به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "میزان اطلاعات چندشکلی" در نشریات گروه "زراعت"

تکرار جستجوی کلیدواژه «میزان اطلاعات چندشکلی» در نشریات گروه «کشاورزی»
جستجوی میزان اطلاعات چندشکلی در مقالات مجلات علمی
  • حبیب الله قزوینی*، مهدیه مرندی، اشکبوس امینی سفید آب

    پایداری عملکرد دانه و تغییرات ژنتیکی 17 ژنوتیپ امیدبخش گندم نان متحمل به شوری به همراه سه رقم شاهد ارگ، بم و افق در دو آزمایش مزرعه ای و مولکولی بررسی شد. در آزمایش مزرعه ای، مقایسه عملکرد ژنوتیپ ها در اراضی شور ایستگاه های میلیشبار یزد، امیرآباد بیرجند، رودشت اصفهان، اختیارآباد کرمان و زهک زابل در دو سال زراعی 92-1391 و 93-1392انجام شد. برای ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ ها از 18 نشانگر ریزماهواره (SSR) مرتبط با تحمل به شوری استفاده شد. تجزیه واریانس مرکب عملکرد دانه تفاوت معنی دار برای اثر رقم، اثر متقابل سال × مکان و اثر سال × رقم و همچنین اثر متقابل سه گانه رقم × سال × مکان نشان داد. مقایسه میانگین ژنوتیپ ها با استفاده از آزمون حداقل تفاوت معنی دار (LSD) نشان داد که لاین های 14، 16، 11 و 5 به ترتیب با عملکردهای 649/4، 517/4، 441/4 و 300/4 تن در هکتار دارای عملکرد دانه بالا بودند. با استفاده از روش های مختلف تجزیه پایداری ژنوتیپ های 11، 15، 16 و 20 (افق) پایداری عملکرد دانه بالایی داشتند. تجزیه خوشه ایداده های مولکولی به روشUPGMA و تجزیه به بردارهای اصلی (PCoA)، ژنوتیپ های مورد مطالعه را در چهار گروه مختلف قرار داد. در مجموع نتایج حاصل ازگروه بندی ژنوتیپ ها بر اساس داده های مولکولی مطابقت کمی با نتایج حاصل از ارزیابی مزرعه ای داشت. نتایج آزمون مانتل نشان داد که همبستگی بین عملکرد دانه ژنوتیپ های گندم نان در محیط های شور با تنوع آللی ژنوتیپ ها حدود 13/0 و غیرمعنی دار بود. علی رغم این همبستگی ضعیف، نشانگرهای SSR به خوبی توانستند تغییرات و تفاوت موجود میان ژنوتیپ های گندم نان مورد ارزیابی را آشکار سازند. این تنوع ژنتیکی می تواند به طور موثری در برنامه های ملی به نژادی تحمل به شوری گندم نان به کارگرفته شود.

    کلید واژگان: تنش شوری, سازگاری, نشانگرهای مولکولی, تجزیه خوشه ای, میزان اطلاعات چندشکلی
    Habibollah Ghazvini *, Mahdeieh Marandi, Ashkbous Amini Sefidab

    Yield stability and genetic variation in 17 salt-tolerant bread wheat promising lines and three cultivars; Arg, Bam and Ofough were evaluated in field trials as well as by molecular assay. In field, yield trials of genotypes was carried out in saline soils of Melishbar (Yazd), Amirabad (Birjand), Roudasht (Isfahan), Ekhtiarabad (Kerman) and Zahak (Zabol) agriculturar research stations, Iran, in 2012-13 and 2013-14 cropping cycle. To evaluate genetic variation among genotypes, 18 SSR markers that were previously mapped on salt-tolerant quantitative trait loci (QTLs) were used. Combined analysis of variance revealed significant differences for genotype main effect and year × location, year × genotype and year × location × genotype interaction effects. Grain yield comparison of genotypes using least significant difference(LSD) test showed that lines 14, 16, 11 and 5 with grain yields of 4.649, 4.517, 4.441 and 4.300 tha-1 had higher grain yields among genotypes. Different methods of stability analysis revealed that genotypes 11, 15, 16 and 20 (cultivar Ofough) had higher yield stability compared to the other genotypes. Cluster analysis of molecular data using UPGMA method and principal component analysis (PCoA) classified studied genotypes into four major groups. Results of cluster analysis based on molecular data were not in agreement with the results of field experiments. Results of Mantel’s test indicated that correlation between grain yield under salinity stress conditions and their allelic diversity was about 0.13 and not-significant. Despite this weak correlation, SSR markers could greatly reveal genetic variation among wheat genotypes. This genetic variation can effectively be used in wheat breeding programs for salt tolerance in Iran.

    Keywords: Salinity stress, Adaptation, molecular markers, cluster analysis, polymorphism information content
  • طاهره فتحی، محمد مهدی سوهانی*، حبیب الله سمیع زاده لاهیجی، علی اشرف مهرابی

    گونه Aegilops triuncialis L. دامنه توزیع وسیعی از شرق اطلس تا نزدیک غرب و مرکز آسیا دارد؛ بنابراین بررسی تنوع ژنتیکی این گونه در این نواحی اهمیت اصلاحی و تکاملی بسزایی دارد. در این راستا تنوع ژنتیکی 40 توده از گونه Ae.triuncialis، جمع آوری شده از مناطق غربی ایران بررسی شد. پس از استخراج DNA و یکسان سازی غلظت آنها، پنج نمونه از هر توده به صورت بالک درآمد و تنوع ژنتیکی با روش ISSR-PCR بررسی شد. با استفاده از 11 آغازگر و 118 نوار چندشکل به دست آمد که از بین آغازگر ها، گونه UBC817 با 16 نوار و آغازگرهای UBC811 و UBC823 با 14 نوار بیشترین و آغازگر UBC825 با 4 نوار کمترین تعداد نوار چندشکل را تشکیل دادند. اطلاعات چندشکلی نشانگرها بین 23/0 تا 40/0 و شاخص نشانگری از 1/1 تا 6/4 متغیر بود. تجزیه بردارهای اصلی نشان داد که دو مولفه اول درمجموع 72/23 درصد از واریانس کل را توجیه کردند. تجزیه خوشه ایبراساس ماتریس فقدان تشابه شاخص سوکال و الگوریتمNeighbor Joining (NJ)، 40 توده بررسی شده را در سه گروه طبقه بندی کرد که هر گروه به ترتیب شامل 13، 9 و 18 توده بود. درستی گروه بندی حاصل از تجزیه خوشه ایبا تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر با 95 درصد تایید شد.

    کلید واژگان: تجزیه تابع تشخیص, تجزیه واریانس مولکولی, شاخص نشانگر, میزان اطلاعات چندشکلی
    Tahereh Fathi, Mohammad Mahdi Souhani, Habibollah Samizadeh Lahiji, Ali Ashraf Mehrabi

    West part of Iran is considered as one of the center of diversity for Aegilops triunsialis، therefore، study of its genetic diversity in this area is extremely important regarding evolution of this plant. The genetic variation among 40 accessions of Ae. triunsialis collected from west of Iran were studied using 12 ISSR markers. DNA was extracted، concentrations adjusted and five samples from each accession were bulked. Totally، 118 polymorphic bands were produced using 12 primers that UBC817 primer with 16 and then UBC811 and UBC823 with 14 bands had the maximum number، while UBC825 with 4 bands had minimum polymorphic bands. The PIC value varied from 0. 23 to 0. 40 and the MI value between 1. 1 and 4. 6. Principal Coordinates Analysis showed that the first two could explain the total variation of 23. 72 percent. Cluster analysis using Neighbor Joining، placed the 40 accessions in three clusters that each contain 13، 9، and 18 members، respectively. Discriminate Function via Fisher''s linear confirmed the validity of clustering analysis result (95%).

    Keywords: analysis of molecular variance, discriminant function analysis, marker index, polymorphism information content
  • محمد محسن زاده گلفزایی، حبیب الله سمیع زاده لاهیجی، علی اعلمی، مرداویج شعاعی دیلمی، سهیلا طالش ساسانی
    گام اول در برنامه های به نژادی تعیین تنوع ژنتیکی مواد اصلاحی است. استفاده از نشانگرهای مولکولی سبب کاهش مدت زمان اصلاح و هزینه های پروژه های اصلاحی می شود. در این مطالعه تنوع ژنتیکی، 49 ژنوتیپ توتون با استفاده از 12 نشانگر ISSR، 3 نشانگر رتروترانسپوزون و یک نشانگر ترکیبی ISSR و رتروترانسپوزون مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از 16 آغازگر 147 نوار چندشکل به دست آمد، که از بین آغازگرهای مورد استفاده، آغازگر TOS-2 با 16 نوار و آغازگرهای UBC811 و TOS-1 با 14 نوار بیشترین و آغازگرهای UBC825 و TOS-3 با 4 نوار کمترین تعداد نوار چندشکل را ایجاد نمودند. میزان اطلاعات چندشکلی نشانگرها بین 27‎/0 تا 46‎/0 و شاخص نشانگر از 15‎/1 تا 87‎/5 متغیر بود. تجزیه به بردارهای اصلی نشان داد که دو مولفه اول توانستند در مجموع 75‎/16 درصد از واریانس کل را توجیه کند. تجزیه خوشه ایبه روش UPGMA، 49 ژنوتیپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، که به ترتیب شامل 9، 4، 1، 13 و 22 ژنوتیپ شدند. صحت گروه بندی حاصل از تجزیه خوشه ایتوسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر با 6‎/79 درصد تائید شد.
    کلید واژگان: تجزیه تابع تشخیص, _ شاخص نشانگر, میزان اطلاعات چندشکلی, ضریب تشابه انطباق ساده
    Mohammad Mohsen Zade, Habibollah Samizade Lahiji, Ali Alami, Mardavij Shoayi Deylami, Soheyla Talesh Sasani
    The first step in breeding programs is detecting the genetic diversity in breeding materials. Molecular markers help to reduce costs and time in breeding programs. Genetic variation in 49 genotypes of tobacco were studied using 12 ISSR markers, 3 Retrotransposon markers and the combination of ISSR and Retrotransposons. One hundred forty seven polymorphic bands were produced using 16 primers. Tos-2 primer with 16 followed by UBC811 and TOS-1 with 14 bands had the maximum and UBC825 and TOS- 3 with 4 band had the minimum polymorphic bands. PIC value varied between 0.27 to 0.46 and MI between 1.15 to 5.87. Principal Coordinates Analysis showed that the aforementioned values could explain total variation of 16.75 percent. In this study, cluster analysis using UPGMA, placed 49 genotypes in five cluster groups. Groups include 9, 4, 1, 13 and 22 genotypes, respectively. Discriminate Function via Fisher's linear (79.6 percent) confirmed the validity of clustering analysis result.
    Keywords: Discriminant function analysis., Marker index, Polymorphism information content, Tobacco
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال