به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب nafiseh davati

  • نفیسه دعوتی*، فاطمه چهری

    امروزه ظهور سویه های میکروبی مقاوم به آنتی بیوتیک در مواد غذایی رو به گسترش است که این امر درمان آنتی بیوتیکی مصرف کننده دچار عفونت غذایی را مشکل می کند. یکی از منایع غذایی که می تواند فرد را دچار عفونت غذایی کند محصولات لبنی تولید شده از شیر خام است و یکی از باکتری های مقاوم شده به انواع آنتی بیوتیک ها سالمونلا می باشد. هدف از این مطالعه بررسی حضور گونه های سالمونلای مقاوم به آنتی بیوتیک در پنیرهای کوزه و پوستی، تولید شده از شیر خام در غرب کشور، است. به این منظور گونه های سالمونلایی محتمل در پنیر کوزه از بوکان و پنیرهای پوستی از لرستان و کرمانشاه جداسازی گردید و پس از شناسایی فنوتیپی اولیه و تست های بیوشیمیایی، مورد شناسایی مولکولی توسط تکثیر ژن ناحیه 16S rRNA توسط پرایمرهای U1492R و B27F گردید. سپس جدایه ها از نظر مقاومت به آنتی بیوتیک های تتراسایکلین، اگزاکسیلین، پنی سیلین و آمپی سیلین بررسی شدند. نتایج حضور سالمونلا اینتریکا زیرگونه تایفی موریوم را در هر سه نوع پنیر در بین 14 جدایه انتروکوکوسی تایید کرد. گونه های شناسایی شده از هر سه نوع پنیر به اگزاکسیلین، پنی سیلین و آمپی سیلین و گونه شناسایی شده از پنیر پوستی لرستان به تتراسایکیلین مقاوم بودند. اما گونه های شناسایی شده در پنیرهای پوستی کرمانشاه و کوزه بوکان به تتراسایکیلین حساس بودند. نتایج این مطالعه نشان می دهد پنیرهای محلی پوستی و کوزه در برخی مناطق غرب کشور می تواند حامل نژادهای سالمونلای مقاوم به آنتی بیوتیک باشد و در صورت عفونت میکروبی ناشی از پنیرهای آلوده، درمان آن با آنتی بیوتیک ممکن است به سختی انجام شود.

    کلید واژگان: مقاومت آنتی بیوتیکی, پنیر, سالمونلا}
    Nafiseh Davati*, Fatemeh Chehri

    Nowadays, the occurrence of antibiotic-resistant bacterial strains in food is increasing, which makes antibiotic treatment of infected food more difficult. One of the food sources that can cause foodborne infection is dairy products made from raw milk and one of the bacteria resistant to various antibiotics is Salmonella. The aim of this study was to investigate the presence of antibiotic-resistant Salmonella species in Poosti and Koozeh cheeses produced from raw milk in western Iran. For this purpose, the probable Salmonella species were isolated in Koozeh cheese from Bukan and Poosti cheese from Lorestan and Kermanshah. After initial phenotypic identification and biochemical testing, molecular identification was performed by amplification of the 16S rRNA gene with primers U1492R and B27F. The isolates were tested for resistance to tetracycline, oxacillin, penicillin and ampicillin. The results confirmed the presence of Salmonella enterica subspecies Typhimurium in all three cheeses among 14 Enterococcus isolates. The species of all three cheese were resistant to oxacillin, penicillin and ampicillin and the identified species of Lorestan Poosti cheese were resistant to tetracycline. But the identified species in Kermanshah Poosti cheese and Bukan Koozeh cheese were sensitive to tetracycline. The results of this study indicate that local Poosti and Koozeh cheeses in some western parts of the country may be carriers of antibiotic-resistant Salmonella strains and that in case of microbial infection caused by contaminated cheese, treatment with antibiotics may be difficult.

    Keywords: Antibiotic-Resistant, Cheese, Salmonella}
  • بهینه سازی بهترین غلظت سرکه و نمک برای کاهش بار میکروبی گل کلم با استفاده از روش سطح پاسخ
    نفیسه دعوتی*
    Optimizing the best vinegar and salt concentration to reduce microbial load in Cauliflower using Response Surface Methodology
    Nafiseh Davati*
  • پروین سوری، آریو امامی فر*، نفیسه دعوتی

    در این پژوهش منحنی زمان - کشندگی اثر نانولیپوزوم های حاوی نانوذرات اکسید روی علیه باسیلوس سریوس (ATCC 11778)  و سودوموناس آیروژینوزا (ATCC 9027) در محیط کشت آزمایشگاهی بررسی شد. دو روش آب پوشانی لایه نازک و حرارتی در تولید نانولیپوزوم های حاوی نانوذرات اکسید روی در نسبت های مختلف لسیتین به نانو ذرات اکسید روی (5:1، 15:1 و 25:1 وزنی- وزنی) مورد ارزیابی قرار گرفت. مقادیر حداقل غلظت بازدارندگی از رشد (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MBC) نانولیپووزم های حاوی نانوذرات اکسید روی در مقایسه با نانوذرات اکسید روی بدون پوشش علیه سویه های باسیلوس سریوس و سودوموناس آیروژینوزا تعیین گردید. نتایج نشان داد که استفاده از نانوذرات اکسید روی درون پوشانی شده در سامانه های نانولیپوزومی به صورت معنی داری قدرت ضد میکروبی آن ها را افزایش داد (05/0p<). نانولیپوزوم حاوی نانوذرات اکسید روی تولید شده به روش آب پوشانی لایه نازک در مقایسه با روش حرارتی در بیشترین نسبت لسیتین به نانو ذرات اکسید روی (25:1 وزنی- وزنی)، قدرت ضد میکروبی بالاتری داشتند. بر اساس منحنی های زمان- کشندگی، در حضور نانولیپوزوم های حاوی نانو ذرات اکسید روی تولید شده به روش آب پوشانی لایه نازک با نسبت لسیتین به نانوذرات اکسید (25:1 وزنی- وزنی)، طول فاز لگاریتمی باکتری های باسیلوس سریوس (8 ساعت) و سودوموناس آیروژینوزا (6 ساعت) به ترتیب در مقادیر حداقل غلظت بازدارندگی به 3 و 3 ساعت و حداقل غلظت کشندگی  به 1 و کمتر از یک ساعت کاهش یافت

    کلید واژگان: فعالیت ضد میکروبی, نانولیپوزوم, نانواکسید روی}
    Parvin Souri, Aryou Emamifar*, Nafiseh Davati

    In this research, in-vitro time- kill curve effect of nano-ZnO loaded nanoliposomes against Bacillus cereus (ATCC 11778) and Pseudomonas aeruginosa (ATCC 9027) were evaluated. Thin layer hydration sonication and heat methods were evaluated to preparation of nano-ZnO loaded nanoliposomes at different level of lecithin: nano-ZnO ratio (5:1, 15:1, and 25:1 w/w). The minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) of nano-ZnO loaded nanoliposomes and free nano-ZnO against Bacillus cereus and Pseudomonas aeruginosa were determined. Results showed that the encapsulation of nano-ZnO in nanoliposome systems significantly increased their antimicrobial activities. Nano-ZnO loaded nanoliposomes were prepared at the highest ratio of lecithin: nano-ZnO ratio (25:1 w/w) showed higher antimicrobial activity compared to those prepared by heat method. From the time- kill curves, the log phase growth of Escherichia coli (8 hours) and Staphylococcus aureus (7 hours) in the medium containing nano-ZnO loaded nanoliposomes prepared through the thin layer hydration sonication at the highest level of lecithin: nano-ZnO ratio (25:1 w/w) at MIC and MBC values decreased to 3 and 3 hours and to 1 and less than 1 hours, respectively.

    Keywords: Antimicrobial activity, Nanoliposome, Nano-ZnO}
  • پروین سوری، آریو امامی فر*، نفیسه دعوتی

    هدف این مطالعه بررسی اثر ضد میکروبی نانولیپوزوم های حاوی نانوذرات اکسید روی در نسبت های مختلف لسیتین به نانو ذرات اکسید روی (5:1، 15:1 و 25:1 وزنی- وزنی) بر علیه سویه های اشرشیا کلی(ATCC 2592) و استافیلوکوکوس اوریوس (ATCC 25923) در محیط کشت آزمایشگاهی بود. نانولیپوزوم های حاوی نانوذرات اکسید روی به دو روش آب پوشانی لایه نازک و حرارتی تهیه شدند. مقادیر حداقل غلظت بازدارندگی (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MBC) نانولیپووزم های حاوی نانوذرات اکسید روی تولید شده در مقایسه با نانوذرات اکسید روی بدون پوشش بر علیه سویه های اشرشیا کلی و استافیلوکوکوس اوریوس تعیین و فعالیت ضد میکروبی آن ها با استفاده از منحنی زمان- کشندگی ارزیابی گردید. نتایج نشان داد که درون پوشانی نانو ذرات اکسید روی با استفاده از سامانه های نانولیپوزومی با افزایش میزان نفوذ به داخل سلول میکروارگانیسم به صورت معنی داری سبب افزایش قدرت ضد میکروبی آن ها گردید(05/0p<). نانولیپوزوم حاوی نانوذرات اکسید روی تولید شده به روش آب پوشانی لایه نازک در مقایسه با روش حرارتی قدرت ضد میکروبی بالاتری داشتند. بر طبق منحنی های زمان- کشندگی، طول فاز لگاریتمی باکتری های اشرشیاکلی (8 ساعت) و استافیلوکوکوس اوریوس(7 ساعت) در محیط کشت شامل نانولیپوزوم های حاوی نانو ذرات اکسید روی تولید شده به روش آب پوشانی لایه نازک با بالاترین نسبت لسیتین به نانوذرات اکسید (25:1 وزنی- وزنی) به ترتیب در مقادیر حداقل غلظت بازدارندگی به 5 و 4 ساعت و حداقل غلظت کشندگی  به 2 و کمتر از یک ساعت کاهش یافت.
    .

    کلید واژگان: سینتیک زمان - کشندگی, نانولیپوزوم, نانواکسید روی}
    Parvin Souri, Aryou Emamifar*, Nafiseh Davati

    The objective of this study was to in-vitro investigation of antimicrobial activity effect of nano-ZnO loaded nanoliposomes at different level of lecithin: nano-ZnO ratio (5:1, 15:1, and 25:1 w/w) against Escherichia coli (ATCC 2592) and Staphylococcus aureus (ATCC 25923). Nano-ZnO loaded nanoliposomes were prepared through thin layer hydration sonication and heat methods. The minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) of nano-ZnO loaded nanoliposomes and free nano-ZnO against Escherichia coli and Staphylococcus aureus were determined and their antimicrobial activities were evaluated by time- kill curve analysis. Results showed that the encapsulation of nano-ZnO in nanoliposome systems significantly increased antimicrobial activities of them by increasing their penetration into the microbial cell. Nano-ZnO loaded nanoliposomes were prepared through thin layer hydration showed higher antimicrobial activity compared to those prepared by heat method. From the time- kill curves, the log phase growth of Escherichia coli (8 hours) and Staphylococcus aureus (7 hours) in the medium containing nano-ZnO loaded nanoliposomes prepared through the thin layer hydration sonication at the highest level of lecithin: nano-ZnO ratio (25:1 w/w) at MIC and MBC values decreased to 5 and 4 hours and to 2 and less than 1 hours, respectively.

    Keywords: Time–kill kinetic, Nanoliposome, Nano-ZnO}
  • Nafiseh Davati *, Abozar Ghorbani, Elham Ashrafi-Dehkordi, Thomas P. Karbanowicz
    Background
    When Salmonella enterica serovar Typhimurium, a foodborne bacterium, is exposed to osmotic stress, cellular adaptations increase virulence severity and cellular survival.
    Objectives
    The aim of the gene network analysis of S. Typhimurium was to provide insights into the various interactions between the genes involved in cellular survival under low water activity (aw).
    Materials and Methods
    We performed a gene network analysis to identify the gene clusters and hub genes of S.Typhimurium using Cytoscape in three food samples subjected to aw stress after 72 hours.
    Results
    The identified hub genes of S. Typhimurium belonged to down-regulated genes and were related to translation, transcription, and ribosome structure in the food samples. The rpsB and Tig were identified as the most important of the hub genes. Enrichment analysis of the hub genes also revealed the importance of translation and cellular protein metabolic processes. Moreover, the biological process associated with organonitrogen metabolism in milk chocolate was identified. According to the KEGG pathway results of gene cluster analysis, cellular responses to stress were associated with RNA polymerase, ribosome, and oxidative phosphorylation. Genes encoding RNA polymerase activity, including rpoA, rpoB, and rpoZ, were also significantly identified in the KEGG pathways. The identified motifs of hub DEGs included EXPREG_00000850, EXPREG_00000b00, EXPREG_000008e0, and EXPREG_00000850.
    Conclusion
    Based on the results of the gene network analysis, the identified hub genes may contribute to adaptation to food compositions and be responsible for the development of low water stress tolerance in Salmonella. Among the food samples, the milk chocolate matrix leads to more adaptation pathways for S. Typhimurium survival, as more hub genes were down-regulated and more motifs were detected. The identified motifs were involved in carbohydrate metabolism, carbohydrate transport, electron transfer, and oxygen transfer.
    Keywords: Hub genes, Low water activity, Network analysis, Salmonella}
  • سوده یوسفی فخر، نفیسه دعوتی*، داریوش مینایی تهرانی

    هدف این مطالعه جداسازی سویه های میکروبی مولد آمیلاز مقاوم به حرارت از فاضلاب غنی از نشاسته یکی از کارخانه های کنسروسازی و سپس شناسایی مولکولی این جدایه ها بود. به علاوه آمیلاز مقاوم به حرارت استخراج شده از باکتری به لحاظ دما و pH بهینه فعالیت آنزیمی مورد بررسی قرار گرفت. در این مطالعه 14 جدایه میکروبی مقاوم به حرارت از پساب جدا گردید، که تنها دو جدایه دارای فعالیت آمیلازی بود. شناسایی مولکولی این دو جدایه براساس تکثیر ژن 16S rDNA توسط پرایمرهای B27F و U1492R و سپس توالی یابی محصول PCR ، حضور Bacillus pumilus وBacillus safensis  را تایید کرد. نتایج نشان داد که دما و pH بهینه فعالیت آمیلازی جدایه ها به ترتیب60 درجه سانتی گراد و 7 بود و  با عملکرد Bacillus safensis (U/ml) 7.67 دارای فعالیت آمیلاز بیشتری نسبت به Bacillus pumilus با عملکرد (U/ml) 6.33  بود.

