ارایه متدولوژی و طراحی کاشی های خودسامانی مبتنی بر دنا جهت انجام محاسبات موازی

محاسبات مولکولی پدیده ای نوظهور از محاسبات در مقیاس نانو متری می باشد. تمرکز محاسبات مولکولی طراحی و ساخت پردازشگرهای مولکولی بر بستری از ماکرومولکولهای زیستی مانند دیاکسیریبونوکلیوتیداسید ، ریبونوکلیوتیداسید و پروتیینها میباشد [1]. محاسبات دنا زیر شاخه ای از محاسبات مولکولی است که از واکنش شیمیایی بین رشته های دنا برای انجام محاسبات استفاده میکند. این محاسبات از نظر مقیاسپذیری، سادگی انجام و ساخت، هزینه های طراحی و پیاده سازی و... تابحال موفقترین روش از بین همه روش های شناخته شده برای محاسبات مولکولی میباشد [2]. مدل های محاسباتی گوناگون با کاربردهای مختلف مبتنی بر رشته های دنا تا به امروز ارایه شده است، از جمله این مدل های محاسباتی، مدل محاسباتی خودسامانی می باشد. این مدل محاسباتی با توجه به قدرت خودسامانی کاشی ها، توان موازی سازی بسیار بالا و قاعده مند بودن آن بسیار مورد توجه قرار گرفت. با وجود این مزایا چالش هایی نظیر عدم کنترل پذیری کاشی ها و درصد خطای بالا و ایجاد کریستال های بزرگ در خروجی نهایی مانع پیشرفت این روش شده است. با حل مشکل کنترل پذیری کاشی ها در [2]، امکان ارایه مدل مناسبی برای ساخت توابع منطقی با استفاده از این روش فراهم شده است. در این مقاله روشی برای طراحی توابع منطقی توسط کاشی های خودسامانی ارایه شده است. علاوه بر این قابلیت گسترش و کاهش هزینه های ساخت و همچنین توسعه روش برای ایجاد روند طراحی خودکار در این مقاله ارایه شده است. متدولوژی معرفی شده در این مقاله می تواند سرآغاز امید بخشی برای انجام محاسبات به صورت موازی باشد.