلید واژگان: وابستگی به هروئین, مسیر سروتونرژیک, rs6313 HTR2A, همراهی ژنتیکی, شمال غرب ایران
    Fatemeh Mahmoudi, Leila Mehdizadeh Fanid, Narges Zeinalzadeh*, Mohammad Ali Hosseinpour Feizy
    Introduction

    Heroin dependence is a chronic relapsing disorder caused by a combination of genetic, epigenetic, and environmental factors. The genetic contribution in the vulnerability to heroin dependence is 40%-60%. Alterations in dopamine transport in the CNS are implicated in drug and alcohol dependence, and according to linkage studies, the HTR2A rs6313 single nucleotide polymorphism plays an important role in drug dependence and abuse. This case-control study aimed to investigate the association between HTR2A rs6313 and heroin dependence among a population from Northwest Iran.

    Material & Methods

    The study included a sample of 100 heroin-dependent patients and 102 control subjects. After DNA extraction from blood samples, the genotype of HTR2A rs6313 polymorphism was investigated among patients and controls using the PCR-RFLP method. The obtained data were analyzed in SPSS software to explore a significant association.
    (Ethic code: 5/4/12152)

    Findings

    Frequencies of CC, CT, and TT genotypes were 23%, 50%, and 27% in the patient group and 32.35%, 44.12%, and 23.53% in the control group. According to statistical analysis, there were no significant differences between case and control groups in this regard (P>0.05).

    Discussion & Conclusion

    The results of the study could not support a significant association between HTR2A rs6313 polymorphism and heroin dependence in the Azeri population of Northwest Iran. This indicates the need to investigate other candidate genetic polymorphisms in the study population.

    Keywords: Genetic association, Heroin dependence, HTR2A rs6313, Northwest of Iran, Serotonergic pathway
  • زینب شقاقی ترکداری، محمد خلج کندری*، محمدعلی حسین پور فیضی
    مقدمه

    سرطان پستان مهم‏ترین علت مرگ و میر ناشی از سرطان در زنان است که بررسی عوامل ایجاد کننده یا تشدید کننده آن ضروری به نظر می‏ رسد. در این مطالعه، سطح  mRNA ژن PHB2 در بافت تومور و بافت غیرتوموری مجاور مربوط به 50 زن مبتلا به کارسینوم داکتال غیرتهاجمی پستان مورد بررسی قرار گرفت.

    روش بررسی

    محلول RNX-Puls برای استخراج RNA کل از بافت توموری و غیرتوموری مجاور بیماران مبتلا به سرطان پستان استفاده شد. سپس با استفاده از کیتPrimeScriptTM RT، RNA کل به cDNA تبدیل شد. سطح mRNA ژن PHB2 توسط qRT-PCR مورد بررسی کمی قرار گرفته و داده ‏ها با آزمون تی زوجی مورد آنالیز قرار گرفت. علاوه بر این، بررسی منحنی ROC برای ارزیابی پتانسیل بیومارکری PHB2 در بافت‏ های توموری سرطان پستان انجام شد.

    یافته ‏ها

    سطح پایینی از PHB2 mRNA در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان در مقایسه با بافت غیرتوموری مجاور مشاهده شد (P<0.0001). به عبارت دیگر، سطح PHB2 mRNA  در بافت توموری نسبت به حالت نرمال تقریبا 5/2 برابر کاهش داشته است (P=0.001). آنالیز منحنی ROC نشان داد که سطح mRNA ژن PHB2 می‏ تواند بافت‏ های توموری و غیرتوموری را با اختصاصیت 3/91% و حساسیت 3/63% تشخیص دهد (AUC=0.712, P<0.001).

    نتیجه‏ گیری

    کاهش سطح mRNA ژن PHB2 در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان نشان می‏ دهد که سطح mRNA این ژن احتمالا بافت توموری را از بافت ‏های غیرتوموری مجاور می‏ تواند تمایز دهد.

    کلید واژگان: سرطان پستان, PHB2, کارسینومای داکتال, بیومارکر
    Zeynab Shaghaghi Torkdari, Mohammad Khalaj-Kondori*, Mohamad Ali Hosseinpour
    Introduction

    Breast cancer is the most important cause of cancer mortality among women, therefore the study of its causative or aggravating factors seems necessary. In this study, the mRNA levels of the PHB2 gene were evaluated in tumor and adjacent non-tumor tissues of 50 women diagnosed with invasive ductal carcinoma of the breast.

    Methods

    RNX-Plus solution was used to isolate total RNA from tumor and adjacent non-tumor tissues of breast cancer patients. Thereafter, total RNA was converted to cDNA using PrimeScriptTM RT reagent kit. The mRNA levels of PHB2 were quantified by qRT-PCR and data were analyzed with a paired-samples t test. Furthermore, ROC curve analysis was performed to evaluate the diagnostic capacity of PHB2 expression in breast cancer tumor tissues.

    Results

    A significantly lower level of PHB2 mRNA was observed in tumor tissues of breast cancer patients compared with adjacent non-tumor tissues (P<0.0001). PHB2 mRNA levels showed an approximately 2.5-fold reduction in tumor tissues compared with normal tissues (P = 0.001). Roc cure analysis showed that PHB2 mRNA level can discriminate tumors from non-tumor tissues with 91.3% specificity and 64.3% sensitivity (AUC=0.712, P<0.001).

    Conclusion

    Downregulation of PHB2 in breast cancer patients shows that its mRNA levels can possibly discriminate tumors from non-tumor tissues.

    Keywords: Breast Cancer, PHB2, Ductal Carcinoma, Biomarker
  • نازیلا والاتبار، رضا صفرعلیزاده*، محمدعلی حسینپور فیضی

    زمینه و هدف  :

    بیماری رینیت آلرژیک رایج ترین اختلال در حوزه سلامت در همه مناطق جهان است. در سال های اخیر، به دلیل افزایش شیوع و نیز اهمیت بالینی بیماری رینیت آلرژیک در ابتلا به سایر بیماری ها نظیر آسم مطالعه روی این بیماری بسیار مورد توجه قرار گرفت است. در این مقاله به طور ویژه، چندشکلی های تک نوکلیوتیدی دخیل در بیماری رینیت آلرژیک مطالعه شده است.

    مواد و روش ها:

     در این مطالعه مروری، از مطالعات انجام شده در زمینه استعداد ژنتیکی ابتلا به بیماری رینیت آلرژیک در فاصله زمانی 2020 -2005 و با جست وجو کلیدواژه های کلی و عمومی  allergic rhinitis, genetic polymorphisms, single nucleotide polymorphism  در پایگاه های اطلاعاتی Scopus ، Google Scholar ،Science Direct ، Pubmed استفاده شده است.

    یافته ها :

    در این مطالعات، در مجموع به بررسی ژن های کاندید احتمالی مرتبط با رینیت آلرژیک در افراد مبتلا به این بیماری و بررسی واریانت های چندشکلی های تک نوکلیوتیدی مرتبط با بیماری مذکور پرداخته شده است. داده های جمع آوری شده در این مطالعه، حاصل مطالعات انجام گرفته در نقاط مختلف جهان بوده است. جمعیت موردمطالعه در مقالات، افراد مبتلا به بیماری رینیت آلرژیک می باشد.

    نتیجه گیری :

    نتایج، همراهی چندین چندشکلی تک نوکلیوتیدی در ژن های مختلف را با رینیت آلرژیک نشان داده است که برخی از آنها ممکن است در درک پاتوفیزیولوژی و پیدا کردن روش های جدید برای ایمونوتراپی بیماری رینیت آلرژیک مفید باشد.

    کلید واژگان: رینیت آلرژیک, چندشکلی های تک نوکلئوتیدی, چند شکلی ژنتیکی
    Nazila Valatabar, Reza Safaralizadeh *, Mohammadali Hosseinpour Feizi
    Introduction

    Allergic rhinitis is a more prevalent health disorder in all regions of the world. In recent years, the study on Allergic rhinitis because of its higher prevalence and its effect on development of asthma have been more attended. In this article specifically reviews Singlenucleotide polymorphism studies in allergic rhinitis disease.

    Materials and Methods

    In this study, the results of previous research conducted between 2005 and 2020 in the field of genetic susceptibility to allergic rhinitis have been used. Articles were collected by searching keywords Allergic rhinitis, genetic polymorphisms, single nucleotide polymorphism in the databases Scopus, Google Scholar, PubMed, Science Direct.

    Results

    In these studies, the candidate genes and the variants of single nucleotide polymorphism associated with allergic rhinitis have been investigated. The data collected in this study are the result of studies conducted in different parts of the world. The population of studies in these articles were allergic rhinitis patients.

    Conclusion

    Results showed association of several SNPs of various genes in allergic rhinitis that some of them may be useful incomprehension of AR pathophysiology finding new procedures for allergic rhinitis immunotherapy

    Keywords: Allergic rhinitis, genetic polymorphisms, single nucleotide polymorphism
  • Zahra Najafi, Mohammad Khalaj Kondori*, MohammadAli Hosseinpour Feizi, Shamsi Abbasaliizadeh
    Background

     Recurrent Pregnancy Loss (RPL) is a multifactorial disease that affects 1-3% of couples. Since Human Leukocyte Antigen-G (HLA-G) gene is involved in fetal maternal immune tolerance, mutations in the HLA-G gene can affect the success rate of pregnancy.

    Objective

     The present study aims to investigate the haplotype effect of rs1736933 and rs2735022 polymorphisms found in the HLA-G gene on the RPL.Methods In this case-control study, participants were 100 women with RPL and 80 women with normal fertility in northwestern Iran. The HLA-G gene promoter was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) method and sequenced. The genotype and allele frequencies of the two polymorphisms were compared between the two groups by using t-test in SPSS software version 22. Haplotype analysis was performed using PHASE 2.1 and Haploview 4.2 applications

    Findings

     C allele and CC genotype in rs2735022 polymorphism and the G allele and GG genotype in rs1736933 polymorphism showed a significant association with the RPL (P<0.05). Frequency of haplotypes AA, AC, GA, GC were 0.72, 0.23, 0.01, 0.03 in patients and 0.39, 0.01, 0.02, 0.59 in the control group (P<0.05). The linkage disequilibrium score was 94.

    Conclusion

     Analysis of GC haplotype in rs2735022 and rs1736933 polymorphisms of the HLA-G gene can be helpful in genetic studies of women with RPL.

    Keywords: Recurrent pregnancy loss, Polymorphism, Haplotype, Human Leukocyte antigen-G
  • زهرا نجفی، محمد خلج کندری*، محمدعلی حسین پور فیضی، شمسی عباسعلیزاده
    سابقه و هدف

    مطالعات حاکی از آن است که HLA-G در حفاظت جنین در برابر سیستم ایمنی مادر نقش دارد و پلی مورفیسم های بالادست این ژن احتمالا با تاثیر بر بیان آن، بر موفقیت حاملگی تاثیر می گذارد. مطالعه حاضر با هدف بررسی همراهی پلی مورفیسم rs1736933 بالا دست ژن HLA-G با اختلال سقط مکرر خودبخودی در جمعیت زنان استان آذربایجان شرقی انجام گرفت.

    مواد و روش ها

    این مطالعه مورد- شاهدی بر روی 80 زن دارای حداقل یک فرزند و بدون هرگونه سابقه سقط و 100 زن دارای حداقل دو سابقه سقط مکرر خودبخودی پس از تایید متخصص زنان و زایمان انجام شد. مقدار 2 میلی لیتر خون از افراد شرکت کننده اخذ و پس از استخراج DNA، بخشی از پروموتر ژن HLA-G توسط PCR تکثیر و به وسیله الکتروفورز روی ژل آگارز بررسی شد. محصولات PCR تعیین توالی و ژنوتیپ افراد مشخص شد. فراوانی های آللی و ژنوتیپی گروه های بیمار و کنترل محاسبه و باهم مقایسه شدند.

    یافته ها

    در این مطالعه فراوانی ژنوتیپ های CC، CA، AA در گروه بیمار به ترتیب 55 و 37 و 8 درصد و در گروه کنترل 37/75 و 41/25 و 20 درصد بدست آمد. مقایسه فراوانی های ژنوتیپی بین دو گروه نشان داد که ژنوتیپ هموزیگوت CC با سقط مکرر همراهی دارد (0/015=p). همچنین، بررسی آماری حاکی از تفاوت معنی دار فراوانی های آللی بین دو گروه بود (0/019=p).

    نتیجه گیری

    نتایج این مطالعه نشان داد که چند شکلی rs1736933 واقع در بالادست ژن  HLA-Gبا بیماری سقط مکرر در جمعیت زنان همراهی دارد.

    کلید واژگان: سقط مکرر, پلی مورفیسم, HLA-G, مطالعات همراهی
    Z .Najafi, M. Khalaj Kondori*, MA. Hosseinpour Feizi, Sh .Abbasaliizadeh
    BACKGROUND AND OBJECTIVE

    Studies have suggested that HLA-G is involved in protecting the fetus against the motherchr('39')s immune system, and upstream polymorphisms of this gene may influence pregnancy success by effecting its expression. The aim of this study was to evaluate the association of upstream HLA-G gene polymorphism, rs1736933, with recurrent spontaneous abortion in East Azerbaijan women population.

    METHODS

    This case-control study was performed on 80 women with at least one child and without any history of abortion, and 100 women with at least two recurrent spontaneous abortions which were diagnosed by gynecologist. 2 ml of blood was obtained from the participants and after DNA extraction, a segment of the HLA-G gene promoter was amplified by PCR and analyzed by agarose gel electrophoresis. PCR products were sequenced and genotyped. Allelic and genotypic frequencies of patient and control groups were compared.

    FINDINGS

    Frequency of AA, CA, CC genotypes in the patient group were 8(8%), 37(37%), 55(55%) and in the control group were 16(20%), 33(41.25%), 31(38.75%) respectively. Comparison of genotypic frequencies between the two groups showed that CC homozygous genotype was associated with recurrent abortion (p= 0.015). Statistical analysis also showed a significant difference between the allelic frequencies of the two groups (p= 0.019).

    CONCLUSION

    The results of this study showed that the upstream HLA-G gene polymorphism, rs1736933, is associated with the recurrent abortion in East Azerbaijan women population.

    Keywords: Recurrent Abortion, Polymorphism, HLA-G, Association Studies
  • نگین راعی، رضا صفرعلیزاده*، محمدعلی حسینپورفیضی، سعید لطیفی نوید، عباس یزدانبد، فرهاد پورفرضی
    Negin Raei, Reza Safaralizadeh*, Mohammad Ali Hessein Pour Feizi, Saeid Latifi Navid, Abbas Yazdanbod, Farhad Pourfarzi

    related deaths worldwide. Aberrant expression of long non-coding RNAs (lncRNAs) plays a crucial role in the development of GC. These molecules take part in various biological processes such as apoptosis, invasion, cell death markers, reprogramming of pluripotent stem cells, and genomic imprinting, which show that lncRNAs play an essential role in eukaryotic gene expression. LncRNAs interact with epigenetic factors including DNA methylases, histone modifiers, miRNAs, and chromatin remodeling complex, which lead to altered gene expression and cancer progression. Because the symptoms of GC usually develop in advanced stages, it is important to identify factors that are of clinical value for early diagnosis and prognosis of the disease. Therefore, in this review article, lncRNAs whose expression levels are increased in GC tissue and by interacting with epigenetic factors may be involved in the development of GC are discussed.

    Keywords: LncRNA, epigenetic, and gastric cancer
  • زینب شقاقی ترکداری، محمد خلج کندری*، محمد علی حسینپور فیضی
    مقدمه

    سرطان پستان دومین عامل مرگ و میر ناشی از سرطان در بین زنان است که نیازمند مطالعه مارکرها برای ارایه گروه‏بندی ویژه از این سرطان می‏ باشد. یافته‏ ها نشان می‏ دهد که lncRNA‏ها به عنوان زیر مجموعه اصلی رونوشت‏ های غیرکدکننده در پروسه‏ های تومورزایی دخیل می‏باشند. ما در این مطالعه بیان FER1L4 و ژن هدف آن در شبکه ceRNA، کورپرسور رونویسی RB 1 (RB1)، را در 61 نمونه بافتی سرطان پستان از نوع کارسینومای داکتال (غیر تهاجمی و درجا) و بافت غیرتوموری مجاورش مطالعه کردیم. همچنین ارتباط FER1L4 و ژن RB1 با ویژگی‏ های مختلف بالینی بیماران مورد بررسی قرار گرفت.

    روش بررسی

    بیان ژن ‏های مذکور با استفاده از روش  Real time PCRدر 61 نمونه مربوط به کارسینومای داکتال (غیرتهاجمی و درجا) پستان در مقایسه با بافت‏های غیرتوموری مجاور آنها در یک گروه از بیماران مبتلا به سرطان پستان بررسی شد و نتایج حاصل با روش آماری ANOVA و T-test مورد آنالیز قرار گرفت.

    یافته‏ ها:

    نتایج نشان داد که FER1L4 تفاوت معنی‏داری بین نمونه ‏های توموری در مقایسه با بافت‏های غیر توموری مجاورشان نداشت در حالیکه ژن RB1 در بافت‏های سرطانی کاهش بیان معنی‏داری داشته است (P=0.008). علاوه بر این نتایج نشان می‏دهد که افزایش بیان FER1L4 و برعکس کاهش بیان RB1 به طور معنی‏ داری با وجود متاستاز در غدد لنفاوی بیماران ارتباط دارد (P<0.05).

