بررسی دو روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی جهت استخراج DNA ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس
جدا کردن DNA ژنومی از سلولهای باکتریایی از جمله فرایندهایی است که به طور معمول در اکثر آزمایشگاه های بیولوژیک انجام می گیرد، لذا برای آن روش های گوناگونی ارایه شده است. در این مطالعه از دو روش فنل و کلروفرم، و استفاده از نانوذرات مغناطیسی در جهت استخراجDNA ژنومی باکتری استافیلوکوکوس اوریوس استفاده شده است.
در مطالعه حاضر از باکتری استافیلوکوکوس اوریوس سویه استاندارد به شماره ATCC 25923 استفاده گردید. جهت استخراج DNA ژنومی از دو روش فنل-کلروفرم و استخراج به وسیله نانوذرات مغناطیسی استفاده شد. جهت بررسی کیفیت و غلظت DNA استخراج شده با دو روش فوق از دستگاه نانودراپ و روش الکتروفورز روی ژل آگارز استفاده گردید.
یافته ها:
بررسی غلظت DNA استخراج شده در هر دو روش، توسط نانودراپ انجام شد که غلظت DNA استخراج شده در روش فنل-کلروفرم و استفاده از نانوذرات مغناطیسی Fe3O4/SiO2 به ترتیب 4/550 و 6/131 میکروگرم بر میلی لیتر به دست آمد.
از یافته های این تحقیق می توان نتیجه گرفت که با توجه به دیواره ضخیم باکتری استافیلوکوکوس اوریوس، استخراج DNA ژنومی به وسیله نانوذرات مغناطیسی Fe3O4/SiO2 دارای غلظت و خلوصی قابل قبول برای انجام پروسه های مولکولی مانند PCR است و می تواند به عنوان جایگزین سایر روش های استخراج استفاده شود.