بررسی مقایسه ای اسید نوکلئیک استخراج شده از باکتری اشریشیا کلای با دو روش استخراج با فنل-کلروفرم و تکنیک استفاده از نانو ذرات مغناطیسی

از موضوعات مهم پژوهش ها در زمینه های مولکولی و مهندسی ژنتیک، استفاده از روش های بهینه در استخراج محتوای ژنومی میکروارگانیسم ها و سلول ها است که با استفاده از آن بتوان با صرف کمترین زمان و هزینه، به بیشترین مقدار و مناسب ترین خلوص دست یافت. روش های متعددی در راستای استخراج DNA باکتری ها وجود دارد که از روش های نوین جداسازی اسید نوکلییک می توان به استفاده از نانو ذرات مغناطیسی اشاره نمود. هدف از این مطالعه، مقایسه دو روش استخراج DNA از باکتری اشریشیا کلای با دو تکنیک فنل - کلروفرم و استفاده از نانو ذرات مغناطیسی است.

در این مطالعه از باکتری اشریشیا کلای سویه 25922ATCC جهت مقایسه دو روش استخراج DNA ژنومی استفاده گردید. جهت استخراج DNA ژنومی از روش فنل-کلروفرم و نیز تکنیک استفاده از نانو ذرات مغناطیسی با بکارگیری نانوذره دولایه SiO2/Fe3O4 استفاده گردید. هر دو محصول به دست آمده جهت سنجش جذب نوری با دستگاه نانودرآپ قرایت و سپس از طریق روش الکتروفورز روی ژل آگارز بررسی گردیدند.

در بررسی میزان جذب نوری با استفاده از دستگاه نانودرآپ میزان غلظت DNA استخراج شده با روش فنل- کلروفرم 4/761 میکروگرم بر میلی لیتر و با استفاده از تکنیک استخراج با نانو ذرات مغناطیسی 531 میکروگرم بر میلی لیتر به دست آمد.

با توجه به نتایج به دست آمده و با مقایسه جذب های نوری دو محصول و نیز ارزیابی مقایسه ای با گروه های کنترل در استخراج به روش نانو ذرات مغناطیسی و نیز با مقایسه فاکتورهای مختلفی نظیر میزان زمان موردنیاز، هزینه ها، کاربری آسان می توان نتیجه گرفت که به دلیل زمانبر و خطرآفرین بودن روش فنل - کلروفرم، روش استفاده از نانو ذرات مغناطیسی یک روش مناسب برای استخراج محتوی ژنومی است.