بررسی بیوانفورماتیکی به منظور یافتن میکروRNA مهار کننده مسیر PI3K/AKT و ارزیابی در رده های سلولی سرطان پروستات

سرطان پروستات دومین سرطان شایع و پنجمین عامل مرگ ناشی از سرطان مردان در سال 2012 در جهان می باشد. مسیر PI3K/AKT نقش اساسی در بیماری زایی سرطان پروستات دارد و به جهت نقش کلیدی این مسیر در پیشروی سرطان آن را به هدف جذابی برای استراتژی های جدید درمانی تبدیل می کند. یکی از روندهای تنظیمی ژنها، میکرو RNAها می باشند که توانایی ویژه ای برای کنترل چندین ژن و مسیر به طور همزمان، آنها را کاندید قابل توجهی برای اهداف درمانی می کند. در این بررسی بر آن بودیم که میکروRNA موثر بر مسیر PI3K/AKT را با روش های بیوانفورماتیکی به دست بیاوریم و نتایج حاصله را در سلول های رده پروستات بررسی نماییم.

برای پیدا کردن میکروRNA موثر بر مسیر PI3K/AKT، شش ژن این مسیر که به عنوان هدف های دارویی مطرح هستند را در ده الگوریتم متفاوت پیش بینی بررسی کردیم. سپس به صورت بیوانفورماتیکی میکروRNA حاصله را از نظر میزان بیان در بافت پروستات سالم و رده های سلولی سرطان پروستات وهمچنین از لحاظ هدف گیری در نرم افزارهای آنالیز چرخه مورد ارزیابی قرار دادیم. به صورت عملی بیان میکروRNA های کاندید در نمونه کنترل و رده های سلولی سرطان پروستات ارزیابی گردید.

میرهای خانواده 29 بیشترین شناسایی را از مجموعه 6 ژنی داشتند و سایر بررسی های بیوانفورماتیک نیز موید نتیجه حاصله بودند. بررسی ها نشان دهنده کاهش بیان معنی دار میرهای خانواده 29 در رده های سلولی سرطان پروستاتDU-145،PC3 و LNCAP نسبت به نمونه کنترل سالم می باشد.

و ی ار و ر ن میرهای خانواده 29، نشان دهنده امکان استفاده از میرهای خانواده 29 برای مهار مسیر PI3K/AKT در سرطان پروستات می باشد.