به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « گاو سیستانی » در نشریات گروه « علوم دام »

تکرار جستجوی کلیدواژه «گاو سیستانی» در نشریات گروه «کشاورزی»
  • مهدی خجسته کی، ابوالحسن صادقی پناه، نادر اسدزاده، علیرضا آقاشاهی، مرتضی کیخا صابر، مرتضی بیطرف ثانی*، سعید اسماعیل خانیان
    از آنجا که استفاده از روش های جایگزین، از جمله روش های مبتنی بر استفاده از هوش مصنوعی، می توانند فرآیند وزن کشی دام ها را تسهیل کند، مطالعه حاضر با هدف پیش بینی وزن گاوهای سیستانی با استفاده از فناوری بینایی رایانه ای انجام شد. بدین منظور، گاوهای سیستانی موجود در ایستگاه زهک برای یک دوره یک ساله وزن کشی شده و به طور هم زمان از نمای جانبی هر دام، تصاویر دیجیتال تهیه شد. تصاویر دیجیتال ابتدا با استفاده از نرم افزار Matlab مورد پیش پردازش قرار گرفت و سپس برخی خصوصیات شکل شناسی از هر یک از آنها استخراج شد. برای پیش بینی وزن گاوها، خصوصیات استخراج شده از تصاویر به عنوان ورودی و وزن هر دام به عنوان خروجی جهت آموزش به شبکه عصبی مصنوعی معرفی شد. مدلی که دارای بالاترین دقت و کمترین خطا بود به عنوان مدل نهایی جهت پیش بینی وزن دام ها انتخاب شد. بر اساس نتایج، قطر معادل، طول محور اصلی، طول محور فرعی، جعبه محاطی، مساحت قسمت محدب، مساحت ناحیه پر شده، محیط تصویر، مساحت تصویر و تعداد نقاط سفید تصویر دارای همبستگی بالاتری با وزن گاوهای سیستانی بود (01/0P<). مدل شبکه عصبی مصنوعی توانست با دقت 4/97 درصد، وزن گاوهای سیستانی را از روی خصوصیات تصاویر دیجیتال آن ها پیش بینی کند. نتایج مطالعه حاضر نشان داد، فناوری بینایی رایانه ای، قابلیت مناسبی برای پیش بینی وزن گاوهای سیستانی داشته و می تواند جایگزین روش های متداول کنونی شود.
    کلید واژگان: بینایی رایانه ای, پیش بینی وزن, گاو سیستانی, هوش مصنوعی}
    M. Khojastehkey, A. Sadeghipanah, N. Asadzadeh, A. Aghashahi, M. Keikhah Saber, M. Bitaraf Sani *, S. Esmaeilkhanian
    Introduction
    Sistani cows are generally restless animals; therefore, controlling, treating, and weighing them is difficult. On the other hand, recording the weight of domestic animals, including Sistani cows, is inevitable, because it provides a good scale for management decisions in the herd such as balancing the diet, changing environmental conditions, or determining the time of slaughter of fattening animals. In addition to scales, various methods are commonly used to measure the body weight of large animals. Some of these methods include the use of weight-meters, appraisal assessments, and the use of mathematical models. One of the new methods for predicting livestock weight is artificial intelligence. Because some reports are indicating that artificial intelligence could facilitate the weighing process of animals, this study was performed to predict the body weight of Sistani cows using computer vision technology.
    Materials and methods
    The data required for this study were recorded in the Zahak breeding station located in Sistan and Baluchestan province of Iran. The recording operation involved the weighing and biometric measurement of about 190 Sistani cattle, including calves, heifers, and male and female animals, every three months during a year. At the time of weighing, images of the lateral view of each animal were taken and recorded using the CANON SX150IS digital camera. During this period, a total of 358 weight records of Sistani cows at different ages were recorded. The digital images were initially preprocessed using MATLAB software, and then some morphological features were extracted from each image. For predicting the weight of Sistani cows via the Artificial Neural Network (ANN), the extracted features of images were introduced to the ANN model as input and the weight of cows as output. The "feed-forward neural network", which was trained by the "error propagation" algorithm, was used to predict the weight of cows. The function used in the hidden layer of the ANN model was sigmoidal and in the output layer was linear. An ANN model which had the highest precision and lowest error was selected as the final model for predicting the animal weights. The criteria for selecting the best model were the highest determination coefficient (R2) and the lowest mean square error (MSE) compared to other available models.
    Results and discussion
    Out of 22 features extracted from each image, only 15 of them, which had a higher correlation with the body weight of cows at different ages, were selected as effective features. As result, equivalent diameter, major axis length, minor axis length, bounding box, convex area, filled area, area, perimeter, and the number of non-zero pixels of the image (NNZ) had the highest correlation with the cattle weights (P<0.01) and used as effective features to train the ANN model. The final ANN model had 15 neurons in the input layer including selected image features, 11 neurons in the hidden layer, and one neuron in the output layer including the weight of the cows. The precisions of the artificial neural network in the training, validation, and test phase were 0.974, 0.970, and 0.981, respectively. The results showed that the final ANN model had acceptable precision in all light, medium, and heavy-weight cows, and the size and the age of animals did not have a significant effect on the precision of the artificial neural network model. A correlation between the actual weight of Sistani cows and the weights predicted by the ANN model was 98.3%. The average error of the model in predicting the weight of cows was 1.11%. In the practical test, a 2.32 kg deviation was observed between the predictions of the ANN model and actual weights in Sistani cows. The accuracy of the ANN model for predicting the weight of Sistani cows in the present study is acceptable and within the range of the other reports.
    Conclusions
    The proposed method based on image processing and ANN, had acceptable results in predicting the weight of Sistani cows. Given the difficulties of weighing Sistani cows as heavy livestock and sometimes the time-consuming process, it seems that the use of new technologies such as computer vision methods can be a good alternative to conventional weighing methods and facilitate and reduce recording costs of Sistani cows.
    Keywords: Computer vision, weight prediction, Sistani cattle, Artificial intelligence}
  • علی مقصودی*، اردشیر نجاتی جوارمی، حمیده نوری صادق، مرضیه جهان، حسین خانی بندانی، علیرضا حسنی بافرانی

    با توجه به آنکه در سال های اخیر جمعیت گاو سیستانی بنا به دلایل متعدد کاهش یافته است، لذا مطالعه حاضر با هدف بررسی علل و عوامل کاهش جمعیت این نژاد و راهکارهای افزایش جمعیت و احیای مجدد آن به انجام رسید. به این منظور با استفاده از روش دلفی پرسش نامه ای تهیه شد که در آن 21 دلیل کاهش جمعیت و 18 راهکار افزایش جمعیت گاوهای سیستانی از منظر 190 نفر از پرورش دهندگان و کارشناسان مورد بررسی قرار گرفت. اطلاعات جمع آوری شده پس از ویرایش با استفاده از نرم افزار Minitab مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همچنین با استفاده از آزمون ناپارامتری کروسکال-والیس پاسخ های دو گروه کارشناسان و بهره برداران با یکدیگر مقایسه شد. از نظر پرورش دهندگان، خشکسالی در سه دهه اخیر مهمترین عامل کاهش جمعیت گاو سیستانی است و از نظر هر دو گروه کم اهمیت ترین عامل موثر بر کاهش جمعیت، غیر اقتصادی بودن پرورش گاو سیستانی است. از نظر هر دو گروه، عوامل اقلیمی دارای بیشترین اهمیت در کاهش جمعیت گاو سیستانی هستند و تقریبا هیچ اختلاف نظری در این خصوص بین دو گروه مشاهده نشد (05/0 > P). از نظر پرورش دهندگان، حمایت اقتصادی از پرورش-دهندگان، مهمترین راهکار برای افزایش جمعیت گاو سیستانی است، در حالی که کارشناسان معتقدند مهمترین راهکار احیای تالاب هامون است. به طورکلی نتایج این مطالعه نشان داد که با توجه به اقلیم متغیر و ناسازگار دشت سیستان، توجه به مسایل اقتصادی و حمایت از پرورش دهندگان می تواند تاحد زیادی مشکلات ناشی از شرایط نامساعد اقلیمی را در احیای مجدد جمعیت گاوسیستانی در منطقه جبران نماید.

    کلید واژگان: انقراض, ذخیره ژنتیکی, گاو سیستانی, دشت سیستان}
    Ali Maghsoudi *, Ardeshir Nejati-Javaremi, Hamideh Noori-Sadegh, Marzieh Jahan, Hosein Khani-Bandani, Alireza Hasani Bafarani

    Reducing the population size of Sistani cattle due to the multi various reasons during the last years, was the motivation of the current study. Therefore, the aim of this study was to investigate the factors of population decline and strategies to increase the population and revive this breed. For this purpose, a questionnaire was developed using the Delphi method. Questionnaire was included 21 reasons and 18 strategies related to the situation of Sistani cattle population. Based on the breeders’ insight, drought in the Sistan region during last three decades was considered as the most important factor in reducing the population of Sistani cattle, and for both groups, the least important factor affecting population decline is the uneconomic importance of Sistani cattle (P < 0.05). Both groups were agreed that climatic factors are the most important in reducing the population of Sistani cattle and almost no differences in this regard were observed between the two groups (P > 0.05). From the breeders' point of view, economic support for Sistani cattle breeders is the most important way to support the Sistani cattle population, while experts believe that the most important way is to rehabilitate Hamoun Wetland. In general, the results of this study showed that due to the changing and varying climate of Sistan region, attention to economic issues and support for breeders can largely compensate for the problems caused by unfavorable climatic conditions in the rehabilitation of Sistani cattle population.

