فهرست مطالب مجتبی انوری نژاد
-
مجله طب جنوب، سال هجدهم شماره 6 (بهمن و اسفند 1394)، صص 1198 -1207مقدمهپسودوموناس آئروژینوزا از عوامل اصلی ایجاد کننده عفونت در بیماران سوختگی می باشد که زندگی بسیاری از این بیماران را تهدید می کند. هدف از مطالعه حاضر تشخیص و ردیابی منبع عفونت با استفاده از دو روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (AP-PCR) و الگوی پلاسمیدی می باشد.مواد و روش هاهفتاد و چهار سویه پسودوموناس از بیماران دچار سوختگی و محیط بیمارستان در بیمارستان قطب الدین شیراز جدا شدند. تیپ بندی ملکولی سویه ها توسط دو روش ذکر شده انجام گردید. سپس ایزوله ها توسط دندروگرام دسته بندی و درصد تشابه آن ها با استفاده از برنامه NTSYS و Photo Capt مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.یافته هابر اساس درصد تشابه 50 درصد و 7/ 64 درصد و 5/ 67 درصد به دست آمده به وسیله دندروگرام، 38 الگوی پلاسمیدی تشخیص داده شد که به ترتیب در خوشه های2، 3 و 5 طبقه بندی گردیدند. دندروگرام محصولات AP-PCR به 47 تیپ مختلف تقسیم بندی شد.نتیجه گیریاین نتایج نشان می دهد که در طول بستری بیماران سوختگی، تیپ های خاصی از پسودوموناس آئروژینوزا در محیط بخش سوختگی بیمارستان شایع هستند و بیماران را درگیر می کنند. برای کنترل آلودگی زخم های بیمار با گونه های مقاوم به آنتی بیوتیک، بایستی محیط حمام را پس از شستشوی محل سوختگی بیماران با مواد ضدعفونی کننده قوی گندزدایی کرد.
کلید واژگان: پسودوموناس آئروژینوزا, الگوی پلاسمید, منبع عفونت, AP, PCR}Iranian South Medical Journal, Volume:18 Issue: 6, 2016, PP 1198 -1207BackgroundPseudomonas aeruginosa is one of the main etiological agents in burn infections which could be life threatening for the infected patients. The aim of the present study was to identify and track source of infections using two molecular typing methods.Materials And MethodsSeventy-four strains of P. aeruginosa were isolated from burn patients and hospital environment in Ghotbadden Burn Hospital, Shiraz, Iran. Isolates were typed by arbitrary primed-polymerase chain reaction (AP-PCR) and plasmid profiling. Similarity and clustering of the strains was assessed using NTSYS-PC software and photo Capt Mw program.ResultsThirty eight plasmid profiles were obtained and classified them into: 2, 3and 5 clusters, based on 50%, 64.7% and 67.5% similarity on the plotted dendrogram, respectively. Drawn dendrogarm categorized AP-PCR products to 47 different types.ConclusionBased on these results, a limited number of P. aeruginosa types are predominant in the hospitals which infect the burn patients. To control of the infections in patients with antibiotics, resistant isolates, strong disinfection of patients’ bathroom after scrubbing of patients wounds, should be implemented.Keywords: Pseudomonas aeruginosa, Plasmid typing, Source of infections, AP, PCR} -
زمینه و هدفظهور باکتری های غیرتخمیرکننده مقاوم به چنددارو تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs)، هم اکنون به عنوان یک مشکل عمده در بیماران بستری مطرح است. هدف این مطالعه، بررسی گسترش باکتری های غیرتخمیرکننده مقاوم به چنددارو تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs) جداشده از خون بیماران، با استفاده از سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 در شیراز (ایران) بود.
