بررسی تنوع ژنتیکی لاکتوباسیلوس های جدا شده از نمونه های شیر گاو به روش RAPD-PCR

محصولات لبنی مناطق مختلف می توانند منبعی برای سویه های جدید لاکتوباسیلوس باشند، بنابراین شناسایی مولکولی و بررسی تنوع ژنتیکی آنها می تواند گام موثری در شناسایی ذخیره لاکتوباسیلوس های بومی با خصوصیات عملکردی ویژه و به کارگیری آنها در محصولات لبنی صنعتی شود. هدف از این تحقیق جداسازی لاکتوباسیلوس ها از فلور موجود در شیر گاو شهرستان نرماشیر و بررسی تنوع ژنتیکی آنها می باشد. بدین منظور تعداد 21 نمونه شیر از مناطق مختلف این شهرستان جمع آوری و با روش های مرسوم فنوتیپی و بیوشیمیایی لاکتوباسیلوس ها جداسازی شدند. به منظور غربالگری و بررسی تنوع ژنتیکی لاکتوباسیلوس های جدا شده، پنج پرایمر RAPD به طور تصادفی انتخاب گردید و پس از PCR، تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی و فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار Pyelph انجام و درخت فیلوژنی رسم شد. تجزیه خوشه ای داده های مولکولی توانست جدایه ها را در فاصله ژنتیکی 10 به هفت گروه مجزا تقسیم بندی کند. جدایه های K3 و K4 در گروه یک و جدایه های K21 و K13 و K11 در گروه چهار قرار گرفتند. بقیه جدایه ها در گروه های مجزا قرار گرفتند. از آنجاییکه جدایه های K3 و K4 از یک ناحیه و جدایه های K21 و K13 نیز از یک ناحیه جمع آوری شده اند، قرار گرفتن آنها در یک گروه منطقی به نظر می رسد. نتایج بدست آمده از این تحقیق بیانگر تنوع ژنتیکی بالای جدایه های بومی شهرستان نرماشیر و مناسب بودن تکنیک RAPD-PCR برای مطالعات مشابه می باشد.