فهرست مطالب جلال مردانه
-
هدف :
عفونت های بیمارستانی همواره تهدیدی جدی برای بیماران بستری در بیمارستان به شمار می روند و در سال های اخیر ظهور ایزوله های مقاوم به آنتی بیوتیک نیز بر شدت این معضل افزوده است. نوع و میزان شیوع باکتری های مولد عفونت بیمارستانی می تواند در مناطق جغرافیایی مختلف متفاوت باشد بنابراین بررسی دوره ای نوع عفونت و نیز تغییر الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی باکتری ها بسیار حائز اهمیت می باشد. از اینرو این مطالعه با هدف بررسی تغییر الگوی مقاومت میکروبی در باکتری های جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت بیمارستانی بستری در بیمارستان علامه بهلول گنابادی در طی سال های 1396 تا 1399 انجام شد.
مواد و روش ها:
بررسی مقطعی- توصیفی حاضر بر روی پرونده 392 بیمار با عفونت بیمارستانی بستری در بیمارستان علامه بهلول گنابادی در طی سال های 1396 تا 1399 انجام شد. سن و جنسیت بیماران، بخش بستری، نوع عفونت بیمارستانی، علت عفونت و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی از پرونده بیماران استخراج و در نهایت تمامی داده ها وارد نرم تفزار SPSS نسخه 21 شده و توسط تست های آماری توصیفی، تجزیه و تحلیل گردید و تغییر الگوی مقاومت میکروبی در باکتری های جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت بیمارستانی مورد بررسی قرار گرفت.
یافته ها :
از مجموع 44204 بیمار مورد بررسی، 392 بیمار عفونت بیمارستانی داشتند. در این مطالعه شیوع عفونت بیمارستانی 88/0 درصد بود. پنومونی وابسته به ونتیلاتور (14/32%)، عفونت ادراری (55/27%) و عفونت محل جراحی (15/20%) شایع ترین شکل عفونت بیمارستانی بودند. بیشترین میزان عفونت بیمارستانی مربوط به بخش مراقبت های ویژه بود. باکتری E. coli (6/%17)، کلبسیلا (2/12%) و آسینتوباکتر (9/10%) پاتوژن های غالب مولد عفونت های بیمارستانی بودند. نتایج مربوط به بررسی تغییر الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی نشان داد که میزان مقاومت آنتی بیوتیکی و فراوانی ایزوله های با مقاومت چند دارویی در طی 4 سال روند افزایشی داشت. تمام ایزوله ها به آمپی سیلین مقاومت 100% نشان دادند. جنتامایسین و آمیکاسین موثرترین آنتی بیوتیک مورد استفاده برای باسیل های گرم منفی بود.
نتیجه گیری :
با توجه به نتایج این مطالعه، الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در طی این 4 سال روند افزایشی داشته است و فراوانی سویه های با مقاومت چند دارویی نیز رو به افزایش بوده است. از طرفی افزایش قابل توجه مقاومت آنتی بیوتیکی در بین ایزوله های عامل عفونت بیمارستانی در سال های اخیر یک خطر جدی است. بنابراین شناخت الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی می تواند به پزشک در انتخاب آنتی بیوتیک مناسب برای درمان بیماران کمک کننده باشد.
کلید واژگان: الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی, عفونت بیمارستانی, مقاومت چند دارویی}AimsNosocomial infections have always been a serious threat to hospitalized patients, and in recent years, the emergence of antibiotic-resistant isolates has aggravated the severity of this problem. The type and rate of bacteria causing nosocomial infection can vary across different geographical areas; therefore, it is of utmost importance to periodically check the type of infection and variations in the antibiotic resistance pattern of bacteria. Therefore, this study aimed to assess the variation in antimicrobial resistance patterns in bacteria isolated from patients with nosocomial infection hospitalized in Allameh Bohlool Gonabadi Hospital from 2017-2020.
Materials & MethodsThe present cross-sectional descriptive study was conducted on 392 patients with nosocomial infection admitted to Allameh Bohllol Gonabadi Hospital from 2017-2020. The age and gender of the patients, the hospital department, the type of hospital infection, the cause of the infection, and the pattern of antibiotic resistance were extracted from the patient's files. Finally, all the data were analyzed in SPSS software (version 21) using descriptive statistical tests, and the variation in antimicrobial resistance pattern in bacteria isolated from patients with nosocomial infection was investigated.
FindingsOut of 44,204 examined patients, 392 cases had nosocomial infections. The rate of nosocomial infection was 0.88%. Ventilator-related pneumonia (32.14%), urinary infection (27.55%), and surgical site infection (20.15%) were the most common nosocomial infections. The highest rate of nosocomial infections was related to the intensive care unit. E. coli (17.6%), Klebsiella (12.2%), and Acinetobacter (10.9%) were the dominant pathogens causing nosocomial infections. The results regarding the variation in antibiotic resistance pattern demonstrated that the rate of antibiotic resistance and the frequency of isolates with multidrug resistance increased over four years. All the isolates showed 100% resistance to ampicillin. Gentamicin and amikacin were the most effective antibiotics used for gram-negative bacilli.
ConclusionAs evidenced by the obtained results, there was a significant increasing trend in the resistance of isolates to all studied antibiotics during these four years; moreover, the frequency of multidrug-resistant strains was also increasing. Furthermore, the marked increase in antibiotic resistance among isolates causing nosocomial infections in recent years is a serious risk. Therefore, a thorough knowledge of antibiotic resistance patterns can be of great help to physicians in selecting more appropriate antibiotics for treatment and preventing the development of antibiotic resistance.
Keywords: Antibiotic Resistance Pattern, Multidrug Resistance, Nosocomial Infections} -
هدف
استرپتوکوکوس گروهB از علل نسبتا شایع عفونت واژینال در زنان در سن باروری است، که در صورت ابتلای زنان باردار با پیامدهای ناگوار جنینی و نوزادی از جمله عفونت زودرس نوزادی، سقط، زایمان زودرس و مرگ نوزادی همراه است. با توجه به شیوع متفاوت استرپتوکوکوس گروهB در نقاط جغرافیایی مختلف، این مطالعه با هدف تعیین شیوع کلونیزاسیون استرپتوکوکوس گروه B در واژن زنان باردار مراجعه کننده به بیمارستان فاطمیه شهر همدان و عوامل مرتبط با آن در سال 1400 انجام گرفت.
مواد و روش هادر این مطالعه توصیفی تحلیلی یا روش نمونه گیری مبتنی بر هدف 130 نفر از زنان باردار مراجعه کننده به بیمارستان فاطمیه شهر همدان در سال 1400 از نظر کلونیزاسیون استرپتوکوکوس گروه B مورد بررسی قرار گرفتند. نمونه گیری با استفاده از سواپ استریل از ناحیه واژن انجام شد و سواب ها پس از قرار دادن در محیط اختصاصی Todd Hewitt broth به ازمایشگاه میکروب شناسی دانشکده پزشکی منتقل شدند. تست های تشخیصی باکتریایی جهت شناسایی استرپتوکوکوس گروه B انجام شد. نتایج پس از ثبت در چک لیست با نرم افزار SPSS نسخه 16 در سطح اطمینان 95% تحلیل شدند.
یافته هامیانگین سن زنان مورد مطالعه 86/6 ± 85/29 سال، از نظر وضعیت اشتغال، اکثرا غیر شاغل و خانه دار (4/95%)، دارای تحصیلات راهنمایی (6/34%) و ساکن شهر (8/93%) بودند. حدود 70% آنان، حداقل یک بار سابقه بارداری قبلی داشتند، 30% سابقه سقط، 2/6 %سابقه زایمان زودرس، 9/6%فشارخون حاملگی، 4/16% دیابت حاملگی، 1/3%سابقه بیماری تناسلی و 7/47%سابقه عفونت ادراری داشتند. شیوع استرپتوکوکوس گروهB 8/3 % بود. بین فراوانی استرپتوکوکوس گروهB با سن زنان باردار، سن بارداری، سوابق بارداری قبلی، سابقه سقط و زایمان زودرس و سوابق بیماری آنان ارتباط معنی دار مشاهده نشد.
نتیجه گیریاگرچه کلونیزاسیون استرپتوکوکوس گروه B در واژن زنان باردار مراجعه کننده به بیمارستان فاطمیه شهر همدان کم بود، با توجه به تاثیر ناگوار آن بر نتیجه بارداری، غربالگری ابتلا به عفونت استرپتوکوکوس گروه B و در نتیجه تشخیص و درمان به موقع آن از اهمیت ویژه ای برخوردار است.
کلید واژگان: استرپتوکوکوس گروه B, کلونیزاسیون, زنان باردار}IntroductionGroup B streptococcus (GBS) is one of the relatively common causes of vaginal infection in women of reproductive age, which in case of infection in pregnant women is associated with adverse fetal and neonatal outcomes, such as early neonatal infection, abortion, premature delivery and neonatal death. Considering the different prevalence of GBS in different geographical locations, this study was conducted with the aim of determining the prevalence of GBS colonization in the vagina of pregnant women referred to Fatemieh hospital in Hamadan city in 2021.
Materials and MethodsIn this descriptive-analytical study, 130 pregnant women referred to Fatemiyeh hospital in Hamadan city in 2021 were examined for GBS colonization using the purpose-based sampling method. Sampling was done using a sterile swab from the vaginal area, and the swabs were transferred to the microbiology laboratory of the Faculty of Medicine after being placed in the Todd Hewitt broth medium. Bacterial diagnostic tests were performed to identify GBS. After registering in the checklist, the results were analyzed with SPSS version 16 software at a confidence level of 95%.
ResultsThe average age of the studied women was 29.85 ± 6.86 years, in terms of employment status, mostly unemployed and housekeeper (95.4 %), with middle school education (34.6%) and living in the city (93.8 %). About 70% of them had a history of pregnancy at least once, 30% had a history of abortion, 6.2 % had a history of premature birth, 6.9% had a history of gestational hypertension, 16.4 % had a history of gestational diabetes, 3.1 % had a history of genital disease, and 47.7 % had a history of urinary tract infection. The prevalence of GBS was 3.8 %. No significant relationship was observed between the frequency of GBS with the age of pregnant women, gestational age, previous pregnancy records, history of abortion and premature birth, and their disease records.
ConclusionAlthough the colonization of GBS in the vagina of pregnant women referred to Fatemiyeh hospital in Hamedan was low, due to its adverse effect on the outcome of pregnancy, screening for GBS infection and, as a result, its timely diagnosis and treatment is of special importance.
Keywords: Group B streptococcus, colonization, pregnant women} -
اهداف
کووید-19 یک بیماری ویروسی است که تمامی کشورها را درگیر همه گیری کرده است. طیف درگیری این بیماری شامل گونه های خفیف و بدون علایم تا شدید و مرگ است. افراد درگیر ویروس کرونا علایم متعدد بالینی و پاراکلینیکی را نشان داده اند. در این مطالعه، علایم گوارشی و یافته های آزمایشگاهی مرتبط با ویروس کووید-19 در بیمارانی که به بیمارستان بهلول گنابادی در شهر گناباد مراجعه کردند، مطالعه و بررسی شده است.
مواد و روش هادر این مطالعه توصیفی مقطعی از طریق روش نمونه برداری تصادفی ساده، 235 بیمار کووید-19 با علایم گوارشی که به بیمارستان بهلول گنابادی در سال های 1398 تا 1400 مراجعه کرده بودند، انتخاب شدند و درخصوص علایم گوارشی و یافته های آزمایشگاهی مرتبط با ویروس کووید-19 انتخاب و ارزیابی شدند.
یافته هامیانگین سن بیماران برابر با 20/12±59/62 سال بوده و 48/1 درصد افراد مرد و 51/9 درصد زن بودند. مهم ترین علایم گوارشی مرتبط با کووید-19 به ترتیب شامل حالت تهوع (45/1 درصد)، استفراغ (16/6 درصد)، بی اشتهایی (14/5 درصد)، درد شکمی (14 درصد) و اسهال (8/9 درصد) بوده است. افزایش در شاخص های لاکتات دهیدروژناژ (96/6 درصد)، آسپارتات آمینو ترانسفراز (57/7 درصد)، زمان پروترومبین (46/8 درصد)، نسبت نرمال شده بین المللی (42/8 درصد) و کاهش در تعداد گلبول های سفید خون (25/7 درصد)، تعداد پلاکت ها (23 درصد) و لنفوسیت ها (68/5 درصد) مهم ترین یافته های آزمایشگاهی در بیماران کووید-19 بوده است. درگیری ریه برابر با 94/7 درصد، ضعف و بی حالی 87/7 درصد، دردهای بدنی (83/3 درصد) و تنگی نفس (76/6 درصد) متداول ترین شکایات بیماران کووید-19 بوه و 83/8 درصد از بیماران پروتیین واکنشی C مثبت داشتند.
نتیجه گیریعلایم و نشانه های نگارشی، ازجمله حالت تهوع، استفراغ و بی اشتهایی شکایتی متداول در بیماران کووید-19 بود. برخی نشانگرهای زیستی شیمیایی مانند تعداد گلبول های سفید خون، لاکتات دهیدروژناژ، آسپارتات آمینو ترانسفراز، آلانین آمینوترانسفراز، نسبت نرمال شده بین المللی، زمان ترومبوپلاستین نسبی، سرعت رسوب گلبول قرمز و سرم فریتین در برخی بیماران کووید-19 تغییر کرده است. افزایش یا کاهش هریک از سلول های خونی، عوامل التهابی و آنزیم ها بیانگر درگیری و پیچیدگی های یک عضو یا بافت خاص در بدن می باشد. درگیری ریه واضح ترین مورد است که می تواند در سی تی اسکن قابل مشاهده باشد.
کلید واژگان: ویروس کووید-19, علائم گوارشی, یافته های آزمایشگاهی}AimsCOVID-19 is a viral disease that has plagued all countries as a pandemic. The range of the disease varies from mild and asymptomatic to severe and fatal. Individuals with COVID-19 have several clinical and paraclinical symptoms. In this study, gastrointestinal symptoms and laboratory findings related to the COVID-19 virus were studied in patients referred to Allameh Bahloul Gonabadi Hospital (Gonabad, Iran).
Methods & MaterialsIn this descriptive/cross-sectional study, using a simple random sampling method, 235 patients with COVID-19 and gastrointestinal symptoms admitted to Allameh Bahloul Gonabadi Hospital in Gonabad from 2019 to 2021 were selected and examined in terms of gastrointestinal symptoms and laboratory findings due to COVID-19 virus.
FindingsThe mean age of the patients was 59.62±20.12 years, among which 48.1% were male and 51.9% were female. The most important gastrointestinal symptoms associated with COVID-19 were nausea (45.1%), vomiting (16.6%), anorexia (14.5%), abdominal pain (14.0%), and diarrhea (8.9%) respectively. Increase in lactate dehydrogenase (96.6%), aspartate transaminase (75.7%), prothrombin time (46.8%), international normalized ratio (42.8%), and decrease in white blood count (25.7%), platelet count (23%), and lymphocytes (68.5%) were the most important laboratory findings of COVID-19 positive patients. Lung involvement (94.7%), weakness and lethargy (87.7%), body aches (83.8%), and shortness of breath (76.6%) were the most common complaints of patients with COVID-19 and 83.8% of patients were C-reactive protein.
ConclusionGastrointestinal signs and symptoms, including nausea, vomiting, and anorexia were common complaints in patients with COVID-19. Some chemical biomarkers, including white blood cell counts, erythrocyte sedimentation rate, partial thromboplastin time, international normalized ratio, alanine transaminase, aspartate transaminase, lactate dehydrogenase, and serum ferritin were altered in patients with COVID-19. An increase or decrease in each of the blood cells, inflammatory factors, and enzymes indicates the involvement and complication of a specific organ or tissue in the body. Lung involvement is the most obvious, which can be seen with a computerized tomography scan.
Keywords: COVID-19, Gastrointestinal symptoms, Laboratory findings} -
اهداف
در سال های اخیر سنتز نانوذرات نقره با گیاهان به دلیل سرعت بیشتر و ارزان تر بودن در مقیاس بزرگ تری انجام شده است. همچنین افزایش بیماری زایی ناشی از استافیلوکوکوس اوریوس مقاوم به آنتی بیوتیک وجود دارد. در این مطالعه، بیوسنتز نانوذرات نقره با استفاده از عصاره بنه و خواص ضد میکروبی آن گزارش شده است.
مواد و روش هااز عصاره بنه به عنوان عامل کاهنده برای بیوسنتز نانوذرات نقره استفاده شد. تشکیل نانوذرات با استفاده از اسپکتروفتومتر (UV) تایید شد. نانوذرات به دست آمده برای تعیین میانگین Z (d.nm) و PDI نانوذرات با استفاده از پراکندگی نور دینامیکی و فعالیت بازدارندگی (حداقل غلظت بازدارندگی) و کشندگی آن (حداقل غلظت باکتری کشی) در برابر استافیلوکوکوس اوریوس بررسی شد. قطر هاله رشد باکتری نیز اندازه گیری شد.
یافته هاطیف UV-Vis نوار جذبی در حدود 350 تا450 نانومتر را نشان می دهد که درواقع، نشان دهنده نانوذرات بیولوژیکی نقره است. اندازه و خواص مورفولوژیکی نانوذرات با پراکندگی نور دینامیکی انجام شد که نشان می دهد قطر هیدرودینامیکی آن (Z-Average) در حدود 1132 نانومتر و عدد شاخص پراکندگی در حدود 373/0 است که این نتایج نشان دهنده توزیع یکنواخت اندازه ذرات و پایداری نانوذرات است. خواص بازدارندگی و کشنده نانوذرات بنه بر روی گونه های استافیلوکوکوس اوریوس (1764 PTCC) 5/12 میکروگرم در میلی لیتر است. همچنین قطر هاله رشد باکتری 12 میلی متر است که در غلظت 1000 میکروگرم در میلی لیتر مشاهده شد.
نتیجه گیرینانوذرات بیو نقره بنه علیه استافیلوکوکوس اوریوس فعالیت ضد میکروبی خوبی داشتند.
کلید واژگان: سنتز سبز, نانوذرات نقره, بنه, DLS, حداقل غلظت مهاری و کشنده}AimsIn recent years, the synthesis of nanoparticles (Ag-NPs) by plants has been done on a larger scale because it is faster and cheaper. There is also an increase in pathogenicity caused by antibiotic-resistant Staphylococcus aureus. In this study, the biosynthesis of silver nanoparticles by using an extract of mountain pistachio (Pistaciaatlantica) and its antimicrobial properties have been reported.
Methods & MaterialsThe extract of Pistaciaatlantica as the reducing agent was used for the biosynthesis of silver nanoparticles. The formation of nanoparticles was confirmed using a spectrophotometer (UV). The resulting nanoparticles were analyzed to determine the Z-Average (d.nm) and the dispersion index (PDI) of the nanoparticles using dynamic light scattering (DLS) and its inhibitory activity and lethality (MBC) against Staphylococcus aureus (S. aureus) were investigated. The diameter of the aura of bacterial growth was also measured.
FindingsThe UV-Vis spectrum shows an absorption band of about 350-450 nm, which represents the biological Ag nanoparticles. Size and morphological properties of nanoparticles were performed by DLS which show that hydrodynamic diameter (Z-Average) is 1132 nm and PDI number is 0.373, indicating a uniform particle size distribution and nanoparticle stability. The inhibitory and lethal properties of Pistaciaatlantica nanoparticles on S. aureus species (PTCC 1764) are 12.5 micrograms per milliliter. Also, the diameter of the halo of bacterial growth is 12 mm which was observed at a concentration of 1000 μg/mL.
ConclusionPistaciaatlantica bio-silver nanoparticles had good antimicrobial activity against S. aureus
Keywords: Green synthesis, Silver nanoparticles, Pistaciaatlantica, DLS, Minimum inhibitory, killing concentrations} -
زمینه و اهداف
بررسی روند انتشار مقالات در حوزه های علمی گوناگون، دیدگاه مناسبی از تلاش های محققان در حوزه های دانشی به ویژه در علوم زیستی ارایه می نماید. بر همین اساس، پژوهش حاضر انتشارات علمی بروسلوز پژوهشگران ایرانی را با استفاده از روش های علم سنجی و تحلیل شبکه های اجتماعی مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار داده است.
مواد و روش کاراین مطالعه از نوع کاربردی است که با استفاده از روش علم سنجی و تحلیل شبکه های اجتماعی انجام شده است. تمامی انتشارات علمی بروسلوز ایران تا سال 2020 از پایگاه استنادی اسکوپوس استخراج شد. جهت تجزیه تحلیل داده ها نرم افزارهای اکسل، VOSviewer و Gephi بکارگرفته شد.
یافته هادر مجموع 816 مورد انتشارات علمی بروسلوز پژوهشگران ایران از پایگاه استنادی اسکوپوس استخراج گردید. بیشترین انتشارات از نوع اورجینال ارتیکل ها و در سابجکت مدیسین بوده است. کرامتی و میرنژاد با مرکزیت درجه 16 دارای بالاترین مرکزیت درجه در بین سایر نویسندگان انتشارات علمی بیماری بروسلوز ایران هستند. میرنژاد با مرکزیت نزدیکی 0/43 و مرکزیت بینابینی 1153/61 دارای بالاترین مرکزیت نزدیکی و بینابینی هستند. همچنین دانشگاه علوم پزشکی تهران با مرکزیت درجه 18 و مرکزیت نزدیکی 0/61 بالاترین میزان مرکزیت درجه و نزدیکی را در بین سایر موسسات ایرانی در انتشارات علمی بروسلوز را دارد. همچنین دانشگاه علوم پزشکی همدان با مرکزیت بینابینی 214/72 بالاترین میزان مرکزیت بینابینی را دارد. ایالات متحده با 22 سند، انگلیس با 9 سند و آلمان با 7 سند بیشترین همکاری علمی را در انتشارات علمی ایران داشتند. سه خوشه موضوعی اصلی این حوزه نیز موضوعات شیوع، تشخیص و درمان بدست آمده است.
نتیجه گیرینتایج این مطالعه ساختار موضوعی و محتوایی و همکاری های علمی نویسندگان در انتشارات و تولیدات علمی بیماری بروسلوز پژوهشگران ایرانی را نشان داد. بر همین اساس نویسندگان و پژوهشگران می توانند با ایجاد شبکه همکاری های علمی در منطقه و جهان، در جهت تولید دانش جدید و حل مشکلات و ارایه راه حل های مناسب همکاری نمایند.
کلید واژگان: بروسلوز, تحلیل شبکه های اجتماعی, علم سنجی, ایران}Background and ObjectiveThe evaluation of the publishing trend of articles in various scientific fields provides an insight into the efforts of researchers in the field of knowledge. Accordingly, the present study has evaluated and analyzed the scientific publications on brucellosis conducted by Iranian researchers using scientometrics methods and analysis of social networks.
MethodsThe present study is practical research that has been performed using the scientometric method and analysis of social networks. All Iranian scientific publications on brucellosis published until 2020 were extracted from the Scopus citation database. Excel, VOSviewer, and Gephi software were applied to analyze the data.
ResultsA total of 816 scientific publications on brucellosis conducted by Iranian researchers were extracted from the Scopus citation database. Keramat F. and Mirnejad R. have the highest degree centrality of 16 among other authors of Iranian scientific publications on brucellosis. Mirnejad has the highest closeness centrality and betweenness centrality, equal to 0.43 and 1153.61, respectively. The United States with 22 documents, the United Kingdom with 9 documents, and Germany with 7 documents had the most scientific collaborations in Iranian scientific publications. The prevalence, diagnosis, and treatment are three main topic clusters in this field.
ConclusionThe present study results revealed the topical and content structure and scientific collaborations of the authors in Iranian publications and scientific productions on brucellosis. Accordingly, authors and researchers can develop a network of scientific collaborations in the region and the world to collaborate in producing new knowledge, solve problems, and provide appropriate solutions.
Keywords: Brucellosis, Iran, Scientometrics, Social Network Analysis} -
اهداف
کرونوباکتر ساکازاکی (CS) عضوی از خانواده انتروباکتریاسه است و یک باسیل از نظر ژنتیکی ناهمگن، متحرک و گرم منفی است. این باکتری یک پاتوژن منتقله از طریق غذا و مرتبط با بلعیدن شیرخشک است که می تواند باعث سپسیس نوزادان، انتروکولیت نکروزان کننده و مننژیت شود. این بررسی روی جدیدترین اطلاعات در مورد ویژگی باکتریایی کرونوباکتر ساکازاکی و عفونت های انسانی ناشی از این باکتری بیماری زا متمرکز شده است.
مواد و روش هاما در پایگاه داده های پزشکی مانند اسکوپوس، پاب مد، آی اس آی ، وب آو ساینس و سایر وب سایت ها جست و جو کردیم.
یافته هاکرونوباکتر ساکازاکی به عنوان یک خطر میکروبی در زنجیره غذایی نوزادان، همراه با مرگ ومیر بالایی در نوزادان است. کمیسیون مشخصات میکروبیولوژیکی مواد غذایی، کرونوباکتر ساکازاکی را به عنوان باکتری خطرناک شدید برای افراد محدود، مدت زمان طولانی، عوارض مزمن قابل توجه یا تهدید کننده زندگی طبقه بندی کرده است. اگرچه میزان بروز عفونت کرونوباکتر ساکازاکی کم است، اما پیش آگهی بیماری ضعیف است و عفونت، با مرگ ومیر قابل توجهی همراه است. محصولات شیرخشک (PIF) آلوده به کرونوباکتر ساکازاکی از نظر اپیدمیولوژیک با چندین مورد بالینی مرتبط شده اند. نوزادان نارس و کم وزن و بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه نوزادان (NICU) بیشتر از نوزادان بزرگ تر در معرض خطر عفونت قرار دارند.
نتیجه گیریما تمرکز بر راهکارهای پیشگیرانه ساده مانند ارتقای تغذیه با شیر مادر، درج هشدار روی بسته های شیرخشک مبنی بر آلودگی آن ها به کرونوباکتر ساکازاکی و پرهیز از عمل گرم شدن مجدد شیرخشک را توصیه می کنیم.در بزرگسالان باید از مصرف محصولات لبنیاتی بازسازی شده در جمعیت سرکوب شده سیستم ایمنی خودداری شود. اقدامات احتیاطی پیشگیری کننده مناسب باید در تنظیمات NICU و ICU رعایت شود، جایی که شیوع عفونت ممکن است بیشتر باشد.
کلید واژگان: پاتوژن منتقله از غذا, کرونوباکتر ساکازاکی, نوزادان, بیماران بستری, عفونت ها, راهکارهای پیشگیری}AimsCronobacter sakazakii (CS) is a member of the Enterobacteriaceae family. It is a genomically heterogeneous, motile, Gram-negative bacillus. It is also an emergent foodborne pathogen associated with the ingestion of infant formula milk that can cause neonatal sepsis, necrotizing enterocolitis, and meningitis. This review is focused on the newest information about the bacterial characteristics of C. sakazakii and human infections causing by this pathogenic bacterium.
Methods & Materials:
We searched medical databases such as ISI Web of Science, PubMed, Scopus, and other websites.
FindingsCronobacter sakazakii acts as a microbiological hazard in the infant food chain, with historic high mortality in neonates. The International Commission for Microbiological Specifications for Foods has categorized C. sakazakii as a severe hazard bacterium for some individuals, with long duration, substantial chronic sequelae, or life-threatening complications. Although the incidence of C. sakazakii infection is low, the prognosis of the disease is poor, and infection is associated with significant morbidity and mortality. Powdered Infant Formula (PIF) milk products contaminated with C. sakazakii have been epidemiologically linked to several clinical cases. Premature infants, low-birth-weight ones, and patients hospitalized in the Neonatal Intensive Care Units (NICUs) are more at infection risk than older infants.
ConclusionWe recommend focusing on simple preventative strategies such as the promotion of breast milk feeding, the inclusion of warnings on the powder infant formula packages that may be contaminated with C. sakazakii, and abstinence from the practice of re-warming of reconstituted formula. Reconstituted dairy products should be avoided in adult immunosuppressed populations. Appropriate barrier precautions should be observed in NICU and intensive care unit settings, where the spread of infection may be more prevalent.
Keywords: Foodborne pathogen, Cronobacter sakazakii, Neonates, Hospitalized patients, Infections, Prevention strategies} -
زمینه و هدف
عفونت های بیمارستانی، از مهم ترین مشکلات بیمارستان ها و مراکز درمانی هستند و سبب از دست دادن منابع اقتصادی، افزایش مدت زمان بستری بیماران و مرگ ومیر آن ها می گردند. استفاده صحیح و اصولی از گندزداها نقش مهمی در کاهش این عفونت ها دارند. در مطالعه حاضر، اثربخشی گندزداهای رایج در بخش های مختلف یک بیمارستان آموزشی بررسی شد.
مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی، از بخش های مختلف بیمارستان علامه بهلول گنابادی در مجموع 245 نمونه گرفته شد. نمونه برداری قبل و بعد از گندزدایی با گندزداهای دکونکس AF 50، پراناسید M1، میکروزد GPH و سارفوسپت کوییک انجام گرفت. نمونه ها روی محیط های کشت میکروبی کشت داده شد و بعد از شمارش کلنی ها، توسط تست های تشخیصی میکروب شناسی باکتری ها تعیین هویت گردیدند. داده ها با استفاده از آزمون آماری ویلکاکسون آنالیز گردید.
یافته هادر مطالعه حاضر، بیشترین باکتری گرم مثبت جدا شده، استافیلوکوک اپیدرمیدیس و بیشترین باکتری گرم منفی جدا شده، اشرشیا کلی بود. میانگین قبل و بعد از گندزدایی در گندزداهای دکونکس و میکروزد در تمامی بخش ها تفاوت معنی داری داشت (0/05>P). درمورد گندزدای پراناسید در بخش های زایشگاه و NICU و میکروزد در بخش های داخلی و ICU بین میانگین قبل و بعد از گندزدایی، تفاوت معناداری مشاهده نشد (0/05<P).
نتیجه گیرینتایج مطالعه نشان داد که موثرترین گندزداها دکونکس و میکروزد بودند. ماده گندزدای پراناسید در بخش های زنان و زایشگاه و NICU و ماده سارفوسپت کوییک در بخش های داخلی و ICU اثربخشی کمتری داشته اند ولی در سایر بخش ها اثربخشی خوبی داشته اند.
کلید واژگان: باکتری, گندزدا, بیمارستان}IntroductionNosocomial infections are one of the most important problems in hospitals and medical centers which cause loss of economic resources increased length of stay in hospitals and mortality. Correct and appropriate use of antiseptic and disinfectants play an important role in reducing infections. In this study the efficacy of the Current Disinfectants on Bacteria Isolated from Different Wards of an Educational Hospital has been studied.
Materials and methodsIn this cross-sectional study, a total of 245 samples were taken from different wards of Allameh Behlul Hospital in Gonabad. Samples were taken before and after disinfection with disinfectants of Deconnex AF50, Peranacide M1, microzed GPH and Sarphosepte Quicks. Samples were cultured on special culture media and identified by biochemical tests and the number of colonies was determined. Data were analyzed using Wilcoxon statistical test.
ResultsIn the present study, microbial contamination of different sections showed that the most gram -positive bacteria were isolated included Staphylococcus epidermidis, and the most Gram -negative bacteria were isolated included, Escherichia coli. Mean before and after disinfection in deconox and microzed disinfection was significantly different in all parts (P <0.05). For peranaside disinfection in Internal and NICU sections, and in ICU and Maternity before and after There was no significant difference in disinfection (P> 0/05).
ConclusionThe results of this study showed that Deconex and Microzed were among the most effective disinfectants. Peranaside disinfectant in the maternity and NICU sections, and the Sarphosepte Quicks were also less effective in the Internal and ICU sections, but had good efficacy in other sections.
Keywords: Bacterium, Disinfectant, Hospital} -
مجله دانشگاه علوم پزشکی سبزوار، سال بیست و پنجم شماره 1 (پیاپی 96، فروردین و اردیبهشت 1397)، صص 31 -37زمینه و هدفباکتری های مقاوم به آنتی بیوتیک های بتالاکتام، پیوسته در حال گسترش می باشند. مصرف بیش از حد آنتی بیوتیکهای بتالاکتام در امر درمان عفونت های وابسته به استافیلوکوک اورئوس باعث ظهور سویه های دارای آنزیم بتالاکتاماز شده است. شناسایی و بررسی ویژگی های مولکولی این سویه ها می تواند در امر درمان و انتخاب آنتی بیوتیک مناسب، موثر باشد. هدف از این مطالعه بررسی مولکولار فراوانی سویه های استافیلوکوک مقاوم به آنتی بیوتیکهای بتالاکتام می باشد.
مواد وروشابتدا جدایه های جمع آوری شده از نمونه های بالینی توسط تست های بیوشیمیایی مورد غربالگری قرار گرفت. استافیلوکوک های اورئوس بعد از تعیین طیف مقاومت به آنتی بیوتیک های بتالاکتام ، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی مورد بررسی و ارزیابی مولکولی قرار گرفتند.نتایجاز 496 ایزوله اخذ شده از نمونه های بالینی مختلف، 147ایزوله بعنوان استافیلوکوک اورئوس شناسایی شدند. بیشترین مقاومت مربوط به آنتی بیوتیکهای پنی سیلین، اوگزاسیلین، تتراسایکلین بود و کمترین مقاومت مربوط به آنتی بیوتیک ونکومایسن بود. از 147نمونه مورد بررسی هم 143نمونه دارای ژن blaZ بودند که بیش از 97درصد را به خود اختصاص داده بود.نتیجه گیریبا توجه به نتایج بدست آمده از تست های مولکولی، گسترش و شیوع سویه های حامل آنزیم بتالاکتاماز در شهر زاهدان بسیار بالا می باشد. این امر سبب می شود تا برای درمان همه عفونت های استافیلوکوکی تا حد امکان از آنتی بیوتیکهای بتالاکتام استفاده نشود تا در کنار دسترسی به درمان سریع از افزایش سویه های مقاوم جلوگیری کرد.کلید واژگان: بتالاکتام, استافیلوکوک اورئوس, مقاومت آنتی بیوتیکی, blaZ}BackgroundBacterial resistants to beta-lactam antibiotics, are steadily expanding. Excessive consumption beta-lactam antibiotics in the treatment of related Staphylococcus aureus infections caused the emergence of beta-lactamase enzymes in strains. Identification and analysis of molecular characteristics of these strains can be effective to select on the appropriate antibiotic treatment.Materials And MethodsInitially, the isolates collected from clinical samples were screened by biochemical tests. After the whole Staphylococcus aureus resistance to beta-lactam antibiotics, were evaluated by used of molecular-specific primers.ResultsOf 496 isolates obtained from different clinical samples, 147 isolates were identified as S. aureus. The highest resistance to the antibiotics had related to penicillin, Oxacillin, Cefocithin and the lowest resistance antibiotics had related to Vancomycin. From the 147 samples, 143 samples were blaZ genes that allocated to over 97 percent.ConclusionAccording to the results of molecular tests, in the Zahedan spread of carrier-lactamase strains is very high. This would be to treat all staphylococcal infections of beta lactam antibiotics are not used as much as possible to the access to early treatment prevented the increase in resistant strains.Keywords: Staphylococcus aureus, Beta, lactam, blaZ, Antibiotic Resistance} -
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران، سال هفتاد و پنجم شماره 3 (پیاپی 195، خرداد 1396)، صص 179 -186زمینه و هدفتغییر شیوه تغذیه نوزادان در سال های اخیر و روند رو به رشد استفاده از شیر خشک در آن ها باعث اهمیت بیشتر به کیفیت شیر خشک های مصرفی و ارزیابی سلامت در آن ها شده است. هدف از این پژوهش شناسایی سویه های توکسین زای گونه های گروه باسیلوس سرئوس در شیر خشک نوزادان با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلیمراز بوده است.روش بررسیدر این مطالعه مقطعی که در طی 12 ماه از فروردین تا اسفند سال 1394 در آزمایشگاه میکروب شناسی مواد غذایی دانشکده بهداشت صورت گرفت، از 125 نمونه شیر خشک نوزادان پس از تهیه رقت 0/1 بر روی محیط اختصاصی باسیلوس سرئوس (Mannitol Egg Yolk Polymyxin Agar، MYP Agar) تلقیح شد و پس از گرمخانه گذاری به مدت 24 ساعت در C° 30، کلنی های ظاهر شده از نظر واکنش های بیوشیمیایی بر اساس روش های استاندارد مورد ارزیابی قرار گرفتند. برای تایید نهایی باسیلوس ها و بررسی توکسین های این باکتری، واکنش زنجیره ای پلیمراز برای ژن های انتخابی ITS تایید کننده باسیلوس و NHE مرتبط با اسهال و EM مرتبط با استفراغ انجام شد.یافته هااز 125 نمونه شیر خشک نوزادان، 84 نمونه (67/2%) آلوده و تعداد 110 جدایه با روش فنوتیپی، مشکوک به گروه باسیلوس به دست آمد. با مطالعه ژنITS ، 91/8% از جدایه ها باسیلوس سرئوس شناسایی شد. 53/63% این باکتری ها دارای ژن های NHE عامل سندرم اسهالی و 79% دارای ژن EM عامل سندرم استفراغی در باسیلوس سرئوس بودند.نتیجه گیریداده های این مطالعه نشان داد که نزدیک به 80% از جدایه های باسیلوس سرئوس دارای ژن مرتبط با استفراغ هستند و بیانکننده قدرت بیماری زایی بالای این سویه ها است. وجود حتی تعداد اندک این سویه های بیماری زا یعنی کمتر از میزان مجاز تعریف شده در مواد غذایی، می تواند مشکلساز باشد.کلید واژگان: مطالعه توصیفی مقطعی, شیر خشک, باسیلوس سرئوس, نوزادان, روش مولکولی, واکنش زنجیره ای پلیمراز, ویرولانس}BackgroundIn recent years, use of powdered infant formula (PIF) milk for neonates feed is increasing; therefore, the quality control (QC) of PIF products is very important. The aim of present study was detection of toxigenic Bacillus cereus species in PIF milk using PCR assay.MethodsThe cross-sectional study was carried out on 125 samples of powdered infant formula milk (PIF) purchased between March 2015 and April 2016 in Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran. Briefly, 0.1 dilutions were prepared and inoculated on Bacillus cereus selective media (MYP) and incubated at 30 °C for 24 hours. The suspicious colonies were verified using biochemical tests based on standard methods. Final confirmation of studied isolates was carried out by ITS gene detection using polymerase chain reaction (PCR) assay. Presence of nonhemolytic enterotoxin (NHE) (linked to diarrhoea syndrome) and emetic toxin (EM) (linked to emetic syndrome) virulence genes were investigated using polymerase chain reaction assay.ResultsIn this study, of 125 PIF samples, 84 (67.2%) were contaminated. Of various recovered bacteria from these samples, 110 bacterial isolates were suspected to be Bacillus spp. using phenotypic methods. The ITS PCR results showed that 91.8% of the isolates were B. cereus. Respectively, 53.63 and 79% of B. cereus isolates possessed NHE and EM virulence genes.ConclusionOur data revealed that near 80% of Bacillus cereus isolates have emetic toxin (EM) gene, as result virulence potency of this isolates is very high. However, the low number of this organisms in foods is very important and food safety protocols for these opportunistic toxigenic bacteria should be revised. Since the pasteurization process is ineffective on B. cereus spores; therefore, spores can remain in PIF milk and the vegetative bacterial cells can cause food poisoning in neonates. Therefore, modification of foods quality control protocols is essential in order to identify virulence genes in this bacterium.Keywords: bacillus cereus, cross-sectional studies, infants, infant formula, molecular method, polymerase chain reaction, virulence}
-
زمینهتغییر شیوه تغذیه نوزادان در سال های اخیر و روند رو به رشد استفاده از شیر خشک در آنها باعث اهمیت بیشتر توجه به کیفیت شیر خشک های مصرفی و ارزیابی سلامت در آنها شده است. این محصول با پاتوژن های باکتریایی زیادی از جمله باسیلوس سرئوس آلوده می شود که وجود این باکتری در شیر خشک به علت گروه سنی مصرف کننده و بیماری زایی این باکتری در شیر خشک حائز اهمیت می باشد. هدف از این پژوهش یررسی فراوانی آلودگی شیر خشک های مصرفی نوزادان در بخش NICU به باسیلوس سرئوس بود.مواد و روش هادر یک مطالعه توصیفی مقطعی، طی هشت ماه در سال 93-1392، تعداد 125 نمونه شیر خشک که جهت تغذیه نوزادان در بخش مراقبت های ویژه نوزادان (NICU) بیمارستان ها استفاده می شد، از نظر آلودگی به باسیلوس سرئوس مورد ارزیابی قرار گرفت. جداسازی و شناسایی باسیلوس سرئوس بر اساس پروتکل استاندارد FDA (FDA Method) بر روی محیط اختصاصی باسیلوس سرئوس (MYP Agar) انجام شد.یافته هانتایج حاصل از این مطالعه نشان داد از 125 نمونه پودر شیر خشک مورد بررسی،84 نمونه (2/67 درصد) از نظر آلودگی به باسیلوس سرئوس مثبت بودند. همچنین 18 نمونه (4/14 درصد) دارای آلودگی با بیش از یک گونه باسیلوس بودند.نتیجه گیریبا توجه به اینکه فرایند پاستوریزه کردن روی اسپورهای باسیلوس سرئوس موثر نمی باشد، اسپور این باکتری می تواند در شیر خشک باقی مانده و برای نوزادان مصرف کننده ایجاد مسمومیت غذایی کند. بدین منظور پیشنهاد می گردد توجه بیشتری به کنترل کیفیت واحدهای تولیدی و وارداتی شیر خشک انجام شود.کلید واژگان: شیر خشک, باسیلوس سرئوس, نوزادان, محیط MYP}BackgroundIn recent years, changing the infant feeding methods and the growing trend of use powdered infant formula (PIF) has raised concern about quality and health assessment among them. These products are contaminated with various pathogenic bacteria such as Bacillus cereus which the presence of this bacteria in PIF is important because of consumer age group and virulence of this bacteria in PIF. The aim of this study was to determine the frequency of Bacillus cereus in powdered milk infant formula consuming in neonatal intensive care unit (NICU) in Tehran hospitals in 2013-14.
Material andMethodsIn this cross-sectional study, 125 samples of powdered infant formula milk which were used in Neonatal Intensive Care Unit (NICU) were surveyed during 8 month in 2014. Isolation and identification of microorganisms (including Bacillus cereus) were carried out according to FDA standard protocol (FDA method) on B. cereus selective agar (MYP Agar).ResultsThe results of present study showed that of 125 samples from of consumable powdered infant formula milk, 84 (67.2%) samples were contaminated with B.cereus and also 18 (14.4%) samples were contaminated by more than one B.cereus species.ConclusionAs regards pasteurization process is not effective on the spore of B.cereus., The spores of these bacteria can remain in PIF and can cause food poisoning in infants. For this purpose, more attention to quality control of production units and imported powder milk is recommended in Iranian infant foods.Keywords: Powdered infant formula milk, Bacillus cereus, Neonatal, MYP media} -
زمینهدر تمام جهان مقاومت چند دارویی در بین باکتری های گرم منفی ایجادکننده عفونت های بیمارستانی یا اکتسابی از جامعه در حال ظهور است. اهداف این مطالعه شامل: (1) تعیین پروفایل حساسیت آنتی بیوتیکی ایزوله های انتروباکتر جداشده از خون، (2) شناسایی فنوتایپی سویه های تولیدکننده ESBL و AmpC، (3) شناسایی سویه های MDR، (4) شناسایی ایزوله های دارای ژن blaSHV با استفاده از روش PCR، بودند.مواد و روش هااین مطالعه مقطعی بر روی 90 ایزوله انتروباکتر که در طی 10 سال (1393-1384) از عفونت گردش خون ارسالی از بیماران بستری در بیمارستان های شهر شیراز با استفاده از سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 جدا شده بودند، انجام شد. ایزوله ها با استفاده از تست های بیوشیمیایی تعبیه شده در سیستم API 20E اختصاصی انتروباکتریاسیه مجددا مورد شناسایی نهایی قرار گرفتند. بر اساس پروتکل ارائه شده توسطCLSI در سال 2014، از روش استاندارد دیسک دیفیوژن و تست فنوتیپی DDST به ترتیب برای تست حساسیت آنتی بیوتیکی و شناسایی سویه های تولیدکننده ESBL استفاده شد. از روش ملکولی PCR برای شناسایی سویه های دارای ژن blaSHV استفاده شد.یافته هادر این مطالعه مروپنم (9/98 درصد) و ایمی پنم (6/95 درصد) و کلیستین (3/93 درصد) موثرترین آنتی بیوتیک ها بر علیه ایزوله ها بودند. در بین سفالوسپورین های نسل سوم مورد بررسی ایزوله ها بهترین پاسخ را به سفتازیدیم (8/47 درصد) و پس از آن به سفتریاکسون (2/42 درصد) نشان دادند. نتایج بررسی نشان داد که 1/11 درصد ایزوله ها MDR هستند. 5/15 درصد ایزوله ها همزمان ESBL مثبت و AmpC مثبت بودند. نتایج انجام PCR به منظور جستجوی ژن blaSHV در ایزوله های انتروباکتر مشخص کرد که 8/7 درصد سویه ها دارای این ژن بوده اند.نتیجه گیرینتایج نشان می دهد مقاومت ایزوله های انتروباکتر به نسل سوم سفالوسپورین ها به یک مشکل تهدید کننده سلامت ملی تبدیل شده است. انجام مطالعات اپیدیمولوژیک کشوری به منظور ارائه برنامه جامع ملی جهت جلوگیری از ظهور و گسترش باکتری های مقاوم در کشور حیاتی است. ما معتقدیم به منظور حفظ کارباپنم ها به عنوان راهکار نهایی جهت درمان گونه های انتروباکتر، کارباپنم ها باید برای درمان ایزوله های مقاوم به دیگر آنتی بیوتیک ها استفاده شوند.کلید واژگان: عفونت گردش خون, انتروباکتر, حساسیت آنتی بیوتیکی, تولید ESBL, ژن blaSHV}BackgroundMultidrug resistance is emerging among gram negative bacteria that cause hospital infections or community acquired around the world. The aims of this study were (1) determination of antibiotic susceptibility profile of Enterobacter spp. isolates recovered from blood, (2) phenotypic identification of ESBL and AmpC-producing isolates, (3) identify MDR strains, and (4) identification isolates harboring blaSHV gene using PCR method.Materials And MethodsIn this cross-sectional study, 90 isolates of Enterobacter spp. isolated from blood stream infection from patients admitted to hospitals in Shiraz using BACTEC 9240 automated system during 10 years (2004-2014). The isolates again were identified by using embedded biochemical tests in the Enterobacteriaceae API-20E diagnostic system. According to proposed protocol by CLSI (2014), standard disc diffusion method and DDST phenotypic test were used for antibiotic susceptibility test, and identification of ESBL-producing strains, respectively. PCR molecular method was used to identify blaSHV gene in strains.ResultsIn this study, as observed, meropenem (98.9%), imipenem (95.6%) and colistin (93.3%) were the most effective antibiotics against isolates. Isolates showed the best response to ceftazidime (47.8%) and ceftriaxone (42.2%), respectively, among the third generation of cephalosporins which were investigated. Results showed that 11.1% of isolates were MDR. 15.5% isolates were positive ESBL and positive AmpC, simultaneously. As revealed, 11.1% of isolates were MDR. The results of PCR to search for blaSHV gene in Enterobacter isolates revealed that 7.8% of the strains harboring this gene.ConclusionResults showed that the resistance of Enterobacter isolates to the third generation of cephalosporins has become a national health-threatening problem. Epidemiologic studies are crucial in order to presentation of comprehensive national program to preventing emergence and dissemination of resistant bacteria in the country. We believe that carbapenems should be used for the treatment of strains resistant to other antibiotics in order to preservation of carbapenems as strategies for the treatment of Enterobacter spp.Keywords: Blood circulation infection, Enterobacter spp., antibiotic susceptibility, ESBL, producing, blaSHV gene}
-
زمینه و هدفکلبسیلا پنومونیه یکی از اعضای خانواده انتروباکتریاسیه است که سبب عفونت های بیمارستانی می شود. در حال حاضر، با ظهور سویه های مقاوم به چنددارو (MDR) این باکتری در جهان، روبرو هستیم. هدف از مطالعه حاضر جداسازی کلبسیلا پنومونیه از بیماران بستری در بیمارستان، شناسایی ایزوله های دارای ژن blaCTX، تعیین Cross-resistance و شناسایی ایزوله های حساس وابسته به دوز (Susceptible-dose dependent (SDD)) نسبت به سفپیم بود.
روش تحقیق: در این مطالعه مقطعی، 111 سویه کلبسیلا پنومونیه از بیماران بستری در بیمارستان های قطب الدین، فقیهی و نمازی شیراز (ایران) جداسازی شدند. ایزوله ها بر اساس تست های بیوشیمیایی موجود در سیستم API20E به عنوان کلبسیلا پنومونیه شناخته شدند. تست حساسیت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش دیسک دیفیوژن و پروتکل سازمان استانداردهای بالینی و آزمایشگاهی (CLSI 2014) انجام شد. ایزوله های حساس وابسته به دوز نسبت به سفپیم شناسایی شدند. شناسایی سویه های تولیدکننده AmpC β-lactamase با استفاده از دیسک های سفوکسیتین و سفپیم انجام گرفت. از روش ملکولی PCR برای شناسایی سویه های دارای ژن blaCTX استفاده شد.یافته هابه طور کلی 111 ایزوله کلبسیلا پنومونیه، مورد مطالعه قرار گرفتند. کم اثرترین دارو سفتازیدیم (8/37 درصد ایزوله ها حساس بودند) بود. همه سویه های SDD حساس به ایمی پنم و کلیستین بودند. کلیستین (4/96%) و ایمی پنم (3/88%) موثرترین آنتی بیوتیک ها بر ضد ایزوله ها بودند. میزان مقاومت به جنتامایسین 4/41 درصد بود. نتایج انجام PCR به منظور جستجوی ژن blaCTX در ایزوله های کلبسیلا پنومونیه نشان داد که 3/70 درصد سویه ها دارای این ژن بودند.نتیجه گیریاین نتایج نشان داد که سویه های کلبسیلا پنومونیه مقاوم به چنددارو (MDR) و مقاوم به طیف وسیعی از داروها (XDR) در حال افزایش است و کمتر آنتی بیوتیکی ممکن است برای درمان عفونت های ناشی از این سویه ها مفید باشد.کلید واژگان: بیماران بستری در بیمارستان, خون, عفونت باکتریای, کلبسیلا پنومونیه, الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی, حساس وابسته به دوز}Background And AimKlebsiella pneumoniae is a member of the Enterobacteriaceae family. There is a global emergence of multidrug-resistant (MDR) strains of K. pneumoniae, a Gram-negative enteric bacterium that causes nosocomial and urinary tract infections. The aims of the present study were to identify the Klebsiella pneumoniae infections in hospitalized patients, characterization of blaCTX gene, detection cross-resistance and cefepime susceptible-dose dependent (SDD) in isolates.Materials And MethodsIn present study, 111 strains of Klebsiella pneumoniae were isolated from patients hospitalized in Ghotbadden, Faghihi and Nemazee hospitals (Shiraz, Iran). The isolates were identified as K.pneumoniae, based on biochemical tests embedded in the API-20E system. Susceptibility testing (disc diffusion) was performed according clinical and laboratory standards institute (CLSI) guidelines. Detection cefepime susceptible-dose dependent (SDD) was performed. The detection of AmpC β-lactamases producing strains was done based on cefoxitin and cefepime disk tests. The blaCTX gene was detected in the isolates by PCR molecular method.ResultsTotal 111 Klebsiella pneumoniae isolates were studied. The less effective drug was ceftazidime (37.8% isolates were sensitive). All SDD strains were susceptible to colistin and imipenem. Colistin (96.4%) and imipenem (88.3%) were the most effective antibiotics against isolates. Respectively, 41.4% and 35.1% isolates displayed resistance to gentamicin and amikacin. All colistin resistant isolates were imipenem sensitive. The results of PCR on blaCTX gene showed that 70.3% of the isolates possess the gene.ConclusionCarbapenem drugs are effective against Klebsieella pneumoniae infections. These results indicate that multidrug-resistant (MDR) and extensively drug resistant (XDR) strains of K.pneumoniae are rising, and fewer antibiotics may be useful for treating infections caused by these strains. Routine investigation and reporting of antibiotics resistance profile in patients presenting with Klebsiella infections is suggested.Keywords: Hospitalized patients, Blood, Bacterial infection, Klebsiella pneumoniae, Antibiotic resistance pattern, Susceptible, dose dependent} -
زمینه و هدفکلبسیلا پنومونیه باکتری گرم منفی رودهای است که سبب عفونتهای بیمارستانی میشود. اهداف این مطالعه جداسازی کلبسیلا پنومونیه از بیماران بستری در بیمارستان، تعیین نمودن مقاومت متقاطع و الگوهای مقاومت آنتیبیوتیکی ایزوله ها و شناسایی ایزوله های با حساسیت وابسته به دوز نسبت به سفپیم بود.مواد و روش هامطالعه حاضر در طی سال های 1394 - 1393 انجام شد. نمونه های مختلف بیماران بستری در بیمارستانهای قطبالدین، فقیهی و نمازی شیراز )ایران( جمعآوری گردیدند. ایزوله ها بر اساس تستهای بیوشیمیایی موجود در سیستم API20E به عنوان کلبسیلا پنومونیه شناسایی شدند. تست حساسیت آنتیبیوتیکی با استفاده از روش دیسک دیفیوژن و پروتکل سازمان استانداردهای بالینی و آزمایشگاهی ) CLSI 2014 ( انجام شد. ایزوله های با حساسیت وابسته به دوز نسبت به سفپیم و سویه های تولیدکننده AmpC β-lactamase با استفاده از دیسکهای سفوکسیتین و سفپیم شناخته شدند.نتایج111 جدایه کلبسیلا پنومونیه مورد بررسی قرار گرفتند. کماثرترین دارو سفتازیدیم ) 39% حساس بودند( بود. کلیستین ) 96% ( و ایمیپنم ) 88% ) موثرترین آنتیبیوتیکها علیه ایزوله ها بودند. میزان مقاومت به جنتامایسین و آمیکاسین به ترتیب 41 % و 35 % بودند. همه سویه های مقاوم به کلیستین به ایمیپنم حساس بودند. تمام سویه های با حساسیت وابسته به دوز نسبت به سفپیم، حساس به ایمیپنم و کلیستین بودند.نتیجه گیریداروهای گروه کارباپنم هنوز علیه عفونتهای کلبسیلا پنومونیه موثر هستند. این نتایج نشان داد که سویه های کلبسیلا پنومونیه مقاوم به چند دارو در حال افزایش است. از اینرو بررسی روتین و گزارش پروفایل مقاومت آنتیبیوتیکی سویه های کلبسیلا پنومونیه پیشنهاد میشود.کلید واژگان: بیماران بستری در بیمارستان, عفونت باکتریایی, کلبسیلا پنومونیه, الگوی مقاومت آنتیبیوتیکی}Background and ObjectiveKlebsiella pneumonia (K. pneumoniae) is a Gram-negative enteric bacterium that causes nosocomial infections. The aims of the present study were to identify the Klebsiella pneumoniae infections in hospitalized patients: the characterization of cross-resistance and antibiotic resistance patterns in isolates and the detection of cefepime susceptible-dose dependent in strains.Materials and MethodsIn the present study (during 2014-2015), samples were collected from patients hospitalized in Ghotbadden, Faghihi and Nemazee hospitals (Shiraz, Iran). The isolates were identified as K. pneumoniae, based on the biochemical tests embedded in the API-20E system. The susceptibility testing (disc diffusion) was performed according to the clinical and laboratory standards institute guidelines (CLSI 2014). The dDetection of cefepime susceptible-dose dependent (SDD) was performed. The detection of AmpC β-lactamases producing strains was done based on the cefoxitin and cefepime disk tests.ResultsIn this study 111 strains of Klebsiella pneumoniae were isolated. The less effective drug was ceftazidime (37.8% were sensitive). All SDD strains were susceptible to colistin and imipenem. Colistin (96.4%) and imipenem (88.3%) were the most effective antibiotics against isolates. Respectively, 41.4% and 35.1% isolates displayed resistance to gentamicin and amikacin. All colistin resistant isolates were imipenem sensitive.ConclusionCarbapenem drugs are effective against Klebsieella pneumoniae infections. These results indicate that multidrug-resistant strains of K. pneumoniae are rising. The routine investigation and reporting of antibiotics resistance profile in patients presenting with Klebsiella infections is suggested.Keywords: Hospitalized patients, Bacterial infection, Klebsiella pneumoniae, Antibiotic resistance pattern, Susceptible, dose dependent}
-
زمینهکلبسیلا اکسی توکا پاتوژن فرصت طلبی است که در ایحاد بسیاری از عفونت های بیمارستانی نقش دارد. شیوع مقاومت به کلاس های مختلف آنتی بیوتیکی در گونه های کلبسیلا در حال افزایش است. در برخی از ایزوله ها مقاومت به واسطه تولید آنزیم AmpC-beta-lactamase است. هدف از این مطالعه بررسی توانایی تولید AmpC-beta-lactamase و شناسایی پروفایل مقاومت آنتی بیوتیکی در ایزوله های بالینی کلبسیلا اکسی توکا در شیراز (ایران) می باشد.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی، 35 سویه کلبسیلا اکسی توکا از بیماران بستری در بیمارستان های شیراز (ایران) جدا شدند و کشت مجدد بر روی محیط های میکروب شناسی شامل مک کانکی آگار انجام شد. ایزوله ها با استفاده از تست های طراحی شده در سیستم API20E مورد تایید نهایی قرار گرفتند. تست تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی بر اساس پروتکل استانداردهای بالینی و آزمایشگاهی (CLSI 2014) انجام شد. به منظور شناسایی فنوتیپی سویه های تولیدکننده AmpC-beta-lactamase از دیسک های سفوکسیتین و سفپیم استفاده شد.یافته هابه طور کلی 35 ایزوله کلبسیلا اکسی توکا ایزوله و مورد بررسی قرار گرفتند که از این بین 4 (4/11 درصد) ایزوله تولیدکننده AmpC-beta-lactamase بودند. در بین آنتی میکروبیال های مورد بررسی ایمی پنم (100 درصد) و کلیستین (100 درصد) موثرترین داروها علیه ایزوله ها بودند. میزان مقاومت ایزوله ها به آمیکاسین، سفوکسیتین، سیپروفلوکساسین و سفپیم به ترتیب 6/88 درصد، 6/88 درصد، 7/85 درصد و 7/85 درصد بود. ایزوله ها بالاترین مقاومت را به سفتازیدیم (20 درصد) نشان دادند. همه ایزوله های AmpC-beta-lactamase positive به آمیکاسین، ایمی پنم و کلیستین حساس بودند.نتیجه گیرینتایج مطالعه حاضر نشان داد که سفالوسپورین های نسل سوم علیه 20 درصد از عفونت های ناشی از سویه های کلبسیلا اکسی توکا مورد مطالعه موثر نیستند. مقاومت به دو کلاس آنتی بیوتیکی بزرگ (آمینوگلیکوزید ها و سفالوسپورین ها) در بین سویه های مورد بررسی مشاهده شد و درمان عفونت های ناشی از این ایزوله ها در آینده مشکل بزرگی خواهد بود.کلید واژگان: عفونت بیمارستانی, کلبسیلا اکسی توکا, مقاومت آنتی بیوتیکی, AmpC, بتالاکتاماز}BackgroundKlebsiella oxytoca is opportunistic pathogen that incriminated in many nosocomial infections. There is an increase in the prevalence of resistance to different classes of antibiotics in Klebsiella species. In some isolates resistance is mediated by the production of AmpC beta-lactamases. The goal of this study was the survey for AmpC β-lactamase production and characterization of antibiotic resistance profile in Iranian (Shiraz) clinical isolates of Klebsiella oxytoca.Materials and MethodsIn this cross-sectional study, thirty-five Klebsiella oxytoca strains were isolated from patients hospitalized in Shiraz (Iran) hospitals, and subculture was performed on microbiological media including MacConkey agar. The isolates were identified based on biochemical tests embedded in the API-20E system. Standard susceptibility testing (disc diffusion) was performed according clinical and laboratory standards institute (CLSI, 2014) guidelines. Phenotypic detection of AmpC beta-lactamasec was performed by cefepime and cefoxitin disk test.ResultsTotal 35 Klebsiella oxytoca isolates were examined that among them 4 (11.4%) isolates were AmpC beta-lactamase producing. Among examined antimicrobials, imipenem (100%) and colistin (100%) were most effective drugs against isolates. Respectively, 88.6%, 88.6%, 85.7% and 85.7% isolates were resistant to amikacin, cefoxitin, ciprofloxacin and cefepime. Strains showed the most frequent resistance to ceftazidime (20%). All AmpC beta-lactamase positive isolates were sensitive to amikacin, imipenem and colistin.ConclusionResults of current study showed third-gerneration cephalosprins are not effective against 20% of infections caused by Klebsiella oxytoca. Resistance to two major classes of antibiotics (aminoglycosides and beta-lactams) was seen among studied strains and treatment of infections causing by this isolates are major problem in future.Keywords: Hospital infection, Klebsiella oxytoca, Antibiotic resistance, AmpC beta, lactamase}
-
زمینهعفونت های مجرای ادراری (UTI) یکی از شایع ترین عفونت های باکتریایی در تمام جهان به ویژه در کشورهای در حال توسعه بوده و همراه با هزینه های اقتصادی بالا هستند. مدیریت عفونت های UTI با افزایش ظهور مقاومت دارویی با خطر جدیدی همراه است. آگاهی از اتیولوژی باکتری های منطقه ای و الگوهای حساسیت برای ردیابی هرگونه تغییرات احتمالی و توصیه ها برای درمان تجربی صحیح UTI ضروری است. هدف از این مطالعه جداسازی و تعیین پروفایل حساسیت آنتی بیوتیکی باکتری های گرم منفی ایجادکننده عفونت های مجرای ادراری (UTI) و شناسایی ایزوله های تولیدکننده آنزیم (NDM-1) New Delhi Metallo-beta-lactamase-1 در اهواز است.مواد و روش هااین مطالعه مقطعی در طی یک سال از فروردین تا اسفند سال 1392 در مرکز جهاد دانشگاهی اهواز انجام شد. نمونه ادرار بیماران مشکوک به UTI مراجعه کننده به مرکز جهاد دانشگاهی پس از رعایت شرایط استریلیتی، به صورت Clean catch midstream ادرار جمع آوری و کشت بر روی محیط های معمول میکروب شناسی انجام شد. باکتری های گرم منفی ایزوله شده از نمونه های ارسالی به کمک تست های مورفولوژی و بیوشیمیایی مورد شناسایی قرار گرفتند. تست تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش استاندارد دیسک دیفیوژن بر اساس پروتکل ارائه شده توسط CLSI 2011 انجام شد. تست اصلاح شده هاج جهت شناسایی سویه های تولید کننده آنزیم کارباپنماز و تست (CDT)Imipenem-EDTA Combined Disc Test جهت شناسایی سویه های تولیدکننده آنزیم های MBL استفاده شد.یافته هادر این مطالعه تعداد 708 ارگانیسم گرم منفی از نمونه ادرار بیماران مراجعه کننده ایزوله شدند. آنالیز نتایج نشان داد که باکتری اشریشیاکلی شایع ترین ارگانیسم جدا شونده (67 درصد) و پس از آن کلبسیلا (5/26 درصد) و انتروباکتر (5/2 درصد) قرار داشتند. نتایج تست حساسیت آنتی بیوتیکی نشان داد که بیش از 90 درصد ایزوله ها به آنتی بیوتیک های تتراسایکلین، سفتازیدیم، مروپنم، آمیکاسین، سفوتاکسیم، ایمی پنم، سفپیم حساس هستند. به طور کلی ایزوله های گرم منفی بیشترین مقاومت را به ترتیب به آنتی بیوتیک های سفالوتین (32 درصد)، تری متوپریم سولفامتوکسازول (5/30 درصد) و نالیدیکسیک اسید (25 درصد) نشان دادند.نتیجه گیرینتایج ما نشان دادند که ارگانیسم های ایزوله شونده از بیماران سرپایی حساسیت آنتی بیوتیکی بسیار خوبی نسبت به آنتی بیوتیک ها متداول مورد استفاده نشان می دهند و ضروری است که به صورت دوره ای و منظم پروفایل حساسیت آنتی بیوتیکی سویه های جداشونده از جامعه بررسی شود زیرا تعیین حساسیت ضدمیکروبی جهت اتخاذ رژیم درمانی صحیح ضروری است.کلید واژگان: بیماران سرپایی, عفونت ادراری, باکتری های گرم منفی, حساسیت آنتی بیوتیکی}BackgroundUrinary tract infection (UTI) is the commonest bacterial infectious disease in worldwide (especially in developing countries) with a high rate of morbidity and financial cost. The management of UTI infections has been jeopardized by increase in immergence of antimicrobial drug resistance. Knowledge of the local bacterial etiology and susceptibility patterns is required to trace any change that might have occurred in time so that updated recommendation for optimal empirical therapy of UTI can be made. The aim of this investigation was distribution and antimicrobial susceptibility pattern of gram negative bacteria causing urinary tract infection (UTI) and detection NDM-1 (new-delhi-metallo-beta-lactamase-1) producing isolates in Ahwaz.Materials And MethodsThis cross-sectional study was done during a period of one year from April 2013 to March 2014. Clean catch midstream urine samples were collected from suspected patients to UTI. The isolates were identified based on morphological and biochemical testes. Culture was performed on routine microbiological media. Susceptibility testing was performed according CLSI (2013) guidelines. Detection of carbapenemase producing isolates was performed by modified hodge test (MHT). Metallo-beta-lactamase isolates were detected by imipenem-EDTA combined disc test (CDT).ResultsIn this study 708 gram negative organisms were isolated from urine samples. E.coli was the most common isolated bacteria (67%) followed by Klebsiella spp. (26.5%) and Enterobacter spp. (2.5%). In antibiotic susceptibility testing more than 90% of isolates were sensitive to tetracycline, ceftazidime, meropenem, amikacin, cefotaxime, imipenem, and cefepime. Isolates were more resistant to cephalothin (32%), co-trimoxazol (30.5%), and nalidixic acid (25%).ConclusionIn our results isolated organisms from outpatients showed very high sensitivity to common antibiotics. Continuous and regular monitoring of susceptibility pattern of community isolated strains is necessary. Antimicrobial susceptibility is important to guide effective antibiotic therapy.Keywords: Outpatients, Urinary tract infection, Gram negative bacteria, Antibiotic susceptibility}
-
اهدافاسینتوباکتر بومانی یکی از ارگانیسم های مقاوم به داروی مهم در بیمارستان ها در تمام جهان است. این مطالعه با هدف بررسی گسترش جمعیت اسینتوباکتر بومانی- کالکواستیکوس مقاوم به دارو، شناسایی سویه های با مقاومت گسترده و سویه های مقاوم به همه داروها، بررسی توانایی تولید کارباپنمازها و تعیین MIC ایمی پنم در ایزوله های آن انجام شد.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی که در طی 10 ماه از مرداد 1393 تا اردیبهشت سال 1394 انجام شد، 48 نمونه از بیماران بستری در بخش های مختلف بیمارستان های شیراز جمع آوری و روی محیط های کشت میکروب شناسی بالینی کشت انجام شد. برای تایید نهایی ایزوله ها از سیستم API 20NE اختصاصی باکتری های غیرتخمیرکننده و تست های بیوشیمیایی استفاده شد. بر اساس پروتکل CLSI 2014 از روش دیسک دیفیوژن برای بررسی حساسیت آنتی بیوتیکی و از آزمون اصلاح شده هاج جهت شناسایی سویه های تولیدکننده آنزیم های کارباپنماز استفاده شد. حداقل غلظت مهارکنندگی (MIC) ایمی پنم با استفاده از روش E-test تعیین شد.یافته هاهمه ایزوله ها به آنتی بیوتیک کلستین حساس بودند. هیچ یک از ایزوله ها به کارباپنم ها (ارتاپنم، ایمی پنم و مروپنم) پاسخ ندادند. همه ایزوله ها علاوه بر داشتن مقاومت چنددارویی، دارای مقاومت دارویی گسترده نیز بودند، اما هیچ یک از ایزوله ها به همه داروها مقاوم نبودند. میزان حساسیت به مینوسایکلین و آمپی سیلین- سولباکتام به ترتیب 3/14 و 7/10% بود. آزمون فنوتیپی اصلاح شده هاج در همه ایزوله ها مثبت بود. در تمام ایزوله ها MIC ایمی پنم بالاتر از واحد 32 بود.نتیجه گیریاستفاده از رژیم های دارویی ترکیبی در درمان سویه های XDR، MDR اسینتوباکتر موثر است.کلید واژگان: کمپلکس اسینتوباکتر بومانی, کالکواستیکوس, سویه های با مقاومت چنددارویی, سویه های با مقاومت دارویی گسترده, MIC ایمی پنم}Aims: One of the drug resistant organisms in the worldwide hospitals is Acinetobacter baumannii. The aim of this study was to investigate the expansion of drug-resistant Acinetobacter baumannii-calcoaceticus population, extensively drug-resistant (XDR) and pan-drug resistant (PDR) strains, and the ability of carbapenemases production, as well as to determine imipenem MIC in its isolates.Materials and MethodsIn the cross-sectional study, 48 samples of the patients hospitalized in different wards of the hospitals in Shiraz were collected and cultured on clinical microbiological media during 10 months from July 2014 to April 2015. Specific non-fermentative bacteria API 20NE system and biochemical tests were used to confirm the isolates finally. Based on CLSI 2014 protocol, disc diffusion method was used to investigate the antibiotic sensibility. Modified hodge test was used to determine the strains producing carbapenemases enzymes. E-test method was used to determine imipenem MIC.
Findings: All the isolates were sensitive to coloistin antibiotic. None of the isolate answered carbapenemases (ertapenem, imipenem, and meropenem). Beside multi-drug resistant characteristics, all the isolates were with expanded drug resistant characteristics. However, there was no pan-drug resistant isolate. Levels of sensitivity to minocycline and ampicillin-sulbactam were 14.3 and 10.7%, respectively. Phenotypic modified Hodge test was positive in all the isolates. Imipenem MIC was higher than 32 units in all the isolates.ConclusionCombined drug regimens are effective on the treatments of XDR and MDR Acinetobacter strains.Keywords: Acinetobacter Baumannii, Calcoaceticus Complex, Multidrug, Resistant (MDR) Strains, Extensively Drug, Resistant (XDR) Strains, Imipenem MIC} -
اهدافبه طور کلی استخراج DNA از باکتری های گرم مثبت بسیار مشکل و پرهزینه است. هدف از این مطالعه استفاده از پلی اتیلن گلیکول 200 به منظور استخراج DNA از باکتری گرم مثبت لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و باکتری گرم منفی سودوموناس آئروژینوزا و انجام PCR روی آنها به منظور جست وجو به ترتیب برای ژن های Lacto و ExoA بود.مواد و روش هادر این مطالعه سویه استاندارد باکتری گرم مثبت لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و باکتری گرم منفی سودوموناس آئروژینوزا به ترتیب بر روی محیط کشت MRS آگار و مولرهینتون آگار کشت داده شدند. سپس کلونی باکتری در بافر TE حل شد و با استفاده از PEG 200 استخراج DNA انجام شد. واکنش PCR بر روی ژن های Lacto (اختصاصی لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس) و ExoA (سودوموناس آئروژینوزا) اختصاصی هر ارگانیسم انجام شد.یافته هاPCR روی ژن های انتخاب شده برای هر ارگانیسم انجام و وجود ژن های Lacto با اندازه 231bp برای سویه استاندارد لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و سویه لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس جداشده از لبنیات و ExoA با اندازه 396bp برای سویه استاندارد سودوموناس آئروژینوزا و سویه های بالینی سودوموناس آئروژینوزا روی ژل آگارز مشاهده شد.نتیجه گیریاز آنجایی که استخراج DNA از باکتری های گرم مثبت به دلیل داشتن دیواره بسیار محکم مشکل است، استفاده از PEG 200 می تواند روش بسیار مناسب، مقرون به صرفه و بسیار سریع و در دسترس برای استخراج DNA از باکتری های گرم مثبت باشد. علاوه بر این، با استفاده از این روش می توان به آسانی DNA باکتری های گرم منفی و قارچ ها را نیز استخراج نمود.کلید واژگان: پلی اتیلن گلیکول 200, استخراج DNA, باکتری های گرم مثبت, باکتری های گرم منفی}Aims: In general, DNA extraction from the gram-positive bacteria is too hard and expensive. The aim of this study was to utilize Polyethylene Glycol 200 in order to extract DNA from Lactobacillus acidophilus gram-positive bacteria and Pseudomonas aeruginosa gram-negative bacteria, as well as PCR conducting on them to search Lacto and ExoA genes, respectively.Materials and MethodsStandard strains of Lactobacillus acidophilus gram-positive bacteria and Pseudomonas aeruginosa gram-negative bacteria were cultured on MRS and Mueller-Hinton agar, respectively. Then, the bacteria colony was dissolved in TE buffer and DNA was extracted using PEG 200. PCR reactions were done on the specific Lacto and ExoA genes of each organism.
Findings: PCR was done on the selected genes for each organism; and bp231 Lacto genes were detected for the standard strain of Lactobacillus acidophilus and the strain of Lactobacillus acidophilus separated from the dairy. In addition, bp396 ExoA genes were detected for the standard strain of Pseudomonas aeruginosa and the clinical strains of Pseudomonas aeruginosa on agarose gel.ConclusionSince DNA extraction from gram-positive bacteria is too hard due their very strong walls, PEG 200 might be a very proper, affordable, quick, and available method to extract DNA from the gram-positive bacteria. In addition, DNA of gram-negative bacteria and fungi can simply be extracted through the method.Keywords: Polyethylene Glycol 200, DNA Extraction, Gram, Positive Bacteria, Gram, Negative Bacteria} -
مجله طب جنوب، سال هجدهم شماره 6 (بهمن و اسفند 1394)، صص 1198 -1207مقدمهپسودوموناس آئروژینوزا از عوامل اصلی ایجاد کننده عفونت در بیماران سوختگی می باشد که زندگی بسیاری از این بیماران را تهدید می کند. هدف از مطالعه حاضر تشخیص و ردیابی منبع عفونت با استفاده از دو روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (AP-PCR) و الگوی پلاسمیدی می باشد.مواد و روش هاهفتاد و چهار سویه پسودوموناس از بیماران دچار سوختگی و محیط بیمارستان در بیمارستان قطب الدین شیراز جدا شدند. تیپ بندی ملکولی سویه ها توسط دو روش ذکر شده انجام گردید. سپس ایزوله ها توسط دندروگرام دسته بندی و درصد تشابه آن ها با استفاده از برنامه NTSYS و Photo Capt مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.یافته هابر اساس درصد تشابه 50 درصد و 7/ 64 درصد و 5/ 67 درصد به دست آمده به وسیله دندروگرام، 38 الگوی پلاسمیدی تشخیص داده شد که به ترتیب در خوشه های2، 3 و 5 طبقه بندی گردیدند. دندروگرام محصولات AP-PCR به 47 تیپ مختلف تقسیم بندی شد.نتیجه گیریاین نتایج نشان می دهد که در طول بستری بیماران سوختگی، تیپ های خاصی از پسودوموناس آئروژینوزا در محیط بخش سوختگی بیمارستان شایع هستند و بیماران را درگیر می کنند. برای کنترل آلودگی زخم های بیمار با گونه های مقاوم به آنتی بیوتیک، بایستی محیط حمام را پس از شستشوی محل سوختگی بیماران با مواد ضدعفونی کننده قوی گندزدایی کرد.
کلید واژگان: پسودوموناس آئروژینوزا, الگوی پلاسمید, منبع عفونت, AP, PCR}Iranian South Medical Journal, Volume:18 Issue: 6, 2016, PP 1198 -1207BackgroundPseudomonas aeruginosa is one of the main etiological agents in burn infections which could be life threatening for the infected patients. The aim of the present study was to identify and track source of infections using two molecular typing methods.Materials And MethodsSeventy-four strains of P. aeruginosa were isolated from burn patients and hospital environment in Ghotbadden Burn Hospital, Shiraz, Iran. Isolates were typed by arbitrary primed-polymerase chain reaction (AP-PCR) and plasmid profiling. Similarity and clustering of the strains was assessed using NTSYS-PC software and photo Capt Mw program.ResultsThirty eight plasmid profiles were obtained and classified them into: 2, 3and 5 clusters, based on 50%, 64.7% and 67.5% similarity on the plotted dendrogram, respectively. Drawn dendrogarm categorized AP-PCR products to 47 different types.ConclusionBased on these results, a limited number of P. aeruginosa types are predominant in the hospitals which infect the burn patients. To control of the infections in patients with antibiotics, resistant isolates, strong disinfection of patients’ bathroom after scrubbing of patients wounds, should be implemented.Keywords: Pseudomonas aeruginosa, Plasmid typing, Source of infections, AP, PCR} -
زمینه و هدفظهور باکتری های غیرتخمیرکننده مقاوم به چنددارو تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs)، هم اکنون به عنوان یک مشکل عمده در بیماران بستری مطرح است. هدف این مطالعه، بررسی گسترش باکتری های غیرتخمیرکننده مقاوم به چنددارو تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs) جداشده از خون بیماران، با استفاده از سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 در شیراز (ایران) بود.
روش تحقیق: در این مطالعه مقطعی، 4825 نمونه خون از بیماران مشکوک به باکتریمی بستری در بیمارستان های شهر شیراز گرفته شد و وارد شیشه های محیط کشت خون سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 گردید. با استفاده از تست های بیوشیمیایی تعبیه شده در سیستم API 20E اختصاصی، باکتری های غیرتخمیرکننده، مورد شناسایی نهایی قرار گرفتند. تست حساسیت آنتی بیوتیکی و شناسایی سویه های تولیدکننده ESBL، با استفاده از تست فنوتیپی DDST بر اساس پروتکل(CLSI(2014 انجام پذیرفت.یافته هااز کل 4825 نمونه خون جمع آوری شده، 1145 کشت خون (24درصد)، توسط سیستم BACTEC از نظر رشد میکروارگانیسم مثبت تشخیص داده شدند. از بین تمام ارگانیسم های جداشده از کشت های خون مثبت، 206 ارگانیسم، باکتری های گرم منفی غیرتخمیر کننده بودند. شایع ترین باکتری های غیرتخمیر کننده جداشده به ترتیب: پسودوموناس (48%)، اسینتوباکتر (7/ 41%) و استنوتروفوموناس (2/ 8%) بودند. در ایزوله های اسینتوباکتر، تولید ESBL در 70 ایزوله (4/ 81%) مشاهده شد. در بین آنتی بیوتیک های کلاس بتالاکتام، ایزوله های پسودوموناس، بهترین حساسیت را به پیپراسیلین-تازوباکتام (5/ 46%) نشان دادند.نتیجه گیریبتالاکتام ها بر روی 40% عفونت های ناشی از پسودوموناس و 78% عفونت های اسینتوباکتر اثر ندارند. ظهور سویه های با مقاومت های چنددارویی، یک مشکل بزرگ سلامت ملی در ایران است که باید مورد توجه بیشتر قرار گیرد.
کلید واژگان: عفونت گردش خون, باکتری های غیرتخمیرکننده, مقاومت آنتی بیوتیکی, ESBL}Background And AimThe emergence of nonfermenter bacteria that are resistant to multidrug resistant ESBL are nowadays a principal problem for hospitalized patients. The present study aimed at surveying the emergence of nonfermenter bacteria resistant to multi-drug ESBL producing isolated from patients blood samples using BACTEC 9240 automatic system in Shiraz.Materials And MethodsIn this cross-sectional study, 4825 blood specimens were collected from hospitalized patients in Shiraz (Iran), and positive samples were detected by means of BACTEC 9240 automatic system. The isolates containing nonfermenter bacteria were identified based on biochemical tests embedded in the API-20E system. Antibiotic sensitivity test was performed and identification of ESBL producing strains were done using phenotypic detection of extended spectrum beta-lactamase producing isolates(DDST) according to CLSI(2013) guidelines.ResultsOut of 4825 blood samples, 1145 (24%) specimen were gram-positive using BACTEC system. Among all isolated microorganisms, 206 isolates were non-fermenting gram- negative bacteria. The most common non-fermenter isolates were Pseudomonas spp. (48%), Acinetobacter spp. (41.7%), and Stenotrophomonas spp. (8.2%). Seventy of them (81.4%) were Acinetobacter spp. which were ESBL positive. Among β-lactam antibiotics, Pseudomonas spp. showed the best sensitivity to piperacillin-tazobactam (46.5%).ConclusionIt was found that β-lactam antibiotics are not effective against more than 40% of Pseudomonas spp. infections and 78% Acinetobacter infections. Emergence of multi-drug resistant strains that are resistant to most antibiotic classes is a major public health problem in Iran. To resolve this problem using of practical guidelines is critical.Keywords: Blood stream infection, Nonfermenter bacteria, Antibiotic resistance, ESBL} -
مقدمه و اهدافبه دلیل طبیعت منحصربفرد، توانایی زنده ماندن در محیط های مرطوب و مقاومت ذاتی به بسیاری از آنتی بیوتیک ها و آنتی سپتیک ها، پسودوموناس آئروژینوزا پاتوژن شایع در بیمارستان بویژه در بخش های مراقبت ویژه است. اهداف این مطالعه شناسایی پسودوموناس آئروژینوزا دارای ژن blaCTX ایجادکننده عفونت ها در بیمارستان، تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی آنها و بررسی توانایی تولید آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBL) بودند.روش کاردر این مطالعه مقطعی نمونه های بالینی بیماران بستری در بخش های مختلف بیمارستان های شیراز جمع آوری شد. نمونه ها بر روی محیط های کشت میکروب شناسی کشت داده شدند. باکتری های رشد کرده به کمک تست های بیوشیمیایی و سیستم API 20NE اختصاصی باکتری های غیرتخمیرکننده مورد تایید نهایی قرار گرفتند. بر اساس پروتکل CLSI 2014، به ترتیب از روش های استاندارد دیسک دیفیوژن، Combination Disk، تست اصلاح شده هاج [MHT] وE-test برای بررسی حساسیت آنتی بیوتیکی، شناسایی سویه های تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف، سویه های تولید کننده آنزیم کارباپنماز و تعیین MIC ایمی پنم استفاده گردید. از روش ملکولی PCR برای شناسایی سویه های دارای ژن blaCTX استفاده شد.نتایجدر این مطالعه 45 ایزوله پسودوموناس آئروژینوزا از نمونه های مختلف بالینی ایزوله گشتند. نوزده بیمار (2/42 درصد) بیمار مرد و 26 (8/57 درصد) مورد آنها زن بودند. 8/57 درصد (26 مورد) سویه ها از نمونه خلط ایزوله شدند. موثرترین داروها بر روی ایزوله ها آمیکاسین و کلیستین بودند بطوریکه 8/97 درصد آنها به این داروها حساسیت نشان دادند. ایزوله ها بالاترین مقاومت را به ترتیب به سفوتاکسیم (8/97%) نشان دادند. تنها 8/77 درصد سویه ها به کارباپنم های گروه 2 (یعنی ایمی پنم و مروپنم) پاسخ دادند. همه ایزوله های مقاوم به ایمی پنم دارای MIC >32 و بالاتر بودند. 17 سویه (7/37 درصد) به کینولون های مورد بررسی (سیپروفلوکساسین، نورفلوکساسین) مقاومت نشان دادند. نتایج انجام PCR به منظور جستجوی ژن blaCTX در ایزوله های پسودوموناس آئروژینوزا که 5/15 درصد سویه ها دارای این ژن هستند.
نتیجه گیری کلی: نتایج این مطالعه از نقطه نظر تجربی و استفاده بالینی از داروها حائز اهمیت است. ما معتقدیم که به منظور حفظ کارپنم ها به عنوان راهکار نهایی جهت درمان، استفاده از کارباپنم ها برای درمان پسودوموناس آئروژینوزا باید برای بیمارانی مدنظر قرار گیرند که دارای عفونت پلی میکروبی هستند بویژه وقتی که باکتری های بیهوازی در محل عفونت حضور دارند یا برای ایزوله های پسودوموناس مقاوم به دیگر آنتی بیوتیک ها استفاده شوند.
کلید واژگان: عفونت بیمارستانی, پسودوموناس آئروژینوزا, مقاوم چنددارویی, ژن blaCTX, حساسیت آنتی بیوتیکی}Armaghane-danesh, Volume:20 Issue: 8, 2015, PP 689 -705Introduction andObjectivesBecause of its ubiquitous nature, ability to survive in moist environments, and innate resistance to many antibiotics and antiseptics, P. aeruginosa is a common pathogen in hospitals. The goals of this study were detection of Psudomonas aeruginosa harboring blaCTX gene causing infections in hospitals, determination of their susceptibility to antibiotics and survey the ESBL production.Materials And MethodsIn the present cross-sectional study, clinical samples from hospitalized patients (Shiraz, Iran) were collected, and culture was done on microbiological media. For final identification, biochemical tests and API 20NE system were used. Disc diffusion, combination disk, modified hodge test (MHT) and E-test were used for antibiotic susceptibility testing, ESBL production, carbapenemas production, and MIC values for imipenem, respectively, according to CLSI 2014 recommendations. The blaCTX gene was detected in the isolates by PCR molecular method.ResultsIn the current study, 45 isolates of Pseudomonas aeroginosa were obtained from hospitalized patients, consisting of 19 males (42.2%) and 26 females (57.8%). As observed, 57.8% (26 strains) of isolates were recovered from sputum. The most effective antibiotics against isolates were amikacin and colistin, with 97.8% of isolates showing sensitivity to them. The highest resistance was to cefotaxime (97.8%). As revealed, 77.8% of isolates showed response to group 2 carbapenems (imipenem, meropenem). All imipenem resistant strains have MIC > 32 for imipenem. Seventeen strains (37.7%) were resistant to quinolones (ciprofloxacin, norfloxacin). The results of PCR on blaCTX gene indicated that 15.5% of the isolates possess the gene.ConclusionThis study is important from a practical point of view. We believe that the use of imipenem for the treatment of P. aeruginosa should be reserved for situations where the infection is polymicrobial, particularly when anaerobic bacteria are present, or for pseudomonal isolates resistant to other antibiotics.Keywords: Hospital infection, Pseudomonas aeruginosa, Multidrug, resistant (MDR), blaCTX gene, antibiotic susceptibility} -
مجله طب جنوب، سال هجدهم شماره 5 (آذر و دی 1394)، صص 970 -981زمینهظهور سویه هایی که تولید آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs) می کنند در خانواده انتروباکتریاسیه هم اکنون به عنوان یک مشکل عمده در بیماران بستری مطرح است. هدف این مطالعه بررسی گسترش سویه های مقاوم به چنددارو تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف (ESBLs) در انتروباکتریاسیه های جداشده از خون بیماران با استفاده از سیستم اتوماتیک BACTEC 9240 در جنوب ایران است.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی 4825 نمونه خون بیماران مشکوک به باکتریمی بستری در بیمارستان های شهر شیراز گرفته شد و وارد شیشه های محیط کشت خون سیستم اتوماتیک BACTEC گردید. نمونه های کشت خون مثبت از دستگاه خارج و بر روی محیط های معمول میکروب شناسی شامل محیط های بلاد آگار، شکلات آگار و مک کانکی آگار کشت انجام شد. با استفاده از تست های بیوشیمیایی تعبیه شده در سیستم API 20E اختصاصی انتروباکتریاسیه ها مورد شناسایی نهایی قرار گرفتند. پروفایل مقاومت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش استاندارد دیسک دیفیوژن بر اساس استاندارهای CLSI انجام شد. شناسایی سویه های تولیدکننده ESBL با استفاده از تست فنوتیپی DDST بر اساس استاندارد ارائه شده توسط (2013)CLSI انجام پذیرفت.یافته هااز کل 4825 نمونه خون ارسال شده 1145 کشت خون (24 درصد) از نظر رشد میکروارگانیسم مثبت بودند که از بین موارد مثبت 248 ارگانیسم (5/ 21 درصد) متعلق به خانواده انتروباکتریاسیه بودند. در خانواده انتروباکتریاسیه به ترتیب اشریشیاکلی (5/ 46 درصد)، کلبسیلا (28 درصد) و انتروباکتر (5/ 13 درصد) شایع ترین جنس های ایزوله شده بودند. در بین انتروباکتریاسیه های جداشده بهترین پاسخ به آنتی بیوتیک آمپی سیلین در سالمونلا مشاهده شد. باکتری اشریشیاکلی شایع ترین ارگانیسم تولیدکننده آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف در این خانواده بود به طوری که 58 درصد ایزوله های این باکتری ESBL مثبت بودند. به ترتیب داروهای پلی میکسین B، کلیستین و ایمی پنم آنتی بیوتیک هایی بودند که بیشترین کارآیی را بر علیه سویه های ESBL مثبت کلبسیلا داشتند. ایزوله های ESBL مثبت انتروباکتر کمترین مقاومت را به ایمی پنم (7/7 درصد) نشان دادند. همه ایزوله های ESBL مثبت سراشیا به کلرامفنیکل، کوتریموکسازول و ایمی پنم حساس بودند.نتیجه گیرینتایج نشان داد متاسفانه داروهای بتالاکتام جهت درمان بیش از 40 درصد باکتریمی های ناشی از اشریشیاکلی و کلبسیلا و 39 درصد باکتریمی های ناشی از انتروباکتر که جزء شایع ترین ارگانیسم های ایجادکننده عفونت در بیمارستان می باشند کارآیی ندارند. خطر گسترش مقاومت های چنددارویی روز به روز در حال افزایش است و هشدار جدی در درمان بیماران در ایران است.
کلید واژگان: باکتریمی, کشت خون, سیستم BACTEC 9240, انتروباکتریاسیه, مقاومت آنتی بیوتیکی, ESBL}BackgroundExtended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) have emerged as important mechanism of resistance among enterobacteriaceae family. These ESBL positive strains are major problem in hospitalized patients. The goal of this study was the survey emergence of multi-drug resistant ESBL producing strains among enterobacteriaceae members isolated from patients blood samples using BACTEC 9240 automatic system in south of Iran.Materials and MethodsIn this cross-sectional study, 4825 blood samples were collected from hospitalized patients, and positive samples were detected by BACTEC automatic system. Positive blood cultures removed from BACTEC and subculture was performed on microbiological media including blood agar, chocolate agar and MacConkey agar. The isolates were identified based on biochemical tests embedded in the API-20E system. Susceptibility testing (disc diffusion) was performed according clinical and laboratory standards institute (CLSI, 2013) guidelines. Phenotypic detection of extended spectrum beta-lactamase producing isolates was performed by double disk synergy test (DDST).ResultsTotal 1145 (24%) blood cultures were positive that among them 248 (21.5%) belonged to the enterobacteriaceae family. The most common isolates in this family were Escherichia coli (46.5%), Klebsiella spp. (28%), Enterobacter spp. (13.5%). Among enterobacteriaceae family, ampicillin was most effective drug against Salmonella isolates. Escherichia coli was the most common ESBL-producing isolate (58% of isolates were ESBL positive). Respectively, polymyxin B, colistin, imipenem were the most effective drugs against ESBL-positive Klebsiella strains. The ESBL-positive Enterobacter strains showed lowest resistance to imipenem (7.7%). All ESBL positive Serratia isolates were sensitive to chloramphenicol, co-trimoxazole and imipenem.ConclusionResults showed unfortunately betalactam antibiotics are not effective against more than 40% of bacteremia caused by Escherichia coli and Klebsiella and 39% bacteremia caused by Enterobacter. Multi drug resistance strains are increasing and treatment of infections causing by this isolates are major problem in Iran.Keywords: Bacteremia, Blood culture, BACTEC 9240 system, Enterobacteriaceae, Antibiotic resistance, ESBL} -
زمینهعفونت های گردش خون (BSIs) از دلایل اصلی ایجاد عوارض و مرگ ومیر در مبتلایان هستند. میزان مقاومت آنتی بیوتیکی در بین پاتوژن های ایجادکننده عفونت های گردش خون در بیمارستان به ویژه در بین باکتری های گرم منفی از جمله پسودوموناس و اسینتوباکتر در حال افزایش است. هدف از این مطالعه جداسازی پسودوموناس و اسینتوباکتر از کشت خون بیماران بستری در بیمارستان امام خمینی کرمانشاه و سپس تعیین پروفایل حساسیت آنتی بیوتیکی ایزوله ها بود.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی تعداد 2382 نمونه خون از 2285 بیمار بستری در بیمارستان مربوطه جمع آوری شد. نمونه های خون بیماران در درون محیط های مخصوص کشت خون تلقیح شدند و سپس ساب کالچر بر روی محیط های معمول میکروب شناسی انجام شد. پسودوموناس و اسینتوباکتر ایزوله شده از نمونه های ارسالی به کمک تست های مورفولوژی و بیوشیمیایی مورد شناسایی قرار گرفتند. تست تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی با استفاده از روش استاندارد دیسک دیفیوژن بر اساس پروتکل ارائه شده توسط سازمان استاندارهای بالینی و آزمایشگاهی (CLSI 2012) مورد مطالعه قرار گرفت.یافته هادر طی این مطالعه از 2382 نمونه خون جمع آوری شده، 133 (6/ 5 درصد) نمونه از نظر کشت باکتریال مثبت بودند. اسینتوباکتر 15 مورد (2/ 11 درصد) و پسودوموناس 15 مورد (2/ 11 درصد) از کل کشت های خون مثبت را به خود اختصاص دادند. ایزوله های اسینتوباکتر بیشترین مقاومت را نسبت به آنتی بیوتیک های سفکسیم (7/ 86 درصد)، سفتازیدیم (1 /80 درصد)، سفالوتین (4/ 73 درصد) و کوتریموکسازول (4/ 73 درصد) نشان دادند و ایزوله های پسودوموناس بیش از همه به کوتریموکسازول (7/ 86 درصد)، سفکسیم (7/ 86 درصد)، سفتریاکسون (4/ 73 درصد)، سفالوتین (4/ 73 درصد) و سفتازیدیم (60 درصد) مقاوم بودند.
تیجه گیری: در این تحقیق وجود اسینتوباکتر و پسودوموناس مقاوم به دارو در کشت خون بیماران اثبات گردید. با توجه به افزایش رخداد مقاومت آنتی بیوتیکی برنامه های نظارتی در تعیین نمودن گسترش گونه و الگوهای مقاومت پاتوژن ایجادکننده عفونت خون مهم است زیرا این برنامه ها اساس درمان تجربی مناسب را فراهم می سازند.
کلید واژگان: عفونت خون (BSI), پسودوموناس, اسینتوباکتر, حساسیت آنتی بیوتیکی}BackgroundBloodstream infections (BSIs) are an important cause of morbidity and mortality. The rates of antibiotic resistance among pathogens causing health care-associated infections are increasing, principally among Gram-negative organisms such as Pseudomonas, and Acinetobacter. The goal of this study was isolation Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. from blood specimens in patients hospitalized in Emam Khomeini hospital (Kermanshah) and subsequently determination susceptibility patterns of isolates.Materials And MethodsIn this cross-sectional study 2382 blood samples collected from 2285 hospitalized patients. Blood specimens were inoculated in blood culture tubes media, and subsequently subculture performed on common microbiological media. The isolated Pseudomonas, and Acinetobacter were identified and confirmed by morphological and biochemical laboratory tests. Antimicrobial sensitivity test was performed by using the standard disc diffusion method according to CLSI (2012) recommendations.ResultsDuring present study 2382 blood samples were collected. 133 (5.6%) specimens were positive in bacterial culture. Acinetobacter, and Pseudomonas were isolated from 15 (11.2%) and 15 (11.2%) of positive blood cultures, respectively. The isolated Acinetobacter were most frequent resistant to cefixime (86.7%), ceftazidime (80.1%), cephalothin (73.4%), and co-trimoxazole (73.4%). The Pseudomonas isolates showed a high level of resistance to co-trimoxazole (86.7%), cefixime (86.7%), ceftriaxone (73.4%), cephalothin (73.4%), and ceftazidime (60%).ConclusionIn this research, drug-resistant Pseudomonas and Acinetobacter were identified in patient’s blood cultures. In the face of increasing antibiotic resistance, surveillance programs have become important in determination the species distribution and resistance patterns of pathogens causing bloodstream infection, and thus are providing the basis for appropriate empirical therapy of patients.Keywords: Bloodstream infection (BSI), Pseudomonas, Acinetobacter, antibiotic susceptibility} -
زمینهانتروباکتر آمنیجنوس، باسیلی گرم منفی، فاقد اسپور، متحرک و عضوی از خانواده انتروباکتریاسیه است. این ارگانیسم، پاتوژن فرصت طلب مهمی برای انسان محسوب می گردد و در افراد مختلف به ویژه افراد دارای نقص سیستم ایمنی و نوزادان نارس و در تمام گروه های سنی ایجاد بیماری می نماید. هدف از این مطالعه جداسازی سویه های انتروباکتر آمنیجنوس از شیرهای خشک مصرفی نوزادان بستری در NICU و تعیین الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی این ایزوله هاست.مواد و روش هادر این مطالعه ی مقطعی، تعداد 125 نمونه پودر شیر خشک که جهت تغذیه نوزادان در بخش مراقبت های ویژه نوزادان (NICU) بیمارستان ها استفاده می شد، مورد تحقیق قرار گرفتند. جداسازی و شناسایی میکروارگانیسم بر اساس پروتکل استاندارد اداره غذا و دارو (FDA) انجام شد. تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی سویه های جداشده با روش استاندارد دیسک دیفیوژن بر اساس پروتکل پیشنهادی سازمان استانداردهای بالینی و آزمایشگاهی (CLSI 2011) صورت پذیرفت.یافته هانتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که از 125 نمونه پودر شیر خشک مورد بررسی، 2 نمونه (1/6 درصد) از نظر آلودگی به انتروباکتر آمینجنوس بیوگروپ 1 مثبت بودند. سویه های ایزوله شده به اغلب آنتی بیوتیک های مورد استفاده در بالین حساس بودند، اما همه به آنتی بیوتیک های آمپی سیلین و کاربنی سیلین مقاوم بودند.نتیجه گیریاز آنجایی که در طی مراحل مختلف فرآوری شیر خشک (PIF) آلودگی به انتروباکتریاسیه می تواند رخ دهد، ضروری است که نمونه های شیر خشک نوزادان بر اساس اصول کارخانه و در شرایط آسپتیک تهیه شوند. آلودگی غذاهای نوزادان را فقط می توان از طریق نظارت بر نقاط کنترل اصلی و به کار بردن عملکردهای مناسب در طی فرآوری کاهش داد یا از آن جلوگیری نمود.
کلید واژگان: بخش مراقبت های ویژه نوزادان, شیرهای خشک, انتروباکتر آمنیجنوس بیوگروپ 1, حساسیت آنتی بیوتیکی}BackgroundEnterobacter amnigenus biogroup 1 is a non-sporeforming, rod-shaped, gram-negative bacterium, within the Enterobacteriaceae family. It is opportunistic pathogen and cause disease humans, especially in premature and immunocompromised persons. The aim of this study was to isolation and determination antimicrobial susceptibility pattern of Enterobacter amnigenus biogroup 1 strains isolated from consumed powdered infant formula (PIF) milk in Neonatal Intensive Care Unit (NICU) ward.Materials And MethodsIn this cross-sectional study, total 125 consumed powdered infant formula milk in NICU ward were surveyed. Isolation and Identification of microorganisms was carried out according to FDA method. Antimicrobial susceptibility test was performed by using the standard disc diffusion method based on CLSI (2011) recommendations.ResultsIn this study, Enterobacter amnigenus biogroup 1 was isolated from 2 (1.6%) of 125 powdered infant formula milk samples. The results showed that isolated strains are sensitive to most antibiotics. All isolates were resistant to amoxicillin and carbenicillin.ConclusionContamination of powdered infant formula (PIF) samples could have occurred during different steps. It is imperative to prepare the powdered infant formula milk foods according to the manufacturer’s instruction and in an aseptic condition. Contamination of powdered infant formula only could be reduced or prevented by monitoring the critical control points and taking appropriate action during the processing.Keywords: Neonatal Intensive Care Unit (NICU), Powdered infant formula milk, Enterobacter amnigenus biogroup 1, Antibiotical susceptibility} -
زمینه و هدفسیتروباکتر، یک باسیل گرم منفی بی هوازی اختیاری، متحرک و فاقد اسپور در خانواده انتروباکتریاسه است و در طبیعت، در همه جا حضور دارد. این پاتوژن، فرصت طلب است و طیف وسیعی از عفونت ها را ایجاد می نماید. هدف از انجام این مطالعه، شناسایی سیتروباکتر در نمونه های خون بیماران بستری در بیمارستان امام خمینی کرمانشاه و تعیین پروفایل حساسیت آنتی بیوتیکی ایزوله ها بود.
روش تحقیق: در این مطالعه مقطعی که در طی یک سال- از فروردین تا اسفند 1391 در بیمارستان امام خمینی کرمانشاه انجام شد، تعداد 2285 نمونه خون از بیماران بستری در این بیمارستان، مورد مطالعه قرار گرفت. نمونه های خون بیماران، در درون محیط های مخصوص کشت خون تلقیح شدند و گونه های سیتروباکتر ایزوله شده از نمونه های ارسالی، به کمک آزمایش های ریخت شناسی و بیوشیمیایی مورد شناسایی قرار گرفتند. با استفاده از روش استاندارد دیسک دیفیوژن بر اساس پروتکل سازمان استاندارهای بالینی و آزمایشگاهی (CLSI 2011)، حساسیت دارویی ایزوله ها بررسی شد.یافته هادر طی این مطالعه، 21 مورد (15/8%) سیتروباکتر از 133 نمونه های خون کشت مثبت بیماران بستری، ایزوله گشتند. موثرترین آنتی بیوتیک ها بر ضد ایزوله های سیتروباکتر به ترتیب: ایمی پنم (90/4 درصد) و آمیکاسین (71/5 درصد) بودند. بیشترین مقاومت نسبت به سفالوتین (76/2%)، سیپروفلوکساسین (76/2%)، سفتازیدیم (66/6%) و کوتریموکسازول (62%) مشاهده شد.نتیجه گیریایزوله های سیتروباکتر، مقاومت بالایی به آنتی بیوتیک های بتالاکتام نشان دادند؛ بنابراین ضروری است که این داروها در بیمارستان ها تنها در صورتی که ایزوله ها در محیط آزمایشگاه حساسیت نشان دهند، برای درمان بیماران مورد استفاده قرار گیرند.
کلید واژگان: بیماران بستری, عفونت خون, سیتروباکتر, مقاومت آنتی بیوتیکی}Background And AimCitrobacter is a gram-negative, nonsporeforming, facultative anaerobic and motile bacillus within the family of Enterobacteriaceae and is ubiquitous in nature. This opportunistic pathogen causes a wide spectrum of infections. The aim of the present study was to examine the isolation of Citrobacter spp. from blood specimens in patients hospitalized in Kermanshah Imam Khomeini hospital and to determine the isolates sensitivity to antibiotics.Materials And MethodsThis cross- sectional study was carried out on 2285 blood specimens collected from hospitalized patients between March 2012 and February 2012. In the beginning, the blood samples were inoculated in blood culture tubes media. The Citrobacter spp. isolates were identified and their identification was confirmed by means of morphological and biochemical laboratory tests. Drug sensitivity test was carried out according to CLSI (2011) recommendations through using the standard disc diffusion method.ResultsIn this study Citrobacter spp. were isolated from 21 (15.8%) of 133 culture positive blood specimens collected from the hospitalized patients. The most effective antimicrobial agents against Citrobacter isolates were imipenem (90.4%), and amikacin (71.5%), respectively. The most frequent resistance observed was to cephalothin (76.2%), ciprofloxacin (76.2%), ceftazidime (66.6%) and co-trimoxazole (62%).ConclusionCitrobacter isolates showed high resistance to betalactam antibiotics. Therefore, it is necessary that these drugs should only be administered to patients whose diagnostic isolates reveal sensitivity in vitro.Keywords: Hospitalized patients, Blood infections, Citrobacter spp, Antibiotic resistance} -
زمینه و هدفبه دلیل ظهور سویه های پسودوموناس آئروژینوزا مقاوم به چنددارو، درمان افراد آلوده به این باکتری مشکل است. هدف از این مطالعه الگوی حساسیت میکروبی و اپیدمیولوژی مولکولی پسودوموناس آئروژینوزا جدا شده از بیماران سوختگی بود.روش بررسیاین مطالعه مقطعی بر روی 270 سویه پسودوموناس آئروژینوزا جداشده از زخم بیماران سوختگی انجام گرفت. شناسایی سویه های تولیدکننده آنزیم متالوبتالاکتاماز با استفاده از روش E-test انجام شد. الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی سویه های متالوبتالاکتاماز مثبت به روش دیسک دیفیوژن نسبت به 11 آنتی بیوتیک بررسی شد. ارتباطات ژنیتکی و اپیدمیولوژی سویه ها به وسیله روش پالس فیلد ژل الکتروفورز انجام شد.یافته هاشصت ایزوله (22/2 درصد) به ایمی پنم و مروپنم مقاوم و تولیدکننده آنزیم متالوبتالاکتاماز بودند، که10 الگوی آنتی بیوتیکی در میان آنها مشاهده گردید و به 5 مورد از آنتی بیوتیک های مورد بررسی کاملا مقاوم بودند. میزان حساسیت به سفتازیدیم، آمیکاسین و سیپروفلوکساسین به ترتیب 23/3 درصد، 6/7 درصد و 1/7 درصد بود. بر اساس نتایج پالس فیلد ژل الکتروفورز و تجزیه و تحلیل باندهای به دست آمده از ژنوم پسودوموناس آئروژینوزا، اغلب سویه ها(71/6 درصد) بیش از 80 درصد شباهت نشان دادند.نتیجه گیریهیچ یک از آنتی بیوتیک های مورد آزمایش جهت تجویز مناسب به نظر نمی رسند. پالسوتایپ های حاصل از پالس فیلد ژل الکتروفورز نشان دادند که تیپ های خاصی از پسودوموناس آئروژینوزا در بخش سوختگی بیمارستان شایع هستند و بیماران را درگیر می کنند.
کلید واژگان: بیماران سوختگی, عفونت های بیمارستانی, پسودوموناس آئروژینوزا, آنزیم متالوبتالاکتاماز, پالس فیلد ژل الکتروفورز}Background and AimBecause of emerging multi-drug resistance (MDR) Pseudomonas aeruginosa strains, treatment of burn patients infected by this bacterium is difficult. The aim of this study was to detect antimicrobial profile and molecular epidemiology of metallo-beta-lactamase (MBL) producer strains.MethodsIn this cross-sectional investigation 270 Pseudomonas aeruginosa isolates were collected from the burn patients. Carbapenem sresistance strains were detected by phenotypic E-test method. Susceptibility profiles of metallo-β-lactamase (MβL) enzyme producing isolates of this bacterium to 11 antimicrobial drug were determined by disc diffusion method according Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines. The genetic correlations between isolates were determined by Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) method.ResultsAmong 270 P. aeruginosa isolates, 60 (22.2%) strains showed resistant to meropenem (MEM) and imipenem (IMI) and were considered as metallo-β-lactamase positive. All metallo-β-lactamase positive isolates were resistant to five tested antimcrobial while their sensitivities to the three best effective antibiotics including ciprofloxacin, amikacin and ceftazidime were 1.7%, 6.7 % and 23.3%, respectively. Majority of the isolates (71.6%) showed more than 80% similarity based on the drawn dendrogram.ConclusionOur results showed, the tested antimicrobials are not safe to prescribe for burn patients. According PFGE pulsotypes, a limited number of P.aeruginosa types are common in the hospital burn unit which infect the patients hospitalized in this ward.Keywords: Burn Patients, Drug Resistance, Nosocomial Infections, Pseudomonas aeruginosa, metallo, β lactamase (MBL) Enzyme, Pulsed, Field Gel Electrophoresis (PFGE)}
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.