به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « تنش شوری » در نشریات گروه « بیوتکنولوژی و ژنتیک گیاهی »

تکرار جستجوی کلیدواژه « تنش شوری » در نشریات گروه « کشاورزی »
  • مهدیه زارع کهن*، نادعلی باباییان جلودار، رضا اقنوم، سید علی طباطبایی، محمدرضا قاسمی نژاد رائینی
    Mahdiyeh Zare-Kohan *, Nadali Babaeian Jelodar, Reza Aghnoum, Seyed Ali Tabatabaee, Mohammadreza Ghasemi-Nezhadraeini

    In this study molecular markers associated with morpho-physiological traits were identified using 14 AFLP primer combinations and 32 SSRs primer pairs across a cohort of 148 barley cultivars employing the association mapping approach. Phenotypic analysis was carried out using an alpha-lattice design with five incomplete blocks replicated twice under normal and salinity stress conditions (EC = 12 dS m-1) in two growing seasons. Population genetic structure was divided into two subpopulations (K = 2). In the present association panel, the mean of D´and r2, indicators for linkage disequilibrium (LD) were estimated at 0.25 and 0.02, respectively. The mixed linear model identified 194 significant marker-trait associations for nine studied traits under normal and salinity stress conditions. Several quantitative trait loci (QTLs) were stable for plant height, number of grains per spike, grain weight per spike, and leaf proline content traits under each of the environmental conditions, and termed stable QTLs. In addition, some stable QTLs were common to several traits and thereby enable barley breeder to undertake a concurrent selection of multiple traits to develop high-yielding cultivars. The identified markers could be useful in the implementation of marker-assisted selection in barley to improve the efficiency of selecting genotypes for salinity tolerance.

    Keywords: Association mapping, barley, Linkage disequilibrium, Mixed linear model, Salinity stress, Stable QTLs}
  • یگانه شفیعی، سدابه جهانبخش گده کهریز*، سلیم فرزانه، سیده یلدا رئیسی ساداتی

    گیاه سویا در تغذیه انسان از ارزش فراوانی برخوردار است، به طوری که پروتیین فرآوری شده سویا، جایگزین پروتیین های حیوانی مصرف روز افزون یافته است. عمده ترین تنش محیطی در اکثر مناطق جهان، شوری می باشد که رشد و عملکرد محصولات زراعی را محدود کرده است. لذا هدف از این تحقیق بررسی تغییرات الگوی پروتیینی دو رقم سویا تحت تنش شوری با استفاده از تکنیک الکتروفورز دو بعدی می باشد. آزمایشی در سال زراعی 1399-1398 به صورت فاکتوریل بر پایه طرح کاملا تصادفی با سه تکرار در دانشگاه محقق اردبیل اجرا شد. فاکتورهای آزمایش شامل فاکتور اول تنش شوری (0، 3، 6 و 9 دسی ‏زیمنس بر متر) و فاکتور دوم ژنوتیپ های سویا (DPX و آرین) بودند. یافته ها نشان داد‏ با انجام الکتروفورز دو بعدی تعدادی لکه پروتیینی تکرار پذیر شناسایی شد که از این تعداد، 14 لکه پروتیینی مربوط به رقم DPX در سطح احتمال پنج درصد معنی دار بود و 11 لکه پروتیینی در رقم آرین تغییرات بیان معنی داری را در سطوح مختلف تنش شوری نشان دادند. همچنین 55 درصد از پروتیین های شناسایی شده کاهش بیان و 19 درصد افزایش بیان داشتند. پروتیین های شناسایی شده در مسیرهای متابولیکی مختلف مانند متابولیسم انرژی، فتوسنتز، تنفس، فعالیت های آنتی اکسیدانی، انتقال پیام، ترجمه، نسخه برداری و دیواره سلولی نقش دارند. بیشتر پروتیین های مشترک در ارقام DPX و آرین از آنزیم های کلروپلاستی و تعدادی هم از آنزیم های میتوکندریایی بودند. بیشترین تغییرات در رقم DPX (متحمل به شوری) و نهایتا کمترین تغییرات در رقم حساس آرین مشاهده شد که نشان دهنده تلاش بیشتر رقم DPX برای کاهش خسارت ناشی از تنش شوری است.

    کلید واژگان: الکتروفورز دو بعدی, پروتئین کل, تنش شوری, سویا}
    Yeganeh. Shafiei, Sodabeh Jahanbakhsh Godehkahriz*, Salim Farzaneh, Seyedeh Yalda Raisi Sadati

    Soybean plant has a lot of value in human nutrition, so the processed soy protein is a substitute for animal proteins, which is increasingly consumed. The main environmental stress in most regions of the world is salt stress, which has limited the growth and performance of crops. Therefore, the purpose of this research is to investigate the changes in the protein pattern of two soybean cultivars under salt stress using two-dimensional electrophoresis technique. An experiment was carried out in the crop year of 2018-2019 as a factorial based on a completely randomized design with three replications in University of Mohaghegh Ardabil. The test factors included the first factor of salinity stress (0, 3, 6 and 9 dS/m) and the second factor of soybean genotypes (DPX and Arian). To study and identify the proteins related to leaf development stages, total protein was extracted from soybean leaves based on TCA-acetone method and separated by two-dimensional electrophoresis method. In order to perform electrophoresis in the first dimension, an 18 cm strip gel with pH = 4-7 was used. The second dimension was put on 11 Percent acrylamide gel by SDS-PAGE method, and the electrophoresis device was first performed for 30 minutes with 50 V and then for 3 hours with 165 V. The findings showed that by performing two-dimensional electrophoresis, a number of reproducible protein spots were identified, of 14 protein spots related to DPX cultivar were significant at the five percent probability level, and 11 protein spots were in Arian cultivar. They showed significance in different levels of salinity stress. Also, 55 Percent of the detected proteins showed decreased expression and 19 Percent increased expression. 26 Percent of the identified proteins did not have regular and significant changes. The identified proteins are involved in various metabolic pathways such as energy metabolism, photosynthesis, respiration, antioxidant activities, message transmission, translation, transcription and cell wall. Most of the common proteins in DPX and Arian cultivars were chloroplastic enzymes and some of them were mitochondrial enzymes. The most changes were observed in the DPX variety (tolerant to salinity) and finally the least changes were observed in the sensitive Arian variety, which indicates the greater effort of the DPX variety to reduce the damage caused by salinity stress.

    Keywords: salt stress, soybean, two-dimensional electrophoresis, total protein}
  • الهام عبیدنژاد، مهدی منصوری*، حمیدرضا کاوسی
    هدف

    سوکروز یا ساکارز محصول اصلی فتوسنتز در گیاهان می‏باشد که نقش‏های مهمی در رشد، نمو، ذخیره انرژی، انتقال سیگنال و سازگاری با تنش های محیطی دارد. ژن سوکروز فسفات فسفاتاز (SPP)، آخرین مرحله در مسیر بیوسنتز سوکروز که یک واکنش غیر برگشت پذیر است را کاتالیز می کند. در این پژوهش ژن های اورتولوگ SPP در گندم نان و گونه های اجدادی آن شناسایی و انتخاب شد و تغییرات میزان بیان آنها در پاسخ به تنش شوری مورد ارزیابی قرار گرفت.

    مواد و روش ها

    بذور گندم نان (Triticum aestivum CV. Rooshan) ، گندم دوروم (Triticum turgidum CV. Hana) و آجیلوپس (Aegilops tauschii) از موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر کرج تهیه شد. استخراج RNA از بافت های ریشه و برگ گیاهان کنترل و تحت تیمار (NaCl 200 mM) انجام شد و تغییرات بیان با روش qRT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. به منظور مطالعه رخدادهای تکاملی و شناسایی روابط فیلوژنی بین اورتولوگ ها و پارالوگ های ژن SPP، درخت ژنی رسم شد. با استفاده از ابزار آنلاین psRNATarget امکان تنظیم پس از رونویسی با واسطه miRNA ها نیز مورد ارزیابی قرار گرفت.

    نتایج

    نتایج آنالیز فیلوژنی نشان داد که بر روی کروموزوم های 1 و 5 گندم نان، گندم دوروم و آجیلوپس به ترتیب 6، 4 و 2 ژن پارالوگ SPP تکامل یافته است. هم چنین مشخص شد که 16 miRNA متفاوت می توانند برخی از رونوشت ژن های SPP را در گندم نان و آجیلوپس، به عنوان ژن هدف شناسایی نمایند. نتایج تغییرات بیان ژن نیز نشان داد که در بافت ریشه و برگ گندم نان در پاسخ به تنش شوری بیان ژن SPP افزایش یافت اما در گندم دوروم کاهش بیان ژن SPP مشاهده شد. واکنش گیاه آجیلوپس به تنش شوری متفاوت بود به طوری که در بافت برگ کاهش بیان ولی در بافت ریشه افزایش بیان ژن SPP مشاهده شد.

    نتیجه گیری

    تنظیم پس از رونویسی با واسطه miRNA ها می تواند نقش مهمی در تنظیم متابولیسم پیچیده سوکروز و بطور ویژه تنظیم بیان ژن SPP داشته باشد. نتایج بیان ژن نشان داد که گیاه گندم نان تحت شرایط تنش شوری تولید سوکروز را افزایش داد در حالی که در گندم دوروم که حساسیت بیشتری به تنش شوری دارد تحت شرایط تنش شوری تولید سوکروز مختل و یا کاهش یافت که این کاهش تولید سوکروز در کنار سایر اثرات مخرب تنش شوری در کاهش عملکرد نقش خواهد شد.

    کلید واژگان: سوکروز, بیان ژن, تنش شوری}
    Elham Obeidnejad, Mehdi Mansouri *, Hamid Reza Kavousi
    Objective

    Sucrose, the final product of photosynthesis, plays important roles in growth, development, storage, signal transduction, and acclimation to environmental stresses in higher plants. Sucrose-phosphate phosphatase (SPP) catalyzes the final irreversible step in the sucrose biosynthesis pathway. In this study, the SPP orthologous genes in wheat and progenitors were selected, and the expression regulation of the orthologous SPP genes were analyzed in response to salinity stress.

    Materials and methods

    Seeds of bread wheat (Triticum aestivum CV. Rooshan), durum wheat (Triticum turgidum CV. Hana), and Aegilops tauschii were provided by the Seed and Plant Improvement Institute, Karaj, Iran. In order to quantify the expression of SPP genes, qRT-PCR was performed on total RNA extracted from leaf and root tissues of control and salt-treated (NaCl 200 mM) samples. A gene tree was constructed to calculate the evolutionary and phylogenetic relationships of the SPP protein family in bread wheat and its progenitors. The possibility of post-transcriptional regulation of the SPP genes was also evaluated using the online tool psRNATarget.

    Results

    The results of the phylogenetic analysis showed that 6, 4, and 2 SPP paralogous genes have evolved on chromosomes 1 and 5 of bread wheat, durum wheat, and Ae. tauschii, respectively. Additionally, We predicted 16 different microRNAs can target some of the SPP gene transcripts in bread wheat and Ae. tauschii. Gene expression results also indicated that SPP gene expression increased in the root and leaf tissues of bread wheat in response to salinity stress, while it decreased in durum wheat. The response of Ae. tauschii to salinity stress was different, with decreased expression observed in leaf tissue but increased expression in root tissue.

    Conclusion

    Post-transcriptional regulation through miRNAs can play an important role in the regulation of the complex sucrose metabolism, especially in the regulation of SPP gene expression. Gene expression results showed that under salinity stress conditions, bread wheat increases sucrose production, while in durum wheat, which is more sensitive to salinity stress, sucrose production is disrupted or decreased. This reduction in sucrose production can lead to a decrease in yield.

    Keywords: Sucrose, Gene expression, Salinity stress}
  • شیما جمالی راد، محمدرضا عظیمی*، نیر اعظم خوش خلق سیما، محمدرضا غفاری

    Suaeda salsa یک شبه هالوفیت یکساله با ارزش غذایی و تحمل شوری بالا بوده که به عنوان یک گیاه روغنی، دارویی و خوراکی بسیار حایز اهمیت می باشد. در حال حاضر مطالعات محدودی در زمینه بررسی تنوع متابولیکی در گیاه S. salsa وجود دارد. در این مطالعه برای درک شاخص تحمل به شوری با استفاده از بررسی تنوع متابولیکی پروفایل اسیدهای آمینه در گیاه S. salsa در غلظت های 0، 200 و 800 میلی مولار NaCl مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج بررسی فیزیولوژیک نشان داد، شوری به صورت معنی داری، محتوای سدیم (Na+) را در اندام های هوایی گیاه تحت تاثیر قرار می دهد، به طوریکه میزان آن در اندام های هوایی گیاه S. salsa در مقایسه با شاهد افزایش معنی داری نشان داد. علاوه بر این تجزیه به مولفه های اصلی نتایج نشان داد که تفاوت در تنوع متابولیکی قادر است 96 درصد از تغییرات فنوتیپی در گیاه S. salsa را تحت شوری توجیه نماید. مقایسه پروفایل اسیدهای آمینه در سطوح مختلف شوری نشان داد پرولین، متیونین، سترولین و لیزین بیشترین تجمع را تحت تنش 800 میلی مولار دارا می باشند. با توجه به نقش مهم این اسیدهای آمینه در کنترل تنش شوری مطالعات بیشتر برای کشف مکانیزم های سازگاری تحمل به شوری در گیاه S. salsa ضروری است.

    کلید واژگان: پروفایل اسیدهای آمینه, تنش شوری, Suaeda salsa}
    Shima Jamalirad, MohammadReza Azimi *, Nayer Azam Khoshkholgh Sima, MohammadReza Ghaffari

    Suaeda salsa is an annual halophyte with nutritional value and high salt tolerance, making it crucial as an oil, medicinal, and edible plant. Currently, there is limited research in the field investigating metabolic diversity in S. salsa. In this study, our aim was to understand the salinity tolerance mechanism by examining metabolic diversity, specifically the amino acids profile, in S. salsa exposed to 0 mM, 200 mM, and 800 mM NaCl. The results of the physiological study indicated that salinity significantly affected the sodium (Na+) content in the aerial parts of the plant, with a significant increase compared to the control. Principal component analysis (PCA) revealed that differences in metabolic diversity can explain 96% of the phenotypic variation in S. salsa under salinity stress. Comparison of amino acids profiles at different salinity levels showed the highest accumulation of proline, methionine, citrulline, and lysine under 800 mM salt stress. Given the crucial role of these amino acids in S. Salsa,further studies are necessary to uncover the mechanisms behind the adaptation response.

    Keywords: Amino acids profile, salinity stress, Suaeda salsa}
  • آفاق یاوری، قادر حبیبی، معصومه عابدینی، غلامرضا بخشی خانیکی

    شوری یکی از مهم ترین تنش های غیرزیستی است که بر عملکرد بذر و تولید محصول تاثیر می گذارد. شوری باعث اثرات نامطلوب مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی بر گیاه گندم می شود. در این پژوهش، اثرات پرایمینگ بذر (پرولین 1 میلی مولار) بر پاسخ گیاه گندمTriticum aestivum L.)) به تنش شوری در شرایط اقلیم پذیر و غیر اقلیم پذیر، مورد بررسی قرار گرفت. بذور گندم تحت اقلیم پذیری و پرایمینگ بذر با پرولین (1 میلی مولار) به مدت 12 ساعت قرار گرفتند. سپس بذرها در گلدان های حاوی خاک شور (EC=26.5 دسی زیمنس بر متر) کاشته شدند و رشد گیاه و پارامترهای فیزیولوژیکی، مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که در شرایط بدون تنش، عملکرد بذر با تیمار پرولین افزایش یافت. پیش تیمار بذرها با پرولین تحت تنش شوری، عملکرد فتوسنتزی آنها را در مقایسه با اقلیم پذیری، حفظ کرد. نتایج بررسی صفات وزن خشک اندام هوایی همراه با اندازه گیری مالون دی آلدیید نشان داد که اقلیم پذیری با غلظت کم نمک، نمی تواند اثر بازدارندگی شوری بالا (EC=26.5 دسی زیمنس بر متر) را کاهش دهد. بنابراین، تحقیقات بیشتری برای بهینه سازی پروتکل اقلیم پذیری، عوامل اسموپرایمینگ بذر و شرایط محیطی برای افزایش تحمل گیاه گندم به تنش شوری مورد نیاز است

    کلید واژگان: املاح سازگار, آنزیم های آنتی اکسیدانی, تنش شوری, حافظه تنش القایی, فلورسانس کلروفیل}
    Afagh Yavari, Ghader Habibi, Masoumeh Abedini, Gholamreza Bakhshi Khaniki

    Salinity is one of the most important abiotic stresses that affects seed yield and crop production. Salinity causes adverse morphological, physiological and biochemical effects on wheat seedlings. In this research, the effects of seed priming (1 mM proline) on the response of wheat plants (Triticum aestivum L.) to salinity stress in acclimatized and non-acclimatized conditions were investigated. Wheat seeds were subjected to acclimatization and seed priming with proline (1 mM) for 12 hours. Then, the seeds were planted in pots containing saline soil (EC=26.5 dS/m) and plant growth and physiological parameters were investigated. The results showed that in non-stressed conditions, seed yield increased with proline treatment. Pretreatment of seeds with proline under salinity stress preserved their photosynthetic performance compared to acclimatization. The results of examining the characteristics of shoot dry weight along with the measurement of malondialdehyde showed that acclimatization with low salt concentration cannot reduce the inhibitory effect of high salinity (EC=26.5 dS/m). Therefore, more research is needed to optimize the acclimatization protocol, seed osmopriming factors and environmental conditions to increase plant tolerance to salinity stress

    Keywords: Antioxidant enzymes, Chlorophyll fluorescence, Compatible solutes, Induced stress memory, Salinity stress}
  • سیاوش صلحی اندراب، ورهرام رشیدی*، حسین شهبازی، فرهاد فرح وش، علیرضا احمدزاده

    به منظور تعیین وراثت پذیری برخی صفات فیزیولوژیکی تحت تنش شوری در ارقام جو، یک تلاقی دی آلل 7×7 یکطرفه در سال 1396- 1395 در دانشگاه آزاد اسلامی واحد اردبیل، انجام شد. بذور F1 حاصل به همراه والدین در یک آزمایش گلدانی در گلخانه و در شرایط بدون تنش (شاهد) و تنش شوری 8 و 12 دسی زیمنس بر متر، کاشته شدند. بعد از اعمال تنش شوری، صفاتی نظیر شاخص کلروفیل برگ، پارامترهای فلورسانس کلروفیل و هدایت روزنه ای، اندازه گیری شدند. وراثت پذیری خصوصی صفات از 16/0 تا 54/0 متغیر بود، در حالیکه وراثت پذیری عمومی صفات، بالا بوده و از 70/0 تا 87/0 متغیر بود. درجه متوسط غالبیت در تمام موارد بزرگتر از یک بود که حاکی از کنترل صفات توسط اثرات فوق غالبیت است. ضریب همبستگی بین میانگین والدین و جهت غالبیت نشان داد در صفت هدایت روزنه ای، آلل های غالب باعث افزایش مقدار صفات مذکور می شوند. در حالیکه در بقیه صفات، چنین رابطه ای مشاهده نگردید. بر اساس اثرات قابلیت ترکیب عمومی (GCA) می توان نتیجه گرفت که والدین افضل، ریحان و صحرا، آلل های مطلوبی برای هدایت روزنه ای دارند. ارقام افضل، نصرت، و یوسف، آلل های مطلوبی برای محتوی کلروفیل داشتند و ارقام افضل، نصرت، والفجر و کویر، آالل های مناسبی برای فلورسانس کلروفیل دارا بودند. با توجه به اینکه هدایت روزنه ای در بین صفات، بیشترین وراثت پذیری خصوصی را داشته و با توجه به سرعت بالای غربالگری توسط دستگاه های هدایت سنج و توان عملیاتی بالا، می توان از این صفت در گزینش تحمل به شوری در نسل های اولیه اصلاحی جو استفاده کرد

    کلید واژگان: تنش شوری, جو, دی آلل, صفات فیزیولوژیکی, وراثت پذیری}
    Siavash Solhi Andarab, Varahram Rashidi *, Hossein Shahbazi, Farhad Farahvash, Alireza Ahmadzadeh

    In order to determine the heritability and genetic parameters of physiological traits related to salinity stress in barley (Hordeum vulgare L.), a 7×7 half diallel cross was conducted at Islamic Azad University, Ardabil, during 2016-2017. The F1 seeds along with their parents were grown in greenhouse under non-stress, 8 and 12 dS/m salinity stress levels. After exposure of plants to salinity, leaf chlorophyll content, chlorophyll fluorescence and stomatal conductance were measured. Narrow sense heritability of chlorophyll content ranged from 0.29 to 0.40. These values for chlorophyll fluorescence ranged from 0.16 to 0.24 and for stomatal conductance ranged from 0.26 to 0.54. Broad sense heritability of traits was high and ranged from 0.70 to 0.87. The degree of average dominance was higher than one in all of traits, indicating the presence of over dominance in control of the traits. Dominant alleles were favorable, in stomatal conductance however such relation was not observed in leaf chlorophyll content and chlorophyll fluorescence

    Keywords: barley, diallel, heritability, Physiological traits, salinity stress}
  • خدیجه عباس زاده، رضا شیرزادیان خرم آباد*، محمدمهدی سوهانی، زهرا حاجی احمدی

    تنش شوری بر خصوصیات مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و فرآیندهای بیوشیمیایی گیاهان تاثیرگذار است. گیاهان تراریخته Bt نقش بسزایی در کنترل آفات برخی از محصولات استراتژیک دارند، اما توان و مقاومت این گیاهان از منظر تنش های محیطی موردتوجه قرار نگرفته است؛ بنابراین اثر تنش شوری در سطوح 0، 50، 100، 150 و 200 میلی مولار بر صفات مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و مولکولی گیاهان تراریخته نسل T3 گوجه فرنگی حاوی ژن cry1Ab (CH-Falat-Bt) همراه با رقم غیرتراریخته (CH-Falat) مورد بررسی قرار گرفت. بررسی صفات مورفولوژیک (سطح برگ، عمق ریشه، وزن تر و خشک ریشه) در سطوح مختلف شوری حاکی از برتری گیاه تراریخته CH-Falat-Bt بر غیرتراریخته CH-Falat بود. میزان محتوای آب نسبی گیاه و کاروتنویید در گیاهان تراریخته به طور معنی داری بیشتر از گیاهان غیرتراریخته بود. محتوای کلروفیل در سطوح تنش شوری 150 و 200 میلی مولار به ترتیب 12 و 9 درصد بیشتر از غیرتراریخته بود. نشت الکترولیت در گیاهان تراریخته نسبت به غیرتراریخته به طور قابل ملاحظه ای کاهش داشت. تجمع پرولین و قندهای محلول در گیاهان تراریخته به طور معنی داری افزایش نشان داد. بیان نسبی ژن های SOS1 و SOS2 با افزایش میزان تنش شوری در گیاهان تراریخته CH-Falat-Bt نسبت به گیاهان غیرتراریخته CH-Falat افزایش قابل توجهی نشان داد. نتایج بررسی های مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و مولکولی نشان داد که اثرات نامطلوب تنش شوری گیاهان تراریخته CH-Falat-Bt نسبت به غیرتراریخته کمتر بود و درمجموع، در مقایسه با ژنوتیپ غیر تراریخت، گیاهان تراریخته به سطوح مختلف شوری اعمال شده متحمل هستند.

    کلید واژگان: تنش شوری, گوجه فرنگی, Bt, cry1Ab, SOS1, SOS2}
    Khadijeh Abbaszadeh, Reza Shirzadian-Khorramabad*, MohammadMahdi Sohani, Zahra Hajiahmadi

    Salinity stress affects morpho-physiological and biochemical traits of plants. The transgenic Bt plants play a significant role in pest control, but their response and ability to cope with environmental stresses still need to be evaluated. Therefore, effect of salinity stress at 0, 50, 100, 150, and 200 mM on morphological, physiological, and molecular traits of T3 transgenic tomato plants containing cry1Ab gene (CH-Falat-Bt) was investigated and compared with that of the non-transgenic control (CH-Falat). Evaluation of the morphological traits (leaf area, root length, fresh and dry weight of roots) at different salinity levels revealed that CH-Falat-Bt transgenic plants are more tolerant to salinity stress compared to CH-Falat non-transgenic plants. The chlorophyll content at 150 and 200 mM salinity levels was 12 and 9% plants, respectively. Moreover, the amount of RWC, carotenoids, proline and soluble sugars increased significantly in transgenic plants as salinity levels increased. The relative expression of SOS1 and SOS2 genes showed a significant increase in all salinity levels in CH-Falat-Bt transgenic plants compared to CH-Falat non-transgenic plants. The amount of electrolyte leakage in the transgenic plants was significantly reduced compared to the non-transgenic plants. The results of morphological, physiological, and molecular investigations of CH-Falat-Bt transgenic plants confirmed that the undesirable effects of salinity stress on transgenic plants is much less than non-transgenic ones. in general CH-Falat-Bt transgenic plants are more tolerant to different applied salinity levels than the wild variety.

    Keywords: Salt stress, Tomato, Bt, Cry1Ab, SOS1, SOS2}
  • الینا نظری خاکشور، امین آزادی*، پیمان فروزش، علیرضا اطمینان، اسلام مجیدی هروان

    تنش شوری یکی از مهم ترین عوامل محدودکننده محیطی در تولید انواع محصولات کشاورزی از جمله گندم است، به طوری که تولید ارقام جدید متحمل به شوری می تواند یکی از راه کارهای موثر در کاهش اثرات تنش در نظر گرفته شود. در این راستا، شناسایی ژن های موثر و مکانیسم های مولکولی درگیر در ایجاد تحمل شوری گامی مهم برای برنامه های بهنژادی به شمار می رود. در مطالعه حاضر، یک جمعیت از لاین های اینبرد نوترکیب (RIL) F12 شامل 186 ژنوتیپ برای شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده برخی ویژگی های فیزیولوژی و میزان عناصر در مرحله گیاهچه ای گندم در شرایط تنش شوری مورد بررسی قرار گرفتند. در مجموع دوازده QTL اصلی با استفاده از آنالیز مکان یابی فاصله ای مرکب (CIM) برای وزن تر، وزن خشک، طول، میزان سدیم و پتاسیم ریشه شناسایی شدند. بیشترین تعداد QTLهای شناسایی شده بر روی کروموزوم های B وD قرار داشتند. تجزیه هستی شناسی ژن ها (Gene ontology) انجام و ژن های کاندید در ناحیه QTL شناسایی شدند؛ اگرچه قابل ذکر است که ژن های کاندید (CG)، برای تایید، نیازمند شناسایی به کمک نشانگر هستند. در مجموع اولویت بندی ژن ها منتهی به تعیین 3486 ژن کاندید در 19 عبارت GO (شامل 8 فرآیند زیستی) شد که در فرآیندهای متابولیسم گلوتاتیون، کاتابولیک ال-فنیل آلانین، ترجمه سیتوپلاسمی، مسیر پیام رسانی فعال شده با اکسین، تنظیم رونویسی، DNA-الگو، پروتوپورفیرینوژن IX، سازمان و پیدایش دیواره سلولی، متابولیسم Xyloglucan، آمینوسیلاسیون لوسیل-tRNA، گلیکوزیلاسیون پروتیین، تنظیم رونویسی، بیوسنتز رنگ دانه و غیره نقش دارند. این روش (Gene ontology) ممکن است برای شناسایی CGهای جدید ارایه شود که QTL مربوطه، مسیول صفات پیچیده است.

    کلید واژگان: تنش شوری, گندم نان, ژن کاندید, نقشه برداری QTL}
    Elina Nazari Khakshoor, Amin Azadi*, Peyman Fourozesh, Alireza Etminan, Eslam Majidi Hervan

    Salinity stress falls into the major environmental factors that limit the production of various crops, including wheat. An effective approach to reducing the impacts of stress is the production of new salinity-tolerant cultivars. Accordingly, identifying effective genes and molecular mechanisms responsible for salinity tolerance is an essential step for breeding programs. In this investigation, a population of F12 recombinant inbred lines (RIL) comprising 186 genotypes was studied to identify the loci that control some physiological traits and element concentrations in the wheat seedling stage under salinity stress. Totally, 12 quantitative traits loci (QTLs) were identified for wet weight, dry weight, length, and sodium and potassium contents using the composite interval mapping (CIM) analysis. Most of the identified QTLs were located on chromosomes B and D. A gene ontology (GO) analysis specified candidate genes in QTL regions. However, it is noteworthy that candidate genes need confirmation using marker-assisted identification. The prioritization of genes resulted in determining 3486 candidate genes in 19 GO phrases (including eight biological processes). These genes are involved in the processes of glutathione metabolism, L-phenylalanine catabolism, cytoplasmic translation, auxin-activated signaling pathway, transcriptional regulation, DNA-patterning, protoporphyrinogen IX, cell wall organization and genesis, xyloglucan tRNA metabolism, protein glycosylation, pigment biosynthesis, etc. GO may be introduced for identifying novel CGs in which the associated QTL is responsible for complicated traits.

    Keywords: Salinity stress, Bread wheat, Candidate genes, QTL mapping}
  • راضیه قربانی، راحله قاسم زاده*، هادی علی پور

    به منظور شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده صفات مورفو-فیزیولوژیک گیاهچه در 88 رقم گندم نان، آزمایشی در شرایط نرمال و تنش شوری 120 میلی مولار (معادل 12 دسی زیمنس بر متر)، در قالب طرح آلفا لاتیس ساده در گلخانه دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه در سال زراعی 1400-1399 انجام شد. صفات میزان کلروفیل a، b و کل، کا روتنویید، پرولین، وزن تر و خشک گیاهچه، طول گیاهچه، محتوای نسبی آب برگ (RWC) و غلظت یون ها (سدیم، پتاسیم و نسبت پتاسیم به سدیم) اندازه گیری شدند. پس از ژنوتیپ سنجی به وسیله توالی یابی با فناوری Ion Torrent و حذف SNPهایی با بیش از 20 درصد داده گمشده و فراوانی آلل جزیی کمتر از 5 درصد، تعداد 5869 SNP شناسایی شد. بر اساس نقشه یابی ارتباطی با روش مدل خطی مخلوط (MLM) برای شرایط نرمال در مجموع 25 ارتباط نشانگر-صفت (MTA) شناسایی شد. ژنوم A بیشترین و ژنوم D کمترین تعداد MTA را به خود اختصاص دادند. در بین صفات مورد بررسی در شرایط نرمال، کلروفیل a بیشترین تعداد MTA را روی کروموزوم های 1A، 3B، 3D، 5B و 7A نشان داد و برای شرایط تنش شوری 21 MTA شناسایی شد که ژنوم B بیشترین تعداد MTA و ژنوم D کمترین تعداد MTA را به خود اختصاص دادند. برای وزن تر گیاهچه پنج MTA شناسایی شد که روی کروموزوم های 4A و 6B قرار داشتند. نتایج پژوهش حاضر، اطلاعات ارزشمندی در ارتباط با مکان های ژنی مرتبط با صفات مورد مطالعه ارایه می دهد که می توان پس از تایید در جمعیت های دو والدی و آزمایش های تکمیلی، در برنامه های به نژادی گندم در گزینش به کمک نشانگر از این یافته ها استفاده نمود.

    کلید واژگان: ارقام گندم نان, تنش شوری, نشانگرهای SNP, نقشه یابی ارتباطی}
    Razieh Ghorbani, Raheleh Ghasemzadeh*, Hadi Alipour

    In order to identify loci controlling seedling morpho-physiologic characteristics in 88 bread wheat cultivars, a greenhouse experiment based on simple alpha lattice was conducted under both normal and 120 mM (12 ds/m) salt stress condition of the Faculty of Agriculture, Urmia University in 2020-2021 cropping season. Chlorophyll a, b and carotenoid content, proline, plant fresh and dry weight, plant height and leaf relative water content (RWC), Na+, K+ and K+/Na+ concentrations were measured. After genotyping by sequencing with Ion Torrent technology and removal of SNPs with more than 20% of missing data and minor allele frequency less than 5%, a total of 5869 SNP markers were identified. Based on association mapping with the mixed linear model (MLM) method, a total of 25 marker-trait associations were detected under normal conditions. The A and D genomes had the highest and lowest number of significant marker-trait associations (MTAs). Among the studied traits under normal conditions, chlorophyll a had the highest number of MTAs on 1A, 3B, 3D, 5B, 7A chromosomes with eight MTAs. A total of 21 MTAs were identified under salt stress conditions which the genome B and D had the highest and lowest number of MTAs, respectively. Five MTAs were identified for plant fresh weight, which were located on chromosomes 4A and 6B. The results of this study provide valuable information about the loci associated with the studied traits, which can be used in marker assisted selection in wheat breeding programs after confirmation in biparental populations and additional experiments.

    Keywords: Bread wheat cultivars, GWAS, Salt stress, SNP markers}
  • رامین خدادادی، نازنین امیر بختیار، بهزاد سرخی لله لو، مسعود سلطانی نجف آبادی*
    تنش شوری به عنوان یکی از عوامل محیطی مهم کاهش دهنده رشد و عملکرد گیاهان زراعی است. شناسایی اجزای اصلی و کلیدی درگیر در شبکه های پاسخ به تنش در تولید ارقام متحمل گندم و جو از طریق مهندسی ژنتیک و اصلاح مولکولی از اهمیت ویژه ای برخوردار است. در پژوهش اصلی حاضر به منظور شناسایی ژن ها و سازوکار های حفظ شده دخیل در پاسخ به تنش شوری در گیاهان گندم،  جو و گیاه مدل آرابیدوپسیس، داده های ریزآرایه مربوط به دو گونه تک لپه، گندم (دو سری داده) و جو (دو سری داده) با سطوح مختلف شوری و گیاه مدل دو لپه آرابیدوپسیس (یک سری داده) در بافت برگ تجزیه و تحلیل شدند. این داده ها از سایت NCBI  قسمتGEO استخراج شدند. به منظور پیدا کردن ژن های مشترک پاسخ دهنده در سه گونه گیاهی مورد بررسی، اورتولوگ آرابیدوپسیسی ژن های پاسخ دهنده به شوری در دو گیاه گندم و جو با استفاده از BLASTx در مقابل بانک اطلاعاتی پروتیینی آرابیدوپسیس تعیین شدند. ترسیم نمودارVenn بین 208 ژن پاسخ دهنده در جو، 1336 ژن پاسخ دهنده در گندم و 4527 ژن پاسخ ‍‍ دهنده در آرابیدوپسیس، منجر به شناسایی 25 ژن مشترک پاسخ دهنده به تنش شوری شد. بررسی عملکرد ژن های مذکور نشان داد که این ژن ها به طور حفاظت شده از طریق مشارکت در مسیرهای مرتبط با سیگنال دهی تنش، هموستازی یونی، هموستازی گونه های اکسیژن فعال، حفاظت اسمزی، هموستازی انرژی و لیگینی شدن در پاسخ سه گیاه مورد مطالعه به تنش شوری نقش دارند. مدل پیشنهادی نشان دهنده نحوه مداخله ژن های مذکور در مسیرهای پاسخ به تنش ارایه شد.
    کلید واژگان: تنش شوری, ژن های حفاظت شده, ریزآرایه, تک لپه, دولپه}
    Ramin Khodadadi, Nazanin Amirbakhtiar, Behzad Sorkhilalehloo, Masood Soltani Najafabadi*
    Salt stress is one of the important environmental factors that adversely affects plant growth and yield. Identification of key components involved in the stress response networks is the important task in development of tolerant varieties through genetic engineering and molecular breeding programs. Here, we have performed comprehensive bioinformatics analysis to identify conserved genes and mechanisms involving in salt stress response across monocots, wheat and barley and dicot Arabidopsis. The microarray data were retrieved from GEO dataset at NCBI, which were already generated through experiments on the leaves of mentioned species under various stress conditions. Arabidopsis orthologues of salt responsive genes from wheat and barley were recognized by performing BLASTx compared with Arabidopsis protein database. We identified 208, 1336, and 4527 salt responsive genes from barley, wheat, and Arabidopsis, respectively, where 25 genes were common and considered as conserved salt responsive genes among species. The conserved genes are involved in stress signaling, ion homeostasis of ions, reactive oxygen species homeostasis, and energy, osmoprotectant mechanisms, and cell wall lignification pathways by exposing to salt stress in the three species. The theoretical gene co-expression network during signaling pathway was also presented in the salt stress condition.
    Keywords: salt stress, microarray, conserved genes, monocot, dicot}
  • سید حمیدرضا هاشمی پطرودی*، سمیرا محمدی، اسماعیل بخشنده، مارکوس کولمن
    پروتیین فسفاتازهای (PP2Cs) 2C، نقشی کلیدی در بیان ژن های پاسخگو به تنش از موجودات پست پروکاریوتی تا یوکاریوت های عالی ایفا می نمایند. در این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی اعضای خانواده ژنی PP2C به منظور شناسایی و تجزیه و تحلیل ژن های اورتولوگ مرتبط با تنش در ژنوم گیاه هالوفیت علفی یک لپه Aeluropus littoralis انجام شد. در مجموع 34 ژن AlPP2C بر اساس ساختار اختصاصی دمین PP2C، در ژنوم این گیاه شناسایی گردید. در درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده از پروتیین های AlPP2C همراه با پروتیین های thaliana Araboidopsis، پروتیین های AlPP2C و AtPP2C در ده گروه مختلف بر مبنای همولوژی طبقه بندی شدند. تجزیه و تحلیل موتیف های حفاظت شده پروتیین های خانواده AlPP2C نشان داد که گروه بندی فیلوژنتیکی از تطابق بالایی با الگوی پراکنش موتیف های هر گروه داشت. تجزیه و تحلیل ساختار اگزون - اینترون توالی ژنی نشان داد که اعضای این خانواده به لحاظ آرایش و فراوانی اگزون ها از الگوی متفاوتی برخوردارند. شناسایی و طبقه بندی عناصر تنظیمی سیس در هشت گروه مختلف صورت گرفت که از مهم ترین عناصر سیس مرتبط به تنش می توان به موتیف های ABRE،MBS ،DRE ، STRE و LTR اشاره نمود. بررسی الگوی ترانسکریپتوم (RNA-Seq) نشان داد که ژن های AlPP2C الگوهای بیان متفاوتی در پاسخ به تنش شوری و شرایط بازیابی در دو بافت برگ و ریشه ارایه نمودند که احتمالا بیانگر مسیرهای تنظیمی متفاوت در بیان این ژن هاست. الگوی بیان مشاهده شده ژن AlPP2C4 در بافت ریشه، حاکی از تنظیمات بیان بافت - اختصاصی این ژن می باشد. این تحقیق با شناسایی ژن های اورتولوگ PP2C مرتبط با تنش در گیاه آلورورپوس لیتورالیس، اطلاعات ارزشمندی را برای مطالعات عملکرد ژنی و فرایندهای بیولوژیکی ژن های PP2C فراهم می آورد.
    کلید واژگان: بیان ژن, تنش شوری, تنش غیرزنده, پیام رسانی, هالوفیت}
    Seyyed Hamidreza Hashemi-Petroudi *, Samira Mohammadi, Esmaeil Bakhshandeh, Markus Kuhlmann
    From prokaryotes to higher eukaryotes, protein phosphatase 2Cs (PP2Cs) play a critical role in the stress response. For the purpose of identifying the AlPP2C gene and examining its expression, Aeluropus littoralis, a salt-secreting halophytic grass belonging to the Poaceae family, was genome-wildly analyzed. Based on the unique structure of the PP2C domain, 34 AlPP2C genes were discovered and classified into ten evolutionary branches based on homology with Arabidopsis thaliana. According to exon-intron structural analyses, they possessed a wide range of exon counts. AlPP2Cs shared similar motif organization in the same evolutionary branches based on motif distribution. The motifs ABRE, MBS, DRE, STRE, and LTR, which are related with stress, were discovered in the promoter region of the AlPP2C. AlPP2Cs displayed varied expression patterns in leaf and root tissues in response to salt stress and recovery conditions, according to transcriptome analyses. The AlPP2C4 gene is only expressed in the root tissues. These results expand our understanding of the PP2C gene family and provide valuable information for future research on PP2Cs molecular function and biological processes studies.
    Keywords: Abiotic Stress, Expression pattern, Halophyte, Salt stress, Signaling}
  • مسعود فخرفشانی، علی نیازی، فاطمه کیخا آخر، پدرام عصار، لیلا تقی پور

    در حال حاضر بین نرخ رشد نیاز به محصولات کشاورزی و نرخ رشد تولید آنها عدم تعادلی وجود دارد که گزارشهای موجود سهم زیادی از این کمبود را به تنشهای غیر زنده نسبت میدهند. این گروه از تنشها، عملکرد گیاهان زراعی را تا 50 درصد کاهش میدهند بر همین اساس به نظر میرسد هر ایدهای که بتواند به کاهش میزان آسیب این تنشها منتهی شود، ارزش مطالعه را خواهد داشت. به همین منظور در پژوهش حاضر، تفاوت شاخص آروماتیکی و ناپایداری آنزیم کاتالاز بر اساس ترکیب آمینو اسیدی و سطح بیان ژن آن در ریشه و اندام هوایی آلوروپوس و واریته IR64 برنج در شرایط تنش شوری مورد ارزیابی قرار گرفتند. با هدف بررسی بهتر اثرات شوری بر گیاهان مورد مطالعه، نمونه برداری از آنها در شرایط تنش در بازه های زمانی کوتاه مدت، میان مدت و بلند مدت صورت گرفت. تحلیل نتایج حاصل نیز وجود تفاوت معنادار بین پاسخ و پتانسیلهای این دو گیاه در برابر تنش شوری را نشان داد. طی بررسیها بیان ژن کاتالاز در ریشه گیاه آلوروپوس به صورت دورهای با دو مرتبه افزایش خود را نشان داد در حالی که پاسخ این ژن در گیاه برنج تنها با یک مرتبه افزایش بیان در کل دوره تنش همراه بود. بیان این ژن در اندام هوایی برنج نیز در مقایسه با شاهد یا کمتر و یا بدون تفاوت معنادار بود در حالی که در تمام مراحل تنش در اندام هوایی آلوروپوس به طور معناداری بیشتر از نمونه های شاهد آن بود. مقایسه شاخصهای بیوشیمیایی ترکیب آمینو اسیدی کاتالاز نیز برتری نسبی آنها را در آلوروپوس نشان داد. به عنوان نتیجه گیری کلی از ارزیابی های صورت گرفته میتوان به این مطلب اشاره کرد که بخشی از تفاوت تحمل و پاسخ دو گیاه به تنش شوری از تفاوت چیدمان نوکلیوتیدهای بخش بیانی و پروموتور ژن کاتالاز این دو گیاه منشاء گرفته است. در نتیجه انتخاب، استخراج و انتقال ژن و پروموتور از آلوروپوس به گیاهی حساس به شوری همچون برنج قابل پیشنهاد است.

    کلید واژگان: شاخص آروماتیک, شاخص ناپایداری, تنش اکسیداتیو, تنش شوری}
    Masoud Fakhrfeshani *, Ali Niazi, Fatemeh Keykha Akhar, Pedram Assar, Leila Taghipour

    There is an imbalance between increase rate in demand for agricultural products and the growth rate of agricultural production. Much of this production deficit is attributed to abiotic stresses. These stresses reduce the yield of crops by more than 50%. Obviously, it worth studying any idea which may lead to reducing the damages of them. In the present research, the transcription level of Catalase in root and shoot of Oryza sativa var. IR64 and Aeluropus littoralis using qtr.PCR and the Aromatic and Instability indices based on amino acid composition were evaluated. The samples were taken at short-term, mid-term and long-term stress span. Analysis of the results showed significant differences in the both gene expression and studied biochemical aspects. The expression of catalase gene in Aeluropus roots was periodic and showed a twice increase and then a decrease however in roots of rice there was just a rise in its expression. In the all sampling of the rice shoots, CAT gene expression levels were either lower or without any significant different in contrast to the control samples. Meanwhile, the rates of expression in most of stressed Aeluropus shoots were significantly higher than control samples. Comparison of the biochemical indices showed that Aeluropus has a relative superiority over rice in terms of amino acid sequences. Based on the evaluated indices, the differences of response to salinity stress in the studied plants could be attributed to the differences in the promoter and nucleotide sequences of their genes.

    Keywords: Aromatic Index, Instability Index, Oxidative stress, Salt stress}
  • فریبا مرسلی آقاجری، رضا درویش زاده*، میترا رازی

    شوری یکی از مهمترین تنشهای غیرزنده است که بر رشد و نمو گیاهان تاثیر میگذارد. اثر سطوح مختلف کلریدسدیم (0 ،2 ، 4 ، 6 و 8 دسی زیمنس بر متر) بر فعالیت آنزیمی و غیرآنزیمی در ژنوتیپهای آفتابگردان دانه روغنی C64 و C68 در دو زمان (3 و 12 روز پس از اعمال تنش شوری) بررسی شد. فتوسنتز خالص، کلروفیل و پروتیینهای محلول با افزایش سطح شوری کاهش یافتند، اما محتوای پرولین و مالون دی آلدهید افزایش یافت. تغییرات میزان فتوسنتز خالص در دو ژنوتیپ مورد مطالعه در طول زمان متفاوت بود و از روند یکسانی پیروی نمیکند. در ژنوتیپ C86 ،سه روز بعد از تنش شوری کاهش میزان فتوسنتز در تمام سطوح شوری مورد مطالعه به ویژه سطوح شوری 2 ،4 و 6 دسی زیمنس بر متر در مقایسه با شاهد (0 دسی زیمنس بر متر) بسیار بالا بود، در حالی که 12 روز بعد از تنش شوری میزان فتوسنتز در سطوح شوری 2 و 4 دسی زیمنس بر متر به طور متوسط و در سطوح شوری بالا به طور شدید کاهش یافت. 12 روز بعد از تنش شوری (2 دسی زیمنس بر متر(بالاترین میزان پرولین36/31 %)مربوط به ژنوتیپ مقاوم و پایینترین میزان (72%/7)آن مربوط به ژنوتیپ حساس بود. مالون دی آلدهید قابل ملاحظه ای در هر دو ژنوتیپ مقاوم و حساس 12 روز پس از تنش مشاهده گردید، بالاترین مقدار آن (83 (%در سطح شوری 8 دسی زیمنس بر متر مشاهده شد. فعالیت کاتالاز و پراکسیداز آسکوربات با افزایش شدت شوری افزایش یافت. میزان افزایش فعالیت پراکسیداز گایاکول در ژنوتیپ C86 بیشتر از C64 بود. میزان کلروفیل a و کلروفیل کل در هر دو ژنوتیپ آفتابگردان تحت تنش شوری کاهش یافت. پایینترین میزان کلروفیل کل (6/8 %)در سطح شوری 8 دسی زیمنس بر متر و در لاین حساس (C64)مشاهده گردید. نتایج نشان داد که ژنوتیپهای C64 و C68 که از دو گروه هتروتیک شناسایی شده انتخاب شده بودند پاسخ فیزیولوژیکی متفاوتی به تنش شوری دارند و C68 نسبت به C64 تحمل بیشتری نسبت به تنش شوری دارد. بنابراین این ژنوتیپها میتوانند بالقوه به عنوان والدین تلاقی در برنامه های اصلاحی ارقام هیبرید مقاوم به شوری استفاده شوند.

    کلید واژگان: آفتابگردان, تنش شوری, فتوسنتز خالص, فعالیت آنتی اکسیدانی, کلروفیل, مالون دی آلدهید}
    Fariba Morsali Aghajari, Reza Darvishzadeh *, Mitra Razi

    Salinity is one of the most important non-biological stresses that affect plant growth and development. Effect of different levels of NaCl (0, 2, 4, 6 and 8 dS/m) were investigated on enzymatic and non-enzymatic activities in C64 and C68 oilseed sunflower genotypes at two times; 3 and 12 days after salinity stress application. Net photosynthesis rate, chlorophyll content and soluble proteins amount decreased by increasing salinity level but proline and malondialdehyde (MDA) contents increased. However, the changes in net photosynthesis in the two studied genotypes was different across time and do not follow statistically the same trend line. In genotype C86, the reduction of photosynthesis rate at all studied salinity levels was very high compared to normal condition (0 dS/m) after 3 days; especially at salinity levels of 2, 4 and 6 dS/m, while 12 days later, the decrease of photosynthesis rate was moderate at salinity levels of 2 and 4 dS/m but severe at 6 and 8 dS/m salinity levels. The highest amount of proline (31.36%) related to tolerant genotype and the lowest amount (7.72%) related to susceptible one was measured 12 days after 2 dS/m salt stress treatment. Considerable MDA was observed in both tolerant and sensitive genotypes 12 days post salt stress application; the highest amount (83%) was observed at 8 dS/m treatment. Catalase and ascorbate peroxidase activity increased with increasing salt intensity. The rate of increase in guaiacol peroxidase activity was higher in C86 genotype than C64. Chlorophyll a and total chlorophyll contents decreased in both sunflower genotypes under salinity stress. The lowest amount of total chlorophyll (8.6%) was observed in the salinity level of 8 dS/m in the sensitive line (C64). Results revealed the C64 and C68 selected genotypes from two our identified sunflower heterotic groups have different physiological response to salinity stress and C68 is more tolerant to salt stress than C64. So, they can be potentially used as parents in sunflower breeding programs to produce salt stress tolerant hybrids.

    Keywords: Antioxidant Activity, Chlorophyll, malondialdehyde, Net photosynthesis, Salinity stress, sunflower}
  • جمشید عظیمیان، امین آزادی*، اسلام مجیدی هروان، محمدرضا بختیاری زاده، رضا عزیزی نژاد

    تنش شوری یکی از محدودکننده ترین عوامل غیرزنده در تولید گندم می باشد. به منظور فایق آمدن بر این مشکل، شناخت نحوه پاسخ و عمل ژن ها در تنش می تواند اطلاعات مفیدی برای اصلاح گیاهان در جهت تحمل تنش های محیطی فراهم آورد. پژوهش حاضر با هدف شناسایی ژن هایی با الگوی بیان متفاوت بین دو حالت (نرمال و تحت تنش شوری) در گندم نان(Triticum aestivum) انجام شد. بررسی الگوی بیانی ژن های pyrroline-5-carboxylate synthetase, serine-threonine protein kinase و ژنAldehyde dehydrogenase family 3 member I1, chloroplastic-like  نشان داد پس از اعمال تنش میزان بیان نسبی این ژن ها نسبت به نمونه ی شاهد افزایش بیش تری داشت و بیان ژن هایProline dehydrogenase 2, mitochondrial like ،Putative calcium binding protein CML29 و GDSL esterase/lipase At2g40250-like نسبت به نمونه شاهد کاهش داشت. محتوی پرولین و بیان ژن های کلیدی درگیر در بیوسنتز پرولین در شرایط تنش نسبت به شرایط کنترل تغییرات قابل توجهی را نشان داد. تنش شوری سبب القاء بیان ژن P5CS و افزایش سطح پرولین شد که می تواند بیانگر نقش مهم ژن pyrroline-5-carboxylate synthetase جهت انتقال به گیاهان حساس به منظور افزایش تحمل به شوری در آن ها باشد.

    کلید واژگان: گندم نان, تنش شوری, آنالیز ریل تایم PCR, پرولین}
    Jamshid Azimian, Amin Azadi*, Eslam Majidi Hervan, Mohammad Reza Bakhtiarizadeh, Reza Azizinezhad

    Salinity is one of the most determinative abiotic stresses in wheat cultivation. In order to overcome this concern, understanding how genes respond and act under stress conditions can provide useful information for plant breeding to withstand environmental stresses. The aim of this study was to identify genes with significant differences between two normal and stress conditions in bread wheat (Triticum aestivum). Gene expression patterns of pyrroline-5-carboxylate synthetase, serine-threonine protein kinase and Aldehyde dehydrogenase family 3 member I1, chloroplastic-like showed that: under salt stress, the genes expression levels have increased while the expression of Proline dehydrogenase 2, mitochondrial like, Putative calcium binding protein CML29 and GDSL_esterase / lipase_At2g40250-like genes decreased compared to control. Proline content and expression of key genes involved in proline biosynthesis under stress conditions showed significant changes in comparison with control conditions. Salinity stress induced P5CS expression and increased proline levels, which could indicate the crucial role of pyrroline-5-carboxylate synthetase as valuable gene transfer from stress tolerant to sensitive plant to increase plant tolerance under salinity.

    Keywords: Bread wheat, Salinity stress, Real-time PCR analysis, Proline}
  • مهدی معتمدی، کامبیز عزیزپور*، وحید سرابی، رعنا ولیزاده کامران

    با وجود اثرات منفی شوری بر گیاهان، به دلیل محدودیت سطح زیر کشت، کاشت انواع گیاهان در اراضی شور اجتناب ناپذیر است. در این میان بامیه از جمله گیاهانی است که مطالعات اندکی درخصوص عکس العمل آن به سطوح مختلف نمک صورت گرفته است، فلذا به منظور بررسی تاثیر سطوح مختلف شوری بر بامیه (Abelmoschus esculentus Moench)، آزمایشی بر پایه طرح بلوک های کامل تصادفی با پنج تیمار شامل غلظت های صفر، 50، 100، 150 و 200 میلی مولار نمک کلرید سدیم در سه تکرار، در گلخانه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، به اجرا درآمد. نتایج حاصل از آزمایش نشان داد که با افزایش سطوح شوری، نسبت پتاسیم به سدیم، میزان کلروفیلa، محتوای نسبی آب برگ، وزن خشک بوته، تعداد میوه در بوته، وزن میوه در بوته، تعداد دانه در بوته، وزن دانه در بوته و وزن هزار دانه کاهش یافت ولی بر درصد سدیم و میزان پرولین برگ افزوده شد. در طی آزمایش، بوته های تیمار 200 میلی مولار مدتی بعد از اعمال تنش شوری از بین رفتند ولی بوته های سایر تیمار ها توانستند با تداوم رشد، تولید محصول نمایند. حفظ درصد پتاسیم در سطح بالا، کاهش کم در میزان کلروفیل و عدم تغییر محسوس در محتوای نسبی آب برگ را می توان از عوامل موثر در ادامه رشد گیاه، سنتز ماده خشک و تولید میوه در غلظت های مختلف نمک عنوان نمود. اگرچه از نظر تعداد میوه در بوته، تفاوت چندانی بین سطوح مختلف شوری با شاهد وجود نداشت، ولی در غلظت های بالای نمک، علی الخصوص 150 میلی مولار، افت معنی داری در وزن میوه در بوته به ثبت رسید، که می تواند عامل مهم تاثیر گذار بر عملکرد اقتصادی گیاه در محیط های شور با هدایت الکتریکی بالاتر از ds/m 10 باشد.

    کلید واژگان: بامیه, تنش شوری, تنظیم اسمزی, رشد, عملکرد}
    Mahdi Motamedi, Kambiz Azizpour*, Vahid Sarabi, Rana Valizade Kamran

    Despite the negative effects of salinity on plants, due to the limited area under cultivation, planting a variety of plants in saline lands is inevitable. Among them, okra is one of the plants that few studies have been done on its response to different levels of salt. Therefore, in order to study the effect of salinity levels on Okra (Abelmoschus esculentus Moench), an experiment was designed based on a randomized complete block design with five treatments including concentration of 0, 50, 100, 150 and 200 mM sodium chloride in three replications at the greenhouse of the faculty of agriculture, Shahid Madani University of Azarbaijan. The results showed that by increasing salinity levels, potassium to sodium ratio, chlorophyll a, relative water content, plant dry weight, number of fruits per plant, fruit weight per plant, number of seeds per plant, seeds weight per plant and 1000 grains weight have decreased but amount of sodium and proline have increased. During the experiment, the plants under 200 mM treatment have died shortly after salinization, but plants under other treatments survived until the end of the experiment and produced the yield. Maintaining high potassium content, low reduction in chlorophyll content and no noticeable change in relative water content were factors that led to continuance of plant growth, dry matter and fruit production at different salt concentrations. Although in terms of number of fruits per plant, there was no significant difference between salinity levels and the control, but a significant decrease in fruit weight per plant was recorded at high salt concentrations, especially under 150 mM, which can be an important factor affecting economic yield of okra in saline environments with EC higher than 10 ds/m.

    Keywords: Growth, Okra, Osmoregulation, Salt stress, Yield}
  • منصوره احمدی لیوانی*، لطیفه پوراکبر، آرین ساطعی، مهدی عبادی، ابوالقاسم محمدی

    بابونه کبیر (Tanacetum parthenium) گیاهی علفی، متعلق به خانواده کاسنی (Asteraceae) می باشد که از جمله گیاهان دارویی ارزشمند است که اثرات مصرف آن در پیشگیری درمان میگرن به اثبات رسیده است که از طریق کاهش تورم درد و اسپاسم رگ های خونی صورت می گیرد. پارتنولید یکی از مهم ترین سزکویی ترپن لاکتون های موجود در گیاه بابونه کبیر است که بیش از 85 درصد کل سزکویی ترپرن های این گیاه را تشکیل داده و به عنوان ماده موثره این گیاه شناخته شده است. در تحقیق حاضر، برگ های جوان گیاه بابونه کبیر در سطوح مختلف شوری (شامل صفر (EC=3.2)، شوری ملایم (EC=6.1)، شوری متوسط (EC=8.4) و شوری شدید (EC=10.2) قرار داشتند به منظور مطالعه تغییرات بیان ژن مسیر بیوسنتزی پارتنولید شامل ژرماکرن A سنتتاز (GAS) از روش Real Time PCR استفاده شد. میزان پارتنولید تولید شده در برگ ها با روش عصاره گیری در دستگاه کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC) و درصد اسانس با دستگاه GC/MS سنجیده شد. نتایج نشان دهنده افزایش معنی دار بیان ژن مورد مطالعه در برگ های گیاهان تحت تنش شوری نسبت به گیاهان شاهد بود. بیشترین میزان بیان ژن GAS در تیمارهای شوری شدید و شوری متوسط مشاهده شد. همچنین روند تغییرات میزان بیان ژن با روند تغییرات میزان پارتنولید تولید شده در برگ ها مطابقت داشت. بازده اسانس گیاه نیز در شرایط تنش ملایم (66/0 درصد) بیشتر از شرایط بدون تنش (49/0 درصد) بود.

    کلید واژگان: بابونه کبیر, پارتنولید, تنش شوری}
    MANSOUREH AHMADI LIVANI*, LATIFEH POURAKBAR, AREYAN SATEII, MAHDI EBADI, ABOLGHASEM Mohamadi

    Feverfew (Tanacetum parthenium) is an herbaceous plant belonging to the Asteraceae family, which is one of the valuable medicinal plants that its usage effect has been confirmed in preventing migraine remedy by reducing the swelling, pain and the spasm of the blood vessels. Parthenolide is one of the most important sesquiterpene lactone in feverfew, which contains more than 85% of the total sesquiterpene in this plant and is known as the effective material in this plant. The aim of the present study was to investigate the gene expression of Germacrene A Synthase Tp (GAS) in Feverfew plants under salinity stress and Parthenolide amount changes by HPLC and essence compound by GC/MS method. In the present study, young leaves of Feverfew were placed under different salinity levels (zero salinity EC=3.2, mild salinity EC=6.1, average salinity EC=8.4 and severe salinity EC=10.2). Additionally, the changes in the expression of Germacrene A Synthase Tp (GAS) was investigated using Real Time PCR. The content of produced Parthenolide in leaves was measured by HPLC extraction and essence percentage was measured using GC/MS instrument. The results demonstrated that there was a significant increase in the expression of the studied genes in the leaves of plants under salinity stress compared to the control plants (p≤0.01). Moreover, the highest expression of GAS gene was observed in severe and moderate salinity treatments. Significantly changes in gene expression was accordance with changes in the amount of produced Parthenolide in leaves. Moreover, the essence percentage under stress condition (0.66%) was more than control (0.49%).

    Keywords: Parthenolide, Feverfew, Salinity stress}
  • مریم چاله کائی، علی دهستانی *، علیرضا عباسی، سید حمیدرضا هاشمی پطرودی

    در این پژوهش نوع و فراوانی عناصر تنظیمی در نواحی پروموتری خانواده ژنی DVL در گیاه آلوروپوس لیتورالیس مورد مطالعه قرار گرفت. همچنین بیان ژن AlDVL8 به‌عنوان یکی از اعضای این خانواده تحت تیمار تنش شوری، هورمون‌های ‌اسید‌سالیسیلیک، ‌اسید‌‌جیبرلیک و سیتوکینین اندازه‌گیری شد. نتایج بررسی پروموتری حاکی از آن بود که این خانواده ژنی عناصر تنظیمی متفاوتی برای پاسخ به انواع تنش‌ها و هورمون‌ها دارا می‌باشد. برخی از این عناصر تنظیمی در ناحیه پروموتری تمامی ژن‌ها موجودند که احتمالا بیانگر نقش عمومی DVLها است. همچنین، گروهی از عناصر تنظیمی تنها در ناحیه پروموتری بعضی از ژن‌ها موجودند که می‌توانند مرتبط با فعالیت اختصاصی آن‌ها باشند. تیمارهای اعمال شده به غیر از سیتوکینین سبب افزایش بیان ژن در ‌اندام‌هوایی در زمان‌های 3، 12 و 24 ساعت و کاهش بیان در زمان 6 ساعت پس از اعمال تنش شد. تیمار سیتوکینین در همه زمان‌ها بیان ژن را در ‌اندام هوایی افزایش داد. در بافت ریشه تقریبا روند معکوس بیان ژن دیده شد، به صورتی که در زمان 6 ساعت افزایش بیان ژن و در زمان 12 و 24 ساعت کاهش بیان در تمامی تیمارها مشاهده شد. نتایج این تحقیق نشان داد که بیان ژن AlDVL8 در ‌اندام هوایی و زمینی با تیمارهای آزمایشی القا شد و بیان آن در دو بافت به‌صورت معکوس بود. با توجه به تغییرات هورمون‌ها طی تنش و القای بیان این خانواده ژنی و وجود عناصر پاسخ‌‌دهنده به تنش در نواحی پروموتری این ژن‌ها، این خانواده ژنی می‌تواند به‌عنوان کاندیدی برای تحمل به تنش‌ها پیشنهاد گردد.

    کلید واژگان: پپتیدهای سیگنالی, تنش شوری, خانواده پروتئینی, عناصر تنظیمی, گیاه هالوفیت}
    Maryam Chalekaei, Ali Dehestani *, Ali reza Abbasi, Seyyed Hamidreza Hashemi-petroudi

    In this study, the type and frequency of regulatory elements in the promoter regions of DVL gene family in Aeluropus littoralis were studied. Relative expression of AlDVL8 gene as a member of this family was also measured under the salinity stress, salicylic acid, gibberellic acid and cytokinin. The results of the promoter study indicated that, this gene family has different regulatory elements for responding to stresses and hormones. Some of these regulatory elements are present in the promoter region of all genes, possibly indicating the general role of DVLs. Some others are present only in the promoter region of some genes that may be related to their specific activity. Treatments other than cytokinin increased gene expression in the shoot at 3, 12, and 24 hours and decreased expression at 6 hours. Cytokinin treatment at all times increased gene expression. In the root, almost the reverse trend of gene expression was observed, so that at 6 hours, increased gene expression was observed in all treatments, and at 12 and 24 hours, decreased expression was observed in all treatments. The results of this study showed that the expression of AlDVL8 gene in shoot and root organs was induced by experimental treatments and its expression was inverse in these two different tissues. Due to the changes in hormones during stress, expression induction of this gene family, and the presence of stress-responsive elements in the promoter regions of these genes, this gene family can be suggested as a candidate for stress tolerance.

    Keywords: Gene expression, Gene family, Halophyte plant, Regulatory elements, Salt stress}
  • احسان شهبازی*، زهرا خواجه، محمد مرادی

    شوری یکی از مهمترین تنش های غیرزیستی است که باعث کاهش عملکرد اکثر گیاهان در سراسر جهان می شود. گیاهان در پاسخ به تنش های محیطی از مکانیسم های مختلفی از جمله تغییر در بیان ژن هایشان و افزایش اسمولیت های سازگار مانند پرولین استفاده می کنند. در این مطالعه به منظور بررسی تاثیر تنش تنش شوری بر بیان ژن های P5CS و PDH و میزان پرولین در گیاه کلزا، آزمایشی بصورت فاکتوریل با سه تکرار در آزمایشگاه دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان انجام شد. فاکتور اول شامل سه لاین دابل هاپلویید (متحمل، نیمه متحمل و حساس) و فاکتور دوم دو زمان نمونه برداری بود. بعد از اینکه گیاهچه ها به مرحله 4 برگی رسیدند تحت تاثیر شوری 150 میلی مولار NaCl قرار گرفتند و در زمان های 6 و 24 ساعت بعد از اعمال تنش نمونه برداری صورت گرفت. نتایج بیان ژن  P5CS حاکی از بیان بیشتر این ژن در لاین حساس در 6 ساعت بعد از تنش بود ولی در زمان 24 ساعت بعد از تنش میزان بیان این ژن در لاین حساس کاهش یافت ولی بیان این ژن در لاین متحمل به شدت افزایش پیدا کرد. مقایسه میانگین نسبی بیان ژن PDH نشان داد که لاین حساس در هر دو زمان 6 و 24 ساعت بعد از تنش افزایش بیان داشت در حالیکه در لاین نیمه متحمل کاهش بیان مشاهده گردید. میزان پرولین در لاین متحمل بیشتر از دو لاین دیگر بود ولی بین لاین های نیمه متحمل و حساس از لحاظ میزان پرولین تفاوت معنی داری مشاهده نگردید. بطور کلی نتایج این تحقیق بیانگر این است که بیان ژن های PDH وP5CR  به میزان تحمل گیاه و زمان تنش بستگی دارد. از آنجاییکه در لاین متحمل افزایش نسبتا بیشتر در بیان ژن P5CS و مهار بیشتر فعالیت PDH نسبت به لاین حساس مشاهده گردید باعث تجمع بالاتر پرولین در رقم متحمل نسبت به حساس شد بنابراین شاید بتوان از پرولین به عنوان یک اسمولیت شاخص در شناسایی میزان تحمل به تنش شوری در کلزا استفاده نمود.

    کلید واژگان: بیان ژن, پرولین دهیدروژناز, P5CS, تنش شوری, کلزا}
    Ehsan Shahbazi*, Zahra Khajeh, Mohammad Moradi

    Salinity is considered as one of the abiotic stresses, which decreases the agricultural production of most crops around the world. Plants use different of adaptive mechanisms to counteract the deleterious effects of salinity as changes in gene expression patterns and the content of compatible osmolytes such as proline. This study was conducted to investigate the effects of salinity stress on expression of P5CS and PDH genes and proline content in canola. To do this, a factorial experiment with three replications was carried out in greenhouse of Agricultural Sciences and Natural Resources of Khuzestan University. Three different lines of doubled haploids (Tolerant, Semi- Tolerant and Sensitive) and two sampling times were considered as the first and second factors. The plant seedling were exposed to 150 mM NaCl as salinity stress at 4-leaf stage. Then, the sampling was performed at 6 and 24 hours after stress application. The results of P5CS gene expression showed that this gene was expressed more in the sensitive line after 6 hours from NaCl application, its expression decreased after 24 hours from starting of stress. On the other hand, the gene expression of P5CS increased sharply in the tolerated line after 24 hours of stress. Comparison of the relative mean of PDH gene expression showed that the sensitive line had a significant increase at both times (6 and 24 hours after stress), while a semi-tolerant line had a significant decrease in PDH expression. The content of proline was more in tolerant line than the others, but non-significant difference observed between the semi-tolerant and sensitive lines in terms of proline content. The results of this study indicated that the expression of PDH and P5CR genes depends on the intensity of plant tolerance and post stress times. With considering the more gene expression in P5CS and greater inhibition of PDH activity in tolerant line, more proline accumulation was occurred in tolerant genotype rather than sensitive one. Therefore, proline may be used as an indicator osmolality in the identification of salt stress tolerance in canola.

    Keywords: Gene expression, Prolin dehydrogenase, P5CS, Salt stress, Canola}
  • حسین احمدی، علیرضا عباسی، علیرضا طالعی*، ولی الله محمدی

    تنش شوری یکی از مهم ترین تنش های غیرزیستی می باشد که عملکرد کلزا را تحت تاثیر قرار می دهد. به منظور مطالعه پاسخ های فیزیولوژیکی کلزا و تغییرات بیان ژن های BnaCDPK6 و BnaCDPK10 در شرایط تنش شوری، دو رقم متحمل (Slm046 و زرفام) و دو رقم حساس (اکاپی و ساریگل) در اتاقک رشد کشت شدند و تنش شوری از طریق آبیاری با 100 و 200 میلی مولار نمک (NaCl) اعمال شد. محتوای نسبی آب برگ، مالون دی آلدهید، آنزیم آنتی اکسیدان سوپراکسید دیسموتاز، آنزیم آنتی اکسیدان کاتالاز و بیان ژن های رمزگذار پروتئین کیناز وابسته به کلسیم 6 و 10 کلزا اندازه گیری شدند. در شرایط شوری شدید (200 میلی مولار نمک سدیم کلراید) محتوای نسبی آب کاهش و مقدار مالون دی آلدهید افزایش یافت. محتوای آنزیم سوپراکسید دیسموتاز، آنزیم کاتالاز و بیان ژن های BnaCDPK6 و BnaCDPK10 با بالارفتن شدت تنش شوری افزایش یافت که مقدار این افزایش در ارقام متحمل بیشتر از ارقام حساس بود. این نتایج نشان می دهد که افزایش گونه های اکسیژن فعال ناشی از تنش شوری نقش مهمی در آسیب به غشای سلول در کلزا دارد و گیاه برای مقابله با آن مکانیسم های حفاطتی خود را در برابر تولید گونه های اکسیژن فعال افزایش می دهد که می توان به افزایش فعالیت آنزیم های آنتی اکسیدان و افزایش بیان ژن های پروتئین کیناز وابسته به کلسیم اشاره کرد.

    کلید واژگان: کلزا, تنش شوری, صفات فیزیولوژیکی, آنزیم آنتی اکسیدان, بیان ژن}
    Alireza Taleei*

    Salinity stress is one of the most important abiotic stresses affecting the yield of oilseed rape. To study the physiological and biochemical changes, and expression BnaCDPK6, BnaCDPK 10 genes in rapeseed (Brassica napus L.). Two tolerant cultivars (Slm046 and Zarfam) and two susceptible cultivars (Okapi and Sarigol) were planted in a growth chamber and were irrigated by 100 and 200 mM NaCl and normal water. Studied parameters include relative water content, malondialdehyde, the enzyme activity of antioxidant enzymes (Superoxide dismutase and Catalase) and the expression of calcium-dependent protein kinase 6 and 10 coding genes (BnaCDPK6, 10).  The result indicated the relative water content and malondialdehyde with a high level of salt (200 mM NaCl) decreased and increased under stress respectively. The antioxidant enzymes Superoxide dismutase and Catalase content and BnaCDPK6 and BnaCDPK10 expression increased by high severity salinity stress that tolerant cultivars showing more increase. These results indicated that increasing the reactive oxygen species due to salt stress plays an important role in damaging cell membrane in canola, and the plant increases its protective mechanisms against the production of reactive oxygen species by increasing the activity of antioxidant enzymes and an increase in the expression of calcium-dependent protein kinase genes expression.

    Keywords: Brassica napus, salinity stress, physiological traits, Antioxidant enzyme, gene expression}
  • سید حمیدرضا هاشمی پطرودی*، سمیرا محمدی

    تنش شوری یکی از تنش های غیرزیستی محدودکننده رشد و نمو گیاهان می باشد. عامل پاسخ دهنده به اتیلن (ERF) خانواده ای از عوامل رونویسی دخیل در رشد و نمو گیاهان و نیز پاسخ دهنده به تنش های زیستی و غیرزیستی بوده و با توجه به اهمیت این خانواده در پاسخ به تنش شوری، در این تحقیق شناسایی ژن های این خانواده در گیاه شورزیست چمن شور آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis) مدنظر قرار گرفت. در مجموع، 36 ژن غیر تکراری ERF در ژنوم آلوروپوس لیتورالیس شناسایی شد. ترسیم درخت فیلوژنتیک بر مبنای همولوژی با گیاه آرابیدوپسیس، خانواده ژنی AlERF را به شش گروه مشخص (B1 تا B6) طبقه بندی نمود. تجزیه و تحلیل ساختار ژنی نشان داد که تعداد اینترون در ژن های AlERF بین صفر تا دو متغیر بود. تجزیه و تحلیل موتیف های حفاظت شده و جستجوی دمین در توالی های پروتیینی AlERF نشان داد از ده موتیف شناسایی شده، تنها موتیف های یک و دو در ساختار دمین AP2/ERF مشارکت دارند. بر اساس داده های ترانسکریپتوم و نمودار Heatmap، ژن AlERF6.3 ببیشترین بیان را در شرایط تنش شوری در بافت ریشه نشان داد و بیشترین کاهش بیان نیز در ژن AlERF6.7 در شرایط بازیابی در بافت برگی مشاهده شد. این الگوی متفاوت بیان ژن ها در بافت های برگ و ریشه در مواجهه با تنش شوری، حاکی از وجود مکانیسم های تنظیمی متفاوت در بیان این ژن ها می باشد. نتایج این مطالعه به عنوان اولین گزارش در مورد خانواده ژنی ERF در آلوروپوس لیتورالیس، اطلاعات پایه ای را برای مطالعات بیشتر در مورد خصوصیات کارکردی ژن های AlERF فراهم می نماید.

    کلید واژگان: آلوروپوس لیتورالیس, تنش شوری, خانواده ژنی, روابط فیلوژنتیکی, عوامل رونویسی ERF}
    Seyyed Hamidreza Hashemi Petroudi *, Samira Mohammadi

    Salt stress is one of the abiotic stresses limiting plant growth and development. The ethylene response factor (ERF) is one of the transcription factor family that involved in plant development and responses to biotic and abiotic stresses. Regarding to importance role of genes belonging to ERF gene family in plant responses to salt stress, identification of these genes in the Aeluropus littoralis, halophyte plant, was considered in this study. In total, 36 non-redundant ERF genes were identified in A. littoralis genome. The phylogenetic tree classified the AlERF gene family into six distinct groups (B1 to B6) based on hemology with the Araboidopsis thaliana. Gene structure analysis revealed that AlERF genes contained zero to two introns. Domain search and conserved motif analyses in AlERF protein sequences determined that 2 motifs (1 and 2) out of the identified 10 motifs participate in the AP2/ERF domain structure. Based on transcriptome data and heatmap diagram, AlERF6.3 gene was expressed more in root tissue under salinity stress, and the least expression level was observed in AlERF6.7 gene in leaf tissue under recovery conditions. The different expression patterns of genes in leaf and root tissues under salt stress suggested different regulatory mechanisms in the gene expression. The results of this study, as the first report on the ERF gene family in A. littoralis, provides basic information for further studies of the functional characteristics of AlERF genes.

    Keywords: Aeluropus littoralis, ERF transcription factor, Gene family, Phylogenetic relationships, Salt stress}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال