طراحی روش جدید محاسبه ی پهنای متوسط لاین در تصاویر پالس فیلد ژل الکتروفورز جهت آشکارسازی و استخراج لاین

مقاله ی حاضر روش جدیدی را برای محاسبه ی پهنای متوسط لاین در تصاویر پالس فیلد ژل الکتروفورز (Pulsed field gel electrophoresis یا PFGE) جهت آشکارسازی و استخراج لاین ها نشان داد. اگرچه مطالعاتی پیرامون آشکارسازی لاین ها بر اساس پروجکشن- پروفایل (Projection profiles) گزارش شده، اما هنوز یک روش اتوماتیک با خطای کم انجام نگرفته است. پهنای متوسط لاین، مهم ترین پارامتر برای انجام اتوماتیک پردازش تصاویر PFGE می باشد. این پژوهش با هدف استفاده از روش چگالی طیف توان برای محاسبه ی پهنای متوسط لاین انجام شد.
ابتدا بر اساس چگالی طیف توان، پردازش تصاویر PFGE انجام گردید. الگوریتم پیشنهادی با استفاده از 10 تصویر PFGE بهبود داده شد و سپس برای تست از 20 تصویر دیگر استفاده گردید که در مجموع شامل 300 لاین بود. تصاویر با استفاده از دستگاه ژل الکتروفورز میدان پالسی مدل Bio-Rad واقع در آزمایشگاه میکروب شناسی دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه تهیه شد.
استفاده از روش چگالی طیف توان در مقایسه با روش تقاطع خط افقی، 6/99 درصد از خطای آشکارسازی مراکز لاین را کاهش می دهد.
با توجه به این که پارامتر پهنای متوسط لاین در چندین مرحله برای آشکارسازی و استخراج لاین ها مورد استفاده قرار گرفت، استفاده از روش چگالی طیف توان می تواند فرایند استخراج لاین را بهبود بخشد.