    کلید واژگان: آمیلاز مقاوم به حرارت, باسیلوس, دما, پساب کارخانه}
    Soudeh Yousefi Fakhr, Nafiseh Davati*, Dariush Minai-Tehrani

    The aim of this study was to isolate thermostable amylase producing bacteria from starch-rich wastewater of one of the canning factories and then molecular identification of these isolates. In addition, the thermostable amylase extracted from the bacterium was investigated for the optimum temperature and pH of enzyme activity. In this study, 14 heat-resistant microbial isolates were isolated from wastewater and only two isolates had amylase activity.  Molecular identification of isolates based on amplification of 16S rDNA gene by B27F and U1492R primers and then sequencing of PCR product confirmed the presence of Bacillus pumilus and Bacillus safensis. The results showed that the optimum temperature and pH of amylase activity were 60°C and 7, respectively, and Bacillus safensis 7.67 (U/ml) had more amylase activity than of Bacillus pumilus 6.33 (U/ml).

    Keywords: Thermostable amylase, Bacillus, Temperature, Factory wastewater}
  • سوده یوسفی فخر، داریوش مینایی تهرانی، نفیسه دعوتی*، آریو امامی فر

    آمیلاز با تجزیه نشاسته آرد و تولید دکسترین با قابلیت متابولیسم سریع تر توسط مخمر نانوایی باعث بهبود بافت و خواص حسی نان حجیم می شود. این مطالعه به بررسی اثر آمیلاز مقاوم به حرارت استخراج شده از Bacillus safensis در سه سطح (U/ml) 0، 9/1، 9/2 و مدت زمان تخمیر در سه سطح 35، 40 و 45 دقیقه بر کیفیت نان حجیم که در فر با دمای210 درجه سانتی گراد به مدت 20 دقیقه پخته شده بود می پردازد. نتایج مطالعه ما نشان داد که افزودن سوپ فیلتر شده حاوی آمیلاز مقاوم به حرارت در سطح  (U/ml) 1.9 و تخمیر به مدت 40 دقیقه نسبت به سایر نمونه ها از نظر پارامترهایی از قبیل میزان حجم، نرمی، قابلیت ارتجاع و پذیرش کلی دارای مقبولیت بیشتری بود اما با افزودن مقادیر بیشتر آنزیم آمیلاز در سطح  (U/ml)2.9 از نظر خواص بافتی و حسی نتایج خوبی حاصل نشد

    کلید واژگان: آمیلاز, نان حجیم, بافت, خواص حسی}
    Soudeh Yousefi Fakhr, Dariush Minai-Tehrani, Nafiseh Davati*, Aryou Emamifar

    Amylase improves the texture and sensory properties of bulky bread by degrading starch and producing dextrin in order to faster metabolism by bakery yeast. This study investigates the effect of thermostable α-Amylase 0, 1.9, 2.9 (U/ml), extracted from Bacillus safensis, and fermentation time at 35, 40 and 45 minutes on the quality of bulky bread baked in oven at 210°C for 20 min. The results of our study showed that adding filtered soup containing   1.9 (U/ml) and fermentation for 40 minutes  was more acceptable than other samples in terms of volume, hardness, cohesiveness and overall acceptance, but adding more amounts of amylase enzyme at 2.9 (U/ml) level did not yield good results in terms of texture and sensory properties of bulky bread.

    Keywords: Amylase, Bulky Bread, Texture, Sensory properties}
  • سحر بهرامی، نفیسه دعوتی*، نوشین نوشیروانی

    اخیرا تولید محصولات تخمیری به دلیل فواید سلامت بخش آن به طور چشم گیری مورد توجه قرار گرفته است. دوینه یک فرآورده تخمیری شیری-غلاته است که غالبا در مناطق غرب ایران به صورت سنتی تهیه می شود. هدف از این مطالعه بررسی افزودن  8% شلغم، 8% کدو حلوایی به عنوان مکمل مغذی و مقادیر متفاوت خمیرترش 0، 0.5 و 1% جهت دستیابی به فرمولاسیونی بهینه با بافت مناسب و فلور میکروبی پایین در طی 9 روز تخمیر بود. نتایج نشان داد که تیمارهای شلغم، کدو حلوایی و مخمر نانوایی باعث بهبود بافت و کاهش فلور میکروبی دوینه شدند. در نمونه های دوینه حاوی مکمل مغذی و مخمر نانوایی، ویسکوزیته افزایش یافت و متقابلا رشد باکتری های بیماری زا و  pHکاهش معنی داری (p<0.05) نسبت به نمونه شاهد در طی زمان تخمیر نشان داد. در حالیکه جذب آب و روغن اختلاف معنی داری (p<0.05) در نمونه ها نشان نداد. براساس نتایج، فرمولاسیون حاوی 1% مخمر نانوایی و 8% شلغم به دلیل بافت بهتر و کنترل بهتر فساد میکروبی پیشنهاد می شود.

    کلید واژگان: دوینه, شلغم, کدو حلوایی, مخمر نانوایی}
    SAHAR BAHRAMI, Nafiseh Davati*, Nooshin Noshirvani

    Recently, the production of fermented products has received significant attention due to health benefits. Doineh is a cereal- dairy based fermented product that is often traditionally prepared in the western regions of Iran. The aim of this study was to investigate the effect of adding 8% turnip, 8% pumpkin as a nutritious supplement and different amounts of bakery yeast 0, 0.5 and 1% to achieve an optimal formulation with a good texture and low microbial flora during 9 days fermentation. The results showed that the treatments of turnip, pumpkin and bakery yeast improved the texture and reduced microbial flora of doineh. The viscosity of doineh samples containing bakery yeast increased and in contrast, the growth of pathogenic bacteria and pH significantly (p<0.05) decreased compared to the control. While, water and oil adsorption showed no significant difference ( p<0.05) in the samples. Based on the results, formulations containing 1% bakery yeast and 8% Turnip are suggested because of better texture and better control of microbial spoilage.

    Keywords: Doineh, Turnip, Pumpkin, Bakery yeast}
  • نفیسه دعوتی*
    سابقه و هدف

    حضور ژن های مقاوم به آنتی بیوتیک در پنیرهای محلی، به دلیل خطر مهاجرت ژن ها، افزایش مقاومت به آنتی-بیوتیک ها در مصرف کنندگان و درنتیجه بی اثر شدن داروهای مربوطه در طی دوره درمانی مطلوب نیست. اخیرا، مطالعات نشان داده است که تقاضای پنیرهای محلی حاصل از شیر خام افزایش یافته است. اما این نگرانی وجود دارد که با مصرف این پنیرها احتمال انتقال ژن های مقاوم به آنتی بیوتیک از طریق باکتری ها بخصوص گونه های انتروکوکوسی به مصرف کنندگان افزایش یابد. البته محصولات تخمیری سنتی ممکن است حاوی فلور میکروبی ذاتی با ویژگی های مفید منحصر به فرد شامل تولید متابولیت های ضدمیکروبی و مقاومت به فاژها باشند که برای صنایع لبنی بسیار مهم است. قابلیت تولید باکتریوسین توسط فلور میکروبی مسیول تخمیر پنیرهای حاصل از شیرخام بسیار مهم است زیرا از رشد باکتری های بیماریزا جلوگیری می کند. از اینرو، اهدف این مطالعه بررسی حضور فلور میکروبی مقاوم به آنتی بیوتیک در پنیرهای محلی حاصل از شیر خام و همچنین بررسی خواص مفیدی از جمله حضور متابولیت های ضدمیکروبی در آن بود.

    مواد و روش ها

    پنیر سنتی حاصل از شیر خام براساس یک دستورالعمل سنتی تهیه گردید. برای جداسازی انتروکوکوس ها، از محیط KAA آگار و سپس گرمخانه گذاری به مدت 48 ساعت در دمای °C 37 استفاده شد. رقیق سازی پنیر در رینگر تا رقت 8-10 استریل انجام شد. جهت جداسازی انتروکوکوس ها، 100 میکرولیتر از نمونه رقیق شده روی KAA آگار کشت گردید و سپس به مدت 48 ساعت تحت شرایط بی هوازی در °C 37 گرمخانه گذاری شد. جدایه های کاتالاز منفی و گرم مثبت توسط تست های فیزیولوژی (رشد در نمک با غلظت های 6.5% و 18% ، pHهای 9.6 و 4.4، دماهای °C10 و °C45 و تولید گاز) به صورت فنوتیپی در سطح جنس شناسایی شدند. بعد از تشخیص فنوتیپی جدایه ها در سطح جنس، شناسایی انتروکوکوس ها براساس روش مولکولی وابسته به کشت توسط PCR و سپس توالی یابی انجام شد.DNA استخراج شده از پنیر توسط تکنیک NGS تکثیر و توالی یابی گردید. داده های متاژنوم برای ژنوم مقاوم به فاژها و آنتی بیوتیک ها، قابلیت تولید باکتریوسین و ترکیبات آنتی اکسیدانی آنالیز شدند. به-علاوه، مقاومت جدایه ها به آنتی بیوتیک و خواص ضد میکروبی عصاره حاصل از پنیر بررسی شدند.

    یافته ها

    در کل20 باکتری از پنیر جدا شد و براساس تشخیص مولکولی شامل 60% انتروکوکوس مالودوراتوس، 5% انتروکوکوس فکالیس، 5% انتروکوکوس دورانس و 30% سایر گونه های انتروکوکوسی بودند. همچنین، آنالیز متاژنومیکس جامعه میکروبی پنیر نشان داد که جامعه انتروکوکوسی پنیر شامل 72% انتروکوکوس مالودوراتوس، 6% انتروکوکوس فکالیس، 13% انتروکوکوس ایتالیکوس و 10% سایر گونه های انتروکوکوسی است و میکروبیوم آن مقاوم به آنتی بیوتیک ها و باکتریوفاژها بوده و دارای پتانسیل تولید ترکیبات آنتی-اکسیدانی و ضدمیکروبی نظیر پلانتاریسین است. به علاوه، تست های آزمایشگاهی نیز مقاومت آنتی بیوتیکی و خواص ضدمیکروبی جدایه ها را تایید کرد.

    نتیجه گیری کلی:

     این مطالعه نشان داد که برخی پنیرهای محلی می توانند عامل انتقال ژن های مقاوم به آنتی بیوتیک به انسان باشند و بایستی مصرف این نوع پنیرها محدود گردد.

    کلید واژگان: انتروکوکوس, متاژنومیکس, مقاومت آنتی بیوتیکی, ضدمیکروبی, پنیر}
    Nafiseh Davati *
    Background and objectives

    The presence of antibiotic-resistant genes in local cheeses is not desirable due to the risk of gene migration, increased resistance to antibiotics in consumers, and therefore the effectiveness of related drugs during the treatment period. Recently, the studies showed that the demand of local cheeses made from raw milk have increased. However, there is concern that consumption of these cheeses could increase the risk of antibiotic-resistant genes transfer through bacteria especially Enterococcus spp to consumers. Of course, traditional fermented products may contain intrinsic microbial flora with unique useful properties, including the production of antimicrobial metabolites and resistance to phages, which is very important for the dairy industry. The ability of bacteriocin production by the microbial flora that responsible for fermentation of cheeses made from raw milk is very important because it prevents the growth of pathogenic bacteria. Therefore, the aims of this study were the evaluation of the presence of antibiotic-resistant microbial flora of local cheeses made from raw milk and the investigation of the useful properties such as the presence of its antimicrobial metabolites.

    Materials and methods

    Cheese made from raw milk was produced based on a traditional recipe. For isolation of Enterococcus spp., KAA agar was used, followed by incubation for 48 h at 37°C. The serial dilution of cheese was carried out until the final dilution of 10-8 in ringer. For isolation of Enterococcus spp., a 100 µl of diluted sample was cultured on KAA agar, then incubated for 48 h under anaerobic conditions at 37°C. The catalase-negative and Gram-positive isolates were phenotypically distinguished at genus level using physiological tests )growth at salt concentrations 6.5% and 18%, pH 9.6 and 4.4, temperatures 10°C and 45°C and gas production. After phenotypic detection of isolates at genus level, culture-dependent characterization through PCR and subsequently sequencing was carried out. DNA extracted from cheese was proliferated and sequenced by NGS technique. The metagenomics data were processed for phage resistance, antibiotic resistance, bacteriocin and antioxidant components production. Furthermore, antibiotic resistance of isolates and antimicrobial properties of cell free supernatant (CFS) from cheese were evaluated.

    Results

    A total of 20 bacteria were isolated from cheese and molecularly identified as Enterococcus malodoratous (60%), Enterococcus faecalis (5%), Enterococcus duran (5%), Enterococcus spp. (30%). Also, the metagenomic analysis showed that Enterococcal community of cheese include Enterococcus malodoratous (72%), Enterococcus faecalis (6%), Enterococcus italicus (13%), Enterococcus spp. (10%) and its microbiome is resistance to ‌-antibiotics ‌and bacteriophages and has the production potential of antioxidant compounds and antimicrobial compounds such as plantaricin. Moreover, laboratory tests confirmed ‌‌antibiotics resistance and antimicrobial properties of isolates.

    Conclusion

    This study showed that some local cheeses can be responsible for transferring antibiotic-resistant genes to humans and consumption of these cheeses should be limited.

    Keywords: Enterococcus, Metagenomic ‌, Antibiotics resistance, Antimicrobial-Cheese}
  • مبین زمان، نفیسه دعوتی*، مصطفی کرمی

    ماست گوسفندی یکی از محصولات لبنی مغذی در ایران است. هدف این مطالعه، شناسایی مولکولی باکتری های اسید لاکتیک جدا شده از ماست های گوسفندی مشهد، دزفول و همدان و بررسی خواص تکنولوژیکی آن ها بود. 47 جدایه باکتری توسط تکثیر ژن 16S rDNA با PCR و سپس توالی یابی از نظر مولکولی شناسایی شدند. خواص تکنولوژیکی جدایه ها شامل تولید اسید لاکتیک، دی استیل، فعالیت های لیپولیتیکی، اوره آزی و پروتیولیتیکی بررسی شدند. آنالیز آماری داده ها توسط SPSS نشان داد که تولید دی استیل و تغییرات pH درطی 24 ساعت توسط جدایه ها بین ماست های دزفول، همدان و مشهد به طور معنی داری (0.05>P) متفاوت است. خواص تکنولوژیکی جدایه ها ثابت کرد که استرپتوکوکوس سالواریوس زیرگونه ترموفیلوس (H1, H2)  و لاکتوباسیلوس دلبروکی زیرگونه بولگاریکوس (H1, H2, H3, H7, H9, H10)  از ماست گوسفندی همدان پتانسیل تکنولوژیکی بالایی دارند. همچنین براساس نتایج آنالیز خواص حسی و سفتی بافت ماست های تولید شده توسط جدایه های منتخب، استرپتوکوکوس سالواریوس (H2)  و لاکتوباسیلوس دلبروکی (H3) به عنوان کشت آغازگر مناسب پیشنهاد شدند.

    کلید واژگان: باکتری های اسید لاکتیک, بافت, لیپولیز, حسی, پروتئولیز}
    Mobin Zaman, Nafiseh Davati*, Mostafa Karami

    Eve’ yogurt is one of the nutritive dairy products in Iran. The aim of this study was molecular identification of lactic acid bacteria isolated of ewe yogurts from 3 different regions of Iran (Mashhad, Dezful, and Hamedan) and assessment of their technological properties. A total of 47 isolates were molecularly identified by PCR of 16S rDNA gene and sequencing. Isolates were evaluated for technological properties including Lactic acid and diacetyl production, lipolytic, urease, and proteolytic activities. The statistical analysis of data using SPSS software indicated that diacetyl production and pH changes by bacterial isolates for 24 hours were significantly (P<0.05) different among yogurts from Dezful, Hamedan and Mashhad. The technological properties of isolates demonstrated that Streptococcus salivarius subsp. thermophilus (H1, H2) and Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus (H1, H2, H3, H7, H9, H10) of ewe’s yogurt from Hamedan have high technological properties. Also, based on the analysis results of the organoleptic properties and texture stiffness of yogurts produced by selected isolates, S. salivarius (H2) and L. delbrueckii (H3) suggested as a suitable starter culture.

    Keywords: Lactic acid bacteria, texture, lipolytic, organoleptic, proteolytic}
  • نفیسه دعوتی*، سحر بهرامی

    در این مطالعه، یک پنیر محلی از شیر گاو براساس دستورالعمل محلی تهیه گردید. جمعیت میکروبی پنیر و توانایی عملکردی آن برای رسیدگی توسط توالی یابی کامل متاژنوم بررسی گردید. پنیر سنتی به وسیله کشت آغازگر مزوفیلیک تولید شد. پنیر در دمای °C10 به مدت 3 ماه دوره رسیدگی خود را طی کرد. نمونه ها از سطح پنیر جمع آوری گردید. بعد از خالص سازی کلنی ها، جدایه های گرم مثبت و کاتالاز منفی از لحاظ فنوتیپی در سطح جنس توسط تست های فیزیولوژی شامل قابلیت تولید گاز، رشد در pHهای مختلف (6/9 و 4/4)، تحمل نمک (5/6 و 18 درصد) و دماهای مختلف (10 و 45 درجه سانتی گراد) شناسایی شدند. نتایج شناسایی فنوتیپی نشان داد که اکثر سویه های باکتری های اسید لاکتیک متعلق بهStreptococcus, Lactococcus  و Lactobacillus بودند. همچنین نتایج آنالیز متاژنومیکس نشان داد که جنس های متعددی شاملStreptococcus, Lactococcus, Lactobacillus, Acinetobacter, Enterococcus Glutamicibacter,  و Weissella در پنیر وجود دارند. Streptococcus thermophilus, Lactococcus lactisوLactobacillus helveticus به عنوان گونه های غالب شناسایی شدند. باکتری های بیماری زا نظیرEnterobacter, Listeria  و Staphylococcus نیز به مقدار جزیی یافت شدند و بنابراین تقریبا نگرانی برای مصرف کنندگان و سلامت انسان وجود ندارد. میکروبیوم این پنیر، توانایی عملکردی برای سنتز رنج وسیعی از ترکیبات بو و مرتبط با توسعه طعم در این محصول را نشان داد که با متابولیسم و بیوسنتز متان، اسیدهای آمینه شاخه دار (ایزولوسین، والین، لوسین)، اسیدهای آمینه آروماتیک (تیروزین، تریپتوفان و فنیل آلانین)، سایر اسیدهای آمینه (ال-لیزین، بتا-آلانین)، اسیدهای چرب (آراشیدونات، پالمیتات، استیارات) و مونوساکاریدها در ارتباط بود. آنزیم های مرتبط با بیوسنتز و متابولیسم اسیدهای آمینه درطی رسیدگی این پنیر یافت شدند. این آنزیم ها شامل 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase, 2-isopropylmalate synthase, 3-dehydroquinate dehydratase, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase, 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase. بودند. براساس نتایج KAAS (سرور حاشیه نویسی اتوماتیک KEGG)، پروتئین های درگیر در مسیرهای متابولیکی جامعه میکروبی روی سطح پنیر سنتی شامل موارد زیر بودند: Cytochrome P450 Photosynthesis Proteins, Peptidases & Inhibitors, Glycosyltransferases, Lipopolysaccharide Biosynthesis Proteins, Peptidoglycan Biosynthesis and Degradation Proteins, Lipid Biosynthesis Proteins, Protein Kinases, Polyketide Biosynthesis Proteins Prenyltransferases, Protein Phosphatases & Associated Proteins, and Amino Acid Related Enzymes.. پنیر تحت مطالعه به عنوان یک غذای عملگر، فواید سلامتی برای مصرف کنندگان به واسطه حضور باکتری های پروبیوتیک و ژن های مرتبط با بیوسنتز ترکیبات با ارزش شامل آنتی بیوتیک ها، داروها و آنتی اکسیدان ها را نشان داد.

    کلید واژگان: پنیر, متاژنومیکس, طعم, باکتری اسید لاکتیک}
    Nafiseh Davati *, Sahar Bahrami
    Introduction

    The consumption of local and traditional dairy products have increased in recent years and some local cheeses as functional foods with desirable organoleptic attributes have positive effects on human health. However, there is concern that consumption of these products may increase the risk of exposure to food born bacteria such as Enterobacteriaceae family, Staphylococcus aureus, and Listeria monocytogenes. The microbiome of fermented products such as cheese is one of the most powerful and important parameters in flavor development and ripening. Furthermore, cheese flavor formation as a dynamic biochemical process is related to environmental conditions including milk source, ripening time, and temperature of storage. These parameters affect the microbial community structures and metabolic pathways.

    Materials and Methods

    In this study, a local cheese made from cow milk was prepared based on a local recipe. The traditional cheese was manufactured using mesophilic starter culture. The cheese was ripened at 10°C for 3 months. The samples were collected from the surface of the cheese. The serial dilution was performed until 10-10 dilution in sterile ringer. For isolation and phenotypic identification of lactic acid bacteria, a 100 µl of diluted sample was cultured on MRS agar and M17 agar, followed by incubation at 37°C for 48 h under anaerobic conditions with Gas-Pak A. After purification of colonies, the Gram-positive and catalase-negative isolates were phenotypically identified at genus level using physiological tests including capacity of gas production, growth at different pHs (9.6 and 4.4), salt tolerance (%6.5 and 18%), and different growth temperatures (10°C and 45°C). DNA extraction was performed with DNeasy®Blood & Tissue Kit. The microbial population of the cheese and its functional potential for ripening were investigated by whole-metagenome sequencing. The prepared library using Nextera™ DNA approach was sequenced by using the Illumina HiSeq® 2000, 2×100 bp paired- end reads. The metagenomics data of cheese microbiome were analyzed for taxonomic profiling and functional potential by De Novo Assemble Metagenome and Bin Pangenomes. The metabolic pathways were extracted from the KEGGdatabase.

    Results and Discussion

    The results of phenotypic identification showed that most of the lactic acid bacteria strains belonged to Streptococcus, Lactococcus, and Lactobacillus. Also, the results of metagenomics analysis showed that there were various genera including Streptococcus, Lactococcus, Lactobacillus, Acinetobacter, Enterococcus, Glutamicibacter, and Weissella in cheese. Streptococcus thermophilus, Lactococcus lactis, and Lactobacillus helveticus were identified as dominant species. Pathogenic bacteria such as Enterobacter, Listeria, and Staphylococcuswere also slightly found and therefore there is nearly no concern for consumers and human health. The microbiome of this cheese showed the metabolic potential for the biosynthesis of a wide range of  aroma compounds and associated with flavor development that related with the metabolism and biosynthesis of methane, branched chain amino acids (isoleucine, valine, and leucine), aromatic amino acids (tyrosine, tryptophan, and phenylalanine), other amino acids (beta-alanine, L-lysine), fatty acids (arachidonate, palmitate, stearate), and monosaccharides. The enzymes related to biosynthesis and metabolism of amino acids were found during ripening of this cheese. These enzymes included 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase, 2-isopropylmalate synthase, 3-dehydroquinate dehydratase, 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase, and 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase. Based on the results of KAAS (KEGG Automatic Annotation Server), proteins involved in metabolic pathways of microbial community on the surface of the traditional cheese included Cytochrome P450 Photosynthesis Proteins, Peptidases & Inhibitors, Glycosyltransferases, Lipopolysaccharide Biosynthesis Proteins, Peptidoglycan Biosynthesis and Degradation Proteins, Lipid Biosynthesis Proteins, Protein Kinases, Polyketide Biosynthesis Proteins Prenyltransferases, Protein Phosphatases & Associated Proteins, and Amino Acid Related Enzymes. The cheese under our study as a functional food showed health benefits for consumers due to the presence of probiotic bacteria and genes encoded for biosynthesis of valuable compounds including antibiotics, drugs, and antioxidants.

    Keywords: Cheese, Metagenomic, Flavor, Lactic acid bacteria}
  • نفیسه دعوتی*، سمیه علی میرزایی

    امروزه به دلیل اثرات جانبی نگهدارنده های شیمیایی، مصرف نگهدارنده های طبیعی نظیر اسانس های روغنی پیشنهاد می شود. سال های زیادی است که فعالیت ضدمیکروبی اسانس های روغنی به خوبی شناخته شده است. در این مطالعه، بعد از تهیه اسانس روغنی آرتیمیسیا افسنطین، ترکیبات آن توسط کروماتوگرافی گازی-طیف سنج جرمی GC-MS)) شناسایی شد. سپس فعالیت ضدمیکروبی اسانس روغنی علیه استافیلوکوکوس اوریوس، اشرشیاکلی، سالمونلا تایفی و باسیلوس سریوس توسط روش های انتشار دیسک در آگار، MIC و MBC ارزیابی گردید. براساس نتایج MIC، غلظت های اسانس روغنی (µl/ml) 16، 32 و 64 جهت ارزیابی کارایی آن در غیرفعال سازی رشد باکتری های بیماریزا روی کاهوی تازه انتخاب گردید. کاهو با استافیلوکوکوس اوریوس، اشرشیاکلی، سالمونلا تایفی و باسیلوس سریوس تلقیح گردید و تعداد باکتری ها در فواصل زمانی (0، 3، 24 و 72 ساعت) شمارش گردید. غلظت زد- بتا- اوسیمن اکساید به عنوان ترکیب اصلی اسانس روغنی 2.36± 76.53 % بود. نتایج مقادیر MIC، MBC و انتشار دیسک در آگار نشان داد که حساس ترین و مقاوم ترین باکتری ها به ترتیب استافیلوکوکوس اوریوس و اشرشیاکلی می باشند. در مقایسه با کنترل (آب)، کاهوی تیمار شده با اسانس روغنی µl/ml 64 بعد از 72 ساعت تیمار نشان داد که باعث کاهش 3.36، 2.27، 3.23 و 3.47 لگاریتمی به ترتیب در تعداد استافیلوکوکوس اوریوس، اشرشیاکلی، سالمونلا تایفی و باسیلوس سریوس در هر گرم کاهو می شود. این تحقیق نشان داد که اسانس روغنی آرتیمیسیا افسنطین می تواند یک عامل ضدمیکروبی موثر جهت کنترل رشد باکتری های پاتوژنیک روی کاهوی تازه باشد.

    کلید واژگان: ضدمیکروبی- آرتیمیسیا افسنطین- کاهو}
    Nafiseh Davati*, Somaye Ali Mirzaei

    Today, because of the side effects of chemical preservatives, it is suggested to use natural antimicrobial compounds such as essential oils. The antimicrobial activities of essential oils are well recognized for many years. In this study, after preparation of Artemisia absinthium essential oil, its components were identified by Gas chromatography–mass spectrometry (GC-MS). Then antibacterial activity of the essential oil was evaluated against Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Salmonella typhi and Bacillus cereus by agar disk-diffusion, MIC and MBC methods. Based on MIC results, essential oil concentrations of 16, 32 and 64 (µl/ml) were selected to evaluate its efficacy in inactivating the growth of pathogenic bacteria on fresh lettuce. Lettuce was inoculated with Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Salmonella typhi and Bacillus cereus and the bacterial count were enumerated at time intervals (0 h, 3 h, 24 h, and 72 h). The concentration of (Z)-β-Ocimene oxide as the major component of the essential oil was 76.53±2.36%. The results of MIC, MBC values and agar disk-diffusion showed that the most sensitive and the most resistant bacteria were Staphylococcus aureus and Escherichia, respectively. Compared to control (water), lettuce treated with 64 µl/ml essential oil at 72 h after treatment showed an up to 3.36, 2.27, 3.23 and 3.47 log CFU/g reductions in Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Salmonella typhi and Bacillus cereus, respectively. This research showed that Artemisia absinthium essential oil may be an effective antimicrobial agent to the Control of pathogenic bacteria growth on fresh lettuce.

    Keywords: Antimicrobial- Artemisia absinthium- Lettuce}
  • نفیسه دعوتی *، شهره حسامی
    برخی مردم نگران مصرف مواد غذایی ارگانیکی هستند که احتمالا توسط ریزسازواره¬های بیماری¬زا آلوده شده¬اند، زیرا برخی از این مواد غذایی تحت شرایط بهداشتی ضعیف تولید می¬شوند. هدف از این مطالعه ارزیابی کیفیت بهداشتی دوغ گوسفندی از عشایر سومار و شناسایی کل جامعه میکروبی آن به خصوص باکتری¬های اسید لاکتیک می¬باشد. مجموع 40 باکتری اسید لاکتیک از 3 نمونه دوغ گوسفندی جدا گردید. این جدایه¬ها براساس روش مولکولی وابسته به کشت، توسط تکثیر ژن 16S rRNA با پرایمرهای یونیورسال27F و 1492R و توالی یابی، به صورت Lactobacillus apis 20% Lactobacillus ultunensi, 10% Pediococcus argentinicus, 10% و Lactobacillus delbrueckii 40% شناسایی گردیدند. این شناسایی توسط روش مولکولی مستقل از کشت براساس نسل جدید توالی یابی آمپلیکون¬های ژن 16S ribosomal RNA کامل شد. نواحی V3 و V4 از ژن 16S rRNA تکثیر شد و توسط پلتفرم Illumina MiSeq توالی یابی گردید. این داده¬ها با نرم افزار BaseSpace و بانک اطلاعاتی greengenes آنالیز گردید. جامعه میکروبی دوغ گوسفندی برپایه نسل جدید توالی¬یابی در سطح جنس به صورت 08/94% Lactobacillus، 07/1% Pediococcus، 33/0% Streptococcus، 20/0% Enterococcus، 11/0% Candidatus Blochmannia، 11/0% Alkalibacillus، 06/0% Cohnella و 02/3% باکتری غیرقابل طبقه¬بندی شناسایی شدند. در سطح گونه به صورت 82/24% Lactobacillus equicursoris، 81/51% Lactobacillus delbrueckii، 61/3% Lactobacillus apis، 79/2% Lactobacillus ultunensis، 86/0% Lactobacillus taiwanensis، 85/0% Lactobacillus gigeriorum، 42/0% Pediococcus argentinicus و 64/13% باکتری غیرقابل طبقه¬بندی شناسایی شدند. روش نسل جدید توالی یابی در شناسایی تنوع میکروبی دوغ صحیح¬تر و بهتر شناخته شد. نتایج نشان داد دوغ گوسفندی عشایر سومار از کیفیت ضعیف بهداشتی برخوردار است اما هیچ باکتری بیماری¬زایی در این محصول شناسایی نگردید.
    کلید واژگان: دوغ, گوسفند, عشایر, نسل جدید توالی یابی}
    Nafiseh Davati *, Shohreh Hesami
    Introduction
    Nowadays, More people are interested in consuming organic products. Many of the organic foods and dairy products are produced by rural people and nomads in Iran. Some people are concerned about using of the contaminated organic foods with pathogenic microorganisms, because some of these organic foods are produced under poor hygienic conditions. On the other hand, many native strains of probiotic bacteria especially lactic acid bacteria can be found in these organic foods. In this study, the microbial community and sanitary quality of ewe’s drinking yogurt produced by Somar region nomads, by using culture dependent molecular method and next-generation sequencing (NGS), as a new tool for the culture independent molecular characterization of bacteria, were assessed.
    Materials and methods
    A total of three Ewe's drinking yogurt samples were collected from the nomads of Somar region in Iran under sterile conditions. For phenotypic identification of lactic acid bacteria, a volume of 0.1 milliliters of appropriate dilutions was cultured on MRS agar and M17 agar media. The plates were incubated at 37oC under anaerobic condition with Anaerocult® A for 48 hours. Typical LAB characteristics colonies were purified by streaking method on MRS agar and M17 agar. The catalase negative and Gram positive isolates were selected as presumptive lactic acid bacteria for phenotypic identification to the genus level. These isolated bacteria were tested for growth at 100C and 450C in MRS and M17 broth, gas production from glucose, growth in the presence of 6.5% and 18% of NaCl, growth at pH 4.4 and pH 9.6 and arginine hydrolysis. Isolates were identified by amplification of the 16S ribosomal RNA gene by Polymerase Chain Reaction and ribosomal DNA sequencing as a culture dependent molecular method. After DNA extraction of isolates, PCR was performed using prokaryotic 16S rDNA universal primers 27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') and 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3). In the next step, the culture-independent molecular method based on next-generation sequencing of 16S ribosomal RNA gene amplicons was applied. The V3 and V4 regions of 16S ribosomal RNA gene were amplified using Forward Primer 5'TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCCTACGGGNGGCWGCAG and Reverse Primer 5'GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGACTACHVGGGTATCTAATCC Overhang adapter sequences were appended to the primer pair sequences for compatibility with Illumina index and sequencing adapters. The Illumina overhang adapter sequences to be added to locus‐specific sequences were: Forward overhang: 5’ TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAG‐ [locus- specific sequence] Reverse overhang: 5’ GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG‐[locus- specific sequence]. Both contained an Illumina adapter region for sequencing on the Illumina MiSeq System. Then, Illumina sequencing on MiSeq was performed. The fastq files from the next generation sequencing were analyzed with BaseSpace (cloud‐based software, MSR: Metagenomics, version: 2.4.60.8). This metagenomics analysis classified organisms from V3 and V4 amplicon using a database of 16S rRNA data and performed a taxonomic classification using the Greengenes database showing species level classification in a graphical format (http://greengenes.lbl.gov/). The analysis output was a classification of reads at several taxonomic levels: kingdom, phylum, class, order, family, genus, and species. The analysis results included tables, cluster pie charts, phylogenetic trees and bar charts. The average and error bars of the relative abundance (%) of bacterial species from ewe’s milk and yogurt were calculated using Microsoft Excel 2010 software.
    Results & Discussion
    A total of 40 bacteria as lactic acid bacteria were isolated from ewe’s drinking yogurt. Among isolated bacteria, two different genus of lactic acid bacteria were phenotypically characterized as 88% Lactobacillus, 3.5% Pediococcus and 8.5% Non-lactic acid bacteria. Isolates were identified by ribosomal DNA sequencing as Lactobacillus delbrueckii, Lactobacillus apis, Lactobacillus ultunensis and Pediococcus argentinicus.
    The microbial community from ewe’s drinking yogurt were identified on the basis of Next-generation sequencing (NGS) at genus level as 94.08% Lactobacillus, 1.07% Pediococcus, 0.33% Streptococcus, 0.20% Enterococcus, 0.11% Candidatus Blochmannia, 0.11% Alkalibacillus, 0.06% Cohnella and 3.02% unclassified. At species level 24.82% Lactobacillus equicursoris, 51.81% Lactobacillus delbrueckii, 3.61% Lactobacillus apis, 2.79% Lactobacillus ultunensis, 0.86% Lactobacillus taiwanensis, 0.85% Lactobacillus gigeriorum, 0.42% Pediococcus argentinicus and 13.64% unclassified were identified. Findings of this study have provided fundamental knowledge on sanitary quality and microbial composition of drinking yogurt produced by Somar nomads. Both phenotypic and molecular identification methods showed Pediococcus and Lactobacillus genus as the dominant genera in these samples. Molecular identification results showed Lactobacillus delbrueckii as the dominant species. Four species, Lactobacillus delbrueckii, Lactobacillus apis, Lactobacillus ultunensis and Pediococcus argentinicus were identified by both cultivation-dependent and cultivation-independent (NGS) methods. Rather, culture-dependent and culture-independent methods were found to be complementary in describing the microbial community of the ewe’s drinking yogurt produced by Somar nomads. The next-generation sequencing was found to be more accurate method in detecting the microbial diversity of drinking yogurt. The results showed poor hygienic quality of ewe’s drinking yogurt from Somar nomads, but there were no pathogenic bacteria in this product.
    Keywords: Next-Generation Sequencing, Drinking Yogurt, Ewe, nomds}
  • نفیسه دعوتی، فریده طباطبایی یزدی، سعید زیبایی*، فخری شهیدی، محمدرضا عدالتیان
    مطالعات نشان داده اند که شیر شتر و محصولات تخمیری آن خواص درمانی و ارزش تغذیه ای بالایی دارند. باکتری های اسید لاکتیک نقش مهمی در محصولات تخمیری لبنی بازی می کنند. هدف از این مطالعه تعیین اجتماع لاکتوباسیل های شیر شتر است. 9 لاکتوباسیل از شیر شتر تک کوهانه استان گلستان جداسازی گردید. لگاریتم تعداد واحد تشکیل دهنده کلنی لاکتوباسیل ها روی محیط MRS تحت شرایط بی هوازی در دماهای 20، 37 و 45 درجه سانتی گراد به ترتیب 14/0±792/8،07/0±301/8 و 03/0±301/7 بود. بر اساس خواص بیوشیمیایی و فنوتیپی باکتری های لاکتوباسیلوس پاراپلانتاروم،لاکتوباسیلوس فرینتوشنسیز، لاکتوباسیلوس برویس، لاکتوباسیلوس پانتریس، لاکتوباسیلوس جونسونی و لاکتوباسیلوس مالی در این شیر شناسایی شدند. حضور اسیدلاکتیک باکتری ها توسط تشکیل باند محصول PCR درbp 1500 تایید شد (تکثیر ژن 16S rRNA با پرایمرهای یونیورسال B27F و U1492R). بررسی خواص تکنولوژیکی جدایه ها نشان دادکه لاکتوباسیل های جدا شده دارای فعالیت لیپولیتیکی و پروتئولیتیکی بوده و قابلیت بالایی در تولید اسید (به غیر از لاکتوباسیلوس مالی و لاکتوباسیلوس جونسونی)دارند. همچنین این جدایه ها به غیر لاکتوباسیلوس جونسونی قابلیتاتولیزاسیون در سطح نسبتا خوب دارند. بر اساس بررسی خواص تکنولوژیکی جدایه های لاکتوباسیلوس پاراپلانتاروم، لاکتوباسیلوس برویس و لاکتوباسیلوس پانتریس کاندیداهای مناسبی برای فراوری شیر شتر و سایر محصولات لبنی دیگر پیشنهاد می شوند.
    کلید واژگان: شتر, شیر, لاکتوباسیل ها, لیپولیتیک, پروتئولیتیک}
    Nafiseh Davati, Farideh Tabataba I. Yazdi, Saeed Ziba I. *, Fakhri Shahidi, Mohammad Reza Edalatian
    Studies have shown that camel milk and its fermented products have therapeutic properties and high nutritional value. Lactic acid bacteria play important role in Fermented dairy products. The aim of this study is to determine the lactobacillus community of camel milk. A total of 9 Lactobacillus were isolated from camel milk of Golestan province in Iran. The log10 CFU of Lactobacillus per ml on MRS medium under anaerobic condition at 20, 37 and 450C included 8.792± 0.14, 8.301±0.07 and 7.301±0.03 respectively. Isolates were identified on the basis of Biochemical and Phenotypic Characteristics as Lactobacillus paraplantarum, Lactobacillus ferintoshensis, Lactobacillus brevis, Lactobacillus pantheris, Lactobacillus johnsonii, Lactobacillus mali. Presence of Lactic acid bacteria was confirmed by band formation of PCR product in 1500 bp (amplification 16S rRNA gene using B27F-U1492Runiversal bacterial primer). Evaluation of their technological properties of isolates showed that isolated Lactobacillus fromcamelmilkhave lipoliticy, Proteolytic activity and high acidifying activity (except for Lb. mali and Lb. johnsonii). Also, allisolates, except Lb. Johnsonii, have autolytic activity in fair level. Based on technological properties ofisolates, Lb. paraplantarum, Lb. Brevis and Lb. pantheris are suggested as good candidates for camels milk processing or other fermentation process.
    Keywords: Camel, Milk, Lactobacillus, Lipolytic, Proteolytic}
  • Nafiseh Davati, Farideh Tabatabaee Yazdi, Saeed Zibaee *, Fakhri Shahidi, Mohammad Reza Edalatian
    Background
    Camel milk is amongst valuable food sources in Iran. On the other hand, due to the presence of probiotic bacteria and bacteriocin producers in camel milk, probiotic bacteria can be isolated and identified from this food product..
    Objectives
    The objectives of the present research were the isolation and molecular identification of lactic acid bacteria from camel milk and evaluation of their probiotic properties..
    Materials And Methods
    A total of ten samples of camel milk were collected from the Golestan province of Iran under aseptic conditions. Bacteria were isolated by culturing the samples on selective medium. Isolates were identified by amplification of the 16S rDNA and Internal Transcribed Spacer (ITS) region between the 16S and 23S rRNA genes by Polymerase Chain Reaction (PCR) and were then screened and grouped by the Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA) method. To evaluate probiotic properties, representative isolates of different ARDRA profiles were analyzed. The antimicrobial activity of Lactic Acid Bacteria (LAB) against Pediococcus pentosaceus, Escherichia coli and Bacillus cereus was examined by the agar diffusion assay. Acid and bile tolerance of isolates were evaluated..
    Results
    A total of 64 isolates were analyzed based on biochemical tests and morphological characteristics. The most frequently isolated LAB was Enterococci. Weissella, Leuconostoc, Lactobacilli and Pediococci were less frequently found. Based on restriction analysis of the ITS, the isolates were grouped into nine different ARDRA patterns that were identified by ribosomal DNA sequencing as P. pentosaceus, Enterococcus faecium strain Y-2, E. faecium strain JZ1-1, E. faecium strain E6, E. durans, E. lactis, Leuconostoc mesenteroides, Lactobacillus casei and Weissella cibaria. The results showed that antimicrobial activity of the tested isolates was remarkable and P. pentosaceus showed the most antibacterial activity. In addition, E. durans, E. lactis, L. casei and P. pentosaceus were selected as probiotic bacteria..
    Conclusions
    This study revealed the presence of bacteriocin-producing bacteria and probiotic bacteria in camel milk from the Golestan province of Iran..
    Keywords: Milk, Camel, Probiotic, Antibacterial}
سامانه نویسندگان
  • دکتر نفیسه دعوتی
    دعوتی، نفیسه
    استادیار علوم و صنایع غذایی، دانشگاه بوعلی سینا
اطلاعات نویسنده(گان) توسط ایشان ثبت و تکمیل شده‌است. برای مشاهده مشخصات و فهرست همه مطالب، صفحه رزومه ایشان را ببینید.
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال