-
تئوری و نحوه تجزیه تلاقی های دی آلل توسط تعداد زیادی از دانشمندان بیان و توسعه داده شده است.
گریفینگ (Griffing 1956) تجزیه دی آلل را در چهار روش مختلف بیان نمود. هر یک از این چهار روش در چهار مدل آماری توضیح داده شده است. هدف از این بررسی مقایسه بین برآورد پارامترهای ژنتیکی در این چهار روش مختلف در گیاه کلزا ((Brassica napus L. است. در این بررسی هفت لاین کلزا در تمامی حالات ممکن (تلاقی های مستقیم و متقابل) با یکدیگر تلاقی داده شدند. نتاج حاصله که شامل 42 F1و تلاقی متقابل بود به همراه هفت والد مربوطه در قالب یک طرح بلوک های کامل تصادفی در دو تکرار به مقایسه گذارده شدند. تجزیه ترکیب پذیری لاین ها از نظر دوازده صفت زراعی با استفاده از روش های چهار گانه گریفینگ انجام شد. واریانس های افزایشی(σA2) و غالبیت(σD2) و درجه غالبیت (σA2/ σD2) برای هر یک از صفات تحت بررسی در چهار روش دی آلل گریفینگ برآورد شد. نتایج نشان داد که در روش سوم، برآورد واریانس ژنتیکی برای تمامی صفات منفی بود. در روش دوم و چهارم نیز این برآورد برای تعدادی از صفات منفی شد اما تنها در روش اول برآورد واریانس افزایش و به طبع آن درجه غالبیت برای تمامی صفات تحت بررسی مثبت بود. مقدار عددی واریانس می بایست همواره مثبت باشد اما با توجه به فرمول های برآورد واریانس افزایشی، دیده شد که هرگاه در جدول های تجزیه واریانس میانگین مربعات ترکیب پذیری خصوصی (SCA) بزرگ تر از میانگین مربعات ترکیب پذیری عمومی (GCA) شود برآورد واریانس افزایشی منفی خواهد بود. این وضعیت در روش های 2، 3 و 4 مشاهده شد اما در روش اول (دی آلل کامل با والدین) برای صفات تحت بررسی دیده نشد. این امر به عنوان معیاری جهت مقایسه روش های دی آلل گریفینگ در نظر گرفته شد. نتایج نشان داد که در این بررسی روش اول گریفینگ نسبت به سایر روش ها برآورد بهتری از اجزاء واریانس ژنتیکی را به دست می دهد.کلید واژگان: کلزا, ترکیب پذیری عمومی, ترکیب پذیری خصوصی, واریانس ژنتیکی, واریانس ژنتیک افزایشیThe theory and analysis of diallel crosses have been defined and developed by many scientists. Griffing in 1965 described the diallel analysis in four methods with four models. In this study estimation of genetic parameters through different methods of Griffing approach was compared. Seven lines of Brassica napus L. were crossed in all possible combinations including reciprocal crosses. Forty two F1s together with seven parents were planted using randomized complete block design with 2 replications. Combining ability analysis was carried out for 12 agronomic characters on the basis of four methods of Griffing’s approach. Estimation of additive (σA2) and dominance (σD2) genetic variances and calculation of dominance ratio (σD2/σA2) was carried out for these methods. The estimation of additive and dominance genetic variances in the method 3 were negative for all characters and in method 2 and 4 they were negative only for some characters. However, in method 1 additive genetic variance was positive for all characters. Considering the estimation formula for additive and dominance genetic variances it was concluded that, when mean square specific combining ability (SCA) is greater than mean square of general combining ability (GCA), estimation of additive genetic variance is negative. This situation was observed in methods 2, 3,and 4 but not in method 1. It was indicated that components of genetic variances was better estimated in method 1 than the other methods in this study. Results indicated that the method 1 provided consistent estimation of additive and dominance genetic variance and was superior in comparison with the other Griffing methods.
Keywords: Canola, Combining ability, Specific combining ability, Genetic variance, Additive genetic variance -
هدف این پژوهش بررسی وجود اختلاط بین واریانس های ژنتیکی غالبیت و افزایشی برای دو صفت تولید مثلی ترکیبی در میش های زندی بود. داده های این مطالعه شامل مجموع وزن بره های متولد شده و نیز مجموع وزن بره های شیرگیری شده به ازای هر راس میش تحت آمیزش در زایش نخست با استفاده از رکوردهای جمع آوری شده طی سال های 1370 تا 1388 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند زندی می باشد. از دو مدل دارنده اثرات ژنتیکی افزایشی و دارنده اثرات ژنتیکی افزایشی و ژنتیکی غالبیت برای برآورد اجزای واریانس این صفات استفاده شد. برای هر دو صفت تفاوت در مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی برآورد شده تحت هر دو مدل ناچیز بود که بیانگر عدم اختلاط بین واریانس های ژنتیکی افزایشی و غالبیت در ارزیابی ژنتیکی این صفات می باشد. مقدار برآورد شده واریانس ژنتیکی غالبیت برای هر دو صفت بیشتر از مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی بود. همبستگی رتبه ای بین ارزش های اصلاحی برآورد شده تحت مدل دارنده اثرات ژنتیکی افزایشی و مدل دارنده اثرات ژنتیکی افزایشی و ژنتیکی غالبیت و نیز همبستگی رتبه ای بین ارزش ژنتیکی کل و ارزش اصلاحی در مدل دارنده اثرات ژنتیکی غالبیت برای هر دو صفت به ترتیب پایین و متوسط به دست آمدند. نتایج این پژوهش نشان داد علی رغم این که بین واریانس های ژنتیکی افزایشی و غالبیت این دو صفت در میش های زندی اختلاطی وجود ندارد رتبه بندی حیوانات در دو مدل متفاوت می باشد. نتایج آزمون نکویی برازش نشان داد برای هر دو صفت مورد مطالعه، مدل دارنده اثرات ژنتیکی افزایشی و ژنتیکی غالبیت سبب افزایش صحت ارزش های اصلاحی برآورد شده می شود که این امر می تواند سبب افزایش میزان پاسخ به انتخاب ژنتیکی در اثر انتخاب در طولانی مدت گردد. هم چنین با استفاده از مدل دارنده اثرات ژنتیکی افزایشی و ژنتیکی غالبیت می توان ارزش ژنتیکی کل را برآورد نمود که در انتخاب جفت در طراحی سیستم های جفتگیری می تواند مورد استفاده قرار گیرد.کلید واژگان: واریانس غیر افزایشی, ارزیابی ژنتیکی, عملکرد تولید مثلی, گوسفندThe aim of the present investigate was to study the existence of confounding between dominance and additive genetic variance for two composite reproductive traits included total litter weight at birth per ewe exposed (TLWB1/EE) and total litter weight at weaning per ewe exposed (TLWW1/EE) at first lambing using data collected from 1991 to 2008 in the breeding station of Zandi sheep. Two animal models including model with additive genetic effects and model with additive and dominance genetic effects were considered for the estimation of variance components of the considered traits. For both TLWB1/EE and TLWW1/EE the differences between estimated additive genetic variance under both considered model were negligible; implying no confounding between additive and dominance genetic variance. The estimated values of dominance genetic variances for both TLWB1/EE and TLWW1/EE were higher than the estimated values of additive genetic variances. Rank correlations between the estimated breeding values under both tested models and between total genetic and estimated breeding values under model including additive and dominance genetic effects were low and medium in magnitude, respectively. The obtained results revealed that in spite of no confounding between additive and dominance genetic effects for the studied traits animals were ranked differently under the both tested models. Goodness of fit measures revealed that taking dominance genetic effects into account should be considered in the models used for increasing accuracy of genetic evaluation for these traits.
-
در این تحقیق، به منظور بررسی برنامه اصلاح نژادی مناسب برای بلدرچین های ژاپنی، برنامه های مختلف شبیه سازی شد. تابع هدف اصلاح نژدای شامل صفات وزن بدن و وزن تخم بود. جهت بررسی استفاده از نشانگرهای ژنتیکی مرتبط صفت وزن لاشه از پنج برنامه اصلاح نژادی مختلف استفاده شد. پیش بینی میزان پیشرفت ژنتیکی و نرخ هم خونی به وسیله شبیه سازی قطعی برنامه انتخاب تک مرحله ای با نسل های مجزا انجام شد. در برنامه اول تنها از فنوتیپ صفات وزن بدن و وزن تخم استفاده شد. در برنامه دوم، صفت وزن لاشه و در برنامه سوم نیز صفات غیرمستقیم لاشه از جمله وزن سینه و وزن پشت در شاخص انتخاب گنجانده شد. پاسخ ژنتیکی در هر دو حالت برای وزن بدن کاهش یافت. در برنامه های انتخاب به کمک نشانگر، اطلاعات QTL که 5، 10، 20 و 50 درصد از واریانس ژنتیکی صفت وزن لاشه را توصیف می کنند در تابع شاخص انتخاب در نظر گرفته شدند. در برنامه اول سهم QTL فرضی، در واریانس ژنتیکی وزن لاشه پنج درصد بود، پیشرفت ژنتیکی برای صفت وزن لاشه به میزان 1/3 درصد نسبت به حالت پایه افزایش نشان داد که این روند افزایشی برای حالات دیگر سهم واریانس QTL فرضی نیز مشهود بود، به گونه ای که در حالت چهارم که 50 درصد از واریانس ژنتیکی صفت وزن لاشه به وسیله QTL فرضی بیان شده بود این افزایش به 42 درصد رسید. پاسخ ژنتیکی برای صفت وزن لاشه به مقدار قابل قبولی با توجه به مقادیر متفاوت واریانس ناشی از QTL افزایش یافت. بنابراین، استفاده از اطلاعات QTL منجر به افزایش دقت برآورد ارزش های اصلاحی شده و می توان کاندیداهای برتر از نظر ژنتیکی را با درجه اعتماد بالاتری گزینش نمود.
کلید واژگان: شبیه سازی, انتخاب, رشد ژنتیکی, برنامه های اصلاح نژادی, بلدرچین ژاپنیIn this study, selection strategies were simulated to find optimal selection strategy in Japanese quails. Breeding goal was consisted of body weight and egg weight traits. Effects of using genetic markers related to carcass weight were investigated by five different selection strategies. In this case, breeding goal included body weight, egg weight and carcass weight. Deterministic simulation, based on single stage selection and discrete generation, was used for predicting genetic gain and rate of inbreeding. In the first (base) program, phenotypic information was available on body and egg weights. In the second program, information on body and egg weights along with carcass weight were included in selection index and in the third program, with taking into account the indirect carcass measurements in selection index, including breast weight and back weight, genetic gain was increased for body weight compared with two previous mentioned programs. Genetic gain for body weight was decreased by including indirect carcass measurements in selection index. In marker assisted selection programs, QTL information that described 5, 10, 20 and 50% of genetic variation in carcass weight was also included in selection index. In the next step, within the first breeding program which assumed QTL described 5% of genetic variance for carcass weight, genetic progress of carcass weight was increased 3.1% in relation to base program. This increasing trend was observed for other cases with different values of genetic variance described by assumed QTL. In the fourth program which assumed QTL described 50% of genetic variance for carcass weight, this increase reached to 42%. Genetic response for carcass weight was increased appropriately with considering different values of genetic variance due to QTL. Therefore, the use of QTL information resulted in increase in the accuracy of breeding values and it could be possible to select genetically superior candidates with greater reliability values.Keywords: Simulation, Selection, Genetic Gain, Selection Strategies, Japanese Quail -
In order to investigate the effect of genetic markers in genetic improvement of domestic fowl، seven breeding programs were simulated. In first breeding program called base program، phenotypic information of traits was only used. In this program، aggregative genotype equation consisted of body weight at 8 weeks of age، egg weight and egg number and selection index consisted of traits in aggregative genotype together with two other tarits including body weight at 12 weeks of age and age at sexual maturity. In other programs called marker assisted programs، QTL information that described 5، 10، 20، 30، 40 and 50% of genetic variation of egg number were also included in selection index. Based on obtained results، in program that QTL described 5% of genetic variance، economic response was improved by 3. 37% compared to base program. Economic response in program that QTL described 50% of genetic variance was also improved by 14. 28% compared to base program. Rate of inbreeding was decreased from 0. 69% in base program to 0. 50% in program that QTL described 50% of genetic variance in each generation. The results of present study showed that QTL information، even with 5% description of genetic variance، effectively can be used in genetic improvement of domestic fowl.Keywords: Breeding programs, Native fowl, Marker assisted selection, QTL
-
در این مطالعه، هفت برنامه اصلاحنژادی به منظور بررسی استفاده از نشانگرهای ژنتیکی در اصلاح نژاد مرغان بومی، شبیه سازی شد. در برنامه اصلاح نژادی اول) برنامه پایه(، تنها از فنوتیپ صفات استفاده شد. در این برنامه،صفات موجود در معادلهی ارزش ژنوتیپی کل شامل وزن بدن در سن 8 هفتگی، وزن و تعداد تخممرغ و صفات موجود در شاخص انتخاب مشابه صفات موجود در ارزش ژنوتیپی کل به اضافه وزن بدن در سن 21 هفتگی و سن بلوغ جنسی بود. در برنامه های اصلاح نژادی دوم تا هفتم)انتخاب به کمک نشانگرها(، در کنار فنوتیپ صفات مذکور، از اطلاعاتQTL صفت تعداد تخممرغ نیز در شاخص انتخاب استفاده شد. در این برنامه ها فرض شد که QTL مورد نظر به ترتیب 01 و 51 درصد واریانس ژنتیکی صفت تعداد تخممرغ را بیان نماید. برای شبیه سازی برنامه های اصلاح، 01، 11، 21، 5 نژادی از نرم افزار SelAction استفاده شد. بر اساس نتایج این مطالعه، پاسخ اقتصادی در برنامه اصلاح نژادی دوم)تنها 5 درصد واریانس ژنتیکی صفت تعداد تخم مرغ توسط QTL فرضی بیان میشود(، نسبت به برنامه اصلاح نژادی 0 درصد افزایش یافت. روند افزایش پاسخ اقتصادی در سایر برنامه ها نیز مشاهده شد تا جایی که در برنامه / پایه، 03هفتم) 51 درصد واریانس ژنتیکی صفت تعداد تخم مرغ توسط QTL فرضی بیان میشود(، پاسخ اقتصادی نسبت به1 درصد / 1 درصد در برنامه پایه به 51 / 20 درصد افزایش یافت. ضریب هم خونی در هر نسل نیز از 96 / برنامه پایه 18در برنامه هفتم کاهش یافت. نتایج این تحقیق نشان میدهد که اطلاعات QTL، حتی زمانی که تنها 5 درصد واریانسژنتیکی صفت را بیان نماید، میتواند به طور موثری در برنامه های اصلاح نژادی مرغان بومی مورد استفاده قرار گیرد.
کلید واژگان: برنامه اصلاح نژادی, مرغان بومی, انتخاب بوسیله نشانگرها, QTLIn order to investigate the effect of genetic markers in genetic improvement of domestic fowl, seven breeding programs were simulated. In first breeding program called base program, phenotypic information of traits was only used. In this program, aggregative genotype equation consisted of body weight at 8 weeks of age, egg weight and egg number and selection index consisted of traits in aggregative genotype together with two other tarits including body weight at 12 weeks of age and age at sexual maturity. In other programs called marker assisted programs, QTL information that described 5, 10, 20, 30, 40 and 50% of genetic variation of egg number were also included in selection index. Based on obtained results, in program that QTL described 5% of genetic variance, economic response was improved by 3.37% compared to base program. Economic response in program that QTL described 50% of genetic variance was also improved by 14.28% compared to base program. Rate of Inbreeding was decreased from 0.69% in base program to 0.50% in program that QTL described 50% of genetic variance in each generation. The result of present study showed that QTL information, even with 5% description of genetic variance, can effectively improve economic traits in native fowl.Keywords: Breeding programs, Native fowl, Marker assisted selection, QTL -
Milk yield records from 1st to 5th lactations of Iranian Holstein cows were analyzed using repeatability and a number of multivariate models that varied in additive genetic variance structure. A total of313,006 milk yield records were used. The records were obtained from 116,531 cows born between 2001 and 2005. The animals originated from 2,355 sires and 91,212 dams. A multivariate model with heterogeneous residual co (variance) and heterogeneous genetic variance was found to be the most parsimonious model in comparison with the repeatability and the other pre-structured multivariate models.Heritability of milk trait at 1st, 2nd, 3rd, 4th and 5th locations were 0.27, 0.19, 0.14, 0.11 and 0.07, respectively using the preferred modelwhile a value of 0.18 was estimated for the heritability of the milk yields where repeatability model was applied.In comparison with the pre-structured multivariate models; the repeatability model was not an appropriate model for genetic analysis of the repeated records of milk yield in the population investigated. In the current study, homogenous genetic covariance was assumed among the different lactations which can be modelled in future studies.Keywords: genetic analysis, repeatability model, pre, structured multivariate model, milk yield, Iranian Holstein cow
-
نشریه علوم آب و خاک (علوم و فنون کشاورزی و منابع طبیعی)، سال یازدهم شماره 1 (پیاپی 39، بهار 1386)، ص 345
گزارش ها در زمینه اثر قارچ های اندوفایت بر عملکرد و اجزای عملکرد بذر اندک و گاها متناقض است. این پژوهش به منظور بررسی تاثیر همزیستی قارچ های اندوفایت بر میانگین و واریانس عملکرد و اجزای عملکرد بذر در فسکیوی بلند انجام گردید. کلون های عاری از اندوفایت (-E) ازطریق اعمال قارچ کش روی کلون های حاوی اندوفایت (+E) در گلخانه ایجاد و سپس هر دو نوع کلون به مزرعه انتقال داده شدند. طی دو سال مجموعه ای از صفات شامل عملکرد و اجزای عملکرد بذر بر روی کلون ها اندازه گیری گردید. حضور قارچ های اندوفایت میانگین عملکرد بذر تک بوته، تعداد دانه در بوته و تعداد خوشه در بوته را به ترتیب 8/32، 6/34 و 6/30 درصد افزایش داد. بین ژنوتیپ ها از نظر میزان تاثیرپذیری از اندوفایت تنوع وجود داشت. واریانس های فنوتیپی برای اکثر صفات معنی دار بود. اثر متقابل ژنوتیپ و قارچ برای تعداد دانه در بوته معنی دار بود که منجر به اختلاف معنی دار واریانس های فنوتیپی و ژنوتیپی بین کلون های +E و -E برای این صفت گردید به طوری که حضور اندوفایت باعث کاهش شدید در واریانس ژنتیکی این صفت گردید. این نتیجه نشان می دهد که حضور اندوفایت بخشی از تنوع ژنتیکی را پنهان کرده است، بنابراین بهتر است که از سایر اجزای عملکرد غیر از تعداد دانه در بوته برای افزایش عملکرد بذر استفاده گردد. نتایج این پژوهش نشان داد که حضور اندوفایت توان تولید مثلی گیاه را در ارتباط با عملکرد و اجزای عملکرد گیاه بهبود می بخشد که می تواند انگیزه اصلاحگران را برای انتقال این رابطه همزیستی به سایر گیاهان افزایش دهد لیکن بایستی توجه داشت که در مورد صفاتی که اثر متقابل قارچ و گیاه در آنها معنی دار است، حضور قارچ بخشی از تنوع ژنتیکی واقعی را پنهان می کند و برای این صفات بهتر است انتخاب به طور غیر مستقیم از طریق سایر صفات صورت پذیرد و یا انتخاب و اصلاح در جوامع فاقد اندوفایت انجام گردد و سپس اندوفایت مناسب در گیاهان اصلاح شده تلقیح گردد.
کلید واژگان: قارچ اندوفایت, صفات بذری, واریانس فنوتیپی و ژنتیکیSeed traits are an important measure of the effects of endophytic fungi in Festuca genus. In this study, endophyte-infected (E+) and un-infected (E-) clones of the same tall fescue genotypes were used to investigate the effects of endophyte on the seed production and associated traits. Endophyte infection resulted in 32.8% increase of total seeds by weight, 34.6% seeds per plant, and 30.6% panicles per plant, but other seed components were not affected by endophyte. Significant phenotypic variances were observed for traits except for 1000 seed weight. Plant genotype×fungal status interactions occurred for seed per plant. These interactions occurred largely because of variation in different plant genotypes. Genetic variance for this trait in E+ was greater than E- for both years, suggesting that the endophyte can mask plant genotypic variance. The results indicated that endophyte had a positive effect on seed production but could result in overestimating of plant genetic variance for some traits. In conclusion, breeding strategies should consider presence or absence of endophyte and the possible effects on variances.
Keywords: Endophytic fungi, Seed traits, Phenotypic, genetic variances -
نشانگرهای تک نوکلئوتیدی تمامی جایگاه های صفات کمی را تحت پوشش قرار داده و به طور بالقوه تمام واریانس ژنتیکی را توجیه می کنند. در این پژوهش از SNPهای گوسفندان سافوک استرالیایی که با تراشه نشانگری 50k شرکت ایلومینا، تعیین ژنوتیپ شده بودند، به منظور برآورد اجزای واریانس ژنومی، استفاده شد. صفات مورد بررسی وزن تولد و وزن شیرگیری بودند. کنترل کیفیت برای فراوانی آللی کمیاب (MAF) در دو آستانه یک و پنج درصد انجام گرفت. برای مطالعه رابطه بین فراوانی آللی و مقدار واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده، SNPها در پنج گروه مختلف MAF، با تعداد تقریبا برابر در هر گروه، طبقه بندی شدند. تجزیه و تحلیل ها با رویکرد حداکثر درست نمایی محدود شده ژنومی و روش تجزیه و تحلیل صفات پیچیده ژنوم گسترده، انجام گرفت. مقدار وراثت پذیری ژنومی برآورد شده توسط SNPهای با MAF بیشتر از یک درصد، برای اوزان تولد و شیرگیری به ترتیب برابر 45/0 و 19/0 و برای SNPهای با فراوانی آللی کمیاب بیشتر از 5 درصد به ترتیب برابر 42/0 و 18/0 بود. سهم گروه های مختلف SNPهای با فراوانی آللی کمیاب در توجیه واریانس ژنتیکی برای دو صفت متفاوت بوده و به طور کلی بخش قابل توجهی از واریانس ژنتیکی، توسط SNPهای با 20/0 MAF < توجیه شد. با توجه به نتایج به دست آمده حجم نمونه بسیار بزرگ، ایده آل و پوشش بهتر واریانت های با فراوانی پایین مورد نیاز است تا استنتاج قوی تر و قابل اعتمادتری به دست آید.کلید واژگان: واریانس ژنومی, گوسفند سافوک, فراوانی آللی, انتخاب ژنومیSince SNP markers in genomic selection spread across the genome, they may potentially explain all of genetic variation. In this study, genotype data from Suffolk sheep, genotyped by 50k Illumina SNP chip were used. Birth weight and weaning weight traits were studied in this research. Quality control for minor allele frequency at two thresholds, one and five percent were studied. To study the association between allele frequency spectrum and captured additive genetic variance, all SNPs were partitioned in five MAF bins with the equal numbers of SNPs. The analysis were performed using GREML approach via GCTA method. Using all SNPs with MAF>0.01 estimates of genomic heritability were 0.45 and 0.19 for birth weight and weaning weight, respectively. For MAF>0.05 these values were 0.42 and 0.18 respectively. The contribution of different groups of SNPs with rare allele frequency in justifying genetic variation for the two traits was different. In general, a significant portion of the genetic variance was explained by SNPs with a MAFKeywords: Genomic Variance, Suffolk Sheep, Allele Frequency, Genomic selection
-
هدف از این مطالعه بررسی تاثیر خطای برآورد اثرات QTL با در نظر گرفتن وجود انحراف غالبیت بر پاسخ به انتخاب به کمک مارکرهای ژنتیکی بود. جمعیتی پایه برابر 1000 نفر غیرخویشاوند و غیرهمخون بر اساس وراثت پذیری های 1/0 و 3/0 که تحت تاثیر QTL با اثرات مختلف افزایشی و غابیت و اثر پلی ژنتیک باقی مانده قرار داشتند شبیه سازی گردید. اثرات QTL با خطای صفر، ده و بیست درصد در نظر گرفته شد و دو سطح غالبیت کامل و غیر کامل برای QTL فرض گردید. پاسخ به انتخاب برای انتخاب به کمک مارکر و انتخاب بدون استفاده از مارکر محاسبه گردید. پاسخ به انتخاب بر اساس انتخاب توده ای 20 درصد از افرادی که بیشترین شاخص انتخاب را داشته اند محاسبه گردید. نتایج نشان داد انتخاب به کمک مارکرهای ژنتیکی باعث افزایش پاسخ به انتخاب می شود اما وجود اثرات غالبیت در شرایطی که اثر QTL با خطا توام باشد باعث کاهش پاسخ به انتخاب می گردد و در شرایطی که خطای برآورد بالا باشد پاسخ به انتخاب به کمک مارکر کمتر از پاسخ انتخاب بدون استفاده از مارکر خواهد بود. نتایج این آزمایش نشان داد پارامترهای QTL قبل از استفاده در برنامه های اصلاحی کاربردی بایستی از دقت بالا برخوردار باشد.کلید واژگان: انتخاب به کمک مارکر, انحراف غالبیت, جایگاه های ژن های کمیIntroduction During years genetic improvement of economically important traits, which are amongst polygenic traits, has been based on the estimation of breeding values i.e. the total heritable effects of genes, based on pedigree and phenotypic records. This approach had limitations such as being time consuming and demanding massive phenotypic information. Nowadays, high throughput genomic technologies are available that provide genotypes of dense markers across genome towards estimating breeding values more accurately. Accurate estimation of allelic and genotypic effects of markers in linkage with QTLs needs a lot of phenotypic observations which is not always available in practice. Therefore, the amount of error of estimated QTL effect could be high. Further, the distribution of the effects of genes controlling traits might be non-non-normal. In case of overlooking these facts, the predicted genetic progress can be erroneous. The objective of this study was to find the influence of the accuracy of QTL effect estimation, considering the dominance deviation, on marker assisted selection response.
Materials and Methods A base population of 1000 unrelated, non-inbred individuals was simulated according to a trait with heritability of 0.1 and 0.3. The trait was affected by residual polygenic and QTL with additive effect associated with 0.0, 0.1 and 0.2 standard errors and complete or incomplete dominance effect. The genotypic effects of the three QTL genotypes were a, d and a, respectively for dominant homozygotes, heterozygotes and recessive homozygotes. The QTL had two alleles and the dominance deviation was considered either equal to or half of the genotypic effect a. The population was in Hardy-Weinberg equilibrium. The polygenic variance was calculated as the difference between total additive genetic variance and QTL variance. Residual variance was equal to the difference between phenotypic variance and total additive genetic variance. Two selection was employed; one with polygenes and marker information, and the other one with polygenic variance without marker information. The difference between mean of selected group and the population mean was considered as response to selection. The selection response calculated by truncation selection based on the performance of top 20% with and without using QTL information over 500 repetitions.
Results and Discussion The results showed higher response for marker assisted selection compared to conventional selection without marker information, but it also showed the presence of dominance effect for QTL effect associated with estimation errors leads to decrease in marker assisted selection response. The superiority of genetic progress with marker assisted selection is proportional to the QTL variance contributing to the total genetic variance. Increasing standard error of QTL effect to 10 and 20 percent, led to lower genetic response to selection. When the contribution of QTL variance in total genetic variance is higher, with high levels of standard error of QTL effect, the response to selection was even lower than response to selection without marker information. Complete dominance further decreased the genetic response compared to incomplete dominance. This is because the genetic variance is more influenced by the dominance variance in case of complete dominance.
Conclusion This study showed that QTL information may be used in practical selection programs when estimated parameters are of high accuracy to be used in practical selection programs. Estimating QTL effects with error causes that selection response would be even lower than polygenic selection if the associated error rate is high. Estimated effects of genes controlling quantitative traits should have less error rate in order to be used in breeding programs.Keywords: Dominance deviation, Marker assisted selection, QTL -
برای مطالعه نحوه توارث مقاومت به گسترش قارچ Fusarium graminearum در سنبله های گندم در شرایط گلخانه ای، مقاومت شش رقم گندم بهاره(Triticum aestivum L.) با سطوح مختلف مقاومت و 15 نتاج F1 حاصل از تلاقی دی آلل یک طرفه آن ها به دو جدایه قارچ مذکور به روش مایه زنی نقطه ای ارزیابی شد. برای ارزیابی مقاومت، گسترش بیماری 28 روز بعد از مایه زنی بر اساس مقیاس 5-0 یادداشت برداری و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. تجزیه دیالل به دو روش گریفینگ (روش دوم و مدل ثابت) و جینکز و هیمن انجام و مشخص شد که برای هر دو جدایه اثرات ترکیب پذیری عمومی (GCA) و ترکیب پذیری خصوصی (SCA) معنی دار بوده ولی اثرات GCA نسبت به SCA خیلی بیشتر است. تجزیه واریانس ژنتیکی نیز نشان داد که واریانس ژنتیکی افزایشی مهم تر از غالبیت می باشد. وراثت پذیری عمومی و خصوصی برای جدایه اول به ترتیب 0.89 و 0.63 و برای جدایه دوم به ترتیب 0.86 و 0.59 برآورد شد، در نتیجه انتظار می رود که انتخاب برای صفت مقاومت به فوزاریوم سنبله در نتاج حاصل از تلاقی ارقام مورد آزمایش موثر باشد.
کلید واژگان: گندم (Triticum aestivum L.), فوزاریوم سنبله, Fusarium graminearum, ژنتیک مقاومت, تجزیه دیاللTo study inheritance of resistance to spread of Fusarium graminearum in spikes of wheat resistance of six spring wheat cultivars (T. aestivum L.) representing different levels of resistance and all possible Fl combinations excluding reciprocals was evaluated with two isolates of F. graminearum. Resistance to spread of the fungus was evaluated in greenhouse by point injection method at anthesis stage. Data for disease spread were collected 28 days after inoculation based on a scals of 0-5. Diallel analysis was performed according to Griffing (method 2, modell) and Hayman and links methods. GCA and SCA effects were significant, but GCA effects were greater than SCA effects. Genetic variance analysis showed strong additive gene action for resistance. Broad sense and narrow sense heritabilities ranged from 0.86-0.89 and 0.59-0.63, respectively. The preponderance of additive genetic variance indicates that considerable progress can be expected from selection.
Keywords: Wheat, Triticum aestivum L, Fusarium head blight, Fusarium graminearum, resistance genetics, diallel analysis
-
از آنجا که گزینه «جستجوی دقیق» غیرفعال است همه کلمات به تنهایی جستجو و سپس با الگوهای استاندارد، رتبه‌ای بر حسب کلمات مورد نظر شما به هر نتیجه اختصاص داده شده‌است.
- نتایج بر اساس میزان ارتباط مرتب شده‌اند و انتظار می‌رود نتایج اولیه به موضوع مورد نظر شما بیشتر نزدیک باشند. تغییر ترتیب نمایش به تاریخ در جستجوی چندکلمه چندان کاربردی نیست!
- جستجوی عادی ابزار ساده‌ای است تا با درج هر کلمه یا عبارت، مرتبط ترین مطلب به شما نمایش داده‌شود. اگر هر شرطی برای جستجوی خود در نظر دارید لازم است از جستجوی پیشرفته استفاده کنید. برای نمونه اگر به دنبال نوشته‌های نویسنده خاصی هستید، یا می‌خواهید کلمات فقط در عنوان مطلب جستجو شود یا دوره زمانی خاصی مدنظر شماست حتما از جستجوی پیشرفته استفاده کنید تا نتایج مطلوب را ببینید.
* ممکن است برخی از فیلترهای زیر دربردارنده هیچ نتیجه‌ای نباشند.
-
معتبرحذف فیلتر
©2000-2025 magiran.com All Rights Reserved.