به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب elham siasi

  • شایسته علی جباری، الهام سیاسی*، رباب رفیعی طباطبایی
    هدف

    سرطان معده دومین علت شایع مرگ ناشی از بدخیمی ها در سرتاسر جهان است. سایتوکاین ها میانجی های پپتیدی هستند که در تنظیم پاسخ های ایمنولوژیکی، التهابی و ترمیمی، در مقابل عوامل مهاجم دخالت می کنند. اینترلوکین ها  سیتوکین هایی هستند که اغلب بر لنفوسیت های دیگر موثر می باشند. اینترلوکین 10 یکی از اینترلوکین های مهم بدن است که در مهار پاسخ های التهابی و ایمنی نقش دارد. پلی مورفیسم های مختلفی در ناحیه پروموتوری ژن اینترلوکین 10 شناسایی شدند که با تغییر در میزان بیان این ژن می توانند سبب تغییر عملکرد آن شوند. در پژوهش حاضر به بررسی ارتباط  پلی مورفیسم  (-1082 G/A) در پروموتر ژن اینترلوکین 10 با سرطان معده پرداخته شد.

    مواد و روش ها

    دو گروه 50 نفری بیمار و50 نفر سالم به عنوان جامعه مورد مطالعه انتخاب شدند و از انان خون گیری شد. پس از استخراج DNA از نمونه ها، به وسیله روش Tetra-ARMS-PCR ژنوتایپ های پلی مورفیسم مورد نظر ارزیابی شدند. سپس نتایج انالیز اماری شد.  

    نتایج

    ژنوتایپینگ نمونه ها نشان داد که فراوانی الل های A و G بترتیب 74% و26% در افراد بیمار و در گروه کنترل 68%  و 32% بود. انالیز اماری رابطه معنا داری بین ژنوتایپ GG در این پلی مورفیسم و سرطان معده را نشان داد (P= 0.013).

    نتیجه گیری

    نتایج این تحقیق نشان داد که می توان از پلی مورفیسم  (-1082 G/A) درژن اینترلوکین 10 بعنوان یک بیو مارکر مولکولی در سرطان معده در جمعیت بیماران ایرانی استفاده نمود.

    کلید واژگان: سرطان معده, ژن اینترلوکین 10, پلی مورفیسم, Tetra Arms-PCR}
    Shayesteh Alijabari, Elham Siasi*, Robab Rafiei Tabatabae
    Aim

    Gastric cancer is the second common cause of cancer death worldwide. Cytokines are mediators of peptides that are involved in the regulation of immunological responses, inflammatory systemic responses, and repair responses to risk factors. Interleukins are cytokines that are produced on other lymphocytes. Interleukin-10, is one of the body's most important interleukin that to inhibit inflammatory and immune responses. Different polymorphisms are found in the promoter region of interleukin 10 gene, which by changing the rate of this gene expression, could been altered its function. In this present research, was studied of relation between (-1082G/A) polymorphism in interleukin 10 gene and gastric cancer.

    Material and methods

    Two groups consist of 50 patients and 50 controls, were selected as the study samples population and were taken blood samples from them. Next DNA extraction from samples, genotyping of this polymorphism was used by Tetra-ARMS-PCR. Then was analyzed the results.

    Results

    Samples genotyping was showed frequency of A and G alleles 74% and 26%, in patient groups and in control groups 68% and 32%, respectively. There was a significant association between GG genotype in this polymorphism and gastric cancer (P=0.013).

    Conclusion

    This study results shown that can be used (-1082G/A) polymorphism in interleukin 10 gene as a molecular biomarker for gastric cancer in Iranian patients’ population.

    Keywords: Gastric Cancer, Interleukin 10 Gene, Polymorphism, Tetra Arms PCR}
  • شکوه وحیدنیا، الهام سیاسی*، امیر مشایخی
    مقدمه
    دیابت یکی از مشکلات در حال رشد برای سلامتی جوامع سراسر دنیا است و ناشی از تعامل عوامل ژنتیکی و محیطی می باشد. یکی از مهم ترین ژن های مرتبط به دیابت نوع 2 ژن FTO می باشد. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط بین پلی مورفیسم های rs6499640 و rs17817449 در ژن FTO با بیماری دیابت نوع 2 در جمعیت شهرستان دزفول بود.مواد و
    روش
    در این مطالعه پژوهشی، نمونه ها شامل 100 فرد نرمال و 100 فرد با بیماری دیابت نوع 2 بودند. پس از خونگیری استخراج DNA انجام شد. کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاه از نانودراپ و الکتروفورز سنجیده شد. جهت تعیین ژنوتیپ افراد از تکنیک های ARMS-PCR و Tetra-ARMS-PCRاستفاده شد. سپس با sequencing نتایج ژنوتایپینگ با PCR تایید شد و داده ها مورد آنالیز آماری قرارگرفت.
    یافته ها
    ارتباط معنی داری در توزیع ژنوتیپ ها بین افراد بیمار و سالم بین پلی مورفیسم های rs6499640 و rs17817449 ژن FTO و افزایش خطر ابتلا به دیابت در جمعیت افراد شهر دزفول مشاهده نشد (به ترتیب P value برابر با 0.728 و 0.085). ولی درمورد پلی مورفیسم rs17817449 بین فراوانی ژنوتیپ GG و ریسک ابتلا به بیماری دیابت نوع دو ارتباط معنی دار مشخص شد.
    نتیجه گیری
    بر اساس نتایج این پژوهش ارتباطی بین حضور پلی مورفیسم های مورد مطالعه و ابتلا به دیابت نوع 2، در جمعیت بیماران دزفول گزارش نشد. برای تایید این نتایج، مطالعات گسترده تری در جمعیت بزرگتر و نمونه های بیشتر توصیه می گردد.
    کلید واژگان: دیابت, ژن, پلیمورفیسم, PC}
    Shokoh Vahidnia, Elham Siasi *, Amir Mashaekhi
    Introduction
    Diabetes is a growing global health problem and caused by the interaction of genetic and environmental factors. One of the most important genes related to type 2 diabetes is the FTO gene. The aim of this study was to investigate the relationship between rs6499640 and rs17817449 polymorphisms in the FTO gene with type 2 diabetes in the population of Dezful city.
    Materials and Methods
    In this research study, samples consist of 100 normal people and 100 people with type 2 diabetes were included in the study. DNA extraction was performed after blood sampling. The quantity and quality of extracted DNA was measured using nanodrop and electrophoresis. ARMS-PCR and Tetra-ARMS-PCR technique was used to determine the genotype of samples. Then was used sequencing for confirming of the genotyping results by PCR and data were analyzed statistically.
    Results
    There was no significant relationship in the distribution of genotypes between rs6499640 and rs17817449 polymorphisms of the FTO gene and the increased risk of diabetes in the population of Dezful city was not shown (P value equal to 0.728 and 0.085, respectively). But in the case of rs17817449 polymorphism, a significant relationship was found between the frequency of GG genotype and the risk of type 2 diabetes.
    Discussion
    According to this study results, association between current studied polymorphisms and causing of type 2 diabetes in the population of Dezful city was not declared. For confirming of these results, more studies in the larger population and more sampling are recommended.
    Keywords: Diabetes, Gene, PCR, Polymorphism}
  • الهام سیاسی*، احمد آل یاسین
    سابقه و هدف

    در روند اسپرماتوژنز پستانداران، پروتیین های پروتامین با اتصال به DNA  سر اسپرم، جایگزین هیستون ها شده و سبب بلوغ اسپرم می شوند. تغییر در ژن های کد کننده پروتامین ها منجر به آسیب DNA اسپرم و در نتیجه ایجاد ناباروری در مردان می گردد. بنابراین هدف این تحقیق بررسی ارتباط دو پلی مورفیسم rs737008 و rs4780356  در دو ژن کد کننده پروتین پروتامین (به ترتیبPRM1 و  PRM2)، با ایجاد ازواسپرمی و الیگواسپرمی در مردان نابارور ادیوپاتیک ایرانی بود.                                                                               

    مواد و روش ها

    از نمونه خون 96 مرد نابارور ادیوپاتیک که ازواسپرم و اولیگو اسپرم بودند و 100 نفر گروه کنترل، استخراج DNA انجام گرفت. حضور دو پلی مورفیسم مورد مطالعه با روش PCR-RFLP بررسی شد .سپس نتایج با روش تعیین توالی تایید شدند.

    یافته ها

    فراوانی الل موتان A از پلی مورفیسم rs737008 در ژن PRM1 در مقایسه بین گروه بیمار با  گروه کنترل متفاوت بود ولی با آنالیز آماری اختلاف معنی دار بین حضور این پلی مورفیسم بین گروه بیمار و کنترل مشاهده نشد (05/0 <P).  با ژنوتایپینگ حضور پلی مورفیسم rs4780356 در ژن PRM2 ، در هیچ یک از گروه بیمار و کنترل مشاهده نشد.

    نتیجه گیری

    یافته های این تحقیق مشخص نمود که ارتباطی بین حضور دو پلی مورفیسم rs737008 در ژن PRM1 و rs4780356 در ژن PRM2 با ایجاد ازواسپرمی و اولیگواسپرمی و در نتیجه ناباروری ادیوپاتیک جمعیت مردان ایرانی، وجود ندارد. مطالعات بیشتر نیاز است تا نقش این دو پلی مورفیسم با  ایجاد ناباروری ادیوپاتیک در مردان ایرانی مشخص گردد.

    کلید واژگان: Iau Science. ناباروری مردان, پلی مورفیسم, ژن های PRM1 و PRM2, PCR-RFLP}
    Elham Siasi*, Ahmad Aleyasin
    Aim and Background

    Histones are replaced by protamines to package sperm head DNA during mammalian spermatogenesis. Protamine genes variation cause sperm DNA damage and is affect infertility in men. Therefore, this study aim was investigation on association of two rs737008 in PRM1 gene and rs4780356 in PRM2 gene polymorphisms with azoospermia and oligospermia in Iranian idiopathic infertile men.

    Material and Methods

    DNA extraction from blood samples of 96 idiopathic infertile men with azoospermia and oligospermia and 100 normal control men. Prevalance of two studied polymorphisms was identified by restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Then results were confirmed with sequencing.

    Results

    A mutant allele frequency of rs737008 in PRM1 gene polymorphism was difference in patient and control groups but statistical analysis showed no significant association between this polymorphism prevalance among case and control groups (P>0.05). By genotyping shown no existent rs4780356 in PRM2 gene polymorphism in anyone of case and control groups.

    Conclusion

    This study finding indicated there was not association with prevalence of two rs737008 in PRM1 gene and rs4780356 in PRM2 gene polymorphisms with oligospermia and azospermia and idiopatic male infertility in Iranian population. More studies need to demonstrate the role of these two polymorphisms with idiopathic infertility in Iranian men.

    Keywords: Male infertility, SNP, PRM1, PRM2 genes, PCR-RFLP, Iau Science}
  • الهام سیاسی*، احمد ال یاسین، جواد مولا
    مقدمه

    میزان شیوع ناباروری در مردان 15- 10درصد است و برای حدود 50% موارد ناباروری مردان نمی توان علت خاصی یافت. این وضعیت به عنوان ناباروری ایدیوپاتیک نامیده می شود و یکی از علل ناباروری ادیوپاتیک در مردان عوامل ژنتیکی می باشد. بنابراین هدف این تحقیق بررسی ارتباط بین دو پلی مورفیسم T886C در ژن TAS2R38 و C109869T در ژن SLC6A14 با ناباروری ادیوپاتیک مردان در جمعیتی از بیماران ایرانی بود.

    مواد و روش ها

    در این تحقیق از 200 نمونه خون، شامل گروه بیمار که 100 مرد با نابابروری ادیوپاتیک (الیگواسپرم و ازواسپرم) و 100 نفر گروه کنترل بودند استخراج DNA، انجام گرفت. ژنوتایپینگ دو پلی مورفیسم مورد مطالعه، با استفاده از روش های مولکولی HRM-PCR Corbett ، PCR-RFLP و Sequencing انجام گرفت، سپس نتایج انالیز اماری شد.

    نتایج

    برای پلی مورفیسم T886C در ژن TAS2R38 تفاوت معنی دار بین گروه بیماران و گروه کنترل مشاهده نشد (P=0.9) و نتایج نشان داد که بین این پلی مورفیسم با جمعیت مردان نابارور ایرانی ارتباطی وجود ندارد. فراوانی پلی مورفیسم C109869T در ژن SLC6A14 دارای تفاوت معنی دار بین گروه بیمار و کنترل بود (P=0.04) و با ناباروری آدیوپاتیک در جمعیت مردان ایرانی مورد مطالعه ارتباط معنی دار نشان داد.

    بحث: 

    بنابر نتایج این مطالعه، پلی مورفیسم C109869Tدر ژن SLC6A14 در ایجاد ناباروری آدیوپاتیک در جمعیت مردان ایرانی موثر است و می تواند با ایجاد اولیگواسپرمی و آزواسپرمی، سبب ناباروری در مردان ایرانی گردد. برای تایید نتایج مطالعات در نمونه های بیشتر توصیه می گردد.

    کلید واژگان: PCR-RFLP, Sequencing, پلی مورفیسم, ناباروری ادیوپاتیک مردان, HRM-PCR Corbett}
    Elham Siasi*, Ahmad Aleyasin, Javad Mowla
    Objective

    Frequency of male infertility is 10-15% and there is not definite reason in 50% of infertility in men. This form of infertility is named idiopathic infertility and genetic factors are one of male infertility causes. Therefore, aim of this study was investigation on association between T886C polymorphism in TAS2R38 gene and C109869T polymorphism in SLC6A14 gene with Iranian idiopathic infertile male.

    Materials and Methods

    For this study. DNA was extracted from 200 blood samples consist of 100 men with idiopathic infertility (oligospermic and azoospermia) and 100 fertile men as control groups. Genotyping of two studied polymorphisms were performed by using of molecular methods, HRM-PCR Corbett, PCR-RFLP and Sequencing, then results were statistical analyzed.

    Results

    For T886C polymorphism in TAS2R38 gene statistical analysis showed no significant difference between patient and control groups (P=0.9) and results shown was not association between this polymorphism and idiopathic male infertility in Iranian population. Frequency of C109869T polymorphism in SLC6A14 gene was different in infertile patients and control groups (P=0.04) and is indicated significant relationship with idiopathic male infertility in studied Iranian men population.

    Conclusion

    According to this research results, The C109869T polymorphism in SLC6A14 gene is actual in affected of idiopathic infertility in Iranian men population and could cause oligospermia and azoospermia and created infertility in Iranian male. For confirming these results is recommended study on more samples.

    Keywords: PCR-RFLP, Sequencing, Idiopathic Male Infertility, Polymorphism, HRM-PCR Corbett}
  • زهرا معین آرا، الهام سیاسی*، رباب طباطبایی
    زمینه و هدف

    بررسی علل ایجاد کننده بیماری آلزایمر هنوز ناشناخته است. عوامل ژنتیکی و محیطی می توانند در ابتلا به بیماری آلزایمر موثر باشند. در تحقیقات اخیر، یکی از ژن ها و پلی مورفیسم های آن، که مرتبط با ایجاد آلزایمر شناخته شده‫اند، ژن شارپین می باشد. هدف از این مطالعه بررسی حضور پلی مورفیسم rs34674752 در ژن شارپین و ارتباط آن با بیماری آلزایمر در جمعیتی از بیماران ایرانی بود.

    روش کار

    این مطالعه بر روی 50 فرد مبتلا به بیماری آلزایمر و 50 فرد سالم انجام شد. پس از خون‫گیری از نمونه ها و استخراجDNA ، ژنوتایپینگ با استفاده از روش Tetra ARMS PCR انجام شد. سپس داده ها مورد آنالیز آماری قرار گرفتند.

    یافته ها

    نتایج نشان داد که فراوانی ژنوتیپ های GG، GT و TT از پلی مورفیسمrs34674752 به ترتیب در گروه کنترل و بیمار، 100، صفر و صفر درصد بود. تعادل هاردی واینبرگ هم در هر دو گروه کنترل و بیمار برقرار بود. همچنین ارتباطی بین ژنوتیپ افراد با احتمال ابتلا به بیماری آلزایمر مشاهده نشد و از عوامل دموگرافیک تنها رابطه بین گروه سنی و ابتلا به بیماری معنی دار بود (0.029=p).

    نتیجه گیری

    بر اساس نتایج این تحقیق، بین حضور پلی مورفیسمrs34674752 در ژن شارپین و بیماری آلزایمر در جمعیت ایرانی مورد مطالعه رابطه معنی داری مشاهده نشد. برای تایید نتایج این تحقیق نیاز به بررسی جمعیت هایی با قومیت متفاوت و تعداد نمونه بیشتر توصیه می‫گردد

    کلید واژگان: پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی, بیماری آلزایمر, واکنش زنجیره ای پلیمراز}
    Zahra Moeinara, Elham Siasi *, Robab Tabatabaeii

    Background &

    objective

    The causes of Alzheimer's disease are currently unknown. Genetic and environmental factors can be effective in creating of this disease. In recent studies, one of the genes and its polymorphisms that was known to affect Alzheimer is SHARPIN. This study aimed to investigate the presence of rs34674752 polymorphism in the SHARPIN gene and its relation with Alzheimer's disease in the population of Iranian patients.

    Methods

    This study was performed on 50 people with Alzheimer's disease and 50 healthy controls. After blood sampling and DNA extraction, genotyping was done by Tetra ARMS PCR. The data was statistically analyzed.

    Results

    Results showed that the frequency of GG, GT and TT genotypes of rs34674752 polymorphism in control and patient groups was 100%, 0% and 0%, respectively. Both control and patient groups were in Hardy Weinberg equilibrium. There was no significant correlation between people's genotype and the possibility of Alzheimer's disease, and among the demographic factors, only the relationship between age group and the disease was significant (p=0.029).

    Conclusion

    According to the results of this study, there was no statistically significant association between the rs34674752 polymorphism in the SHARPIN gene and Alzheimer's disease in the studied Iranian population. To confirm the present study results, the investigation of populations with different societies and a larger quantity of samples are recommended.

    Keywords: Single Nucleotide Polymorphism, Alzheimer's Disease, Polymerase Chain Reaction}
  • Zahra Kalantari, Elham Siasi *, Kumarss Amini

    Alzheimer's disease is the most common cause of dementia in the elderly. One of the polymorphisms in Alzheimer's disease is rs7920721 in the ECHDC3 gene, which has not been studied in the population of Iranian Alzheimer's patients and was evaluated in the present study. In 2021, 100 patients with Alzheimer's disease and 100 healthy controls performed the current case-control analysis. Following blood sampling and DNA extraction, rs7920721 polymorphism was examined using Tetra ARMS PCR. The frequency of AA, AG and GG genotypes in rs7920721 in the control group was 89, 10, and 1%, respectively; in people with Alzheimer's disease, they were 73, 23, and 4%, respectively (P = 0.014). The frequency of A and G alleles in the control group was 94% and 6%, respectively, and in people with Alzheimer's disease, they were 84.5% and 15.5%, respectively (P = 0.046). The value (OR = 2.874) (CI 95% = 1.43-5.77) indicated an increased probability of disease in the presence of polymorphism. Both the case and control populations were also in the Hardy-Weinberg equilibrium. The results of the present study showed that the presence of the G allele in rs7920721 of the ECHDC3 gene could be associated with an increased risk of Alzheimer's disease in the Iranian population. As a result, this polymorphism can be introduced as a potential biomarker for Alzheimer's disease.

    Keywords: Alzheimer's disease, Single nucleotide polymorphism, ECHDC3 gene, rs7920721}
  • مقدمه

    تخمین زده می شود که 5-1% زوجین از سقط مکرر رنج می برند. تحقیقات اخیر تاثیر پلی مورفیسم های ژنی را در سقط مکرر را نشان داده است.

    هدف

    هدف از این مطالعه، ارزیابی تاثیر سه پلی مورفیسم ژنی (rs1048943 از ژن CYP1A1، rs28371725 از ژن CYP2D6 و rs7830 از ژن NOS3) در سقط مکرر است. به منظور بررسی ارتباط این پلی مورفیسم ها با بیماری و در صورت امکان، استفاده از آنها به عنوان فاکتورهای غربال گری می باشد.

    مواد و روش ها

    نمونه های خون مورد از 136 زن دارای حداقل دو سقط مکرر و نمونه های خون کنترل از 136 زن بدون سابقه سقط و حداقل یک بارداری موفق از جمعیت ایرانی-آذری جمع آوری گشت. این مطالعه بین سال های 2020-2018 انجام گرفت. به منظور ژنوتایپینگ هر یک از این پلی مورفیسم ها در هریک از نمونه های DNA ژنومی استخراج شده، از روش ARMS-PCR استفاده شد. متعاقب این مرحله، بررسی های آماری جهت حصول نتیجه ی ارتباط یا عدم ارتباط پلی مورفیسم های مذکور با سقط مکرر انجام گرفت.

    نتایج

    از بین این سه پلی مورفیسم، فقط rs1048943 از ژن CYP1A1 ارتباط معنی داری با سقط مکرر در زنان ایرانی-آذری نشان داد.

    نتیجه گیری

    مطالعه ما پیشنهاد می کند که پلی مورفیسم rs1048943 از ژن CYP1A1 می تواند با ریسک پایین ابتلا به بیماری در ارتباط باشد. مطالعات دیگر در جمعیت های دیگر و یا در همین جمعیت با اندازه نمونه بزرگتر (مورد و شاهد) و همچنین آنالیزهای ژنومیکس عملکردی یا مطالعات اپی ژنتیکی به منظور تایید نتایج ما مورد نیاز است.

    کلید واژگان: سقط مکرر, پلی مورفیسم, CYP1A1, CYP2D6, NOS3}
    Mahsa Yousefian, Abdolhamid Angaji*, Elham Siasi, Seyed Ali Rahmani, Shamsi Abbasalizadeh Khiaban
    Background

    It is estimated that 1-5% of couples suffer from recurrent pregnancy loss (RPL). Recent studies have shown the effects of gene polymorphisms in RPL.

    Objective

    The aim of this study was to evaluate 3 gene polymorphisms including rs1048943 of CYP1A1, rs28371725 of CYP2D6, and rs7830 of NOS3 in idiopathic RPL to identify their association with RPL.

    Materials and Methods

    Blood samples were collected from 136 women with at least 2 consecutive idiopathic miscarriages (case group) and 136 women with no history of miscarriage and at least one successful pregnancy (control group) from the Iranian Azeri population. This study was carried out between April 2018-April 2020. Amplification-refractory mutation system polymerase chain reaction was used for the rs7830, rs1048943 and rs28371725 polymorphisms in order to genotype each extracted genomic DNA sample. After that, Chi-square, Fisher’s exact test and logistic regression were used to investigate whether each of these polymorphisms is associated with RPL.

    Results

    Among these polymorphisms, only rs1048943 of CYP1A1 showed a statistically significant association with RPL in the Iranian Azeri women studied.

    Conclusion

    Our results suggest that CYP1A1 gene polymorphisms might be associated with a reduced risk of RPL. Further studies in other populations and in the same population with a larger sample size, as well as functional genomics analyses such as gene expression analyses or epigenetic studies are required to validate our results.

    Keywords: Recurrent pregnancy loss, Polymorphism, CYP1A1, CYP2D6, NOS3}
  • الهام سیاسی*، الهه منیری، سهیلا عبدی
    مقدمه

    مطالعات بیوالکترومغناطیس و نقش تابش های میدان های الکترومغناطیس با فرکانس بسیار پایین از عوامل محیطی مهم در بروز و درمان سرطان ها می باشد. در این مطالعه تغییرات بیان miR-21 و miR-29 در رده سلولی سرطان معده تحت تاثیر تابش میدان های الکترومغناطیس با شدت های 25/0 و 5/2 میلی تسلا در دو نوع تابش پیوسته و ناپیوسته بررسی شد.

    مواد و روش ها

    رده سلولی سرطانی معده، تحت تابش میدان الکترومغناطیسی در دو شدت میدان 25/0 و 5/2 میلی تسلا و دو نوع تابش پیوسته و ناپیوسته قرار گرفتند و با یک گروه کنترل که تحت تابش قرار نداشت، مقایسه شدند. پس از استخراج RNA از سلول ها، سنتز cDNA انجام شد و با استفاده از روش Real Time PCR تغییرات بیان دو microRNA بررسی و نتایج انالیز اماری شدند.

    نتایج

    بر اساس نتایج میزان بقای سلول ها در تابش میدان های الکترومغناطیسی نسبت به کنترل کاهش معنی داری نشان داد. افزایش میزان بیان miR-21 و miR-29 در هر دو میدان الکترومغناطیسی با افزایش شدت میدان معنی دار بود. همچنین با افزایش بیان miR-21 و miR-29 در هر دو نوع تابش میزان زنده ماندن سلول ها کاهش معناداری نشان داد.

    بحث

     نتایج مشخص نمود تابش میدان های الکترومغناطیس با فرکانس بسیار پایین در رده سلولی سرطان معده سبب افزایش بیان miR-21 و miR-29 شده که تایید تحقیقات بیشتر می تواند ان را بعنوان بیومارکر مولکولی برای سرطان معده مطرح نماید.

    کلید واژگان: سرطان معده, تابش میدان های الکترومغناطیس, miR-21, miR-29, رده سلولی سرطان معده}
    Elham Siasi *, Elahe Moniri, Soheila Abdi
    Introduction

    Bio electromagnetic studies, and the role of electromagnetic field radiation with very low frequency is the important environmental factors associated with the beginning and treatment of cancers. In this study, the variation of miR-21 and miR-29 expression in the gastric cancer cell line was investigated when was exposed under the influence of electromagnetic fields with 0.25 and 2.5 ml Tesla strength, in two type of continuous and discontinues radiation.

    Materials and Methods

    Gastric cancer cell line culture, was exposed to the electromagnetic radiation system including 0.25 and 2.5 ml Tesla field strength and in continuous and discontinues radiation, and was compared with a non-radiation control group. After RNA extraction from cells, using the cDNA synthesis and by Real Time PCR variations of two microRNAs expression was explored and results was statistical analyzed.

    Results

    According the results, cell viability percent in electromagnetic field radiation compare to the control group, was showed significant decrease. Eexpression of miR-21 and miR-29 was showed significant increase due to increase the electromagnetic field radiation strength. As also, nearby over expression of miR-21 and miR-29 in two type radiation, cell viability percent was shown significant decline.

    Conclusion

    Finding demonstrated radiation with very low frequency electromagnetic field in the gastric cancer cell line has led to over expression of the miR-21 and miR-29, which confirmation beside future studies, it's could be proposed as molecular biomarker for gastric cancer.

    Keywords: gastric cancer, Electromagnetic field radiation, miR-21, miR-29, Gastric Cancer cell line}
  • Maryam Mollaei, Mehrdad Hashemi *, Elham Siasi, Sayeh Jafari Marndi, Malihe Entezari
    Background

    Temperature changes cause testicular dysfunction. It has been observed that testicular hyperthermia leads to oxidative stress and as a result a severe reduction in testicular parameters. Causes a severe reduction in Sperm parameters to become oxidative due to stress. Recently, natural plant materials and magnetic nanoparticles have been considered. In the internal mitochondrial apoptosis pathway, gen bcl2 is a target of miR455.

    Objectives

    The present study aimed to investigate the effects of titanium dioxide nanoparticles and improve their impacts by using the antioxidant curcumin on sperm parameters by investigating changes in expression miR455 in response to temperature-induced stress in scrotal hyperthermia rats.

    Methods

    After preparation, the rats were placed in a hot water bath at 43°C. for 30 minutes for six consecutive days. The rats were then divided into eight groups. We used TiO2 nanoparticles at a concentration of 0.03 mg/kg of body weight and curcumin at a concentration of 0.02 mg/kg of body weight. After killing the animals, such parameters of sperm as viability, concentration, motility, and morphology of spermatozoa were studied. RNA extraction and cDNA synthesis were performed using appropriate kits. A gene primer was designed and RT-PCR was used to assess gene expression. The t-test and ANOVA were used to examine differences between different groups. Data analysis was performed using Prism8 software and SPSS version 26.

    Results

    The results showed that miR455 expression was lower in the treatment groups and was associated with curcumin (P < 0.05). A positive effect of curcumin on improving sperm parameters in rats with scrotum hyperthermia and a negative and toxic effect of TiO2 nanoparticles were shown. However, a significant improvement in sperm parameters was observed when rats were given TiO2 nanoparticles along with curcumin.

    Conclusions

    The changes in the expression miR455, shown in curcumin have controlled the damage to TiO2 nanoparticles. It seems that miRNA455 can be used as a marker to predict sperm health status. So Curcumin can play a protective role in reducing the toxic effects of testicular hyperthermia as well as titanium dioxide nanoparticles.

    Keywords: Gene Expression miR455, TiO2, Nanoparticle, Curcumin, Rats}
  • الهام سیاسی*، مهکامه سلیمانی، صدیقه مهرابیان
    مقدمه

    بیان ژن ها را miRNAها، که RNA های کوچک غیر کد کننده هستند، تنظیم می کنند و تغییرات ژنتیکی مانند پلی مورفیسم های ژن های miRNAها، در پیش بینی استعداد ابتلا به سرطان ها به عنوان نشانگرهای زیستی مولکولی، هستند. یکی از miRNAهایی که با ژن های BRCA1/BRCA2 در ارتباط می باشد، miR146a است و در سرطان های زیادی از جمله سرطان سینه دخالت دارد. هدف از این تحقیق بررسی ارتباط بین حضور پلی مورفیسم rs2910164در ژن miR146a و سرطان سینه در جمعیتی از زنان ایرانی بود.

    مواد و روش ها

    این پژوهش بر روی 50 نمونه خون بیمار و 50 نمونه خون افراد کنترل انجام شد. از نمونه ها استخراج DNA انجام شد. سپس برای ژنوتایپینگ از روش Tetra Arms PCR استفاده گردید و نتایج آنالیز آماری شدند.نتایج - درصد فراوانی ژنوتیپ های GG، GC و CC به ترتیب در افراد سالم 330% ، 66% و 4% و در بیماران 46% ، 52% و 2% بدست آمد. بین فراوانی حضور الل های غالب و مغلوب این پلی مورفیسم بین افراد سالم و بیماران اختلاف معناداری مشاهده نشد (P>0.05).

    بحث

    در نتایج تحقیق حاضر بین فراوانی آلل های G و C در گروه بیمار و کنترل , تفاوت معنی داری مشاهده نشد که می تواند بیانگر عدم وجود ارتباط بین حضور پلی مورفیسم rs2910164در ژن miR146a و سرطان سینه در جمعیت زنان ایرانی مورد مطالعه، باشد. البته برای تایید نتایج این تحقیق به مطالعات بیشتر با افزایش حجم نمونه نیاز است.

    کلید واژگان: سرطان سینه, ژن miR-146, پلی مورفیسم, Tetra-Arms PCR .rs2910164}
    Elham Siasi *, Mahkameh Solimani, Sedigheh Mehrabian
    Introduction

    Gene expression is regulated with miRNAs, that are non-coding small RNA molecules and genetic variations such as miRNA genes SNPs, which are molecular biomarkers in the prediction of cancers risk. One of miRNAs that is associated with BRCA1 / BRCA2 genes, is miR146a and related with many cancers, including breast cancer. This research aim was association study between prevalence of rs2910164 SNP in miR146a gene with breast cancer in Iranian female population.

    Materials and Methods

    This study was performed on 50 patient and 50 control blood samples. DNA was extracted of samples. Then for genotyping was used Tetra Aarms PCR and results was statistically analyzed.Results- Frequency of genotypes for GG, GC and CC in control groups were 30%, 66% and 4%, and for patient groups was 46% , 52% and 2%, respectively. No significant difference was observed between frequency of dominant and recessive allels in control and patients gorups (P > 0.05).

    Conclusion

    In this study results, there was not significant difference between G and C alleles in the control and case groups. Therefore, could be indicated that there was not association between of miR146a gene rs2910164 polymorphism and breast cancer in the studied Iranian females population. So, further studies with larger sample size are required to support finding of this research.

    Keywords: Breast cancer, miR-146 gene, SNP, rs2010164, Tetra-Arms PCR}
  • Maryam Mollaei‚ Mehrdad Hashemi*‚ Elham Siasi‚ Sayeh Jafari Marandi‚ Malihe Entezari
    Background

    Testicular function depends on temperature, and it has been shown that scrotal hyperthermia causes a sharp decrease in sperm parameters due to oxidative stress. In recent years, the use of natural materials from the plant and nanoparticles has attracted much attention. Therefore, the present study aimed to investigate the effect of curcumin and Fe2O3 nanoparticles on sperm parameters in rats.

    Materials and Methods

    After preparing the rats, they were placed in a hot water bath at 43°C for 30 minutes for six consecutive days. The 48 rats were then divided into eight groups. A concentration of 0.03 mg/kg body weight magnetic Fe2O3 nanoparticles and curcumin at the concentration of 0.02 mg/kg body weight were used. After killing animals, the semen parameters such as viability, concentration, motility, and morphology of sperm were studied.

    Results

    Significant differences were observed in all groups of rats in terms of semen parameters (P<0.001). The results showed a positive effect of curcumin on improving semen parameters in scrotal hyperthermia rats and a negative and toxic effect of Fe2O3 magnetic nanoparticles. However, significant improvement in sperm parameters was observed when Fe2O3 magnetic nanoparticles were given to rats along with curcumin.

    Conclusion

    Curcumin has a positive and significant effect on improving sperm parameters in scrotal hyperthermia conditions. Fe2O3 magnetic nanoparticles, if co-administered with curcumin, can significantly improve sperm parameters. In this regard, green synthesis of nanoparticles and concomitant administration of antioxidants such as curcumin in scrotal hyperthermia conditions is recommended.

    Keywords: Sperms, Rats, Fe2O3, Scrotal Hyperthermia}
  • مهسا یوسفیان، سید عبدالحمید انگجی*، الهام سیاسی، سید علی رحمانی، شمسی عباسعلی زاده خیابان
    سابقه و هدف

     دو ژن F2 و PAI-1 از ژن هایی هستند که جهش در آن ها به ایجاد ترومبوفیلی در زنان منجر می شود. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط rs3136520 از ژن F2 و rs6090 از ژن PAI-1 با سندروم سقط مکرر است.

    مواد و روش ها:

     در این مطالعه مورد-شاهدی 120 زن مبتلا به سقط مکرر بدون دلیل و 120 زن بدون سابقه ناباروری و سقط و دارای حداقل یک فرزند سالم که توسط متخصص زنان و زایمان به یک آزمایشگاه ژنتیک پزشکی بخش خصوصی ارجاع داده شده بودند، به عنوان گروه های بیمار و کنترل در مطالعه شرکت داده شدند. پلی مورفیسم های rs3136520 و rs6090 با روش ARMS-PCR بررسی شدند و نتایج حاصل با استفاده از نرم افزار SPSS نسخه 26 و آزمون مربع کا تجزیه وتحلیل شدند. سطح معنی داری 05/0P˂ در نظر گرفته شد.

    یافته ها:

     در مدل multiplicative ارتباط معنی داری بین rs6090 و سقط مکرر با 222/0OR= و
    599/0-082/0CI= 95 درصد مشاهده شد، ولی هیچ ارتباطی بین rs3136520 و سقط مکرر مشاهده نشد (1OR=). بر اساس مدل additive نیز بین rs3136520 و سقط مکرر هیچ ارتباط معنی داری وجود نداشت، اما بین ژنوتیپ AG در rs6090 و سقط مکرر ارتباط معنی دار با 245/0O=Rو901/0-066/0CI= 95 درصد وجود داشت.

    نتیجه گیری:

     بین rs6090 و بروز سقط مکرر ارتباط معنی داری از نوع محافظتی وجود دارد، اما هیچ ارتباط معناداری بین rs3136520 و بروز سقط مکرر وجود ندارد.

    کلید واژگان: پلاسمینوژن نوع 1, پلی مورفیسم, ترومبوفیلی, سقط مکرر, فاکتورهای انعقادی, مهارکننده فعال کننده}
    Mahsa Yousefian, Seyed Abdolhamid Angaji*, Elham Siasi, Seyed Ali Rahmani, Shamci Abbasalizadeh Khiaban
    Background and Objective

    The mutation of F2 and PAI-1 genes can cause thrombophilia in women. The present study aimed to assess the relationship of recurrent pregnancy loss (RPL) with rs3136520 in F2 and rs6090 in PAI-1.

    Materials and Methods

    This case-control study was conducted on 120 women with idiopathic RPL as case group and 120 healthy women without any history of infertility or abortion with at least one healthy child as the control group. These subjects were referred to a private genetic lab by a gynecologist. Both polymorphisms were studied using the amplification-refractory mutation system-polymerase chain reaction approach, and the obtained data were analyzed in SPSS software (version 26) using the chi-squared test (P˂0.05).

    Results

    In the multiplicative model, there was a significant association between rs6090 and RPL (OR=0.222; 95%CI=0.082-0.599); nonetheless,
    no relationship was detected between rs3136520 and RPL (OR=1, 95%CI=0.488-2.049). Moreover, according to additive model, there was no association between rs3136520 and RPL; however, there was a significant relationship between AG genotype in rs6090 and RPL (OR=0.245; 95% CI=0.066-0.901).

    Conclusion

    As evidenced by the obtained results, there was a protective association between rs6090 and RPL; nonetheless, there was no relationship between rs3136520 and RPL.

    Keywords: : Coagulation Factors, Plasminogen Activator Inhibitor 1, Recurrent Abortion, Thrombophilia}
  • مهرداد هاشمی*، فاطمه سادات علوی مقدم، الهام سیاسی
    سابقه و هدف

    سرطان ریه یکی از علل عمده مرگ و میر ناشی از سرطان است. فعال سازی سیگنال هایfgf از جمله fgf-9 در بیماری زایی چندین سرطان، از جمله سرطان ریه نقش دارد. همچنینfgf-9 ممکن است یک شاخص برای پیش آگهی باشد و با میزان بقا در بیماران مبتلا به NSCLC مرتبط است. بنابراین در این تحقیق میزان بیان ژن fgf-9 در سرم افراد مبتلا به سرطان ریه بررسی گردید.

    روش بررسی

    در این تحقیق، 50 نمونه سرم افراد سالم و 50 نمونه سرم افراد مبتلا بهNSCLC از مراجعین به بیمارستان مسیح دانشوری تهران تهیه و توسط پرسشنامه هایی، اطلاعات فردی وکلینیکوپاتولوژیکی افراد مورد مطالعه جمع آوری شد. سپس جداسازی پلاسما، استخراج RNA، سنتز cDNA، طراحی پرایمرها انجام و میزان تغییرات بیان fgf-9 درسرم افراد سالم و مبتلا به سرطان ریه توسط روش Real time PCR مورد ارزیابی قرارگرفت. برای آنالیز نتایج از نرم افزار REST استفاده شد.

    یافته ها

    در این مطالعه در سرم افراد مبتلا به مراحل اول تا سوم متاستاز، بیان ژن fgf-9 اختلاف معنی داری نداشت اما در سرم افراد مبتلا به مرحله چهارم متاستاز، میزان بیان ژن fgf-9 به مقدار 46/4 برابر نسبت به نمونه های نرمال کاهش معنی دار (05/0 <p) داشت.

    نتیجه گیری

    با توجه به نتایج این مطالعه، در صورت تایید این نتایج در نمونه های بیشتر، احتمالا درآینده می توان از بررسی میزان بیان ژن fgf-9 موجود در سرم افراد، برای پیش بینی مرحله متاستاز سرطان ریه استفاده نمود.

    کلید واژگان: سرطان ریه, سرم, متاستاز, ژنfgf-9}
    Mehrdad Hashemi *, Fatemeh Sadat Alavimoghadam, Elham Siasi
    Background

    Lung cancer is one of the major causes of cancer deaths. The activation of fgf signals, including fgf-9, is involved in the pathogenesis of several cancers, including lung cancer. Also, fgf-9 may be an indicator for prognosis and is associated with survival rates in patients with NSCLC. Therefore, in this study, the rate of fgf-9 gene expression in the serum patients with lung cancer was investigated. Analysis

    method

    In this study, 50 serum samples of healthy subjects and 50 serum samples of NSCLC patients were collected from patients referring to Masih Daneshvari Hospital in Tehran and were collected by questionnaires, individual and clinical data of the subjects. Then, Plasma isolation, RNA extraction, cDNA synthesis, primer design were performed and the rate of changes of fgf-9 expression in the serum of healthy and lung cancer patients was evaluated using Real Time PCR. REST software was used to analyze the results.

    Findings

    In this study, the expression of fgf-9 gene was not significantly different in the serum of patients with the first to third stages of metastasis but in the serum of people with stage IV metastasis the level of expression of fgf-9 gene had a significant reduction of 4.46 (p < 0.05) times than normal samples.

    Conclusion

    According to the results of this study, if these results are confirmed in more samples, the level of the fgf-9 gene expression in the serum of individuals can probably be used in the future to predict the stage of metastasis of lung cancer

    Keywords: Lung Cancer, Serum, Metastasis, fgf-9 gene}
  • Elham Siasi, Elaheh Moniri
    Aim

    Extremely low frequency electromagnetic fields affect miRNAs expression in cancer cell. In this study, electromagnetic fields exposed to low frequency were used to compare miR-21 and miR-29 expressions in a gastric cancer cell line.

    Background

    It has been recently suggested that the low frequency electromagnetic fields probably function as a treatment for cancers.

    Methods

    A cultured cell line of gastric cancer was exposed to an electromagnetic radiation system. The cell line was assigned to 4 groups under continuous and discontinuous radiations of 0.25 and 2.5 ml Tesla field strength. Then, the groups were compared with a non-radiation control group. Later, RNA extraction and cDNA synthesis were prepared for miR-21 and miR-29. Real Time PCR method was used to determine how expressions of these two microRNAs differ. Finally, the results were statistically analyzed.

    Results

    The percentage of cell viability in the electromagnetic field radiation experienced a significant decrease compared to that of the control group. In addition, expression of miRNA-21 and miRNA-29 had a significant increase as the strength of the electromagnetic field radiations was on an upward trend. Similarly, the percentage of cell viability saw a significant decline in the upregulation of miRNA-21 and miRNA-29 regardless of radiation types.

    Conclusion

    Findings of this study showed the therapeutic effect of low frequency electromagnetic fields on the gastric cancer cell line. They also indicated that novel biomarkers (miRNA-21 and miRNA-29) could be proposed as potential treatments of gastric cancer, but the results are required to be well established by future studies.

    Keywords: Gastric cancer cell line, Electromagnetic field, miR-21, miR-29, expression}
  • الهام سیاسی*، بهاره آزادی، صدیقه مهرابیان
    سابقه و هدف

    ژن های حدت در سالمونال مربوط به ترکیبی از فاکتورهای پالسمیدی و کروموزومی بوده و یک جایگاه ژنی منفرد مسیول تمام تظاهرات بیولوژیکی در سالمونال نمی باشد. با توجه به اینکه در سروتیپ های مختلف سالمونال از نظر ژنهای حدت تفاوت وجود دارد، هدف از این مطالعه مقایسه حضور ژن های حدت پالسمیدی و کروموزومی)(vir (spv,inv,int)سالمونال اینفنتیس و تیفی موریوم از موارد بالینی در کودکان و بزرگساالن با روش PCR Multiplex بود.

    روش کار

    در این پژوهش 676 نمونه مدفوع از بیماران مراجعه کننده به بیمارستان های امام خمینی و میالد جمع آوری شد و 60 ایزوله به عنوان سالمونال شناسایی شد. پس از انجام سروتایپینگ،30 ایزوله به عنوان سالمونال تیفی موریوم و 30 ایزوله به عنوان سالمونال اینفنتیس تشخیص داده شد. سپس با استفاده از تکنیک PCR Multiplex شیوع ژن های (vir (spv,inv,int مورد بررسی قرار گرفت.

    یافته ها

    تمام سروتیپ های مورد بررسی دارای ژن های invA و Int بودند. 3/93 %سروتیپ های تیفی موریوم و 7/6 %سروتیپ اینفنتیس دارای ژن SpvC بودند. در 3/93 %از سویه های تیفی موریوم و 7/6 %از سویه های اینفنتیس هر سه ژن به صورت همزمان وجود داشت.

    نتیجه گیری

    ژن های حدت، شدت بیماری زایی سویه های سالمونال اینفنتیس و تیفی موریوم را افزایش می دهند، لذا جداسازی و بررسی مولکولی و ژنتیکی این ژن ها می تواند کمک شایانی به شناخت آنزیم های باکتری های نام برده نموده و به ساخت داروهای موثر برای درمان بیماری های مرتبط منجر شود

    کلید واژگان: سالمونال تیفی موریوم, سالمونال اینفنتیس, PCR Multiplex, ژن های spv, inv, i}
    Elham Siasi*, Bahareh Azadi, Sedigheh Mehrabian
    Background and objective

    virulence genes in Salmonella are a combination of plasmid and chromosomal factors and a single genetic position would not be responsible for all biological manifestations in Salmonella. Considering the difference in the serotypes of Salmonella in terms of serious genes, the aim of this study was to compare the presence of plasmid and chromosomal virulence genes (int, inv, spv (vir)) Salmonella typhimurium and Infantis in clinical cases in children and adults by Multiplex PCR.

    Materials and methods

    In this study, 676 stool specimens were collected from patients referring to Imam Khomeini and Milad hospitals and 60 isolates were identified as Salmonella. After serotyping, 30 isolates were recognized as Salmonella infants and 30 isolates as salmonella typhimurium. By using the Multiplex PCR technique, the prevalence of spvC, invA and Int genes was studied.

    Results

    All investigated serotypes had invA and Int genes. 93.3% of typhimurium serotypes and 6/7% of infantis serotypes infants had SpvC gene. In 93/3% of typhimurium serotypes and 6/7% of infantis serotypes all three genes were present simultaneously.

    Conclusion

    virulence genes increase the pathogenicity of typhimurium and Infantis strains. Therefore, the genetic and molecular genetic isolation of these genes can help to identify the bacterial enzymes and to make effective drugs for the treatment of related diseases.

    Keywords: Salmonella typhimurium, Salmonella infections, Multiplex PCR, int, inv, spv genes}
  • الهام سیاسی، احمد ال یاسین*

    سابقه و هدف:

    در روند اسپرماتوژنز پستانداران، پروتئین های پروتامین با اتصال به DNA  سر اسپرم، جایگزین هیستون ها شده و سبب بلوغ اسپرم می شوند. تغییر در ژن های کد کننده پروتامین ها منجر به آسیب DNA اسپرم و در نتیجه ایجاد ناباروری در مردان می گردد. بنابراین هدف این تحقیق بررسی ارتباط دو پلی مورفیسم rs737008 در ژن PRM1 و rs4780356 در ژن PRM2  با ایجاد ازواسپرمی و الیگواسپرمی در مردان نابارور ادیوپاتیک ایرانی بود.

    مواد و روش ها:

     از نمونه خون 96 مرد نابارور ادیوپاتیک که ازواسپرم و اولیگو اسپرم بودند و 100 نفر گروه کنترل، استخراج DNA انجام گرفت. حضور دو پلی مورفیسم مورد مطالعه با روش PCR-RFLP بررسی شد .سپس نتایج با روش Sequencing تایید شدند.

    یافته ها:

    فراوانی الل موتان A از پلی مورفیسم rs737008 در ژن PRM1 در مقایسه بین گروه بیمار با  گروه کنترل متفاوت بود ولی با آنالیز آماری اختلاف معنی دار بین حضور این پلی مورفیسم بین گروه بیمار و کنترل مشاهده نشد (P>0/05[M1] ).  با ژنوتایپینگ حضور پلی مورفیسم rs4780356 در ژن PRM2 ، در هیچ یک از گروه بیمار و کنترل مشاهده نشد.

    نتیجه گیری:

    یافته های این تحقیق مشخص نمود که ارتباطی بین حضور دو پلی مورفیسم rs737008 در ژن PRM1 و rs4780356 در ژن PRM2 با ایجاد ازواسپرمی و اولیگواسپرمی و در نتیجه ناباروری ادیوپاتیک جمعیت مردان ایرانی، وجود ندارد. مطالعات بیشتر نیاز است تا نقش این دو پلی مورفیسم با  ایجاد ناباروری ادیوپاتیک در مردان ایرانی مشخص گردد.

    کلید واژگان: ناباروری مردان, پلی مورفیسم, ژن های PRM1 و, IAU science., PRM2, PCR-RFLP}
    Elham Siasi, Ahmad Aleyasin*
    Aim and Background

    Histones are replaced by protamines to package sperm head DNA during mammalian spermatogenesis. Protamine genes variation cause sperm DNA damage and is affect infertility in men. Therefore this study aim was investigation on association of two rs737008 in PRM1 gene and rs4780356 in PRM2 gene polymorphisms with azoospermia and oligospermia in Iranian idiopathic infertile men.

    Materials and Methods

    DNA extraction from blood samples of 96 idiopathic infertile men with azoospermia and oligospermia and 100 normal control men. Prevalance of two studied polymorphisms was identified by restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Then results were confirmed with sequencing

    Results

    A mutant allele frequency of rs737008 in PRM1 gene polymorphism was difference in patient and control groups but statistical analysis showed no significant association between this polymorphism prevalance among case and control groups (P>0.05). By genotyping shown no existent rs4780356 in PRM2 gene polymorphism in anyone of case and control groups.

    Conclusion

    This study finding indicated there was not association with prevalence of two rs737008 in PRM1 gene and rs4780356 in PRM2 gene polymorphisms with oligospermia and azospermia and idiopatic male infertility in Iranian population. More studies need to demonstrate the role of these two polymorphisms with idiopathic infertility in Iranian men.

    Keywords: Male infertility, SNP, PRM1, PRM2 genes, PCR-RFLP., IAU science}
  • الهام سیاسی، *عاطفه رضایی، جمیله نوروزی
    سابقه و هدف

     باکتری اشریشیاکلی (E. coli) فلور طبیعی در روده طبیعی انسان و حیوانات است. این باکتری یکی از عوامل اصلی عفونت ادراری است. هدف از این مطالعه شناسایی و بررسی حضور هم زمان 3 فاکتور بیماری زای kpsMTII، iucD  و usp در ژنوم سویه های باکتری اشریشیاکلی ایجاد کننده عفونت ادراری بود.

    مواد و روش ها

     60 نمونه باکتری اشریشیاکلی ایجاد کننده عفونت ادراری جمع آوری گردید. باکتری های مورد نظر با تست های بیوشیمیایی و رنگ آمیزی گرم شناسایی شدند. ژنوم باکتری از طریق کیت های جداسازی DNA باکتری گرم منفی جداسازی شد. سپس برای حضور هم زمان 3 عامل بیماری زایی مورد نظر از روش Multiplex-PCR استفاده شد.

    یافته ها

     در این 60 نمونه باکتری اشریشیاکلی جداسازی شده، حضور ژن های بیماری زا، kpsMTII 66/71 درصد، iucD 33/88 درصد، usp 66/36 درصد بود و هم چنین حضور هم زمان 3 فاکتور در 33/28 درصد نمونه ها مشاهده شد. بین فراوانی حضور این سه ژن با ایجاد عفونت ادراری در نمونه های اشریشیاکلی مورد بررسی ارتباط معنی داری وجود داشت (05/0 < Pvalue).

    نتیجه گیری

     بر اساس نتایج این تحقیق، مشابه با مطالعه های پیشین، بین حضور این سه ژن بیماری زا در نمونه های مورد مطالعه از باکتری اشریشیاکلی ایجاد کننده عفونت ادراری می تواند ارتباط معنی دار وجود داشته باشد.

    کلید واژگان: اشریشیاکلی, عفونت ادراری, ژن های بیماری زا, Multiplex PCR}
    Elham Siasi*, Atefeh Rezaei, Jamileh Nowroozi
    Aim and Background

     E. coli is a normal flura in the human and animal intestinal tract. This bacteria is one of the main cause of the urinary tract infection. The aim of this study was identification and simultaneously presence of 3 virulence factors, kpsMTII, iucD, usp in the genome of urinary tract infection E. coli strains.

    Materials and Methods

     60 samples of E. coli, which caused urinary tract infection, were collected. These bacteria were isolated by biochemical tests and gram staining. Then bacteria genome was extracted by gram-negative bacteria DNA extraction kits.  Multiplex-PCR was used for identifying of 3 virulence factors.

    Results

     In these 60 samples of isolated E. coli, the prevalence of virulence genes is as follows: kpsMTII 71.66%, iucD 88.33%, and usp 36.66%. As also, simultaneously presence of 3 virulence factors were observed in 28.33% of samples. There was significant association between prevalence of these three genes and urinary tract infection in studied E. coli isolates (Pvalue<0.05).

    Conclusion

     According to this study results, that was similar to previous researches, could be significant related between prevalence of these three genes in studied urinary tract infection E. coli samples.

    Keywords: E. coli, Urinary tract infection, Virulence genes, Multiplex PCR}
  • فاطمه احمدی، الهام سیاسی*، کیومرث امینی
    زمینه

    ژنوم انتروکوکوس تعداد زیادی توالی تکراری‎ ‎ دارد که به طور تصادفی در طول ‏DNA‏ پراکنده شده اند. در‏ERIC-PCR‏ برای هر سویه یک الگوی مجزا به دست می آید و یک تایپ جداگانه در نظر گرفته می شود. ‏ژنوم پروکاریوتی و یوکاریوتی شامل توالی های تکراری است که نسبتا کوتاه و غیر کد دهنده هستند. آغازگرهای BOX-PCR و ERIC-PCR مکمل این توالی های تکراری هستند و اجازه می دهد تا اتصال اختصاصی انجام گردد و الگوهای منحصر به فرد اثر انگشتی BOX-PCR و ERIC-PCR با قابلیت تولید مجدد فراهم شود.

    روش کار

    در‎ ‎این‎ ‎مطالعه‎ ‎مقطعی-توصیفی، بر‎ ‎اساس‎ ‎مطالعات قبلی‎ ‎و‎ ‎سطح‎ ‎اطمینان‎ ‎‏95%‏‎ ‎با‎ ‎استفاده‎ ‎از‎ ‎فرمولn= z2P(1-P)/d2‎‏ و‎ ‎خطای‎ ‎قابل‎ ‎قبول 05/0، تعداد 60 سویه انتروکوک فکالیس از نمونه های بالینی جمع آوری و در شرایط استریل بر روی محیط KFآگار کشت و مدت 24 ساعت در حرارت 37 درجه سانتی گراد گرم خانه گذاری و به وسیله تست های بیوشیمیایی نمونه های انتروکوک فکالیس تعیین هویت شدند. DNA نمونه ها استخراج و آزمایش BOX-PCR وERIC-PCR صورت گرفت.

    یافته ها

    نتایج آزمون BOX-PCR و آنالیز دندوگرام نشان داد که، تمامی سویه ها در سطح تشابه 58 درصد به 25 کلاستر مجزا قابل تمایز بودند. هم چنین نتایج آزمون ERIC-PCR نشان داد که تمامی سویه ها در سطح تشابه 58 درصد به 15 کلاستر مجزا تفکیک شدند.

    نتیجه گیری

    انگشت نگاری مولکولی توسط روش BOX-PCR دارای قدرت تفریق و تمایز بسیار مناسب تری نسبت به ERIC-PCR، جهت تایپینگ جدایه های باکتری ها می باشد و دارای کاربرد فراوان در مطالعات اپیدمیولوژی و ردیابی منبع عفونت و تاکسونومی هستند.

    کلید واژگان: انتروکوک فکالیس, BOX-PCR, ERIC-PCR, پلی مورفیسم}
    Fatemeh Ahmadi, Elham Siasi*, Kumarss Amini
    Background

    The genome of Enterococcus has a large number of repetitive sequences that are randomly distributed over DNA. In ERIC-PCR, a separate pattern is obtained for each strain and is considered a separate type. Prokaryotic and eukaryotic genomes include dispersed repeat sequences that are relatively short non-coding, and dispersed in the bacterial genome. BOX-PCR and ERIC-PCR primers are complementary to these repeat sequences and allow for dedicated binding and unique BOX-PCR fingerprint patterns and ERIC-PCR with reproducibility capability.

    Methods

    In this cross-sectional descriptive study, based on previous studies and 95% confidence level using the formula n = z2P (1-P)/d2 and acceptable error 0.05, total of 60 Enterococcal Faecalis strains were cultured from sterile specimens on KF agar medium and incubated at 37°C for 24h and were identified by biochemical tests of suspected Enterococcal Faecalis. DNA samples were extracted and BOX-PCR and ERIC-PCR tests were performed.

    Results

    All strains were distinguished in 25 distinct clusters at the level of similarity of 58%. Also, by analyzing the ERIC-PCR results, all strains were segregated into 15 separate clusters at a similar level of 58%.

    Conclusion

    Molecular fingerprinting with BOX-PCR has a better subtraction and differentiation than ERIC-PCR for typing bacterial isolates and is widely used in epidemiological studies and trace source of infection and taxonomy.

    Keywords: Enterococcus Faecalis, BOX-PCR, ERIC-PCR, Polymorphism}
  • الهام سیاسی*، بهاره قانع، فاطمه اشرفی
    مقدمه
    ژن TOX3نقش مهمی در خطر بروز سرطان سینه در زنان دارد. پلی مورفیسم هایی در این ژن شناسایی شده اند که می توانند با ایجاد سرطان سینه مرتبط باشند. هدف این مطالعه بررسی ارتباط سرطان سینه و پلی مورفیسم rs3803662 از ژن TOX3 در جمعیت زنان ایرانی با روش Tetra Arms PCR بود.
    مواد و روش ها
    نمونه گیری از خون 50 نفر فرد سالم و 50 نفر بیمار مبتلا به سرطان سینه انجام شد. پس از استخراج ژنوم از نمونه ها فراوانی این پلی مورفیسم در ژن TOX3 با روش Tetra Arms PCR بررسی شد.
    نتایج
    فراوانی ژنوتیپ های TT، TC و CC به ترتیب در افراد سالم 10% ، 88% و 2% و در بیماران 6% ، 50% و 44% بدست آمد. بین فراوانی حضور ژنوتیپ هموزیگوت مغلوب CC از پلی مورفیسم rs3803662 در ژن TOX3 بین افراد سالم و مبتلا به سرطان سینه اختلاف معنادار مشاهده شد (P<0.05). بحث: تحقیق حاضر برای اولین بار به بررسی ارتباط خطر ابتلا به سرطان پستان و حضور پلی مورفیسم rs3803662 از ژن TOX3 در جامعه زنان ایرانی انجام گرفت. نتایج این پژوهش نشان داد که حضور پلی مورفیسم rs3803662 از ژن TOX3 می تواند به عنوان مارکر ژنتیکی، با سرطان سینه در زنان ایرانی مرتبط باشد.
    کلید واژگان: پلی مورفیسم rs3803662, ژن TOX3, سرطان سینه, Tetra Arms PCR}
    Elham Siasi *, Bahare Ghane, Fatemeh Ashrafi
    Objective
    TOX3 gene plays an important role in the risk of breast cancer in females. Polymorphisms were identified in this gene, that can associated with breast cancer. The aim of this study was relation between breast cancer and rs3803662 polymorphism of TOX3 gene in Iranian females by Tetra Arms PCR.
    Materials and Methods
    Blood samples were collected from 50 normal groups and 50 Breast cancer Patients. Then was extracted DNA from samples. Genotype frequency of this polymorphism in TOX3 gene were determined by using Tetra Arms PCR.
    Results
    Genotyp frequency for TT, TC and CC in normal groups was 10%, 88% and 2%, and For patient groups was 6% , 50% and 44%, respectively. Frequency of CC recessive homozygous genotype of rs3803662 polymorphism in TOX3 gene between normal groups and breast cancer patients was statistical significant difference (P < 0.05).
    Conclusion
    This research for first time was studied relation between the risk of breast cancer and presence of rs3803662 polymorphism in TOX3 gene in Iranian females. The results of this study was showed that presence of rs3803662 polymorphism in TOX3 gene, as genetic marker, can associated with breast cancer in Iranian female.
    Keywords: breast cancer, rs3803662 Polymorphism, TOX3 Gene, Tetra Arms PCR}
  • الهام سیاسی، ریحانه هاجری*، فرناز سهراب وند
    سابقه و هدف

    استافیلوکوکوس اورئوس عامل عفونت های مختلفی در انسان است. عفونت باکتریایی دهانه رحم می تواند در تغییر پارامترهای اسپرماتوزوا نقش داشته باشد و ممکن است منجر به ناباروری در زنان شود. هدف این تحقیق بررسی حضور سوپر آنتی ژن های استافیلوکوکوس اورئوس در زنان نابارور با علت ناشناخته بود.

    مواد و روش ها

    صد نمونه واژینال از زنان نابارور بدون علت مشخص جمع آوری شد. نمونه های مثبت استافیلوکوکوس اورئوس با حداقل سه مقاومت آنتی بیوتیکی، به وسیله PCR بررسی شدند. جهت بررسی تاثیر عفونت بر ناباروری، پس از انکوباسیون نمونه های تازه اسپرم با سویه های دارای یکی از ژن های  seg , sei و یا Tsst-1 ، پارامترهای اسپرم اندازه گیری شد.

    یافته ها

    باکتری استافیلوکوکوس اورئوس از 52 نمونه جدا شد. پس از انجام تست آنتی بیوگرام، 19 نمونه استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به سه یا بیش تر آنتی بیوتیک، شناسایی شدند. فراوانی ژن های Tsst-1، sei و seg به ترتیب 3/26%، 1/21% و 5/10% بود. در 11 سویه (9/57%) ، ژن های  seg , sei و یا Tsst-1 حضور داشتند. هم چنین در 5/10٪  نمونه ها، هر دو ژن sei و seg  وجود داشت. یک سویه (3/5%) دارای هر سه ژن  seg , sei و Tsst-1، توانایی اگلوتیناسیون 50٪ اسپرم های تازه را بدون تغییر قابل ملاحظه ای در حرکت و قابلیت زنده ماندن داشت.

    نتیجه گیری

    نتایج نشان داد  استافیلوکوکوس اورئوس عامل عفونت واژ ینال می تواند سبب آسیب به مورفولوژی و تحرک اسپرم شود. در نتیجه، درمان واژینوز باکتریال جهت پیشگیری از ناباروری ها با علل ناشناخته در زوجین نابارور می تواند نقش موثری ایفا نماید.

    کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, سوپر آنتی ژن, ناباروری, PCR}
    Elham Siasi, Reihaneh Hajari*, Farnaz Sohrabvand
    Aim and Background

    Staphylococcus aureus can be caused different infections in human. Bacterial infection of the cervix can be effective in spermatozoid parameters change and may be come  infertility in women. The aim of this study was identification of Staphylococcus aureus super-antigenes from infertile women with unexplained  infertility.

    Materials and Methods

    Hundred vaginal samples were isolated from unexplained infertile women. Positive samples for Staphylococcus aureus with at least three antibiotic resistances were analyzed by PCR. For identification of infection effect on infertility, after incubation of fresh sperm samples ubated with the Staphylococcus aureus consist one of seg, sei or Tsst-1 genes, were measured sperm parameters.

    Results

    Staphylococcus aureus was selected from 52 samples. After antibiogram test, 19 Staphylococcus aureus samples were identified with resistance to three or more antibiotics. Frequency of Tsst-1, sei and seg genes were, (26.3%) ,(21.1%) and (10.5%), respectively. There were in 11 (57.9%) isolates, sei, seg or Tsst-1 genes. As also, 10.5% of isolates had both of seg and sei genes. One strain (5.3%) with seg, sei and Tsst-1 genes, could be agglutinated 50% of fresh sperms without any significant changes on motility and viability.  

    Conclusion

    The results were indicated  Sphylococcus aureus that is caused vaginal infection could be damage the morphology and motility of male spermatozoa. In summary, treatment of bacterial vaginosis could be effective for prevention of idiopathic infertilities in infertile couples rates.

    Keywords: Staphylococcus aureus, Super antigen, infertility, PCR}
  • الهام سیاسی *، محدثه عبدی برزگر، فرناز سهراب وند
    سابقه و هدف

    کاندیدا آلبیکنس مهم ترین دلیل ولوواژینال کاندیدیازیس است و مقاومت به آزول ها با مکانیسم هایی هم چون تغییر در ژنERG11 می تواند در این پاتوژن رخ دهد. هدف از این مطالعه بررسی جهش در ژن ERG11 کاندیدا آلبیکنس مقاوم به دارو در بیماران مبتلا به واژینیت کاندیدیایی و ارتباط آن با ناباروری در زنان ایرانی بود.

    مواد و روش ها

    با نمونه گیری واژینال از تعداد 100 بیمار گونه های کاندیدا البیکانس با استفاده از روش کشت بر روی محیط کروم آگار جداسازی شدند. حساسیت دارویی بر اساس روش استاندارد انتشار دیسک تعیین شد. سپس ژنوم نمونه های مقاوم استخراج شد و با انجام PCR و تعیین توالی جهش در ژن ERG11 مشخص شد. جهت بررسی تغییر خصوصیت های اسپرم و ارتباط با ناباروری، نمونه اسپرم نرمال با کاندیدا آلبیکانس حساس و مقاوم در غلظت و زمان های مختلف مجاورت داده شد.

    یافته ها

    از 100 نمونه بیمار، 40 نمونه کاندیدا آلبیکنس جداسازی شد که 2 مورد مقاوم به فلوکونازول و کتوکونازول بودند. در این 2 مورد جهش ژن ERG11از نوع تبدیلی و افزایشی بود. در غلظت های CFU/ml100000 و 10000 ، مدت زمان 4 ساعت و با 3 بار تکرار، در میزان چسبندگی و تحرک اسپرم ها کاهش معنی داری مشاهده شد (P<0.05).

    نتیجه گیری

    نتایج نشان داد مقاومت به دارو می تواند با جهش در ژن ERG11 در کاندیدا البیکانس افزایش یابد و این عفونت های واژینیت کاندیدیایی می تواند با ایجاد ناباروری در زنان ارتباط داشته باشد.

    کلید واژگان: کاندیدا آلبیکنس, ژن ERG11, ناباروری}
    Elham Siasi *, Mohaddeseh Abdi barzegar, Farnaz Sohrabvand
    Aim and Background

    Candida Albicans is the most important cause of vulvovaginal candidiasis and resistance to azoles can occur via various mechanisms including, change in the ERG11 gene. This study aim was to identification of ERG11 gene mutations in drug resistant Candida albicans isolated from patients with Candida vaginitis and its association with infertility in Iranian women.

    Material and methods

    From 100 patients with vaginitis Candida Albicans species were isolated by using chromogen agar culture . The drug sensitivity was determined with standard protocol, diffusion disc test. Then extraction genome from resistance species and was used PCR and sequencing for investigation of ERG11 gene mutations. For detection of sperm parameters disorders and relation with infertility, normal sperm was placed adjacent to sensitive and resistance Candida Albicans by different concentrations and times.

    Results

    From 100 patients, 40 samples of Candida albicans were isolated that 2 samples were fluconazole and ketoconazole-resistant. ERG11 gene mutations e in 2 samples were, conversion and insertion. In 10000 and 100000 CFU/ml concentrations, 4 hours and with 3 repeated, was observed significant relation to agglutination and reduction in motility of the sperms (P<0.05).

    Conclusion

    This study results showed that antibiotic resistance can be increased in Candida albicans with mutation in the ERG11 gene and this Candida vaginitis infections, can associated with infertility in women.

    Keywords: Candida albicans, ERG11 gene, Infertility}
  • الهام سیاسی*، نجمه حسن پور باغبانچیان، جمیله نوروزی
    سابقه و هدف
    سالمونلا و E.coli از مهم ترین پاتوژنهای مواد غذایی به ویژه گوشت مرغ هستند . تشخیص سریع، اختصاصی همزمان این پاتوژنها با شناسایی ژنهای اختصاصی از اهمیت بالایی برخوردار است. هدف این مطالعه تشخیص همزمان سالمونلا E.coli در گوشت مرغ بر مبنای تکثیر دو ژن inv A و lamB با روش Multiplex PCR بود.
    روش کار
    تعداد 100 نمونه گوشت مرغ جمعآوری شد. نمونه ها با نرمال سالین شسته شدند و بر روی محیط های بیوشیمیایی کشت داده شدند. جدایه های سالمونلا و E.coli خالص سازی شدند و استخراج DNA انجام گرفت. سپس تکثیر همزمان ژن های invA و lamB با واکنش Multiplex PCR انجام شد.
    یافته ها
    از 100 نمونه گوشت مرغ، 9 نمونه و 26 نمونه به ترتیب باکتری سالمونلا و E.coli، با تست های بیوشیمیایی جداسازی شدند. نتایج واکنش Multiplex PCR فراوانی ژن invA را در 9% و ژن lamB را در 26%، همچنین فراوانی هم زمان هر دو ژن را در 1% ، نمونه ها نشان داد.
    نتیجه گیری
    در این مطالعه نتایج واکنش Multiplex PCR که بر اساس ژنهای بیماریزای اختصاصی سالمونلا و E.coli انجام شد نتایج حاصل از روش تست های بیوشیمیایی را تایید کرد. بنابراین مقایسه نتایج نشان داد واکنش Multiplex PCR جهت شناسایی سریع و همزمان پاتوژنهای مواد غذایی از حساسیت بالایی برخوردار است و می تواند به عنوان روشی قابل اعتماد در کنترل آلودگی های مواد غذایی مطرح باشد.
    کلید واژگان: گوشت مرغ, سالمونلا, E, coli, ژن اختصاصی, Multiplex PCR}
    Elham Siasi *¹, Najmeh hassanpourbaghbanchian², Jamileh Nowroozi
    Background and objective
    Salmonella and Escherichia coli are the most common food pathogens bacterial especially in chicken products. Rapidly, specifically and simultaneously detection of the pathogens by identification of special genes, is important. This study aim was identification of both E.coli and Salmonella in chicken products by using multiplex PCR with lamB and invA genes amplification.
    Materials and methods
    100 chicken samples were obtained . Samples were washed by sterile saline water and were cultured in biochemical medium. Salmonella and Escherichia coli strains were purified and DNA extraction was performed. Then amplification of both invA and lamB genes were used by multiplex PCR.
    Results
    From 100 chicken samples, 9 samples and 26 samples were isolated by biochemichal tests, Salmonella and E.coli, respectively. Multiplex PCR results showed ferequency of invA gene was 9% and for lamB gene was 26% , As also, frequency of both genes in samples were 1%.
    Conclusion
    In this study, multiplex PCR results was based on Salmonella and E. coli special virulence genes was comfirmed biochemical tests results. Therefore comparation of results showed Multiplex PCR for rapid and simultaneous detection of food pathogens has high sensitivity and can be a reliable method for controlling of food contamination.
    Keywords: Chicken products, E.coli, Salmonella, Special gene, Multiplex PCR}
  • الهام سیاسی*، مرضیه غلامی، فاطمه اشرفی
    هدف

     در این مطالعه به ارتباط سرطان سینه و پلی‫مورفیسم A/T 251 از ژن اینترلوکین 8، به‏عنوان مارکر ژنتیکی در جمعیت زنان ایرانی با روش Tetra arms-PCR پرداخته شده است.

    مواد و روش‏ها

     در این مطالعه شاهد-موردی، 50 زن مبتلا به سرطان سینه و 50 زن سالم به‏عنوان گروه کنترل انتخاب شدند. بعد از استخراج DNA، تعیین ژنوتیپ‏های پلی‫مورفیسم 251 T/A از ژن IL-8 به‏روش Tetra arms-PCR انجام شد.

    نتایج

     فراوانی ژنوتیپ‏های AA، AT و TT در گروه کنترل به‏ترتیب صفر درصد، 88 درصد و 12 درصد و در گروه بیمار به‏ترتیب 12 درصد، 54 درصد و 34 درصد بود. نتایج تفاوت معنی‏داری بین ژنوتیپ‏های AA، AT و TT در گروه کنترل و بیمار نشان نداد (05/0<p).

    نتیجه گیری

     در تحقیق حاضر بین فراوانی آلل‏های A و  Tدر گروه بیمار و کنترل، تفاوت معنی داری وجود نداشت، بنابراین می‏تواند بیانگر این باشد که بین پلی‫مورفیسم 251 T/A از ژن IL-8 و سرطان سینه در جمعیت زنان ایرانی مورد مطالعه، ارتباطی وجود ندارد.
     

    elham siasi*
    Aim

     In this study, relationship between breast cancer and 251A/T polymorphism of IL-8 gene, as the genetic marker, was investigated in the Iranian females population by Tetra arms-PCR.

    Materials and methods

     In this case-control study, 50 women with breast cancer and 50 healthy women as control group were selected. After extraction of DNA, determination of IL-8 gene 251 A / T polymorphism genotypes was performed by Tetra arms-PCR.

    Results

     In the control group, frequency of AA, AT, and TT genotypes were 0%, 88% and 12%, respectively and them for case group were 12%, 54% and 34%, respectively. Result showed no significant difference between AA, AT and TT genotypes in the control and case groups (P ≤ 0.05).

    Conclusions

     In current research, there was no significant difference between A and T alleles in the control and case groups. Therefore, it indicated that there was not association between IL-8 gene 251 A/T polymorphism and breast cancer in the studied Iranian females population.

  • الهام سیاسی*، فرزانه حسینی، حلیمه بابایی

    سابقه و هدف- ریبوفلاوین یا ویتامین B2 برای انسان ضروری است و نقش مهمی در متابولیسم ماکرمولکول های بدن دارد. انسان قادر به سنتز این ویتامین نبوده و باید آن را از رژیم غذایی دریافت نمایند. مسیر بیوسنتتیکی ریبوفلاوین در باکتری ها مطالعه شده است. هدف این پژوهش جداسازی و شناسایی باسیلوس سوبتی لیس به عنوان باکتری مولد ریبوفلاوین از خاک مناطق مختلف ایران بود.
    مواد و روش ها- نمونه های خاک از مناطق مختلف ایران جمع آوری شد و کشت پورپلیت انجام شد. سپس ایزوله هایی از کشت خالص باکتری ها، با آزمایش های بیوشیمیایی و مورفولوژیکی شناسایی شدند. ژنوم نمونه های باسیلوس سوبتی لیس جداسازی شده استخراج شد و برای حضور ژن ribC، واکنش PCR انجام گرفت.
    یافته ها- نتایج آزمون های بیوشیمیایی و واکنش PCR نشان داد، از 100 نمونه خاک بررسی شده، 19 جدایه باکتری باسیلوس سوبتی لیس دارای ژن ribC با توانایی رشد در محیط فاقد ریبوفلاوین جداسازی شدند.
    نتیجه گیری- باسیلوس سوبتی لیس از خاک به راحتی جداسازی می گردد و ژن ribC در باسیلوس سوبتی لیس می تواند کد کننده ریبوفلاوین باشد. با توجه به این که تنظیم بیوسنتز ریبوفلاوین در باسیلوس سوبتی لیس توسط ناحیه تنظیمی که در بالا دست اپران ژن ribC است صورت می پذیرد، می توان از این باکتری در تهیه ریبوفلاوین مقرون به صرفه که از نظر مسائل محیط زیستی نیز مناسب تر است، استفاده نمود.
    کلید واژگان: ریبوفلاوین, باسیلوس سوبتی لیس, ژن ribC, باکتری های خاک}
    Elham Siasi*, Farzaneh Hossieni, Halime Babaee
      Aim and Background- Riboflavin or vitamin B2 is essential for body and has the significant role in the macromolecules metabolism. Human can not to synthesize vitamin B2 and must be acquire it from food-diet. Riboflavin biosynthetic pathway have been studied in Bacteria. The aim of this study was to isolation and identification of Bacillus subtilis as, riboflavin producing bacteria from different soil of Iran. Materials and Methods- Soil samples from different areas of Iran was collected and was purplated. Then was prepared pure isolated of bacteria and was identified by biochemical and morphological tests. DNA was extracted from isolated of B. subtilis, and using PCR for detection of ribC gene. Results- Biochemical tests and PCR results showed, from 100 soil samples, 19 B. subtilis was isolated that was contained ribC gene and could growth in riboflavin-free medium. Conclusion- B. subtilis was isolated easy from the soil and ribC gene can coded riboflavin in B. subtilis. Riboflavin in B. subtilis was biosynthesed by regulatory region in the up-strand of ribC gene operon, therefore can be produced economic riboflavin from this bacterium that is appropriate for environmental
    Keywords: Riboflavin, B. subtilis, ribC gene, Soil bacteria}
  • Elham Siasi *¹_Ziba Sadat Majid Seyed biglou ² _Farzaneh Hossieni
    Background and objective
    Exfoliative toxin is Staphylococcus aureus various factors that can caused colonization and virulance. The aim of this study was to investigate the presence of several antibiotic resistant genes on exfoliative B-encoding plasmids in S. aureus infected skin specimens.
    Materials and methods
    100 wound samples collected from Tehran Hospitals. Bacteria were identified by standard biochemical and microbiological tests. Antibiogram test was performed for S. aureus isolates. DNA was extracted of resistance S. aureus. Presence of antibiotic resistant etb, aac, and msrA genes were identified by Muliplex-PCR.
    Results
    From 100 samples, 60 samples were S. aureus. Resistance to erythromycin, gentamicin, tobramycin, ciprofloxacin and linzolide was 3 (5%), 1 (2%), 1 (2%), 1 (2%) and 0 (0%) respectively. Frequency of msrA, aac and etb genes were 29 (48.3%), 45 (75%) and 37 (61.7%) respectively. Frequency for simultaneously presence of the etb / aac, etb / msrA, msrA / aac and msrA / aac / etb gene were 28 (46.6%), 22 (36.6%), 22 (36.6%) and 18 (30%) strains. .
    Conclusion
    In this study, etb gene was indicated in most strains. As also, investigation of virulence genes in S. aureus skin infection samples showed frequency of resistance pathogen genes were increased.
    Keywords: Staphylococcus aureus, Plasmid resistance genes, Exfoliative toxin, Skin infection, MultiplexPCR}
نمایش عناوین بیشتر...
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال