جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « ارتباط کمی ساختار- فعالیت » در نشریات گروه « علوم پایه »
-
مقاومت بیماری سل به دارو همچنان یکی از مهمترین چالش های پیش رو در درمان این بیماری عفونی است و بنابراین کشف و توسعه داروهای جدید موثر ضد سل همواره مورد توجه محققان است. در این مطالعه، تحلیل ارتباط کمی ساختار-فعالیت (QSAR) بر روی یک سری از مشتقات ایمیدازول[1 و2- a] پیریدین کربوکسامید به عنوان عوامل ضد سل اعمال شد. فعالیت بیولوژیکی 18 ترکیب با روش های رگرسیون خطی چندگانه و شبکه عصبی مصنوعی برآورد شد. چهار توصیف کننده مولکولی (nCl، MATS8m، BELe4 وGATS8e) با استفاده از رگرسیون خطی چندگانه گام به گام انتخاب شدند. بهترین نتایج شبکه عصبی مصنوعی با الگوی 5-5-1 آموزش داده شده با الگوریتم پس انتشار رو به جلو به دست آمد. یک مجموعه آزمون حاوی 5 ترکیب برای ارزیابی توانایی پیش بینی مدل استفاده شد. نتایج نشان داد که رویکرد شبکه عصبی مصنوعی در مقایسه با رگرسیون خطی چندگانه قدرت پیش بینی بهتری را ارایه می دهد. بر اساس نتایج این مطالعه، الکترونگاتیوی، جرم اتمی و هندسه مولکولی عوامل مهم کنترل کننده فعالیت ضد سل هستند.کلید واژگان: ارتباط کمی ساختار-فعالیت, شبکه عصبی مصنوعی, مشتقات ایمیدازول [1 و2 -a] پیریدین, ضد سل}Tuberculosis drug resistance is still one of the most important challenges in the treatment of this infectious disease, and therefore the discovery and development of new effective anti-tuberculosis drugs are always of interest to researchers. In this study, Quantitative structure – activity relationship (QSAR) analysis was applied on a series of imidazole[1,2-a] pyridinecarboxamide derivatives as anti-tuberculosis agents. The biological activity of the 18 derivatives were estimated by multiple linear regression and artificial neural network approaches. The four molecular descriptors (nCl, MATS8m, BELe4 and GATS8e) were selected by using stepwise multiple linear regression. The best results of artificial neural network were obtained with a 5-5-1 architecture trained with the feed forward backpropagation algorithm. An external test set containing 5 compounds for evaluating the model's predictive ability was used. The results showed that the artificial neural network approach provides better predictive power compared with multiple linear regression. According to the results of this study, electronegativity, atomic masses and molecular geometry have been found to be important factors controlling the anti-tuberculosis activity.Keywords: QSAR, Artificial Neural Networks, Imidazole [1, 2-a] pyridinecarboxamide derivatives, Anti-tuberculosis}
-
در این تحقیق، پیشبینی میزان متوسط دوز کشنده داروهای مهم برای اطفال با استفاده از توصیفکنندههای مولکولی ساختاری و همچنین بهکارگیری مدلهای ارتباط کمی ساختار- فعالیت (QSAR) توسط مدلهای رگرسیون خطی MLR و شبکه عصبی مصنوعی ANN بهطور جداگانه موردبررسی قرارگرفتهاند. روش رگرسیون مرحلهای جهت کاهش تعداد توصیفگرهای (متغیرها) محاسبهشده به کار گرفته شد و بهترین نتایج با 8 توصیفکننده بدست آمد. در ادامه از مدل خطی رگرسیون خطی چندگانه MLR برای پیشبینی دوز کشنده داروها استفاده شد که نتایج تقریبا خوبی به همراه داشت و پارامترهای R2، Q2 و RMSE برای این مدل به ترتیب 894/0، 155/12 و882/0 محاسبه و گزارش شد. همچنین با استفاده از مدل غیر خطی شبکه عصبی مصنوعی (ANN) نیز برای پیشبینی مقدار دوز کشنده این داروها استفاده شد و ضرایب همبستگی گروههای آموزش، آزمون، اعتبارسنجی و کل به ترتیب 984/0 و 994/0 و 999/0 و 983/0 محاسبه گردید که نشاندهنده اعتبار خوب این روش جهت پیشبینی میزان دوز کشنده سایر داروهای مشابه برای اطفال میباشد.
کلید واژگان: ارتباط کمی ساختار- فعالیت, دوز کشنده داروها, همبستگی}In this study, prediction of average lethal dose of important drugs for children using molecular descriptors and application of Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) models by Multiple Linear Regression (MLR) and Artificial Neural Network (ANN) models have been investigated separately. After getting a lot of descriptors the Stepwise regression method was used to reduce the number of descriptors (variables) and the best results were obtained with 8 descriptors. Multivariate linear regression model was then used to predict the lethal dose of the drugs, which yielded almost good results and the parameters R2, Q2 and RMSE for this model were calculated and reported as 0.894, 12.15 and 0.882, respectively. Also by using artificial neural network a better model with correlation coefficients of training, test, validation and total groups were calculated 0.984, 0.994, 0.999 and 0.983, respectively, indicating good validity of this method for Predicting the lethal dose of other similar drugs for children.
Keywords: Lethal dose of Drug, Neural Network, Multiple linear regression, Quantitative structure-activity relationship} -
مطالعه ارتباط کمی ساختار فعالیت (QSAR) برای مدل سازی و پیش بینی فعالیت مهارکنندگی PIM،39 ترکیب از مشتق های تری آزولوپیریدین به کار گرفته شد. نخست پس از رسم و بهینه سازی ساختار ترکیب ها و محاسبه توصیف کننده ها، مجموعه داده ها به صورت تصادفی به دو مجموعه آموزش و آزمون تقسیم شد. در انتخاب مهم ترین توصیف کننده ها روش گام به گام (SW) و الگوریتم ژنتیک (GA) استفاده شد. سپس برای مدل سازی و پیش بینی فعالیت های ترکیب ها از روش برازش خطی چندگانه (MLR) استفاده شد. مقایسه مدل های SW-MLRو GA-MLR نشان داد که GA-MLR نسبت به SW-MLR نتیجه های بهتری به دست می دهد. سپس برای بررسی اعتبار مدل ها از روش های اعتبارسنجی تقاطعی (LOO) و (LGO)، Y- تصادفی و آزمون خارجی استفاده شد. این مطالعه نشان داد که مدل GA-MLR با پنج توصیف کننده می تواند برای پیش بینی فعالیت ترکیب های دارویی همانند به کار رود و همچنین از تحلیل توصیف کننده های مدل می توان در طراحی ترکیب های دارویی نوین استفاده کرد.کلید واژگان: ارتباط کمی ساختار فعالیت, الگوریتم ژنتیک, برازش خطی چندگانه, مهارکننده های PIM, مشتق های تری آزولوپیریدین}Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) was developed for modeling and predicting of the PIM inhibitory activities a data set containing 39 structures of triazolopyridine derivatives with known biological activities. Segmentation the whole dataset into a training set and test set was performed randomly. StepWise (SW) and Genetic Algorithm (GA) techniques with Multiple Linear Regression (MLR) were used to select the most important descriptors and to create the best prediction model. Comparison of the results obtained for SW-MLR and GA-MLR models was showed that GA-MLR model is superior to the SW-MLR model. The robustness and the predictive ability of the final GA-MLR model validated by internal and external statistical validations including Leave-One-Out (LOO) cross-validation, Leave-Group-Out (LGO) cross-validation, Y-randomization and external test set. High agreement between experimental and predicted activity values indicated that GA-MLR model with five variables has good quality and it could be used in design novel compounds with higher PIM inhibitor activity.Keywords: QSAR, Genetic algorithms (GA), Multiple Linear Regressions (MLR), PIM inhibitors, Triazolopyridine derivatives}
-
یک مدل ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت آنتاگونیستی مشتقات بنزیل تترازول به عنوان گیرنده هیستامین ایجاد شده است. انواع مختلف توصیف کننده های مولکولی برای نشان دادن جنبه های مختلف ساختارهای مولکولی استفاده شده است. در این روش، تمامی مجموعه داده های ترکیبات به دو بخش آموزشی و آزمایشی تقسیم شده اند. مدل ارتباط بین توصیف کننده های مولکولی و فعالیت بیولوژیکی مولکول ها با استفاده از رگرسیون خطی چندگانه، و با استفاده از روش گام به گام و ژنتیک الگوریتم ایجاد شده است. مقایسه نتایج حاصل شده، نشان دهنده برتری روش ژنتیک الگوریتم - رگرسیون خطی چندگانه نسیت به روش گام به گام رگرسیون خطی چندگانه می باشد. مدل ارتباط کمی ساختار فعالیت با استفاده از روش ارزیابی متقاطع یک نمونه خارج از رده و آماره فیشر، دسته آزمون خارجی (N=64, R2=0.808, F= 30.806, Q2adj=0.782, Q2LOO=0.751, Q2LGO=0.669) و روش بهم ریختگی تصادفی تایید شد. در نتیجه، مدل ارتباط کمی ساختار- فعالیت ایجاد شده می تواند به عنوان ابزار ارزشمند برای طراحی ساختارهای مشابه آنتاگونیست های جدید گیرنده هیستامین مورد استفاده قرار گیرد.
کلید واژگان: ارتباط کمی ساختار- فعالیت, ژنتیک الگوریتم, رگرسیون خطی چندگانه, گیرنده هیستامین}A quantitative structure-activity relationship model has been created for forecasting the antagonist potency of benzyl tetrazole derivatives as human histamine receptors. Various kinds of molecular descriptors were used to represent different aspects of the molecular structures. In this method, the whole data set for the compounds were divided into the training and test sets. The model of relationships between molecular descriptors and biological activity of molecules were created by using stepwise multiple linear regressions and a genetic algorithm. Comparison of the results obtained indicated the superiority of the genetic algorithm based multiple linear regression over the stepwise based multiple linear regression. The ultimate quantitative structure-activity relationship model (N =64, R2=0.808, F= 30.806, Q2adj= 0.782, Q2LOO = 0.751, Q2LGO=0.669) was fully approved using the leave-one-out cross-validation method, Fischer statistics (F), external test set and the Y-randomization test. As a result, the produced quantitative structure-activity relationship model could be applied as a valorous instrumentation for sketching analogous groups of new antagonists of histamine receptors.
Keywords: Quantitative Structure-Activity Relationship, genetic algorithms, Multiple Linear Regressions, Histamine Receptor}
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.