    نتیجه‏ گیری:

    برخلاف مطالعات پیشین، در مطالعه ما افزایش معنی‏ داری از FER1L4 در سرطان پستان یافت نشد ولی با این حال بیان ژن RB1 به صورت معنی ‏داری کاهش یافته است.

    کلید واژگان: FER1L4 lncRNA, سرطان پستان, RB1, شبکه ceRNA
    Zeinab Shaghaghi Torkdari, Mohammad Khalaj, Kondori*, Mohammad Ali Hosseinpour Feizi
    Introduction

    Breast cancer is the second most common cause of cancer-related death among females, which requires an exploration for markers to propose a more specific categorization of this cancer. Long noncoding RNAs (lncRNAs), the main subset of noncoding transcripts, are involved in tumorigenic processes. In this study, we investigated the expression of the fer- 1– like family member 4 (FER1L4) lncRNA and its competitive endogenous RNA network target gene, RB transcriptional corepressor 1 (RB1), in ductal carcinoma (invasive and in situ) tissue and its adjacent noncancerous tissue (ANCT). Furthermore, associations of FER1L4 and RB1 with various clinical features of the patients were analyzed.

    Methods

    Quantitative real-time PCR was used to measure the expression of the mentioned genes in 61 samples of ductal carcinoma and their ANCTs, and the data were analyzed using ANOVA and t tests.

    Results

    FER1L expression was not significantly different in breast tumor samples compared with their ANCT samples, while RB1 showed significant downregulation in tumor tissues (P = 0.008). In addition, increased expression of FER1L4 and decreased RB1 expression were significantly correlated with lymph node metastasis in breast cancer patients (P < 0.05).

    Conclusion

    FER1L4 is not upregulated in breast cancer tissue. However, RB1 expression is significantly downregulated.

    Keywords: lncRNA FER1L4, Breast Cancer, RB1, ceRNA Network
  • ریحانه روانبخش گاوگانی، اسماعیل بابایی*، محمد علی حسینپور فیضی، وحید منتظری
    زمینه و هدف

    سرطان پستان شایع ترین بدخبمی در میان زنان جهان می باشد. مطالعات گروه جدیدی از RNAهای غیر کدکننده به نام RNAهای غیر کدکننده طویل را شناسایی کرده اند که نقش مهمی در ایجاد، گسترش و متاستاز سرطان ایفا می کنند. بنابراین هدف از مطالعه حاضر شناسایی و ارزیابی بیان RNAغیرکدکننده طویل جدید lncUSMycN در سرطان پستان می باشد.

    مواد و روش ها

    در این مطالعه 40 بافت توموری کارسینومای تهاجمی مجاری پستان و 40 بافت سالم اطراف تومور جمع آوری شد و پس از استخراج RNA تام با استفاده از کیت ترایزول، سنتز cDNA صورت گرفت. با استفاده از روش qRT-PCR سطح بیان lncUSMycN در نمونه ها بدست آمد. برای برررسی ارتباط بیان در بافت های توموری نسبت به اطراف سالم آنها، از نرم افزار REST استفاده شد. توان بیومارکری آن نیز با استفاده از نرم افزار SigmaPlot و با رسم منحنی ROC ارزیابی شد. علاوه براین، ارتباط بیان lncUSMycN با ویژگی های کلینیکوپاتولوژیکی نیز مورد بررسی قرار گرفت.

    یافته ها

    نتایج حاصل از نرم افزار REST افزایش معنی دار بیان lncUSMycN را در بافت های توموری نسبت به حاشیه سالم مجاور آنها نشان داد (001/0 =p، CI 95%(. آنالیز منحنی ROC توان بیومارکری lncUSMycN را ثابت کرد (001/0 =p، 72/0= ROCAUC). نتایج بررسی بیان lncUSMycN با ویژگی های کلینیکوپاتولوژیکی نشان داد که بین بیان این lncRNA با مراحل اولیه تومور (005/0 =p، CI 95%(و تومورهای با درجه تمایز بهتر (046/0 =p، CI 95%(ارتباط معنی داری وجود دارد.

    نتیجه گیری

    با توجه به افزایش بیان lncUSMycN در کارسینومای تهاجمی مجاری پستان، بیان این RNA غیرکدکننده طویل می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی بالقوه جدید در سرطان پستان مطرح شود.

    کلید واژگان: کارسینومای تهاجمی مجاری, RNA غیرکدکننده طویل, lncUSMycN, بیومارکر
    Reyhaneh Ravanbakhsh Gavgani, Esmaeil Babaei*, Mohammad Ali Hosseinpourfeizi, Vahid Montazeri
    Introduction

    Breast cancer is the most common tumor malignancy among women worldwide. Studies have revealed new class of RNA molecules named Long non-coding RNAs that play important role in tumor development, progression and metastasis. Therefore, this study aimed to evaluate long non-coding RNA lncUSMycN expression in breast cancer.

    Methods

    In this study, 40 breast tumor with invasive ductal carcinoma and 40 normal marginal tissues were collected and after RNA extraction using TRizol kit, cDNA was synthesized. Expression level of lncUSMycN was obtained by applying qRT-PCR method. In order to evaluate association of lncUSMycN expression in tumor compared to normal tissues REST software was used. Biomarker potential of lncUSMycN was evaluated by drawing ROC curve using SigmaPlot. In addition, relationship between lncUSMycN expression and clinicopathological features was analysed.

    Results

    Results from REST indicated significant upregulation of lncUSMycN in tumor tissues compared to normal marginal specimens (95% CI, p =0.001). ROC curve analysis demonstrated the biomarker potential of lncUSMycN (ROCAUC =0.72, p=0.0006). Evaluation of the relationship between lncUSMycN expression and clinicopathological features revealed that there are significant association between lncUSMycN expression and early stages (95% CI, P=0.005) and well-differentiated tumors (95% CI, P=0.046).

    Conclusion

    Considering upregulation of lncUSMycN expression in invasive ductal carcinoma this lncRNA may be probably considered as a new potential diagnostic biomarker for breast cancer.

    Keywords: breast invasive ductal carcinoma, long non-coding RNA, lncUSMycN, Biomarker
  • ریحانه روانبخش گاوگانی، اسماعیل بابایی *، محمدعلی حسین پور فیضی، اشرف فخرجو، وحید منتظری
    اهداف

    علی رغم پیشرفت های اخیر در زمینه تشخیص و درمان، سرطان پستان همچنان دومین عامل مرگ مرتبط با سرطان در میان زنان جهان است. گزارش های اخیر، گروه جدیدی از مولکول های غیرکدکننده به نام RNAهای غیرکدکننده طویل را شناسایی کرده اند که نقش مهمی را در فرآیندهای بیولوژیکی متعدد درگیر در سرطان ایفا می کنند. هدف از این مطالعه، ارزیابی بیان RNA غیرکدکننده طویل HULC در سرطان پستان بود.

    مواد و روش ها:

    در مطالعه تجربی حاضر، پس از جمع آوری 40 نمونه بافت توموری کارسینومای تهاجمی مجاری پستان و 40 بافت سالم حاشیه تومور، استخراج RNA و سنتز cDNA صورت گرفت. با استفاده از PCR کمی، سطح بیان HULC در نمونه ها به دست آمد. از نرم افزار REST 2009 به منظور برررسی ارتباط بیان آن در بافت های توموری و بافت های سالم، استفاده شد. توان بیومارکری HULC نیز با رسم منحنی ROC ارزیابی شد. ارتباط بیان HULC با ویژگی های کلینیکوپاتولوژیکی نیز مورد بررسی قرار گرفت.

    یافته ها:

    نتایج حاصل از نرم افزار REST افزایش معنی دار بیان HULC را در بافت های توموری نسبت به حاشیه سالم آنها نشان داد (0/0001=p؛ CI 95%). آنالیز منحنی ROC نیز توان بیومارکری HULC را در سرطان پستان ثابت کرد (0/0001>p؛ 0/79=ROCAUC). نتایج بررسی بیان HULC با ویژگی های کلینیکوپاتولوژیکی نشان داد که بین بیان HULC با مراحل پیشرفته تومور رابطه مثبت معنی داری وجود دارد (0/019=p؛ CI 95%).

    نتیجه گیری:

    با توجه به افزایش بیان HULC در کارسینومای تهاجمی مجاری پستان، بیان این RNA غیرکدکننده طویل می تواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی بالقوه جدید در سرطان پستان مطرح شود.

    کلید واژگان: کارسینومای تهاجمی مجاری, RNA غیرکد کننده طویل, HULC, بیومارکرها
    R. Ravanbakhsh Gavgani, E. Babaei *, M.A. Hosseinpourfeizi, A. Fakhrjou, V. Montazeri
    Aims

     Despite recent advances in diagnosis and treatment, breast cancer still remains the second leading cause of cancer- related death in women. Recent reports have detected a new class of non-coding molecules named long non-coding RNAs that play an important role in various biological processes involved in cancer. This study aimed to evaluate the expression level of long non-coding RNA HULC in breast cancer.

    Materials & Methods

     In this experimental study, after collecting 40 breast tumors with invasive ductal carcinoma and 40 normal marginal tissues, RNA extraction and cDNA synthesis were done. The expression level of HULC was obtained by using the qRT-PCR method. REST 2009 software was employed to evaluate the association of its expression in tumor and normal tissues. Biomarker potential of HULC was evaluated by drawing ROC curve. Relationship between HULC expression and clinicopathological features was analyzed.

    Results

     Results from REST indicated significant upregulation of HULC in tumor tissues compared to normal marginal specimens (95% CI; p=0.0001). ROC curve analysis also demonstrated the biomarker potential of HULC in breast cancer (ROCAUC=0.79; p<0.0001). Evaluation of the relationship between HULC expression and clinicopathological features revealed that there is a statistically significant positive correlation of HULC expression with advanced stages (95% CI; P=0.019).

    Conclusion

     Considering the upregulation of HULC expression in invasive ductal carcinoma, this lncRNA could be considered as a new potential diagnostic biomarker in breast cancer.

    Keywords: Invasive Ductal Carcinoma, Long Non-Coding RNA, HULC, Biomarkers
  • آسیه جبلی، محمد خلج کندری*، مرتضی بنیادی، محمدعلی حسین پور فیضی، محمد رحمتی یامچی
    سابقه و هدف
    در گذشته، از کندر به عنوان عطر و بخور و در درمان بیماری های مختلف استفاده می‎شد. امروزه، مشخص شده است کندر بر بهبود حافظه و درمان/پیشگیری بیماری آلزایمر نیز تاثیر می گذارد. ژن CaMKIIα به علت دخالت داشتن در فرآیندهای سلولی مرتبط با حافظه، تحت عنوان حافظه مولکولی نامیده می شود. بنابراین، هدف مطالعه حاضر بررسی تاثیر عصاره اتانولی کندر بر بیان ژن CaMKIIα در سلول های B65 و PC12 می باشد.
    مواد و روش ها
    برای تعیین تاثیر عصاره در زیستایی سلول ها، از آزمون MTT استفاده شد و سلول ها در غلظت ها و زمان های متفاوت با عصاره تیمار شدند. جهت مطالعه بیان ژن، سلول ها با دو غلظت عصاره و در چهار بازه زمانی تیمار شدند. سپس RNA استخراج شده، cDNA سنتز شد و میزان بیان CaMKIIα توسط qPCRبررسی شد.
    یافته ها
    نتایج واکنشqPCR نشان داد که کندر بیان CaMKIIα را در سلول های B65 با پیشرفت زمان به طور متناوب افزایش و کاهش می دهد. با این وجود، عصاره نتوانست بیان این ژن را در سلول های PC12 القا کند.
    استنتاج
    با توجه به اهمیت CaMKIIα به عنوان حافظه مولکولی و تاثیر مثبت کندر در تقویت حافظه، نتایج این مطالعه می تواند گامی در جهت شناخت بیش تر مکانیسم های مولکولی تاثیر کندر در تقویت حافظه باشد.
    کلید واژگان: کندر, حافظه, ژنCaMKII?
    Asiyeh Jebelli, Mohammad Khalaj, Kondori *, Mortaza Bonyadi, Mohammad Ali Hosseinpour Feizi, Mohammad Rahmati, Yamchi
    Background and purpose
    In the past, olibanum was used as an incense and perfume and a remedy for treating various diseases. Now, it is confirmed that olibanum improves memory and has a role in treatment and prevention of Alzheimer disease. CaMKIIα gene is known as molecular memory because of its role in cellular processes associated with memory. The aim of this research was to study the effect of ethanolic extract of olibanum on the expression of CaMKIIα in B65 and PC12 cells.
    Materials and methods
    To determine the effect of olibanum on cell viability, MTT assay was done and cells were treated with the extract in different concentrations and times. To study the gene expression, the cells were treated by two concentrations of the extract at four time points. Then, RNA was extracted, cDNA was synthesized, and the expression of CaMKIIα was quantified by qPCR.
    Results
    The qPCR data revealed that olibanum alternately changed the expression of CaMKIIα in a reducing and increasing pattern over time in B65 cells. However, the extract could not induce the expression of this gene in PC12 cells.
    Conclusion
    According to the role of CaMKIIα as molecular memory and the positive effect of olibanum in memory improvement, current results could be helpful in understanding the molecular mechanisms by which olibanum affects memory performance.
    Keywords: olibanum, memory, CaMKII? gene
  • آی سان زینل زاده تبریزی، اسماعیل بابایی*، محمدعلی حسین پور فیضی
     
    مقدمه
    سرطان پستان شایع ترین بدخیمی در زنان می باشد که باعث مرگ و میر بالائی در افراد مبتلا می شود. شناسائی مارکرهای مولکولی توموری سیال در خون می تواند به عنوان راهکار غیر تهاجمی در تشخیص زودهنگام و پیش آگهی در نظر گرفته شود. هدف از مطالعه حاضر، بررسی وجود RNA ژن PRNCR1 در پلاسمای بیماران مبتلا به سرطان پستان و ارزیابی میزان بیان آن نسبت به نمونه های غیر توموری بود.
    مواد و روش ها
    نمونه های خون از 32 بیمار سرطان پستان و 25 خانم سالم گرفته شده و از پلاسمای آن ها RNA استخراج گردید. سپس، حضور کمیRNA ژن Lnc-PRNCR1 در پلاسما توسط تکنیک real-time PCR ارزیابی شد. هم چنین، میزان بیان این ژن نسبت به ویژگی های کلینیکی-پاتولوژیکی بیماران نیز مورد مطالعه قرار گرفت. آنالیز آماری داده ها توسط آزمون t-test انجام شد.
    یافته های پژوهش: نتایج نشان داد که ژن PRNCR1 در پلاسمای خون بیماران سرطانی قابل ردیابی است. بیان این ژن در نمونه های توموری نسبت به پلاسماهای سالم افزایش معنی داری نشان داد (P<0. 05). با این حال، داده های آماری نشان داد که بیان PRNCR1 در نمونه های توموری نسبت به ویژگی های کلینیکی-پاتولوژیکی از جمله سایز تومور، سن بیمار و درگیری گره های لنفاوی تفاوت معنی داری ندارد (P>0. 05).
    بحث و نتیجه گیری
    نتایج به دست آمده نشان داد که ژن lnc-PRNCR1 سیال در پلاسما می تواند برای تمیز افراد مبتلا به کارسینومای پستان تهاجمی از نمونه های سالم به کار گرفته شود. با این حال، مطالعات بیشتری جهت مشخص کردن نقش تومورزایی lncRNA PRNCR1 در پستان باید انجام شود.
    کلید واژگان: Long noncoding RNA, PRNCR1, سرطان پستان, Real-Time PCR
    Aysan Zeynalzadeh tabrizi, Esmaeil Babaei*, Mohammad Ali Hoseinpour Feizi
     
