تنوع توالی سیتوکروم-b ژنوم میتوکندی در اسبهای کرد ایران

بررسی توالی نوکلیوتیدی ناحیه سیتوکروم-b ژنوم میتوکندری در درون جمعیت ها می تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد مطالعه باشد. تحقیق اخیر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در اسب کرد و رابطه فیلوژنتیکی اسب کرد با سایر نژادهای اسب در دنیا با استفاده از ناحیه سیتوکروم-b انجام شد. بدین منظور از 30 راس اسب نژاد کرد خون گیری بعمل آمد و DNA آن به روش نمکی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه سیتوکروم-b به طول 1029جفت باز تکثیر و تمام نمونه ها بعد از خالص سازی توالی یابی شدند. قطعه مورد نظر پس از توالی یابی، با نرم افزار BioEdit  ویرایش و قطعه 882 جفت بازی از آن استخراج شد. نمونه ها با توالی مرجع اسب به شماره دسترسی (X79547) با استفاده از رویه Clustal-W همردیف شدند. تعداد هاپلوتیپ، جایگاه های نوکلیوتیدی متغیر، تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلیوتیدی با استفاده از نرم افزار DNASP4.0 تعیین شد. درخت فیلوژنی با استفاده از نرم افزار MEGA6.1 به روش Neighbour-joining ترسیم شد. تعداد 7 هاپلوتایپ با 7 جایگاه نوکلیوتیدی متغیر شناسایی شد. هاپلوتایپهای بدست آمده همگی در هاپلوگروه K قرار گرفتند. میزان تنوع هاپلوتیپی و نوکلیوتیدی به ترتیب 001/0±784/0 و 001/0±00218/0 برآورد شد. ترکیب نوکلیوتیدها در توالی شاخص شامل 27/21% نوکلیوتید A، 77/32% نوکلیوتید C، 15/13% نوکلیوتید G و 87/26% نوکلیوتید  Tبود. بر اساس نتایج آنالیز فیلوژنی، اسب کرد از نظر ژنتیکی به نژادهایی از ژاپن، چین ، نژادی از لهستان و عربستان نزدیکتر است، که نشان دهنده تشابه ژنتیکی بیشتر اسب کرد با نژادهای آسیایی و تا حدودی اروپایی می باشد..