روش تحقیق: در این مطالعه مقطعی، 4825 نمونه خون از بیماران مشکوک به باکتریمی بستری در بیمارستان های شهر شیراز گرفته شد و وارد شیشه های محیط کشت خون سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 گردید. با استفاده از تست های بیوشیمیایی تعبیه شده در سیستم API 20E اختصاصی، باکتری های غیرتخمیرکننده، مورد شناسایی نهایی قرار گرفتند. تست حساسیت آنتی بیوتیکی و شناسایی سویه های تولیدکننده ESBL، با استفاده از تست فنوتیپی DDST بر اساس پروتکل(CLSI(2014 انجام پذیرفت.یافته هااز کل 4825 نمونه خون جمع آوری شده، 1145 کشت خون (24درصد)، توسط سیستم BACTEC از نظر رشد میکروارگانیسم مثبت تشخیص داده شدند. از بین تمام ارگانیسم های جداشده از کشت های خون مثبت، 206 ارگانیسم، باکتری های گرم منفی غیرتخمیر کننده بودند. شایع ترین باکتری های غیرتخمیر کننده جداشده به ترتیب: پسودوموناس (48%)، اسینتوباکتر (7/ 41%) و استنوتروفوموناس (2/ 8%) بودند. در ایزوله های اسینتوباکتر، تولید ESBL در 70 ایزوله (4/ 81%) مشاهده شد. در بین آنتی بیوتیک های کلاس بتالاکتام، ایزوله های پسودوموناس، بهترین حساسیت را به پیپراسیلین-تازوباکتام (5/ 46%) نشان دادند.نتیجه گیریبتالاکتام ها بر روی 40% عفونت های ناشی از پسودوموناس و 78% عفونت های اسینتوباکتر اثر ندارند. ظهور سویه های با مقاومت های چنددارویی، یک مشکل بزرگ سلامت ملی در ایران است که باید مورد توجه بیشتر قرار گیرد.
کلید واژگان: عفونت گردش خون, باکتری های غیرتخمیرکننده, مقاومت آنتی بیوتیکی, ESBL}Background And AimThe emergence of nonfermenter bacteria that are resistant to multidrug resistant ESBL are nowadays a principal problem for hospitalized patients. The present study aimed at surveying the emergence of nonfermenter bacteria resistant to multi-drug ESBL producing isolated from patients blood samples using BACTEC 9240 automatic system in Shiraz.Materials And MethodsIn this cross-sectional study, 4825 blood specimens were collected from hospitalized patients in Shiraz (Iran), and positive samples were detected by means of BACTEC 9240 automatic system. The isolates containing nonfermenter bacteria were identified based on biochemical tests embedded in the API-20E system. Antibiotic sensitivity test was performed and identification of ESBL producing strains were done using phenotypic detection of extended spectrum beta-lactamase producing isolates(DDST) according to CLSI(2013) guidelines.ResultsOut of 4825 blood samples, 1145 (24%) specimen were gram-positive using BACTEC system. Among all isolated microorganisms, 206 isolates were non-fermenting gram- negative bacteria. The most common non-fermenter isolates were Pseudomonas spp. (48%), Acinetobacter spp. (41.7%), and Stenotrophomonas spp. (8.2%). Seventy of them (81.4%) were Acinetobacter spp. which were ESBL positive. Among β-lactam antibiotics, Pseudomonas spp. showed the best sensitivity to piperacillin-tazobactam (46.5%).ConclusionIt was found that β-lactam antibiotics are not effective against more than 40% of Pseudomonas spp. infections and 78% Acinetobacter infections. Emergence of multi-drug resistant strains that are resistant to most antibiotic classes is a major public health problem in Iran. To resolve this problem using of practical guidelines is critical.Keywords: Blood stream infection, Nonfermenter bacteria, Antibiotic resistance, ESBL} -
مجله طب جنوب، سال هجدهم شماره 5 (آذر و دی 1394)، صص 970 -981زمینهظهور سویه هایی که تولید آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs) می کنند در خانواده انتروباکتریاسیه هم اکنون به عنوان یک مشکل عمده در بیماران بستری مطرح است. هدف این مطالعه بررسی گسترش سویه های مقاوم به چنددارو تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs) در انتروباکتریاسیه های جداشده از خون بیماران با استفاده از سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 در جنوب ایران است.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی 4825 نمونه خون بیماران مشکوک به باکتریمی بستری در بیمارستان های شهر شیراز گرفته شد و وارد شیشه های محیط کشت خون سیستم اتوماتیک BACTEC گردید. نمونه های کشت خون مثبت از دستگاه خارج و بر روی محیط های معمول میکروب شناسی شامل محیط های بلاد آگار، شکلات آگار و مک کانکی آگار کشت انجام شد. با استفاده از تست های بیوشیمیایی تعبیه شده در سیستم API 20E اختصاصی انتروباکتریاسیه ها مورد شناسایی نهایی قرار گرفتند. پروفایل مقاومت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش استاندارد دیسک دیفیوژن بر اساس استاندارهای CLSI انجام شد. شناسایی سویه های تولیدکننده ESBL با استفاده از تست فنوتیپی DDST بر اساس استاندارد ارائه شده توسط (2013)CLSI انجام پذیرفت.یافته هااز کل 4825 نمونه خون ارسال شده 1145 کشت خون (24 درصد) از نظر رشد میکروارگانیسم مثبت بودند که از بین موارد مثبت 248 ارگانیسم (5/ 21 درصد) متعلق به خانواده انتروباکتریاسیه بودند. در خانواده انتروباکتریاسیه به ترتیب اشریشیاکلی (5/ 46 درصد)، کلبسیلا (28 درصد) و انتروباکتر (5/ 13 درصد) شایع ترین جنس های ایزوله شده بودند. در بین انتروباکتریاسیه های جداشده بهترین پاسخ به آنتی بیوتیک آمپی سیلین در سالمونلا مشاهده شد. باکتری اشریشیاکلی شایع ترین ارگانیسم تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف در این خانواده بود به طوری که 58 درصد ایزوله های این باکتری ESBL مثبت بودند. به ترتیب داروهای پلی میکسین B، کلیستین و ایمی پنم آنتی بیوتیک هایی بودند که بیشترین کارآیی را بر علیه سویه های ESBL مثبت کلبسیلا داشتند. ایزوله های ESBL مثبت انتروباکتر کمترین مقاومت را به ایمی پنم (7/7 درصد) نشان دادند. همه ایزوله های ESBL مثبت سراشیا به کلرامفنیکل، کوتریموکسازول و ایمی پنم حساس بودند.نتیجه گیرینتایج نشان داد متاسفانه داروهای بتالاکتام جهت درمان بیش از 40 درصد باکتریمی های ناشی از اشریشیاکلی و کلبسیلا و 39 درصد باکتریمی های ناشی از انتروباکتر که جزء شایع ترین ارگانیسم های ایجادکننده عفونت در بیمارستان می باشند کارآیی ندارند. خطر گسترش مقاومت های چنددارویی روز به روز در حال افزایش است و هشدار جدی در درمان بیماران در ایران است.
کلید واژگان: باکتریمی, کشت خون, سیستم BACTEC 9240, انتروباکتریاسیه, مقاومت آنتی بیوتیکی, ESBL}BackgroundExtended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) have emerged as important mechanism of resistance among enterobacteriaceae family. These ESBL positive strains are major problem in hospitalized patients. The goal of this study was the survey emergence of multi-drug resistant ESBL producing strains among enterobacteriaceae members isolated from patients blood samples using BACTEC 9240 automatic system in south of Iran.Materials and MethodsIn this cross-sectional study, 4825 blood samples were collected from hospitalized patients, and positive samples were detected by BACTEC automatic system. Positive blood cultures removed from BACTEC and subculture was performed on microbiological media including blood agar, chocolate agar and MacConkey agar. The isolates were identified based on biochemical tests embedded in the API-20E system. Susceptibility testing (disc diffusion) was performed according clinical and laboratory standards institute (CLSI, 2013) guidelines. Phenotypic detection of extended spectrum beta-lactamase producing isolates was performed by double disk synergy test (DDST).ResultsTotal 1145 (24%) blood cultures were positive that among them 248 (21.5%) belonged to the enterobacteriaceae family. The most common isolates in this family were Escherichia coli (46.5%), Klebsiella spp. (28%), Enterobacter spp. (13.5%). Among enterobacteriaceae family, ampicillin was most effective drug against Salmonella isolates. Escherichia coli was the most common ESBL-producing isolate (58% of isolates were ESBL positive). Respectively, polymyxin B, colistin, imipenem were the most effective drugs against ESBL-positive Klebsiella strains. The ESBL-positive Enterobacter strains showed lowest resistance to imipenem (7.7%). All ESBL positive Serratia isolates were sensitive to chloramphenicol, co-trimoxazole and imipenem.ConclusionResults showed unfortunately betalactam antibiotics are not effective against more than 40% of bacteremia caused by Escherichia coli and Klebsiella and 39% bacteremia caused by Enterobacter. Multi drug resistance strains are increasing and treatment of infections causing by this isolates are major problem in Iran.Keywords: Bacteremia, Blood culture, BACTEC 9240 system, Enterobacteriaceae, Antibiotic resistance, ESBL} -
زمینه و هدفبه دلیل ظهور سویه های پسودوموناس آئروژینوزا مقاوم به چنددارو، درمان افراد آلوده به این باکتری مشکل است. هدف از این مطالعه الگوی حساسیت میکروبی و اپیدمیولوژی مولکولی پسودوموناس آئروژینوزا جدا شده از بیماران سوختگی بود.روش بررسیاین مطالعه مقطعی بر روی 270 سویه پسودوموناس آئروژینوزا جداشده از زخم بیماران سوختگی انجام گرفت. شناسایی سویه های تولیدکننده آنزیم متالوبتالاکتاماز با استفاده از روش E-test انجام شد. الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی سویه های متالوبتالاکتاماز مثبت به روش دیسک دیفیوژن نسبت به 11 آنتی بیوتیک بررسی شد. ارتباطات ژنیتکی و اپیدمیولوژی سویه ها به وسیله روش پالس فیلد ژل الکتروفورز انجام شد.یافته هاشصت ایزوله (22/2 درصد) به ایمی پنم و مروپنم مقاوم و تولیدکننده آنزیم متالوبتالاکتاماز بودند، که10 الگوی آنتی بیوتیکی در میان آنها مشاهده گردید و به 5 مورد از آنتی بیوتیک های مورد بررسی کاملا مقاوم بودند. میزان حساسیت به سفتازیدیم، آمیکاسین و سیپروفلوکساسین به ترتیب 23/3 درصد، 6/7 درصد و 1/7 درصد بود. بر اساس نتایج پالس فیلد ژل الکتروفورز و تجزیه و تحلیل باندهای به دست آمده از ژنوم پسودوموناس آئروژینوزا، اغلب سویه ها(71/6 درصد) بیش از 80 درصد شباهت نشان دادند.نتیجه گیریهیچ یک از آنتی بیوتیک های مورد آزمایش جهت تجویز مناسب به نظر نمی رسند. پالسوتایپ های حاصل از پالس فیلد ژل الکتروفورز نشان دادند که تیپ های خاصی از پسودوموناس آئروژینوزا در بخش سوختگی بیمارستان شایع هستند و بیماران را درگیر می کنند.
کلید واژگان: بیماران سوختگی, عفونت های بیمارستانی, پسودوموناس آئروژینوزا, آنزیم متالوبتالاکتاماز, پالس فیلد ژل الکتروفورز}Background and AimBecause of emerging multi-drug resistance (MDR) Pseudomonas aeruginosa strains, treatment of burn patients infected by this bacterium is difficult. The aim of this study was to detect antimicrobial profile and molecular epidemiology of metallo-beta-lactamase (MBL) producer strains.MethodsIn this cross-sectional investigation 270 Pseudomonas aeruginosa isolates were collected from the burn patients. Carbapenem sresistance strains were detected by phenotypic E-test method. Susceptibility profiles of metallo-β-lactamase (MβL) enzyme producing isolates of this bacterium to 11 antimicrobial drug were determined by disc diffusion method according Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines. The genetic correlations between isolates were determined by Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) method.ResultsAmong 270 P. aeruginosa isolates, 60 (22.2%) strains showed resistant to meropenem (MEM) and imipenem (IMI) and were considered as metallo-β-lactamase positive. All metallo-β-lactamase positive isolates were resistant to five tested antimcrobial while their sensitivities to the three best effective antibiotics including ciprofloxacin, amikacin and ceftazidime were 1.7%, 6.7 % and 23.3%, respectively. Majority of the isolates (71.6%) showed more than 80% similarity based on the drawn dendrogram.ConclusionOur results showed, the tested antimicrobials are not safe to prescribe for burn patients. According PFGE pulsotypes, a limited number of P.aeruginosa types are common in the hospital burn unit which infect the patients hospitalized in this ward.Keywords: Burn Patients, Drug Resistance, Nosocomial Infections, Pseudomonas aeruginosa, metallo, β lactamase (MBL) Enzyme, Pulsed, Field Gel Electrophoresis (PFGE)} -
زمینه و هدفسیکلوفسفامید، ماده آلکیله کننده ای است که باعث توقف تکثیر DNA می گردد. از این ماده برای درمان سرطان ها و اختلالات ایمنی استفاده می شود. هدف از این مطالعه بررسی اثر تنظیم کنندگی سیکلوفسفامید بر سیستم ایمنی موش های واکسینه و غیر واکسینه شده می باشد.مواد و روش هااین مطالعه بر روی سه گروه موش ها، شامل: گروه های واکسینه و غیر واکسینه و کنترل انجام شد. واکسیناسیون با تزریق داخل صفاقی کاندیدا آلبیکانس طی 3 مرحله مجزا انجام شد. گروه واکسینه که سیکلوفسفامید را در روز شروع تست (0) دریافت کرده بودند با دوز کشنده از ارگانیسم در روزهای 0، 1، 3، 6 و 12 مورد چالش قرار گرفتند. گروه غیر واکسینه شبیه گروه واکسینه با سیکلوفسفامید و دوز کشنده به چالش کشیده شدند. گروه کنترل در روز (0) تزریق سیکلوفسفامید دریافت کردند. در روزهای ذکر شده بعد از تزریق سیکلوفسفامید؛ به منظور مطالعات پاتولوژیک کشته شدند. سپس از لام تهیه شده خون استفاده شد و بافت طحال و کلیه به صورت میکروسکوپی و ماکروسکوپی مورد بررسی قرار گرفتند.نتایجدر گروه واکسینه شده افزایش زمان بقا، افزایش سلول ها با هسته ی چند قسمتی و هیپرپلازی در پالپ سفید طحال، مشاهده شد. در گروه غیر واکسینه، این فاکتورها؛ پس از تزریق سیکلوفسفامید در روز های 1 و 3؛ کاهش یافته بود.نتیجه گیریهیپرپلازی در پالپ سفید طحال و افزایش سلول های پلی مورفونوکلئر محیطی به علت اثرات انتخابی سیکلوفسفامید می باشد که به طور موثر از حیوانات در برابر عفونت کاندیدا آلبیکنس محفاظت می کند.
کلید واژگان: اثر تنظیم کنندگی سیستم ایمنی, دوز کشنده, کاندیدا آلبیکنس, موش, سیکلوفسفامید}Background and ObjectivesCyclophosphamide is an alkylating agent that stops the replication of DNA، which is used to treat various types of cancer and some autoimmune disorders. This study was aimed at then evaluating the immunomodulating effect of cyclophosphamide (Cy) on the immune system of vaccinated and non-vaccinated mice.Materials and MethodsThe study was performed on three groups of mice consisting of vaccinated، non-vaccinated and control groups. Vaccination was carried out by three separated courses of C. albicans injection intraperitoneally. Then، the vaccinated group received Cy on day zero and were challenged with lethal doses of C. albicans on days zero، one، 3، 6 and 12 post-Cy injection. Non-vaccinated group received Cy on day zero and similar to vaccinated ones were challenged with lethal doses of the organism. The control groups received just Cy on day zero and were sacrificed on days post-Cy injection. Then، the hemogram and the spleen and the renal tissues were studied microscopically and macroscopically.ResultsIn the vaccinated group، an increase in survival time، the number of polymorphonuclear and the significant hyperplasia in the white pulp on days 6 and 12 post-Cy injection were noticed. In non-vaccinated ones، these factors had significant decrease on days 1 and 3.ConclusionIt is concluded that the hyperplasia in the white pulp of spleen and an increasing in peripheral polymorphonuclear due to the selective effects of Cy could effectively protect the animal against C. albicans infection.Keywords: immunomodulating effect, Cyclophosphamide, Candida albicans, lethal dose, mice} -
مقدمه و اهدافافزایش ارگانیسم های دارای مقاومت چندگانه دارویی (Multi Drug Resistance) و مشکلات زیاد بوجود آمده برای کودکان در کشورهای در حال توسعه، یکی از نگرانی های جامعه پزشکی است. کودکان آلوده به میکروارگانیسم های دارای مقاومت چندگانه دارویی بیش تر احتیاج به مراقبت و بستری شدن دارند. همچنین بیماران مبتلا به این دسته از ارگانیسم ها برای درمان احتیاج به داروهای گران تری دارند. مطالعه حاضر با هدف بررسی این دسته از ارگانیسم ها در میان کودکان شهر جهرم، تلاش دارد با شناخت عوامل، بهترین راهبرد مصرف آنتی بیوتیک های مناسب را پیشنهاد کند.مواد و روش هادر این مطالعه توصیفی – مقطعی، 90 سوش اشرشیاکلی جدا شده از کودکان یک ماهه تا 14 ساله مبتلا به عفونت های ادراری بررسی شد. پس از جداسازی ارگانیسم، الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی هر ایزوله با روش دیسک دیفیوژن بررسی شد.نتایجدر مطالعه حاضر، شیوع بالایی از مقاومت چندگانه دارویی در میان ایزوله ها دیده شد. 77% نمونه ها به سه آنتی بیوتیک یا بیش تر مقاوم بودند. بیش ترین الگویی که در میان نمونه ها دیده شد (4/14%) مقاومت به آمپی سیلین، تتراسایکلین و کوتریموکسازول بود که در میان 13 نمونه تکرار شده بود.نتیجه گیریبا توجه به شیوع بالای ایزوله های دارای مقاومت چندگانه دارویی، لازم است بررسی های مستمر در راستای آگاهی از بروز مقاومت آنتی بیوتیکی در مناطق مختلف انجام گیرد تا بدین وسیله از مصرف آنتی بیوتیک های نامناسب که خود موجب بروز ارگانیسم ها با مقاومت های چند دارویی است جلوگیری شود.
کلید واژگان: اشرشیاکلی, مقاومت چندگانه دارویی, عفونت مجاری ادراری}IntroductionA current phenomenon of great concern in the medical community is the rise in multi-drug resistant (MDR) organisms and their respective problems in developing countries for children. Children infected with such organisms need more care and hospitalization and for their therapy we also use expensive drugs.So, we evaluated the multidrug resistant strains of Escherichia coli isolated from urinary tract infection in children of Jahrom to recognize the factors involved and control the use of antimicrobials in this area to select best strategies.Materials And MethodsThis cross sectional descriptive study was performed on 90 E. coli strains isolated from the children aged from 1 month to 14 years, with urinary tract infection. The resistance patterns of the isolates to different antibiotic were determined by the disk diffusion method.ResultsIn this study, the prevalence of the isolates demonstrating a multi drug resistant phenotype was high. Seventy seven percent of the isolates were resistant to three or more antibiotics. The predominant pattern among these strains (14.4%) included resistance to ampicillin, co- trimoxazole and tetracycline repeated among 13 strains.ConclusionWith due attention to the results and high rate of multi drug resistance, regular monitoring of antimicrobial drug resistance in different areas is necessary to prevent the unsuitable consumption of the drugs which cause multi drug resistance. -
مقدمهژل الکتروفورز در میدان ضربانی (pulsed field gel electrophoresis) یکی از بهترین روش هایی است که برای تیپ بندی و مطالعات اپیدمیولوژی در مناطق مختلف کاربرد دارد. این روش با قدرت تکرارپذیری و افتراق بالایی که دارد برای تمام پاتوژن های انسانی قابل استفاده می باشد. اما این روش بسیار حساس بوده و کوچک ترین تغییری در پارامترهای وابسته به آن باعث عدم نتیجه گیری درست می شود. با توجه به این موارد در مطالعه حاضر سعی شده است با استاندارد سازی بیش تر این روش و برطرف کردن اشکالات تکنیکی موجود در انجام آن به نتایج دقیق تری برای مقایسه سوش های مختلف در مطالعات اپیدمیولوژی دست یافت.روش کاردر تحقیق حاضر در راستای تعیین الگوی ژنتیکی سوش های اشریشیاکلی به وسیله پروتکل ژل الکتروفورز در میدان ضربانی، پارامتر های مختلفی از جمله غلظت DNA موجود در نمونه و رابطه آن با غلظت و طول مدت زمان مورد استفاده برای آنزیم ها مورد بررسی قرار گرفت.یافته هاپس از بررسی های مختلف، مناسب ترین چگالی نوری (Optical Density) سوسپانسیون باکتریایی در طول موج 610 نانومتر بین 7/0 -6/0 نانومتر، غلظت آنزیم XbaI 150 واحد و زمان مناسب تاثیر آنزیم پروتئیناز K هفت ساعت مشخص شد.نتیجه گیریبه نظر می رسد که متغیر های مورد استفاده در این مطالعه برای بهینه سازی روش میدان ضربانی از اساسی ترین متغیر ها در راه اندازی یک روش کارآمد می باشند. بنابراین با رعایت نکات گفته شده، این روش ملکولی بیش از گذشته به محققین در مطالعات اپیدمیولوژی و مقایسه بین سوش های مختلف کمک خواهد کرد.
کلید واژگان: اشرشیاکلی, الکتروفورز, ژل, میدان ضربانی}IntroductionPulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) is one of the best typing methods which is highly effective in molecular epidemiological studies in different areas. All bacterial isolates are typeable by PFGE and the results are highly reproducible. As this technique is very sensitive and the least variation in the parameter leads to lack of result or false positive, in this study we tried to optimize this method and eliminate the technical problems to obtain accurate results for comparison of different strains in epidemiological studies.Material And MethodsTo assess the genotype pattern of Escherichia coli strains by PFGE method, we studied different parameters such as concentration of DNA molecules of the sample and their relationship with the enzymes concentration.ResultsAfter different examinations, the best optical density for bacterial suspension in the wavelength of 610 was found to be within 0.6-0.7 nm and the best concentration of XbaI enzyme was 150 units. The appropriate time for proteinase K effect was 7 hours.ConclusionIt seems that the parameters used in this study are the most essential factors in the establishment of an effective PFGE method. With due attention to this experiment, researchers can use this method more efficiently than before for epidemiologic studies and comparison of different strains. -
مقدمهعفونت مجاری ادراری یکی از معمول ترین عفونت های باکتریایی است که توسط گروهی از باکتری ها که به نام اوروپاتوژن اشریشیاکلی شناخته می شوند و دارای تنوع ژنتیکی زیادی می باشند ایجاد می شود. سیستیت و پیلونفریت دو نوع از علایم بالینی است که در بیماران مبتلا به این نوع از عفونت ها مشاهده می شود. تنوع ژنتیکی بالای ایزوله های اشرشیاکلی مانع تشخیص سوش های غالب در ایجاد عفونت مجاری ادراری می شود و هنوز این مسئله که آیا تمام ایزوله های اوروپاتوژن قادر به ایجاد هر دو بیماری پیلونفریت و سیستیت هستند یا خیر مشخص نیست. روش های مناسب و دقیقی برای تقسیم بندی ژنتیکی این ارگانیسم ها مورد نیاز است که یکی از بهترین این روش ها پالس فیلد (Pulsed Field) می باشد که در این مطالعه به منظور بررسی الگوی ژنتیکی ایزوله های عامل عفونت ادراری از آن استفاده شده است.روشاین بررسی توصیفی - مقطعی بر روی 90 سوش Escherichia coli جدا شده از کودکان مبتلا به عفونت های ادراری انجام گرفت و الگوهای ژنتیکی به دست آمده برای 42 ایزوله عامل سیستیت و 48 ایزوله عامل پیلونفریت با روش PFGE مورد بررسی قرار گرفتند.یافته هابا استفاده از روش PFGE کلا 66 الگو به دست آمد که بیشترین درصد ایزوله ها تعداد 13 و 12 باند و کمترین درصد ایزوله ها تعداد 19 و 8 باند تشکیل دادند. اندازه ژنوم ایزوله ها نیز kbp 1610-4170 بود.نتیجه گیریبا توجه به نتایج به دست آمده می توان گفت که در بعضی موارد ایزوله های عامل سیستیت و پیلونفریت دارای الگوی مشترک می باشند و علایم بالینی متفاوت مربوط به بروز فاکتور های مختلف است.
کلید واژگان: اشرشیاکلی, پیلونفریت, سیستیت, پالس فیلد ژل الکتروفورز}Background and AimsUrinary tract infection (UTI) is one of the most frequently acquired bacterial infections caused by a large genetically heterogeneous group of Escherichia coli which are called uropathogenic E. coli (UPEC). Cystitis and pyelonephritis are two most common symptoms seen in patients with UTI. The genetic diversity of this organism has hampered the identification of UTI strains and it is unclear whether all UPEC isolates are capable of causing both cystitis and pyelonephritis. Therefore, Careful selection of appropriate genotyping methods is mandatory. The most popular method is Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) that is used in the present study to evaluate the genetic patterns of UPEC.MethodsIn this cross-sectional study a total of 90 E. coli strains consisting of 48 isolates causing pyelonephritis and 42 isolates causing cystitis in children were analyzed by PFGE and their corresponding patterns were compared.ResultsSixty six PFGE profiles were obtained from the genome of E. coli strains by this genotyping method. Most strains exhibited twelve and thirteen bands and the patterns with eight or nineteen bands had the lowest rate. Genome size of strains was between 1610-4170 kbp.ConclusionAccording to these results, it can be suggested that in some cases the strains causing pyelonephritis or cystitis have common patterns and different clinical symptoms could be attributed to different gene factors.
بدانید!
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.