ارزیابی مناسب بودن نشانگرهای SCoT برای تنوع ژنتیکی و ساختار ژنتیکی گونه های Lepidium

گونه .Lepidium spp (Brassicaceae) گیاهانی علفی هستند که در سراسر جهان رشد می کنند و به عنوان سبزی، غذای گیاهی یا گیاه دارویی به حساب می آیند. تنوع ژنتیکی و ساختار ژنتیکی 22 جمعیت Lepidium شامل 3 گونه (L. sativum، L. draba و L. latifolium) از ایران با استفاده از 14 نشانگر Start Codon Targeted (SCoT) ارزیابی شد. درصد پلی مورفیسم بالا (98.4%)، محتوای اطلاعات چندشکلی (0.35) و باندهای چندشکلی (4.5) نشان دادند که نشانگرهای SCoT برای تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی در گونه های Lepidium قابل اعتماد هستند. میانگین قدرت تفکیک (Rp)، شاخص نشانگر (MI) و نسبت چندشکلی موثر (EMR) به ترتیب 5.0، 1.6 و 4.4 بود. بیشترین درصد جایگاه چندشکلی (92.2%)، تنوع ژنی Nei (0.35) و شاخص شانون (0.51) در L. sativum مشاهده شد. بر اساس تجزیه و تحلیل واریانس مولکولی (AMOVA)، تنوع ژنتیکی درون گونه (88.0٪) بیشتر از بین گونه ها (12.0٪) بود. علاوه بر این، بیشترین شباهت بین L. draba و L. latifolium (94/0 = r) مشاهده شد. سطح بالایی از جریان ژنی در جمعیت های Lepidium (Nm = 2.65) یافت شد، که توسط تجزیه خوشه ای همسایه (NJ)، تجزیه مختصات اصلی (PCoA) و تجزیه ساختار، که می تواند تفکیک ضعیف بین کونه های Lepidium را نشان دهد، تایید شد. تجزیه خوشه NJ جمعیت های Lepidium را به سه گروه تقسیم کرد، و گروه بندی جمعیت ها به طور کلی با منشاء آنها مطابقت داشت. این تحقیق اولین مطالعه ای است که مناسب بودن نشانگرهای SCoT را در تنوع ژنتیکی گونه های Lepidium بررسی و اثبات می کند. اطلاعات تجزیه و تحلیل ژنتیکی ارایه شده در اینجا برای برنامه های اصلاح نژاد و حفظ ژرم پلاسم در گونه های Lepidium مفید خواهد بود.