به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب hamid mahdiuni

  • حمید مهدیونی*، طاهره مراتی

    پروتیین FOXM1 به عنوان یک فاکتور رونویسی مهم، در عملکردهای متنوعی ازجمله کنترل بیان ژن های مختلف، انتقال سلول ها به فاز تقسیم، آنژیوژنز، مهاجرت و غیره درگیر می باشد و بیش بیان آن در انواع مختلف سرطان گزارش شده است. بنابراین، این پروتیین یک هدف دارویی بالقوه در درمان سرطان می باشد. تاکنون، داروها و ترکیبات زیادی FOXM1 را هدف قرار داده اند، از جمله FDI-6 و RCM-1 که عملکرد آن ها مهار میان-کنش های FOXM1-DNA می باشد. در این مطالعه، به منظور پیش گیری از تشکیل کمپلکس FOXM1-DNA، زیرمجموعه In-vitro از پایگاه داده ZINC بصورت محاسباتی مورد بررسی قرار گرفت. برای دستیابی به این هدف، ابتدا جایگاه های اتصال لیگاند در پروتیین، با اجرای الگوریتم MDpocket مورد جست و جو قرار گرفتند. قبل از محاسبه ی انرژی اتصال پذیری ترکیبات به پاکت های پیش بینی شده، کتابخانه ها (حدود 260.000 ترکیب) با استفاده از وب سرور FAF-Drugs4 بر اساس خواص فیزیکوشیمیایی غربال شدند. پس از آن، ترکیبات منتخب با استفاده از AutoDock VINA علیه پاکت های پیش بینی شده FOXM1 داک شدند. فرایند غربالگری بر اساس انرژی اتصال پذیری، هشدارهای ساختاری و گروه های غیر توکسیک طراحی شد. بر این اساس، سه ترکیب با انرژی داکینگ تقریبا مشابه، نمره ی عبور را بدست آوردند. جهت تمایز و رتبه بندی ترکیبات انتخاب شده، روش MM/PBSA روی سه کمپلکس FOXM1-لیگاند اعمال شد و نهایتا، لیگاند1 بر اساس انرژی آزاد اتصال انتخاب شد. لیگاند معرفی شده در این مطالعه، مولکول hit جدید نویدبخشی است که امید می رود میان کنش FOXM1 با DNA مرتبطش را قطع کند. با این حال، کوشش های تجربی بیشتری به منظور شناسایی لیگاند کشف شده به عنوان یک ترکیب lead باید انجام شود.

    کلید واژگان: FOXM1, غربالگری مجازی, داکینگ مولکولی, شبیه سازی دینامیک مولکولی, MM-PBSA}
    Hamid Mahdiuni *, Tahereh Merati

    As an important transcription factor, FOXM1 involves in various functions including the control of expression of several genes, the transition of cells into dividing phase, angiogenesis, migration and so on, and its overexpression has been reported in the different types of cancers. Therefore, this protein is a putative drug target in cancer therapy. Hitherto, many compounds and medicines have been targeted FOXM1 including FDI-6 and RCM-1 whose functions are the inhibition of FOXM1-DNA interactions. In this study, in order to inhibit FOXM1-DNA complex formation, in-vitro subset of the ZINC database was evaluated computationally. To achieve this purpose, ligand-binding pockets on the protein were explored firstly by running of MDpocket algorithm. Before computation of affinity binding energy of the compounds to the predicted pockets, the libraries (circa 260000 compounds) were screened using FAF-drugs4 web server based on the physicochemical properties. Afterwards, the passed compounds were docked on the predicted pockets of FOXM1 using AutoDock-VINA. The screening process was planned according to the affinity binding energy, structural alerts and toxic-free groups. Accordingly, the three compounds acquired the passing score with approximately the same docking energy. To differentiate and ranking of the selected compounds, the MM/PBSA approach was applied on the three ligand-FOXM1 complexes and finally, 1-Hydroxypyrene β-D-Glucuronide was picked out based on its binding free energy. The introduced ligand in this study is the promising novel hit molecule, interrupting FOXM1 interactions with its cognate DNA. However, more experimental efforts need to be performed for recognition of the discovered ligand as lead compound.

