«خشت اول چون نهاد معمار کج، تا ثریا می رود دیوار کج» تعبیری معروف که بیش از هر توضیحی گویای ساختار معیوب سازمان سینمایی است. هر چند ایده شکل گیری سازمان سینمایی مبنی بر اینکه نهادی فراتر از یک معاونت سینمایی یا اداره کل شکل بگیرد تا با وجود ارتباط با وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی ساز و کار مستقل تری داشته باشد درست و اصولی بود اما در عمل هیچ کدام به نتیجه نرسید. یکی از مهم ترین این اشکالات چارت سازمانی و ساختار معیوب آن است که امکان هر گونه تحولی را از این سازمان گرفته است. در یک بازنگری کلی این گونه به نظر می رسد معاونت ها و موسسات تابع و مدیر کل های مختلف هر کدام ساز خودشان را می زنند و هیچ ارتباط