آذر سبکبار
-
سابقه و هدف
تجزیه زیستی یکی از روش های پاکسازی محیط از ترکیبات نفتی می باشد. هدف از این پژوهش تحقیقی شناسایی باکتری بومی تجزیه کننده فنانترن وبررسی شرایط بهینه رشد به منظور تجزیه زیستی بود.
مواد و روش هانمونه برداری ازخاک های آلوده به مواد نفتی در میدان نفتی دارخوین ایران انجام شد. پس ازجداسازی و شناسایی اولیه باکتری ها، باکتری شاخص انتخاب و شناسایی شد. سپس مقدار بیوسورفکتانت باکتری پس از بررسی اولیه، با دستگاه تنسیومتر اندازه گیری شد. بررسی اثر فاکتورهای دما، زمان، pH، نیترات و سدیم فسفات در3 سطح مختلف با طراحی آزمایش به روش تاگوچی انجام گرفت و باکتری منتخب درشرایط طراحی شده قرار داده شد. میزان تجزیه فنانترن با دستگاه GC-MS بررسی ونتایج بدست آمده تجزیه وتحلیل شد.
یافته هادرمیان جدایه ها باسیلوس مجاونسیس دارای قدرت بیشتری در تجزیه فنانترن بود. ارزیابی حضور بیوسورفکتانت این باکتری مقدار mN/m 47 را نشان داد. نتایج حاصل ازتجزیه وتحلیل شرایط بهینه باکتری باسیلوس مجاونسیس برای تجزیه زیستی دمای45 درجه سلسیوس،7 pH ، نیترات mg/mL1، سدیم فسفات mg/mL 3/0 و زمان 5 روز را نشان داد که در این شرایط%55 فنانترن تجزیه شد.
نتیجه گیرینتایج این پژوهش نشان داد که با توجه به حضور باکتری های بومی با قابلیت تجزیه فنانترن درخاک های آلوده، وتعیین سطح مواد مغذی، فاکتورهای محیطی ودیگرعوامل موثردر تجزیه زیستی، یک استراتژی کارآمد به منظور افزایش سرعت تجزیه زیستی فنانترن می باشد.
کلید واژگان: تجزیه زیستی, فنانترن, باسیلوس مجاونسیس, بهینه سازیBackground & ObjectivesBioremediation is one of the methods of cleaning the environment from petroleum compounds. The aim of this research was to identify a native phenanthrene-degrading bacterium and to investigate the optimal growth conditions for biodegradation.
Materials and MethodsSampling was carried out from petroleum-contaminated soils in the Darkhovin oil field, Iran. After isolation and primary identification of the bacteria, the specific bacterium was selected and identified. Then, after initial examination, the amount of biosurfactant produced by the bacterium was measured using a tensiometer. The effect of temperature, time, pH, nitrate, and sodium phosphate factors at 3 different levels was investigated using the Taguchi method, and the selected bacterium was placed under the designed conditions. The amount of phenanthrene degradation was examined using GC-MS, and the obtained results were analyzed.
ResultsAmong the isolates, Bacillus mojavensis had a higher ability to degrade phenanthrene. Evaluation of the presence of biosurfactant in this bacterium showed a value of 47 mN/m. The results of analyzing the optimal conditions of Bacillus mojavensis for biodegradation showed a temperature of 45 °C, pH 7, nitrate 1mg/mL, sodium phosphate 0.3 mg/mL 0.3, and a time of 5 days, under which conditions 55% of phenanthrene was degraded.
ConclusionThe results of this study showed that, considering the presence of native bacteria capable of degrading phenanthrene in contaminated soils, and determining the level of nutrients, environmental factors, and other effective factors in biodegradation, it is an effective strategy to increase the rate of phenanthrene biodegradation.
Keywords: Bioremediation, Phenanthrene, Bacillus Mojavensis, Optimization -
سابقه و هدف
گیاهان منبع غنی از مواد شیمیایی فعال و یا مواد مغذی زیستی هستند که نقش مهمی در پیشگیری و درمان بیماری های عفونی دارند. در این مطالعه توانایی عصاره آبی و اتانولی میوه گیاه سماق (Rhus coriaria) در مهار رشد تریکوموناس واژینالیس (Trichomonas vaginalis) و کاندیدا آلبیکنس (Candida albicans) در شرایط برون تنی بررسی شد.
مواد و روش هاعصاره گیری از میوه سماق به روش خیساندن و هم زدن توسط آب و اتانول 96 درصد انجام و اثرات ضد میکروبی آن به طور کمی به روش رقیق سازی سریالی و با تعیین میزان حداقل غلظت بازدارندگی اندازه گیری شد.
یافته هاغلظت مهاری 50 درصد (IC50) عصاره الکلی در مقابل تریکوموناس واژینالیس برابر با 8/1 میلی گرم بر میلی لیتر و برای عصاره آبی، 05/3 میلی گرم بر میلی لیتر در 24 ساعت بود. هیچ غلظتی از عصاره آبی میوه سماق توانایی ممانعت از رشد کاندیدا آلبیکنس را نداشت اما عصاره الکلی با غلظت 60 میلی گرم بر میلی لیتر رشد کاندیدا آلبیکنس را در مدت 24 ساعت مهار کرد.
نتیجه گیریعصاره های حاصل از میوه سماق می تواند به عنوان یک جایگزین بالقوه برای داروهای شیمیایی در درمان عفونت های حاصل از تریکوموناس واژینالیس به شمار آید اما این ترکیبات نتایج ضد قارچی مطلوبی در برابر کاندیدا آلبیکنس از خود نشان ندادند.
کلید واژگان: میوه سماق, کاندیدا آلبیکنس, تریکوموناس واژینالیس, اثرات ضد میکروبی, Iau ScienceAim and BackgroundPlants are a rich source of bioactive chemical compounds that play an important role in the prevention and treatment of infectious diseases. In this study, the ability of aqueous and ethanolic extracts of sumac (Rhus coriaria) fruit to inhibit the growth of Trichomonas vaginalis and Candida albicans were investigated in vitro.
Material and methodsExtraction of sumac fruit was done by soaking and stirring with water and ethanol and its antimicrobial effects were evaluated by Broth microdilution method by determining the minimum inhibitory concentration (MIC).
ResultsThe 50% inhibitory concentration (IC50) of ethanolic extract against Trichomonas vaginalis was 1.8 mg/ml and for aqueous extract was 3.55 mg/ml in 24 hours. No concentration of the aqueous extract of Sumac fruit was able to inhibit the growth of Candida albicans, while the ethanolic extract at 60 mg/ml inhibited the growth of Candida albicans after 24 hours.
ConclusionSumac fruit extracts can be considered as a potential alternative to chemical drugs in the treatment of Trichomonas vaginalis infections, but these compounds have not shown favorable antifungal results against Candida albicans.
Keywords: Sumac fruit, Candida albicans, Trichomonas vaginalis, Antimicrobial effects, Iau Science -
بررسی الگوی حساسیت دارویی 5 داروی ضد قارچی بر علیه گونه های آسپرژیلوس جدا شده از نمونه های بالینیزمینه
عفونت آسپرژیلوزیس مهاجم هنوز هم یکی از علت های اصلی مرگ و میر در بیماران دارای ایمنی ناکارآمد می باشد. در مطالعات اخیر مقاومت گونه های آسپرژیلوس نسبت به داروهای ضد قارچی بخصوص آمفوتریسین ب و تری آزول ها گزارش شده است. الگوی حساسیت دارویی گونه های آسپرژیلوس جهت انتخاب داروی موثر و مصرف به موقع آن جهت بهبود وضعیت بیماران مبتلا بسیار ضروری است. مطالعه حاضر با هدف بررسی الگوی حساسیت دارویی داروی های ضد قارچی بر علیه گونه های آسپرژیلوس جدا شده از نمونه های بالینی انجام شد.
روشایزوله های آسپرژیلوس جدا شده از نمونه های بالینی بر اساس مشخصات ماکروسکوپی و میروسکوپی و همچنین تعیین توالی نوکلیوتیدی ناحیه ژنی ژن بتا توبولین شناسایی شدند. ارزیابی الگوی حساسیت داروهای آمفوتریسین ب، ایتراکونازول، وریکونازول، پوساکونازول و کاسپوفانجین بر علیه ایزوله های آسپرژیلوس بر اساس روش استاندارد میکرودایلوشن و مطابق آخرین نسخه از روش های تاییدی CLSI ، پروتکل M38-A2 برای قارچ های رشته ای انجام شد.
یافته هادر طی مطالعه حاضر تعداد 163 نمونه بالینی از بیماران مشکوک به عفونت قارچی آسپرژیلوزیس از بیمارستان های شهر تهران و ساری مورد مطالعه بررسی شد. بر اساس شناسایی مولکولی، گونه های آسپرژیلوس فلاووس 42 (4/64 %)، آسپرژیلوس فومیگاتوس 12 (4/18 %)،آسپرژیلوس نایجر 8 (3/12 %) و آسپرژیلوس تریوس 3 (6/4 %) شناسایی شدند. در بین داروهای مورد مطالعه، داروی کاسپوفانجین دارای بیشتری فعالیت ضد قارچی بر علیه ایزوله های آسپرژیلوس بوده و 100% ایزوله ها دارای MIC90 برابر با µg/mL063/0 بودند. در بین داروهای آزولی، داروی پوساکونازول دارای بیشترین فعالیت ضدقارچی بود و میزانMIC این دارو برای تمام ایزوله های مورد مطالعه برابر با ≤1 µg/mL بود. همچنین به ترتیب 5/0 % و 1 % ایزوله ها آسپرژیلوس فومیگاتوس نسبت به داروهای ایتراکونازول و وریکونازول مقاوم بودند.
نتیجه گیرینتایج این مطالعه نشان داد که ایزوله های آسپرژیلوس جدا شده از نمونه های بالینی مورد مطالعه نسبت به داروهای کاسپوفانجین و پوساکونازول بسیار حساس می باشند. نتایج ارایه شده بصورت آزمایشگاهی در مطالعه نیاز به بررسی های بیشتر بخصوص در مطالعات مدل های حیوانی مبتلا به تظاهرات مختلف بیماری آسپرژیلوزیس مبتلا به این عامل دارد.
کلید واژگان: حساسیت دارویی, آسپرژیلوس فلاووس, آسپرژیلوس فومیگاتوسIn Vitro Activities of Five Antifungal Agents Against Clinical Isolates of Aspergillus SpeciesInvasive aspergillosis is one of the leading causes of death in patients with weakened immune systems. Since resistance to antifungal agents has been observed in patients, susceptibility testing is helpful in defining the activity spectrum of antifungals and determining the appropriate drug for treatment. Despite an increasing number of infections of Aspergillus in Iran, the antifungal susceptibility patterns and molecular epidemiology of clinical strains has not been well studied. In the current study, we evaluated the in vitro antifungal susceptibilities of five antifungal agents against clinical Aspergillus isolates from Iran.Clinical Aspergillus isolates were preliminarily identified to the species level based on microscopic and macroscopic characteristics; subsequently, their identity was confirmed by DNA sequencing of the partial β-tubulin (BTU) gene. Antifungal susceptibilities of AMB, ITC, VRC, POS, and CAS against clinical Aspergillus isolates were determined in accordance with the CLSI M38-A2 document. One hundred and sixty-three clinical (n = 163) Aspergillus isolates were evaluated for their antifungal susceptibilities patterns. Aspergillus flavus 42 (64.4%), Aspergillus fumigatus 12 (18.4%), Aspergillus niger 8 (12.3%) and Aspergillus terreus 3 (4.6%) species were identified. Caspofangin (MIC90=0.063 μg/mL) had the highest antifungal activity against Aspergillus isolates and 100% of the isolates had MIC90 equal to 0.063 μg/mL. Among azole drugs, posaconazole had the highest antifungal activity and the MIC of this drug for all isolates was ≤1 μg/mL. Also, 0.5% and 1% of Aspergillus fumigatus isolates were resistant to itraconazole and vriconazole, respectively.Our results suggest that clinical Aspergillus isolates are the most susceptible to posaconazole and caspofungin. These results should be further investigation, especially in in vivo study with different manifestations of aspergillosis.
Keywords: Antifungal susceptibility, Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus -
امروزه سرطان بر اساس گزارش سازمان بهداشت جهانی در سال 2018 دومین عامل مرگ و میر درجهان می باشد. استفاده از پلی ساکارید های قارچی یکی از راه های ارزانتر، کم خطرترو با عوارض جانبی کمتر و جدیدتر در پیشگیری و درمان سرطان می باشد. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی قارچ فوزاریوم بومی از خاک های کرج و استخراج پلی ساکارید گلوکان وتعیین ویژگی های شیمیایی آن باروش های FT-IR و HPLC و نقش ضد سرطانی آن برروی سل لاین های لنفوییدی (LCL) و هلا (Hela) می باشد. دراین مطالعه نمونه قارچ فوزاریوم از خاک منطقه کرج جداسازی گردید وبه روش میکروسکوپی وماکروسکوپی و ژنتیکی درحد جنس شناسایی شد . وسپس قارچ در محیط کشت مایع انتخابی برای تولید بیشترین مقدار توده قارچی برای استخراج گلوکان کشت گردید.گلوکان قارچ به روش آب جوش مورد استخراج قرارگرفت .مقادیر مختلفی ازگلوکان استخراج شده را به کشتهای سلولی LCLوHela اضافه شد واثرات سایتوتوکسیسیته آن بررسی شد.نتایج کشت نشان داد پلی ساکارید گلوکان نقش ضد سرطانی بر روی سلول های لنفوییدی داشت اما بر روی سلول های هلا اثر ضدسرطانی نداشت. اثرات سایتوتوکسیسیته پلی ساکارید گلوکان با روش کالریمتری (MTT) نشان داده شد.
کلید واژگان: فوزاریوم, استخراج گلوکان, کشت سلول, FT-IR, HPLCCancer is the second factor of death in world on the basis of WHO reports on 2018. Application of fungal polysaccharides is one of the cheaper, less dangerous, less side effects, and newer in the treatment and prophylaxis of cancer. Object of this research is isolation and identification of endemic fusarium fungus, its glucan extraction, determination of chemical characteristics by HPLCand FT-IR and anticancer effects on cell lines of LCL, Hela.In this study fusarium fungus was isolated from soil of karaj district and identified on the basis of microscopic and macroscopic and genetical characteristics as a fusarium genus .Then fungus was grown into selective broth medium for obtaining of the most biomass for extraction of glucan .Glucan of fungus was extracted by boiling water method.Different amounts of extracted glucan were treated to the cell cultures of lcl and Hela and its cytotoxicity effects were surveyed.Results showed that glucan polysaccharide had anticancer effects against cell lines of LCL and no anticancer effects against Hela cell lines. Cytotoxicity effects of glucan showed by colorimetry MTT method.
Keywords: Fusarium, Glucan extraction, Cell culture, HPLC, FT-IR -
زمینه و هدف
زندانیان در معرض خطر ابتلا به عفونت های خطرناک مسری از جمله ویروس نقص ایمنی انسان (HIV)، ویروس هپاتیت B (HBV)، ویروس هپاتیت C (HCV) و توبرکلوزیس (TB) قرار دارند. این مطالعه به منظور تعیین شیوع عفونت های همزمان با ویروس نقص ایمنی انسان (HIV) در زندانیان مرد استان البرز انجام شد.
روش بررسیاین مطالعه توصیفی - تحلیلی روی 100 بیمار مرد زندانی مبتلا به HIV با میانگین سنی 7±39 سال انجام شد. از بیماران نمونه خلط و خون گرفته شد. برای بررسی هپاتیت B و C تست الایزا بر روی سرم بیماران انجام شد. پس از استخراج DNA این ویروس ها، بار ویروسی با استفاده از روش مولکولی Real time PCR اندازه گیری و سپس نمونه های مثبت تعیین توالی شدند و ژنوتیپ آنها تعیین گردید. برای بررسی عفونت توبرکلوزیس خلط بیماران به روش اسید فست رنگ آمیزی شد.
یافته هافراوانی ابتلا به HBV، HCV و TB در بین 100 نفر از زندانیان مرد مبتلا به HIV به ترتیب 45 درصد، 3 درصد و 9 درصد تعیین شد. مبتلایان به HBV دارای ژنوتیپ D و ساب ژنوتیپ ayw2 بودند. 45 درصد بیماران آلوده به HCV بودند که از میان آنها 3 درصد آلودگی همزمان HIV-HCV-TB داشتند. از 45 بیمار مبتلا به HCV، تعداد 34 نفر (75.5%) ژنوتیپ 1a و 11 نفر (24.5%) دارای ژنوتیپ 3a بودند. تعداد 9 بیمار همزمان مبتلا به بیماری TB بودند. سابقه اعتیاد تزریقی شایع ترین راه (79%) ابتلا به HCV و HBV تعیین شد. بین متغیرهای سن، تعداد سلول های CD4 و راه انتقال با ابتلا به عفونت HCV در افراد مبتلا به HIV ارتباط آماری معنی داری یافت نشد.
نتیجه گیریاین مطالعه نشان دهنده شیوع بالای هپاتیت C و بیماری سل در بین زندانیان مرد مبتلا به HIV است.
کلید واژگان: ویروس نقص ایمنی انسان, عفونت همزمان, ویروس هپاتیت B, ویروس هپاتیت C, توبرکلوزیسBackground and ObjectivePrisoners are among the high risk population for contagious infections such as HIV (Human Immunodeficiency Virus), HBV (Hepatitis B Virus), HCV (Hepatitis C Virus), TB (Tuberculosis), and other dangerous diseases. In spite of other countries in the world, data about the prevalence and risk factors for infectious diseases among prisoners are spars in Iran. The aim of this study was to determine the prevalence of HBV, HCV and TB coinfections among male prisoners suffering from HIV.
MethodsIn this descriptive-analytical study, 100 HIV patients were selected. Microscopic examination (acid fast staining) was applied on sputum specimens and serological (HBsAg, anti- HCV) and molecular (Real time PCR and DNA sequencing) investigations carried out on patient’s sera.
ResultsAmong 100 prisoners affected with HIV, the prevalence of HCV, HBV and TB infections were 45%, 3%, and 9%, respectively. All HBV positive cases were genotype D, subgenotype ayw2. Among the HCV positive subjects, 34 (75.5%) and 11 (24.5%) were genotype 1a and genotype 3a, respectively. There was no significant relation between age, CD4 and transmission route of HCV in male prisoners affected with HIV. Drug injection was the main route for the acquisition of HCV, HBV infections.
ConclusionThis study showed that a high prevalence of HCV and TB infections among male prisoners affected with HIV.
Keywords: Human Immunodeficiency Virus, Coinfection, Hepatitis B Virus, Hepatitis C Virus, Tuberculosis -
مایکوباکتریوز ماهی یک بیماری پیش رونده مزمن است که توسط گونه های مختلف مایکوباکتریوم ها ایجاد می شود. تشخیص این بیماری در ماهی های زینتی، بطور معمول با استفاده از روش های هیستوپاتولوژی، کشت، انجام می شود. تعیین گونه نیز بر اساس خصوصیات رشد باکتری در دماهای مختلف، نوع پیگمان، مورفولوژی کلنی ها و تست های بیوشیمیایی می باشد. اگرچه تشخیص اولیه مایکوباکتریوز ماهی بر پایه علائم بالینی خارجی و حضور گرانولوم در بافت های احشایی با روش نمونه برداری است، اما برخی موراد، هیچ علائم بالینی بوده و یا توده های گرانولومی مشاهده نمی شود. با توجه به خصوصیت زئونوتیک بیماری، افزایش اهمیت آکواریوم و همچنین افزایش عفونت های فرصت طلب بواسطه مایکوباکتریوم های غیر توبرکلوزی در افراد سالمند و بیماران مبتلا به نقص ایمنی، درمان بسیار دشوار و دوره های درمانی طولانی مدت این عفونت ها، و از طرفی اهمیت یافتن آن در ماهی ها که منجر به تلفات مالی می شود، موجب شد که در این تحقیق به جداسازی و شناسایی گونه های مایکوباکتریوم ها در ماهیان آکواریومی طراحی شود. وجود مایکوباکتریوم ها در 53 ماهی که از آکواریوم فروشی های منطقه ای شهر تبریز تهیه شده بودند با روش های رنگ آمیزی ذیل _ نلسون و کشت روی محیط لوانشتاین_ جانسون مورد تحقیق قراگرفتند. شناسایی گونه های مایکوباکتریومی ایزوله شده با ویژگی های مورفولوژی و تست های بیوشیمیایی انجام شد. مقاومت دارویی ایزوله ها نسبت به داروهای ایزونیازید، استرپتومایسین، ریفامپین، اتامبوتول، کانامایسین، آمیکاسین و سیپروفلوکساسین به روش نسبی در محیط کشت لوانشتاین- جانسون بررسی گردید. سویه حساس به همه داروها، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (H37Rv) جهت کنترل کیفی استفاده شد. در بررسی مستقیم میکروسکوپی با روش رنگ آمیزی ذیل- نلسون، باسیل های اسید فست در هفت نمونه شناسایی گردید. با استفاده از روش کشت باکتریایی در 3/28% از ماهی ها، گونه های مایکوباکتریوم ایزوله گردید. گونه های مختلف مایکوباکتریوم به شرح ذیل شناسایی گردید: مایکوباکتریوم مارینوم، مایکوباکتریوم فورچئیتوم، مایکوباکتریوم اسمگماتیس، مایکوباکتریوم تره آ، مایکوباکتریوم فلاوسنس و مایکوباکتریوم آزیاتیکوم. نتایج حاصل از بررسی نمونه ها نشان داد که، مایکوباکتریوم فورچئیتوم و مایکوباکتریوم مارینوم بیش از سایر گونه ها ایزوله گردید. در بررسی حساسیت دارویی ایزوله ها نتایج نشان داد که بیشترین مقاومت دارویی به استرپتومایسین و کمترین مقاومت به سیپروفلوکساسین مربوط می شد. در این تحقیق، مایکوباکتریوم مارینوم،مایکوباکتریوم فورچوئیتوم، مایکوباکتریوم اسمگماتیس و مایکوباکتریوم فلاوسنس که در ماهی و انسان بعنوان پاتوژن شناخته شده اند از ماهی های آکواریومی جدا شدند. سویه های ایزوله شده به بیشتر داروهای مورد استفاده در درمان مقاوم بودند، بنابراین ملاحظات بیشتری در خصوص حضور مایکوباکتریوم ها در ماهیان آکواریومی لازم است تا میزان انتقال باکتری به انسان کاهش یابد.کلید واژگان: مایکوباکتریوز, ماهی آکواریومی, مقاومت دارویی, مایکوباکتریوم فورچئیتوم و مایکوباکتریوم مارینوم
Fish mycobacteriosis is a chronic progressive disease that caused by different species of mycobacteria. Diagnosis of the disease in ornamental fish is usually done by bacterial culture and histopathology. Identification is also based on the rate of growth at different temperature, the pigmentation type, the morphology of colony and by biochemical tests. Although the primary diagnosis of fish mycobacteriosis is based on clinical symptoms and the presence of granuloma in visceral tissues by sampling, but in some cases no any clinical symptoms or no granulomas masses are seen. Due to the zoonotic character of the disease, increasing importance of aquariology, and also increasing of opportunistic infections via Non-tuberculous mycobacteria in older persons or immunocompromised patients, also existence of some extremely difficulties to treat like to require the long course of therapy, and on the other hand, the financial losses, so; the present study planned to detection and identification of mycobacterial species in aquarium fish. Existence of Mycobacterial species in 53 fishes were investigated that they were obtained from some local aquarium shops in Tabriz by Ziehl-Neelsen staining and culture on Lowenstein-Jensen (LJ) medium. Identification of isolates was done by morphological characters of mycobacteria on LJ and using of biochemical tests. For drug susceptibility testing, the proportional method on LJ were used for isoniazid, ethambutol, rifampin, streptomycin, kanamycin, ciprofloxacin, and amikacin. The susceptible (H37Rv) standard Mycobacterium tuberculosis strain was used as a control. Acid-fast bacilli were detected on the 7 smears of samples by direct microscopic examinationmethodof Ziehl-Neelsen. In using of the culture method, Mycobacterium spp. were isolated from 28.3% of the fishes. The isolated species were identified as M. marinum, M. fortuitum, M. smegmatis, M. terrea, M. flavescens and M. asiaticum. The study showed that M. fortuitum and M. marinum are more than other species. In the drug susceptibility testing; the streptomycin had the highest resistance (93.33%) and the lowest drug resistance was diagnosed to ciprofloxacin (20%). In the investigation, Mycobacterium marinum, M. fortuitum, M. smegmatis and M. flavescens that are well known as pathogens in fish and humans were isolated, which were resistant to most drugs that are used in the treatment. Therefore, more attention should be paid to the presence of
mycobacteria in aquarium fish for reducing the rate of bacterial transmission to human.Keywords: mycobacteriosis, aquarium fish, drug resistance, Mycobacterium marinum, Mycobacteriumfortuitum -
مقدمهحذف زیستی بهترین روش برای رفع آلودگی های ناشی از فلزهای سنگین در پساب های صنعتی است و نخستین قدم در این مسیر، شناسایی و طبقه بندی ریزموجودات مناسب به ویژه باکتری های مقاوم به این فلزهاست. مواد و روش ها: در پژوهش حاضر، 17 باکتری گرم منفی غیرتخمیرکننده از پساب های صنعتی جداسازی و شناسایی شدند و کمترین غلظت بازدارنده (MIC) آنها نسبت به غلظت های مس و کادمیوم ارزیابی شد؛ DNA باکتری های یادشده با دو روش CTAB و دلاپورتا استخراج و تنوع ژنتیکی آنها با 7 نشانگر RAPD و 3 نشانگر ISSR بررسی شد. ماتریس تشابه بر اساس ضریب تشابه جاکارد با نرم افزار 2. 02) NTSYS-pc (Ver برای ژنوتیپ ها محاسبه و دندروگرام به روش UPGMA رسم شد.نتایج133 باند با استفاده از 10 نشانگر DNA شناسایی شدند که از این تعداد، 122 باند چندشکل و 11 باند یک شکل بودند. این نشانگرها سطح بالایی از چندشکلی را در میان باکتری های مطالعه شده نشان دادند. بحث و نتیجه گیری: تنوع ژنتیکی حاصل از بررسی توام نشانگرهای ISSR و RAPD در تجزیه خوشه ایو دندروگرام رسم شده با تنوع ژنتیکی مشاهده شده بر اساس مقادیر MIC تطابق زیادی داشت و استفاده توام از هر دو نوع نشانگر برای دسته بندی های ژنتیکی بر اساس مقاومت به فلزهای مس و کادمیوم دقیق تر بود. برای تکمیل نتایج روش خوشه ای، تجزیه به مولفه های اصلی نیز انجام شد و پلات های دو بعدی و سه بعدی رسم شدند. نتایج مقایسه این دو روش نشان دهنده انتخاب مناسب نشانگرها برای بررسی تنوع ژنتیکی می باشد واز بین دو روش، انجام تجزیه خوشه اینوصیه می شود.کلید واژگان: تنوع ژنتیکی, نشانگر RAPD, نشانگر ISSR, باکتری های غیرتخمیرکننده, فلزهای سنگینIntroductionOne of the best methods to remove pollutions resulted from heavy metals in industrial wastewater is biological removing. The first step in this way is identifying and clustering microorganisms especially, resistant bacteria to these metals. Material and methods: In this research, 17 non-fermenting gram-negative bacilli were isolated and identified from industrial wastewater. Their MIC was determined by different concentrations of Cu and Cd. With CTAB and Dellaporta, methods were extracted bacterial DNA. Then evaluated genetic diversity by 7 RAPD, 3 ISSR markers. The similarity matrix was calculated by using NTSYS-pc software based on Jaccard’s coefficient for genotypes and dendrogram was drawn in UPGMA method.Results133 bands were identified by using 10 markers that they included 122 polymorphic bands and 11 monomorphic bands. This markers show high level of polymorphism among the bacteria studied. Discussion and Conclusion: In the study cluster analysis and dendrogram drawn based on RAPD and ISSR markers together, there was a significant match between genetic diversity of markers and genetic diversity based on the MIC values. The combined use of both markers for genetic clustering based on resistance to copper and cadmium was more accurate. Principal component analysis was performed to complete the results of cluster analysis and 2-D, 3-D plots were drawn. The results of comparing these two methods showed that these markers had been properly selected for studying genetic diversity, and it was recommended using cluster analysis.Keywords: Genetic Diversity, RAPD, ISSR, Non-fermenting gram-negative Bacilli, Heavy Metals
-
اهدافدر این مطالعه، جایگزنی ترکیبات طبیعی مانند چای سبز بجای استفاده از داروهای شیمیایی ایتراکونازول و وریکونازول بررسی شد.مواد و روش هادر این پژوهش میزان اثرات ضد قارچی عصاره های آبی و متانولی چای سبز و همچنین اثرات هم افزایی این دو عصاره با دو داروی ایتراکونازول و وریکونازول بر روی چهار سویه آسپرژیلوس مطابق روش رقت در پلیت الایزا با تعیین حداقل غلظت مهاری و حداقل غلظت قارچ کشی موردبررسی قرار گرفت.یافته هادوسویه آسپرژیلوس فلاووس 39 ATCC و آسپرژیلوس ترئوس 274 ATCC نسبت به داروی ایتراکونازول حساس و دوسویه دیگر مقاوم بودند. تمامی 4 سویه موردبررسی نسبت به وریکونازول مقاوم بودند. دو عصاره آبی و متانولی چای سبز، اثر ضد قارچی از خود نشان ندادند اما اثرات هم افزایی در ترکیب عصاره آبی چای سبز و ایتراکونازول در دو سویه آسپرژیلوس فومیگاتوس ATCC278 و آسپرژیلوس نایجرATCC9142 ارزشمند بود و همچنین دو ترکیب عصاره متانولی چای سبز و ایتراکونازول در آسپرژیلوس نایجر ATCC9142 و دو ترکیب عصاره آبی چای سبز و وریکونازول بر روی آسپرژیلوس فلاووس 39 ATCC و آسپرژیلوس فومیگاتوس ATCC278 ارزشمند گزارش شد.نتیجه گیرینتایج حاصل از این پژوهش بیانگر وجود اثرات هم افزایی ارزشمندی بین ترکیبات داروها و عصاره های مورد آزمایش بود.کلید واژگان: چای سبز, ایتراکونازول, وریکونازول, آسپرژیلوسAims: In this study, the replacement of natural compounds such as green tea by chemical drugs like itraconazole and voriconazole was studied.Materials and MethodsIn this study, the effects of the aqueous and methanol extracts of green tea and the synergistic effects of these two extracts were studied along with two drugs of itraconazole and voriconazole against four strains of Aspergillus accordaing to microdilution method to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum fungicidal concentration (MFC).
