به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب amir mousavi

  • Elham Faryabi *, Mitra Noori, Amir Mousavi, Ali Ashraf Jafary
    Iran has different environmental conditions due to specific geographical. Therefore, exploring essential oil and flavonoids components among different medicinal may be caused discoveries about valuable components. The present study aimed to study flavonoids profile and essential oils composition of four Lamiaceae species i.e. Stachys lavandulifolia Vahl, Teucrium polium L., Thymus daenensis Čelak., and Ziziphora clinopodioides Lam. from Oshtorankoh located on Zagros Mountains, Iran. The plants were collected during 2014-2015 and were identified using available references. A chemical study using two-dimensional paper chromatography (2-DPC) and thin-layer chromatography (TLC) showed that the four studied species contained flavone C and C-/O glucosides and flavonoid sulfates. The result of the present study revealed that T. polium had high levels of many flavonoids such as apigenin, genistein, isorhamnetin, kaempferol, quercetin, rutin, andvitexin compared to the other studied plants. According to the results of GC/MS analysis, S. lavandulifolia was rich in α‑pinene (21.16%) and 1,8‑cineol (16.95%), T. polium in α‑pinene (12.21%) and sabinene (9.55%), T. daenensis in γ‑Terpinene (36.98%) and p‑Cymene (26.87%), and Z.‍clinopodioides in piperitone (16.84%) and 1,8‑cineol (16.11%) components.
    Keywords: Flavonoids, essential oil, Lamiaceae, mint, Zagros}
  • فهیمه قائمی زاده، فرشاد دشتی*، امیر موسوی
    هدف

    اکثر کلون های سیر، غیر گلده و عقیم بوده و به صورت غیر جنسی تکثیر می شوند؛ با این حال برخی از کلون ها گلده بوده وانواع زایا تا حدودی در بین آن ها یافت می شود. درک صحیح از الگوی بیان و ساختار ژن های خانواده ژنی MADS-BOX ازجمله ژنAGL6 در گیاه سیر از ارزش بالایی برخوردار بوده و می تواند روند برنامه های اصلاحی آن را بهبود ببخشد. تاکنون پژوهشی مبنی شناسایی این ژن موثر در گلدهی و باروری سیر صورت نگرفته است. لذا هدف از تحقیق حاضر بررسی الگوی بیان نسبی ژن AGL6 در همگروه گلده، نیمه گلده و غیر گلده سیر ایرانی و شناسایی ساختار و توالی نوکلئوتیدی آن می باشد.

    مواد و روش ها

    بدین منظور، ابتدا بیان نسبی این ژن در اندام های مختلف همگروه های گلده، نیمه گلده و غیر گلده سیر ایرانی و با استفاده از روش RT-PCR کمی بررسی شد. سپس بخشی از توالی کد کننده ژن AGL6 با استفاده از روش مذکور از بافت گلچه های سیر گلده جد اسازی و همسانه سازی شد. نتایج حاصل از توالی یابی و آنالیز همسانه های نوترکیب با استفاده از نرم افزارهای، BLAST، Vector NTI، ORF finder و MEGA6 مورد ارزیابی قرار گرفت.

    نتایج

    بر اساس نتایج بدست آمده، AGL6 در مریستم، گل آ ذین، تپال و برچه گلچه های سبز و ارغوانی سیر گلده بیان شد. اما اثری از بیان این ژن در پرچم دیده نشد. سطح بیان آن در مریستم سیر گلده در تمامی مراحل نمونه برداری و به ویژه مرحله القا گلدهی بالاتر ازمریستم سیر نیمه و غیر گلده بود. AGL6در گل آذین سیر نیمه گلده نیز بیان شد اما بیان آن در این مرحله نیز در مقایسه با گل آذین سیر گلده 4 برابر کمتر بود. نتایج توالی یابی قطعه همسانه سازی شده، وجود ناحیه کدکننده به طول 728 جفت باز را نشان داد که با کد دسترسی OK086759.1در پایگاه NCBI ثبت گردید. این توالی نوکلئوتیدی یک پروتئین با 243 اسید آمینه را کد می کند و دارای دومین های MADS-box و K-box می باشد. بررسی ها بیانگر تشابه بالا و همپوشانی زیاد این توالی با سایر همولوگ های ژن AGL6 در سایر گونه های گیاهی و بویژه تک لپه ای های پتالوئیدی نظیر پیاز، لیلیوم، گل نرگس، زعفران در NCBI بود؛ از این رو توالی حاصل AsAGL6 نامیده شد.

    نتیجه گیری

    در این پژوهش برای اولین بار الگوی بیان یک ژن کلیدی مسیر گلدهی و باروری (AsAGL6) و ساختار نوکلئوتیدی آن در گیاه سیر مشخص شد. نتایج بدست از این تحقیق میتواند به طور موثری در طراحی برنامه های اصلاحی کلاسیک و مولکولی سیر مورد استفاده قرار گیرند.

    کلید واژگان: باروری, خانواده ژنی MADS-BOX, کلونینگ, گلدهی, Real-time PCR}
    Fahimeh Ghaemizadeh, Farshad Dashti *, Amir Mousavi

    Most of the garlic clones are non-bolting and sterile and propagate asexually; however, some of the clones are bolting, and there are some fertile clones among the bolting ones. A correct understanding of the MADS-BOX genes family expression pattern and structure, including AGL6, is a valuable project and will improve garlic breeding programs. So far there are no reports relating AGL6 identification as a flowering and fertility integrator gene in garlic. So the aim of this study is to investigate the relative expression of AGL6 in Iranian bolting, semi- and non-bolting garlic clones and to identify its structure and nucleotide sequence.

    Materials and Methods

    At first the relative expression of the AGL6 was investigated in the different organs of non-bolting, semi-bolting and bolting Iranian garlic clones using quantitative Real time- PCR. Then the isolation and cloning of the AGL6 partial sequences from the garlic floret was carried out using RT-PCR. The sequence of the recombinant plasmid was evaluated using BLAST, Vector NTI, ORF finder and MEGA6 software.

    Results

    According to the obtained results, AGL6 was expressed in the meristem, inflorescence, tepal and carpel of green and purple flowers of the bolting garlic. But there was no sign of its expression in the stamen. AGL6 expression level in the meristem of bolting garlic was higher than the meristem of the semi-bolting and non-bolting garlic in all sampling stages, especially in the flowering induction stage. AGL6 was also expressed in the inflorescence of the semi-bolting and bolting garlic, but its expression in the inflorescence of the semi- bolting garlic was 4 times less than the inflorescence of the bolting garlic. Sequence analysis of the colonized fragment showed the coding region with a 728 bp length, which was registered in the NCBI database with the accession number of OK086759.1. This nucleotide sequence encodes a protein with 243 amino acids and has MADS-box and K-box domains. Results showed the high similarity of the sequence obtained in this research with other AGL6 gene homologues in other plant species, especially petaloid monocots such as onion, lily, narcissus and saffron in NCBI. Hence the resulting sequence was named AsAGL6.In this research, for the first time, the expression pattern of a key gene of the flowering and fertility pathway (AsAGL6) and its nucleotide structure were determined in garlic. The results of this research can be effectively used in the design of classical and molecular garlic breeding programs.

    Keywords: cloning, Fertilization, Flowering, MADS-BOX gene family, Real -Time PCR}
  • محمدصادق تمکین، مرضیه قنبری جهرمی*، امیر موسوی

    سیکلامن هم به عنوان گیاه زینتی و هم دارویی شناخته شده است. عصاره این گیاه، فعالیت زیستی قوی و محتوای پلی فنولی، تانن و پروتئین بالا دارد. به دلیل وجود این ترکیبات بازدارنده، استخراج اسیدهای نوکلئیک از گیاه دشوار است. بیشتر آزمون های زیستی با استخراج DNA و RNA آغاز می شود. بنابراین، انتخاب یک روش استخراج مناسب، قابل اعتماد و تکرارپذیر، اهمیت زیادی دارد. در این آزمایش، بهینه سازی استخراج اسیدهای نوکلئیک از گیاه سیکلامن ایرانی (Cyclamen coum Miller) و امکان بیان ژن های خانه دار مناسب در این گونه،  ارزیابی شد. پس از جمع آوری نمونه های گیاهی از سه اندام برگ، گلبرگ و هیپوکوتیل، برای استخراج DNA روش های تغییریافته CTAB و SDS و برای استخراج RNA روش های Trizol تغییریافته، CTAB-LiCl و RNX-Plus، استفاده  شد. کیفیت و کمیت DNA و RNA استخراج شده از راه الکتروفورز، اسپکتروفتومتری و PCR بررسی شد. برای تایید کیفیت DNA استخراج شده وجود قطعات ژن های 18S ریبوزومی، اکتین (ACT)، توبولین (TUB) و فاکتور طویل سازی (EF-1a) به عنوان ژن خانه دار با کمک PCR بررسی  شد. بر اساس نتایج به دست آمده، کمترین غلظت DNA در روش CTAB تغییریافته مشاهده شد. غلظت و کیفیت DNA نمونه های برگ، گلبرگ و هیپوکوتیل در روش SDS تغییریافته بهتر از روش CTAB بود. مقایسه سه روش Trizol تغییریافته، CTAB-LiCl و RNX-Plus در استخراج RNA، نشان داد که روش Trizol تغییریافته از لحاظ وضوح نوارها و غلظت RNA استخراج شده بهتر از دیگر روش ها بود. با استفاده از این پروتکل، نسبت جذب A260/280 نانومتر از 01/2 تا 10/2 متغیر بود که نشان دهنده کیفیت بالای RNA جدا شده بدون آلودگی فنولی یا پروتئینی است. علاوه بر این، نسبت A260/A230 نانومتر بین 99/1 و 15/2 بود که نشان می دهد RNA استخراج شده بدون پلی ساکارید است. ساخت cDNA از RNA استخراج شده از سه بافت سیکلامن ایرانی تنها در دو روش Trizol و RNX-Plus با موفقیت انجام شد. برای بررسی کیفیت نمونه های RNA، امکان بیان ژن های خانه دار با استفاده از RT-PCR ارزیابی شد. نتایج RT-PCR نشان داد که در بین ژن های خانه دار، TUB و 18S در همه نمونه های برگ، گلبرگ و هیپوکوتیل سیکلامن ایرانی از وضوح باند بیشتر و کیفیت بالاتری برخوردار بودند.

    کلید واژگان: استخراج RNA, Trizol, Cyclamen coum, استخراج DNA, ژن خانه دار}
    Mohammad Sadegh Tamkin, Marzieh Ghanbari Jahromi*, Amir Mousavi

    Most molecular genetic tests begin by extracting DNA and RNA. To achieve this, obtaining a suitable, reliable, and repeatable extraction method is of great importance. In this regard, optimization of the extraction of nucleic acids from the Iranian cyclamen plant (Cyclamen coum Miller) and the introduction and expression of housekeeping genes was performed. After collecting plant samples from the three organs of leaf, petal and hypocotyl, modified CTAB and SDS methods were used for DNA isolation and modified Trizol, CTAB-LiCl and RNX-Plus methods were used for RNA isolation. The quality of isolated DNA and RNA was checked by electrophoresis and their concentration was measured with nanodrop. The presence of 18S ribosomal, actin (ACT), tubulin (TUB) and elongation factor (EF-1a) gene fragments was investigated using polymerase chain reaction (PCR). Based on the results, the lowest DNA concentration was related to the CTAB method. The DNA concentration and quality of Iranian cyclamen leaf, petal and hypocotyl samples were higher in the modified SDS method than in the CTAB method. The isolation of DNA using the modified SDS method not only had a high purity but also had relatively high performance. According to quality analysis of the RNA isolated from leaf, petal, and hypocotyl samples using Trizol, CTAB-LiCl, and RNX-Plus protocols, all three strategies may be used to isolate RNA from Iranian cyclamen tissues. However, the Trizol method is superior to other methods in terms of high band resolution and RNA concentration. The production of cDNA from RNA isolated from three Iranian cyclamen tissues was successfully performed only by Trizol and RNX-Plus methods. Based on the results, cDNA made from RNA isolated by Trizol method had better quality. To check the efficiency of RNA samples in RT-PCR reaction and the expression of housekeeping genes, RT-PCR test was performed. Based on the results, the presence of the bands related to the housekeeping genes fragment in the electrophoresis stage confirmed the good quality of the produced cDNA and also indicated the high quality of the isolated RNA from the Trizol and RNX-Plus methods. RT-PCR results showed that the expression of actin, EF-1a, 18S and tubulin gene was positive in most Iranian cyclamen organs. Among housekeeping genes, tubulin and 18S genes, had higher band resolution and higher quality in all samples and tissues.

    Keywords: Nucleic acid, RNA extraction, Phenol-Chloroform, RNX, Tarizol, CTAB}
  • ساحل میلادی لاری، مهرداد احمدی*، عبدالکریم کاشی، امیر موسوی، یونس مستوفی

    : آزمایشی به صورت فاکتوریل به منظور تعیین تاثیر دز های مختلف پرتو گاما بر ماندگاری پس از برداشت و کیفیت چهار رقم پیاز ایرانی (سفید قم، سفید نیشابور، قرمز ری و قرمز اصلاحی) طی 120 روز نگهداری در دمای 15-10 درجه سانتی گراد و رطوبت نسبی 70 درصد انجام شد. اثرات متقابل رقم و دز پرتو به طور قابل توجهی بر جوانه زدن، کاهش وزن، سفتی، محتوای جامدات محلول (TSS) و محتوای قندهای احیاکننده و اسید پیروویک (PA) پیازها پس از 120 روز نگهداری تاثیر گذاشت. جوانه زدن پیازها بین 100-10 درصد بود. پیازهای تیمار نشده بیشترین جوانه زدن و کاهش وزن را نشان دادند. تابش پرتو گاما (30-150 گری) درصد جوانه زدن را به طور قابل توجهی محدود کرد و در نتیجه مانع از کاهش وزن پیازها شد. سفتی سوخ های تحت تابش (90-150 گری) بیشتر از سوخ های شاهد بود. کاهش وزن پیازها با جوانه زدن همبستگی مثبت و با سفتی پیاز همبستگی منفی داشت. تیمارهای پرتودهی (30-150 گری) باعث افزایش TSS و (60-150 گری) کاهش محتوای قند سوخ ها شد. سوخ های تیمار نشده در پایان آزمایش کمترین مقدار PA را داشتند. قرار گرفتن در معرض تابش 90-150 گری منجر به بالاترین محتوای PA در سوخ ها شد. به طور خلاصه، استفاده از 90 تا 120 گری پرتو گاما برای بهبود عمر پس از برداشت و کیفیت پیاز می تواند به عنوان یک دستورالعمل کلی در نظر گرفته شود.

    کلید واژگان: Allium cepa L, پرتودهی مواد غذایی, اسید پیروویک, قندهای احیاء, محتوای جامدات محلول}
    Sahel Miladi Lari, mehrdad ahmadi *, Abdolkarim Kashi, Amir Mousavi, Younes Mostofi

    A factorial experiment was conducted to determine the effects of different doses of gamma irradiation on postharvest life and quality of bulbs of four Iranian onion cultivars (White-Ghom, White-Neyshabour, Red-Ridge-Lump, Red-Ray-Corrugated) during 120 days storage at 10-15 °C and 70% relative humidity. Interactive effects of cultivar and irradiation dose significantly affected sprouting, weight loss, firmness, soluble solids content (TSS), and contents of reducing sugars and pyruvic acid (PA) of the bulbs after 120 days of storage. Sprouting of the bulbs ranged between 10-100%. The untreated bulbs represented the highest sprouting and weight loss. Gamma irradiation (30-150 Gy) significantly restricted sprouting percentage and consequently decreased weight loss of the bulbs. Firmness of the irradiated bulbs (90-150 Gy) was higher than the control bulbs. Weight loss of the bulbs was positively correlated with sprouting and it was negatively correlated with bulb firmness. The irradiation treatments increased TSS (30-150 Gy) and reducing sugar content (60-150 Gy) of the bulbs. The untreated bulbs had the lowest PA content at the end of the experiment. Exposure to 90-150 Gy irradiation doses resulted in the highest PA content in the bulbs. In summary, application of 90 to 120 Gy of gamma radiation for improving postharvest shelf life and quality of onions can be considered as a general guideline.

    Keywords: Allium cepa L pyruvic acid, reducing sugars, soluble solids, content sprouting}
  • ماریا میثاقی، فتانه یاری*، امیر موسوی، یونس مستوفی، حمیده افقی
    بنفشه آفریقایی یکی از گیاهان تجاری مهم با تنوعی بی نظیر در رنگ و شکل بوده که سبب محبوبیت این گیاه شده است. مهندسی ژنتیک می تواند یکی از تکنیک های پرکاربرد برای اصلاح گیاهان باشد. اگرچه این تکنیک خود مبتنی بر کشت بافت برای به ثمر نشاندن ایده های نو در ایجاد ارقام جدید است و بهینه سازی اندام زایی مستقیم به منظور پایه گذاری اصلاح گل بسیار حایز اهمیت است. به همین منظور بهینه سازی اندام زایی از بافت های برگ و دمبرگ دو رقم مختلف بنفشه آفریقایی به نام های Little Maya, Grinia با استفاده از روش سطح پاسخ مورد بررسی قرار گرفت. هدف پژوهش حاضر اثر محیط کشت پایه حاوی مقادیر مختلف تنظیم کننده های رشد شاملTDZ،BA وIAA بر القا اندام زایی مستقیم بود. تیمارهای اعمال شده در هر دو رقم، منجر به القای اندام زایی مستقیم در ریزنمونه های برگ و دمبرگ شدند. ریزنمونه برگ نسبت به دمبرگ پتانسیل اندام زایی بیشتری نشان داد اما پتانسیل اندام زایی مستقیم رقم ها در ریزنمونه های مشابه باهم با یکدیگر تفاوت چشمگیری نداشت. اگرچه مدل بهینه شده توسط نرم افزار و نتیجه تکرار آزمایشگاهی این مدل، بیانگر این است که ریزنمونه برگ رقم Little Maya بیشترین پتانسیل اندام زایی مستقیم را دارد و در این راستا محیط حاوی BA 0.05 mg/l+ TDZ 0.01 mg/l +IAA 1 mg/l در القای اندام زایی مستقیم در هر دو رقم موفق عمل نموده است. لذا باتوجه به مدل بدست آمده، به نظر می رسد میزان اندام زایی مستقیم ماحصل تعامل بین نوع هورمون های بکار رفته و نوع ریزنمونه بوده که می تواند همبستگی مستقیم با ژنوتیپ نیز نشان دهد.
    کلید واژگان: بنفشه آفریقایی, القای اندام زایی, کالوس, هورمون های گیاهی}
    Maria Missaghi, Fataneh Yari *, Amir Mousavi, Younes Mostofi, Hamideh Ofoghi
    Saintpaulia ionantha is one of the most important commercial plants with unique natures in color and shape, which has made it, the most popular indoor plant. Genetic engineering would be one of the most widely used technique for plant breeding. However, these methods are based on tissue culture techniques to create and produce novel cultivars. It also seems that successful direct regeneration constitutes the first step in developing strategies for genetic manipulation. This study aimed to determine the influence of MS medium supplemented with various amounts of growth regulators including IAA, BA, TDZ on direct organogenesis of two African violet cultivars (Little Maya and Grinia) from leaf and petiole explants, using the response surface methodology. Treatments applied on both cultivars resulted in the induction of regeneration in leaf and petiole explants. However, leaf explants showed more organogenic potential than petioles. The potential of direct organogenesis of both cultivars was not significantly different from each other in the same explants. Although, predicted model by historical data design which were investigated practically in 3 replications indicated that, the Little Maya cultivar had the highest percentage of direct organogenesis. In this regard, medium containing BA 0.05 mg/l + TDZ 0.01 mg/l + IAA 1 mg/l was more successful in inducing direct organogenesis in both cultivars. Therefore, according to the obtained model, it seems that the direct organogenesis potential was affected by the interaction of hormones and explants, which could also result from the genotypes.
    Keywords: African violet (Saintpaulia ionantha), organogenesis induction, Callus, Plant hormones}
  • Ghader Amani, Mansoore Shamili *, Ali Imani, Amir Mousavi, Hamed Rezai
    In almonds (Prunus dulcis), selecting salt-tolerant rootstocks and genotypes is an appropriate breeding strategy. In the present research, we grafted two commercial almond cultivars (‘Sahand’ and ‘TS3’) on the ‘GF677’ rootstock. Then, we monitored the impact of salinity (0.5, 6.5, and 8.5 dS m-1) on the morphological, physiological, and molecular characteristics of the Sahand and TS3 cultivars. The photosynthetic rate, chlorophyll (a, b and total) content, and carotenoid content decreased with increasing salinity levels in both cultivars, with the least decrease observed in TS3. Under a salinity level of 8.5 dS/m, Sahand exhibited the lowest growth (8.9 cm), leaf area (5412.5 mm2), Chla, Chlb, Chltotal and carotenoid contents (0.58, 0.15, 0.74 and 0.31 mg g-1FW, respectively). Additionally, Sahand had a Fm/Fv (0.75), N content (1.33%) and Ca, B, Mg, S, Fe and Zn values of 1654.55, 1.64, 395.28, 168.6, 10.35 and 3.05 mg L-1, respectively. Furthermore, Sahand exhibited the highest MDA level (25.17 nmol g-1FW), TFC (2.95 mg GA g−1FW), Na content (649.84 mg L-1) and Cl content (3.52%).  the lowest TFC (1.75 mg GA g−1FW) and the highest NHX1 expression, photosynthesis rate (5.65 μmol m-2 s-1), gs (0.1 mol m-1 s-1) transpiration rate (6.08 mmol m-1 s-1), Ca, S and B content (1903.63, 196.9 and 2.09 mg L-1, respectively) were belonged to TS3 under 0.5 dS/m salinity. Higher levels of Mg and Fe in the TS3 cultivar resulted in the stablization of photosynthetic pigments. Compared to Sahand, TS3 had a higher nitrogen content, and its greater NHX1 expression was a molecular confirmation of its salt tolerance.
    Keywords: Chlorophyll, growth, macro elements, Micro elements, NHX1 gene expression, Osmolites, Photosynthesis}
  • ارزریابی عملکرد دو پپتید نشانه از گیاهان اطلسی ((Petunia × hybrida و اسفناج (Spinacia oleracea) به منظورانتقال پروتئین های نوترکیب به اندامک کلروپلاست
    مرجان آدی گوزلی بهروز، امیر موسوی*، علی هاتف سلمانیان
    بمنظور انتقال پروتیین های نوترکیب به کلروپلاست در جهت عملکرد مناسب و یا ذخیره سازی آنها در این اندامک، می توان از توالی های پپتید نشانه مناسب بهره جست. در این مطالعه، در دو مرحله آنالیزهای بیوانفورماتیکی و سپس آزمایشگاهی، با هدف انتخاب پپتیدهای نشانه مناسب کلروپلاستی، ارزیابی روی توالی های مختلف انجام گرفت. بدین منظور ابتدا 160 پپتید نشانه از ژن ها و میزبان های مختلف جهت بررسی جایگاه برش، احتمال انتقال به کلروپلاست و بررسی آب گریزی آن ها مورد آنالیز بیوانفورماتیکی از جمله Targetp ، Tppred ، PredSL و  Protoscale  قرار گرفتند. ساختارهای ثانویه مربوط به رونوشت های آنها به در حالت اتصال به ژن گزارشگر نیز پیش بینی شدند. در ادامه، پپتیدهای نشانه ژن epsps از گیاه اطلسی (Petunia × hybrida) و نیز ژن pcaD از گیاه اسفناج (Spinacia oleracea) با طراحی آغازگرهای اختصاصی و انجام PCR از ژنوم آنها جداسازی و به توالی ژن گزارش گر gus متصل شدند. انتقال سازه ها به آگروباکتریوم تومفاشینس برای تراریختی گیاه مدل توتون (Nicotiana tabacum) صورت گرفت. پس از تراریختی و باززایی گیاهان تراریخت، سنجش کیفی و کمی β-glucuronidaseبه ترتیب به روش های رنگ آمیزی هیستوشیمیایی و فلوریمتری بر روی کلروپلاست های جداشده از برگ های سبز و جوان نشان داد که محصول ژن gus با موفقیت به کلروپلاست های گیاه هدفمند شده است و پپتید نشانه ژن epsps کارایی بالاتری را در انتقال پروتیین نوترکیب به کلروپلاست ها داشته است. توالی مذکور می تواند کاندیدی برای استفاده در گیاهان تراریخته تجاری در راستای هدفمندی محصول پروتیینی در ساختارهای پلاستیدی و نهایتا افزایش بروز صفت موردنظر و یا ذخیره سازی و خالص سازی بهتر محصولات پروتیینی باشد.
    کلید واژگان: کلروپلاست, پپتید نشانه, انتقال ژن, ارزیابی کمی و کیفی gus, SOEing PCR}
    Functional study of two signal peptides derived from Petunia (Petunia × hybrida) and Spinach (Spinacia oleracea) in order to transfer recombinant proteins to chloroplast
    Marjan Adigozali Behrouz, Amir Mousavi *, Ali Hatef Salmanian
    Signal peptides can be used to effectively transfer recombinant proteins into chloroplast for their appropriate functionality or storage. In this study, the efficiency of candidate signal peptides was studied using in silico and in vitro approaches. At first, the cleavage sites, ability to transport into chloroplast, and hydrophobicity of 160 signal peptides were analyzed by bioinformatic tools such as Targetp, Tppred, PredSL, and Protoscale. The secondary structures of the transcripts of reporter gene fused to these signal peptides were also predicted. In the next step, signal peptides of epsps and pcaD genes respectively from petunia (Petunia × hybrida) and spinach (Spinacia oleracea) were cloned using specific primers. β-glucuronidase gene and each signal peptides coding sequences were fused together. The resulting fragments were then transferred by Agrobacterium tumefaciens and over-expressed in tobacco (Nicotiana tabacum) as a model plant. Chloroplasts were extracted from transgenic young and green leaves and β-glucuronidase activity was assayed qualitatively by histochemical and quantitatively by fluorometric methods. The results showed that GUS was present and active in chloroplasts and the epsps signal peptide was more effective than pcaD in transferring the target protein. In conclusion, we can speculate that the identified signal sequences have the potential to transfer recombinant proteins into plastids for more effectiveness or for storage and extraction purposes.
    Keywords: Chloroplast, Signal Peptide, Gene Transformation, Spinacia oleracea, SOEing PCR}
  • Maria Missaghi, Fataneh Yari *, Amir Mousavi, Younes Mostofi, Hamideh Ofoghi
    In this study, the possibility of organogenesis of leaves and petioles of two African violet cultivars were evaluated using MS media containing various concentration of plant growth regulators (IAA (1,2 mg/l), BA (0.05, 0.1, 0.2, 0.5 mg/l), NAA (1, 2 mg/l), and TDZ (0.01 mg/l)). All experiments were arranged completely randomized design then data analyzed by one-way ANOVA, and means were separated using Duncan’s new multiple range test (𝑃 ≤ 0.01). Direct and indirect organogenesis from the whole leaf with petiole bases were observed in both cultivars. However, the separated leaf blade and petiole were unable to produce any organs. The organogenesis potential of cultivars was significantly different, although the medium containing BA (0.1 mg/l) + IAA (1 mg/l) showed the highest indirect organogenesis (90 %< in both cultivars). In contrast, the media containing BA 0.05 mg/l + TDZ 0.01 mg/l + IAA 2 mg/l and BA 0.05 mg/l + TDZ 0.01 mg/l + IAA 1 mg /l had more success on the induction of direct organogenesis. Therefore, the level of direct and indirect organogenesis appears to be dependent on the interaction between the PGRs and the explant type having a direct correlation with the genotype.
    Keywords: Saintpaulia ionantha, tissue culture, PGRs, regeneration, genotype}
  • Mahdieh Salehi Vozhdehnazari, Seyed Mohsen Hesamzadeh Hejazi *, Fatemeh Sefidkon, Marzieh Ghanbari Jahromi, Amir Mousavi
    A karyological study of five taxa (15 populations) of the genus Satureja L. from different geographic origins is presented. The haploid levels were different among species (n= 12 and 15). The work deals with chromosome number and morphometry. We found two of the usual basic chromosome numbers in this study for satureja species, x= 12 and x= 15. All populations were diploid and were located in 1B or 2B Stebbins classes. The karyotypic results showed the diversity among the species as mostly displayed median region (m) and submedian region (sm) and the chromosome lengths were determined between 0.60 µm in Satureja sahendica Bornm. (1041) to 2.27 µm in S. macrantha C.A.Mey. (3). Detailed karyotype analysis allows us to group the different populations and determine the relationships among them. It also pointed out the possibility of inter and intra-species cross to improve plants.
    Keywords: Chromosome evolution, Endemic satureja, karyology, Lamiaceae, Ploidy level}
  • داود نادری، امیر موسوی*، محمود لطفی

    یک پروتکل قابل اعتماد برای تراریختی و باززایی با واسطه آگروباکتری برای ارقام مهم تجاری خربزه بومی ایرانی (Cucumis melo L.) از جمله «ایوانکی»، «سمسوری» و «خاتونی» ایجاد شد. اثر محیط MS انتخابی حاوی غلظت های مختلف 6-بنزیلادنین (BA) 0، 0.5، 1 و 1.5 میلی گرم در لیتر) و 1 میلی گرم در لیتر اسید جیبرلیک (GA3) بر باززایی دمبرگ های لپه ای، هیپوکوتیل و لپه های حاصل از دانهال های 6 روزه رشد یافته در شرایط درون شیشه سه خربزه ایرانی مورد بررسی قرار گرفت. برای مراحل تراریختی، ابتدا حساسیت به غلظت های کانامایسین (Km) شامل 0، 50، 75، 100، 125 میلی گرم در لیتر، تاثیر سه سویه A. tumefaciens ، شامل GV3103، LBA4404، و AGL0، زمان تلقیح (5/0، 1، 5 و 30 دقیقه) و زمان همکشتی (24، 48 و 72 ساعت) روی زادآوری مستقیم اندام هوایی دمبرگ لپه ای رقم سمسوری بررسی شد. باززایی نوساقه ها از ریزنمونه های دمبرگ لپه ای بیشترین کارایی را از خود نشان داد. بخش های دمبرگ لپه ای «سمسوری» و «خاتونی» به ترتیب در 0/1 میلی گرم در لیتر و 5/1 میلی گرم در لیتر BA بیشترین پتانسیل را برای تکثیر شاخساره نشان دادند. در حالی که میزان باززایی «ایوانکی» به شدت کمتر بود. گیاهچه های تراریخته فرضی «سمسوری» گزینش شده در 100 میلی گرم در لیتر کانامایسین بر روی محیط کشت MS طویل شدن جوانه متشکل از 100 میلی گرم در لیتر در کانامایسین، 1/0 میلی گرم در لیتر BA، 1 میلی گرم در لیتر GA3 به اضافه 400 میلی گرم در لیتر CTX قرار داده شده و سپس به مدت دو هفته با موفقیت روی محیط کشت MS بدون تنظیم کننده رشد ریشه دار شدند. با استفاده از سنجش هیستوشیمیایی GUS همراه با غربالگری ژنومیک بوسیله PCR برای ژن های gusA و virG، کارایی تراریختی برای AGL0 ، ده درصد و در LBA4404 ، شش درصد برآورد شد.

    کلید واژگان: جوانه ها, اندام زایی, گزارش گر, انتقال, باززایی}
    Davood Naderi, Amir Mousavi *, Mahmoud Lotfi

    A reliable Agrobacterium-mediated transformation and regeneration protocol was developed for commercially important endemic Persian melon cultigens (Cucumis melo L.) comprising ‘Eyvanaki’, ‘Samsoori’, and ‘Khatooni’. The effect of selective Murashige and Skoog (MS) medium containing various concentrations of 6-benzyl adenine (BA) (0, 0.5, 1, and 1.5 mg l-1) and 1 mg l-1 Gibberellic acid (GA3) on regeneration of cotyledon, hypocotyl, and cotyledonary petioles derived from 6-day-old in vitro grown seedlings of the three Persian melons were investigated. For transformation, the sensitivity to kanamycin (Km) concentrations (0, 50, 75, 100, 125 mg l-1 ), the effect of three A. tumefaciens strains (GV3103, LBA4404, and AGL0), inoculation time (0.5, 1, 5, and 30 min), and co-cultivation time (24, 48, and 72 h) on direct shoot regeneration of cotyledonary petiole of ‘Samsoori’ were investigated. Shoot regeneration from cotyledonary petiole explants received the highest attention. Cotyledonary petiole segments of ‘Samsoori’ and ‘Khatooni’ treated respectively with 1.0 mg l-1 and 1.5 mg l-1 BA exhibited the highest potential for shoot multiplication; while the regeneration rate of ‘Eyvanaki’ was drastically lower. Putative transgenic ‘Samsoori’ plantlets selected in 100 mg l-1 Km were subcultured on elongation MS medium composed of 100 mg l-1 Km, 0.1 mg l-1 BA, 1 mg l-1 GA3 plus 400 mg l-1 CTX, and then successfully rooted on growth regulator-free MS medium for two weeks. Using histochemical GUS assay along with genomic PCR screening for GusA and VirG genes, the efficiency of transformation was estimated to be 10% for AGL0 and 6% in LBA4404.

    Keywords: AGL0, Cucumis melo, Multiple buds, organogenesis, Reporter genes, Transgenic plant}
  • فاطمه افشارنیا، سید امیر موسوی*

    بذر از دیدگاه کشاورزی نقطه آغاز تمامی فعالیت های منجر به تولید محصول است. امروزه ماشین های کشاورزی از جمله مهم ترین منشا تولید آلاینده های زیست محیطی در مزارع مکانیزه می باشند و آلودگی ناشی از آن ها می تواند سبب اختلال در فرآیند جوانه زنی و رشد گیاهان گردد. بنابراین علاوه بر انواع چالش های محیطی، مانند تنش های شوری و خشکی، آلودگی های حاصل از ماشین های کشاورزی نیز می تواند به جوانه زنی و رشد گیاه چه به عنوان یک تهدید اضافه شود. رویکرد تیوری خاکستری به عنوان یکی از تیوری های جدید ریاضی برگرفته از مجموعه خاکستری جهت اولویت بندی خطر ها بکار می رود و هدف آن حل مسیله، اولیت بندی و کمک به تصمیم گیری است. مطالعه حاضر در سال 1398 با هدف بررسی اثر آلاینده های ناشی از اگزوز تراکتور در سه عمر مختلف اولیه، عمر مفید و فرسودگی بر جوانه زنی بذر کلزا در دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان اجرا گردید. این آزمایش به صورت فاکتوریل بر پایه طرح کاملا تصادفی و در سه تکرار انجام گرفت. تیمارهای آزمایش، شامل سه دوره عمر مختلف تراکتور شامل عمر اولیه، عمر مفید و فرسودگی به عنوان عامل اول، و تیمار مدت زمان های قرار گرفتن بذرها در معرض آلودگی خروجی از اگزوز تراکتور شامل صفر، 30، 60، 90 و 120 دقیقه به عنوان عامل دوم در نظر گرفته شد. اگر γ(x_0,x_i)≥γ(x_0,x_j) که نشان دهنده درجه ارتباط بین x_i و x_0 می باشد، بزرگ تر از x_j و x_0 باشد؛ در این صورت، ارتباط بین علل بالقوه و مقادیر بهینه فاکتورهای تصمیم را نشان می دهد. با این مفهوم که درجه ارتباط بزرگ تر اثر کوچک تری دارد. بنابراین، افزایش رتبه درجه ارتباط اولویت خطر دلایل بالقوه را نشان می دهد که بایستی بهبود یابند. برای آنالیز خطر آلاینده های گازی خروجی از اگزوز تراکتور، تیمار با کمترین ضریب ارتباط خاکستری، بایستی بالاترین اولویت خطر را نشان دهد. به طوری که بیشترین درجه ارتباط خاکستری، بهترین حالت تیمار بذر را مشخص می کند. نتایج نشان داد که بیشترین مقدار طول ریشه چه و ساقه چه، ضریب سرعت جوانه زنی، شاخص جوانه زنی، شاخص سرعت جوانه زنی و بنیه بذر کلزا از تیمار عدم وجود آلودگی ناشی از اگزوز بدست آمد؛ در حالی که کمترین میزان این صفات مربوط به تیمار قرار گیری در معرض آلودگی به مدت 120 دقیقه و تراکتور فرسوده بود. برعکس، میزان پروتیین بذر و فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدانی کاتالاز و پرکسیداز با افزایش فرسودگی تراکتور و مدت زمان قرار گرفتن در آلودگی افزایش نشان داد. محاسبات انجام شده بر اساس تیوری خاکستری نشان داد که تیمار با رتبه کمتر، تیمار مورد ترجیح و دارای خطر کمتر با توجه به تمامی شاخص های رشد در نظر گرفته شده برای بذر کلزا می باشد که در این مطالعه، مدت زمان صفر برای عمرهای مختلف تراکتور تیمار بدون خطر شناخته شد.  بنابراین احتمال می رود که افزایش زمان در معرض گیری با آلاینده اگزوز تراکتور به تدریج موجب کاهش آستانه تحمل بذر و مسمومیت آن گردد. تیوری خاکستری مشخص ساخت که مدت زمان قرار گرفتن در معرض آلودگی از میزان آلودگی مهم تر است. شدت تاثیرپذیری بسته به میزان آلودگی نیز متفاوت بود. حساسیت بذر کلزا به آلاینده های ناشی از تراکتور فرسوده بیشتر از تراکتور نو بود. حساسیت این بذرها لزوم تعویض ماشین های فرسوده، سرویس و تعمیر به موقع تراکتورها، استفاده از سوخت پاک و بکارگیری تراکتورهای نو یا با دوره عمر مفید را دو چندان می کند.

    کلید واژگان: آلودگی, بذر, تراکتور}
    Fatemeh Afsharnia, Amir Mousavi *

    Introduction:

    From an agricultural point of view, seeds are the starting point of all activities that lead to crop production. Today, agricultural machinery is one of the most important sources of environmental pollutants in mechanized farms and pollution caused by them can disrupt the germination process and plant growth. Therefore, in addition to a variety of environmental challenges, such as salinity and drought stress, contamination from agricultural machinery can also be added to germination and seedling growth as a threat. 

    Materials and Methods:

    Based on the gray correlation coefficient between the comparison series and the standard series, a relative series can be created. If γ (x_0, x_i) ≥γ (x_0, x_j), which indicates the degree of correlation between x_i and x_0, is greater than x_j and x_0; In this case, the relationship between potential causes and the optimal amounts of decision factors is shown. In the sense that a larger degree of connection has a smaller effect. Therefore, increasing the degree of prioritization of risk indicates the potential reasons that need to be improved. To analyze the risk of gaseous pollutants leaving the tractor exhaust, the treatment with the lowest gray correlation coefficient should show the highest risk priority. So that the highest degree of gray connection determines the best state of seed treatment. The aim of this study was to investigate the effect of pollutants from tractor exhaust in three different initial life, useful life and burn on canola seed germination. This factorial experiment was performed based on a completely randomized design with three replications. Experimental treatments include three different tractor life periods including initial life, useful life and wear as the first factor, and treatment for the duration of seeds exposed to tractor exhaust pollution including zero, 30, 60, 90, and 120 minutes as the factor. The second was considered. 

    Results and Discussion:

    The results showed that the highest values of root and stem length, germination rate coefficient, germination index, germination rate index and canola seed vigor were obtained from the absence of exhaust pollution; while the lowest amount of these traits was related to the treatment of exposure to contamination for 120 minutes and worn tractor. Conversely, the amount of seed protein and the activity of antioxidant enzymes catalase and peroxidase increased with increasing tractor wear and duration of contamination. Calculations based on gray theory showed that the treatment with a lower rank is the preferred treatment and has a lower risk according to all growth indices considered for rapeseed. In this study, zero time for different tractor lives without treatment, the risk was identified. Therefore, it is likely that increasing the exposure time to the tractor exhaust contaminant will gradually reduce the seed tolerance and poisoning threshold. 

    Conclusion:

    Gray's theory has shown that the duration of exposure is more important than the amount of contamination. The severity of exposure also varied depending on the degree of infection. Rapeseed seeds were more sensitive to contaminants from worn-out tractors than new tractors. The sensitivity of these seeds doubles the need to replace worn-out machines, service and repair tractors in a timely manner, use clean fuel, and use new or serviceable tractors.

    Keywords: Pollution, Seed, Tractor}
  • مهناز عبدالهی، فاطمه سفیدکن*، محسن کلاگری، امیر موسوی
    در این تحقیق به منظور مقایسه مشخصات ریخت شناسی، عملکرد تولید الیاف ساقه، روغن و اسانس شاهدانه، بذر دو اکوتیپ بومی و یک رقم خارجی (Fedora17) به همراه نتاج آن (Fedora17-2) در سه ایستگاه تحقیقاتی البرز، چالکی و صفرابسته کشت شدند و خصوصیات ریخت شناسی و فیتوشیمیایی آنها مطالعه شد. بیشترین ارتفاع و بالاترین درصد ماده خشک ساقه مربوط به رقم فدورا17 و نتاج آن بود، در حالی که گسترده ترین تاج پوشش، قطورترین ساقه را اکوتیپ های بومی ایران داشتند. محتوی روغن دانه ها از 88/18 درصد در نتاج فدورا تا 09/40 درصد در اکوتیپ یزد متغیر بود. اکوتیپ های بومی فارس (820 کیلوگرم در هکتار) و یزد (830 کیلوگرم در هکتار)، بالاترین عملکرد روغن را داشتند. ارتفاع گیاهان از 7/99 سانتی متر در ایستگاه صفرابسته تا 5/197 سانتی متر در ایستگاه البرز متغیر بود. عملکرد تولید الیاف ساقه از 1569 کیلوگرم در هکتار (ایستگاه صفرابسته) تا 13991 کیلوگرم در هکتار (ایستگاه البرز) متغیر بود. همچنین شاهدانه های کشت شده در ایستگاه البرز از نظر خصوصیات ریخت شناسی، زایشی و عملکرد تولید ساقه نسبت به سایر ایستگاه ها به طور معنی داری برتری داشتند. عملکرد اسانس در هر بوته از 35/11 کیلوگرم (ایستگاه چالکی) تا 39/36 کیلوگرم (ایستگاه البرز) متغیر بود. بنابراین کشت شاهدانه در منطقه البرز با میانگین تولید13991 کیلوگرم در هکتار الیاف، 2/2 تن در هکتار اسانس و 1110 کیلوگرم در هکتار روغن بذر قابل توصیه است. رقم های خارجی با بلندترین ساقه و بیشترین درصد ماده خشک ساقه برای تولید الیاف مناسب می باشند. همچنین خصوصیات ریخت شناسی گیاه مادری (فدورا17) در نتاج آن حفظ شد.
    کلید واژگان: شاهدانه, عملکرد الیاف ساقه, اسانس, روغن دانه ها, صفات ریخت شناسی, ‏Cannabis sativa L.‎}
    Mahnaz Abdollahi, Fatemeh Sefidkon *, Mohsen Calagari, Amir Mousavi
    In this study, in order to investigate morphological characteristics, yield of fiber, essential oil and seed oil yields, seeds of two native ecotypes from Iran and one foreign variety (Fedora17) with its progenies (Fedora17-2) were cultivated in research fields of three locations (Gilan, Golestan, and Alborz province) in Iran and their morphological and phytochemical characteristics were studied. The greatest height and shoot dry matter were observed in Fedora17 and its progenies while the widest coverage and thickest stem was observed in the native ecotypes of Iran. Also, the oil content varied from 18.88% in Fedora17-2 to 40.09 % in Yazd. The highest oil yield was observed in native ecotype of Fars (820 kg ha-1) and Yazd (830 kg ha-1). Plant height fluctuated from 99.7 cm in Safrabasteh to 197.5 cm in Alborz. Fiber yield ranged from 1569 kg ha-1 in Safrabasteh to13991 kg ha-1 in Alborz. The hemp cultivated in Alborz, in terms of morphological and reproductive properties and fiber yield was significantly better compared to the other stations. The oil yield per plant was 11.35 kg in Chalaky station to 36.39 kg in Alborz  station. Therefore, cannabis cultivation is recommended in Alborz with average production of 13991 kg ha-1 fiber, 2.2 t ha-1 essential oil and 1110 kg ha-1 seed oil. The foreign cultivars with the tallest stem and the highest percentage of stem dry matter were proper for fiber production. In addition, the morphological characteristics of Fedora 17 were also preserved in its progeny.
    Keywords: Cannabis sativa L, Hemp, fiber yield, Essential oil, Oil, morphological characteristics‎}
  • Shahrokh Garousi, Soodabeh Jahanbakhsh Godehkahriz *, Kasra Esfahani, Tahmineh Lohrasebi, Amir Mousavi, Ali Hataf Salmanian, Mahsa Rezvani, Maryam Moein
    Background
    Although epidermal growth factor (EGF) controls many crucial processes in the human body, it can increase the risk of developing cancer when overexpresses.
    Objectives
    This study focused on detecting cancer-associated genes that are dysregulated by EGF overexpression.
    Materials and Methods
    To identify differentially expressed genes (DEGs), two independent meta-analyses with normal and cancer RNA-Seq samples treated by EGF were conducted. The new DEGs detected only via two meta-analyses were used in all downstream analyses. To reach count data, the tools of FastQC, Trimmomatic, HISAT2, SAMtools, and HTSeq-count were employed. DEGs in each individual RNA-Seq study and the meta-analysis of RNA-Seq studies were identified using DESeq2 and metaSeq R package, respectively. MCODE detected densely interconnected top clusters in the protein-protein interaction (PPI) network of DEGs obtained from normal and cancer datasets. The DEGs were then introduced to Enrichr and ClueGO/CluePedia, and terms, pathways, and hub genes enriched in Gene Ontology (GO) and KEGG and Reactome were detected.
    Results
    The meta-analysis of normal and cancer datasets revealed 990 and 541 new DEGs, all upregulated. A number of DEGs were enriched in protein K48-linked deubiquitination, ncRNA processing, ribosomal large subunit binding, and protein processing in endoplasmic reticulum. Hub genes overexpression (DHX33, INTS8, NMD3, OTUD4, P4HB, RPS3A, SEC13, SKP1, USP34, USP9X, and YOD1) in tumor samples were validated by TCGA and GTEx databases. Overall survival and disease-free survival analysis also confirmed worse survival in patients with hub genes overexpression.
    Conclusions
    The detected hub genes could be used as cancer biomarkers when EGF overexpresses.
    Keywords: Biomarker, cancer, EGF, Meta-analysis, RNA-Seq}
  • بنفشه جمشیدی، مرضیه قنبری جهرمی*، امیر موسوی

    تحقیق حاضر با هدف بررسی راندمان ریزغده زایی سه رقم سیب زمینی (Solanum tuberosum L.) تحت تنش اسمزی در شرایط درون شیشه به صورت طرح فاکتوریل با 3 تکرار انجام شد. بذر سه رقم سیب زمینی (آگریا، ساوالان، HPS-II/67) در محیط MS کشت شدند که پس از پرآوری گیاهچه ها به محیط های حاوی نه تیمار ایجاد کننده تنش اسمتیک شامل پلی اتیلن گلایکول در چهار غلظت (003/0، 006/0، 009/0 و 012/0 مولار) و سوربیتول در چهار غلظت (1/0، 2/0، 3/0 و 4/0 مولار) و یک محیط بدون عامل اسمتیک (شاهد) منتقل شدند. گیاهچه های رشد یافته در شرایط غیرتنش (شاهد) نسبت به گیاهچه های تحت تیمار تنش از نظر صفات تعداد برگ، طول نوشاخه و ضریب پرآوری از مقادیر بالاتری برخوردار بودند. رقم آگریا نسبت به بقیه ارقام در شرایط تنش ویژگی های رشدی بهتری نشان داد. بالاترین درصد خشکیدگی در تیمار 012/0 مولار پلی ‍ اتیلن گلایکول در رقم ساوالان مشاهده شد. درصد ریز غده زایی در هر سه رقم با ایجاد تنش جزیی (003/0 مولار پلی اتیلن گلایکول) نسبت به شاهد تا حدودی افزایش و در سطوح بالاتر تنش این صفت کاهش پیدا کرد. بیشترین درصد ریز غده زایی در رقم آگریا و غلظت 003/0 مولار پلی اتیلن گلایکول بدست آمد. بررسی خصوصیات فیزیولوژیکی نشان داد که میزان تولید پرولین، آنزیم کاتالاز و سوپراکسید دیسموتاز (SOD) با ایجاد تنش نسبت به شاهد افزایش یافت. همچنین میزان کلروفیل کل با ایجاد تنش نسبت به شاهد کاهش پیدا کرد. به طور کلی بر اساس نتایج بدست آمده بیشترین میزان ریزغده زایی و زنده مانی به ترتیب در ارقام آگریا و HPS-II/67 و بیشترین وزن ریز غده در رقم HPS-II/67 مشاهده شد.

    کلید واژگان: تنش اسمزی, پلی اتیلن گلایکول, سوربیتول, سیب زمینی}
    Banafsheh Jamshidi, Marzieh Ghanbari Jahromi *, Amir Mousavi
    Background and Objectives

    Potato (Solanum tuberosum L.) is one of the most important crops worldwide. It is vegetatively propagated using pieces or whole potato tubers, but a virus infection causes crop reduction to almost a half or even one third, which varies from place to place and from season to another. Micropropagation is the practice of rapidly multiplying stock plant material to produce many progeny plants, using modern plant tissue culture methods. Microtuberization in potato needs the right interaction between several factors such as cyto, sucrose and osmotic stress. The purpose of present study was to investigate microtuberization efficiency of three potato cultivars under osmotic stress and in vitro conditions.

    Materials and Methods

    This experiment was carried out based on completely randomized design (CRD) in three replications. Potato seeds of three cultivars (Agria, Savalan and HPS-II/67) were cultured on Murashige and Skoog (MS) medium. After proliferation, plantlets were transferred to the media containing nine treatments with polyethylene glycol hydrogel (PEG) at four levels (0.003, 0.006, 0.009, 0.012 M), sorbitol at four levels (0.1, 0.2, 0.3, and 0.4 M). For this purpose, potato quality, microtuberization percentage, proline concentration, chlorophyll content, and Catalase (CAT) and superoxide dismutase (SOD) activities were measured.

    Results

    The results showed that plantlets grown under non-stressed conditions (control) possessed higher rates of leaf number, new shoot length and proliferation index compared to the under stressed conditions. Agria cultivar presented better growth characteristics under stressed conditions compared to other experimental cultivars. The highest potato destruction was observed at 0.012 M PEG in Savalan cultivar followed by 0.4 M sorbitol in all cultivars. Microtuberization percentage increased in all three cultivars by stress conditions, in which it increased with progressing in stress levels. The greatest percentage of microtuberization was obtained from Agria cultivar at 0.003 M PEG. Compared to the control, proline concentration, and also CAT and SOD activities increased under stress conditions. Moreover, total chlorophyll content decreased under the stress conditions in comparison to the control.

    Discussion

    Generally, based on the results, maximum rates of microtuberization and viability were observed in Agria followed by HPS-II/67, and the highest microtuber weight was obtained in HPS-II/67 cultivar. When plants are faced to stress conditions like osmotic stress, free radicals such as reactive oxygen species (ROS) increases. On the other hand, plants use different strategies to scavenge the generated ROS. The reduction of chlorophyll content and increases of antioxidant enzyme activities are due to increase of ROS under osmotic stress conditions. At slight stress conditions, potato plants utilize the strategy to generate more tuber. Therefore, the lower concentrations of PEG can be introduced as a stimulator of microtuber.

    Keywords: Osmotic stress, Polyethylene glycol, Sorbitol, Potato}
  • کاظم آقایی، عبدالله قاسمی پیربلوطی*، امیر موسوی، حسنعلی نقدی بادی، عبدالمحمد محنت کش

    به منظور بهبود عملکرد گیاهان دارویی و معطر، استفاده از مواد طبیعی نظیر اسیدهای آمینه، در حال افزایش است که در همین راستا اطلاعات اندکی در خصوص اثرات جداگانه آن ها و در ترکیب با سایر منابع کودی در دسترس است. به منظور بررسی اثر کودهای مختلف و محلول پاشی فنیل آلانین بر عناصر تغذیه ای زوفا، آزمایشی در دو سال متوالی 96-1395 و 97-1396 به صورت اسپلیت پلات در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار در مزرعه تحقیقاتی در شهرکرد اجرا شد. عوامل مورد بررسی شامل تیمارهای کود شیمیایی (NPK)، کود حیوانی، ورمی کمپوست و کود زیستی قارچ میکوریزا (قارچ های جنس Glomus) در کرت های اصلی و محلول پاشی ال- فنیل آلانین (در سه سطح: صفر، 500 و 1000 mg/L) در سه مرحله پاشش در کرت های فرعی بودند. نتایج نشان داد که کاربرد کودها همراه محلول پاشی ال - فنیل آلانین در سطوح 500 و 1000 میلی گرم در لیتر منجر به افزایش معنی دار غلظت اغلب عناصر تغذیه ای شامل نیتروژن (N)، فسفر (P) و پتاسیم (K) و ریزمغذی شامل آهن (Fe)، روی (Zn)، منگنز (Mn) و مس (Cu) موجود در برگ نسبت به شاهد گردید و در این میان، کاربرد کود های قارچی و ورمی کمپوست و تیمارهای تلفیقی ال - فنیل آلانین + کود قارچی و فنیل آلانین + ورمی کمپوست، بیشترین تاثیر را در افزایش غلظت های N، P، K، Fe، Zn، Mn و Cu داشتند. در مجموع مشخص شد که کاربرد کودهای ارگانیک با محلول پاشی ال - فنیل آلانین در غلظت mg/L1000 ، نقش موثری در بهبود عناصر تغذیه ای گیاه باغی زوفا و عملکرد ماده خشک اندام هوایی آن دارد.

    کلید واژگان: گیاه دارویی, اسیدهای آمینه, ورمی کمپوست, قارچ میکوریزا, Hyssopus officinalis}
    Kazem Aghaie, Abdollah Ghasemi Pirbalouti *, Amir Mousavi, Hassanali Naghdi Badi, Abdolmohammad Mehnatkesh
    Introduction

    In order to improve the quantity and quality of medicinal plants, the use of natural substances such as amino acids have increased in recent years, which provide little information on their individual effects, as well as interaction with other fertilizer sources.

    Material and Methods

    To investigate effect of different fertilizers and the foliar application of L-phenylalanine on nutritional elements of hyssop [Hyssopus officinalis L. subsp. angustifolius (Bieb.)], an experiment was done in a randomized complete block design with three replications during two consecutive years of 2016 and 2017 in a field experiment at the experimental field, Shahrekord. The investigated factors were fertilizer treatments including chemical fertilizer (NPK), organic fertilizers (animal and vermicompost) and a bio-fertilizer, mycorrhizal fungus (including Glomus genus) in the main plots and L-phenylalanine (at three levels: 0, 500, and 1000 mg/L) in sub plots.

    Results and Discussion

    Results indicated that the application of different fertilizers along L-phenylalanine at two studied concentrations (500 and 1000 mg/L) led to significant increase in the concentration of most nutrient elements including nitrogen (N), phosphorus (P), potassium (K) and micro elemts [Iron (Fe), zinc (Zn), manganese (Mn) and copper (Cu)] in the leaf were compared to the control. Among them, the application of fungal and vermicompost fertilizers, L-phenylalanine × fungal fertilization, and phenylalanine × vermicompost had highest effects on the increase of these traits. In conclusion, the results indicated that the application of organic fertilizers along with L-phenylalanine spraying at 1000 mg/L level has a beneficial role in the improvement of nutritional elements and dry matter yield of H. officinalis L. subsp. angustifolius (Bieb.).

    Keywords: Medicinal plant, Amino acids, Vermicompost, mycorrhizal fungus, Hyssopus officinalis L}
  • شاهرخ گروسی، سدابه جهانبخش گده کهریز*، کسری اصفهانی، تهمینه لهراسبی، امیر موسوی، علی هاتف سلمانیان
    هدف

    گیاهان کارآیی بسیاری در تولید پروتیین های ارزشمند دارویی دارند. عامل رشد اپیدرمی انسانی، اثرات بی شماری بر روی سیستم های مختلف سلولی داشته و نقش مهمی در بهبودی زخم ها و اندام زایی دارد. هدف از پژوهش اخیر ساخت سازه های ویژه تک لپه ای ها برای انتقال بعدی ژن عامل رشد اپیدرمی و تولید انبوه آن در یک گیاه تک لپه ای خودگشن یعنی جو بود. گیاه جو با داشتن عملکرد پروتیینی بالا و دگرگشنی بسیار پایین، میزبان ایده الی برای تولید عامل رشد اپیدرمی است.

    مواد و روش ها

     به منظور دسترسی به بالاترین میزان بیان عامل رشد اپیدرمی در بذر جو، توالی ژن موردنظر بر اساس ترجیح کدونی گیاه جو با نرم افزار COOL بهینه و همراه با پیش بر اختصاصی دی هوردیین سنتز شد. همچنین توالی راهنمای پپتیدی اندامک ذخیره ای پروتیین در بذر جو در ابتدای ناحیه رمزکننده قرار گرفت. پس از دریافت قطعه سنتزی در ناقل pUC57Hvorhegf، آن قطعه توسط آنزیم های SacI و HindIII از ناقل جدا و در پلاسمید pBI121 همسانه سازی شد. در گام بعدی همسانه سازی، برای درج توالی ژن موردنظر در ناقل pGH215، به دلیل نبود جایگاه های شناسایی یکسان در این ناقل ها، از ناقل حدواسط pBI121Gus-12 استفاده شد. بعد از برش ناقل همسانه سازی و pBI121Gus-12 توسط آنزیم های SacI و KpnI، همسانه سازی قطعه موردنظر در pBI121Gus-12 انجام گرفت. در گام آخر، ناقل pBI121G-12Hvorhegf و pGH215 با آنزیم های KpnI و SalI هضم شده و توالی موردنظر در مرز راست T-DNA و قبل از پایان دهنده NOS قرار گرفت.

    نتایج

    با استفاده از آزمون کلونی پی سی آر، الگوی هضم آنزیمی و توالی یابی با آغازگرهای رفت وبرگشت، درستی همسانه سازی و تولید ناقل های pBI121Hvorhegf واجد ژن hegf با نشانگر کانامایسین و pGH215Hvorhegf واجد ژن hegf با نشانگر هیگرومایسین، مناسب برای انتقال ژن در تک لپه ای ها تایید شد.

    نتیجه گیری

     ناقل بیانی نوترکیب pGH215 تغییریافته دارای کاست ژنی موردنظر همراه با نشانگر هیگرومایسین می تواند برای انتقال ژن موردنظر در تک لپه ای ها و بیان پروتیین نوترکیب در اندام ذخیره ای بذر استفاده شود.

    کلید واژگان: اگروباکتریوم تومه فاشینس, تک لپه ای, همسانه سازی}
    Shahrokh Garousi, Sodabeh Jahanbakhsh Godehkahriz *, Kasra Esfahani, Tahmineh Lohrasebi, Amir Mousavi, Ali Hatef Salmanian
    Objective

    Plants are very efficient in producing valuable pharmaceutical proteins. Human epidermal growth factor (hEGF) has numerous effects on various cellular systems, including wound healing, organogenesis, and so on. The present study was carried out with the aim of constructing monocotyledonous-specific vectors for hegf insertion and mass-production in a self-pollinated crop, barley, afterwards. This crop plant, with high protein yield and very low cross-pollination, is an ideal host for the production of epidermal growth factor.

    Materials and methods

    The hegf sequence was optimized by COOL software, based on the codon preference of the host plant, and synthesized with a specific promoter, D-hordein. The encoding sequence of signal peptide targeting protein storage organelles in barley seeds was included at the beginning of the encoding area. The synthesized gene cassette was isolated from the cloning vector pUC57Hvorhegf by SacI and HindIII and cloned in pBI121. To insert the gene cassette of interest into pGH215, due to the lack of similar restriction sites in pUC57Hvorhegf and pGH215, the intermediate vector, pBI121Gus-12, was applied. After digesting pUC57Hvorhegf and pBI121Gus-12 by SacI and KpnI, the sequence of interest was incorporated into pBI121Gus-12. Finally, the recombinant pBI121Gus-12 and pGH215 were digested with KpnI and SalI, and the gene cassette was cloned at the right border of T-DNA, behind the NOS terminator.

    Results

    Cloning accuracy and constructing pBI121Hvorhegf and pGH215Hvorhegf vectors bearing kanamycin and hygromycin, respectively, suitable for monocotyledons-crop transformation was confirmed by colony PCR, digestion pattern, and sequencing with forward and reverse primers.

    Conclusions

    The modified recombinant expression vector pGH215 with the gene of interest carrying the hygromycin gene cassette, giving a high level of ability to select transformed explants, can be used to transfer desired genes in monocotyledons and express those genes in protein storage organelles.

    Keywords: Agrobacterium tumefaciens, cloning, Monocotyledons}
  • Ali Saghafian Larijani, Hassan Hajnajari *, Mahmood Khosrowshahli, Amir Mousavi
    The influence of five open-pollinated seedling rootstocks and two marketed seed lots (as the controls) were assessed on pomological, biochemical, and organoleptic traits of four apple cultivars (Malus×domestica Borkh.), grown in Meshkin Abad Horticultural Research Station (Karaj, Iran). The maternal parents, as the three crabs 'Zinati', 'Morabbaei', and 'Azayesh' along with the standard trees 'Northern Spy' and 'Golden Karaj' were selected as the seed sources through a breeding program in 2003. The present study was achieved on the 4- and 5-year-old trees, spindle formed, planted in 3.5×4 m, and drop irrigated in 28 combinations (four cultivars onto 5+2 rootstocks, distributed in four distinct parcels). The investigation was carried out on pomological traits based on UPOV scales, as well as biochemical and organoleptic traits. Higher fruit length, diameter, and weight were recorded for the cultivars grafted onto 'Northern Spy', followed by 'Zinati' and 'Morabbaei' seed sources. 'Zinati' F1 crab seedling induced higher flesh firmness combined with the four scions. The crab seedling rootstocks 'Zinati' followed by 'Azayesh' caused a higher organoleptic scent, flavor, and sweetness attributed by the panel members. Moreover, pH, TA, and TSS were influenced by scion, while rootstock effect was negligible. These results indicated that F1 half-sib seedling rootstocks positively influenced the pomological and organoleptic traits and improved the fruit's quality.
    Keywords: Crab apple, fruit quality, Genetic improvement, Pomology, Seed rootstock}
  • Elham Faryabi, Mitra Noori *, Amir Mousavi, Aliashraf Jafari
    The study presents flavonoids compounds patterns of thirty two Lamiaceae (Mint) taxa from Oshtorankoh located on Zagros Mountains, Iran for understanding flavonoids role in mint chemotaxonomy and their usages as food additive, edible, spices and medicine. This is a novel report of some Iranian Mint taxa flavonoids using two-dimensional paper chromatography and thin layer chromatography methods. Results showed all of the studied taxa contained flavone C-&C-/O-glucosides and flavonoid sulphates. Eight taxa had aglycones while the rest lacked. Quercetin was found in all of taxa except Lamium album ssp. crinitum and Nepeta persica. Stachys setifera had not myricetin while others had. Rhamnetin, tricin and morin were not detected in all taxa exceptional Salvia brachycalyx and Salvia staminea those had. Kaempferol was found in all taxa except Ajuga chamaecistus, Lamium amplexicaule var. amplexicaule, Nepeta persica and Stachys pilifera. All of taxa except six species had luteolin. These results showed aerial parts flavonoids compounds variation in studied taxa can be useful for studying relationships within relatively narrow taxonomic limits, e. g. at the species and genus levels and their importance in chemotaxonomic surveys of mint genera. Also flavonoids compounds presence in studied taxa increase their quality and antioxidant activity as edible, spices and medicinal plants.
    Keywords: Chemosystematics, mint, Polyphenolic, Compounds, Zagros}
  • Ali Imani *, Ghader Amani, Mansoore Shamili, Amir Mousavi, Rezai Hamed, Mousa Rasouli, Pedro José Martínez García

    Phenotypic and genetic diversity are mandatory aspects to allow future breeding in fruit trees. This work was aimed to study the genetic diversity and heritability of important phenological traits in several almond genotypes. The seedlings were planted in randomized complete block design with 3 replications (two trees in each replication). Phenological traits including flower size, petal length, petal width, sepal length, sepal width, pistil length, pistil thickness were evaluated. Furthermore, number of stamens, first flowering, 10% flowering, 50% flowering, 90% flowering, date of flowering among 33 selected almond cultivars and genotypes were also evaluated using almond descriptors during 27 February to 29 March 2017. The results showed the existence of genetic variation among the studied cultivars and genotypes. A great phenotypic variation was observed for pistil length, petal width and flowering time. The exact and extended characterizations of all the new materials of almond could provide breeders new opportunities to develop future crosses and to obtain more resistant seedlings that can be better adapted to extreme and changing weather conditions in this area and in other regions of the world.

    Keywords: compost, almond, Flowering, Genotypic diversity, Phenotypic diversity}
  • سعید سهیلی وند*، امیر موسوی، محمدرضا صفرنژاد

    انتقال ژن به لیموترش (Citrus aurantifolia L.)، به عنوان یکی از گیاهان چوبی سرسخت، چالش برانگیز است. تاکید این مطالعه بر عوامل مهمی است که در افزایش موفقیت انتقال ژن و کاستن شیمری شدن شاخساره های تراریخته، موثر هستند. ریزنمونه های اپی کوتیل و میانگره، با سه سویه اگروباگتریوم (LBA4404، GV3101 و GV3850)، حامل پلاسمیدهای pBI121 و pCAMBIA3301 دارای ژن گزارشگر بتا گالاکتوزیداز (GUS)، جهت بررسی عوامل دخیل در انتقال ژن، استفاده شدند. فاکتورهای اصلی همچون OD600 اگروباکتریوم (3/0، 5/0 و 1)، زمان تلقیح ریزنمونه (5 ثانیه، 10 دقیقه و 30 دقیقه)، مدت هم کشتی (2 و 3 روزه) و انتخاب نوع و میزان عامل انتخابگرهای فسفینوترایسین (1، 3، 5 و 10 میلی گرم در لیتر) و کانامایسین (25، 50، 75 و 100 میلی گرم در لیتر) ارزیابی شدند. بدین منظور، بازدهی تراریختی با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و میزان حالت شیمری شاخساره های تراریخته به کمک آزمون هیستوشیمیایی GUS، تایید گردیدند. نتایج نشان داد که اگروباکتریوم سویه LBA4404، با OD600 5/0 و زمان تلقیح پنج ثانیه برای اپی کوتیل و 10 دقیقه برای میانگره با هم کشتی دو روزه، مناسب ترین تیمارها برای هر دو ریزنمونه بودند. فراوانی انتقال ژن بین 93/0% در ریزنمونه میانگره روی محیط DKW حاوی 1 میلی گرم در لیتر فسفینوترایسین و 29/14 درصد، در ریزنمونه اپی کوتیل روی محیط DKW حاوی 50 میلی گرم در لیتر کانامایسین حاصل شد. همچنین مشخص گردید، به کار بردن سطوح بالای عامل انتخابگر، بازدهی تراریزش را با کاهش پدیده شیمری و جلوگیری از فرار شاخساره های غیرتراریخته، بهبود می بخشد. یافته های این مطالعه، راهکارهای موثری را در باززایی شاخساره های تراریخته غیرشیمری در لیموترش، ارایه می دهد.

    کلید واژگان: ژن گزارشگر GUS, اگروباکتریوم, نشانگر انتخابگر, بافت شیمر}
    Saeed Soheilivand *, Amir Mousavi, Mohammadreza Safarnejad

    Sour lime (Citrus aurantifolia L.) is one of the most important woody plants is widely known for its recalcitrance to genetic transformation. We aimed herein to evaluate effective factors influencing the transformation efficiency and the reduction of chimeric transgenic shoots in sour lime. Epicotyl and internode explants were genetically transformed with different Agrobacterium tumefaciens strains e.g., LBA4404, GV3850, and GV3101, harboring the vectors pBI121 and pCAMBIA3301 containing β-glucuronidase (GUS) as a reporter gene. The effect of the following factors was evaluated: Agrobacterium concentration (OD600=0.3, 0.5 and 1), during inoculation (5 seconds, 10 minutes and 30 minutes), co-culture (2 and 3 days), and the selection regime (phosphinothricin at 1, 3, 5 and 10 mg/l and kanamycin at 25, 50, 75 and 100 mg/l). In following, transformation efficiency and the chimeric transgenic shoots rate were respectively confirmed by PCR and GUS assays. The results showed that Agrobacterium strain LBA4404, at the OD600 of 0.5, with 5 seconds (for epicotyl) and 10 minutes (for internode) inoculation at two-day co-culture period, were identified the most suitable treatments for both explants. The transformation frequencies ranged from 0.93% for internode on DKW medium containing 1.0 mg/l of phosphinothricin to 14.29% for epicotyl on DKW medium containing 50 mg/l of kanamycin. Inclusion of the high-level of selective treatments, improved the transformation rate through decreasing frequency escape and chimeric transgenic shoots. These findings provide novel insights into the appropriate procedure to constitute non-chimeric lime transgenic shoots.

    Keywords: GUS Reporter gene, Agrobacterium, selectable marker, chimeric tissue}
  • حسن رهنما*، مرضیه قنبری جهرمی، امیر موسوی، سعید سهیلی وند، رضا پوررحیم

    یکی از بیماری های مهمی که سالانه خسارت های اقتصادی بسیاری به کشاورزان کشور وارد می کند و باعث افت عملکرد و کیفیت محصول می شود، ویروس Y سیب زمینی (PVY) است. امروزه استفاده از سازوکار های ایجاد مقاومت ناشی از پاتوژن افق های جدیدی در راستای تولید گیاهان تراریخت مقاوم به ویروس گشوده است. در این پژوهش از روش خاموشی ژن برای ایجاد مقاومت بر علیه PVY استفاده شده است. برای این منظور از یک سازه ژنی RNAi برگرفته از بخش پروتئین پوششی (CP)  ژنوم PVY استفاده شد. سازه با استفاده از اگروباکتریوم به ریزنمونه های میانگره و برگ گیاه سیب زمینی انتقال داده شد. درصد نوساقه های تولید شده در محیط انتخابی حاوی علفکش فسفینوتریسین پس از رشد و تکثیر مورد ارزیابی قرار گرفت. تراریختی بوته ها و بررسی بیان ژن در گیاهان تراریخته با استفاده از آزمون زنجیره ای پلیمراز (PCR)  و RT-PCR بررسی شد. بر اساس نتایج 42 درصد گیاهان باززا شده تراریخته بودند. بیان ژن CP نیز در اغلب لاین ها به اثبات رسید. به منظور تعیین مقاومت گیاهان تراریخته در برابر آلودگی PVY، آزمون زیست سنجی صورت گرفت. نتایج حاصله نشان داد که حدود 82 درصد گیاهان سیب زمینی تراریخت نسبت به آلودگی PVY مقاوم هستند.

    کلید واژگان: سیب زمینی, مقاومت به ویروس, PVY, RNAi, خاموشی ژن}
    Hassan Rahnama*, Marzie Ghanbari Jahromi, Amir Mousavi, Saied Sohilivand, Reza Pourrahim

    Potato virus Y (PVY) is one of the most damaging viruses of potato plants which infects most cultivars and causes a significant decrease in yield products quality and also economical losses annually. Recently, the application of pathogen derived resistance mechanisms has opened new horizons for the development of virus-resistant transgenic plants. This research was carried out to study RNA silencing to engineered potato plants that are resistant to potato virus Y (PVY). RNAi construct was designed from coat protein (CP) segment of PVY. Potato explants were transformed by Agrobacterium tumefaciens AGL1 with pCAMRNAiCP containing bar selectable gene. The rate of regenerated plants was evaluated in the selected medium containing the herbicide phosphinotricin after growth and propagation. Transgenic plants and their gene expression were investigated using polymerase chain reaction (PCR) and RT-PCR. Results showed that 42 percent of regenerated plants were transformed. The expression of CP hairpin construct was determined by RT-PCR analysis in most of the lines. PVY resistance bioassay showed that 82 percent of transgenic potato plants were resistance to PVY.

    Keywords: gene silencing, potato, PVY, RNAi, virus resistance}
  • مهسا توکلی، امیر موسوی*، کمال الدین حق بین
    این مقاله نخستین گزارش کاربرد نشانگرهای آی.اس.اس.آر جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی در گیاه آرنبیا پولچرا است. از آنجایی که سرعت تقسیم سلولی و تکثیر در این گیاه باارزش کم است، دستیابی به زیست توده، نیازمند تامین فناوری و راکارهایی است که بتواند بقای کالوس را تضمین نماید. مطالعه حاضر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در دو نمونه کشت درون شیشه ای گیاه دارویی آرنبیا پولچرا، شامل کالوس های جدید (یک ماهه) و کالوس قدیمی (چهار ساله) در مقابل بذر این گیاه با استفاده از نشانگر آی.اس.اس.آر انجام شده است. 79 باند توسط ده آغازگر آی.اس.اس.آر تولید شد. هتروزیگوتی کل مورد انتظار (He)، 028/0 محاسبه شد. بیشترین مقدار هتروزیگوتی مربوط به نمونه بذر بوده (054/0) که بیشترین تعداد آلل های مختلف و موثر و شاخص شانون را نیز به خود اختصاص داده است. تجزیه خوشه ای به صورت دندوگرام برای نشان دادن پایداری ژنتیکی نمونه ها انجام شد. درختچه UPGMA ، نمونه ها را در دو گروه اصلی تفکیک کرد و تجزیه به مولفه های اصلی (PCoA)  این خوشه بندی را تایید کرد. اولین خوشه اصلی شامل بذور و خوشه دوم شامل کالوس های جدید و قدیمی بود. گرچه تصور می شد تغییرات مورفولوژیکی کالوس های آرنبیا پولچرا می تواند ناشی از تنوع سوماکلونال حاصل از واکشت های متوالی باشد، اما نتایج نشان داد کالوس های جدید و قدیمی در یک گروه قرار گرفته اند. بنابراین می توان نتیجه گرفت که تغییرات مورفولوژیکی کالوس های قدیمی و جدید می تواند ناشی از عوامل محیطی یا تغییرات اپی ژنتیک باشد اما مستقیما به دلیل تنوع سوماکلونال نبوده است.
    کلید واژگان: تجزیه خوشه ای, نشانگرهای آی.اس.اس.آر, تنوع سوماکلونی, واکشت های متوالی, کشت بافت}
    Mahsa Tavakoli, Amir Mousavi *, Kamahldin Haghbeen
    This is the first report on the analysis ISSR markers for assessing the genetic variation in Arnebia pulchra. As the rate of cell division and propagation in A. pulchra is very low, the achievement of biomass in this valuable plant requires techniques and strategies that can guarantee the survival of the callus. The present study was performed to investigate genetic variation in two in vitro culture samples of the medicinal plant A. pulchra including new (one month old) and old (four years old) calli versus seeds by Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) marker. In total, 79 bands were produced by 10 ISSR primers. The total expected heterozygosity (He) was calculated 0.028 and the greatest value was contributed to seeds samples (0.054) followed by old and new calli, respectively. The maximum values of different alleles (Na), effective alleles (Ne) and Shannon’s index were also observed in seeds. Cluster analysis was performed in the form of dendogram to indicate the genetic stability of the samples. UPGMA tree discriminated samples in two major groups and principal component analysis (PCoA) confirmed the clustering result. The first major cluster included seeds and the second involved new and old calli. Although it was thought that the morphological changes of A. pulchra could be due to the somaclonal variation caused by successive subcultures, however, the results indicated that the new and old calli were clustered in the same group. Therefore, it can be concluded that the morphological changes of the old and new calli could be due to environmental parameters or epigenetic changes but not directly due to somaclonal variation.
    Keywords: Cluster analysis, ISSR markers, Somaclonal variation, successive subculture, Tissue culture}
  • عباسعلی رستگار، حسین دامغانیان، امیر موسوی*
    هدف

    به دلیل گسترش رسانه‎های اجتماعی در کشور ضروری است که رهبران سازمان بعنوان اصلی‎ترین عوامل شکل دهنده فرهنگ سازمانی، مهارت لازم برای استفاده از این بستر ارتباطی نوین را بدست آورند. هدف محقق در این پژوهش بررسی تغییرات سبک رهبری در سازمان‎ها با ظهور رسانه‎های اجتماعی است.

    روش شناسی:

     روش اجرای این تحقیق با استفاده از نظریه داده بنیاد است. در این تحقیق جامعه آماری شرکت ها و آژانس های تبلیغاتی هستند. نمونه های آماری به شیوه قضاوتی و گلوله برفی از گروه های نخبگان شاغل در آژانس های تبلیغاتی انتخاب گردید. در این تحقیق مصاحبه با 12 نفر به اشباع و کفایت نظری رسیده است.

    یافته های پژوهش:

     نتایج نشان داد که تفکر راهبردی، ویژگی‎های شخصیتی رهبر و برند رهبری سازمان به‎عنوان مبانی تغییرات سبک رهبری و شاخص‎های ادراکی، ارتباطی و انگیزشی به‎عنوان مولفه‎های آن شناسایی شده‎اند. هم‎چنین ساختار سازمانی، عوامل اقتصادی، عوامل فرهنگی و سرمایه انسانی سازمان عوامل محیطی موثر بر این تغییرات هستند.

    محدودیت ها و پیامدها:

     فقدان پژوهش‎های مشابه و نبود شاخص‎های عینی برای مقایسه در داخل کشور مهم‎ترین محدودیت‎ها بودند.

    پیامدهای عملی:

    مطالعه انجام شده در صنعت تبلیغات صورت گرفته است که همین امر تعمیم‎پذیری آن به سایر حوزه‎ها را تا حدی با چالش مواجه می‎کند.  

    ارزش مقاله:

    مقاله به درک بهتر تغییرات در رهبری سازمانی با استفاده از بسترهای ارتباطی نوین؛ رسانه‎های اجتماعی، می‎افزاید.

    کلید واژگان: سبک رهبری, رسانه های اجتماعی, ارتباطات, فرهنگ سازمانی, تفکر راهبردی}
    Abbas Ali Rastgar, Hossein Damghanian, Amir Mousavi *
    Objective

     Due to the development of social media in the country, it is essential that organizational leaders, as the main factors shaping the organizational culture, acquire the necessary skills to use this new communicational platforms. The aim of this researcher in this study is to examine changes in leadership style in organizations due to advent of social media.

    Methodolgy:

     The research method is using Grounded Theory. In this study, the statistical population is advertising agencies. Statistical samples were selected by judging method and snowball from elite groups working in advertising agencies. In this research, interviews with 12 people have reached saturation and theoretical adequacy.

    Findings

     The results showed that strategic thinking, personality traits of the leader and the leadership brand of the organization have been identified as the basis for changes in leadership style and perceptual, communicative and motivational indicators have been identified as its components. Also, organizational structure, economic factors, cultural factors and human capital of the organization are environmental factors affecting these changes.

    Results and limitations:

     Lack of similar research and lack of objective indicators for comparison within the country were also the most important limitations.

    Practical implications:

     The study was conducted in the advertising industry, which challenges its generalizability to other areas to some extent.

    Article Value:

     Article improves to better understanding of changes in organizational leadership by using modern communication platforms (Social media)

    Keywords: Leadership style, social media, communication, organizational culture, strategic thinking}
  • Hadi Ghaderitabar, Amir Mousavi *, Ali Hataf Salmanian, Faranak Hadi
    Background

    Glyphosate is a non-selective systemic herbicide with a broad spectrum of weed control that inhibits a key enzyme, 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate (EPSP) synthase, in the shikimate pathway.

    Objectives

    Isolation and analysis of the epsps (aroA) gene responsible for glyphosate-tolerance in bacteria from Roundupcontaminated soils was the aim of this study.

    Materials and Methods

    Sampling was done from the soil of the gardens which were heavily contaminated by Roundup herbicide and then bacterial screening was performed in the presence of high concentrations of glyphosate. The genus of bacterium was identified via molecular methods such as 16S rRNA sequencing. The aroA gene of this bacterium (aroAHA-09) was isolated using the primers designed-upon specific regions of aroA genes available in NCBI GenBank database. The PCR product was cloned, sequenced and subcloned into pET28a as an expression vector and transferred into E. coli strainBL21(DE3). The cells were inoculated in liquid M9 minimal medium containing IPTG and different concentrations of glyphosate.

    Results

    The genus of bacterium was identified as Pseudomonas sp. strain HA-09. The isolated aroAHA-09 gene from this bacterium was approximately 2.2 kb in size. Bioassay of E. coli expressing this gene showed high tolerance to glyphosate(up to 300 mM).

    Conclusions

    The aroAHA-09 gene could be considered as a novel and efficient candidate for development of glyphosatetolerant crop plants.

    Keywords: aroA gene, EPSP synthase, Glyphosate-tolerant, Pseudomonas sp}
  • وحیده هدایتی، ثریا موسوی، امیر موسوی*، سید مهدی حسینی مزینانی، زهرا هاشم آبادی

    زیتون (Olea europaea L.) یکی از مهمترین گونه های باغی در حوزه مدیترانه است که روش تکثیر آن از طریق قلمه می-باشد. ریشه زایی قلمه ها یکی از فرآیندهای اساسی در ازدیاد گیاه زیتون است. توانایی ریشه زایی در قلمه گیاهان و ارقام مختلف بطور معنی داری با یکدیگر متفاوت است. از طرفی ژن های متعددی در این فرآیند نقش دارند. یکی از این ژن ها OeAOX2 می باشد که در تعادل انواع اکسیژن واکنشی نقش اصلی را بر عهده دارد و به عنوان ژن کاندید در القای ریشه زایی در جمعیت زیتون ایتالیایی حاصل از تلاقی ژنوتیپ های لچینو و دلچه آگوجا معرفی شده است. در این مطالعه، توانایی ریشه زایی در قلمه های 99 ژنوتیپ زیتون ایران از استان های مختلف بررسی شد و ژنوتیپ ها با توانایی ریشه زایی بالا و پایین تعیین شدند. سپس بررسی طول کامل ژن OeAOX2 در دو ژنوتیپ زیتون ایران، دالاهو (ریشه زایی بالا) و اوزینه (ریشه زایی پایین) به ترتیب از استان های کرمانشاه و گلستان، انجام شد. همچنین، توالی این ژن در 20 ژنوتیپ زیتون ایران با ریشه زایی بالا و پایین در ناحیه 5’ UTR و اگزون شماره 1 نیز بررسی گردید. بررسی های بیوانفورماتیکی طول کامل ژن OeAOX2 در دالاهو و اوزینه نشان داد که چندشکلی های زیادی در نواحی اینترون وجود دارد ولی در سطح اگزون ها تنها یک چندشکلی مشاهده شد. از سوی دیگر، بررسی چند شکلی های این ژن در 20 ژنوتیپ دیگر زیتون ایران مشخص نمود که این چند شکلی ها منجر به تغییر اسیدهای آمینه ها نمی شود و احتمالا ژن OeAOX2 در سطح ترانسکریپتوم و تفاوت بیان، القای ریشه زایی را می تواند تحت تاثیر قرار دهد.

    کلید واژگان: ژنوتیپ های زیتون ایران, توان ریشه زایی, چندشکلی, ژن OeAOX2}
    Vahideh Hedayati, Soraya Mousavi, Amir Mousavi *, Mehdi Hosseini Mazinani, Zahra Hashemabadi

    Olive (Olea europaea L.) is one of the most important fruit crops throughout the Mediterranean Basin, mainly propagated by cuttings. One of the fundamental processes in woody plant propagation, especially olive is rooting ability of cuttings. Rooting ability in various plants and ecotypes is different significantly. Also, many genes are affecting rooting ability process in plants. One of these is OeAOX2 gene which plays a central role in the balance of reactive oxygen species in plants. OeAOX2 as a candidate gene has been introduced and it induces rooting in an Italian olive population (Cross progenies of Leccino and Dolce Agogia). In this project, rooting ability of 99 semi-hard cutting of Iranian olive genotypes was studied from different provinces of Iran, so genotypes with high- and low-rooting ability were determined. Then, the full length of OeAOX2 gene was evaluated in two Iranian olive genotypes such as Dalahoo (high rooting) and Uzineh (low rooting) from Kermanshah and Golestan provinces, respectively. Also, the sequence of this gene was studied in 20 Iranian olive genotypes with high and low rooting in 5’UTR and exon 1 region. Bioinformatics studies of the OeAOX2 gene indicated that there are many polymorphisms in the introns, but only one polymorphism was observed in the exon levels. On the other hand, polymorphism of the OeAOX2 gene in 20 Iranian olive genotypes did not lead to protein alteration and probably it influenced rooting induction in transcript level.

    Keywords: Iranian olive genotypes, rooting ability, Polymorphism, OeAOX2 gene}
نمایش عناوین بیشتر...
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال