چند شکلی ادغامی رتروترنسپوزون ها و تنوع ژنتیکی در ارقام زراعی و ژنوتیپ-های وحشی انگور

به منظور مطالعه چند شکلی ادغامی خانواده های رتروترنسپوزونیTvv1، Edel، Vine1، Gentilو Huben و تنوع ژنتیکی در 67 رقم زراعی و ژنوتیپ های وحشی انگور (Vitis vinifera L.) از نشانگرهای IRAPو REMAP استفاده شد. در مجموع 103 مکان با استفاده از دو آغازگر IRAP و 13 ترکیب آغازگری REMAP تولید شد که از این تعداد، 83 مکان (58/80 درصد) چند شکل بودند. مقادیر شاخص تنوع نی برای آغازگرها از صفر (آغازگرGentil-A7) تا 38/0 (آغازگر Tvv1-808) متغیر بود. میانگین شاخص تنوع نی در کل ارقام مطالعه شده 27/0 بود. دامنه ضرایب تشابه ژنتیکی دایس بین ارقام از 57/0 (رقم H6 با دسترچین) تا یک (رقم رشه اصل با سیاه معمولی) متغیر و میانگین آن 78/0 بود. بیشترین مقادیر شاخص تنوع نی، تعداد الل های موثر (Ne) و شاخص اطلاعاتی شانون (I) مربوط به خانواده رتروترنسپوزونی Tvv1 و به ترتیب 32/0، 54/1 و 47/0 بود که بیانگر تحرک و چند شکلی زیاد این خانواده در ارقام مطالعه شده می باشد. تجزیه کلاستر بر اساس ضریب تشابهDice و الگوریتم UPGMA ارقام مورد مطالعه را در شش گروه اصلی قرار داد و نمونه های زراعی و وحشی را از هم متمایز کرد. شباهت و تمایز ارقام بر اساس نتایج حاصل از تجزیه کلاستر ژنوتیپ های مورد مطالعه، به وسیله روش های مبتنی بر مدل با استفاده از نرم افزار Structure 2.3.1 تایید شد. نتایج نشان داد خانواده های رتروترنسپوزونی مورد استفاده به ویژه Tvv1 در ژنوم انگور به لحاظ انتقالی فعال بوده و می توان از نشانگرهای مبتنی بر این خانواده در تمایز ارقام و ژنوتیپ های انگور استفاده کرد.