آنالیز فیلوژنتیکی دو جدایه ویروس ای انگور با استفاده توالی ژن پروتئین پوششی

هدف این مقاله، شناسایی ویروس ای انگور، آنالیز تنوع ژنتیکی و ارتباط فیلوژنتیکی جدایه های GVA از تاکستان های استان زنجان است. برای این منظور، نمونه ای از تاکستان های استان زنجان بر اساس علایم مشخص جمع آوری شد. آران-ای کل از نمونه های برگ استخراج و برای ساخت cDNA آن ها از آغازگر شش تایی تصادفی استفاده شد. سپس یک قطعه دی ان ای شامل ژن کامل پروتئین پوششی ویروس در 9 نمونه از 57 نمونه بررسی شده به کمک پی سی آر، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد. دو قطعه دی ان ای تخلیص، سپس تعیین توالی شد. شباهت توالی پروتئین پوششی دو جدایه این تحقیق 97.3% در سطح نوکلئوتیدی و با سایر جدایه ها -که قبلا گزارش شده بودند- 76 تا 95% در سطح اسید نوکلوئیک و 82 تا 98% در سطح اسید آمینه بود. درخت فیلوژنتیکی بر اساس ژن پروتئین پوششی، از تشکیل سه گروه (I, II, III) حکایت دارد که جدایه های ایرانی در گروه یک با جدایه هایی از مناطق جغرافیایی مختلف شامل اسرائیل، ایتالیا، چک، اردن، آمریکا و آفریقای جنوبی همراه بود. بر اساس اطلاعات موجود، این اولین گزارش از ردیابی و آنالیز فیلوژنتیکی جدایه های GVA از تاکستان ها براساس ژن کامل پروتئین پوششی در یکی از مناطق عمده کشت انگور در ایران است.