به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « انگور » در نشریات گروه « بیوتکنولوژی و ژنتیک گیاهی »

تکرار جستجوی کلیدواژه «انگور» در نشریات گروه «کشاورزی»
  • ولی الله رسولی*

    انگور یکی از محصول های مهم باغی در دنیا و ایران به شمار می رود و از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار است. تعیین سطح تنوع ژنتیکی اولین قدم در اجرای برنامه های به نژادی است. اطلاع از تنوع ژنتیکی علاوه بر ارایه اطلاعاتی در زمینه روابط تکاملی و فیلوژنتیکی، نقشه ژنتیکی، سازگاری های اکولوژیکی و محیطی و در نهایت انتخاب والدین مطلوب در برنامه های اصلاحی، موجب کاهش مدت زمان و هزینه پروژه های اصلاحی خواهد شد. این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 69 رقم و ژنوتیپ های امید بخش انگور روسی به همراه سه رقم انگور تجاری ایرانی با استفاده از 15 نشانگر بین ریزماهواره ای (ISSR) انجام گرفت. فراورده های حاصل از PCR بر روی ژل آگارز 3/1 درصد، الکتروفورز شدند. پس از اختصاص یک و صفر به وجود یا عدم وجود نوار در هر آغازگر برای هر ژنوتیپ، تجزیه خوشه ای به روش UPGMA بر مبنای ضریب تشابه جاکارد انجام گرفت. بیشترین درصد چندشکلی (100 درصد) مربوط به آغازگرهای UBC-823، UBC-825، UBC-841، UBC-846، UBC-855 و UBC-873 و کمترین آن نیز (7/66 درصد) مربوط به آغازگر UBC-817 بود. بیشترین و کمترین میران شاخص محتوای چند شکلی به ترتیب در آغازگرهای UBC-825 (487/0) و UBC-856 (216/0) مشاهده شد. بیشترین و کمترین میران شاخص نشانگر به ترتیب 718/2 و 904/0 به ترتیب مربوط به آغازگرهای UBC-889 و UBC-817 بود. از نظر شاخص EMR (Effective Multiplex Ratio) نیز بیشترین و کمترین مقدار به ترتیب 7 و 33/1 مربوط به آغازگرهایUBC-841 و UBC-817 بود. بیشترین و کمترین مقدار قدرت تفکیک به ترتیب 11/8 و 2 در آغازگرهای UBC-877 و UBC-841 دیده شد. دو آغازگر UBC-815 و UBC-834 نوارهای واضح و قابل امتیازی نداشتند. از 13 آغازگر نشانگر مولکولی ISSR، به طورکلی 73 نوار به دست آمد که 64 نوار چند شکل بودند و درصد چندشکلی کل 1/88% برآورد شد. بیشترین و کمترین تعداد نوارها به ترتیب هشت و دو نوار مربوط به آغازگرهای UBC-826 و UBC-817 بود. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA بر مبنای ضریب تشابه جاکارد منجر به طبقه بندی 72 رقم انگور با مقدار تشابه بین 89/0-12/0 در 7 گروه متفاوت شد. در مطالعه حاضر تنوع بالایی در میان ارقام انگور مورد مطالعه مشاهده شد. این امر ممکن است نشان دهنده متفاوت بودن منشاء جغرافیای ارقام و ژنوتیپ های مورد بررسی باشد.

    کلید واژگان: انگور, تابع تشخیص خطی, تنوع ژنتیکی, چندشکلی ژنتیکی, قرابت ژنتیکی, نشانگر}
    Valiollah Rasoli*

    Grape is one of the most important horticultural products in the world and in Iran and has a high genetic diversity. Determining the level of genetic diversity is the first step in plant breeding programs. Knowledge of genetic diversity, in addition to providing information on evolutionary and phylogenetic relationships, genetic mapping, ecological and environmental adaptations, and ultimately selecting the right parents for breeding programs, will reduce the time and cost of breeding projects. This study was performed to investigate the genetic diversity of 69 cultivars and promising genotypes of Russian grapevines with three Iranian commercial grapevine cultivars using 15 microsatellite markers (ISSR). Polymerase chain reaction (PCR) samples were electrophoresed in 1.3% agarose gel. Cluster analysis with the UPGMA method was used based on the Jaccard coefficient after assigning one and zero to the presence or absence of a band in each primer for each genotype. The highest percentage of polymorphisms (100%) was related to UBC-823, UBC-825, UBC-841, UBC-846, UBC-855, and UBC-873 primers, and the lowest (66.7%) was related to UBC-817 primer. The highest and lowest levels of the polymorphic content index were observed in UBC-825 (0.487) and UBC-856 (0.216) primers, respectively. The highest and lowest levels of marker index were 2.718 and 0.904 related to UBC-889 and UBC-817 primers, respectively. The highest and lowest values of the effective multiplex ratio index were 7 and 1.33 for UBC-841 and UBC-817 primers, respectively. The highest and lowest resolving power were 8.11 and 2 for UBC-877 and UBC-841 primers, respectively. The UBC-815 and UBC-834 primers had no clear and concise bands. Overall, 73 bands were obtained from the 13 primers of the ISSR DNA marker which 64 bands were polymorphic and the total polymorphism was 88.1%. The highest and lowest numbers of bands were eight and two bands for UBC-826 and UBC-817 primers, respectively. The cluster analysis was performed by the UPGMA method based on Jaccard's coefficient of similarity, which led to the classification of 72 grape varieties with a similarity value of 0.12 to 0.89 in seven different groups. In the present study, high diversity was observed among the studied grapevine cultivars. This indicates the different geographical origins of the cultivars and genotypes under study.

    Keywords: Vine, Genetic polymorphism, Genetic relation, Marker, Genetic diversity, Grapes, Linear discriminant}
  • بهاره قربانی*، رقیه نجف زاده

    تنش سرما ازجمله تنش های ناگهانی بوده و خسارات زیادی بر محصولات کشاورزی وارد می آورد. گیاهان با وجود دارا بودن مکانیسم های تحمل تنش سرما باز قادر نیستند به میزان سرعت توسعه تنش در منطقه عمل نمایند. . کاربرد ترکیبات هورمونی و شبه هورمونی می تواند تاحدودی از خسارات ناشی از سرما بکاهد، به این منظور عملکرد گاما آمینوبوتیریک اسید (GABA) بر روی خصوصیات بیوشیمیایی و بیان ژن های متحمل به سرما در نهال انگور مورد بررسی قرار گرفت. در این پژوهش برای کاهش تلفات تنش سرما از اسپری برگی GABA در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی در سه تکرار و در 3 غلظت (صفر (شاهد)، 20،10 میلی مولار) بر روی قلمه های یکساله انگور، رقم ریش بابا (متحمل) و رقم یاقوتی (حساس) استفاده گردید، قلمه های تیمار شده به گروس چنبر با دمای 4 درجه سانتی گراد منتقل و پس از تحمل دوره سرما 10ساعته در پنج مرحله سرمادهی (صفر (شاهد)، 2، 4، 8 و 10 ساعت) نمونه برداری صورت پذیرفت و در آزمایش اول شاخص های بیوشیمیایی از قبیل محتوای آنتی اکسیدانی کل (DPPH)، فنل کل و فعالیت آنزیم سوپراکسیددسموتاز مورد بررسی قرار گرفت، درآزمایش دوم نمونه های تیمار شده GABA با غلظت20 میلی مولار در 8 و10 ساعت بعد از اعمال تنش در مقایسه با سایر تیمارها در هر دو رقم بیشترین اثر مثبت را به جهت مقابله با اثرات سوءسرما از خود نشان دادند لذا وارد بررسی مولکولی شده و بدین ترتیب بیان ژن های CBF1،CBF2، CBF3و CBF4دخیل در سرما با روش Real Time-PCR مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد GABA سبب افزایش سیگنالینگ گیاه و تولید ترکیبات آنتی اکسیدانی می شود و قادر است رادیکال های آزاد تولید شده طی تنش را مهار نماید. همچنین موجب تقویت سیگنالینگ درون گیاه شده و سطح بیان ژن مقاومت در انگور 8 و10 ساعت بعد از اعمال تنش سرما بالاتر برده است. عامل رونویسی  CBF2بین ارقام تیمار شده با GABA در غلظت20 میلی مولار بالاترین سطح بیان را دارا می باشد.

    کلید واژگان: آنتی اکسیدان, اتاقک رشد, انگور, گاما آمینوبوتیریک اسید, CBF}
    Bahareh Ghorbani*, Roghayeh Najafzadeh

    Cold stress is one of the sudden stresses and causes a lot of damage to agricultural products. Plants, despite having open cold stress tolerance mechanisms, are not able to act at the rate of stress development in the region. . The use of hormonal and quasi-hormonal compounds can reduce the damage caused by cold to some extent. For this purpose, the function of gamma-aminobutyric acid (GABA) on biochemical properties and expression of cold-tolerant genes in grape seedlings was investigated. In this study, to reduce cold stress losses from GABA leaf spray in the form of a randomized complete block design in three replications and in 3 concentrations (zero (control), 20.10 mM) on annual grape cuttings, Rish Baba cultivar (tolerant) and Yaghooti cultivar (susceptible) were used zero (control), 4, 8 and 10 hours) sampling was performed and in the first experiment biochemical parameters such as antioxidant content (total DPPH), phenol alcohol, and superoxide dismutase activity were examined, in the second experiment the treatment samples GABA at a concentration of 20 mM at 8 and 10 hours after application of stress in comparison with other treatments in both cultivars showed the most positive effect to counteract the effects of cold, so entered the molecular study and thus gene expression of CBF1, CBF2, CBF3 and CBF4 genes involved in cold were examined by Real Time-PCR. The results showed that GABA increases plant signaling and production of antioxidant compounds and is able to inhibit free radicals produced during stress. It also strengthens the signaling inside the plant and raises the expression level of resistance in grapes 8 and 10 hours after the application of cold stress. The transcription factor CBF2 has the highest expression level among GABA treated cultivars at a concentration of 20 mM has increased the resistance level in grape seedlings to an acceptable level.

    Keywords: Antioxidant, CBF, Gamma aminobutyric acid, Grape, Growth chamber}
  • مهدی قبولی*، شیما سادات بهشتی روی، احسان محسنی فرد، روح الله کریمی
    Mehdi Ghabooli *, Shima Sadat Beheshti Rooy, Ehsan Mohseni Fard, Rouhollah Karimi

    Low temperature is a major abiotic stress which can significantly affect the grape production. microRNAs play an important role in the control of plant development and response to adverse environmental conditions. Although miRNAs and their targets have been identified in several Vitis species, their participation during cold accumulation remains largely unknown. One such microRNA is miR395, which is conserved and regulates sulfate assimilation and distribution in plants. In this study, the possible role of miR395 in cold stress response was investigated. Identification of target genes, gene ontology and biological system analysis were performed to identify the major networks in which this miRNA is involved. Finally, the effects of gradual chilling and also a shock chilling on the expression of miR395 were investigated. In total, five target genes were identified, which all of them are targeted by miR395s a to m, whereas of the five target genes, only one is identified by miR395n as a target. Three of these genes, including ATP sulfurylase, sat-1 and, LAST3-like are involved in the control of sulfur metabolism and transport. Pathway analysis showed that miR395 was involved in response to cold stress in grape through cellular response to sulfate and phosphate deficiency. Based on RT-PCR results, contrary expression patterns of miR395 under gradual (up-regulated) and shock chilling stress (down-regulated) were observed. The changes of sulfate assimilation process would influence the formation of sulfur-containing antioxidant compounds. These results provide an insight into the regulatory roles of miR395 in response to low-temperature stress in V. viniferae.

    Keywords: abiotic stress, Grape, miRNAs, RT-PCR, Oxidative stress}
  • حمیدرضا جهانتیغ، عباسعلی امام جمعه*، محمود سلوکی، فروزان حیدری

    انگور یاقوتی سیستان، زودرس ترین انگور در ایران می باشد و هر ساله محصول آن در اواخر اردیبهشت و اوایل خرداد برداشت می شود. زودرس بودن انگور یاقوتی یک صفت مطلوب است. چرا که محصول، پیش از آغاز بادهای گرم و خشک 120 روزه سیستان و گرمای شدید تابستان برداشت می شود. در این تحقیق الگوی بیانی ژن های  Chalcone Synthase و  ABA-8′ Hydroxylase به عنوان فاکتورهای رونویسی دخیل در فرآیند زودرسیدن انگور یاقوتی سیستان، با استفاده از نمونه های برگی ارقام زودرس (یاقوتی قرمز و یاقوتی سفید) و ارقام دیررس (فخری و چشم گاوی) و رقم شاهد میان رس سنگی در دو مرحله نموی خوشه انگور پر شدن حبه ها و رسیدگی حبه ها) با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز در زمان واقعی مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج بدست آمده از تغییرات بیانی ژن های مورد مطالعه، برای هر دو ژن الگوی بیانی معنی داری را در ارقام زودرس نسبت به ارقام دیررس در مراحل نموی خوشه انگور نشان دادند. نتایج نشان دادند که ژن Hydroxylase ABA-8′  یک عامل رونویسی دخیل در زودرسیدن انگور یاقوتی سیستان می باشد و ژن   Chalcone Synthase نقش موثر در فرآیند رسیدگی و تغییر رنگ حبه ها ایفا می نماید.

    کلید واژگان: کالکون سنتاز, اسید آبسیزیک '8-هیدروکسیلاز, انگور, زود رسی, عوامل رونویسی, واکنش زنجیره ای پلیمراز در زمان واقعی}
    Hamidreza Jahantigh, Abbasali Emamjomeh*, Mahmood Solouki, Forouzan Heidari

    The Yaghoot grape of Sistan is the earliest grape cultivar in Iran and its product is harvested at the end of May. The early ripening in grape is a desirable trait, because the product will be harvested before starting the warm and dry 120-day winds so it can escape the Sistan heat season. In this study, the expression pattern of two genes, Chalcone Synthase and ABA-8′ Hydroxylase, as transcription factors involved in the early ripening process of Yaghooti grape cultivar were investigated during different developmental stages. The leaf samples related to early ripening cultivars Red and White Yaghooti and late cultivars Fakhri and Cheshm-e-gavi and Sangi intermediate cultivar  as control treatment were studied during two development stages of grape clusters (filling and ripening the berries) using Real-time PCR method. The results of the expression changes of the studied genes showed a meaningful expression pattern in early cultivars compared by late cultivars during differnet developmental stages in grape clusters. The findings indicated that the ABA-8′ Hydroxylase gene was a transcription factor involved in the early ripening of the Sistan Yaghooti grape cultivar, and the Chalcone Synthase gene are playing an important role in ripening and changing the color of the berries.

    Keywords: Chalcone Synthase, ABA-8′ Hydroxylase, Early ripening, Real Time PCR, Transcription Factor, vitis vinifera}
  • محمدقاسم کشاورزخوب، شاهرخ قرنجیک*، اسد معصومی اصل، مهدیه پارساییان، بابک عبدالهی مندولکانی
    تعیین تنوع ژنتیکی مواد گیاهی، گام اولیه برای شناسایی، حفظ و نگهداری ذخایر توارثی بوده و اهمیت زیادی در اجرای برنامه های اصلاحی دارد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی 25 رقم انگور شهرستان های شاهرود و سی سخت از 9 آغازگر و ترکیب آغازگری رتروترنسپوزونی شامل سه آغازگر IRAP و شش ترکیب آغازگری REMAP استفاده شد. در مجموع 87 باند تولید شد که 79 باند در بین ارقام چندشکل بودند. تعداد باندهای چندشکل از چهار (Tvv1Fa+Ms11) تا 12 باند (Vin1Fa) به ازای هر آغازگر متغیر بود. هتروزیگوسیتی موردانتظار از 29/0 (Tvv1Fa+ Ms8) تا 44/0 (Vine1Fa+ Ms3) متغیر و میانگین آن 35/0 به دست آمد. میانگین درصد چندشکلی در بین ارقام مورد مطالعه 83/95 درصد بود. تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) نشان داد که پنج مولفه اول توانستند در مجموع، 5/68 درصد از واریانس کل را توجیه کنند. تجزیه کلاستر به روش UPGMA براساس ضریب تشابه جاکارد با ضریب همبستگی کوفنتیک 89/0، ارقام مورد مطالعه را در شش گروه متفاوت قرار داد به طوری که در گروه اول تا ششم به ترتیب 13، 4، 2، 3،2 و 1 رقم از ارقام مورد مطالعه قرار گرفتند. بر اساس این گروه بندی سه رقم سیاه دانه بلند، سیاه دانه گرد و عسکری که از شهر سی سخت انتخاب شدند در سه گروه مجزا قرار گرفتند که نشان دهنده تفاوت ژنتیکی این ارقام می باشد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که نشانگرهای IRAP و REMAP توسعه یافته بر اساس رتروترنسپوزون های فعال در ژنوم انگور می توانند به عنوان نشانگرهای ملکولی کارا در تسریع برنامه-های اصلاحی در انگور مورد استفاده قرار گیرند.
    کلید واژگان: انگور, تنوع ژنتیکی, رتروترنسپوزون, IRAP, REMAP}
    Keshavarz Khoob Mgh, Gharanjik Sh*, Masoumiasl A., Parsaeyan M., Abdollahi Mandoalkani B
    Determination of genetic diversity in plant material is the initial step to identify and preservation of genetic resources and also is important in conducting of breeding programs. In order to study genetic variation among 25 grapevine cultivars of Shahrood and Sisakht regions, nine retrotransposonal primer combinations including 3 IRAP primers and 6 REMAP primers combination were used. Totally, 87 bands produced that 79 bands were polymorphic among cultivars. Numbers of polymorphic bands varied from 4 (Tvv1Fa㋍) to 12 (Vin1Fa) bands per primer. Expected heterozygosis ranged from 0.29 (Tvv1Fa Ms8) to 0.45 (Vine1Fa Ms3) with an average of 0.35. Average of polymorphism percentage among evaluated cultivars was 95.83%. Principle coordinates analysis (PCoA) showed that first five components explained 68.5% of total variance. Cluster analysis using UPGMA method based on Jaccard similarity coefficient with cophenetic correlation coefficient of 0.89, divided grapevine cultivars into 6 different groups. In the first to sixth group, 13, 4, 2, 3, 2 and 1 cultivars were assigned respectively. According to this grouping, cultivars named Syah-Daneh Boland, Syah-Daneh Gerd and Asgari from SySakht city were assigned in three different groups that showed genetic differences among these cultivars. The results of this study indicated that IRAP and REMAP markers developed based on active retrotransposons in the grapevine genome can be used as efficient molecular markers to accelerate grapevine breeding programs.
  • محمدقاسم کشاورزخوب، شاهرخ قرنجیک*، اسد معصومی اصل، بابک عبدالهی مندولکانی
    در این تحقیق تنوع ژنتیکی 22 رقم انگور Vitis vinifera L.)) شهرستان شاهرود و 3 رقم انگور شهر سی سخت با استفاده از 6 آغازگر مولکولی ISSR مورد ارزیابی قرار گرفت. نشانگرهای مورد استفاده در مجموع 69 باند تولید کردند که از این تعداد 65 باند در بین ارقام مورد استفاده چندشکل بودند. بیشترین باند چندشکل مربوط به آغازگر UBC825 با 16 باند و کمترین باند مربوط به آغازگر UBC857 با 6 باند بود. میانگین درصد چندشکلی آغازگرها 1/94 درصد محاسبه گردید. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار (He) و میانگین ضریب شانون (SI) برای این آغازگرها به ترتیب 37/0 و 54/0 بدست آمد. بیشترین مقدار ضریب شانون (61/0) مربوط به آغازگر UBC825 و کمترین میزان آن (48/0) مربوط به آغازگر UBC849 بود. همچنین آغازگر UBC825 بیشترین مقدار هتروزیگوسیتی مورد انتظار (42/0)، بیشترین تعداد آلل های موثر (75/1) و بیشترین تعداد آلل های متفاوت (2) را نشان داد.گروه بندی ژنوتیپ ها به روش تجزیه خوشه ایبر اساس ماتریس تشابه جاکارد و با استفاده از الگوریتم UPGMA ارقام مورد مطالعه را در سه گروه قرار داد. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ISSR می توانند به عنوان ابزاری کارا در ارزیابی تنوع ژنتیکی و تسریع برنامه های اصلاحی در انگور مورد استفاده قرار گیرند.
    کلید واژگان: تنوع ژنتیکی, انگور, نشانگرهای مولکولی, ISSR}
    Keshavarz, Khoob M.Gh, Gharanjik Sh*, Masoumiasl A., Abdollahi, Mandoalkani B
    In this research, genetic variation among 22 grapevine cultivars of Shahrood region and 3 cultivars from Sisakht city were evaluated using 6 ISSR primers. The used primers produced totally 69 bands, which 65 bands showed polymorphism among evaluated cultivars. Primers UBC825 with 16 bands and UBC857 with 6 bands produced the highest and lowest numbers of polymorphic bands, respectively. Polymorphism percentage using these markers was 94.1%. Mean of expected heterozygosis (He) and mean of Shannon index were 0.37 and 0.54, respectively. The highest (0.61) and lowest (0.48) amount of Shannon index was belong to the primers UBC 825 and UBC849, respectively. Also primer UBC825 showed the highest amount of the expected heterozygosity (0.42), highest number of effective allele (1.75) and highest number of different alleles (2). Cluster analysis using Jaccard similarity coefficients and UPGMA algorithm put the 25 studied cultivars in three different groups. The results of this study showed that ISSR markers can be used as effective tools to evaluate the genetic variation and to accelerate grapevine breeding programs.
    Keywords: Genetic variation, Grapevine, Molecular marker, ISSR}
  • معصومه فرخ نیا، بابک عبدالهی مندولکانی*، حامد دولتی بانه، ایرج برنوسی
    به منظور مطالعه چند شکلی ادغامی خانواده های رتروترنسپوزونیTvv1، Edel، Vine1، Gentilو Huben و تنوع ژنتیکی در 67 رقم زراعی و ژنوتیپ های وحشی انگور (Vitis vinifera L.) از نشانگرهای IRAPو REMAP استفاده شد. در مجموع 103 مکان با استفاده از دو آغازگر IRAP و 13 ترکیب آغازگری REMAP تولید شد که از این تعداد، 83 مکان (58/80 درصد) چند شکل بودند. مقادیر شاخص تنوع نی برای آغازگرها از صفر (آغازگرGentil-A7) تا 38/0 (آغازگر Tvv1-808) متغیر بود. میانگین شاخص تنوع نی در کل ارقام مطالعه شده 27/0 بود. دامنه ضرایب تشابه ژنتیکی دایس بین ارقام از 57/0 (رقم H6 با دسترچین) تا یک (رقم رشه اصل با سیاه معمولی) متغیر و میانگین آن 78/0 بود. بیشترین مقادیر شاخص تنوع نی، تعداد الل های موثر (Ne) و شاخص اطلاعاتی شانون (I) مربوط به خانواده رتروترنسپوزونی Tvv1 و به ترتیب 32/0، 54/1 و 47/0 بود که بیانگر تحرک و چند شکلی زیاد این خانواده در ارقام مطالعه شده می باشد. تجزیه کلاستر بر اساس ضریب تشابهDice و الگوریتم UPGMA ارقام مورد مطالعه را در شش گروه اصلی قرار داد و نمونه های زراعی و وحشی را از هم متمایز کرد. شباهت و تمایز ارقام بر اساس نتایج حاصل از تجزیه کلاستر ژنوتیپ های مورد مطالعه، به وسیله روش های مبتنی بر مدل با استفاده از نرم افزار Structure 2.3.1 تایید شد. نتایج نشان داد خانواده های رتروترنسپوزونی مورد استفاده به ویژه Tvv1 در ژنوم انگور به لحاظ انتقالی فعال بوده و می توان از نشانگرهای مبتنی بر این خانواده در تمایز ارقام و ژنوتیپ های انگور استفاده کرد.
    کلید واژگان: انگور, تنوع ژنتیکی, رتروترنسپوزون, IRAP, REMAP}
    Farokhnia M., Abdollahi Mandoulakani B.*, Dolati Baneh H., Bernousi I
    In the current investigation, inter retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) and retrotransposon microsatellite amplified polymorphism (REMAP) markers were used to study the insertional polymorphism of retrotransposon families Tvv1, Edel, Vine1, Gentil and Huben and genetic diversity in 67 grape (Vitis vinifera L.) cultivars and wild genotypes. Totally, 103 loci generated using 2 IRAP and 13 REMAP primers which 83 (80.58%) was polymorphic. The mean of Nei’s diversity index for primers ranged from 0 (Gentil-A7) to 0.38 (Tvv1-808), averaging 0.27 for the studied grape collection. The Dice similarity coefficients varied from 0.57 (H6 and Dastarchin) to 1 (Rasha-SeyahMamoli) with a mean value of 0.78. The maximum values of Nei’s diversity index (0.32), number of effective alleles (Ne=1.54) and Shannon’s information index (I=0.47) was for retrotransposon Tvv1, showing its high activity and insertional polymorphism in the studied grape collection. Cluster analysis using Dice similarity coefficients and UPGMA algorithm grouped cultivars in 6 main clusters and differentiated cultivated and wild grapes. The UPGMA classification of the studied cultivars was confirmed using model-based methods, implemented in software Structure 2.3.1. It was concluded that used retrotransposon families especially Tvv1 are transpositionally active and could make insertional polymorphism in grape genome; hence molecular markers developed based on this retrotransposon could be used in grapevine genotypes and cultivar identifications.
    Keywords: Genetic diversity, IRAP, REMAP, Retrotransposon, Vitis vinifera L}
  • رحیم حداد*، علیرضا کمانگر
    اثر سیلیکات سدیم (SI) و پتاسیم (K) در فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدان مهم در دو رقم مختلف انگور (Vitis vinifera L.) ارقام یزندایی و رامفی تحت تنش خشکی مورد بررسی قرار گرفت. صفات مورد بررسی شامل سوپراکسید دیسموتاز (SOD, EC 1. 15. 1. 1) ، کاتالاز EC 1. 15. 1. 6) (CAT, ، پراکسیداز EC 1. 11. 1. 7) (POD, ، گوایکول پراکسیداز(GPX, EC1. 11. 1. 7) ، آسکوربات پراکسیداز (APX, EC 1. 11. 1. 11) و همچنین صفات فیزیولوژیک مانند نسبت مقدار آب برگ (LWCR) ، کلروفیل (Chl) ، پروتئین محلول در آب، پراکسید هیدروژن (H2O2) ، پرولین (Pro) و تجمع گلایسین بتائین (GB) بود. این آزمایش در قالب طرح کاملا تصادفی شامل چهار تیمار کنترل، خشکی، سیلیکون-خشکی (004/0 مولار سیلیکات سدیم / کیلوگرم خاک) ، و پتاسیم-خشکی (004/0 مولار فسفات پتاسیم / کیلوگرم خاک) با سه تکرار در گلخانه انجام شد. تنش خشکی باعث کاهش قابل توجهی در LWCR، کلروفیل و پروتئین محلول گردید. در مقابل، در مقایسه با گیاهان تحت تیمار خشکی، اعمال Si و K به طور معنی داری فعالیت SOD، CAT، POD،GPX و APX را افزایش داد. تحت تنش خشکی Pro و GB افزایش یافت. نتایج نشان داد که کاربرد Si و K تا حدودی اثرات منفی تنش خشکی را با افزایش تحمل انگور ضمن فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدانت و تنظیم فشار اسمزی جبران می نماید.
    کلید واژگان: آنزیم های آنتی اکسیدانت, تنش خشکی, انگور, پتاسیم, سیلیکون}
    Raheem Haddad *, Alireza Kamangar
    The effect of sodium silicate (Si) and potassium (K) were investigated on the major antioxidant enzyme activities in two different grapevine cultivars (Vitis vinifera L., cvs Yezandai and Malinger Ramfi) under drought stress. The traits included superoxide dismutase (SOD, EC 1.15.1.1), catalase (CAT, EC 1.11.1.6), peroxidase (POD, EC 1.11.1.7), guaiacol peroxidase (GPX, EC 1.11.1.7), ascorbate peroxidase (APX, EC 1.11.1.11), and also physiological traits such as leaf water content ratio (LWCR), chlorophyll (Chl), soluble protein contents, hydrogen peroxide (H2O2), prolin (Pro) and glycine betaine (GB) accumulation. The experiment was performed in a completely randomized design including four treatments i.e. the control, drought, Si-drought (0.004 M sodium silicate/kg soil), and K-drought (0.004 M potassium phosphate/kg soil) with three replications in a greenhouse. Drought stress caused a considerable decrease in LWCR, chlorophyll and soluble protein contents. In contrast, compared with the plants treated with drought, applied Si and K significantly enhanced the activities of SOD, CAT, POD, GPX and APX. Under drought stress Pro and GB increased. The results indicated that Si and K partially offset the negative impacts of drought stress by increasing the tolerance of grapevine by rising antioxidant enzyme activities and osmotic adjustment.
    Keywords: Antioxidant enzymes, Drought stress, Grapevine, Potassium, Silicon}
  • نیر محمدخانی

    به دلیل افزایش شوری خاک در سرتاسر جهان شناسایی ژن های دخیل در تحمل گیاهان مهم است. هدف مطالعه بررسی اثرات شوری بر بیان سه ژن -مربوط به پروتئین ها و آکواپورین- در انگور (Vitis vinifera L.) بود. بر اساس آزمایش های غربالگری روی 18 ژنوتیپ H6 و قره شانی که کاهش کمتری در پتانسیل آب، سطح برگ، سرعت رشد برگ و محتوای آب نسبی نشان دادند، به عنوان ژنوتیپ های متحمل در مقایسه با حساس (شیرازی و قزل اوزوم) انتخاب شدند. گیاهان با 50 میلی مول NaCl – به عنوان غلظت مناسب - به مدت 0، 24 ساعت و 14 روز تیمار شدند. بیان بالای ژن VvFS41  در ژنوتیپ های حساس تحت شوری نشان داد که این ژنوتیپ ها حداکثر ظرفیت خود را برای بقا در شرایط شور به کار می برند. بیان VvPHP1 هیچ نظم خاصی نداشت. بیان  VvPIP2.2در ریشه همه ژنوتیپ ها تحت شوری کاهش یافت و تعیین نقش VvPIP2.2 در ژنوتیپ ها مشکل بود. براساس نتایج ژنوتیپ های حساس تحت شوری تغییرات بیشتری در ژن های پروتئین ها و آکواپورین نشان دادند، اما ژنوتیپ های متحمل باثبات تر بودند. یافته های ما تفاوت معنی داری بین ژنوتیپ های حساس و متحمل نشان داد و ارتباط قوی بین انباشتگی ژن ها و درجه تحمل به شوری را برجسته کرد.

    کلید واژگان: شوری, انگور, پروتئین های تنشی, رونوشت ها, ژن های آکواپورین}
    Nayer Mohammadkhani

    Due to worldwide increasing of salinity, the identification of genes conferring tolerance to plants is important. The aim of this study was to investigate salinity effects on the expression of three genes-related to proteins and aquaporin in grape (Vitis vinifera L.). Based on screening study on 18 grape genotypes, H6 and Gharashani that showed lower decrease in water potential, leaf area, leaf growth rate and relative water content under salinity, were selected as tolerant genotypes compared to sensitive ones (Shirazi and GhezelUzum). Plants were treated with 50 mM NaCl as a critical concentration for 0, 24 hours and 14 days. High expression of VvFS41 gene in the sensitive genotypes under salinity showed that these genotypes used all of their capacity to survive under stress condition. The expression of VvPHP1 showed no regular status. Expression of VvPIP2.2 decreased in roots of all genotypes under salinity and the determination of VvPIP2.2 role seems be difficult in these genotypes. Based on the results, sensitive genotypes showed higher changes in proteins and aquaporin genes under salinity, but tolerant genotypes was more stable. Our findings showed a significant difference between tolerant and sensitive genotypes and highlighted a strong relationship between the accumulation of specific transcripts and stress tolerance.

    Keywords: Salinity, Grape, Stress proteins, Transcripts, Aqua, porin genes}
  • حامد دولتی بانه، سید ابوالقاسم محمدی، بابک عبدالهی مندولکانی*، ساسان رحمان پور
    انگور متعلق به تیره Vitaceae است و به علت داشتن مصارف متعدد به عنوان یک منبع مهم غذایی همیشه مورد توجه بوده است. به منظور شناسایی نشانگرهای مرتبط با 14 صفت شامل حجم آب میوه، درصد جوانه زنی دانه گرده، درصد تشکیل میوه، میانگین وزن تک خوشه و وزن تک حبه، وزن گوشت میوه، وزن تک بذر، طول و عرض خوشه و سیستم باردهی، مواد جامد محلول میوه، مقدار اسید و pH میوه در 48 رقم انگور ایرانی موجود در کلکسیون مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان غربی از 22 جفت آغازگر SSR و 7 ترکیب آغازگری AFLP استفاده گردید. تجزیه رگرسیون گام به گام رابطه معنی داری بین تعدادی از نشانگرهای SSR و تمامی 14 صفت مورد مطالعه در ارقام انگور نشان داد. در کل 49 آلل از 18 نشانگر SSR ارتباط معنی دار با تغییرات 14 صفت نشان دادند. وزن حبه و وزن گوشت میوه هرکدام با 7 آلل بیشترین و صفات pH میوه، اسید میوه، حجم آب میوه و درصد جوانه زنی گرده با یک آلل کمترین تعداد آلل مرتبط را داشتند. از 7 جفت ترکیب آغازگری AFLP مورد استفاده، 49 قطعه رابطه معنی داری با تغییرات 14 صفت نشان دادند. تعدادی از این قطعات برای صفات مختلف مشترک بودند. وزن گوشت میوه با 11 نشانگر مرتبط بیشترین و صفات مواد جامد محلول، درصد تشکیل میوه، جوانه زنی گرده و عرض خوشه با یک نشانگر مرتبط، کمترین تعداد نشانگرهای مرتبط AFLP را به خود اختصاص دادند.
    کلید واژگان: انگور, تجزیه ارتباط, صفات مورفولوژیک, نشانگرهای مرتبط}
    Dolati Baneh H., Mohammadi S.A., Abdollahi Mandoulakani B.*, Rahmanpour S
    Grapevine (Vitis sp.), belongs to Vitaceae family, is one of the most important food sources in world because of its wide consumptions. In the current investigation, 22 SSR primer pairs and 7 AFLP primer combinations were used to identify molecular makers associated with 14 flower and fruit related traits in Iranian grapevine germplasm. The traits studied, included fruit water content, percentage of pollen germination, percentage of fruit production, bunch and berry weight, fruit lobe and single seed weight, bunch and yielding system length and width, total soluble solids, acid content and fruit pH. Stepwise regression analysis showed significant relationship between some SSR alleles and all 14 traits in grapevine varieties. In general, 49 alleles produced by 18 SSR primers, showed significant association with variation of 14 traits. The highest and lowest number of associated markers achieved for berry weight and fruit lobe weight each with 7 alleles and pH, fruit acid content, fruit water content and percentage of pollen germination each with 1 alleles, respectively. Significant association between polymorphism of AFLP markers and studied traits was also detected. Forty-nine AFLP fragments showed significant association with the variations of 14 traits. Some of the associated AFLP segments were common among different traits. The fruit lobe weight, with 11 associated markers and total soluble solids, percentage of fruit production, pollen germination and bunch width each with 1 associated marker, were the traits with the highest and lowest number of associated AFLP markers, respectively.
    Keywords: Grapevine, Association Analysis, Morphological traits, Associated markers}
  • سمیه خون رز*، براتعلی سیاه سر، مسیح فروتن
    هدف این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی ارقام انگور بومی و غیر بومی موجود در سیستان با استفاده از نشانگرهای REMAP می باشد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ارقام انگور بومی و غیر بومی مربوط به ایستگاه تحقیقاتی زهک در سیستان، 33 رقم انگور (Vitis vinifera L.) موجود در این ایستگاه توسط 7 ترکیب آغازگری REMAP حاصل از ترکیب آغازگر های ISSR و آغازگر های مبتنی بر رتروترانسپوزون از خانواده Ty1-copia و Ty3-gypsy مورد ارزیابی قرار گرفتند. میزان چندشکلی مشاهده شده در هر کدام از نشانگر های MS1/Gret1 Ra و MS5/Gret1Rb هم در ارقام بومی و هم غیر بومی به ترتیب 80 و 75 درصد بود. نتایج حاصل این احتمال را تقویت می کند که رتروترانسپوزون Gert1 در فرایند تکامل گیاهان مورد تحقیق بیشتر جابجا شده و تعداد نسخه های بیشتری را داخل ژنوم تکثیر کرده است. دندروگرام بر اساس الگوریتم UPGMA و ضریب تشابه جاکارد ترسیم شد. ارقام مورد مطالعه در ضریب تشابه (44/0) به یک گروه بزرگ با 12 زیر گروه و یک گروه کوچک با یک رقم تقسیم شدند. نتایج بدست آمده از تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که 6 مختصه اول در مجموع 44/50 درصد از کل تغییرات را توجیه می کند.
    کلید واژگان: انگور, تنوع, رتروترانسپوزون, REMAP}
    Khunraz S.*, Siyahsar Ba, Forootan M.
    The aim of this study Investigating the genetic variation in the collection germplasm Sistan grapevine native and non-native cultivars using REMAP marker. To study the genetic diversity of grapevine native and non native cultivars of Zahak research station in Sistan, 33 grape varieties (Vitis vinifera L.) were evaluated by by 7 primer combination REMAP combination ISSR primers and retrotransposons based primer from of Ty1-copia and Ty3-gypsy families. The observed polymorphism for markers MS1 / Gret1 Ra, MS5 / Gret1Rb in both native and non-native varieties were 80 and 75%, respectively. The results revealed that the Gret1 retrotransposon has more transcription and translocation trough the genome. Cluster analysis based on Jaccard's similarity and UPGMA algorithm showed that the population is divided into two groups at (0.44) similarity; one group with twelve sub-groups and one group with one varieties. The results of principal component analysis extracted six components that explained 50.44 % of the total variation among the studied population.
    Keywords: Biodiversity, Grapevine, REMAP, Retrotransposon}
  • الهام محولاتی، سیروس قبادی*، بدرالدین ابراهیم سیدطباطبایی، غزاله خاکسار، محمدعلی تقدس
    عامل نسخه برداری DREB (پروتئین متصل شونده به عنصر پاسخ دهنده به کم آبی) یکی از چهار سیستم تنظیمی مستقل در گیاهان است که در فعال شدن ژن های پاسخ دهنده به تنش های محیطی نقش دارد. به منظور شناسایی و جداسازی برخی از ژن های DREB در انگور، گیاهان تحت تنش 150 میلی مولار NaCl قرار گرفته و سپس RNA کل استخراج شد. آغازگرهای اختصاصی براساس ژن فرضی DREB و همولوگ ژن SbDREB2A گیاه نمک دوست Salicornia brachiata با انگور طراحی و ژن های VvDREB و DREB like 2C (ارتولوگ SbDREB) از انگور جدا شد. نتایج نشان داد که ژن VvDREB با ژن های DREB گروه دو خانواده سویا در حدود 85 درصد و دو ژن SbDREB2Aو DREB like 2C درحدود 80 درصد شباهت دارد. رسم ساختار ثانویه پروتئین VvDREB و پروتئین های DREB2 سویا نشان داد که در ناحیه حفاظت شده AP2 آن ها ساختارHelix مشابه وجود دارد. مطالعه و مقایسه موتیف های پروتئین VvsDREB وSbDREB2A در سایت ELM حاکی از عدم وجود پنج موتیف متفاوت (BRCT، MAPK، PKB، NES، NLS) در پروتئین VvsDREB بود که احتمال می رود دلیل بر ناکارایی موثر عملکرد آن باشد.
    کلید واژگان: انگور, تنش اسمزی, زیست رایانه, DREB, Salicornia brachiata}
    Mahvelati E., Ghobadi C.*, Sayed Tabatabaei Be, Khaksar G., Taghaddos Ma
    DREB transcription factors are one of the four independent regulation systems in plants which involves in abiotic stress signaling pathway and activation of stress responsive genes. For identification and isolation of DREB genes, one-year-old own-rooted grapevine’ were used. Potted plants were subjected to150mM NaCl during the experiment and total RNA was extracted. Specific primers were designed based on predicted DREB and SbDREB2A gene homologue in halophilic plant Salicornia brachiata. VvDREB and VvsDREB (DREB like 2C) genes were isolated from grapevine (Vitis vinifera L.’ Askari’). Bioinformatics results indicated that VvDREB gene has 85% similarity with DREB2 genes from soybean family and VvsDREB gene has 80% similarity with SbDRE 2A gene. SbDREB2A and VvsDREB proteins motif studies in ELM database showed that there are no five motifs (BRCT, MAPK, PKB, NES, NLS) in VvsDREB protein.
    Keywords: Bioinformatics, DREB, Grapevine, Osmotic stress, Salicornia brachiata}
  • قاسم علی گروسی
    تیوردوکسین ها، دی سولفید ردوکتازهای کوچک و فراوانی هستند که در واکنش های تبادلی دی تیول- دی سولفید شرکت می کنند. در مقایسه با جانوران و پروکاریوت ها که تنها حاوی یک یا تعداد کمی از ژن های کدکننده تیوردوکسین ها می باشند، گیاهان عالی دارای هشت نوع تیوردوکسین متفاوت از قبیل: f، m، x، y، z، o، s و h هستند. تیوردوکسین h با اشکال متعدد در فرآیندهای مختلفی همچون جوانه زنی بذر، محافظت سلولی در برابر تنش اکسیداتیو، خودناسازگاری و غیره شرکت می نماید. بررسی بیان سه ژن تیوردوکسین h، به نام های VvTrx h1، VvTrx h2 و VvCxxS2 در بافت های مختلف سه رقم انگور (عسکری، بیدانه قرمز و بیدانه سفید) در مراحل رشدی مختلف بوسیله تکنیک RT-PCR نیمه کمی مورد مطالعه قرار گرفت. ژن های تیوردوکسین h انگور در بافت های حبه، برگ، دمبرگ، خوشه، ساقه، ریشه و بذر در مراحل رشدی مختلف بیان شده و در مقایسه با بافت ریشه، بالاترین سطح بیان آیزوفرم ها در بافت حبه مشاهده گردید. در بافت حبه، بیان آیزوفرم های VvTrx h1، VvTrx h2 و VvCxxS2 در شش مرحله رشدی شامل 14، 28، 42، 56، 82 و 110 روز پس از گلدهی (dpa) مورد بررسی قرار گرفت و مشاهده شد که بالاترین سطح بیان آیزوفرم ها به مرحله ترش- شیرین (Veraison، 56 dpa) تعلق دارد. بیان ژن های تیوردوکسین h انگور در بافت های برگ، دمبرگ و خوشه در سه مرحله رشدی جوانی، بلوغ و پیری نیز مورد مطالعه قرار گرفته و در مقایسه با بافت حبه، الگوی مشخصی از بیان را نشان ندادند. در مقایسه با آیزوفرم های VvTrx h1 و VvCxxS2، آیزوفرم VvTrx h2 بالاترین سطح بیان را در بافت های مختلف نشان داد که حاکی از ایفای نقش مهم این آیزوفرم در گیاه انگور می باشد.
    کلید واژگان: تیوردوکسین h, انگور, بررسی بیان, RT, PCR نیمه کمی}
    Reza Heidari Japelaghi, Raheem Haddad, Ghasem, Ali Garoosi
    Thioredoxins (Trxs) are small ubiquitous disulfide reductases that participate in dithiol-disulfide exchange reactions. In contrast to animals and prokaryotes that typically possess one or a few genes encoding Trxs، higher plants contain eight different Trx types: f، m، x، y، z، o، s، and h. Trx h with multiple forms is involved in different processes such as seed germination، cellular protection against oxidative stress، self-incompatibility etc. The expression analysis of the three h-type Trx genes، called VvTrx h1، VvTrx h2 and VvCxxS2 was studied in different tissues of three grape cultivars (Askari، Red Seedless and White Seedless) at various develpmental stages by semiquantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). The grape Trx h genes were expressed in berry، leaf، petiole، cluster، stem، root، and seed tissues at different developmental stages. The higher expression of the isoforms was observed in berry tissues as compared to those of the roots. In berry tissues، the expression of VvTrx h1، VvTrx h2 and VvCxxS2 isoforms were analyzed at six growth stages، including 14، 28، 42، 56، 82، and 110 days post anthesis (dpa). The highest level of expression was observed at veraison stage (56 dpa). The expression of grape Trx h genes was also analyzed in leaf، petiole and cluster tissues at three developmental stages including young، mid and old stages with a imprecise pattern of expression in comparison to the berry tissues. In contrast to VvTrx h1 and VvCxxS2 isoforms، VvTrx h2 showed the highest level of expression in different tissues، suggesting a major role for this isoform in grape.
    Keywords: Thioredoxin h, Grape, Expression analysis, Semiquantitative RT, PCR}
  • انتخاب کلونی یکی از مهم ترین روش های اصلاح کمیت و کیفیت میوه در ارقام انگور می باشد. امروزه نیاز به روش های دقیق و قابل اعتماد برای تشخیص تفاوت های ژنتیکی بین کلون ها برای استفاده خزانه داران و اصلاح گران وجود دارد. به منظور بررسی اختلافات ژنتیکی بین کلون های بی دانه سفید حاصله از برنامه انتخاب کلونی در استان آذربایجان غربی، از 23 نشانگر ریزماهواره و 7 ترکیب آغازگر AFLP استفاده شد. تجزیه داده های حاصله از نشانگرهای ریزماهواره نتوانست هیچگونه اختلافی را بین این کلون ها مشخص نماید در حالی که از 499 قطعه DNA بدست آمده از آغازگرهای AFLP، هشت عدد چند شکل بودند. تعداد قطعات در محدوه 44 عدد در ترکیب آغازگری E34-M34 تا 97 قطغه در E31-M32 با میانگین 3/71 بود. تجزیه خوشه ایبر اساس داده های AFLP تمامی کلون ها را در دو گروه قرار داد. اولین گروه شامل 9 کلون انگور بی دانه سفید بدون اختلاف ژنتیکی و گروه دوم شامل کلون بی دانه قرمز بود. روش AFLP فقط توانست کلون بی دانه قرمز را از سایر کلون های پوست سفید متمایز نماید.
    کلید واژگان: انگور, کلون, اختلاف ژنتیکی و نشانگرهای مولکولی}
    Clonal selection has become the most important way to improve the quality of grape cultivars. Nowadays، there is a need for reliable and precise methods to characterize of clones for use by nurseries and breeders. To assess the genetic differences among clones of grapevine (Vitis vinifera L.) cv Bidaneh sefid، 10 selected clones from a clonal selection program were analyzed by 23 Simple Sequence Repeats (SSR) and seven Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) primer combination. No intra-varietal differences could be detected by SSRs among clones whereas eight out of the 499 AFLP fragments generated by the seven primer combinations were polymorphic. The number of markers ranged from 44 (E34-M34) to 97 (E31-M32) with an average of 71. 3 fragments per primer combination. Cluster analysis based on AFLP data were separated all the clones of Bidaneh sefid in two groups. The first group includes nine white berry skin clones، without any genetic differences and the second group with only a red berry skin clone. AFLP could only differentiated the red berry clone from other white berry clones.
    Keywords: Grapevine, Clone, Genetic difference, Molecular markers}
  • رحیم حداد، سید شرف الدین موسوی، قاسمعلی گروسی، رامین حسینی، رضا حیدری جاپلقی
    یکی از فعالیت های مهم سلول های گیاهی در دوره رشد آن، فعال نمودن ژن های عامل و آنزیم های موثر در تجزیه برخی مواد ذخیره شده در مراحل اولیه تشکیل میوه است. براساس مطالعات انجام شده، آنزیم های مختلفی در تخریب دیواره سلولی و نرم شدن بافت میوه نقش دارند. از مهم ترین این آنزیم ها، آنزیم پکتات لیاز می باشد. در این مطالعه، cDNA ناقص یکی از ژن های پکتات لیاز از بافت حبه انگور بیدانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره ای پلی مراز نسخه برداری معکوس (Reverse Transcriptase-PCR) جداسازی و در ناقل pUC19 همسانه سازی و ساختار مولکولی، ویژگی-های بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی این ژن، تحت عنوانVvPel1، به طول bp429 بوده و یک پروتئین با 143 اسیدآمینه را رمز می کند. وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیش بینی شده این پروتئین به ترتیب برابر 78/15 کیلو دالتون و 53/6 می باشد. بررسی ساختارهای دوم و سوم توالی پروتئینی VvPel1 نشان داد که این پروتئین از نظر ساختاری مشابه با توالی های پکتات لیاز گزارش شده از موجودات دیگر می باشد. توالی پروتئینی بدست آمده شباهت زیادی را با توالی های پکتات لیاز سایر گیاهان نشان داد. بررسی فیلوژنتیکی نیز مشخص کرد که این ژن به زیرگروه I پکتات لیازهای گیاهی تعلق دارد.
    کلید واژگان: انگور, پکتات لیاز, نرم شدگی, دیواره سلولی, همسانه سازی}
  • رضا حیدری جاپلقی، رحیم حداد *، قاسمعلی گروسی، سعید نواب پور

    تیوردوکسین ها (Trxs)، دی سولفید ردوکتازهای کوچک و فراوانی هستند که در تمام موجودات زنده از پروکاریوت ها تا یوکاریوت های عالی یافت شده و در تنظیم ردوکس سلولی دخالت دارند. در مقایسه با سایر موجودات زنده، گیاهان دارای 6 نوع تیوردوکسین مختلف f، h، m، o، x و y می باشند که تنها تیوردوکسین نوع h با اشکال متعدد، بطور وسیع مورد مطالعه قرار گرفته و در فرآیندهای مختلفی از جمله محافظت سلولی در برابر تنش اکسیداتیو ایفای نقش می نماید. همسانه سازی ژن تیوردوکسین نوع h از بافت حبه انگور عسکری (Vitis vinifera L. cv. Askari) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره ای پلی مراز نسخه برداری معکوس (RT-PCR) انجام شده و ویژگی های فیزیکوشیمیایی، ساختاری و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی چارچوب بازخوانی این ژن، تحت عنوان VvTrx h4، به طول bp345 بوده و یک پروتئین با 114 اسیدآمینه را رمز نموده و دارای جایگاه فعال معمول WCGPC می باشد. وزن مولکولی تخمین زده شده و نقطه آیزوالکتریک پیش بینی شده این پروتئین به ترتیب برابر 76/12 کیلودالتون و 22/5 بوده و پیش بینی ساختار سه بعدی آن با استفاده از ساختار کریستالی ژن AtTrx h1 از آرابیدوپسیس نشان داد که این پروتئین با سایر تیوردوکسین های بررسی شده مطابقت داشته و با داشتن 5 صفحه β و 4 مارپیچ α، ساختار سه بعدی از نوع Thioredoxin Fold را نشان می دهد. توالی پروتئینی بدست آمده شباهت زیادی را با تیوردوکسین های نوع h سایر گیاهان، از قبیل صنوبر (89 درصد تشابه با تیوردوکسین Pth3) و رقم Shiranuhi از جنس مرکبات (86 درصد مشابه با تیوردوکسین Csh) نشان داده و بررسی های فیلوژنتیکی با استفاده از ژن های تیوردوکسین از گیاهان دیگر نشان داد که ژن VvTrx h4، تیوردوکسین نوع h بوده و متعلق به زیرکلاس IA از زیرگروه I می باشد.

    کلید واژگان: انگور, تیوردوکسین نوع h, جداسازی, ساختار سه بعدی, همسانه سازی}
    Heidari Japelaghi R., Haddad R., Garousi Gh, Navabpour S

    thioredoxins (Trxs) are small ubiquitous disulfide reductases that are present in all organisms from prokaryotes to higher eukaryotes and involve in the cell redox regulation. In contrast to other organisms, plants contain six different Trx types: f, m, x, y, o and h that only h type Trx has been the most extensively studied and consists of multiple forms that involved in different processes including cellular protection against oxidative stress. Cloning of a h-type thioredoxin gene was performed from grape (Vitis vinifera L. cv. Askari) berry tissue by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) technique, and then its physico-chemical, structural and phylogenetic characteristics was analyzed. The nucleotide sequence of open reading frame, called VvTrx h4, was revealed a 345 bp long with a deduced amino acid of 114 residues, possessing a WCGPC active site. The estimated molecular mass and the predicted isoelectric point of the deduced polypeptide were 12.76 kDa and 5.22 respectively. Prediction of three-dimensional structure of VvTrx h4 using the crystal structure of AtTrx h1 from Arabidopsis was consistent with these predictions and with five β-sheets and four α helixes, contains the thioredoxin fold. The deduced protein sequence was shown a high similarity to thioredoxins h isolated from plants, e.g. Populus trichocarpa (89% similar with Pth3) and Citrus cv. Shiranuhi 86% similar with Csh). Phylogenetic studies using of thioredoxin from other plants was indicated that VvTrx h4 gene is a thioredoxin h, belonging to the subclass IA from subgroup I.

  • سیدشرف الدین موسوی، رحیم حداد، قاسمعلی گروسی، رامین حسینی
    جهت بررسی ساختار ژن تیوردوکسین، RNA کل از بافت حبه انگور (Vitis vinifera L.) رقم یاقوتی استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز نسخه برداری معکوس(RT-PCR)، کتابخانه cDNA تهیه گردید. سپس ژن تیوردوکسین h تحت عنوان VvTrxh10 سنتز، جداسازی و در ناقل پلاسمیدی pUC19 همسانه سازی شد. نتایج توالی یابی نشان داد که قطعه همسانه سازی شده از ژن تیوردوکسین h حاوی یک چارچوب قرائت آزاد منفرد به طولbp 345 بوده و پروتئینی با 114 اسید آمینه را کد می کند. بررسی ترجمه پروتئینی توالی رمز کننده نشان داد که این ژن حاوی جایگاه فعال غیر معمولRCGLC، اسید آمینه تریپتوفان ویژه W و یک موتیف ساختاری درگیر در انتقال سلول به سلول در انتهای آمینوی (MAEE) خود می باشد. بررسی فیلوژنتیکی و نیز همردیف سازی چندگانه نشان داد که این آیزوفرم متعلق به زیرگروه I از تیوردوکسین های h است. علاوه بر آن، توالی پروتئینی پیش بینی شده، شباهت زیاد آن را با ژن تیوردوکسین h سایر گیاهان در بانک ژن NCBI نشان داد.
    کلید واژگان: انگور, تیوردوکسین, همسانه سازی, بررسی توالی, رقم یاقوتی}
    Mussavis., S., Haddadr., Garousi, Gh., Hosseini, R
    Total RNA was extracted from grape (Vitis vinifera L.) cv. Yaquti berry tissue to characterize a thioredoxin h gene (VvTrxh10). A cDNA library was synthesized using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Then, the VvTrxh10 gene was amplified, isolated and cloned in a pUC19 vector plasmid. Nucleotide sequence analysis revealed that the cloned cDNA expressed thioredoxin and contained a single open reading frame of 345 bp encoding a protein of 114 amino acid residues. Predicted protein sequence analysis showed that this gene contains a nongeneral catalic site RCGLC, characteristic tryptophan (W) and potential structural motif involving cell-to-cell taransfer (MAEE) in N-terminal. Phylogenetic and alignment studies revealed that such isoform belongs to the subgroup I from h thioredoxins group. Moreovere, relevant predicted protein exhibited a high similarity with the other plant thioredoxins h gene in the NCBI gene bank.
    Keywords: Grapevine, Thioredoxin h, Cloning, Sequence analysis, Yaquti cultivar}
  • حسن ساری خانی، علی عبادی، ذبیح الله زمانی
    در این پژوهش اثر نوع والد پدری بر میزان جوانه زنی تخمک سه رقم انگور استنواسپرموکارپ، ارقام فلیمسیدلس، یاقوتی و عسگری بررسی شد. گلهای این ارقام پس از اخته شدن، با دانه های گرده ارقام پدری، بیدانه سفید (والد بیدانه)، دیزماری یا مهدیخانی (والد دانهدار) و خودگردهافشانی (شاهد) گرده افشانی شدند. تخمکها 40 روز پس از گردهافشانی از حبه ها بیرون آورده و در محیط کشت نیچ و نیچ حاوی یک میکرومولار جیبرلیک اسید، 10 میکرومولار ایندول استیک اسید و 2/0 درصد زغال فعال کشت شدند و پس از جوانه زنی به محیط کشت MS با نصف مقدار نمکها انتقال یافتند. نتایج نشان داد که ژنوتیپ والد پدری بر میزان سیاه شدن و جوانه زدن تخمکها اثر معنی داری داشت، اما روی کالوسدهی، بزرگشدن و متلاشیشدن تخمکها تاثیر معنی داری نداشت. والد پدری بیدانه سفید باعث افزایش درصد سیاه شدن تخمکها و کاهش جوانهزنی آنها در مقایسه با خودگردهافشانی شد. والد پدری دانهدار در تلاقی های مورد آزمایش اثرات متفاوتی را نشان داد. در مقایسه با خودگردهافشانی، دیزماری جوانه زنی تخمکها را افزایش داد ولی مهدیخانی در این رابطه اثر معنی داری نشان نداد. به طور کلی، ژنوتیپ هر دو والد مادری و پدری بر نجات جنین انگورهای استنواسپرموکارپ موثر بودند.
    کلید واژگان: انگور, استنواسپرموکارپ, کشت درون شیشهای, نجات جنین, والد پدری}
    Sarikhanih., Ebadia., Zamani, Z
    The study was conducted to investigate the effect of male parent on embryo rescue of three seedless cultivars, Flame Seedless, Yaghooti and Askary. Pistils of female parents were emasculated and then were pollinated with pollen of Bidaneh Sefid (seedless), Dizmary or Mehdikhani (seeded) and self-pollinated as control. Forty days after full bloom, berries were harvested, ovules were excised and cultured on Nitsch and Nitsch medium containing 1 µM GA3, 10 µM IAA and 2 g/l activated charcoal. Germinated ovules were transferred to 1/2 MS medium. Male parent had significant effect on ovule blackening and ovule germination and no effect on callus formation, ovule growth or ovule collapse. The percentage of blackened ovules was increased when Bidaneh Sefid was used as male parent. However, it reduced the number of germinated ovules in compared with those from self-pollination. The effects of seeded male parents varied for different female parents. Compared with self-pollination, Dizmary increased ovule germination but Mehdikhani had no effect on ovule germination. It was found that embryo development and germination varied greatly with both female and male parent genotypes.
    Keywords: Embryo rescue, Seedlessness, Male parent, In vitro, Stenospermocarpe, Vitis vinifera}
  • محمد غلامی پرشکوهی، مجید رشیدی، بابک بهشتی، سعید عباسی
    یکی از مهم‎ترین مراحل تولید کشمش، فرآیند خشک کردن انگور می باشد. در این مرحله رطوبت اولیه‎ی حصول به 15 تا 17 درصد بر پایه خشک کاهش می یابد. در این تحقیق تاثیر دمای دو مرحله ای و همچنین روش آماده سازی محصول بر روی زمان و آهنگ خشک شدن انگور بیدانه سفید مورد بررسی قرار گرفت. خشک شدن به دو صورت انجام گرفت یکی با دمای ثابت 50، 60، 70 و 80 درجه سانتی گراد و دیگری با دمای دو مرحله ای، برای انجام کار ابتدا نمونه ها تحت دمای 80 درجه سانتی گراد قرار گرفته و پس از رسیدن رطوبت محصول به 50 درصد، دما به 50، 60 و 70 درجه سانتی گراد کاهش پیدا کرد. روش آماده سازی محصول نیز در چهار سطح بدون آماده سازی، آماده‎سازی با آب داغ، آماده‎سازی با کربنات پتاسیم 5% و 4/0% روغن زیتون و آماده‎سازی با هیدروکسید سدیم 5/0% انجام گرفت. نتایج بدست آمده نشان داد که پارامترهای دما و آماده‎سازی محصول اثرات معنی داری بر زمان و متوسط آهنگ خشک شدن دارند. زمان خشک کردن انگور با دمای دومرحله‎ای نسب به خشک کردن با دمای ثابت کم‎تر شده و در بعضی از آماده‎سازی ها تا 61% کاهش می‎یابد. بیش‎ترین و کم‎ترین انرژی فعال‎سازی نیز به ترتیب بین 6/4065 و 8/3015 کیلو ژول بر کیلو‎گرم تعیین شد.
    کلید واژگان: آماده سازی, انرژی فعالسازی, انگور, دمای دو مرحله ای, خشک کردن}
    M.Gholami, M. Rashidi, B. Beheshti, S. Abbasi
    Drying is one of the most important step in raisin processing. During this step, initialmoisture content is decreased up to 15 – 17 percent (d.b). In this research, the effect of two-tempreture and pretreatments on time and drying rate of Thompson seedless grape was studied. Drying was in two steps: First step; temperature at four levels of 50,60,70, and 80 ºC and secound step which samples were placed at two temperatures. In this step, samples were placed at 80 ºC and while moisture content was reduced to 50%, temperature was reduced to 70,60 and 50 ºC. Four pretreatments including hot water, %5 potassium carbonate, %0.4 olive oil, %0.5 sodium hydracids and no pretreatment was performed. According to the results of the ANOVA, factors such as temperature, two-temperature and pretreatment have significant effects on drying time and average drying rate. Drying time of grape with two-temperature in comparison with drying time of constant temperature was decreased, up to 61% for some pretreatment. Maximum and minimum activation energy were determind 893.9, 4538.8 kj/kg.
  • محمد غلامی پرشکوهی، مجید رشیدی، بابک بهشتی
    مدل های ریاضی خشک کردن محصولات در طراحی و بهینه سازی خشک کن ها و نیز برای کنترل مراحل عملیاتی آن ها موثر است. این مدل ها پدیده های خشک کردن را در یک روش واحد بدون توجه به مکانیسم های کنترل تشریح می کنند. در این تحقیق، تغییرات رطوبت انگور بی دانه قرمز در حین فرایند خشک شدن در شرایط مختلف با مدل های هندرسون و پابیس، دو جمله ای، لوییس، پیج، پیج اصلاح شده و تامسون برازش داده شد. در این آزمایش، دما در چهار سطح 50، 60، 70 و 80 درجه سانتی گراد، سرعت جا به جایی هوای گرم در سه سطح 1، 2 و 3 متر بر ثانیه و روش آماده سازی محصول در چهار سطح بدون آماده سازی، آماده سازی با آب داغ، آماده سازی با کربنات پتاسیم 5% و 4/0% روغن زیتون و آماده سازی با هیدروکسید سدیم 5/0% متغیر بود.
    نتایج نشان می دهد که مدل های دو جمله ای و پیج تغییر یافته، برازش قابل قبولی با مقدار رطوبت در حین فرایند خشک شدن دارند.
    کلید واژگان: انگور, خشک شدن, مدل ریاضی}
    M.Gholami, M.Rashidi, B.Beheshti
    Mathematical Models are helpful in designing new or improving existing dryingsystems or for the control of the drying operation. These models describe the dryingphenomena in a unified way, regardless of the controlling mechanism.In this research, Henderson and Pabis, the two-term, Lewis, Page, Modified Page, andThompson equations were used to fit moisture content variations during the drying process., temperature at four levels of 50,60,70, and 80 ºC, and also air velocity at three levels of 1, 2 and 3 m/s, and four pretreatments including hot water, %5 potassiumcarbonate, %0.4 olive oil, %0.5 sodium hydracids and no pretreatment was varied.Results showed that Moisture variations during the drying process fit to the two-termsand changed Page models well.
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال