به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
فهرست مطالب نویسنده:

nahid masoudi

  • Farinaz Farhoudi, MohammadEbrahim Zohalinezhad, MohammadMehdi Zarshenas, Nahid Masoudi, Ebrahim Fallahzadeh Abarghooei, Mahdi Haghighatafshar *
    Introduction

    The standard treatment for differentiated thyroid carcinoma is post-surgical radioiodine ablation; however, salivary gland damage is prevalent. This study aimed to evaluate the efficacy of Zataria multiflora Boiss. (ZM) aerial part essential oil in protecting salivary glands from post-radioiodine therapy damage in differentiated thyroid cancer patients.

    Methods

    In this randomized clinical trial, 24 patients with differentiated thyroid cancer were randomly allocated to two groups: 11 patients in the ZM essential oil group and 13 in the placebo group. Patients in the intervention and placebo groups received 20 oral drops three times a day of ZM essential oil or placebo respectively, starting from one week before radioiodine therapy to 4 weeks afterward. Salivary gland function was assessed using scintigraphic parameters before and six months following radioiodine therapy.

    Results

    Follow-up scintigraphy demonstrated significant decrease in parotid UI in the placebo group (P=0.032) while significant increase in UI (P=0.025) and EF (P=0.042) of the parotid was observed in the ZM group. Comparing changes in functional indices of salivary glands between the two groups after six months revealed significantly better function in parotid UI (P=0.005) and parotid EF (P=0.006) in the ZM group. Substantial damage to parotid UI was significantly less in the ZM group (P=0.044).

    Conclusion

    Results of this study demonstrated that administration of ZM essential oil to patients with differentiated thyroid cancer may protect the salivary glands from radioiodine injury.

    Keywords: Persian medicine, Radioiodine, Salivary gland scintigraphy, Thyroid cancer, Zataria multiflora Boiss
  • مریم افراشته، داود کولیوند*، محمد حاجی زاده، ناهید مسعودی

    یکی از ویروس های مهم آلوده کننده درختان میوه، ویروس لکه برگی کلروتیک سیب (Apple chlorotic leaf spot virus, ACLSV است. تهیه آنتی بادی و طراحی کیت الایزا و بیوسنسورها یکی از راهبردهای مفید در تشخیص زود هنگام عوامل بیماری‎ زا در نمونه های با تعداد زیاد است. در همین راستا، تحقیق حاضر با هدف تولید آنتی بادی چندهمسانه ای نوترکیب و طراحی کیت الایزا جهت ردیابی سریع ویروس لکه برگی کلروتیک سیب با استفاده از بیان در سیستم پروکاریوتی انجام شد. ابتدا، سازه pTG19-ACLSV-CP به باکتریEscherichia coli  سویه DH5α منتقل و پس از تکثیر و استخراج پلاسمید نوترکیب، ژن پروتیین پوششی با استفاده از آنزیم های برشی خارج و درون پلاسمید بیان pET28(a) همسانه سازی گردید. سازه بیان pET28-ACLSV-CP ساخته شده به منظور بیان پروتیین، به باکتری E. coli  سویه BL21(DE3) منتقل شد. پس از بهینه سازی، بیان و استخراج پروتیین پوششی، نوار پروتیینی با اندازه تقریبی 27 کیلودالتون چهار ساعت بعد از القاء مشاهده شد. سپس، پروتیین بیان شده به روش طبیعی با ستون Ni-NTA Agarose، خالص سازی شد. پروتیین خالص شده، به عنوان آنتی ژن به خرگوش ماده نژاد نیوزیلندی طی چهار مرحله تزریق شد. ایمنوگلوبولین ها با استفاده از کیت تخلیص IgG مبتنی بر پروتیین A از سرم خون به دست آمده از خرگوش های ایمن شده تخلیص شدند. کارایی ایمنوگلوبولین های خالص شده، نشان داد که کاربرد غلظت 1:1000 آنتی بادی نوترکیب تهیه شده و نشاندار برای ردیابی آنتی ژن های موردنظر مناسب هستند. نتایج آزمون های مختلف نشان داد، آنتی بادی تولید شده جهت ردیابی ویروس لکه برگی کلروتیک سیب دارای اختصاصیت و کارایی مناسب است،  و از این آنتی بادی ها می توان برای شناسایی این ویروس به منظور غربال درختان و یا نمونه های مشکوک استفاده کرد.