    Keywords: FOXM1, virtual screening, Molecular Docking, molecular dynamics simulation, MM-PBSA}
  • *Abdoreza Nazari, Elham Golezar, Hamid Mahdiuni
    Introduction

    Measuring of natural antioxidants power is important in the food industry. Ferula gummosa Boiss. plant, locally called Barijeh, is a member of genus Ferula belonging to the Apiaceae family. To introduce endemic natural antioxidants, antioxidant capacity of alcoholic and hydroalcoholic extracts of aerial parts of F. gummosa Boiss. was investigated.

    Objective

    The primary objective of this study was to compare the antioxidant levels and activities between flower and leaf extracts of Ferula gummosa Boiss. plant by different assay methods.

    Method

    The antioxidant activity of flower and leaf extracts of F. gummosa Boiss. was assessed usingferric-reducing antioxidant power (FRAP), 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) radical scavenging assay and oxygen radical absorbance capacity (ORAC) assay. In addition, phenolic content of the extracts was measured byFolin-Ciocalteu (FC) method.

    Results

    Ferric reducing antioxidant power assay showed that leaf extract has more antioxidant activity compared to flower extract. DPPH assay had similar results. A slow kinetic behavior was found for methanol extracts of both tissues (EC50 of 0.21 mg/mL and 0.25 mg/mL for leaf and flower methanol extracts, respectively) which was estimated by kinetic mode of DPPH assay. The ORAC assay showed higher values for methanolic extracts compared to ethanolic extracts. Except for ORAC assay, a significant positive correlation was found between antioxidant data of ferric-reducing antioxidant power, DPPH and Folin-Ciocalteu assays.

    Conclusion

    These findings suggest that high antiradical potential and reducing power of the alcoholic and hydroalcoholic extracts of the aerial parts of F. gummosa Boiss. correspond to a high phenolic content in these plant parts. The high antioxidant activity of the F. gummosa Boiss. could propound the hydroalcoholic extracts of this plant as a therapeutic agent to prevent and treat diseases due to free radical imbalance in the body

    Keywords: Antioxidant activity, DPPH, ferric‑reducing antioxidant power, Ferula gummosa Boiss., oxygen radical absorbance capacity}
  • Shafagh Heidari Heidari, Hassan Akrami, Roghaye Gharaei, Ali Jalili, Hamid Mahdiuni, Elham Golezar
    Ferulago angulata Boiss. known in Iran as Chavir, has some bioactive compounds having antioxidant activity. Because of its antioxidant activities, it sounded Chavir extract can be a good candidate for finding chemopreventive agents having inductive apoptosis properties on cancer cells. In this study, the cytotoxic effects and proapoptotic activities of Chavir’s leaf and flower extracts were investigated on human adenocarcinoma gastric cell line (AGS). The ferric reducing antioxidant power (FRAP) assay was used to determine antioxidant activity of the extract. Cytotoxic effects of the extract were performed by trypan blue and neutral red assays. For apoptosis detection, we used Annexin V staining, flow cytometry and DNA fragmentation assays. The FRAP assay results showed that antioxidant activity of leaf extract was higher than flower extract. Cytotoxicity and apoptosis–inducing activity of flower and leaf extracts changed coordinately, indicating the cytotoxicity of chavir extracts is due probably to induce apoptosis. Our results revealed that the cytotoxic effects of F. angulate Boiss. extracts on AGS cell line is close to some other plant extracts such as Rhus verniciflua Stokes (RVS) and Scutellaria litwinowii. This is the first study on cytotoxic and apoptosis–inducing effects of chavir leaf and flower extracts against AGS cell line. The Further investigation can be identification of the agent(s) by which these effects is observed.
    Keywords: Apoptosis, Antioxidant activity, cytotoxicity, Ferulago angulata Boiss, Human adenocarcinoma gastric cell line (AGS)}
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال