غربالگری مجازی مبتنی بر ساختار با توان بالا جهت انتخاب ترکیب (ترکیبات) شیمیایی مهارکننده ی جدید علیه کمپلکس فاکتور رونویسی FOXM1 با ترادف ژنومی هدف

پروتیین FOXM1 به عنوان یک فاکتور رونویسی مهم، در عملکردهای متنوعی ازجمله کنترل بیان ژن های مختلف، انتقال سلول ها به فاز تقسیم، آنژیوژنز، مهاجرت و غیره درگیر می باشد و بیش بیان آن در انواع مختلف سرطان گزارش شده است. بنابراین، این پروتیین یک هدف دارویی بالقوه در درمان سرطان می باشد. تاکنون، داروها و ترکیبات زیادی FOXM1 را هدف قرار داده اند، از جمله FDI-6 و RCM-1 که عملکرد آن ها مهار میان-کنش های FOXM1-DNA می باشد. در این مطالعه، به منظور پیش گیری از تشکیل کمپلکس FOXM1-DNA، زیرمجموعه In-vitro از پایگاه داده ZINC بصورت محاسباتی مورد بررسی قرار گرفت. برای دستیابی به این هدف، ابتدا جایگاه های اتصال لیگاند در پروتیین، با اجرای الگوریتم MDpocket مورد جست و جو قرار گرفتند. قبل از محاسبه ی انرژی اتصال پذیری ترکیبات به پاکت های پیش بینی شده، کتابخانه ها (حدود 260.000 ترکیب) با استفاده از وب سرور FAF-Drugs4 بر اساس خواص فیزیکوشیمیایی غربال شدند. پس از آن، ترکیبات منتخب با استفاده از AutoDock VINA علیه پاکت های پیش بینی شده FOXM1 داک شدند. فرایند غربالگری بر اساس انرژی اتصال پذیری، هشدارهای ساختاری و گروه های غیر توکسیک طراحی شد. بر این اساس، سه ترکیب با انرژی داکینگ تقریبا مشابه، نمره ی عبور را بدست آوردند. جهت تمایز و رتبه بندی ترکیبات انتخاب شده، روش MM/PBSA روی سه کمپلکس FOXM1-لیگاند اعمال شد و نهایتا، لیگاند1 بر اساس انرژی آزاد اتصال انتخاب شد. لیگاند معرفی شده در این مطالعه، مولکول hit جدید نویدبخشی است که امید می رود میان کنش FOXM1 با DNA مرتبطش را قطع کند. با این حال، کوشش های تجربی بیشتری به منظور شناسایی لیگاند کشف شده به عنوان یک ترکیب lead باید انجام شود.