    Introduction
    Breast cancer is the most common malignancy in women, causing high mortality in the affected patients. The identification of circulating tumor biomarkers in blood could be considered as non-invasive strategy for early diagnosis and prognosis. The aim of this study was to investigate the presence of PRNCR1 (prostate cancer associated non-coding RNA 1) gene in the plasma of patients with breast cancer and to evaluate its expression compared to the normal ones.
    Materials & Methods
    This study was carried out on the 32 blood samples from breast cancer patients and 25 ones from healthy women. The RNA was extracted from the plasma of the samples. Subsequently, the presence of RNA of PRNCR1 gene in plasma of patients was quantitatively evaluated by a real-time polymerase chain reaction (Real-Time PCR). Moreover, the expression of PRNCR1 gene was studied in terms of clinico-pathological characteristics of patients. The statistical analysis of data was performed in SPSS software using t-test.
    Findings
    The results showed that the PRNCR1 gene could be detected in the plasma of cancer patients. The obtained results indicated significantly higher expression in tumor samples, compared to the healthy ones (P<0.05). However, statistical data showed that the expression of PRNCR1 gene in tumor samples does not have any significant correlation with clinical-pathological characteristics, including tumor size, age, and lymph node involvement (P>0.5). Discussion &
    Conclusions
    The data demonstrated that circulating non-coding PRNCR1 of plasma could be used in the discrimination of breast invasive ductal carcinomas from those of normal people. However, more studies should be conducted to determine the tumorigenic role of lncRNA PRNCR1.
    Keywords: PRNCR1, Long noncoding RNA, Breast cancer, real-time PCR
  • آسیه جبلی، محمد خلج کندری*، مرتضی بنیادی، محمدعلی حسین پور فیضی، محمد رحمتی یامچی
    زمینه و هدف
    حافظه بلندمدت وابسته به سنتز پروتئین می باشد. محصول ژن Camkiv با فعال کردن پروتئین های حافظه، آن را تقویت می کند. تیمار حیوانات آزمایشگاهی نیز با کندر منجر به تقویت حافظه و بهبود آلزایمر می شود. بنابراین، هدف این مطالعه بررسی تاثیر عصاره الکلی کندر در بیان Camkiv در سلول های PC12 می باشد.
    مواد و روش ها
    سمیت کندر بر زیستایی سلول ها با آزمون MTT بررسی شد. سلول ها با غلظت های 10 ، 25، 40، 55، 70 و 85 میکروگرم/میلی لیتر عصاره در بازه های زمانی 12، 24، 48 و 72 ساعت تیمار شده و میزان جذب آن ها اندازه گیری شد. سپس، سلول ها با غلظت های 2 و 20 میکروگرم/میلی لیتر عصاره در زمان های فوق تیمار شدند. RNA استخراج شده به cDNA تبدیل شد و واکنش real-time PCR انجام یافت.
    نتایج
    مرگ سلولی با افزایش زمان و غلظت تیمار با عصاره افزایش یافت. مقادیر IC50 به‎دست آمده برای تیمارهای 12، 24، 48 و 72 ساعت به ترتیب برابر با 71. 01، 52. 95، 21. 05 و 13. 85 میکروگرم/میلی لیتر بود. علاوه براین، غلظت های 2 و 20 میکروگرم/میلی لیتر عصاره، 24 ساعت پس از تیمار منجر به افزایش معنی دار بیان Camkiv شد. در تیمار 48 ساعت، حداکثر بیان Camkiv مشاهده شد. تاثیر کندر در افزایش بیان ژن تا 72 ساعت پایدار بود.
    نتیجه گیری
    عصاره الکلی کندر می تواند بیان Camkiv را به طور قابل توجه و طولانی مدت افزایش دهد. این نتایج در راستای مطالعات قبلی می باشد که نشان دادند کندر بیان Bdnf، ژن پایین دست Camkiv، را افزایش می دهد. بااین وجود، با توجه به وجود مسیر دوطرفه در تنظیم بیان Bdnf و Camkiv نیاز به مطالعات جامع تری برای شناخت مکانیسم دقیق عملکرد کندر در مغز می باشد.
    کلید واژگان: عصاره الکلی کندر, ژن Camkiv, سلول های PC1
    Asiyeh Jebelli, Mohammad Khalaj, Kondori *, Mortaza Bonyadi, Mohammad Ali Hosseinpour Feizi, Mohammad Rahmati, Yamchi
    Background & Objective
    Long-term memory depends on protein synthesis. The product of Camkiv gene promotes memory via activating its proteins. The treatment of laboratory animals by Olibanum leads to memory improvement and the recovery of Alzheimer. Therefore, the aim of this study is the evaluation of Olibanum ethanolic extract on the Camkiv expression in PC12 cells.
    Materials & Methods
    Olibanum toxicity on the cell viability was investigated by MTT test. Cells were treated with concentrations 10,25,40,55,70 and 85 μg/ml of extract in time intervals 12,24,48 and 72 hours and their absorption rate was measured. Then, cells were treated by concentrations 2 and 20 μg/ml of extract in mentioned times. Extracted RNA was converted into cDNA and real-time PCR performed.
    Results
    Cell death was raised by increasing time and concentration of extract treatment. IC50 values were obtained as 71.01, 52.95, 21.05 and 13.85 μg/ml in 12, 24, 48 and 72 hours of treatment, respectively. Besides, concentrations 2 and 20 μg/ml significantly increased Camkiv expression following 24 hour treatment. The maximum expression of Camkiv was observed in 48 hour treatment. The effect of Olibanum on gene upregulation was stable until 72 hours.
    Conclusion
    The Olibanum ethanolic extract can remarkably upregulate Camkiv expression for a long time. These results are consistent with the previous studies indicating the effect of Olibanum on upregulation of Bdnf, Camkiv -downstream gene. However, regarding the existence of the two-direction pathway in the expression regulation of Bdnf and Camkiv , comprehensive studies are required to determine exact mechanism of Olibanum function in the brain.
    Keywords: Olibanum ethanolic extract, Camkiv gene, PC12 cells
  • فائزه امینی سپهر، اسماعیل بابائی*، محمدعلی حسینپورفیضی

    آشکار سازی microRNA های اختصاصی تومور در خون بیماران سرطانی می تواند بیومارکرهای با ارزشی را برای تشخیص و درمان معرفی نماید. هدف از مطالعه حاضر، تحقیق پتانسیل مارکری سطوح پلاسمایی 4270-miR برای کارسینومای تهاجمی مجاری پستان بود. در مجموع، 40 نمونه از بیماران سرطانی و 28 نمونه کنترل در این مطالعه استفاده شد. RNA کل از نمونه ها استخراج شده و بیان 4270-miR توسط PCR Time-Real ارزیابی شد. همچنین، ارتباط بین بیان 4270-miR و یافته های کلینیکوپاتولوژیکی مورد ارزیابی قرار گرفت. داده های ما نشان داد که بیان 4270-miR به صورت معنی داری در نمونه های توموری نسبت به نمونه های کنترل افرایش می یابد (00.0=value-p)علاوه براین، آنالیز داده ها نشان داد که بین سطح پایین 4270-miR پلاسما و اندازه تومور، درگیری گره های لنفاوری و سطوح بالای بدخیمی ارتباط وجود دارد. سطح زیر منحنی ROC بیانگر آن بود که 4270-miR توانایی تمایز پلاسماهای توموری را از نمونه های غیر توموری ندارد. یافته های حاضر، اطلاعات اولیه را در مورد پروفیل بیانی 4270-miR در پلاسمای بیماران سرطان پستان نشان می دهد. با این حال، مطالعات بیشتری برای آشکارسازی نقش 4270-miR در کارسینومای مجرایی پستان باید انجام شود.

    کلید واژگان: microRNA سیال, 4270-miR, سرطان پستان, Real-Time PCR
    Faezeh Aminisepehr, Esmaeil Babaei *, Mohammad Ali Hosseinpour Feizi

    Detection of tumor-specific microRNAs (miRs) in the blood of cancer patients may provide a unique and valuable biomarker for diagnosis and prognosis. The aim of this study was to investigate whether plasma levels of microRNA-4270 could serve as a potential marker for breast invasive ductal carcinoma. A total of 40 breast cancer patients and 28 controls were recruited in this study. Total RNA was extracted from plasma samples andmiR-4270 expression was evaluated by real-time polymerase chain reaction (PCR). The correlation between miR-4270 expression and clinicopathological characteristics were also studied. Our data showed that plasma miR-4270 is significantly up-regulated in patients compared to control group (P-value=0.00). In addition, data analysis illustrated a correlation between low plasma levels of miR-4270 and larger tumor size, lymph node metastasis and higher stages of malignancy (P-value > 0.05). The area under the curve of the ROC revealed thatmiR-4270 expression was not able to distinguish between tumor plasmas and nontumoral specimens. Current work shows preliminary data on the expression profile of-4270 in plasma of breast cancer patients. However, further studies are required to fully elucidate the role of circulating mix-4270 in breast ductal carcinoma.

    Keywords: Circulating microRNA, miR-4270, Breast cancer, Real-Time PCR
  • محمدعلی حسین پورفیضی، سولماز دیانتی، اکبر ثمیر، نرگس دستمالچی، ناصر پولادی *
    سرطان پستان رایج ترین سرطان در زنان است که با تغییرات ژنتیکی مانند جهش در ژن های سرطان زا و ژن های سرکوب گر تومور مرتبط می باشد. از مهم ترین ژن های سرکوب گر تومور درگیر در سرطان پستان، ژن BRCA1 می باشد. جهش در این ژن، رویداد شایعی در سرطان پستان انسانی می باشد. هدف از تحقیق حاضر، بررسی جهش های اگزون BRCA1 11-A در زنان مبتلاء به سرطان پستان در جمعیت شمال غرب ایران می باشد.
    در این مطالعه توصیفی، از 40 بیمار مبتلاء به سرطان پستان که سن تشخیص چهل سال و پایین تر دارند، نمونه خونی دریافت و اگزون 11-A ژن BRCA1 با استفاده از روش های PCR و توالی یابی مستقیم برای شناسایی جهش ها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج توالی یابی با استفاده از نرم افزار Chromas بررسی گردید.
    در مطالعه حاضر، یک جهش غیر مترادف (nonsynonymous) به عنوان جهش جدید ژن BRCA1 و برای اولین بار گزارش گردید: جهش Ala584Thr نیز در دو نمونه مشاهده شد. جهش های کدون 694 (Ser694Ser) شیوع بیشتری (52/5%) نشان داد. سایر جهش ها در کدون های 693، 356، 486، 550 و 628 مشاهده گردید.
    کلید واژگان: سرطان پستان, BRCA1, اگزون 11- A, جهش
    Ma Hosseinpourfeizi, S. Dianati, A. Samir, N. Dastmalchi, N. Pouladi *
    Background And Objective
    Breast cancer is the most common cancer in women, which is associated with genetic changes such as mutations in carcinogenic genes and tumor suppressor genes. One of the most important tumor suppressor genes involved in breast cancer is the BRCA1 gene. The mutation in this gene is a common occurrence in human breast cancer. The purpose of this study is to investigate the mutations of exon 11-A of BRCA1 gene in women with breast cancer in the northwest of Iran.
    Methods
    In this descriptive study, blood sample were collected form 40 patients with breast cancer whose cancer was diagnosed before the age of 40 years and the exon 11-A of BRCA1 gene was examined using PCR and direct sequencing methods to detect mutations. Sequencing results were analyzed using Chromas software.
    FINDING: In the present study, a nonsynonymous mutation was reported as a new mutation of BRCA1 gene for the first time: Ala584Thr mutation was also observed in two samples. The mutations of codon 694 (Ser694Ser) showed a higher incidence (52.5%). Other mutations were observed in codons 693, 356, 486, 550 and 628.
    Conclusion
    Based on the results of this study, mutations and polymorphisms of exon 11 of BRCA1 gene were observed for the first time in the northwestern population of Iran. One new case of mutation was observed in exon 11-A of BRCA1 gene.
    Keywords: Breast cancer, BRCA1, Exon 11-A, mutation
  • الهه سلیمانپور، اسماعیل بابایی، محمدعلی حسینپورفیضی*، وحید منتظری
    زمینه و هدف
    سرطان پستان ازجمله رایج ترین انواع بدخیمی ها است که منجر به مرگ ومیر زنان مبتلا به ویژه در کشورهای صنعتی می شود. مطالعات اخیر نشان می دهند که مولکول های RNA غیرکدکننده با تاثیر بر ژن های هدف در بروز، پیشرفت تومور و همچنین مقاومت به درمان نقش مهمی را ایفا می کنند. RNA غیرکدکننده سرطان پروستات (PRNCR1)، RNA غیرکدکننده بلندی است که در برخی سرطان ها بیان بالایی دارد و این افزایش بیان، با تاثیر بر ژن های زیردست گیرنده آندروژن منجر به سرطان زایی می شود. هدف از این تحقیق بررسی تغییرات بیانی PRNCR1 در سرطان پستان است.
    مواد و روش ها
    در این تحقیق 30 نمونه بافت توموری و بافت غیر توموری حاشیه تومور از زنان مبتلا به سرطان پستان در محدوده زمانی سال 94-93 از استان آذربایجان شرقی جمع آوری و تغییرات بیانی PRNCR1 با استفاده از qReal-Time PCR موردمطالعه قرار گرفت. آنالیزهای آماری (t-test) جهت مطالعه ارتباط بین تغییر بیان PRNCR1 با خصوصیات کلینیکوپاتولوژیکی نمونه های توموری صورت پذیرفت.
    نتایج
    داده های حاصل حاکی از افزایش معنی دار بیان PRNCR1 در نمونه های بافت توموری پستان در مقابل بافت نرمال حاشیه تومور بود. همچنین بررسی خصوصیات کلینیکوپاتولوژیکی نشان داد که افزایش بیان PRNCR1 در سرطان پستان با افزایش سایز تومور و متاستاز گره های لنفاوی ارتباط مثبت و معنی داری دارد (05/0P<).
    نتیجه گیری
    نتایج حاصل از این مطالعه، نشان داد که PRNCR1 تغییرات بیان قابل توجهی در سرطان پستان دارد. با توجه به تاثیر آن در کنترل ژن های زیردست گیرنده آندروژن، می تواند به عنوان یک هدف درمانی مناسب در سرطان پستان پیشنهاد شود. هرچند بررسی های جامع تر در این زمینه موردنیاز است.
    کلید واژگان: سرطان پستان, RNA بلند غیرکدکننده, گیرنده آندروژن, PRNCR1
    Elaheh Soleimanpour, Esmaeil Babaei, Mohammadali Hosseinpourfeizi *, Vahid Montazeri
    Background and Objective
    Breast cancer is one of the most common malignancies leading to death in women especially in industrial countries. Recent studies revealed that noncoding RNAs play important roles in various cellular activities such as tumor initiation, progression, and resistance to therapy. PRNCR1 is a long noncoding RNA that upregulates in some cancers and through androgen receptor signaling causes carcinogenesis. The aim of this study was to evaluate the expression pattern of PRNCR1 in breast cancer patients.
    Material &
    Methods
    In the present study, 30 breast tumor specimens and paired adjacent nontumoral tissues were collected from breast cancer women from East Azarbaijan province during the period of 2014-2015 and the expression level of PRNCR1 was evaluated using qRT-PCR. Also, the statistical analysis (t-test) was performed to examine the association between PRNCR1 and clinic-pathologic characteristics of tumor samples.
    Results
    The data revealed that PRNCR1 significantly upregulates in breast tumor tissues compared to the paired adjacent normal tissues. Moreover, overexpression of PRNCR1 in breast tumor tissues was significantly related to tumor size and lymph node metastasis (P
    Conclusion
    The results revealed that PRNCR1 significantly dysregulates in breast cancer. Considering its effect on downstream pathways of androgen receptor, suggesting that it might be used as a therapeutic agent, although further studies are required.
    Keywords: Breast cancer, long noncoding RNA, androgen receptor, PRNCR1
  • سونیا فریدی، نرگس زینال زاده*، محمد علی حسینپور فیضی، ناصر پولادی
    زمینه و هدف
    سرطان سینه یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان زنان ایرانی است. پروتئین RAD51 انسانی، نقشی مرکزی در ترمیم نوترکیبی همولوگ شکست های دو رشته ای DNA ایفا می کند و برای حفظ ثبات ژنوم ضروری است. اخیرا نشان داده شده است که یک چندشکلی تک نوکلئوتید (SNP) در منطقه ′5 غیر کدشونده ی ژن RAD51 (RAD51 135G˃C) خطر ابتلا به سرطان سینه را تغییر می دهد. هدف مطالعه حاضر، یافتن رابطه ی SNP مذکور با خطر ابتلا به سرطان سینه در میان زنان ترکی-آذری ایرانی است.
    مواد و روش ها
    این مطالعه بر روی 127 بیمار مبتلا به سرطان سینه و 125 نمونه ی شاهد انجام شد. DNA ژنومی با استفاده از روش استاندارد استخراج و چندشکلی RAD51 135G>C با استفاده از روش PCR مبتنی بر چند شکلی طولی قطعات برشی، مشخص گردید. ژنوتیپ ها با انجام توالی یابی تایید شدند و نهایتا نتایج مورد بررسی آماری قرار گرفتند.
    یافته ها
    فراوانی ژنوتیپ های CC، CG و GGچندشکلی G>C 135 ژن RAD51 در گروه شاهد به ترتیب 1.61%، 20.16٪ و 78.22٪ و در افراد بیمار به ترتیب 2.36٪، 24.40٪ و 73.22٪ بودند. بررسی آماری نتایج نشان داد که بین گروه های بیمار و شاهد تفاوت معنی داری وجود ندارد.
    نتیجه گیری
    نتایج مطالعه حاضر حاکی از آن بود که بین چندشکلی G>C 135 ژن RAD51 با خطر ابتلا به سرطان سینه در جمعیت آذری ایرانی همراهی وجود ندارد.
    کلید واژگان: سرطان سینه, چندشکلی RAD51 135G>C, ترکی, آذری, ایران
    Sonia Faridi, Narges Zeinal Zadeh *
    Background And Objective
    Breast cancer is one of the main causes of death among Iranian women. Human RAD51 protein, play a central role in homologous recombination repair of double-stranded DNA breaks and is essential for maintaining genomic stability. A single nucleotide polymorphism in the 5′-untranslated region of RAD51 gene (RAD51 135G˃C) is reported to modulate breast cancer risk. The aim of this study was to find out the relationship of this SNP with breast cancer risk among Iranian Azeri Turkish women.
    Materials And Methods
    This case-control study was performed on 127 breast cancer cases and 125 controls. Genomic DNA was extracted and the RAD51 135G > C genotype was determined using a PCR–Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) based assay and confirmed by sequencing. The results were analyzed statistically.
    Results
    The frequencies of CC, CG and GG genotypes of RAD51 135G˃C were 1.613%, 20.161% and 78.225% in control group and 2.362%, 24.409% and 73.228% in patients, respectively. The results showed no significant differences among patients and controls groups.
    Conclusion
    The data presented here may suggest that the RAD51 135G > C polymorphism is not associated with breast cancer risk in Iranian Azeri population.
    Keywords: Breast cancer_RAD51 135G > C polymorphism_Azeri-Turkish_Iran
  • نازیلا مقترن بناب، محمدعلی حسینپورفیضی، مرتضی بنیادی، علی دسترنج تبریزی
    پیش زمینه و هدف
    سرطان تخمدان چهارمین علت مرگ و میر مرتبط با سرطان در زنان می باشد، به منظور کاهش مرگ ومیر ناشی از آن، شناسایی و ارزیابی بیومارکرهای تشخیصی اولیه که مختص این سرطان هستند ضروری می باشد، با توجه به اهمیت نقش ژن GADD45A در بقا و مرگ سلولی، تغییرات بیان آن در انواع مختلف بافت های خوش خیم، بوردورلاین و بدخیم متعلق به سرطان سروزی اپیتلیال تخمدان در این تحقیق موردبررسی قرار گرفته است.
    مواد و روش کار
    نمونه های تازه مربوط به بافت های مختلف سروزی تخمدان شامل 75 نمونه توموری و 20 نمونه بافت نرمال در فاصله زمانی 93 تا خرداد 96 از بیماران مراجعه کننده به بیمارستان کوثر ارومیه و بیمارستان الزهرا تبریز جمع آوری و در دمای -80 نگهداری شد، پس از تشخیص توسط پاتولوژیست، استخراج RNA توسط کیت تریزول انجام و. cDNA به وسیله کیت تاکارا سنتز شد. بیان ژن GADD45A به وسیله Real-Time PCR در این نمونه ها مورد ارزیابی قرار گرفت.
    بحث و نتیجه گیری
    آنالیز نتایج حاکی از آن است که سطح بیان ژن GADD45A اختلاف قابل توجهی بین بافت های بدخیم و نرمال نشان داد (P<0.0001). همچنین روند کاهش بیان قابل توجهی در ژن GADD45A از نمونه های خوش خیم به سوی بدخیم مشاهده شد. بر اساس یافته های ما می توان چنین بیان نمود که سطح بیان ژن GADD45A در نمونه های سرطانی به شدت کاهش می یابد. بنابراین ممکن است که بتوان از میزان بیان آن برای تشخیص مرحله بیماری استفاده کرد، همچنین در سطوح درمانی سرطان می توان سطح بیان آن را مورد هدف قرار داد.
    کلید واژگان: سرطان تخمدان, ژن GADD45A, بیان
    Nazila Moghtaran Bonab, Mohammad Ali Hosseinpour Feizi, Morteza Bonyadi, Ali Dastranj Tabrizi
    Background and Aims
    ovarian cancer is the 4th leading cause of cancer-related death in women. In order to reduce its mortality and morbidity, identification and evaluation of specific diagnostic biomarkers are necessary. Given the importance of the GADD45A role in cell survival and death, its expression changes were investigated in benign, borderline and malignant ovarian serous tumors in the present work.
    Materials and Methods
    Fresh specimens from different types of ovarian serous tissues including 75 tumors and 20 normal gathered from patients who referred to Urmia Kosar and Tabriz Alzahra hospitals between 2015 and 2017 and stored in -80°C. After making a diagnosis by a pathologist, RNA extraction was performed with TRIzol kit, cDNA was synthesized by Takara kit and then the GADD45A gene expression was evaluated by Real-Time PCR
    Results
    The analysis revealed that GADD45A gene expression level showed a significant difference between malignant and normal tissue (p
    Conclusion
    Based on our findings, it has been shown that the GADD45A gene expression level significantly reduced in cancer samples. Therefore, this gene expression level may be used to identify the disease stage in ovarian serous tumors. In addition, its expression level can be considered as a target in cancer therapy.
    Keywords: Ovarian cancer, GADD45A gene, Expression
  • رقیه عزیزی آقاعلی، محمد خلج کندری *، نرگس زینال زاده، محمدعلی حسین پور فیضی، مهدی فرهودی، مهناز طالبی
    سابقه و هدف
    تشخیص بیماری آلزایمر معمولا زمانی صورت می گیرد که آسیب های جدی به مغز وارد شده و درمان های رایج در ممانعت از آن ناکارآمد هستند. یکی از RNAهای دخیل در بیماری آلزایمر، RNA غیرکدکننده بلند بنام BDNF antisense(BDNF-AS) می باشد. این مطالعه با هدف بررسی حضور و مقایسه سطح BDNF-AS در پلاسمای بیماران آلزایمری و افراد سالم و ارزیابی پتانسیل آن به عنوان نشانگر پلاسمایی برای بیماری آلزایمر صورت گرفت.
    مواد و روش ها
    در این مطالعه مورد-شاهدی، 30 فرد مبتلا به آلزایمر دیرهنگام و 30 فرد سالم بدون بیماری عصبی که از نظر سن با بیماران منطبق بودند، براساس معیارهای تشخیص بالینی بیماری آلزایمر توسط پزشک متخصص انتخاب و نمونه خون وریدی آنها دریافت شد. پلاسمای نمونه های خونی جداسازی و RNA تام پلاسما استخراج شد. پس از سنتز cDNA، حضور BDNF-AS در پلاسما توسط PCR بررسی شد. در نهایت، مقدار نسبی رونوشت های BDNF-AS در نمونه های پلاسمای بیماران آلزایمری و سالم با استفاده از Real time PCR مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت.
    یافته ها
    نتایج حاصل نشان داد کهRNA غیرکدکننده بلند BDNF-AS در پلاسمای افراد بیمار و کنترل وجود دارد و مقایسه داده های به دست آمده از Real time PCR نشان داد که سطوح BDNF-AS در پلاسمای گروه بیماران(0/021±0/107)افزایش معنی داری نسبت به افراد سالم (0/006±0/039)دارد.
    نتیجه گیری
    نتایج حاصل از این بررسی اولیه نشان می دهد که شاید بتوان از مقدارRNA ی غیر کد کننده بلندBDNF-AS در پلاسما، به عنوان نشانگر خونی/پلاسمایی برای تشخیص بیماری آلزایمر استفاده کرد
    کلید واژگان: بیماری آلزایمر, BDNF-AS, نشانگر زیستی
    R. Azizi Aghali, M. Khalaj *, N. Zeinalzadeh, Ma Hosseinpour Feizi, M. Farhoudi, M. Talebi
    Background And Objective
    Diagnosis of Alzheimer's disease usually occurs when serious damages have occurred in the brain and common treatments are ineffective in preventing it. One of the RNAs involved in Alzheimer's disease is a long noncoding RNA, called BDNF antisense (BDNF-AS). The aim of this study is to determine the presence and compare the BDNF-AS levels in plasma of Alzheimer's patients and healthy subjects, and to evaluate its potential as a plasma marker for Alzheimer's disease.
    Methods
    In this case-control study, 30 patients with late-stage Alzheimer's disease and 30 healthy subjects without neurological disease who matched the patients in terms of age were selected by a specialist according to the criteria for clinical diagnosis of Alzheimer's disease and their intravenous blood samples were collected. The plasma of the blood samples was isolated and total plasma RNA was extracted. After cDNA synthesis, the presence of BDNF-AS in plasma was examined by PCR. Finally, the relative level of BDNF-AS transcripts in plasma samples of patients with Alzheimer's disease and healthy subjects was evaluated using Real Time PCR.
    FINDINGS: The results of this study showed that long noncoding RNA BDNF-AS was present in the plasma of patients and controls. Comparison of Real Time PCR data showed that BDNF-AS levels in the plasma of patients (0.107±0.021) showed significant increase compared to healthy subjects (0.039 ± 0.006).
    Conclusion
    The results of this preliminary study indicate that the levels of long noncoding RNA BDNF-AS in plasma can be used as a blood/plasma marker for the diagnosis of Alzheimer's disease.
    Keywords: Alzheimer's disease, BDNF-AS, Biomarker
  • فاطمه قربانی پارسا، محمد علی حسینپور فیضی *
    تعیین توالی DNA از مهم ترین دستاوردهای بشر محسوب می شود. امروزه روش های متفاوتی جهت تعیین توالی نوکلئوتیدها به کار می رود. آشنایی با این دانش از ارکان اجتناب ناپذیر پژوهش های مرتبط با علم زیست شناسی است. تعیین توالی نوکلئوتیدها در گرایش های پژوهشی و کاربردی گسترده مانند تشخیص بیماری، زیست فناوری، زیست شناسی جنایی و زیست شناسی سیستماتیک استفاده می شود که به طور چشمگیری پژوهش و کشفیات در این زمینه را سرعت بخشیده است.
    تاکنون چندین نسل از فناوری تعیین توالی به وجود آمده که بر اساس ماهیت عملکرد و اطلاعات خروجی طبقه بندی می گردند. درحالی که روش تعیین توالی ختم زنجیره که توسط سنگر معرفی شد بیش از 30 سال متداول بود و در پروژه ژنوم انسان نیز این روش استفاده شد اما در سال های اخیر تغییرات در فناوری تعیین توالی شتاب گسترده ای یافته است. در سال 2005 نخستین روش تعیین توالی نسل دوم معرفی شد که خروجی بسیار بالاتر و هزینه های فوق العاده کمتری نسبت به روش سنگر داشت و هم اکنون شاهد آغاز فعالیت نسل سوم فناوری تعیین توالی هستیم.
    ازآنجاکه پژوهشگران علم ژنتیک در ایران نیز از این فناوری ها استفاده می نمایند و با توجه به نیاز به منابع فارسی قابل فهم در این زمینه، مولفان مقاله حاضر بر آن شدند تا به ترجمه و نگارش مجموعه ای از مقالات مروری در این زمینه بپردازند. مقاله حاضر به معرفی مختصر مرسوم ترین روش های تعیین توالی نسل دوم و سوم پرداخته است.
    کلید واژگان: تعیین توالی DNA, تعیین توالی با توان عملیاتی بالا, نسل دوم فناوری تعیین توالی, نسل سوم فناوری تعیین توالی
    Fatemeh Ghorbani Parsa, Mohammad Ali Hossein Pour Feizi *
    DNA sequence determination is a tremendous human achievement. DNA sequencing includes several methods and technologies in use for determining the order of the nucleotide bases in a molecule of nucleic acid. Knowledge of DNA sequences has become indispensable for the basic biological researches. Nucleotides sequence determination is used in numerous applied fields such as diagnostics, biotechnology, forensic biology and biological systematics. The advent of DNA sequencing has significantly accelerated biological researches and discoveries.
    There are several generations of DNA sequencing technologies that can be well characterized through their nature and the kind of output they provide. Dideoxy terminator sequencing developed by Sanger dominated for 30 years and was the workhorse used for the Human Genome Project. In 2005 the first 2nd generation sequencer was presented with an output orders of magnitude higher than Sanger sequencing and dramatically decreased cost. We are now at the dawn of the 3rd generation of sequencing systems.
    Researchers in the field of genetics in Iran use this technology in their studies, but unfortunately our literature lacks proper Persian language resources. This review briefly describes the current high-throughput nucleotide sequencing platforms commercially available.
    Keywords: DNA sequencing, High Throughput Nucleotide Sequencing, second generation sequencing, third generation sequencing
  • سمیرا کاظم زاده، اسماعیل بابایی*، محمدعلی حسینپور فیضی
    زمینه و هدف
    lnc-CCAT2 یک RNA غیر کد کننده پروتئین است که به میزان بالایی در انواع بافت ها و رده های سلول سرطانی بیان می گردد. به دلیل شیوع روزافزون تومورهای پستان در سال های اخیر، در این پژوهش صلاحیت بیان ژن CCAT2 به عنوان مارکر مولکولی احتمالی در تشخیص و درمان تومورهای پستان ارزیابی شده است.
    مواد و روش ها
    درمجموع 35 نمونه توموری و 35 نمونه طبیعی مربوط به حاشیه ی تومور با استفاده از روش کمی Real-time PCR موردمطالعه قرار گرفتند و ژن 2β میکروگلوبولین β2m)) به عنوان کنترل داخلی به کار گرفته شد. نتایج به دست آمده با استفاده از نرم افزار spss و sigmaplot مورد تجزیه وتحلیل آماری قرار گرفت.
    نتایج
    نتایج به دست آمده نشان داد که بیان ژن CCAT2 در نمونه های توموری پستان نسبت به نمونه های غیر توموری حاشیه ای، به طور معنی داری افزایش می یابد (P < 0.01).
    نتیجه گیری
    این نتایج، استفاده از ژن CCAT2 را به عنوان مارکر تشخیصی در تفکیک و شناسایی بافت های توموری پستان از انواع غیر توموری نشان می دهد. ازاین رو می تواند در کنار سایر روش های مرسوم تشخیصی آزمایشگاهی مورد استفاده قرار گیرد. مطالعات بیشتر درزمینهٔ توان بیومارکری این ژن در دست انجام است.
    کلید واژگان: CCAT2, PCR کمی, RNA غیر کد کننده, سرطان پستان
    Samira Kazemzadeh, Esmaeil Babaei *, Mohammad Ali Hoseinpour Fizi
    Background and Objectives
    lnc-CCAT2 is a non-protein coding RNA, which is highly expressed in tissues and cancer cell types. Due to the increasing incidence of breast tumors in recent years, in this research, the qualification of CCAT2 gene expression is assessed as a potential molecular marker in the diagnosis and treatment of breast tumors.
    Material &
    Methods
    Totally, 35 breast tumor specimens and 35 non-tumoral ones related to the tumor margins were studied using quantitative real-time PCR method. Gene β2m was used as the internal control. Obtained results were statistically analyzed Using the SPSS and sigmaplot software.
    Results
    The results showed that CCAT2 gene expression, significantly increased in breast tumor samples compared to marginal non-tumor specimens. (P
    Conclusion
    This results showed that CCAT2 gene can be applied as a diagnostic marker for the identification and diagnosis of breast tumor tissues and non-tumor types. Therefore, it can be used alongside other conventional Diagnostic Laboratorial methods. More studies are underway on the biomarking potentiality of this gene.
    Keywords: Breast cancer, Non-coding RNA, Real-time PCR, CCAT2
  • ناصر پولادی *، رقیه دهقان الوار، محمدعلی حسینپور فیضی، سپهر عبدالهی، معصومه ولی پور
    از زمان کشف P53 در سال 1979 به عنوان یک آنتی ژن توموری تا به امروز که جایگاه آن در قالب یک ژن سرکوبگر توموری مهم تثبیت شده است بیش از شصت و چهار هزار مقاله و گزارش پژوهشی با نام این پروتئین، در PubMed منتشر شده است. هرچند نتایج این پژوهش ها به روشن شدن ساختار، عملکرد و تنظیم P53 کمک کرده اند با این حال باعث به وجود آمدن ابهام ها و پرسش های بیشتری پیرامون این پروتئین شده اند. شناسایی ایزوفرم های مختلف P53، کشف یک آنتی سنس طبیعی P53 (WraP53) و نقش های مهم این ژن در فرآیند هایی چون طول عمر، پیری و سوخت و ساز موجب شده اند که P53 همچنان مولکولی جذاب برای تحقیق و بررسی باقی بماند. انتقال نسخه سالم P53 به سلول های سرطانی دارای نقص در P53 و معرفی مولکول های کوچکی که پروتئین P53 جهش یافته را فعال می کنند و یا فعالیت تنظیم کننده مهم آن یعنی پروتئین MDM2 را مهار می کنند از جمله روش های درمانی سرطان هستند که بر مبنای P53 توسعه یافته اند. در مقاله ی حاضر تلاش شده است به مرور کلی تاریخچه و عملکرد های P53 پرداخته شود و روش های درمانی توسعه یافته بر مبنای خاصیت آنتی توموری آن مورد بحث قرار گیرد.
    کلید واژگان: P53, آسیب DNA, پروتئین های سرکوبگر تومور, نئوپلاسم
    Nasser Pouladi *, Roghayeh Dehghan, Mohammadali Hosseinpour Feizi, Sepehr Abdolahi, Masoumeh Valipour
    Since the discovery of P53 in 1979 as a tumor antigen until today that has been established as an important tumor suppressor gene, over sixty four thousand paper and research reports were published in PubMed including this protein name. Although the results of these investigations have been helped to clarify the structure, function and regulation of P53, they also led to more ambiguities and questions about this protein. Identification of different isoforms of P53, the discovery of a P53 natural antisense (Wrap53) and recent findings about its different roles in processes such as longevity, aging and metabolism have made P53 remain attractive for study. Delivering the wild type P53 gene to p53 mutant cancer cells, introduction of small molecules that reactivate mutant p53 or suppress its important regulator, MDM2, are among the cancer therapies developed based on p53. The present article attempts to review the history and functions of p53 and discuss about the treatment strategies have been developed based on its antitumor properties.
    Keywords: p53, DNA Damage, Tumor Suppressor Proteins, Neoplasms
نمایش عناوین بیشتر...
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال