فهرست مطالب

نشریه تحقیقات بیماری های گیاهی
سال هفتم شماره 1 (بهار و تابستان 1403)

  • تاریخ انتشار: 1403/03/01
  • تعداد عناوین: 2
|
  • سامان جوزاریان، گیلدا نجفی پور*، کاوس ایازپور صفحات 1-16

    شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار ناشی از Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss)، در کلیه مناطق کشت درختان هسته دار وجود دارد و یکی از مهم ترین بیماری های درختان میوه هسته دار در ایران است. این بیماری باعث ایجاد زوال در درختان جوان و کاهش محصول در درختان مسن می شود (Agrios, 2005). طی بازدیدهای انجام شده از مناطق مختلف استان کهگیلویه و بویراحمد، نمونه های آلوده به شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار جمع آوری شد. همه سویه ها به منظور بررسی خصوصیات فنوتیپی، ژنوتیپی، فیزیولوژیکی، بیماریزایی، تغذیه ای و وجود ژن SyrB مورد بررسی قرار گرفتند. علاوه بر این سویه های مورد نظر از لحاظ ژنوتیپی با روش RFLP نیز مورد ارزیابی قرار گرفتند. ویژگی های ریخت شناسی و زیست شناسی بررسی شده نشان داد که تمام سویه ها میله ای شکل،گرم منفی، متحرک، هوازی اجباری، کاتالاز مثبت و از نظر واکنش فوق حساسیت روی توتون نیز مثبت هستند. کل سویه ها روی محیط کشت Kings B تولید رنگ سبز فسفری نمودند. در آزمون های گروه LOPAT نتیجه ی واکنش های اکسیداز، لهیدگی سیب زمینی و آرژنین دهیدرولاز برای کلیه سویه ها منفی، اما نتیجه آزمون های لوان و فوق حساسیت مثبت ارزیابی شد. برای آنالیز عددی خصوصیات فنوتیپی از نرم افزار Ntsys-pc استفاده شد. نتابج نشان داد که سویه های مورد بررسی در سطح بالاتر از 90% با هم تشابه دارند. تمام سویه ها در آزمون اثبات بیماریزایی، روی گیاهان هسته دار، در مدتی کمتر از دو هفته علایم بیماری را نشان دادند. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی B1 و B2، یک قطعه DNA به اندازه تقریبی 752 جفت بازی تولید شد، که این نتایج تشخیص پاتوار Pss را قطعی نمود. به منظور ارزیابی اثرانگشت ژنتیکی سویه ها از آزمون RFLP و آنزیم های kpnI ،EcorI ،HaeIII ،AluI و HindIII استفاده شد که در این میان، تنها HaeIII قادر به ایجاد برش در ژن SyrB بود. اثر انگشت ژنتیکی حاصل از این برش در کلیه سویه ها یکسان ارزیابی شد. نتایج حاصل از آزمون های فنوتیپی، بیماریزایی و RFLP نشان دادکه احتمالا سویه های Pss هسته داران در استان کهگیلویه و بویراحمد از یکنواختی زیادی برخوردارند.

    کلیدواژگان: درختان میوه هسته دار، Syrb، PCR، Pseudomonas Syringae Pv. Syringae، RFLP
  • گیلدا نجفی پور، کاووس ایازپور * صفحات 17-41

    عامل لکه قهوه ای قارچ خوراکی (Brown Blotch) Pseudomonas tolaasii است که در بسیاری از نقاط دنیا مشاهده می شود. طی سال های 96 و97 از سالن های پرورش قارچ در مناطق مختلف استان فارس (جهرم، شیراز، لار، سپیدان، کازرون، نی ریز و آباده) نمونه برداری و به آزمایشگاه منتقل شد. در مجموع 100 جدایه از مناطق مذکور بدست آمد. کلیه ی جدایه ها به منظور بررسی خصوصیات فیزیولوژیکی، بیوشیمیایی و تغذیه ای و نیز وجود ژن تولاسین با استفاده از آغازگرهای اختصاصی PT1A وPT1D1 مورد بررسی قرار گرفتند. سویه های مورد بررسی میله ای شکل، گرم منفی و هوازی اجباری بوده و آزمون های اکسیداز و آرژنین دی هیدرولاز آنها مثبت بود. همچنین توانایی لهانیدن ورقه های سیب زمینی، تولید لوان، هیدرولیز نشاسته و فوق حساسیت روی توتون (HR) برای کلیه جدایه ها منفی ارزیابی شد. در بررسی تنوع ژنوتیپی باکتری، با استفاده از روشrep-PCR مشخص شد که با استفاده از آغازگرهای مذکور، جدایه های مناطق مختلف استان فارس به شش یا هفت گروه متمایز تقسیم می شوند. کلاسترهای ایجاد شده در بسیاری موارد، با پراکنش جغرافیایی جدایه ها هماهنگی نسبی داشت. نتایج نشان داد آزمونrep-PCR بوسیله ی هر یک از آغازگرهای سه گانه یREP ، ERIC وBOX بطور انفرادی می تواند بطور مشخصی جدایه های مناطق مختلف استان را بر اساس منطقه جغرافیایی از یکدیگر تفکیک نماید. همچنین مقایسه بین گروه های ایجاد شده بر اساس آزمون بیماریزایی روی قارچ دکمه ای و کلاسترهای ایجاد شده در آزمون rep-PCR نشان داد که کلاسترهای ایجاد شده در آزمون rep-PCR بر اساس بیماریزایی با یکدیگر هماهنگ می باشند.

    کلیدواژگان: Pseudomonas Tolaasii، استان فارس، Rep-PCR، لکه قهوه ای قارچ خوراکی
|
  • S. Jozarian, G. Najafi Pour*, K. Ayazpour Pages 1-16

    Bacterial canker of stone fruit trees caused by Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss), is present in all areas where stone fruit trees are cultivated. It is one of the most important diseases of stone fruit trees in Iran. This disease causes deterioration in young trees and yield reduction in old trees (Agrios, 2005). During investigation in different regions of Kohgiloye and Boyerahmad province (Iran), plants showing bacterial canker symptoms were collected. A total of 30 gram-negative isolates were initially identified as Pseudomonas syringae pv. syringae. All isolates were studied for phenotypic, physiological, pathogenicity, nutritional characteristics and evaluation for syrB gene. Moreover, they were subjected to genetically analysis via RFLP. All isolates were rod shaped, gram negative, motile, and obligate aerobic. All of them showed positive reaction in catalase and hypersensitive reaction on tobacco. Additionally, they produced a fluorescent pigment on Kings’B medium. In LOPAT tests, oxidase, arginine dehydrolysis and potato rot were negative and hypersensitive reaction and levan production were positive. In numerical analysis of phenotypic characteristics using Ntsys-pc, all isolates were showed 90% similarity. Pathogenicity test shown that all strains were infectious on stone fruit plants regardless of their initial hosts. An approximately, a 752 bp fragment DNA, was synthetized using B1 and B2 specific primers. In RFLP test, five enzymes including kpnI, EcoRI, HaeIII, AluI and HindIII were applied on syrB gene. Only one enzyme, HaeIII, was able to cut syrB gene. Genetic fingerprint obtained from RFLP, were evaluated identical for all isolates. Results of phenotypic, pathogenicity, and RFLP tests signify that Pss strains isolated from stone fruits in Kohgiloye and Boyerahmad province, show high homogeneity.

    Keywords: Stone Fruits Syrb, Pseudomonas Syringae Pv. Syringae, RFLP
  • M.A Ramazani, G. Najafi Pour*, K. Ayazpour Pages 17-41

    Brown Blotch in mushroom, caused by Pseudomonas tolaasii can be seen in many mushroom farms. This disease causes dark brown or chocolate spots on the cap and base, eventually reducing the quality and quantity of mushrooms produced. During 2017- 2018, samples were collected and transported in plastic bags to the laboratory. A total of 100 gram-negative isolates were initially identified as Pseudomonas tolaasii on nutrient agar. All isolates were studied for physiological, biochemical, and nutritional characterization, as well as for the presence of the tolaasin gene using specific primers, PT1D1 and PT1A. All strains were rod-shaped, Gram-negative, obligate aerobic, were positive for oxidase, and arginine dehydrolase. This isolates produced fluorescent pigment on KB medium. Levan production, hydrolyze starch were positive and tobacco hypersensitive reaction (HR) was assessed negative in all isolates. In this study rep-PCR method was used for evaluating of geographical diversity of P. tolaasii. Three primers, consist of BOX, ERIC, and REP primers, were used. The results showed that using these primers, the isolates from different regions of Fars province were divided into six or seven distinct groups. Clusters created based on geographical distribution showed relative similarity among the isolates. rep-PCR results revealed that both REP, ERIC, and BOX primers individually were largely acceptable, and isolates from different places were separated according to geographical area. Comparisons between groups were also made based on a pathogenicity test on mushroom’s cap, and clusters created by the rep-PCR showed synchronization based on pathogenicity.

    Keywords: Pseudomonas Tolaasii, Fars Province, Phenotypic, Genotypic, Characteristics, Rep-PCR Brown Blotch