فهرست مطالب نویسنده:

هانیه باقری فرد

انتخاب همه

بررسی فراوانی جهش ژن thyA و میزان مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید در سویه های بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به دارو در شهر تهران در سال 1400-1397

هانیه باقری فرد، میترا صالحی*، مونا قاضی

نشریه پژوهش در پزشکی، سال چهل و هفتم شماره 4 (پیاپی 188، زمستان 1402)، صص 96 -105

سابقه و هدف

پیدایش مقاومت های دارویی و ظهور سویه‏های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به درمان، کنترل این بیماری را با چالش مواجه ساخته است. بنا به آمار سازمان بهداشت جهانی (WHO)، سالانه در سراسر جهان حدود 000,500 مورد ابتلای جدید سل مقاوم به دارو گزارش می‏شود. با توجه به اینکه مکانیسم‏های مرتبط با بروز مقاومت های دارویی به درستی شناخته نشده است و تحقیق های مختلف نشان‏دهنده نتایج متفاوتی است، بر آن شدیم تا به بررسی جهش‏های ژن thyA در ارتباط با مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید (PAS) بپردازیم.

روش کار

در این مطالعه توصیفی- مقطعی، در مدت سه سال تعداد 255 نمونه‏ مثبت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش استاندارد کشت و اسمیر جداسازی شد، سپس با انجام آزمون حساسیت‏سنجی دارویی 68 نمونه سل مقاوم به دارو انتخاب شد. برای بررسی جهش های ژن‏ thyA، از روش PCR استاندارد استفاده شد و قطعه های حاصله توالی‏یابی شدند. جهش‏های منجر به تغییر کدون، با به کارگیری نرم‏افزارهای پیش‏بینی تغییرهای پروتئین آنالیز شدند. ارتباط جهش‏های یافت ‏شده با مقاومت به داروی PAS از لحاظ آماری توسط آزمون مربع کای مطالعه شد.

یافته ها

از 255 نمونه مورد بررسی، 68 سویه (26/7درصد، فاصله اطمینان 21/3درصد) مقاوم به دارو تعیین شد. مجموعا 13 نمونه (19/1درصد) سویه مقاوم به PAS یافت شد که 5 سویه (38/4درصد) دارای جهش های نوکلئوتیدی مختلف در ژن thyA بودند. از لحاظ آماری ارتباط جهش‏های مذکور با مقاومت آنتی‏بیوتیکی معنادار بود. به علاوه، نتایج آنالیز بیوانفورماتیک نشان داد که جهش‏های یافت‏شده منجر به اختلال در عملکرد و ناپایداری در ساختار پروتئین حاصله می‏شوند.

نتیجه گیری

طبق نتایج به دست آمده به نظر می‏رسد که جهش‏ در ژن thyA با مقاومت به داروی PAS مرتبط است. همچنین یافته‏ها ارزش تشخیصی آنالیز قطعه های کوچک ژنومی و ابزارهای نوین بیوانفورماتیک را در شناسایی مکانیسم‏های مقاومت دارویی نشان می‏دهد.

کلید واژگان: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, مقاومت دارویی, جهش ژنتیکی, آنالیز بیوانفورماتیک

چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی

Frequency Determination of thyA Mutations and Prevalence of Resistance to Para- Aminosalycylic Acid in Clinical Strains of Drug- Resistant Mycobacterium Tuberculosis in Tehran from 2018 to 2021

Hanieh Bagherifard, Mitra Salehi*, Mona Ghazi

Journal of Research In Medical Sciences, Volume:47 Issue: 4, 2024, PP 96 -105

Background and Aim

The emergence of drug resistance and treatment- renitent Mycobacterium tuberculosis has made controlling the disease a challenge. World Health Organization (WHO) estimates that approximately 500,000 new cases of tuberculosis occur annually. Considering that mechanisms involved in drug resistance are yet to be elucidated and results of the studies are not consistent, we decided to investigate the correlation between mutations in thyA gene and resistance to para- aminosalicylic acid (PAS).

Methods

In this descriptive cross- sectional study, a total of 255 positive MTB specimens were isolated during a three- year period using standard microscopic and culture methods from which 68 Multidrug resistant (MDR) and extensively drug resistant (XDR) tuberculosis samples were selected through drug susceptibility testing. Then, to determine potential mutations in thyA gene, the fragment was amplified using conventional PCR and products were sequenced. Afterward, mutations which have been induced amino acid substitutions were evaluated with various protein prediction tools. Also, the correlation between mutations and drug resistance was statistically determined using chi-square test.

Results

From 255 clinical TB samples, 68 (26.7%, CI 21.3%) MDR / or XDR-TB strains were isolated. In total, 13 (19.1%) were PAS- resistant and 5 (38.4%) of them had different nucleotide mutations in thyA gene. All of the mutations were statistically correlated with drug resistance. Moreover, the results of bioinformatics showed that identified mutations could lead to the structural and functional disruption of the protein.

Conclusion

According to our results, mutations in thyA gene have appeared to be associated with resistance to PAS. Also, our findings have shed light on the potential of the analysis of short genomic regions and new computational tools in unraveling the molecular mechanisms of drug resistance.

Keywords: Mycobacterium tuberculosis, Drug resistance, thyA, Mutation, Bioinformatics

Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
تشخیص کووید-19: بیماری و ابزارهای شناسایی

مترجم: سعید ذاکر,هانیه باقری فرد

مجله زیست شناسی ایران، سال چهارم شماره 7 (بهار و تابستان 1399)، صص 304 -315

از زمان کشف کووید-19 در استان هوبای کشور چین در دسامبر سال 2019، این بیماری در سرتاسر جهان انتشار یافته است. در ابتدا برای غربالگری و شناسایی SARS-CoV-2 و سبب شناسی ویروسی بیماری کووید-19، ترکیبی از روش های تصویربرداری توموگرافی کامپیوتری، توالی یابی کامل ژنگان (genome) و میکروسکوپ الکترونی، مورد استفاده قرار گرفت. هدف از این مقاله، معرفی تکنولوژی های مرتبط با تشخیص و نظارت بر SARS-CoV-2 و نیز ویژگی های کاربردی آنهاست. در این مقاله روش های جدید تشخیصی در محل مراقبت از بیمار توصیف شده و محققین را تشویق به پیشرفت ایده های خود در مورد تکنولوژی های جدید می کنیم. توسعه تجهیزات تشخیصی کامپیوتری با کاربرد سریع و آسان به منظور مدیریت شرایط در زمان شیوع ناگهانی SARS-CoV-2، می تواند در جلوگیری از اپیدمی های آینده سودمند باشد.

کلید واژگان: SARS-CoV-2, روش های تشخیصی, کووید-19, PCR, نظارت, پاندمی

چکیده مشاهده متن مقاله مروری زبان: فارسی

Diagnosing COVID-19: The Disease and Tools for Detection

Buddhisha Udugama, Pranav Kadhiresan, Hannah N. Kozlowski, Ayden Malekjahani, MatthewOsborne, Vanessa Y. C. Li, Hongmin Chen, SamiraMubareka, Jonathan B. Gubbay, Warren C. W. Chan

Iranian Journal of Biology, Volume:4 Issue: 7, 2020, PP 304 -315

View Paper Review Article Original: Persian

بدانید!

در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.

به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

هانیه باقری فرد