    کلید واژگان: لکه برگی کلروتیک سیب, پلاسمید, بیان پروتئین, ژن پروتئین پوششی, خالص سازی
    Maryam Afrashtehg, Davoud Koolivand*, Mohammad Hajizadeh, Nahid Masoudi

    Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) is one of the most important viruses infecting fruit trees. Preparation antibodies, ELISA kit and, biosensors are one of the applicable strategies to rapid and efficient screen a number of viral samples. To aim, the recent study was conducted to raise recombinant polyclonal antibodies to rapid detection of Apple chlorotic leaf spot virus by expressing coat protein gene in the prokaryotic system. First, the pTG19-ACLSV-CP was transformed to E. coli DH5α, the replicated plasmids were extracted and double digested was optimized by restriction enzymes, then the released fragment (Coat protein gene) was cloned into pET28 as an expression vector. Next, the expression construct (pET28a-ACLSV-CP) was transformed into E. coli strain BL21 (DE3) to express the coat protein gene. After optimization of expression the transformed cells, a protein band an approximate size of 27 kDa (22 kDa for coat protein and about 5 kDa for histidine tags) was observed at four hours after induction. The recombinant protein was purified by native methods using Ni-NTA Agarose column, then purified proteins were injected into New Zealand female rabbits in four steps as antigen. IgGs were purified from serums raised from immunized rabbits using an IgG purification kit. The efficiency of purified IgGs was approved that a 1: 1000 concentration of recombinant anti-ACLSV-CP antibodies are efficient to detect the desired antigens. The results showed the raised antibodies have enough specificity to detect Apple chlorotic leaf spot virus in gardens and seedlings.

    Keywords: ACLSV, Plasmid, Protein Expression, Coat Protein Gene, Purification
  • Nahid Masoudi, Tahereh Ghaedian *, Saeed Deilami
    Introduction
    Gated SPECT myocardial perfusion scanning has new capabilities in addition to its main applications such as left ventricular dyssynchrony using phase analysis. Phase analysis has been investigated through various software including Emory Cardiac Toolbox (ECTb) and Quantitative Gated SPECT (QGS). The aim of this study is to evaluate the effect of reconstruction parameters on dyssynchrony indices including phase histogram bandwidth (PHB) and phase standard deviation (PSD) derived from two different software packages.
    Methods
    In this study three groups of patients including 47 patients with normal findings 53 patients with Left bundle branch block (LBBB) and 47 patients with heart failure (HF) (including gated studies with 8 or 16 frames). All studies were analyzed by both ECTb and QGS software and reconstructed by both FBP and OSEM reconstruction methods. Then, the PHB and PSD were compared between these methods in separate patient groups.
    Results
    Comparison of two reconstruction methods in ECTb and QGS software showed no statistical difference for mean PHB and PSD parameters except for PHB in HF patients that analyzed with ECTb and obtained by 8 frame. On the other hand, the comparison of two software (QGS and ECTb) showed significant difference for both PHB and PSD, although, the correlation of two software was acceptable and significant.
    Conclusion
    The present study showed that the method of cardiac scan reconstruction had no significant effect on the ranges of dyssynchrony parameters obtained from phase analysis. However, the type of software used for phase analysis, significantly affect the PHB and PSD.
    Keywords: Phase analysis, Dyssynchorony, Myocardial perfusion scan
  • Maryam Shahbazi, Tahereh Poordast, Nahid Masoudi, Mahdi Haghighatafshar *
    Introduction
    Endometriosis is a gynecological disease and disorder that occurs when endometrial cells are shed through the fallopian tubes and are implanted on the surfaces of pelvis and abdomen. They form lesions that respond to hormones of the menstural cycle and will stimulate inflammation. It is controversial whether [99mTc]Tc-RBC scan would be sufficient for localizing bleeding sites. This study evaluated the value of [99mTc]Tc-RBC in diagnosing endometriosis.
    Methods
    Twenty patients were included in the study for endometriosis localization. Between the 2nd and the 5th days of menstruation, when the lesions were highly activated, [99mTc]Tc-RBC scan was performed and compared with TVUS, pelvic MRI and laparoscopic surgery findings. Scans of the patients were reported by two nuclear medicine specialists who were blind to patients’ history.
    Results
    The patients’ age range was 21-48 years (mean age: 35±8.79). The sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value for the right pelvic bleeding sites were 73.3%, 80.0%, 91.7% and 50%, respectively while the corresponding indices on the opposite pelvic site were find to be 87.5%, 75.0%, 93.0% and 60%, respectively.
    Conclusion
    Radiolabeled red blood cell scintigraphy has the potential to be used as an alternative procedure for diagnosing endometriosis.
    Keywords: Red blood cell, Scintigraphy, Endometriosis, Tc-99m
  • ناهید مسعودی، محمدحسن عصاره، احمد روحی بخش، رسول مدنی، مسعود نادرپور*، تارا امامی، سید محمد امینی، داود کولیوند
    علیرغم وجود روش های مختلف در تشخیص ویروس ها، زمان بر بودن آزمون ها یکی از مهمترین محدودیت های آنها است. از این رو، توسعه روش های سریع تر برای صدور گواهی در ایستگاه های قرنطینه و مدیریت ویروس های گیاهی اهمیت شایانی دارد. در این تحقیق، با استفاده از فناوری نانو، نانوذرات طلا (AuNP) برای شناسایی ویروس اس سیب زمینی (Potato virus S, PVS) به کار گرفته شد. AuNP از طریق احیاء سیترات تهیه شد و سپس آنتی بادی اختصاصی پروتئین پوششی PVS به آ نها متصل شد. بهینه سازی واکنش اتصال با تغییر اسیدیته AuNPs و غلظت آنتی بادی انجام گرفت. با استفاده از نانوذرات پوشش داده شده با آنتی بادی، تشخیص آنتی ژن در غلظت های مختلف با طیف سنجی انجام شد. پس از اتصال آنتی بادی به نانوذرات طلا، بیشینه جذب نانوذره به علت افزایش اندازه ذرات به مقدار 4-5 نانومتر تغییر کرده و از 524 به 530 نانومتر رسید. اتصال آنتی ژن به نانوذره نیز موجب تغییر اندازه ذرات و افزایش بیشینه جذب از 530 به 539 نانومتر شد. طیف جذبی نانوذره در  هنگام استفاده از PVY و CMV تغییر نکرد. این مطالعه اولین تلاش برای استفاده از نانوذرات در تشخیص سریع و آسان PVS است.
    کلید واژگان: نانوذرات طلا, آنتی بادی, بیوسنسور, تشدید پلاسمون, ویروس اس سیب زمینی
    Nahid Masoudi, Mohamad Hasan Assareh, Ahmad Rouhibakhsh, Rasoul Madani, Masoud Naderpour *, Tara Emami, Seyed Mohammad Amini, Davoud Koolivand
    In spite of existing of several methods for detection of viruses, time consuming is major limitation of them. So, developing faster and real time method is important to certificate the plant materials in quarantine stations and virus management. In the recent research, nanotechnology was employed to detect Potato virus S (PVS) using gold nanoparticles (AuNPs). Colloidal AuNPs were prepared through citrate reduction and conjugated to a specific antibody against PVS coat protein. Conjugation was optimized by changing the pH of AuNPs and antibody concentration. Antibody coated nanoparticles were used to detect different concentrations of antigen using spectrophotometry. After binding the antibody to the gold nanoparticles which cause an increase in particle size, the SPR peak was displaced in range of 4-5 nm and shifted from 524 to 530 nm. The binding of the antigen to the nanoparticle also caused a change in the particle size and an increase maximum absorbance from 530 to 539 nm. No spectral change were seen when PVY and CMV used as controls. This study is the first attempt of nanoparticle usage in quick and easy detection of PVS
    Keywords: Gold nanoparticles, Antibody, Biosensors, plasmon resonance, Potato virus S
  • ناهید مسعودی، احمد روحی بخش*، محمدحسن عصاره، مسعود نادرپور، داود کولی وند
    بیان ژن ویروس ها در باکتری برای مطالعه پروتئین ویروس ها و تولید آنتی بادی اختصاصی مورد استفاده قرار می گیرد. در این پژوهش، نمونه های سیب زمینی از هشت استان ایران جمع آوری شده و ردیابی ویروس Potato virus S، به عنوان یکی از مخرب ترین ویروس های سیب زمینی، بوسیله داس-الیزا و آرتی-پی سی آر انجام گرفت. تعیین گروه غالب با توجه به توالی ژن پوشش پروتئینی و پس از تجزیه فیلوژنی انجام شد. ژن کامل CP تکثیر و همسانه سازی شده و مورد توالی یابی قرار گرفت، سپس از پلاسمید pJET1.2/blunt برش داده شده و به پلاسمید بیان pET-28a (+) متصل شد و سازه (pET-28a:PVS:CP) به باکتری Escherichia coli سویه BL21 منتقل شد. بهینه سازی بیان ژن با القا بوسیله IPTG در غلظت های 5/0، 1 و 2 mM به مدت 3، 4 و 6 ساعت انجام گرفت و توسط SDS-PAGE و وسترن بلات تایید شد. بر اساس توالی نوکلئوتیدی، جدایه های ایرانی PVS به سه گروه تقسیم شدند که یک گروه با 22 عضو به عنوان گروه غالب شناخته شد. بیان پروتئین نوترکیب با وزن 34 کیلودالتون توسط وسترن تایید شد. القاء با غلظت 1 میلی مولار IPTG و به مدت 4 ساعت بهترین بیان را نشان داد. این نخستین گزارش بیان ژن پوشش پروتئینی ویروس PVS است که برای تهیه آنتی بادی این ویروس اهمیت دارد.
    کلید واژگان: ویروس اس سیب زمینی, بیان ژن, پروتئین نوترکیب, تجزیه فیلوژنتیکی, PVS
    Nahid Masoudi, Ahmad Rouhibakhsh*, Mohammad Hassan Asareh, Masoud Naderpour, Davoud Koolivand
    Gene expression in bacteria have already been used to study the protein of viruses and to produce specific antibodies. In this research, potato samples were collected from eight provinces of Iran and were tested for Potato virus S, as one of the most destructive viruses of potato fields, by DAS-ELISA and RT-PCR. Dominant isolate of PVS was selected according to coat protein (CP) gene sequences following phylogenetic analysis. Full length CP gene was amplified, cloned and sequenced, then was digested from pJET1.2/blunt vector, ligated into the expression vector pET-28a and the construct (pET-28a:PVS:CP) was transformed into Escherichia coli BL21 strain. Gene expression was optimized by induction with 0.5, 1 and 2 mM final concentrations of IPTG for 3, 4 and 6 h and was verified by SDS-PAGE and Western blotting. Based on the nucleotide analysis, the Iranian isolates of PVS were divided into three groups that one group with 22 members known as the dominant group. The expression of recombinant CP of about 34 kDa was proved by western blotting. Induction by 1 mM IPTG for 4 h proved to be the most efficient method of expression. This is the first report of the expression of PVS CP gene, which is important for the preparation of anti-PVS antibody.
    Keywords: Potato virus S, Gene expression, Recombinant protein, Phylogenetic analysis, PVS
  • نسیم احتشام راثی، احمد روحی بخش *، بیتا سهیلی مقدم، ناهید مسعودی

    ویروس S سیب زمینی (PVS) متعلق به جنس Carlavirus از تیره Betaflexiviridae یکی از ویروس های مهم خسارت زا در سیب زمینی می باشد. به منظور ردیابی ویروس S سیب زمینی، نمونه برداری از مزارع سیب زمینی استان اردبیل، طی تابستان سال های 95-1394، صورت گرفت. گیاهان محک در گلخانه، به منظور بررسی بیولوژیکی نمونه های برگی مشکوک به آلودگی، مایه زنی شدند. نمونه ها با آزمون الیزا از نظر آلودگی به ویروس PVS مورد بررسی قرار گرفتند. جهت ردیابی مولکولی، از روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مربوط به ناحیه پروتئین پوششی ویروس PVS استفاده شد. توالی نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی مربوط به دو جدایه از ویروس (با رس ‍شمار MH159207 و MH159208) جدا شده از ارقام آگریا و اوشینا تعیین شد. توالی پروتئین پوششی دو جدایه با یکدیگر و با 29 جدایه دیگر قابل دسترسی در بانک ژن مقایسه شد. درخت تبارزایی رسم شده نشان داد که جدایه ها به دو گروه اصلی I (زیرگروه های IA وIB) و II تقسیم شدند. دو جدایه Ag-9-PVS-F و Os-11-PVS-F در زیرگروه IB همراه با جدایه های آذربایجان، کرمان، همدان و اصفهان و جدایه هایی از مجارستان، اوکراین، اسکاتلند و هند قرارگرفتند. هم ردیفی توالی اسید آمینه فرضی پروتئین پوششی دو جدایه مورد بررسی با شش جدایه ایرانی و پنج جدایه خارجی این ویروس بیانگر اختلاف در هشت و 25 اسیدآمینه به-ترتیب برای جدایه های Ag-9-PVS-F و Os-11-PVS-F بود. نتایج نشان دهنده وجود جدایه های متنوع ویروس PVS در کشور بوده و تفاوت در توالی اسید نوکلئوتیدی و اسید آمینه ای می تواند حاکی از تفاوت در منشا جفرافیایی و به تبع آن نحوه و زمان ورود جدایه های ویروس به منطقه باشد.

    کلید واژگان: آرتی-پی سی آر, الیزا, درخت فیلوژنی, کارلاویروس, ویروس اس سیب زمینی
    Nasim Ehteshm Rasi, Ahmad Rouhibakhsh, Bita Soheili Moghadam, Nahid Masoudi

    Potato virus S (PVS) of the genus Carlavirus belongs to the Betaflexiviridae family is one of the important potato infectious viruses. To detect PVS, the suspected leaf samples were collected from potato fields in Ardabil province during summer in 2015 and 2016. To assess the biological properties, symptomatic leaves inoculated to indicator plants in the greenhouse condition. The samples were tested for PVS infection using DAS-ELISA. RT-PCR for molecular detection was done using specific primers related to the coat protein area of Potato virus S. The coat protein gene nucleotide sequences of two isolates of Potato virus S called Ag-9 and Os-11 obtained from Agria and Oceana cultivars were determined. The CP sequences of two isolates were compared with each other and with 29 other isolates of the virus. The reconstructed phylogenetic tree clustered the isolates in two main groups I (subgroups IA and IB) and II. Two Ag-9-PVS-F and Os-11-PVS-F isolates were clustered in IB subgroup along with isolates from Azarbaijan, Hamedan, Kerman and Esfahan as well as isolates from Hungary, Ukraine, Scotland and India. The putative coat protein amino acid sequence alignment of this two isolates with 6 Iranian and 5 foreigner isolates showed difference in 8 and 25 amino acids for Ag-9-PVS-F and Os-11-PVS-F isolates respectively. The results indicate that there are various PVS isolates in the country, and the difference in nucleotide and amino acid sequences may indicate differences in the geographic origin and hence the type and timing of entry of virus isolates into the region.

    Keywords: Carlavirus, ELISA, Phylogenetic tree, Potato virus S, RT-PCR
  • محمد شکرزاده، عباس محمدپور، یحیی صالح طبری، ناهید مسعودی، محمدمصطفی نصیریان شکیب، سیده مرضیه محمدی*، مریم علیزاده

    سرطان معده چهارمین علت شایع مرگ و میر ناشی از بدخیمیها در سرتاسر دنیا بوده، که همچنین دارای شیوع بالایی در ایران است. ژن Caspase3 به عنوان یکی از ژن های عمده مستعد ابتلا به سرطان معده در نظر گرفته شده است. هدف این مطالعه، بررسی ارتباط پلی مورفیسم rs12108497 ژن Caspase3 می باشد.. به علت نقش اساسی کاسپازها ما یک SNP از کاسپاز3 (مربوط به کاسپازهای اجرایی مشترک دو مسیر) که ارتباط آنها با سرطانهای مختلف ثابت شده است، را در نظر گرفته ایم. در این مطالعه مورد - شاهدی، 95 بیمار و 90 نفر از افراد سالم ثبت نام کردند. وضعیت بیمار به وسیله آندوسکوپی و آسیب شناسی مورد تایید قرار گرفت و به عنوان آدنوکارسینومای گوارشی و عضلانی شناخته شد. در مجموع 5 میلی لیتر از خون محیطی پس از اخذ رضایت آگاهانه از همه شرکت کنندگان جمع آوری شد. DNA ژنومی با استفاده از روش out-Salting استخراج شد و با استفاده از روش RFLP-PCR بررسی ژنوتیپی پلی مورفیسم انجام شد. فراوانی ژنوتیپی پلی مورفیسم rs12108497 به طور معنی داری بین بیماران مبتلا به آدنوکارسینوم معده و افراد سالم متفاوت بود (0259/0=p .(همچنین در این مطالعه تفاوت توزیع 3/7778 و% 95 CI (1/3539- 10/5412)) آمده بدست OR میزان به باتوجه و) p=0/0111) بوده معنیدار ، T/T ژنوتیپ =OR ،(این نتیجه پیشنهاد می شود که ژنوتیپ T/T ،خطر ابتلا به بیماری را افزایش می دهد و یک فاکتور خطر محسوب می- شود. نتایج ما ارتباط بین پلی مورفیسم rs12108497 ژن Caspase3 و افزایش خطر ابتلا به آدنوکارسینوم معده در افراد مراجعه کننده به کلینیک طوبی ساری را تایید می کند.

    کلید واژگان: آدنوکارسینو, پلی مورفیسم 12108497, Caspase ژن 3, PCR-RFLP
    Mohammad Shokrzadeh, Abbas Mohammadpour, Nahid Masoudi, Mohammad Mostafa Nasirian Shakib, Seyedeh Marziyeh Mohammadi *, Yahya Saleh Tabari, Maryam Alizadeh

    Gastric cancer is the fourth most common cause of malignancy death in the world, which also has a high prevalence in Iran. Caspase 3 gene is considered one of the major genes related to gastric cancer. The present study aimed to investigate the relationship between rs12108497 polymorphism of Caspase 3 gene. Due to the fundamental role of caspases, we have considered an SNP of Caspase 3 (common to two-way joint execution caspases), which has been proven to be related to various cancers. In this case-control study, 95 patients and 90 healthy subjects were enrolled. The patient status was approved, by endoscopy and pathology, to be gastroduodenal adenocarcinoma. Overall, 5 ml of the peripheral blood was collected from all participants, after obtaining an informed consent. Genomic DNA was extracted using the salting-out method and genotypic polymorphism was investigated using the PCR-RFLP method. The frequency of rs12108497 polymorphism was significantly different between patients with gastric adenocarcinoma and healthy subjects (p = 0.0259). Also, the difference in the distribution of T/T genotype was significant (P = 0.0111) and according to the OR score ((95.1% CI = 1.3539-10.5412) and OR = 3.7778), it is suggested that the T/T genotype increases the risk of disease. Our results confirm the association between the rs12108497 polymorphism of Caspase3 gene and the increased risk of gastric adenocarcinoma in individuals referring to Toba Sari Clinic.

    Keywords: Adenocarcinoma, rs12108497 polymorphism, Caspase3 gene, PCR-RFLP
  • نعمت سخندان بشیر، آیسان قاسمزاده، ناهید مسعودی، رضا خاک ور، داود فرج زاده
    مقدمه
    پوتی ویروس ها عامل 40% بیماری های ویروسی در محصولات مختلف از جمله سبزیجات و حبوبات می باشند. پوتی ویروس ها از طریق شیره گیاهی، بذر و گونه های متعدد شته انتقال می بایند. به لحاظ آسانی سرایت این ویروس ها، ردیابی این چنین ویروسها به منظور کنترل بیماری های ناشی از آنها خیلی مهم می باشد..
    اهداف
    این مطالعه، بررسی کارآیی دو جفت آغازگر در ردیابی پوتی ویروس های آلوده کننده سبزیجات در شمال غرب ایران می باشد..
    مواد و روش ها
    برای تشخیص پوتی ویروس های آلوده کننده سبزیجات، آر ان ای کل تهیه شده از برگ های بیمار مورد نسخه برداری معکوس با آغازگر Oligo d(T)15،M4T یا یکی از آغازگر اختصاصی پوتی ویروس قرار داده شد و متعاقبا واکنش زنجیره ای پلیمرآز با یک جفت آغازگر دژنره شامل Sprimer/M4 یا NIb2F/NIb3R قرار داده شد که انتظار می رفت قطعات حدود 1700 یا 350 جفت باز، به ترتیب، تولید کنند. تکثیر با Sprimer/M4 از تعداد 7 نمونه انجام گرفت اما قطعات غیراختصاصی هم مورد تکثیر قرار گرفتند. با وجود این، تکثیر اختصاصی از تعداد 31 نمونه با استفاده از NIb2F/NIb3R انجام گرفت. قطعات 350 جفت باز حاصل از پی سی آر با NIb2F/NIb3R مورد همسانه سازی و ترادف یابی قرار داده شدند..
    یافته ها
    بررسی با BLAST روی داده های ترادف نوکلئوتیدی آشکار نمود که قطعات حاصله متعلق به ویروس موزاییک معمولی لوبیا (از لوبیا سبز)، ویروس موزاییک زرد لوبیا (از باقلا)، ویروس وای سیب زمینی (از سیب زمینی)، ویروس موزاییک هندوانه (از کدو، طالبی یا هندوانه)، ویروس موزاییک زوکینی (از کدو) و ویروس موزاییک سویا (از لوبیا) بوده است..
    بحث و نتیجه گیری
    این مطالعه کارایی بالای NIb2F/NIb3R درردیابی پوتی ویروس ها را ثابت نمود و آلودگی ها به تنوعی از گونه های پوتی ویروس در شمال غرب ایران را آشکار کرد. در این مطالعه، ویروس موزاییک سویا برای اولین بار در ایران با پی سی آر مورد ردیابی واقع شد..
    کلید واژگان: ویروس موزاییک معمولی لوبیا, ویروس موزاییک زرد لوبیا, فیلوژنتیک, ویروس وای سیب زمینی, ویروس موزاییک هندوانه
    Nemat Sokhandan, Bashir, Aisan Ghasemzadeh, Nahid Masoudi, Reza Khakvar, Davoud Farajzadeh
    Background
    Potyviruses are accounted for 40% of viral diseases of various crops including vegetables and legumes. Potyviruses can be transmitted through plant sap, seeds and many aphid species. Due to ease of spread of these viruses detection of such viruses are crucial as to the control of the incited diseases..
    Objectives
    This study compared the efficiencies of two couples of primers in their detection of potyviruses infecting vegetables in North-West of Iran..
    Materials And Methods
    To identify potyviruses infecting vegetables, total RNA preparations from leaves of diseased plants were subjected to reverse transcription (RT) with oligo d(T)15, M4T or a potyvirus-specific primer, followed by polymerase chain reactions (PCR) with two pairs of degenerate primers including Sprimer/M4 or NIb2F/NIb3R that would yield ~ 1700 or 350 bp fragments, respectively. Amplification was achieved from 7 samples when Sprimer and M4 were used, but non- specific fragments were also amplified. However, specific amplifications from 31 samples were achieved with NIb2F2 and NIb3R. PCR products resulting from the use of NIb2F/NIb3R were subjected for cloning and sequencing..
    Results
    BLAST analysis of the sequenced data revealed that the PCR-amplified fragments belonged to Bean common mosaic virus (green bean), Bean yellow mosaic virus (broad bean), Potato virus Y (potato), Watermelon mosaic virus (squash, muskmelon or melon), Zucchini yellow mosaic virus (squash), and Soybean mosaic virus (bean)..
    Conclusions
    This study demonstrated the efficiency of NIb2F2/NIb3R in detection of potyviruses and revealed the extent of infections with diverse potyviruses species in the northwest part of Iran..
    Keywords: Bean cmmon mosiac virus, Bean yellow mosaic virus, Phylogenetic, Potato virus Y, Watermelon mosaic virus
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال