کاربرد نشانگرهای چند شکلی مشتق از جعبه CAAT در بررسی تنوع ژنتیکی Aegilops tauschii

در این مطالعه، تنوع مولکولی 95 توده Aegilops tauschii با نشانگر (CBDP (CAAT-box derived polymorphism مورد ارزیابی قرار گرفت. 15 آغازگر CBDP در مجموع 73 قطعه (87/4 قطعه برای هر آغازگر) تولید کردند که از این تعداد 66 قطعه (9/91 درصد چندشکل بودند. میانگین محتوای اطلاعات چندشکل (PIC=0.26) و قدرت تفکیک (Rp=5.62) بیانگر توانایی این سیستم نشانگری در ارزیابی تنوع ژنتیکی در Ae. tauschii بود. همچنین میانگین درصد مکان های چندشکل، تعداد آلل های مشاهده شده و موثر، شاخص اطلاعات شانون و تنوع ژنتیکی به ترتیب 90/91، 83/1، 47/1، 44/0 و 27/0 برآورد شد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که %96 از تغییرات کل را تنوع درون جمعیت تشکیل می دهد، در حالی که %4 از تغییرات کل مربوط به تنوع بین جمعیت بود. تجزیه خوشه ای توده ها را در هفت خوشه اصلی گروه بندی کرد. همچنین، بر اساس تجزیه مختصات اصلی (PCoA)، توده ها در شش گروه اصلی طبقه بندی شدند که دو مختصات اصلی اول %19/24 از تغییرات کل را توضیح دادند. نتایج تجزیه و تحلیل خوشه ای با نتایج PCoA نسبتا مطابق بود. در این مطالعه، اگرچه سیستم نشانگری CBDP توده های ایرانی را به طور کامل از سایر توده ها تمایز نکرد، اما توده های ترکمنستان، روسیه، گرجستان، ترکیه، ژاپن و کوزوو در خوشه های جداگانه گروه بندی شدند. به طور کلی، سیستم نشانگری CBDP چندشکلی ها را در توده های مطالعه شده به طور کارآمد شناسایی کرد. بنابراین نشانگرهای CBDP را می توان در انگشت نگاری ژنتیکی ژرم پلاسم گندم برای ارزیابی صفات مختلف زراعی و نیز تحمل به تنش های محیطی استفاده نمود.