جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "gene flow" در نشریات گروه "زیست شناسی"
تکرار جستجوی کلیدواژه «gene flow» در نشریات گروه «علوم پایه»-
بارهنگ کبیر (Plantago major L.) که زمانی محدود به اوراسیا بود، امروزه گستردگی زیادی در دنیا دارد و به عنوان گیاهی مهاجم شناخته می شود. با توجه به دامنه پراکنش وسیع بارهنگ کبیر در ایران، تلاش های علمی مولکولی در راستای روشن ساختن تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی آن به شدت مورد نیاز است. بر همین اساس، بررسی تنوع ژنتکی 17 جمعیت مختلف P. major با مارکرهای ISSR انجام گرفت که سطح بالایی از تنوع ژنتیکی را آشکار نمود و میانگین پارامترهای تنوع ژنتیکی برای جمعیت ها شامل تعداد آلل های مختلف (Na)، تعداد آلل های موثر (Ne)، ضریب شاخص شانون(I) و ضریب تنوع نی (H) به ترتیب 12/1، 32/1، 271/0 و 184/0 بودند. جمعیت دماوند از بیشترین مقدار Na (51/1) برخوردار بود، در حالیکه جمعیت مشکین شهر مقادیر برتری را برای Ne (466/1)، I (386/0) و H (262/0) را دارا بود. بررسی توزیع تنوع ژنتیکی با AMOVA نشان داد که نسبت عمده ای از کل تنوع ژنتیکی به صورت درون جمعیتی (77%) بوده و به مقدار کمتری بین جمعیتی (19%) و بین منطقه ای (4%) می باشد. طبقه بندی ژنتیکی جمعیتی مخلوطی از دو گروه با غالبیت مختلف از شمال غربی تا شرق و جنوب ایران را نشان داد. تنوع در سیستم تولید مثل، ویژگی های مهاجم بودن و پراکنش بذر به عنوان فاکتورهای موثری برای نرخ بالای جریان ژنی و وجود همزمان نشانه هایی از تمایز ژنتیکی بین جمعیت های مختلف P. major پیشنهاد گردیده اند.
Once only limited to Eurasia, the worldwide distributed Plantago major L. is now considered as invasive. Its significant distributional range in Iran requires molecular scientific efforts to reliably elucidate its genetic diversity and population structure. Therefore, analysis of genetic diversity of 17 different populations of P. major by ISSR markers was carried out and revealed the presence of a relatively high genetic diversity, in which, means of genetic diversity statistics for populations including number of different alleles (Na), number of effective alleles (Ne), Shannon’s information index (I) and Nei gene diversity (H) were 1.12, 1.32, 0.271 and 0.184, respectively. Population of Damavand had the maximum Na (1.51) while population from Meshkinshahr indicated superior values for Ne (1.466), I (0.386), H (0.262), and UHe (0.291). Analyzing the genetic diversity distribution by AMOVA exhibited that a major portion of total genetic diversity is within-population (77%), and less among-populations (19%) and among-regions (4%). Neighbor Joining trees display gene flow/shared alleles among studied populations. Populations genetic stratification showed a mixture of two groups with different dominance from northwest to the northeast of Iran. Assessing the genetic structure indicated existence of a relatively strong genetic structure among populations. Mating system, invasiveness characters and seed dispersal are suggested to be effective factors for a high rate of gene flow and simultaneous presence of genetic differentiation among populations of P. major in Iran.
Keywords: Plantago, Gene flow, molecular markers, population, Genetic diversity, Iran -
در سال های اخیر، گستره پراکنش خرس قهوه ای با کاهش شدیدی روبرو بوده است و در این میان، احتمال انقراض برخی جمعیت های ناشناخته وجود دارد. بنابراین، داشتن یک تصویر جامع از تنوع ژنتیکی و ساختار جغرافیایی جمعیت ها و گونه های مختلف در راستای توسعه راهکارهای حفاظتی موثر ضروری است. در پژوهش حاضر، یک قطعه 271 نوکلئوتیدی ناحیه کنترل میتوکندری مربوط به تعداد هفت نمونه خرس قهوه ای از ایران و 460 توالی از خرس های قهوه ای و قطبی ثبت شده در ژن بانک در تحلیل ها استفاده شد. بر اساس نتایج، تعداد 113 هاپلوتایپ و 77 جایگاه متغیر برای قطعه مورد مطالعه شناسایی شد. بر اساس تحلیل ها، خرس های ایران در گروهی مجزا از سایر خرس های قهوه ای قرار می گیرند. افزون بر این، نرخ جریان ژنی (Nm) بسیار پایین (014/0-187/0) و میزان فاصله ژنتیکی (Fst) زیاد (728/0-972/0) بین خرس های ایران و سایر گروه ها نشان دهنده اختلاف ژنتیکی معنی دار بین خرس های ایران و سایر گروه های مورد مطالعه است. علاوه بر این، برآورد نرخ مهاجرت (Nm) جدایی جمعیت ایران را از سایر خرس های قهوه ای تایید می کند. شواهد مشخصی از گسترش جمعیت شناختی ناگهانی در گذشته در خرس های ایران مشاهده نشد. بر اساس برآوردهای مرتبط با زمان های واگرایی، نیای مشترک تمامی خرس های قهوه ای در حدود 221 هزار سال پیش برآورد شد. همچنین، زمان آخرین نیای مشترک توالی های خرس قهوه ای ایران در حدود 19 هزار سال پیش به دست آمد.کلید واژگان: خرس قهوه ای, جریان ژنی, تاریخچه جمعیت شناختی, زمان واگراییIn recent years, the brown bear's range has declined and its populations in some areas have faced extinction. Therefore, to have a comprehensive picture of genetic diversity and geographic structure of populations is essential for effective conservation strategies. In this research, we sequenced a 271bp segment of mtDNA control region of seven Iranian brown bears, where a total dataset of 467 sequences (brown and polar bears) were used in analyses. Overall, 113 different haplotypes and 77 polymorphic sites were identified within the segment. Based on phylogenetic analyses, Iranian brown bears were not nested in any other clades. The low values of Nm (range=0.014-0.187) and high values of Fst (range=0.728-0.972) among Iranian bears and others revealed a genetically significant differentiation. We arent found any significant signal of demographic reduction in Iranian bears. The time to the most recent common ancestor of Iranian brown bears (Northern Iran) was found to be around 19000 BP.Keywords: Brown bear, Gene flow, Demographic history, Divergence
-
در پژوهش حاضر، با استفاده از ناحیه D-Loop میتوکندریایی، تنوع ژنتیکی پایکای افغانی (Ochotona rufescens) در بین چهار جمعیت مختلف در استان خراسان شمالی بررسی و تحلیل شد. به این منظور، تعداد 16 فرد (4 فرد از هر جمعیت) از چهار منطقه حفاظت شده (قرخود، گلول-سرانی، سالوک و ساریگل) جمع آوری و پژوهش های آزمایشگاهی انجام شد. عوامل ژنتیکی بین و درون جمعیت های پایکا از قبیل تنوع ژنتیکی و نوکلئوتیدی، تفاوت هاپلوتیپی، میزان تفاوت ژنتیکی بر اساس آماره F، جریان ژن (Nm) شاخص توزیع شکل گاما، آزمون و جدایی از طریق فاصله جغرافیایی (IBD) محاسبه و مقایسه شد. به طور کلی، با بررسی قطعه 483 جفت بازی 25 جایگاه متغیر، 457 جایگاه حفاظت شده و 10 هاپلوتیپ مختلف شناسایی شد. مقدار پایین (21/0) ولی معنی داری (P<0.05) Fst بین جمعیت ها بیانگر تفاوت ژنتیکی نسبتا پایین یا به بیان دیگر جریان ژنی نسبتا بالا بین جمعیت های مورد مطالعه بود. نتایج مربوط به وجود رابطه بین ماتریس فاصله و ماتریس ژنتیکی بر اساس آزمون منتل (057/0=p؛ 172/0=r) نشان داد که جدایی بر اثر فواصل جغرافیایی بین نمونه ها معنی دار نبوده یا جدایی بر اثر فاصله رخ نداده است. همچنین، این جدایی بر اساس آزمون منتل (10000 تکرار) بین جمعیت های مختلف (159/0=p؛ 64/0-=r) به وجود نیامده است. شاخص توزیع شکل گاما به منظور برآورد نرخ یا ضریب ناهمگونی بین چهار جمعیت مورد بررسی عدد 200 محاسبه گردید که نشان دهنده ناهمگونی و نرخ جهش پایین بین چهار منطقه است. همچنین، میزان شاخص راجرز-هارپندینگ 08/0 (P>0.5) و شاخص تاجیما 37/0 (P>0.1) محاسبه گردید و نشان داد که جمعیت در گذشته گسترش ناگهانی نداشته است.
کلید واژگان: ساختار ژنتیکی, پایکای افغانی (Ochotona rufescens), تنوع هاپلوتیپی, جریان ژن, Fst, خراسان شمالیThis study was carried out for genetic diversity of Afghan Pika (Ochotona rufescens) among four different populations in Northern Khorasan Province using D-Loop region of mitochondrial gene. The sixteen specimens were trapped from four different sanctuaries (Ghorkhod، Golol-Sarani، Salouk and Sarigol) and transferred to Laboratory. The intra and inter population genetic factors (haplotype and nucleotide diversity، haplotype differentiation among populations، Fst، Nm، gamma distribution parameter، mismatch distribution، Tajima''D neutrality test and Isolation by distance) were estimated and the results were compared among the populations. Finally، data set with 483 bp was used for each individual. The results showed 25 polymorphic، 457 conserved sites and 10 different haplotypes. The low value of Fst (Fst=0. 21، P<0. 05) among populations based on D-Loop region of mitochondrial gene showed that genetic differentiation among populations were low and gene flow between populations were high. Mantel test (10000 irritations) showed that the relationship between distance and genetic matrix among all individuals (r=0. 172، P=0. 057) and among populations (r=-0. 64، P=0. 159) were not significance and IBD did not occur. Discrete gamma distribution for estimating heterogeneity rate among populations was 200 which indicated low mutation or heterogeneity rate among the four populations. The Rogers-Harpending index for mismatch distribution (0. 08، P>0. 5) and Tajima ''D test (0. 37، P>0. 1) showed no population expansion and relatively stable population sizes.Keywords: Genetic structure, Afghan Pika (Ochotona rufescens), Haplotype diversity, Gene flow, Fst, Northern Khorasan -
World’s population is significantly increasing and food needed is decreasing. However, today the progress in the science especially plant biotechnology helps to improve food resources. Therefore, high yield and more stable cultivars are screened. At the moment due to the significant progress in plant biotechnology, limitation regarding genetic manipulations and gene transfer are being disappeared and researchers are capable to do breeding on importanttraits. In spite of advantages obtained by plant biotechnology some concerns still exist such as transfer of foreign genes from transgenic plants to herbs or other special from the same genes. The highest environmental concern regarding the gene flow from transgenics is related to transfer of genes into wild population of plants and its impact on environment. The effect of gene flow on the environment is its introgression into the genome of wild species. In order to block the negative environmental effects of gene flow on weeds and landraces, using gene flow barriers and mitigation of gene flow are very important. Molecular methods for controlling the gene flowbetween crops and weeds are based on maternal inheritance, male sterility and seed sterility. The distance adjustment of cultivation between transgenic and non- transgenic plants in a region could be a suitable strategy to decrease gene flow via pollen. According to these cases and the presence of transgenic crops on the market using this type of product which hascommercial any adverse effect has been not reported. According to the available resources and acreage, these productions annually increase that is embracing the use of these products.Keywords: Gene flow, Plant transgenic, Pollen grain
-
در جنگاکاری با گونه های بومی می بایست حفاظت از گوناگونی زمانی و ساختار جغرافیایی تنوع ژنتیکی گونه های جنگلی در نظر گرفته شود. برای تهیه اطلاعات کاربردی در مورد کارآمدی روش های جمع آوری نمونه، ترکیب ژنتیکی ده جمعیت راش (حداقل 40 درخت در هر جمعیت) و نتاج آنها (بذور 10 درخت مادری در هر جمعیت، به میزان 7 بذر از هر درخت) توسط چهار لوکوس میکروساتلایتی پلی مورف بررسی شد. تکثر آللی در نمونه های بذر بیش از درختان بالغ بود که حاکی از وجود جریان ژن از جمعیتهای گیاهی مجاور است. مقایسه مقادیر تنوع ژنتیکی بین درختان بالغ و نسل بذری هیچ اختلافی را از نظر غنای آللی (Na)، تعداد موثر آللها (Ne)، تعداد آللهای نادر (Nr)، هتروزیگوزیتی مشاهده شده (Ho) و هتروزیگوزیتی مورد انتظار (He) نشان ندادند. تمایز ژنتیکی در فراوانی آللی بین درختان بالغ و نسل بذور نیز بسیار کم بود (Fst = 058/0). روابط ژنتیکی نزدیکی بین درختان بالغ و نسل بذری در هر جمعیت وجود داشت که بوسیله روش معدل گروهی (UPGMA) نشان داده شد و آنالیز واریانس ملکولی (AMOVA) نیز آن را تایید نمود. در این پژوهش برخی ویژگی های جمع آوری بذر مورد بحث قرار گرفت
Reforestation with autochthonous species should take into account the preservation of the temporal variability and the geographic structure of genetic diversity in forest species. In order to provide empirical data about the suitability of methods of sampling material, genetic comparison of 10 beech populations (at least 40 trees per population) and their progenies (seeds of 10 mother trees per population, each tree 7 seeds) were analysed using four highly polymorphic microsatellite loci. The allelic multiplicity was higher in seed samples than adult trees indicating gene flow from adjacent plant populations. The comparison for genetic diversity measures between adult trees and seed generation revealed no significant differences for allelic richness (Na), effective number of alleles (Ne), and number of rare alleles (Nr), neither observed (Ho) nor expected heterozygosity (He). Genetic differentiation in allelic frequencies between adult trees and seeds generation were rather low (Fst = 0.058). A close genetic relationship between adult trees from seed generation of each population, which revealed by un-weighted pair group method based on arithmetic average (UPGMA) and supported by an analysis of molecular variance (AMOVA), were detected. In this paper some aspects related to seed sampling were discussed
Keywords: Fagus orientalis, Hyrcanian forests, Genetic diversity, microsatellite, gene flow, Iran
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
©2000-2025 magiran.com All Rights Reserved.