تشخیص سریع COVID-19 با تکنیک RT-LAMP PCR و مقایسه آن با روش Real-Time RT-PCR

  این مطالعه با هدف تکثیر اسید نوکلئیک ایزوترمال برای شناسایی کووید-19 انجام شد.

  در این مطالعه 200 نمونه نازوفارنکس و اوروفارنکس از بیمارستان قلب جماران تهران جمع آوری شد. کووید-19 توسط LAMP-RT PCR و Real-Time RT-PCR مورد بررسی قرار گرفت. نمونه ها هم با کیت استخراج RNA پیشتاز و هم نمونه مستقیم بررسی شدند، اما نمونه های Real-Time RT-PCR تنها با استخراج RNA مورد آزمایش قرار گرفتند. مخلوط پروب-پرایمر این کیت با یک روش ژن هدف دوگانه طراحی شده است که به طور همزمان توالی های ژنومی ناحیه اسپایک و نوکلئوکپسید N را مورد هدف قرار می دهد. فلورسانس توسط Real-Time RT-PCR و LAMP-RT PCR اندازه گیری شد.

  از این 200 نمونه، 112 نمونه بالینی توسط Real-Time RT-PCR مثبت گزارش شدند که میانگین Ct کمتر از 30 مثبت و 88 نمونه منفی بود. در واکنش RT-LAMP نمونه های استخراج RNA ژنومی، 104 نمونه بالینی مثبت بودند. تکنیک RT-LAMP حساسیت 92.8 درصد را نشان داد. روش RT-LAMP بدون استخراج RNA دارای حساسیت 85.7 درصد بود.

  تکنیک LAMP به عنوان یک جایگزین مناسب برای روش Real-Time RT-PCR در حال ظهور است. این تکنیک دارای مزایای اساسی مانند دارا بودن دمای ثابت، حذف سیکل حرارتی، نتایج آزمایش سریعتر و ظرفیت تشخیص بالقوه بیشتر است، در حالی که با داشتن همان حساسیت و ویژگی تقریبا RT-PCR از این نظر، برای بیماری های همه گیر مناسب است.