تشخیص مولکولی و بررسی فیلوژنتیک Entamoeba histolytica و Giardia intestinalis در بیماران اسهالی در عراق

  Entamoeba histolytica و Giardia intestinalis دو انگل رایج مرتبط با عفونت های گوارشی و بیماری های اسهالی در سراسر جهان هستند. این مطالعه به بررسی شیوع، خصوصیات مولکولی و روابط فیلوژنتیکی E. histolytica و G. intestinalis در بیماران مبتلا به اسهال و اختلالات روده در بیمارستان های سراسر عراق پرداخت.

  نمونه های مدفوع از افرادی که علائم گوارشی داشتند جمع آوری شد و یک معاینه میکروسکوپی برای غربالگری وجود E. histolytica و G. intestinalis انجام شد. DNA از نمونه های مثبت استخراج شد و تکثیر PCR با هدف قرار دادن ژن 16S rRNA برای E. histolytica و ژن تریوز فسفات ایزومراز (TPI) برای G. intestinalis انجام شد. محصولات PCR به دست آمده تحت الکتروفورز ژل آگارز قرار گرفتند، خالص شدند و توالی یابی شدند. درختان فیلوژنتیک با استفاده از روش حداکثر درستنمایی بر اساس مدل Tamura-Nei ساخته شدند و تجزیه و تحلیل بوت استرپ انجام شد.

  از بین نمونه های مورد مطالعه، (85=n) 27/8 درصد E. histolytica و (n=60) 19/6 درصد G. intestinalis مثبت بودند. تجزیه و تحلیل توالی حضور E. histolytica و G. intestinalis با تطبیق توالی های به دست آمده با آنهایی که در بانک ژن NCBI موجود است را تایید کرد. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک تنوع ژنتیکی و ارتباط جدایه های E. histolytica و G. intestinalis را نشان داد. الگوهای خوشه بندی خاص برای جمعیت عراق مشاهده شد که نشان دهنده پویایی انتقال منطقه ای بالقوه است.

   این مطالعه بینش های ارزشمندی در مورد شیوع، خصوصیات مولکولی و روابط فیلوژنتیکی E. histolytica و G. intestinalis در بیماران عراقی مبتلا به اسهال و اختلالات روده ارائه می کند.