Findings: Two strains of A.flavus ATCC39 and A.terreus ATCC274 are sensitive to itraconazole while two other strains were resistant. All four tested strains were resistant to voriconazole. The aqueous and methanol extracts of green tea did not show antifungal effect but synergistic effects of aqueous extract of green tea and itraconazole were worthwhile against A.niger ATCC9142 and A.fumigatus ATCC278. Also, the combined methanol extracts of green tea and itraconazole against A.niger ATCC9142 and the combined aqueous extracts of green tea and voriconazole against A.flavus ATCC 39 and A.fumigatus ATCC278 were reported valuable.ConclusionThe results of this study showed that there is a valuable synergistic effect between the tested antifungal drugs and the extracts.Keywords: Green Tea, Itraconazole, Voriconazole, Aspergillus -
سابقه و هدفاستنوتروفوموناس مالتوفیلیا، به عنوان باکتری نوظهور جهانی شناخته شده است که با محدوده وسیعی از بیماری ها در ارتباط است. هدف از این مطالعه، بررسی عوامل بیماری زای باکتری شامل آنزیم های خارج سلولی این باکتری، توانایی تشکیل بیوفیلم و ژن rpfF دخالت کننده در کروم سنسینگ می باشد.مواد و روش هااین مطالعه مقطعی بر روی نمونه ها ادرار، خون و خلط، نمونه های سواب از سیستم مانومتر اکسیژن و شیر آب بیمارستان ها، همچنین ساکشن دندانپزشکی انجام شد. ابتدا، شناسایی باکتری با روش کشت و تست های بیوشیمیایی انجام و برای تایید قطعی باکتری، بررسی وجود ژن 23S rRNA به روش real-time PCR انجام شد. جدایه ها از نظر آنزیم های ژلاتیناز، همولیزین، هیالورونیداز، لسیتیناز، لیپاز و پروتئاز به روش فنوتیپی و تشکیل بیوفیلم به روش میکروپلیت بررسی شدند. همچنین وجود ژن rpfF جدایه ها به روش PCR مورد بررسی قرار گرفت.یافته ها100% جدایه ها، دارای ژن rpfF بودند. بیشتر جدایه ها دارای آنزیم های ژلاتیناز (90%)، همولیزین (85%)، پروتئاز (75%)، لسیتیناز (90%)، لیپاز (75%) و هیالورونیداز (100%) بودند. تشکیل بیوفیلم در 15% جدایه ها، دیده نشد، 45% جدایه ها، قدرت تشکیل بیوفیلم ضعیف، 40% جدایه ها، قدرت تشکیل بیوفیلم متوسط و هیچ کدام از جدایه ها، قدرت تشکیل بیوفیلم قوی نداشتند. همبستگی بین متغیرهای همولیزین و لیپاز، همولیزین و لسیتیناز و لسیتیناز و لیپاز، معنی دار بودند.نتیجه گیریبر اساس نتایج این مطالعه جدایه های باکتری، واجد عوامل بیماری زای متعددی شامل ژن rpfF بودند، همچنین، توانایی تولید آنزیم های خارج سلولی و تشکیل بیوفیلم را به میزان بالا داشتند.کلید واژگان: استنوتروفوموناس مالتوفیلیا, ژنrpfF, آنزیم, بیوفیلم
-
سابقه و هدفبرخی گونه های جنس آسپرژیلوس مولدین بالقوه آفلاتوکسین هستند که مایکوتوکسینی با اثرات کارسینوژنیک و تراتوژنیک است. آلودگی خوراک دام با گونه های آسپرژیلوس سبب تولید آفلاتوکسین، انتقال آن به شیر و فرآورده های لبنی و اختلال در سلامت دام، شیر و افراد مصرف کننده آن می شود. هدف از این مطالعه، جداسازی گونه های بالقوه مولد آفلاتوکسین از خوراک دام در گاوداری های منطقه شهر قدس- شهریار بود.روش بررسیدر این مطالعه، 394 خوراک دام از41 گاوداری در منطقه شهر قدس- شهریار در پاییز 1393 به طور تصادفی انتخاب و از نظر آلودگی با آسپرژیلوس هایی که به طور بالقوه مولد آفلاتوکسین هستند به روشPCR مورد سنجش قرار گرفت. آسپرژیلوس های جدا شده از خوراک دام پس از جداسازی و کشت در محیط اختصاصی، با روش میکروسکوپی و ماکروسکوپی مورد بررسی قرار گرفتند و جهت شناسایی مولکولی از روش PCR در حضور پرایمرهای AFLR، Omt1،FLA1،Nor1،Par1 استفاده شد.یافته هانتایج حاصل از بررسی خوراک دام با PCR نشان داد که 42 خوراک دام 8 گاوداری، دارای آلودگی با گونه آسپرژیلوس فلاووس هستند که به طور بالقوه می توانند مولد آفلاتوکسین باشند.نتیجه گیرینتایج نشان دادند که گاوداری های منطقه شهرقدس-شهریار به آسپرژیلوس فلاووس آلوده هستند.کلید واژگان: آفلاتوکسین, خوراک دام, PCRMedical Science Journal of Islamic Azad Univesity Tehran Medical Branch, Volume:26 Issue: 3, 2016, PP 180 -187BackgroundSome of Aspergillus species are potential generators of aflatoxin that is a mycotoxin with carcinogenic and teratogenic effects. Animal feed contaminated with Aspergillus species produce aflatoxin, and transfer it to milk and dairy products that cause animal and human health problems. The aim of this study was to isolate any potential aflatoxinogen of animal feeds from farms area in the Shahr Ghods Shahriar districtsMaterials And MethodsIn this study, 394 cattle feed from 41dairy farming in Shahr Ghods Shahriar districts in autumn, 2014, were randomly selected and they were tested for contamination with potentially aflatoxin-producing Aspergillus by PCR. Isolated Aspergillus from animal feed, by smear and culture, were examined by microscopic and macroscopic and then by molecular method. PCR method used in the presence of primers AFLR, Omt1, FLA1, Nor1, and Par1 to identify potential toxin generating Aspergillus.ResultsThe results of study showed 42 cattle feed contaminated with 8 species Aspergillus flavus by PCR which could potentially produce aflatoxin.ConclusionThe results showed that the dairy farming in Shahr Ghods Shahriar districts were contaminated with Aspergillus flavus.Keywords: Aflatoxin, Animal feed, PCR
-
مقدمهافزایش مقاومت ضد میکروبی در بین باکتری های گرم منفی خصوصا خانواده انتروباکتریاسه به مشکل جهانی تبدیل شده است و در نتیجه انتخاب های درمانی را محدود کرده است. کلبسیلا پنومونیه پاتوژن فرصت طلب گرم منفی است که به علت ایجاد طیف وسیعی از بیماری ها و مقاومت آنتی بیوتیکی امروزه مورد توجه قرار گرفته است. پمپ های ترشحی به عنوان یکی از مکانیزم های مقاومت به آنتی بیوتیک ها در این باکتری مطرح است. لذا هدف از این مطالعه تشخیص ژن های acrB، acrA، oqxA، oqxB ، تعیین میزان بیان پمپ acrA، oqxA و بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در میان ایزوله های بالینی کلبسیلا پنومونیه جداشده از بیمارستان های تهران می باشد.مواد و روش هادر مطالعه حاضر تعداد 83 کلبسیلا پنومونیه از بیماران مراجعه کننده به سه بیمارستان در تهران جمع آوری شدند. تست حساسیت آنتی بیوتیکی با روش دیسک دیفوژن انجام شد. وجود یا عدم وجود ژن های مقاومت acrA، oqxB، oqxA و acrB با استفاده از تکنیک PCR بررسی شد. از CCCP به عنوان مهارکننده استفاده شد و سپس میزان بیان ژن های oqxA و acrA از طریق Real-time PCR بررسی شد.نتایجنمونه های مقاوم به فلوروکینولون ها، به اکثر عوامل ضدمیکروبی استفاده شده در این مطالعه هم، مقاومت نشان دادند. اکثریت نمونه ها دارای پمپ های OqxAB (96%) و AcrAB (97%) بودند. استفاده از مهارکننده نتایج متفاوتی را در MIC سیپروفلوکساسین نشان داد. Real-time PCR ، افزایش بیان 3/2 برابری پمپ دفعی OqxAB و 4 برابری پمپ دفعی AcrAB در نمونه های مقاوم را آشکار ساخت.
بحث: وجود ژن های مقاومت، افزایش سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک های رایج و افزایش عفونتهای بیمارستانی و مرگ و میر ناشی از آن همه و همه لزوم تشخیص دقیق باکتری های مقاوم و جلوگیری از ایجاد مقاومت های جدید و کنترل گسترش مقاومت ها را ضروری می سازد.کلید واژگان: کلبسیلا پنومونیه, پمپ های ترشحی, مقاومت آنتی بیوتیکی, Real, Time PCRBackgroundThe increasing emergence of antimicrobial resistance among gram negative bacteria especially Enterobacteriaceae has become a global problem. Klebsiella pneumoniae is an opportunistic pathogen, which recently due to causing broad spectrum of disease and antibiotic resistance has been lionized. Efflux pumps are one of the antibiotic resistance mechanisms, which were introduced in this bacteria. Therefore, the aims of this study were detection of oqxA, oqxB, acrA and acrB genes, evaluation of expression level of oqxA and acrA genes and determination of antibiotic resistance patterns among Klebsiella pneumoniae isolated at Tehran hospitals.Materials And MethodsIn this descriptive study 83 Klebsiella pneumoniae were collected from patients attending to three hospitals in Tehran. Antibiotic susceptibility test was performed by disk diffusion method. The presence of oqxA, oqxB, acrA and acrB resistance genes was detected by PCR. The CCCP was used as efflux pump inhibitor and the oqxA, acrA genes expression level was analyzed by using real-time PCR.ResultsThe most of strains showed to have OqxAB (96%) and AcrAB (97%) pumps. The use of efflux pump inhibitor showed different results for ciprofloxacin MIC. Real-time PCR assay showed higher expression level of OqxAB (2.3 folds) and AcrAB (4 folds) pumps in resistant strains.ConclusionThe existence of antibiotic resistance genes, increasing of Klebsiella pneumoniae strains, which become resistant to common antibiotics and nosocomial infections, highlights the need for particular detection, prevention and control of spread of resistant bacteria.Keywords: klebsiella Pneumeniae, Efflux Pumps, Antimicbial resistance, Real, Time PCR -
سابقه و هدفآسپرژیلوزیس شایعترین عامل ایجاد کننده عفونت های قارچی با منشاء خارجی است. علی رغم توسعه داروهای ضد قارچی، به دلیل افزایش مقاومت دارویی، افزایش میزانMIC در بین سویه های آسپرژیلوس، میزان مرگ و میر عفونت های فرصت طلب ناشی از گونه های آسپرژیلوس فلاووس افزایش یافته است.مواد و روش هااین مطالعه در طی 9 ماه بر روی 40 سویه آسپرژیلوس فلاووس شامل 20 سویه بالینی و 20 سویه محیطی انجام شد. سپس تست حساسیت دارویی طبق روش استاندارد NCCLS-M38P انجام شد. سوسپانسیون قارچی از هر کلنی قارچ خالص شده با محدوده سلولی cfu/ml 104 x4-1 توسط اسپکتروفتومتر 530 نانومتر تهیه گردید. رقت های سریالی از دارو برای ایتراکونازول و وریکونازول از mg/ml 16 -015/0 و برای داروی کاسپوفانژین از mg/ml 8-007/0 تهیه و میزان MIC داروها بعد از 48 ساعت انکوباسیون در دمای 30 درجه سانتی گراد تعیین گردید.یافته هامحدوده MIC بدست آمده آسپرژیلوس فلاووس در برابر داروی ایتراکونازول بین 2-125/0 و5/0 MIC50= و1MIC90= و داروی وریکونازول بین 2-25/0 و5/0 MIC50= و1MIC90= و برای داروی کاسپوفانژین بین 125/0-0131/0 و063/0 MIC50= و125/0MIC90= بدست آمد.نتیجه گیریتمامی نمونه ها به داروهای مورد مطالعه حساسیت نشان دادند. میزان محدودهMIC حاصل از ایتراکونازول، وریکونازول و کاسپوفانژین، سویه های بدست آمده آسپرژیلوس فلاووس، جزء سویه های حساس ارزیابی شدند و سویه مقاوم مشاهده نگردید. دامنه MIC سویه ها در دامنه مطالعات مشابه و در مواردی نیز خارج از این دامنه ها قرار گرفت که نشان دهنده حساسیت بیشتر سویه های مورد مطالعه بود.کلید واژگان: آسپرژیلوس فلاووس, حساسیت دارویی, کاسپوفانژین, ایتراکونازول, وریکونازولAim andBackgroundDifferent studies have shown that despite the expanding number of antifungal agents, death rate caused by Aspergillus species has been increased during the recent decades due to drug-resistance occurrence, increased minimum inhibitory concentration (MIC) and cross-resistance among the isolated species. Regarding the lack of effective response to conventional treatments and antifungal susceptibility patterns of the most common isolated Aspergillus species.
Material andMethodIn this study, during 9 months; 20 clinical isolates and 20 environmental strains were studied. In the next stage, drug sensitivity test was done according to the NCCLS-M38P method. A fungal suspension was made with 1-4*104cfu/ml cellular range using 530nm spectrophotometer. Serial dilution of Itraconazol, Voriconazol (0.015-16mg/ml) and Caspofungin (0.007-8mg/ml) were performed and MIC was determined after 48Hr of incubation on 350c.ResultsIn studied strains we did not find any drug resistance gene. MIC range for Aspergillus flavus in Itraconazol was determined as 0.125-2mg/ml which MIC50= 0.5 and MIC90=1mg/ml. also for vericonazol range was 0.25-2mg/ml and MIC50=0.5 and MIC90=1 determined and caspofungin 0.0131-0.125mg/ml and MIC50=0.063 and MIC50 = 0.063 and MIC90 = 0.125.ConclusionAccording to MIC range for Itraconazol, voriconazol and caspofungin , the studied aspergillus flavus strains were drug sensitive; also, we did not find any drug resistance strain.Keywords: Aspergillus flavus, drug sensitivity, Itraconazol, Voriconazol, Caspofungine -
مقدمهکریپتوکوکوزیس یک بیماری قارچی فرصت طلب است. بیشترین فرم آن به صورت ریوی بروز می کند و می تواند به صورت مزمن، تحت حاد و ندرتا حاد بروز نماید. آلودگی های کریپتوکوکوسی عمدتا، در بیماران دارای ضعف سیستم ایمنی ایجاد می شود. این مطالعه به منظور جداسازی کریپتوکوکوس نئوفورمنس واریته گتی از مناطق مختلف ایران انجام شد.مواد و روش هاکشور به سه قسمت شمالی(استان مازندران و گلستان)، مرکزی(در سه استان تهران، اصفهان و شیراز) و جنوبی(دو استان خوزستان و هرمزگان) تقسیم و مناطق کشت اکالیپتوس جهت نمونه برداری تصادفی انتخاب شد. تعداد 495 نمونه از برگ، خاک، گل و نمونه هوای مجاور درخت برداشت و در محیط های کشت پایه سابورودکستروز آگار و سابورودکستروزآگار حاوی کلرامفنیکل کشت داده شدند و محیط های کشت نایجر سید آگار و L کاناوانین گلیسین بروموتیمول آگار به عنوان محیط های تفریقی کریپتوکوکوس نئوفورمنس واریته گتی استفاده شد.
یافته های پژوهش: در مجموع 13 سوش کریپتوکوکوس نئوفورمنس واریته گاتی شناسائی شد. از این تعداد 3 نمونه(5/2 درصد) مربوط به استان خوزستان، 10 نمونه(2/9 درصد) مربوط به استان های مازندران و گلستان و از استان های مرکزی موردی جدا نگردید. 1 مورد از 113 نمونه گل، 3 مورد از 171 نمونه برگ، 4 مورد از 40 نمونه هوا و 5 مورد از 171 نمونه خاک، کریپتوکوکوس نئوفورمنس واریته گتی بود.بحث و نتیجه گیریاختلاف معنی داری در جداسازی کریپتوکوکوس از خاک و هوای اطراف اکالیپتوس مشاهده شد. هم چنین اختلاف معنی دار بین وجود مخمر در نمونه های گیاه و هوا مشاهده شد(P<0.05). مطالعات بیشتری در زمینه شیوع بیماری و عوامل زمینه ساز آن در افراد در ایران پیشنهاد می گردد.کلید واژگان: کریپتوکوکوس نئوفورمنس واریته گتی, جداسازی, ایرانIntroductionCryptococcosis is aopportunistic fungal infection. Current disease form occurs as a pulmonary form and as a chronic, subacute and rarely acute disease. Cryptococcal infections mainly occur in immunocompromised patients. This study was done to isolate Cryptococcusneoformans var. gatti from different regions of Iran.Materials and MethodsIran was divided to 3 regions including north, south and central areas. Areas with Eucalyptus trees are randomly selected covering total regions. In north area (Mazandaran and Golestan provinces), in central area,( Tehran, Esfahan and Fars provinces) and in south area,( Khuzestan and Hormozgan provinces) were selected. 495 samples were collected from leaf, soil, flower and air around the Eucalyptus trees during 6 months and were cultured on Sabouraud dextrose agar (S) and Sabouraud dextrose agar supplemented with chloramphenicol (SC) media. Niger seed agar and l-canavanine glycine bromothymol blue were used as differentiation of Cryptococc-usneoformans var. gatti.
Findings: Total of 13 Cryptococcusneoformans var. gatti were identified which 3 isolates (2.5%) were from Khuzestan province, 10 samples (9.2 %) isolated from Mazandaran and Golestan provinces but no cases were isolated from central area .From total isolates, 1 case from 113 flowers samples, 3 cases from 171 leaves samples, 4 cases from 40 air samples and 5 cases from 171 soil samples, identified as Cryptococcusneoformans var. gatti.
Discussion &ConclusionsA significant difference was observed in isolation of Cryptococcusneoformans var. gatti from soil and air, also asignificant difference was observed between presence of yeast in air and soil samples (PKeywords: Cryptococcus neoformansvar gatii, Isolation, Iran -
Background And ObjectiveAntibiotic resistance rates especially against aminoglycosides in E. coli are rapidly rising. Antibiotic-resistant bacteria such as E. coli released from humans and animals into water sources may act as a donor of antimicrobial resistance genes for other pathogenic E. coli strains. The aim of this study was to investigate the prevalence of antibiotic resistance to aminoglycosides among E. coli strains isolated from different water sources in Alborz province.Materials And MethodsThe study included all E. coli strains isolated from different surface water sources in Alborz province in 2013. Bacterial strains were isolated, detected and identified by standard microbiological and biochemical tests. To screen the aminoglycosid-resistant isolates, the antimicrobial susceptibility testing was determined according to Kirby Baur assay. Susceptibility patterns of isolates were determined to lincomycin, rifampin, streptomycin, gentamicin, tobramycin, kanamycin, clindamycin, amikacin and azithromycin.ResultsOne hundred E. coli strains were isolated from water sources and examined in this study. Antibiotic susceptibility testing showed that 95.7, 94.7, 93.7, 28.1, 27.08, 10.4, 7.4, 6.6 and 4.1 percentages of the isolates were resistant to clindamycin, lincomycin, rifampin, streptomycin, gentamicin, tobramycin, kanamycin, amikacin and azithromycin respectively.ConclusionThis study reflects an increasing prevalence of aminoglycosides resistant E. coli strains circulating in water sources. Dissemination of these resistant strains is of particular concern in water sources.Keywords: Antibiotic resistance, E. coli, Aminoglycoside, water sources
-
زمینه و هدفترایکوفایتون روبروم معمول ترین پاتوژن مولد بیماری درماتوفیتوزیس است. فلوکونازول دارویی از خانواده آزول ها است که جهت درمان تجویز می شود. اخیرا روش های تایپینگ مولکولی برای پاسخ دادن به سوالات اپیدمیولوژیکی و مشکلات عود مجدد بیماری گسترش زیادی یافته اند. این مطالعه روی 22 ایزوله ترایکوفایتون روبروم که به طور اتفاقی از بیماران مبتلا جدا شده بود، انجام گرفت. هدف مطالعه بررسی رابطه الگوی ژنتیکی و حساسیت به داروی فلوکونازول در ایزوله های کلینیکی ترایکوفایتون روبروم بود.روش کارابتدا جنس و گونه قارچ های جداشده از بیماران با روش های ماکروسکوپی و میکروسکوپی تایید گردید. سپس با استفاده از محیط کشت های حاوی مقدار معین دارو مقاومت و حساسیت ایزوله ها نسبت به دارو تعیین شد. در مرحله بعد DNA قارچ ها استخراج گردید و RAPD-PCR (تکثیر تصادفی قطعات پلی مرفیک) با استفاده از 3 پرایمر با توالی تصادفی انجام گرفت.یافته هاهر پرایمر الگوی تکثیریافته متفاوتی را ایجاد کرد و با هر 3 پرایمر تفاوت هایی در الگوی ژنتیکی نمونه های حساس و مقاوم دیده شد ولی هیچ باندی که 100% اختصاصیت را نشان دهد، یافت نشد.نتیجه گیری12 ایزوله حساس که در غلظت 50 میکروگرم در میلی لیتر دارو رشد نکردند، در غلظت های پایینتر دارو نیز رشد آنها به میزان چشمگیری در مقایسه با پلیت شاهد محدود شد. 10 ایزوله مقاوم که در غلظت 50 میکروگرم در میلی لیتر دارو رشد کردند، در غلظت های پایین تر دارو نیز از خود مقاومت نشان دادند. تفاوت هایی در الگوی ژنتیکی نمونه های حساس و مقاوم وجود دارد. آنالیز RAPD جهت تایپینگ مولکولی ایزوله های ترایکوفایتون روبروم کاملا مناسب نشان داد.
کلید واژگان: ترایکوفایتون روبروم, فلوکونازول, RAPD, PCR, تنوع ژنتیکیBackground and ObjectivesTrichophyton rubrum is one of the most common pathogenic causes of dermatophytosis. One of the drugs prescribed for fungal infections is fluconazole which belongs to Azoles group of antifungal agents. Recently molecular typing methods have been developed for answering the epidemiological questions and disease recurrence problems. Current study has been conducted on 22 isolates of Trichophyton rubrum obtained from patients randomly. Our aim was the investigation of correlation between genetic pattern and sensitivity to Fluconazole in clinical isolates of Trichophyton rubrum.MethodsFirstly the genus and species of isolated fungi from patients have been confirmed by macroscopic and microscopic methods. Then, the resistance and sensitivity of isolates against drug have been determined using culture medium containing defined amount of drug. In next step fungal DNA has been extracted by RAPD-PCR (random amplified polymorphic DNA) with random sequences of 3 primers.ResultsEach primer produced different amplified pattern, and differences have been observed in genetic pattern of resistant and sensitive samples using each 3 primers, but there was no bond with 100% specificity.ConclusionThe 12 sensitive isolates which didn’t grow in 50µg/ml concentration of drug, also had limited growth at the lower concentration of drug. Ten resistant isolates which grew in 50µg/ml of drug, also showed resistant to lower concentration of drug. There are differences in genetic pattern of resistant and sensitive samples. RAPD analysis for molecular typing of Trichophyton rubrum seems to be completely suitable.Keywords: Trichophyton rubrum, Fluconazole, RAPD, PCR, Genetic Diversity -
زمینه و هدفامروزه استفاده از پروبیوتیک ها در پیشگیری و درمان بیماری های سیستم ایمنی، از طریق افزایش جذب فاکتورهای محافظتی، مورد توجه پژوهشگران قرار گرفته است. از این رو هدف از انجام این مطالعه بررسی اثر باکتری های پروبیوتیک (لاکتوباسیلوس پلانتاروم 299 وی و بیفیدوباکتریا بی94) بر سطح سرمیFe+2، ویتامین D3، به دنبال دمیلیناسیون ناشی از اتیدیوم بروماید در هیپوکمپ موش های صحرایی بود.روش کاردر این تحقیق تعداد 40 سر موش صحرایی نر نژاد ویستار به وزن 250-200 گرم در 4 گروه 10 تایی شامل کنترل (سالین)، آسیب با اتیدیوم بروماید، گروه های درمانی پروبیوتیک لاکتوباسیلوس پلانتاروم 299 وی و پروبیوتیک بیفیدوباکتریابی94 قرار گرفتند. در گروه آسیب و درمان جهت القا دمیلیناسیون از تزریق مستقیم و تک دوز 3 میکرولیتر اتیدیوم بروماید در هیپوکمپ موش ها استفاده شد همچنین در گروه کنترل از سالین به عنوان حلال اتیدیوم بروماید به همان میزان استفاده شد. پس از القا دمیلیناسیون در گروه های درمانی، به میزان 108×5/1 باکتری پروبیوتیک به مدت 28 روز به صورت گاواژ تجویز شد.یافته هانتایج این مطالعه نشان داد که میزان آهن در گروه درمان با لاکتوباسیلوس پلانتاروم 299 وی و میزان ویتامینD3 سرم در هر دو گروه درمان افزایش نشان داد. همچنین میزان آهن در گروه درمان با بیفید وباکتریا بی94 کاهش نشان داد، هرچند که این افزایش و کاهش معنی دار نبود.نتیجه گیریپروبیوتیک ها برای پیشگیری و درمان بیماری ها و از جمله بیماری شایع ام اس(MS) به کار می روند. در مطالعات قبلی نقش موثرFe+2، ویتامینD3 در بهبود بیماری MS گزارش شده است. علیرغم اینکه یافته های معنی داری در این تحقیق حاصل نشد، اما این یافته ها مطالعات قبلی در رابطه با توصیه مصرف پروبیوتیک را تا اندازه ای مورد تایید قرار داد. شاید دلیل چنین یافته ای تفاوت در نوع، تعداد و مدت زمان مصرف پروبیوتیک در مقایسه با سایر مطالعات باشد.
کلید واژگان: پروبیوتیک, دمیلیناسیون, اتیدیوم بروماید, Fe+2, ویتامین D3BackgroundRecently, using probiotics for preventing and treating the immune system diseases via increasing the absorption of protective factors has attracted the attention of researchers. The aim of the present study was to evaluate the effect of probiotic bacteria, Lactobacillus plantarum 299v and Bifidobacteria B94, on serum Fe +2 and vitamin D3 levels following ethidium bromide - induced demyelination of rat hippocampus.MethodsIn this study, 40 male Wistar rats were divided into four groups, including control, damaged with ethidium bromide, lactobacillus plantarum 299v, and bifidobacterium B94 treatment groups. In damage and treatment groups, a single dose of 3 μl ethidium bromide was directly injected for inducing demyelination in the hippocampus of rats. Also, in control group, the same amount of saline was used. After the induction of demyelination in treatment groups,1/5×108 probiotic bacteria were administered by gavage for 28 days.ResultsResults showed increased levels of Fe +2 in the treatment group with lactobacillus plantarum and that of vitamin D3 in both treatment groups. The level of serum Fe +2 in the treatment group with Bifidobacteria B94 decreased, although this increase and decrease were not significant.ConclusionAlthough the findings in this study were not significant, but, somehow were in agreement with the findings of previous studies that suggested effects of probiotics. Perhaps the reason for such result is a difference in the type, number and duration of probiotics use compared with other studies.Keywords: Probiotics, Demyelination, Ethidium bromide, Fe +2, Vitamin D3 -
مقدمهکاندیدا آلبیکنس در 65 درصد از افراد سالم بدون علایم بالینی جدا شده است. دهانشویه ها برای بسیاری از اهداف پیشگیرانه و درمانی استفاده می شوند. مطالعه حاضر با هدف بررسی تاثیر دهانشویه های ایرانی و خارجی بر کاندیدا آلبیکنس به عنوان فلور قارچی رایج در دهان انجام شد.مواد و روش هادر این مطالعه، ازسوش استاندارد کاندیدا آلبیکنس 10231 ATCC استفاده شد. سپس از کشت تازه کاندیدا آلبیکنس (24 ساعته)، سوسپانسیون تهیه و OD آن در 530 نانومتر خوانده شد. سوسپانسیونکاندیدا آلبیکنس در محیط سابوروددکستروزآگارکشت داده شد. سپس، دو چاهک در محیط کشت ایجاد، در داخل آن ها دهانشویه ریخته (100 میکرولیتر) و در دمای 37 درجه سانتی گراد به مدت24 ساعت انکوبه شد. سپس، هاله عدم رشد اندازه گیری شد. حداقل غلظت مهارکنندگی رشد (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MFC) دهانشویه ها نیز مشخص شد. داده ها با استفاده از نرم افزار آماری SPSS، آزمون های آماری T مستقل و تحلیل واریانس یک طرفه بررسی شد.نتایجنتایج مربوط به روش آگار دیفیوژن، MIC و MFC، اختلاف معناداری بین اثرات ضد قارچی دهانشویه های ایرانی و خارجی نشان ندادند (P value>0.05).بحث و نتیجه گیریاین مطالعه نشان داد که هر دو دهانشویه ایرانی و خارجی اثر خوبی دربرابر کاندیدا آلبیکنس به عنوان فلور قارچی شایع در دهان داشتند.کلید واژگان: کاندیدا آلبیکنس, فلور قارچی, دهانشویهIntroductionCandida albicans has been isolated in up to 65% of healthy individuals without signs of clinical disease. Mouthwashes can be used for many preventative and therapeutic purposes. This study evaluates the effectiveness of Iranian and foreign mouthwashes against C.albicans as a common fungal flora in the mouth.Materials And MethodsIn this research, standard strain of C.albicans, ATCC 10231 is used. The suspension is provided by a fresh culture of C.albicans (24 hours) and the OD is read in 530 nm. The C. albicans suspension was cultured on Sabouraud dextrose agar plate. In the next step, two wells created on SDA, filling with mouthwashes (100 µl). After incubation at 37ºC for 24 hours, the inhibition zone was measured. Minimum inhibitory concentration (MIC) and Minimum fungicidal concentration (MFC) of mouthwashes were determined. The data are analyzed by SPSS software, independent T-tests and one sided variance analysis (ANOVA-one way).ResultsFindings of our study showed in which agar diffusion, MIC and MFC tests, there are no significant differences between the antifungal effect of the Iranian and foreign mouthwashes on C.albicans (P value>0.05). Discussion andConclusionThis study shows that both Iranian and foreign mouthwashes have a good effect against C.albicans, as a common fungal flora in the mouth.Keywords: Candida albicans, Fungal flora, Mouthwash
-
سابقه و هدفدر پژوهش های مختلف نشان داده شده است که قارچ ها می توانند در افراد مستعد منجر به شکل گیری آسم آلرژیک شوند. از مهمترین قارچ های آلرژی زای شایع، می توان به آلترناریا، آسپرژیلوس ها و پنیسیلینیوم ها اشاره نمود. این مطالعه با هدف شناسایی و بررسی الگوی فراوانی باندهای آلرژی زا در قارچ های آلترناریا آلترناتا، آسپرژیلوس فومیگاتوس و پنیسیلیوم سیترینوم و همچنین مقایسه بین آنها انجام شد.مواد و روش هااین پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی بر روی 48 بیمار مبتلا به آسم و 22 فرد سالم به عنوان کنترل انجام شد. در ابتدا قارچ ها کشت داده شده و عصاره سلولی آنها به روش انجماد و ذوب به دست آمد. اجزای پروتیینی با روش SDS-PAGE جداسازی شده و پس از انتقال به کاغذ نیتروسلولز، ایمونوبلاتینگ بر علیه سرم بیماران آسمی و گروه کنترل انجام شد.یافته هاپس از انجام ایمونوبلاتینگ برای آلترناریا آلترناتا 6 باند آلرژی زای 49 تا 115 کیلودالتونی، برای آسپرژیلوس فومیگاتوس 4 باند آلرژی زای 57 تا 112 کیلودالتونی و برای پنیسیلیوم سیترینوم نیز 5 باند 37 تا 127 کیلودالتونی شناسایی گردید.نتیجه گیریدر بین قارچ های مورد بررسی، آلترناریا آلترناتا بیشترین باندهای آلرژی زا را داشت. به نظر می رسد باندهای دارای وزن مولکولی بالاتر، توانایی بیشتری را در تحریک اختصاصی IgE داشته باشند.کلید واژگان: آسم, آلترناریا آلترناتا, آسپرژیلوس فومیگاتوس, پنیسیلیوم سیترینوم, ایمونوبلاتینگ-IgEBackground &ObjectivesSeveral studies have shown that fungi can cause allergenic asthma in the susceptible persons. Among these fungi, Alternaria, Penicillium and Aspergillus species are more common in this cases. This study was performed to detect and to compare allergenic bands in A.alternata, P.citrinum and A.fumigatus. Materials &MethodsThis cross-sectional study was performed on 48 patients afflicted to asthma and 22 healthy controls. The fungi were grown and their extract crude were obtained using the liquid nitrogen. The protein fractions were isolated by SDS-PAGE and after electrotransfering and transfer of the bands into the nitrocellulose membrane, the proteins were used for immunoblotting against the sera obtained from patients and controls.ResultsBased on the immunobloting test, 6 protein allergenic bands for A. alternata (49-115 kDa), 4 protein bands for A. fumigatus (57-112 kDa) and 5 protein bands for P. citrinum (37-127 kDa) are detected in these samples.ConclusionThe highest amount of allergic band belonged to A. alternate. The bands with higher molecular weights were more effective in stimulation of IgE.Keywords: Asthma, Alternaria alternata, Aspergillus fumigatus, Penicillium citrinum, IgE-immunoblotting
-
زمینه و هدفترایکوفایتون روبروم معمول ترین پاتوژن مولد بیماری درماتوفیتوزیس است. یکی از داروهایی که به طور وسیعی جهت درمان تجویز می شود، تربینافین از گروه آلیل آمین ها می باشد. اخیرا روش های تایپینگ مولکولی برای پاسخ دادن به سوالات اپیدمیولوژیکی و مشکلات عود مجدد بیماری گسترش زیادی یافته اند. این مطالعه روی 22 ایزوله ترایکوفایتون روبروم که به طور اتفاقی از بیماران مبتلا جدا شده بود، انجام گرفت. هدف مطالعه بررسی رابطه الگوی ژنتیکی و حساسیت به داروی تربینافین در ایزوله های کلینیکی ترایکوفایتون روبروم بود.روش کارابتدا جنس و گونه قارچهای جداشده از بیماران با روش های ماکروسکوپی و میکروسکوپی تایید گردید. سپس با استفاده از محیط کشت های حاوی مقدار معین دارو مقاومت و حساسیت ایزوله ها نسبت به دارو تعیین شد.در مرحله بعد DNA قارچ ها استخراج گردید و RAPD-PCR (تکثیر تصادفی قطعات پلی مرفیک) با استفاده از 3 پرایمر با توالی تصادفی انجام گرفت.یافته هاهر پرایمر الگوی تکثیریافته متفاوتی را ایجاد کرد و با هر 3 پرایمر تفاوتهایی در الگوی ژنتیکی نمونه های حساس و مقاوم دیده شد ولی هیچ باندی که 100% اختصاصیت را نشان دهد یافت نشد.نتیجه گیری12ایزوله حساس که در غلظت 1/0 میکروگرم در میلی لیتر دارو رشد نکردند،در غلظت های پایین تر دارو نیز رشد آن ها به میزان چشمگیری در مقایسه با پلیت شاهد محدود شد.10 ایزوله مقاوم که در غلظت 1/0میکروگرم در میلی لیتر دارو رشد کردند، در غلظت های پایین تر دارو نیز از خود مقاومت نشان دادند.
آنالیز RAPD جهت تایپینگ مولکولی ایزوله های ترایکوفایتون روبروم کاملا مناسب نشان داد.
کلید واژگان: ترایکوفایتون روبروم, تربینافین, RAPD, PCR, تنوع ژنتیکیBackground and ObjectivesTrichophyton rubrum is one of the most common pathogeniccause of dermatophytosis. One of the medicines which has been prescribed widely for fungal infections is terbinafine which belongs to allylamines group of antifungal agents. Recently molecular typing methods have been developed for answering the epidemiological questions and disease recurrence problems. Current study has been conducted on 22 isolates of Trichophyton rubrum obtained from patients randomly. Our aim was the investigation of correlation between genetic pattern and sensitivity to Terbinafine in clinical isolates of Trichophyton rubrum.MethodsFirstly the genus and species of isolated fungi from patients have been confirmed by macroscopic and microscopic methods, then, the resistance and sensitivity of isolates against medicine have been determined using culture medium containing defined amount of medicine. In next step fungal DNA has been extracted by RAPD-PCR (random amplified polymorphic DNA) with random sequences of 3 primers.ResultsEach primer produced different amplified pattern, and using each 3 primers differences have been observed in genetic pattern of resistant and sensitive samples using each 3 primers, but there was no bond with 100% specificity.ConclusionThe 12 sensitive isolates which didn’t grow in 0.1 mg concentration of medicine, also had limited growth at the low concentration of medicine..Ten resistant isolates which grew in 0.1mg/ml of medicine, in lower concentration of medicine were resisted. RAPD analysis for molecular typing of Trichophyton rubrum seems to be completely suitable.Keywords: Trichophyton rubrum, Terbinafine, RAPD, PCR, Genetic Diversity -
Background And ObjectiveBrucellosis is a zoonosis transmittable to humans poses a significant public health problem in many developing countries and requires rapid and accurate diagnostic methods. Here, our aim was to develop a diagnostic polymerase chain reaction (PCR) assay in artificially contaminated serum samples as a model for rapid and accurate laboratory confirmation of human brucellosis.Material And MethodsIn this study, initially the standard Brucella abortus strain (2308) were cultured on Brucella agar medium and then colonies were inactivated by formalin 10 %. Genomic DNA was extracted from inactivated bacterial colonies. Serial dilutions of bacterial-DNA were prepared in fetal bovine serum (FBS) and water and subsequently DNA extraction were repeated on these artificially contaminated samples. The two pairs of primers amplified two different fragments included in: a gene encoding an outer membrane protein (omp-2) (primers JPF/JPR) and a sequence 16S rRNA of B. abortus (primers F4/R2).ResultsThe two primers assayed showed a difference in sensitivity for detecting Brucella DNA, ranging between 5 pg and 50 pg for artificially contaminated serum samples and 50Fg and 5 pg for contaminated control samples. Therefore, the sensitivity of PCR using F4/R2 primers was greater than the PCR using JPF/JPR primers.ConclusionAlthough the sensitivity of PCR using these primers was affected by serum inhibitors, they are still the most sensitive and they could provide a useful tool for the diagnosis of human brucellosis.Keywords: Brucellosis, Optimization, PCR, Omp, 2
-
سابقه و هدفسالمونلا یکی از مهم ترین عوامل ایجاد کننده مسمومیت های غذایی در انسان است. استفاده از روش های استاندارد کشت برای تشخیص و جداسازی سالمونلا و نیز ارزیابی خصوصیات باکتری از طریق آزمون های بیوشیمیایی و سرولوژی به صرف 4 تا 7 روز زمان، دقت و مهارت کاربر و کیفیت محیط های کشت نیازمند است. این مطالعه با هدف ارزیابی روش مولکولی PCR برای ردیابی سریع سالمونلا در نمونه های گوشت جوجه کباب و مقایسه کیفیت آن با دو روش الایزا و کشت استاندارد انجام شد.مواد و روش هااین پژوهش به صورت مقطعی - توصیفی بر روی60 نمونه جوجه کباب جمع آوری شده از فروشگاه های سطح شهر تهران انجام شد. فراوانی سالمونلا در این نمونه ها با استفاده از سه روش میکروبیولوژی (کشت و آزمون های بیوشیمیایی)، الایزا (کیت SAL-VIA96, TECRA) و PCR (تکثیر ژن invA) مورد بررسی قرار گرفت. همچنین دقت، حساسیت و ویژگی سه روش با یکدیگر مقایسه گردیدند.یافته هااز مجموع نمونه های مورد بررسی فراوانی سالمونلا بر اساس سه روش کشت، الایزا و PCR به ترتیب 55%، 47% و 65% بود. نتایج نشان داد که با استفاده از روش PCR و پرایمرهای invA تنها با یک مرحله غنی سازی اولیه 20ساعته در محیط BPW می توان در مدت 24 تا 30 ساعت با حساسیت و ویژگی 100% وجود سالمونلا را در نمونه غذایی مشخص نمود.نتیجه گیرینتایج این پژوهش نشان داد که تکنیک PCR کفایت و حساسیت لازم به منظور پایش سریع سالمونلا را دارد. از این رو استفاده از این روش برای ارزیابی وجود سالمونلا در مواد غذایی پیشنهاد می گردد.کلید واژگان: سالمونلا, الایزا, واکنش زنجیره ای پلی مراز, invA
-
سابقه و هدفبیماری های ناشی از مواد غذایی یکی از مهم ترین مشکلات دنیای امروزی بوده و به دلیل مصرف آب یا غذاهای آلوده در انسان بروز می نمایند. با توجه با اینکه در حال حاضر گونه های سالمونلا رایج ترین نوع مسمومیت غذایی می باشند. هدف از این مطالعه، تعیین شیوع سروتیپ های سالمونلا در مواد غذایی به روش Multiplex PCR می باشدروش بررسیاین مطالعه توصیفی بر روی 170 نمونه مواد غذایی اعم از گوشت گاو، گوشت مرغ، تخم مرغ، شیر و سس مایونز انجام شد و پس از جمع آوری نمونه های مورد نظر، مراحل تشخیص برای باکتری و روش PCR انجام شد. با استفاده از آزمون های کای دو و فیشر نمونه ها مورد قضاوت آماری قرار گرفتند.
یافته هاشیوع آلودگی باکتریال در 7/24 درصد نمونه های مواد غذایی وجود داشت. با توجه به این شیوع در نمونه های مورد بررسی، میزان واقعی آن با اطمینان 95% از حداقل 2/18 درصد تا 2/31 درصد برآورد می گردد. آلودگی گوشت گاو به سالمونلا، 8/8 درصد برآورد شد. از کل نمونه های مواد غذایی، 7/1% آلودگی به باکتری سالمونلا مشاهده شد که 1/1% آن مربوط به سالمونلا تیفی موریوم و 59/.% مربوط به سالمونلا اینتریتیدیس از گوشت گاو بود.
نتیجه گیریبه نظر می رسد که آلودگی سالمونلا در مواد غذایی بالا بوده و باید توجه بیشتری گردد. روش های تشخیصی مولکولی مانند Multiplex PCR احتمالادر کنار کشت و سایر روش های باکتری شناسی می تواند در تایید تشخیص کمک کننده باشد.
کلید واژگان: مواد غذایی, گونه های سالمونلا, Multiplex PCRBackgroundFood-borne illnesses are one of the main problems due to contaminated food or water that can occur in humans. Since salmonella species is one of the most common causes of food poisoning, the purpose of this study was to define the prevalence of serotypes of Salmonella species, in foods by multiplex PCR.MethodsThis Cross-Sectional study was done on 170 samples of food products viz. healthy milk, beef, poultry and salad dressings. After collecting the samples, identification procedures for bacteria were performed by the PCR method.ResultsBacterial contamination was found in 24.7% of sample; 8.8% of beef samples were contaminated with Salmonella. On the whole, from all tested food samples, 1.7% were contaminated with Salmonella: 1.1% with typhimurium and 0.59% with Salmonella enteritidis.ConclusionIt seems Salmonella contamination in meat is high. Multiplex PCR may be helpful in diagnostic confirmation.Keywords: Food products, Salmonella Spp, Multiplex PCR -
زمینه و هدفمطالعات نشان داده است که باکتری های پروبیوتیک نقش مفیدی در سلامت جانوران ایفاء می کنند. باکتری های پروبیوتیک می توانند باعث جلوگیری از رشد پاتوژن ها در دستگاه گوارش، بهبود مصرف چربی ها و تقویت سیستم ایمنی شوند. در تحقیق حاضر گونه های انتروکوکوس از نمونه پنیر محلی ایران جداسازی گردیده و فعالیت پروبیوتیکی آنها مانند اثر بر سطح چربی ها، گلوکز و سایتوکاین های (IL-6، IL-10، IL-2) بررسی گردید.روش کارنمونه پنیر محلی از استان اردبیل تهیه گردید. انتروکوک های موجود در پنیر محلی بواسطه محیط کشت های انتخابی جداسازی گردیده و با استفاده از تست های تخمیر قند شناسایی شدند. اثرات بازدارنگی انتروکوک های جداسازی شده بروش کشت چاهکی بر روی سودوموناس ائروژینوزا و پاتوژن های دستگاه گوارش شامل شیگلا دیسانتری، اشریشیاکلی، سالمونلا تیفی موریوم بررسی گردید. برای مطالعه اثرات پروبیوتیکی انتروکوک های جداسازی شده در جانوران زنده، موش های سوری نژاد NMRI به گروه های مختلف تقسیم شده و به مدت دو هفته دوزهای مختلف انتروکوک های جداسازی شده را در رقت های معادل کدورت های 2 (CFU/mL 9 x 108) 3 (CFU/mL 6 x 108) و 4 (CFU/mL 12 x 108) مک فارلند به حجم 1 میلی لیتر به ازای هر موش بصورت دهانی (گاواژ) دریافت کردند. پس از دو هفته تیمار مداوم سطح کلسترول، تری گلیسیرید، LDL و HDL به روش طیف سنجی و با استفاده از اسپکتروفتومتر و سطح اینترلوکین های 2، 6 و 10 سرم به روش الیزا اندازه گیری شد.یافته هانتایج حاصل از پژوهش حاضر نشان می دهد که تیمار با گونه فاسیوم باعث کاهش سطح کلسترول خون و افزایش سطح اینترلوکین 10 در سرم موش ها می گردد اما اثر معنی داری بر سطح گلوکز، تری گلیسریدها و اینترلوکین های 2 و 6 ندارد (05/0 > p). تیمار با گونه فکالیس تغییر معنی داری در سطح، گلوکز و چربی های خون بجود نمی آورد ولی باعث افزایش معنی داری در سطح اینترلوکین های 6 و 10 سرم می شود (05/0 > p). نتایج بدست آمده همچنین نشان می دهد که هیچکدام از گونه های مذکور اثر معنی داری بر روی رشد پاتوژن های روده نداشتند.نتیجه گیرینتایج این مطالعه بیانگر آن است که تیمار مداوم با گونه فاسیوم باعث کاهش کلسترول سرم در موش ها می شود. همچنین تیمار مداوم با هر دو گونه می تواند با تاثیر برالگوی سایتوکائنی، فعالیت سیستم ایمنی را تغییر دهد.
Background and ObjectivesPrevious studies demonstrated that selected probiotic bacteria elicit beneficial effects in animals. Probiotic bacteria inhibit pathogens growth in the gut, improve lipid metabolism and activate immune system of animals. In the present study Enterococcus spp were isolated from Iranian traditional cheese and their effects on intestine pathogens (Shigella dysenteriae, Escherichia coli and Salmonella Typhimurium) growth, serum lipids level and activation of immune systems in mice were studied.MethodsIranian cheese samples were collected from Ardabil province. Enterococci spp were isolated using selective culture mediums and identified using API kites. Inhibitory effects of isolated Enterococci on growth of Pseudomonas aeruginosa and intestine pathogens (Shigella dysenteriae, Escherichia coli and Salmonella typhimurium) were tested using agar well method. In order to study probiotic activities of isolated bacteria in live animals, NMRI mice were divided into different groups and Enterococci was administrated orally (1 ML/mouse) with doses equal to 2 (6×108 cfu/ml) 3 (9×108 cfu/ml) and 4 (12×108 cfu/ml) MacFarland standard for 2 weeks. After two weeks continues treatment, blood samples were collected from retroorbital sinus and serum levels of cholesterol, triglycerides, LDL and HDL measured using enzymatic method. Interleukins (IL-2, IL-6 and IL-10) levels were measured using ELISA kites.ResultsResults of this study demonstrated that treatment with faecium species decreases serum cholesterol and increases serum IL-10 level, while it has not showed significant effects on serum levels of glucose, triglycerides, IL-2 and IL-6 (p< 0.05). Administration of faecalis species have no significant effects on lipid levels of serum (p< 0.05). Moreover, results revealed that treatment with faecalis species increased IL-6 and IL-10 (p< 0.05). None of the species affected pathogens growth significantly (p< 0.05).ConclusionThe results obtained from current study demonstrate that continues treatment with both species can affect immune functions of animal by altering the cytokines profile and treatment with faecium species decreases serum level of cholesterol. -
بر اساس گزارش سازمان بهداشت جهانی ایجاد و شیوع سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک ها در بسیاری از کشورها یک مشکل رو به افزایش می باشد. تلاش های زیادی برای کشف ضد میکروب های جدید از منابع مختلفی مانند میکروارگانیسم ها، حیوانات و گیاهان صورت گرفته است. یکی از این منابع طب سنتی می باشد که بررسی های صورت گرفته در آن منجر به کشف مواد موثره جدیدی گردیده است. افدرا ماژور گیاهی طبی با فعالیت های مختلف فیزیولوژیک است. گیاه از منطقه کرج جمع آوری گردید و عصاره گیری با استفاده از حلالهای آبی، اتانولی، استنی و متانولی صورت گرفت. عصاره ها در دمای 60 درجه سیلیسیوس در خلاء تغلیظ گردیدند. فعالیت ضد باکتریایی عصاره ها با روش های انتشار در ژل، MIC و MBC در باکتری های استافیلوکوکوس اورئوس (ATCC6538)، سودوموناس آئروژینوزا(ATCC27853)استرپتوکوکوس پیوژنز (PTCC 1447)و اشریشیا کولای(ATCC 8739) سنجیده شد. اشریشیا کولای فقط به عصاره استنی حساسیت نشان داد و سودوموناس ائروژینوزا به عصاره آبی مقام بود و به سایر عصاره ها حساسیت نشان داد. استرپتوکوکوس پیوژنز و استافیلوکوک اورئوس به کلیه عصاره ها حساس بودند.کلید واژگان: هوم, عصاره گیاهی, ترکیبات ضد باکتریایی, گیاهان دارویی, ریش بزAccording to WHO reports increase of antibacterial resistance is a growing problem in many countries. Many efforts have been made to discover new antimicrobial compounds from various kinds of sources such as micro-organisms, animals, and plants. One of such resources is folk medicines. Systematic screening of them may result in the discovery of novel effective compounds. This study was undertaken to evaluate the growth inhibitory activity of Ephedra major Host, an important medicinal plant with various biological activities, against pathogenic Bacteria involved in common infection.Plant collection was made from district west Tehran, Iran. Extracts were obtained from arial part of plant using ethanol, acetone, methanol and water. Extract was evaporated under vacuum at 60° C. Antibacterial activities of extracts were determined by In Vitro bioassays using agar diffusion-method, MIC and MBC against standard strains of Staphylococcus aureus (ATCC 6538), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853), Streptococcus pyogenes (PTCC 1447) and E. coli (ATCC 8739). E. coli exhibit sensitive only to acetone extract, Pseudomonas aeruginosa was resistance to water extract. Staphylococcus aureus and Streptococcus pyogenes were sensitive to all tested extracts.Keywords: Antibiotics, Folk medicene, Ma hung, Palnt exctract, phytomedicen
-
هدفتفکیک گونه های مختلف پنی سیلیوم بر اساس باندهای پروتئینی.روشدراین مطالعه جهت مقایسه آنتی ژن های پروتئینی جدایه های پنی سیلیوم، از 4 گونه پنی سیلیوم سیترینوم، پنی سیلیوم اگزالیکوم، پنی سیلیوم نوتاتوم و پنی سیلیوم فرکوئنتس جدا شده از هوای ایران استفاده گردید (30 جدایه پنی سیلیوم). ابتدا این قارچ ها برروی محیط سابورودکستروز آگار کشت داده شده و سپس بر روی محیط چاپکس آگارپاساژ داده شد و در دمای 30 درجه سانتیگراد به مدت 72-48 ساعت نگهداری شدند. سپس برای تهیه عصاره پروتئینی قارچ های فوق در محیط سابوروروی مایع کشت داده شده و از روش برادفورد (Braud ford Method) برای اندازه گیری میزان پروتئین استفاده شد. با استفاده از روش پلی اکریل آمیدژل الکتروفورزیس (SDS-PAGE) با ژل جدا کننده 10 درصد تفکیک پروتئین ها صورت گرفت. برای رنگ آمیزی ژل، ازکوماسی بلو G250 استفاده شد که بعد از ثابت نمودن، رنگ آمیزی و رنگ زدایی ژل، باندهای مختلفی ظاهر شدند.نتایجبر این اساس 34 باند پروتئین با اوزان موکوسی 19.5، 24، 26، 27، 5/28، 32، 36، 39، 45، 48، 50، 52، 53، 55، 56.5،. 59.5، 63، 65،. 66.5، 68، 76، 84، 88، 90، 92، 93، 94، 95، 97، 107، 116، 123، 128 و 158 کیلو دالتون مشاهده شد. که باندهای 19.5-24، 28.5-45-52، 53-56.5، 59.5-76-84 و 97 کیلو دالتون باندهایی هستند که در تمام گونه ها حضور داشته، یعنی در تمام 30 جدایه تحت مطالعه این باندها دیده شده اند.نتیجه گیریبر اساس نتایج به دست آمده در این رابطه مشخص گردید که تفاوت هایی بین گونه و داخل گونه وجود دارد ولی اختلاف معنی داری در الگوی پروتئینی جدایه های تحت مطالعه مشاهده نگردید.
کلید واژگان: پنی سیلیوم, پروتئین, SDS-PAGE
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.