    Keywords: extinction, Genetic Resource, Sistani cattle, Sistan plain}
  • مهدی خجسته کی، مرتضی کیخاصابر*، سعید اسماعیل خانیان، نادر اسدزاده، محمدحسین بنابازی، اسحق نخزری

    این تحقیق با هدف بررسی امکان استفاده از فناوری ماشین بینایی در اندازه گیری ابعاد بدنی گاوهای سیستانی انجام شد. بدین منظور، رکورد ابعاد بدن شامل طول، ارتفاع شانه، ارتفاع کپل و دور سینه 179 راس دام موجود در ایستگاه پرورش گاو سیستانی زهک، در مقاطع زمانی مختلف، با استفاده از متر نواری اندازه گیری شد. هنگام رکوردبرداری تصاویری از نمای جانبی هر یک از دام ها با استفاده از دوربین دیجیتال Canon و از فاصله 2 متری دام ها تهیه شد. پردازش و استخراج خصوصیات عددی از تصاویر با استفاده از امکانات نرم افزار متلب انجام شد. خصوصیات تصاویر دیجیتال به عنوان ورودی و ابعاد مختلف بدن گاوها به عنوان خروجی شبکه عصبی مصنوعی در مرحله آموزش و برازش مدل مورد استفاده قرار گرفت. نتایج نشان داد که ازمجموع 22 ویژگی استخراج شده از تصاویر گاوهای سیستانی، تعداد 15 ویژگی که مهمترین آنها شامل قطر معادل، طول محور اصلی، طول محور فرعی، جعبه محاطی، مساحت قسمت محدب، مساحت ناحیه پرشده، محیط تصویر، مساحت تصویر و تعداد نقاط سفید تصویر بود با ابعاد بدن گاوها همبستگی بالا و معنی داری داشتند (p<0.01). ابعاد بدن گاوهای سیستانی شامل طول بدن، ارتفاع شانه، ارتفاع کپل و دور سینه به ترتیب با دقت 0/98، 0/97، 0/97و 0/98 درصد توسط مدل شبکه عصبی مصنوعی تخمین زده شد. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که فناوری هوش مصنوعی می تواند به عنوان جایگزین مناسبی برای ارزیابی بیومتریک گاوهای سیستانی عمل کرده و در صرف وقت و هزینه های مربوطه صرفه جویی نماید.

    کلید واژگان: هوش مصنوعی, بیومتری, گاو سیستانی}
    M. Khojastekey, Mortaza Keykhasaber *, S. Esmaeil Khanian, N. Asadzadeh, M. H. Banabazi, E. Nakhzari

    This research was conducted to investigate the possibility of using visual machine technology in measuring the body dimensions of Sistani cows. For this purpose, the record of body dimensions including length, shoulder height, hip height and chest circumference of 179 heads of livestock in Zahak Sistani cow breeding station, were measured at different time points, using a tape meter. At recording time, digital images were taken using the canon camera from the lateral view of cattle from distance of 2 meters. Digital image processing and feature extraction were performed using Graphical Unit Interference of MATLAB software. The feature of digital images as input and different body dimensions of cows as output of Artificial Neural Network(ANN) were used in the training and modeling phase. The results showed that, out of 22 features extracted from the images of Sistani cows, the 15 effective features, such as Equivalent Diameter, Major Axis Length, Minor Axis Length, Bounding Box, Convex Area, Filled Area, Area, Perimeter, and the number of white pixels of image (NNZ) had a significant correlation with the body dimensions of the Sistani cow(p<0.01). Body dimensions of Sistani cows including body length, shoulder height, hip height, and chest girths were estimated with accuracy of 0.98, 0.97, 0.97and 0.98%, by the ANNs model, respectively. The results of the present research showed that Artificial Intelligence Technology can act as a suitable alternative to biometric evaluation of Sistani cows and save time and relevant costs.

    Keywords: Artificial intelligence, Weight estimation, biometry, Sistani cattle}
  • افسانه احراری، lمصطفی یوسف الهی*، محمدرضا سنجابی، ناهید مژگانی، مهدی وفای واله، عبدالفتاح بن سالم
    سابقه و هدف

    شکمبه گاو محل نگهداری بسیاری از باکتری ها است که مسیول تبدیل مواد غذایی به انرژی هستند. در سال های اخیر بسیاری از میکروب های شکمبه با استفاده از توالی یابی ژن 16sRNA شناسایی و جداسازی شده اند. بعضی از میکروب ها به عنوان افزودنی های خوراکی برای پیشرفت رشد و تولید حیوانات پیشنهاد می شوند. استفاده از پروبیوتیک ها به عنوان افزودنی خوراک سبب تعادل مطلوب میکروفلور روده میزبان می شود. بنابراین، هدف از انجام این تحقیق جداسازی، شناسایی و انتخاب باکتری های اسید لاکتیک برای تولید پروبیوتیک از شکمبه و مدفوع گاوهای سیستانی است.

    مواد و روش ها

    در این آزمایش از شکمبه 12 راس و مدفوع 4 راس گاو سیستانی در کشتارگاه صنعتی شهرستان زابل نمونه گرفته شد. نمونه های اخذ شده به لوله های آزمایش حاوی محیط کشت MRS مایع منتقل و به مدت 48 ساعت در دمای 39 درجه سانتیگراد گرمخانه گذاری شدند. پس از رشد از محیط مذکور بر روی پلیت های حاوی محیط MRS آگار کشت خطی انجام شد و پلیت ها به مدت 48 ساعت در شرایط هوازی در دمای 39 درجه سانتیگراد گرمخانه گذاری شدند. پرگنه های ظاهر شده از نظر خصوصیات رشد و مورفولوژی و همچنین، خلوص مورد بررسی قرار گرفتند. باکتری های گرم مثبت، فاقد اسپور، کاتالاز منفی کروی و میله ای شکل که همولیز بتا ایجاد نکردند، برای انجام آزمایشات ضد میکروبی، تحمل به اسید، نمک صفراوی و حساسیت به آنتی بیوتیک ها مورد بررسی قرار گرفتند.

    یافته ها

    از تعداد اولیه 158جدایه باکتری اسید لاکتیک 84 جدایه جهت انجام فعالیت ضد میکروبی علیه چهار گونه باکتری سالمونلا و یک گونه باکتری (E Coli) Escherichi.coli مورد بررسی قرار گرفتند. سپس جدایه های حاصل از آزمون ضد میکروبی جهت انجام آزمایش مقاومت به pH بررسی شدند. تعداد 13 نمونه منتخب از این آزمایش جهت انجام آزمون مقاومت به صفرا مورد مطالعه قرار گرفتند که از این تعداد پنج جدایه جهت انجام آزمون حساسیت آنتی بیوتیکی مورد بررسی قرار گرفت و به منظور آزمایش ژنتیکی و مولکولی وارد مرحله نهایی شد. آن چه از آزمون مولکولی و توالی ژنتیکی 16sRNA بدست آمد، تنها دو جدایه بود که بعد از توالی یابی و استفاده از نرم افزار NCBI قرابت ژنتیکی بالایی با دو باکتری Streptoccos infantarius (جدایه A) و Entrococcos faecium (جدایه B) داشت. این دو جدایه به عنوان پروبیوتیک بالقوه در گاوهای سیستانی مشاهده شدند.

    نتیجه گیری

     نتایج کلی تحقیق نشان داد جدایه های A و B ویژگی های مناسبی برای استفاده به عنوان پروبیوتیک دارند. این ویژگی ها شامل نرخ زنده مانی بالا در شرایط pH پایین و غلظت 3 درصد صفرا و همچنین، مقاومت آنتی بیوتیکی و عدم رشد در مواجهه با باکتری های بیماری زایی همچون (E.Coli) Escherichi.coli و Salmonella است. بنابراین، جدایه های A و B به عنوان پروبیوتیک در خوراک نشخوارکنندگان می توان استفاده نمود.

    کلید واژگان: پروبیوتیک, باکتری های اسید لاکتیک, گاو سیستانی}
    Afsane Ahrari, MohamadReza Sanjabi, Nahid Mojgani, Mehdi Vafaee Valeh, Abdolfatah Bensalem
    Background

    The bovine rumen is the suitable growth medium to many of the bacteria responsible for converting food into energy. In recent years, many rumen microbes have been identified and isolated using 16sRNA gene sequencing. Some microbes are suggested as food additives to promote the growth and production of animals. The use of probiotics as feed additive has been induced by stimulating the positive effects on the host by creating a favorable balance of intestinal microflora. Therefore, is study aimed to isolate, identify and select lactic acid bacteria to produce probiotics from the rumen and feces of Sistani cows.

    Material and Method

    In this experiment, samples were taken from the rumen of 12 and the feces of 4 Sistani cows in the industrial slaughterhouse of Zabol city. The samples were transferred to test tubes containing liquid MRS culture medium and incubated at 39 ° C for 48 hours. After growing from the mentioned medium, the plates containing MRS agar were linearly cultured and the plates were incubated in aerobic conditions at 39 ° C for 48 hours. The emerged colonies were examined for growth characteristics and morphology as well as purity. Gram-positive, spore-free, spherical negative catalase, and rod-shaped bacteria that did not produce beta hemolysis were tested for antimicrobial, acid, bile salt, and antibiotic susceptibility testing.

    Results

    Of the initial 158 isolates of lactic acid bacteria, 84 isolates were tested for antimicrobial activity against four species of Salmonella and one species of E. coli. Then the isolates obtained from the antimicrobial test were examined for pH resistance test. Thirteen samples selected from this experiment were studied for bile resistance test, of which five isolates were examined for antibiotic susceptibility testing and entered the final stage for genetic and molecular testing.There were only two isolates that were obtained by molecular testing and after sequencing and using NCBI software had a high genetic affinity with two bacteria Streptoccos infantarius (isolate A) and Entrococcos faecium isolate B. These two isolates were observed as potential probiotics in Sistani cows.

    Conclusion

    The general results of the study showed that isolates A and B have suitable properties for the use of probiotics. . These characteristics are high survival rate at low pH and 3% bile concentration and inhibition of pathogenic bacteria such as E. coli and Salmonella, as well as antibiotic resistance. Therefore, isolates A and B will later be used as probiotics the ruminants feed.

    Keywords: Probiotic, Acid lactic bacteria, Sistain cow}
  • بتول اصغری اسفدن، غلامرضا داشاب*، محمدحسین بنابازی، محمد رکوعی

    جهش در طول توالی ژن ها سبب بروز تغییرات نوکلیوتیدی و درنتیجه ایجاد عملکرد جدید در ژن ها می شود. هدف از مطالعه حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی و تحلیل بیان متفاوت ژن های مرتبط با سیستم ایمنی در بین دو جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد بود. در این مطالعه از نتایج مربوط به آنالیز بیان افتراقی در بین جمعیت گاو های نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq جهت تجزیه ژنتیکی و ترسیم درخت فیلوژنتیکی استفاده شد. توالی های نوکلیوتیدی با روش ClustalW توسط نرم افزار MegaAlign هم ردیف سازی شدند و درخت فیلوژنتیکی و ماتریس تفاوت و تشابه توالی ها ترسیم  شد. بر اساس نتایج این تحقیق، میانگین اختلاف نوکلیوتیدها و تعداد کل جهش ها برای ژن های مورد مطالعه در بین جمعیت های گاو نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد به ترتیب در محدوده ی (2598/66-186) و (3898-74) قرار داشت. هم چنین، نواحی حفاظت شده بخش اندکی از توالی ژن های مورد مطالعه را تشکیل دادند که این امر نشان دهنده چند شکلی بالای این ژن ها و هم چنین مستعد بودن به تغییرات نوکلیوتیدی و جهش می باشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنی توالی نوکلیوتیدی ژن های مورد مطالعه نشان داد که تنوع ژنتیکی و واگرایی برای ژن های مورد مطالعه در بین جمعیت های گاو نژاد خالص، آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد و ایندیکوس وجود دارد. میزان عددی نسبت جایگزینی dN/dS برای ژن های مورد مطالعه نشان دهنده انتخاب مثبت این ژن ها بود.

    کلید واژگان: تکامل, تنوع ژنتیکی, جهش, فیلوژنتیک, گاو سیستانی}
    Batol Asghariesfeden, Gholam Reza Dashab*, MohammadHossein Banabazi, Mohammad Rokouei

    Mutations during gene sequencing lead to nucleotide changes, resulting in new function in gene. The aim of the present study was to evaluate the genetic diversity and analysis the reasons for the differential expression of immune-related genes between the two populations of purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cows. In this study, the results of the analysis of differential expression among the population of purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cows using RNA-Seq data were used for genetic analysis and phylogenetic tree mapping. Clustal W nucleotide sequences were aligned using the MegaAlign software, and the phylogenetic tree and matrix of differences and similarities of the sequences were plotted. Based on the results of this study, the mean difference between nucleotides (nucleotide divergence) and the total number of mutations for the studied genes among purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde populations were in the range (2598-1869) and (3898-74) . Also, conserved regions make up a small part of the sequence of genes studied, indicating a high polymorphism of these genes and their susceptibility to nucleotide changes and mutations. The results of the phylogenetic tree for the nucleotide sequence of the studied genes showed that there is genetic diversity and divergence in the studied genes among purebred and crossbreed Sistani and Montebilliard and Indicus populations. The numerical value of the dN/dS ratio for the studied genes indicated the positive selection for these genes.

    Keywords: Evolution, Genetic diversity, Mutations, Phylogenetic, Sistani cows}
  • سجاد شهدادی ساردو، مهدی وفای واله*، غلامرضا داشاب، محمد رکوعی
    نشان داده شده است که بروز هر گونه تغییر در عملکرد ژنهای DNMTs اثرات شگرفی بر فرآیند تکوین جنین و نیز وزن تولد در پستانداران دارد، لذا هدف از انجام این تحقیق بررسی چندشکلی ژن های خانواده DNA متیل ترانسفراز و ارتباط آن ها با وزن تولد در گاو سیستانی بود. خون گیری به طور تصادفی از 60 راس گاو سیستانی به عمل آمد. استخراج DNA با استفاده از روش فنول کلروفرم انجام شد. نواحی کاندیدا برای وجود جهش شامل قطعه های 114 جفت بازی واقع در اگزون 33 ژن DNMT1، قطعه 176 جفت بازی واقع در اینترون 4 ژن DNMT3a و قطعه 207 جفت بازی واقع در اینترون 3 ژن DNMT3b توسط واکنش زنجیره ای پلی مراز تکثیر شدند. به منظور بررسی وجود چند شکلی در ژن های هدف از روش PCR-SSCP به وسیله ی ژل پلی آکریل آمید و رنگ آمیزی نیترات نقره استفاده گردید. ارزیابی نتایج دلالت بر عدم وجود تنوع الگوهای باندی در تمام نمونه های مورد بررسی داشت. بر اساس نتایج این مطالعه به نظر می رسد که عدم مشاهده تنوع ژنتیکی در نواحی مورد بررسی احتمالا دلالت بر انتخاب بر علیه وقوع جهش های خاص در جمعیت مورد نظر دارد. در مجموع براساس نتایج این مطالعه ارزیابی تنوع ژنتیکی در نواحی مورد بررسی، جهت شناسایی مارکرهای موثر در برنامه های اصلاحی صفات تولیدی در گاو سیستانی فاقد کارایی می باشد
    کلید واژگان: ژن های DNA متیل ترانسفراز, چند شکلی, گاو سیستانی, PCR-SSCP}
    Sajjad Shahdadi Sardo, Mehdi Vafaye Valleh *, Gholam Reza Dashab, Mohammad Rokouei
    It has been shown that the occurrence of any changes in the function of DNMTs genes has a significant effect on both the embryo development and birth weight in mammals; therefore, the aim of the present study was to investigate the presence of DNA polymorphisms in the members of DNA methyl transferase superfamily and its relationship with birth weight in Sistani cattle’s. Blood sampling was done randomly from 60 Sistani cows. DNA extraction was performed using phenol chloroform method. Candidate region for the presence of functional polymorphism within the DNMTs gene including the 114-bp fragment of the exon 33 of the DNMT1 gene, the 176-bp fragment of the intron 4 of the DNMT3a gene, and the 207-bp fragment in intron 3 of the DNMT3b gene were amplified by polymerase chain reaction. PCR-SSCP followed by polyacrylamide gels silver stain analysis was done to evaluate the presence of candidate mutations in target gens. The result analysis of all analyzed region did not show any mutations in the investigated DNMTs genes. Based on the results of this study, it seems that the lack of observation of genetic diversity in the studied regions could be related to the evolutionary selection against occurrence of specific mutations in the analyzed population. In general, based on the results of this study, analysis of genetic diversity in the studied genomic region may not be effective in identifying effective markers for breeding programs in Sistani cows.
    Keywords: DNA Methyltransferases Genes, Polymorphism, Sistani cattle, PCR-SSCP}
  • حسین اکبری، غلامرضا داشاب، مهدی وفای واله
    به منظور بررسی چند شکلی ژن MEG9 و ارتباط آن با وزن تولد در گاوهای سیستانی، از تعداد 130 راس گوساله (نر و ماده) مرکز به گزینی گاو سیستانی به طور تصادفی خونگیری به عمل آمد. استخراج DNA از خون کامل به روش فنل-کلروفرم انجام شد. واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) جهت تکثیر قطعه 210 جفت بازی واقع در اگزون 3 ژن مذکور با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام شد. شناسایی جهش ها با روش SSCP با الکتروفورز محصولات پی سی آر بر روی ژل پلی آکریل آمید 8 درصد و رنگ آمیزی نیترات نقره انجام گرفت. به منظور بررسی ارتباط الگوهای شناسایی شده در جایگاه ژنی MEG9 با وزن تولد در گوساله های گاو سیستانی از مدل های ثابت خطی و مقایسه میانگین ها با روش توکی-کرامر انجام گرفت. نتایج مطالعه در جایگاه ژنی MEG9 سه الگوی باندی (ژنوتیپ) q1، q2 و q3 را به ترتیب با فراوانی های 37، 34 و 29 درصد نشان داد. مطالعه همبستگی الگوهای مشاهده شده در جایگاه ژنی MEG9با صفت وزن تولد معنی دار بود (05/0P<). در نهایت، نتایج این مطالعه نشان داد که ژن MEG9 می تواند یک نشانگر مولکولی مناسب جهت انتخاب وزن تولد در گاوهای سیستانی باشد.
    کلید واژگان: MEG9, چند شکلی, PCR, SSCP, گاو سیستانی, وزن تولد}
    Hossien Akbari, Gholamreza Dashab, Mehdi Vafaye Valleh
    To determine of MEG9 gene polymorphism and its association with birth weight in Sistani cattle, the blood sample of 130 calves (male and female) were randomly collected belonging to Sistani cattle Research Center. The DNA extraction from whole blood was performed using phenol-chloroform procedure. Polymerase chain reaction was performed for amplification of 210-bp segments of exon 3 of MEG9 gene using specific primers. Detection of mutations were carried out by electrophoresis of poly-acrylamide gel 8% and silver staining using SSCP method. Association study of allele patterns with birth weight was done with fixed linear model and comparison of means was conducted by Tukey-kramer method. Results showed that three allele patterns including q1, q2 and q3 in PCR product of MEG9 gene in Sistani cattle with frequency of 37, 34 and 29 % respectively. The genetic diversity in MEG9 gene had significant correlation with birth weight (P
    Keywords: Birth weight, MEG9, PCR, SSCP, Polymorphism, Sistani cattle}
  • حسین مرادقلی، غلامرضا داشاب *، مهدی وفای واله
    گاو سیستانی نژاد گوشتی و از ذخایر ژنتیکی با ارزش کشور است که از لحاظ تولید گوشت، کمیت و ‏کیفیت لاشه و بازده غذایی مناسب است. در پژوهش حاضر به منظور بررسی چند شکلی ژن ‏TFAM‏ ‏‏(‏Mitochondrial transcription factor A‏) با استفاده از ‏PCR-RFLP، از 150 راس‏ گاو سیستانی به صورت تصادفی و انفرادی خونگیری از ورید گردنی انجام گرفت. سپس نمونه های خون دام ها با روش ‏شستشوی نمکی بهینه شده استخراج وکیفیت آنها با الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد بررسی گردید. ناحیه ‏پروموتور جایگاه ‏TFAM‏ به طول ‏bp‏801 با روشPCR تکثیر و محصول ‏PCR‏ توسط آنزیمBsuRI برش داده شد. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز با ژل آگارز ‏3 درصد و رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید ‏نمایان سازی گردید. با توجه به این که آنزیم برشی مذکور در قطعه تکثیر شده دارای چندین سایت برشی ‏می باشد، نتایج الگوی هضمی در حیوانات هموزیگوت (‏AA‏) سه باند با اندازه 152، 187 و 462‏ جفت باز، ‏در حیوانات هموزیگوت (‏CC‏) چهار باند با اندازه 83، 104، 152 و 462 جفت باز و نهایتا‏ در حیوانات ‏هتروزیگوت (‏AC‏) پنچ باند با اندازه های 83، 104، 152، 187 و 462 جفت باز مشاهده گردید. داده های آماری با استفاده نرم افزار ‏POPGENE3.2 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. جمعیت در جایگاه ‏TFAM‏ ‏انحراف از تعادل هاردی-‏ واینبرگ را نشان داد(05/0>‏P‏). شاخص شانون(‏I‏)، شاخص نئی، هتروزیگوسیتی‏ مشاهده شده و هتروزیگوسیتی‏ مورد انتظار به ترتیب، 69، 49، 37، 50 درصد محاسبه شد. در مطالعه حاضر ‏ارتباط معنی داری بین ژنوتیپ های گاو سیستانی در جایگاه ژنTFAM با صفات رشد مشاهده نشد .
    کلید واژگان: گاو سیستانی, صفات رشد, افزایش وزن, ژن TFAM}
    Hossein Moradgholi, Gholam Reza Dashab *, Mehdi Vafa Valleh
    Sistani beef cattle is a native breed of east of Iran that as a valuable genetic resource in the ýtropical area could be good a candidate to produce high quantity of muscularþ þcarcass portions ýwith highþ þefficiency. In order to explore the Mitochondrial transcription factor A gene ýý(TFAM) polymorphisms using PCR-RFLP, 150 Sistani cows were randomly selected and ýthen blood samples were taken from the jugular vein of each animal individually. ýThereafter, blood samples wereþ þsalting-out and electrophoresed with 1% agarose gel. The ýposition of the TFAM promoter region amplified by PCR and PCR products with 801bp ýlength were sliced byþ þBsuRI enzyme. Digestion products on 3% agarose gel were shown by ýelectrophoresis and staining with ethidium bromide. The patterns of digestion in AA ýhomozygotes, CC homozygotes, and AC heterozygotes were as follows: three bands with ýý152, 187, and 462bp; four bands with 83, 104, 152, and 462bp; and five bands with 83, 104, ýý152, 187, and 462bp, respectively. The results showed that the position of TFAM population ýdeviated from the Hardy-Weinberg equilibrium (P
    Keywords: Sistani? ?cattle, ?Growth traits, Daily gain, TFAM gene}
  • M. Dehmardeh, Gh. R. Dashab *, M. Vafaye Valleh
    The objective of the present study was to determine the extent of BOLA-DRB3 locus polymorphism in a herd of Sistani Cattle and their associations with body weight traits including birth weight, 3, 6, 9 and 12 months, and blood serum biochemical such as total protein, albumin and globulin. For this, blood samples collected randomly from 143 Sistani Cattle in a research herd at the Sistani Cattle Research Centre. DNA extraction from complete blood samples was performed with optimized saline method. The amplification of the 284-bp fragment of the BoLA-DRB3 gene was performed in two steps. In the first step, the HLO30 and HLO31 primers were used and in the second step the HLO30 and HLO32 primers were used. Then, the amplified fragment was digested by HaeIII enzyme. The digestion products were resolved on electrophoresis of 3% gel agarose. Population and genetic structure was calculated with POPGENE software and probable genotype patterns association with body weight traits and blood biochemistry traits were implemented by fixed linear model. The results of this study revealed two alleles and three genotypes as aa, bb and ab in locus of BOLA-DRB3.2 in Sistani cattle. Genotype frequencies of aa, bb and ab were 30, 41 and 28%, respectively, and alleles frequencies of a and b were calculated 44 and 56%, respectively. In this experiment, the Shannon index (I), Nei's index, heterozygosity was observed and the expected heterozygosity were calculated 69, 49, 28 and 50 respectively. The analysis of likelihood ratio test and X2 in BOLA-DRB3.2 showed that the population of Sistani cattle studied in this study was beyond the Hardy-Weinberg equilibrium. Also, the correlation of different genotypes with body weight traits including birth, 3, 6, 9 and 12 months, and biochemical characteristics of serum were not significant.
    Keywords: Sistani cattle, MHC, Polymorphism, PCR-RFLP}
  • فاطمه میر، محمد رکوعی، غلام رضا داشاب، هادی فرجی آروق
    هدف از انجام تحقیق حاضر، کمک به طراحی برنامه به گزینی پایه برای گاوهای سیستانی با استفاده از شبیه سازی تصادفی بود. بدین منظور سه اندازه جمعیت (500، 1000، و 2000 راس)، سه سطح تعداد گله (5، 10، و 20)، دو سطح شدت انتخاب (زیاد و کم)، و دو سطح روش آمیزش (تصادفی و حداقل هم تباری) با هم ترکیب و درمجموع 36 راهبرد در مدت 30 سال شبیه سازی مقایسه شد. نتایج نشان داد که اثر همه عوامل بر پیشرفت ژنتیکی سالانه برای شایستگی کل، پیشرفت ژنتیکی سالانه وزن تولد (به استثنای روش آمیزش و شدت انتخاب) و وزن یک سالگی، تغییر سالانه هم خونی (به استثنای تعداد گله)، فاصله نسل (به استثنای روش آمیزش و شدت انتخاب)، و صحت انتخاب نرها و ماده ها معنی دار بود (01/0P<). پیشرفت ژنتیکی سالانه در حالت شدت انتخاب زیاد، اندازه جمعیت 2000، و تعداد گله کم (5 گله) در مقایسه با شدت انتخاب کم، اندازه جمعیت 500، و تعداد گله بیشتر (20 گله) به ترتیب 5/8، 2/93، و 38درصد بیشتر بود. در آمیزش با حداقل هم تباری باوجود کمتربودن پیشرفت ژنتیکی (11درصد)، افزایش سالانه هم خونی در مقایسه با آمیزش تصادفی کمتر بود. نتایج تحقیق نشان می دهد که در برنامه های به گزینی گاو سیستانی باید تعداد گله کم، اندازه جمعیت بزرگ، و شدت انتخاب زیاد باشد و برای کنترل هم خونی جمعیت، آمیزش با روش حداقل هم تباری انجام گیرد.
    کلید واژگان: آمیزش تصادفی, اندازه جمعیت, تعداد گله, شبیه سازی, گاو سیستانی}
    Fatemeh Mir, Mohammad Rokouei, Gholamreza Dashab, Hadi Faraji, Arough
    The aim of this study was to design the base breeding plan in Sistani cattle by using of stochastic simulation. For this purpose, three population size (500, 1000, 2000 heads), three levels of herd number (5, 10, 20), two levels of selection intensity (high and low) and two levels of mating method (random and Minimum co-ancestry) were combined together and in total 36 scenarios were compared for 30 years. Results showed that the effect of all factors on the annual genetic gain for total merit, the annual genetic gain of birth weight (except in mating method and selection intensity) and yearling weight, the annual inbreeding rate (except in herd number), generation interval (except in mating method and selection intensity) and selection accuracy of sire and dames was significant. The annual genetic gain in high selection intensity, population size of 2000 and less number of herd (5 herds) was 8.5, 93.2 and 38 percent higher than low selection intensity, population size of 500 and more number of herd (20 herds). Despite having less total genetic gain (11 percent) in Minimum co-ancestry mating, the annual inbreeding rate in this mating method was 18 percent lower than random mating. The results of this study showed that less number of herd, large population size and high selection intensity considered in breeding plans of Sistani cattle and minimum co-ancestry mating used for control of population inbreeding.
    Keywords: Number of herds, Population size, Random mating, simulation, Sistani cattle}
نمایش نتایج بیشتر...
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال