خوشه بندی بیومارکرهای تمایز سلول های بنیادی به آستروسیت ها

به دلیل ایجاد حجم عظیمی از داده های پروتئومیکی و نیاز به روش های جدید تحلیل نتایج آزمایشگاهی، تحلیل جمعی پروتئین ها میتواند علاوه بر صرف زمان کمتر، محققین را در شناسایی الگوهای جدید در مجموعه داده ها یاری کند. تحلیل خوشه ای یک روش آماری مطلوب و همچنین ابزاری است که میتواند در تحلیل اینگونه داده ها مورد استفاده قرار گیرد. در این مطالعه با استفاده از تکنیک های پروتئومیکی و آنالیزهای بیوانفورماتیکی، پروتئوم سلول های بنیادی طی فرآیند تمایز به آستروسیت مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته است. ژلهای دو گروه نمونه (سلول های بنیادی و آستروسیت) با استفاده از نرم افزارهای Progensis same spots و Flicker از نظر افزایش و کاهش بیان پروتئینی و شناسایی پروتئین ها بررسی گردید و سپس با استفاده از برنامه های آنالیز پروتئوم DAVID و PANTHER خوشه بندی جهت ایجاد یک رابطه منطقی بین داده های حاصل در این فرآیند انجام گردید. در طی این تمایز 11 پروتئین شناسایی شد که تعدادی از آنها در مطالعات پیشین ارتباط معنی داری با فرآیند تمایز برقرار کرده بودند و تعدادی پروتئین جدید نیز بدست آمد که این پروتئینها میتوانند بیومارکرهای ناشناخته ای برای فرآیند تمایز سلولهای بنیادی به آستروسیت باشند. همچنین، نتایج نشان داد که اکثر پروتئین- های درگیر در این فرآیند در فضای خارج سلولی و قسمتهای بین سلولی وجود داشتند و از نظر عملکرد ملکولی، در دسته پروتئین های اسکلت سلولی و اتصالات سلولی قرار می گیرند. بنابراین، خوشه بندی میتواند روش مطمئنی جهت جداسازی پروتئین ها در گروه های مجزایی بر اساس میزان بیان با عملکرد بیولوژیکی باشد که بدین طریق به محقق کمک میکند تا بتواند بیومارکرها را در بین گروه عظیمی از پروتئین ها با منطق درستتری انتخاب نماید.